Search Result
On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI020259 | Chr12 | 11465213 | 11472986 | - | Transcription factor ICE1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI020259.m1 | 349 | 391 | PF00010.29 | HLH | Domain | 37.4 | 2.10E-09 |
| LITCHI020259.m2 | 349 | 391 | PF00010.29 | HLH | Domain | 37.3 | 2.20E-09 |
| LITCHI020259.m3 | 349 | 391 | PF00010.29 | HLH | Domain | 37.7 | 1.70E-09 |
Download Copy
>LITCHI020259.m1 ATGCTCTCCAGAGTGAACGGTGGTGGTGTGGGTTGGATGAATGATAAGGAAGACGAAGAC TCTGCTTCATGGACCAGAAACAACAACAACGGTGTCGTCATGGAGAACGAAGAAGAGATG GGAGGTCTGTCTGGTTTGAAAACCATGCTTGAAGTAGAAGATGAGTGGTATGTGTCCGGA CACAACCAACAAGACATCACATTCTCGCCACCAAATCTGGGTGACCCAACAACAGATAAT CTGCTGTTGAACCCAGTTGATTCCTCCTCTTCTTGCTCACCATCCTCCTCTGTTTTCAAC AACCTTGACGCCTCTCAGGTGCACTACTTTTTGCCACCCAAAAACACCCTCTCTTCCTTC CTTAATGTTGTCTCCAACAACTCTTTAGAGCACGCCTTCGATTTAGGCGAGATTGGCTTT CTCGACAACCCACCAACACACACCATCAACAGGCCTATTTTGACTAATTTCCCTGATTTG ACCTCTAATAATCAGATTACTACTACTCCTAACTTGTGCTCTGATTCACAGTTTGGAACA GCAAACCGTTTGCTTCAGTTTCCTGAAAATGGTAGTAATTTTTCAGGTTTTCGTGGTTTC GATGAGAACAGTGTGAATTCTATGTTTTTGAATAGGTCTAAATTGTTAAGGCCACTTGAA ACTTTCCCTTCAATGGGGGCTCAACCAACCCTTTTCCAGAAAAGAGCTGCTTTGAGGAAA AACTTAGGTGATAACAATGGGGCACCCAACTTGGGGGATTTAGGTCCAGAAAACAGTCAA GTTTTGAGTGGAATTGATGGTGATAAAGGGAAGAAGGAAGTTAATGAAGATAATGGGAAA AAGAGGAGGATGAGTGTGAGTGATGATTTTGAGGATGTGAGCATTGATGGGTCTGGTGTG AATTATGATTCTGATGACTTTGTAGAGAACAGTAAGGTGGAGGAGATTGGTAAAAATGGT GGGGGGAGTAGCTCGATGGCGAATAGTACTGTCACTGGAGGACACCAGAAGGGAAAGAAG AAAGGGCTGCCTGCGAAGAATTTGATGGCGGAGAGGCGCCGCAGAAAGAAGCTCAATGAT AGGCTGTACATGTTACGGTCTGTTGTTCCGAAGATCAGCAAAATGGACAGGGCTTCAATT CTTGGGGATGCAATAGAGTACTTGAAGGAACTTCTTCAAAGGATCAATGACCTTCACAAT GAATTGGAGTCAACCCCACCTGGCTCAGCATTGACACCAACCACAAGCTTCCACCCTTTG ACGCCCACTCCACCTTCCTTGCACAGCCGTATCAAGGATGAACTTTGCCCCAGCTCATTG CCAAGTCCAAATGGCCAACCTGCAAGGGTTGAAGTTAGGGTGAGAGAAGGAAGAGCTGTA AACATTCACATGTTCTGTGGCCGCAGACCGGGTCTCCTGCTCTCCACAATGAGGGCGCTG GATAGTCTGGGACTAGATATCCAGCAAGCTGTCATCAGTTGTTTCAATGGATTTGCCATG GATATTTTCCGAGCCGAGCAATGCAAGGAAGGCCAGGATGTCCATCCCGAGCAAATCAAA GCAGTACTCCTGGATTCGGCTGGCTTCCATGGCATGATGTAG >LITCHI020259.m2 ATGCTCTCCAGAGTGAACGGTGGTGGTGTGGGTTGGATGAATGATAAGGAAGACGAAGAC TCTGCTTCATGGACCAGAAACAACAACAACGGTGTCGTCATGGAGAACGAAGAAGAGATG GGAGGTCTGTCTGGTTTGAAAACCATGCTTGAAGTAGAAGATGAGTGGTATGTGTCCGGA CACAACCAACAAGACATCACATTCTCGCCACCAAATCTGGGTGACCCAACAACAGATAAT CTGCTGTTGAACCCAGTTGATTCCTCCTCTTCTTGCTCACCATCCTCCTCTGTTTTCAAC AACCTTGACGCCTCTCAGGTGCACTACTTTTTGCCACCCAAAAACACCCTCTCTTCCTTC CTTAATGTTGTCTCCAACAACTCTTTAGAGCACGCCTTCGATTTAGGCGAGATTGGCTTT CTCGACAACCCACCAACACACACCATCAACAGGCCTATTTTGACTAATTTCCCTGATTTG ACCTCTAATAATCAGATTACTACTACTCCTAACTTGTGCTCTGATTCACAGTTTGGAACA GCAAACCGTTTGCTTCAGTTTCCTGAAAATGGTAGTAATTTTTCAGGTTTTCGTGGTTTC GATGAGAACAGTGTGAATTCTATGTTTTTGAATAGGTCTAAATTGTTAAGGCCACTTGAA ACTTTCCCTTCAATGGGGGCTCAACCAACCCTTTTCCAGAAAAGAGCTGCTTTGAGGAAA AACTTAGGTGATAACAATGGGGCACCCAACTTGGGGGATTTAGGTCCAGAAAACAGTCAA GTTTTGAGTGGAATTGATGGTGATAAAGGGAAGAAGGAAGTTAATGAAGATAATGGGAAA AAGAGGAGGATGAGTGTGAGTGATGATTTTGAGGATGTGAGCATTGATGGGTCTGGTGTG AATTATGATTCTGATGACTTTGTAGAGAACAGTAAGGTGGAGGAGATTGGTAAAAATGGT GGGGGGAGTAGCTCGATGGCGAATAGTACTGTCACTGGAGGACACCAGAAGGGAAAGAAG AAAGGGCTGCCTGCGAAGAATTTGATGGCGGAGAGGCGCCGCAGAAAGAAGCTCAATGAT AGGCTGTACATGTTACGGTCTGTTGTTCCGAAGATCAGCAAAATGGACAGGGCTTCAATT CTTGGGGATGCAATAGAGTACTTGAAGGAACTTCTTCAAAGGATCAATGACCTTCACAAT GAATTGGAGTCAACCCCACCTGGCTCAGCATTGACACCAACCACAAGCTTCCACCCTTTG ACGCCCACTCCACCTTCCTTGCACAGCCGTATCAAGGATGAACTTTGCCCCAGCTCATTG CCAAGTCCAAATGGCCAACCTGCAAGGGTTGAAGTTAGGGTGAGAGAAGGAAGAGCTGTA AACATTCACATGTTCTGTGGCCGCAGACCGGGTCTCCTGCTCTCCACAATGAGGGCGCTG GATAGTCTGGGACTAGATATCCAGCAAGCTGTCATCAGTTGTTTCAATGGATTTGCCATG GATATTTTCCGAGCCGAGGTACATATATTTCTTTATCCCGTTAATTTTTTATCTAGTTGG CAAAAATTAAATTTCCAGAGCAACATTACAACTCATATATCCACTCCATTCCATAATGTA GCGTGTACCAGCCGAGGACAAAATTATTTGCTTATCTAA >LITCHI020259.m3 ATGCTCTCCAGAGTGAACGGTGGTGGTGTGGGTTGGATGAATGATAAGGAAGACGAAGAC TCTGCTTCATGGACCAGAAACAACAACAACGGTGTCGTCATGGAGAACGAAGAAGAGATG GGAGGTCTGTCTGGTTTGAAAACCATGCTTGAAGTAGAAGATGAGTGGTATGTGTCCGGA CACAACCAACAAGACATCACATTCTCGCCACCAAATCTGGGTGACCCAACAACAGATAAT CTGCTGTTGAACCCAGTTGATTCCTCCTCTTCTTGCTCACCATCCTCCTCTGTTTTCAAC AACCTTGACGCCTCTCAGGTGCACTACTTTTTGCCACCCAAAAACACCCTCTCTTCCTTC CTTAATGTTGTCTCCAACAACTCTTTAGAGCACGCCTTCGATTTAGGCGAGATTGGCTTT CTCGACAACCCACCAACACACACCATCAACAGGCCTATTTTGACTAATTTCCCTGATTTG ACCTCTAATAATCAGATTACTACTACTCCTAACTTGTGCTCTGATTCACAGTTTGGAACA GCAAACCGTTTGCTTCAGTTTCCTGAAAATGGTAGTAATTTTTCAGGTTTTCGTGGTTTC GATGAGAACAGTGTGAATTCTATGTTTTTGAATAGGTCTAAATTGTTAAGGCCACTTGAA ACTTTCCCTTCAATGGGGGCTCAACCAACCCTTTTCCAGAAAAGAGCTGCTTTGAGGAAA AACTTAGGTGATAACAATGGGGCACCCAACTTGGGGGATTTAGGTCCAGAAAACAGTCAA GTTTTGAGTGGAATTGATGGTGATAAAGGGAAGAAGGAAGTTAATGAAGATAATGGGAAA AAGAGGAGGATGAGTGTGAGTGATGATTTTGAGGATGTGAGCATTGATGGGTCTGGTGTG AATTATGATTCTGATGACTTTGTAGAGAACAGTAAGGTGGAGGAGATTGGTAAAAATGGT GGGGGGAGTAGCTCGATGGCGAATAGTACTGTCACTGGAGGACACCAGAAGGGAAAGAAG AAAGGGCTGCCTGCGAAGAATTTGATGGCGGAGAGGCGCCGCAGAAAGAAGCTCAATGAT AGGCTGTACATGTTACGGTCTGTTGTTCCGAAGATCAGCAAAATGGACAGGGCTTCAATT CTTGGGGATGCAATAGAGTACTTGAAGGAACTTCTTCAAAGGATCAATGACCTTCACAAT GAATTGGAGTCAACCCCACCTGGCTCAGCATTGACACCAACCACAAGCTTCCACCCTTTG ACGCCCACTCCACCTTCCTTGCACAGCCGTATCAAGGATGAACTTTGCCCCAGCTCATTG CCAAGTCCAAATGGCCAACCTGCAAGGGTATAA
Download Copy
>LITCHI025168.m1 ATGGAGAGCACCATGAACAAGAAAACTACTGTCCCTACAAACCGATTGAAGTCAACAACT GACAGCAATGGTGGAAACTCTGGTCCTCTTAAGATGGAGCCAACCACGTCCGAAAATCCT GCTGTGGCTTCCAGCAGCCAGGACCCCAGACATGCTGATGATAAGAAGCTCAAAAGAATT CTTGCAAGCCGAGAGTATGCTCAGAAATCTCGATTCAGGCAGCAACAATATATTATGCAA CTCGAAGATCGAGTGAAATTTCTTAAAAATCAGATAGCAATTATGGCTCTAAACCTCAAA CATATGAATAGTCATAATTCAATGTTGAAAGCAAAAAATGCTTCATTGAAGCAGCGACTC TCCGAATTGGCTGGTGAACTAACCCACAAACACGCTCAATATGAAGAGCTGAAGAAAGAG AAGGAAGCAATGAAGCAATTGTACGCGCATCAACAACGAACTCTACGTTATAATAATCAG AACATGAATATCCAATTCGGGCCTGCATGCCTAGATTTTGGATACCATCATGACTGTTAG
Download Copy
>LITCHI025168.m1 + Up_Stream_Len 2000 ATTTACTATTTTTTTTTTCACTTTTGTTATTTCTAAGTGCAGTGTATTTAGCACAAAGAT TAGCATAACATTGAGAGGATCCAATTAATCCATTGGTTATCAAATTATTTTAAATTATAT ATATATATATATGCATTGCACTGGATACATGCGAAATTTTTTATTAGCTTATAAAACAAA TTTGTTATTACAAACATTTGTGACCATTATATCATGAAATCAGTGGCAGAGTTAGAAATA TTTACCAATAAGGCTACTATGGGATAATGATTTATATCTACATGTATCTTTTAAAATTAA ATATGGATATATGTTTGCACATGGTTTACATGTTTCTTAAACAATTTTATTAATTTTAAG TATTAACTATATTATAAATTTTATTTGAAATTCTAACAAACTATACTTTAATTGCATAAA TTAGCAAGTATTATTATTATTTTTTAAAATAAATAATAGAATACAAGTATGATAGAGAGA TAAGTAAAATTGAGAATGTATAAAACATTTTAAAGAGAGATATGATTTGGTTACATTGGA AATGGGGATAGAAAAAGTGAAAAATAATATTATAAGAATTTAAAAATTTAGAGAGAATGT TAAAATAATATGTAGGCAACATTATATAGATAATTAGTTGCTTACATAAAATCAGCCATT CCATGTTTTATACTGTTAAGAACTACACTTTTTTATATATGTCTATGCATTTCCTGTAAT TCTGTGTCCAAAGTTCTAGTATGAACCTATTCATCAAATAGGTTGTGATAATTCATTATT GCATTCCTCAACCGATTTAGATCATTCCTATGCTAAATTTTATCATCCTAAATAAATAAA TCCTCATTGCATTGATGACTGAGCTTAACGTGCTGAATCCGAAGCTATTTGATGACAAAA CAAATAAATAGACTTCATTGGGATGAACATATCAATATTGTTCTACAAATGATATTAATC AATCCAATGATGATTAATTAATATGTTAATAATACTGATGATCACATGTAAATGTGCGGT GGTCATATACATACTTAATTCATAGCACAGGATTGTGGCTATTGCATAGTCAACTAAGAT CACACTAAATTAGCCTAACTCATGTAATCCATCTTTGGTTGACACTAGTGTATTCAATTT CAGATTTTATTGGAATTTAAAGGATTTTAAAAGTCTAGGTACATGCAATTAAGATTTCTG AAGAGTCCGGTAAATTTAGATACATTCAATTTAGATTTGTATTAATTATATTGAAATTCA TATAAATCTAAGTATATTAAATTCAGATTTGTTTAGATTCTACTGAAATCCACATAAATT TAAATGTATTTAATTCAAACTTTTAGAAAGTTTAAACAAATTTTAGATGTATTTAAAAAG TCATTGACTTTGTAGATTTTATATAAAGATGGAATTTAATTGATTTTAATGAATTTGAAA GTAGAATTTGTTTTAGAGCGTTCATTTGCAGGCTGGTGAATTTAATTCACCACTTCCAAA TATAACTAATTATATAACAAGATATATAATTACATTTTGGTAGAGAATAAATATATCAAA TCAGGGTTCAGTACTGTAAAGAATGAGCTAATAACCATAAAAAAAAAATACATTTCAAAT CCAATATCTCAATCTGGGTAATTTGGGTACGTAAATACATTAAAAGGCAGGCTTGGCCAT ATATAGAATAGTAGGATTATATGGTAACATTACATGGCGGTATGATCTAGAAGAAAATGA ACCATCTATAAAACGAGAGGTAATAGAATCTTGGCTCTCATCATAAGTACTTAGATCTCA TTACAAGATCCTTGGATCTCATATCGCTTTTGGGTTGTCTAGTGTAAGTATATTTGTATA TGCATAGAATCAAAATCAATTTCAATTTCAATTTTATTTTATTTTTTTTCAAGTTCATGA TTGTATATAATATATAATATTGGTTTTGATTTATATATCTAGATGATAAGTACTTGGCTT TTTTGTTTGGTATGTAAGAA
Download Copy
>LITCHI025168.m1 GenomeSequence + ATGGAGAGCACCATGAACAAGAAAACTACTGTCCCTACAAACCGATTGAAGTCAACAACT GACAGCAATGGTGGAAACTCTGGTCCTCTTAAGATGGAGCCAACCACGTCCGAAAATCCT GCTGTGGCTTCCAGCAGCCAGGACCCCAGACATGCTGATGATAAGAAGCTCAAAAGGTCG ATTTATTAAATACTTTTTTTTCCCCTAGTATCTCTAGTACATGTTTTATTTTGTGACATT TATACAACCATGATCTAGTGTTAATATATGATCCATTAGACACATACAATATATTGAGAT CGACAGATAATAACAATGTATTTTCATTTATTGATTCATTTTACAATCAATTATTTGTTA GATTCAATGTTAAAACTAGGGGTTTGGCTAACTTTTTGGTTTGGGTAAGGTTATTCAAAC TAGTTTCTTCAATAATAACTTTTATATTGGTTGTAATAGTGGTTATTTAAGAATTTTACA ATCAATCTAAGGGTGGTTATTGAAGATTCTTATTGAATAACCTTATCTAAACCACTAAAG TAACAAAACCCTTGATATTAGAATTTGCACATATGCTATTGATTATTTTCAAAATCATAG ATATTTGTATGTAGTTTGAAATATTAATCTCTCTTTATAGAAAATTTTCAAATTTGATTG CCGCCATTATTCTCACTCACAAAATGCATTTCACATGAAAAACCTAATTATTCACGCATC ATTCTAGCAATTTAACCCTAAACGGTTGTTTTTACATATCTATGTTTTTTCTGTGAAGCA GAATTCTTGCAAGCCGAGAGTATGCTCAGAAATCTCGATTCAGGCAGCAACAATATATTA TGCAACTCGAAGATCGAGTGAAATTTCTTAAAGTAATCAATTATTAACTAGGATATATAC ATTGTTTATTGTTATATATATATACATACAAATATGTTTTATATATGACATTTTAAAATC TTCACTATTCATGTACTTTGTTTCACATATATGCAGAATCAGATAGCAATTATGGCTCTA AACCTCAAACATATGAATAGTCATAATTCAATGTTGAAAGCAAAAAATGCTTCATTGAAG CAGCGACTCTCCGAATTGGCTGGTGAACTAACCCACAAACACGGTGACACTTGCTGATAT CTCTCGTGAACAATTAACACACGAATCACAAAAAATAACTACTAACCGCGATGAGATTAT AATTTGTGCAGCTCAATATGAAGAGCTGAAGAAAGAGAAGGAAGCAATGAAGCAATTGTA CGCGCATCAACAACGAACTCTACGTTATAATAATCAGAACATGAATATCCAATTCGGGCC TGCATGCCTAGATTTTGGATACCATCATGACTGTTAG