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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI020204 | Chr12 | 10767629 | 10773489 | - | Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 31 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI020204.m1 | 26 | 118 | PF05669.15 | Med31 | Family | 120.8 | 2.00E-35 |
LITCHI020204.m2 | 26 | 118 | PF05669.15 | Med31 | Family | 120.8 | 2.00E-35 |
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>LITCHI020204.m1 ATGGCGAAGGCTGAAGAAGCATCCTCTACTTCATCTTCGCCAAAGAGCATTTACAAAGAT TTAGATGATGGGCGACAACGGTTTTTGCTCGAGTTGGAATTCGTTCAATGCCTTGCTAAT CCCACCTACATTCACTATTTGGCTCAGAATCGCTATTTTGAAGATGAGGCATTTATTGGT TACTTAAAATACCTTCAGTACTGGCAACAGCCCGAGTATATCAAATTTATAATGTATCCT CATTGCCTTTTCTTCCTTGAACTTCTCCAAAATGCGAACTTCCGCAATGCTATGGCTCAT CCTGGCAACAAGGAATTGGCGCATAGGCAGCAATTCTTTTTCTGGAAGAACTACAGAAAC AATCGGTTAAAACACATTTTACCGAGGCCTCGTCCTGAACCTGTTGCTGCGCCACCACCT GCTACTCTTCCGCCTCAGCCTCCTGCACCACCTGTGCCAGCCACAACTATTCCTCCGACA GCTGCTACTGGTCCTGCTCATTCTCCTATGCAGTATGCTATTCCCCCAGGACCTGCTCTT GCAAAGAATGATATGAGGAGTAGTAGCATTGACCGAAGAAAAAGAAAGAAAGAAGGTTAA >LITCHI020204.m2 ATGGCGAAGGCTGAAGAAGCATCCTCTACTTCATCTTCGCCAAAGAGCATTTACAAAGAT TTAGATGATGGGCGACAACGGTTTTTGCTCGAGTTGGAATTCGTTCAATGCCTTGCTAAT CCCACCTACATTCACTATTTGGCTCAGAATCGCTATTTTGAAGATGAGGCATTTATTGGT TACTTAAAATACCTTCAGTACTGGCAACAGCCCGAGTATATCAAATTTATAATGTATCCT CATTGCCTTTTCTTCCTTGAACTTCTCCAAAATGCGAACTTCCGCAATGCTATGGCTCAT CCTGGCAACAAGGAATTGGCGCATAGGCAGCAATTCTTTTTCTGGAAGAACTACAGAAAC AATCGGTTAAAACACATTTTACCGAGGCCTCGTCCTGAACCTGTTGCTGCGCCACCACCT GCTACTCTTCCGCCTCAGCCTCCTGCACCACCTGTGCCAGCCACAACTATTCCTCCGACA GCTGCTACTGGTCCTGCTCATTCTCCTATGCAGTATGCTATTCCCCCAGGACCTGCTCTT GCAAAGAATGATATGAGGAGTAGTAGCATTGACCGAAGAAAAAGAAAGAAAGAAGGTTAA
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>LITCHI020204.m1 MAKAEEASSTSSSPKSIYKDLDDGRQRFLLELEFVQCLANPTYIHYLAQNRYFEDEAFIG YLKYLQYWQQPEYIKFIMYPHCLFFLELLQNANFRNAMAHPGNKELAHRQQFFFWKNYRN NRLKHILPRPRPEPVAAPPPATLPPQPPAPPVPATTIPPTAATGPAHSPMQYAIPPGPAL AKNDMRSSSIDRRKRKKEG. >LITCHI020204.m2 MAKAEEASSTSSSPKSIYKDLDDGRQRFLLELEFVQCLANPTYIHYLAQNRYFEDEAFIG YLKYLQYWQQPEYIKFIMYPHCLFFLELLQNANFRNAMAHPGNKELAHRQQFFFWKNYRN NRLKHILPRPRPEPVAAPPPATLPPQPPAPPVPATTIPPTAATGPAHSPMQYAIPPGPAL AKNDMRSSSIDRRKRKKEG.
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>LITCHI020204.m2 AATGAGAGAGTTTAAGATTCTTTGAATTCCAAACCCATTATTTTTCAATTGGTCTTCAAA TATGGTATTTAAGAAGTTTATGATTTTTGAATCCAAAACCCACTCTCATTGCCGTATTGA AAATCAAATCAGAAAGGAAATGGGCCTGCATTTGGGCCTGGGTGAATCAACCCTTGGTTT TTTTTTTTTTTTTGAAATAGAATCAGCCTGTTTTGTGACCAATTAAATGGAGAGTCGTCT TTTTGTATGAGAATTGCAGAGGCTTTGAAGCTGAGCTGAGCGCAATTTGAGTTTGCGATG GCGAAGGCTGAAGAAGCATCCTCTACTTCATCTTCGCCAAAGAGCATTTACAAAGATTTA GATGATGGGCGACAACGGTTTTTGCTCGAGTTGGAATTCGTTCAATGCCTTGCTAATCCC ACCTACATTCACTATTTGGCTCAGAATCGCTATTTTGAAGATGAGGCATTTATTGGTTAC TTAAAATACCTTCAGTACTGGCAACAGCCCGAGTATATCAAATTTATAATGTATCCTCAT TGCCTTTTCTTCCTTGAACTTCTCCAAAATGCGAACTTCCGCAATGCTATGGCTCATCCT GGCAACAAGGAATTGGCGCATAGGCAGCAATTCTTTTTCTGGAAGAACTACAGAAACAAT CGGTTAAAACACATTTTACCGAGGCCTCGTCCTGAACCTGTTGCTGCGCCACCACCTGCT ACTCTTCCGCCTCAGCCTCCTGCACCACCTGTGCCAGCCACAACTATTCCTCCGACAGCT GCTACTGGTCCTGCTCATTCTCCTATGCAGTATGCTATTCCCCCAGGACCTGCTCTTGCA AAGAATGATATGAGGAGTAGTAGCATTGACCGAAGAAAAAGAAAGAAAGAAGGTTAACGT GACCAACCATACCTTTCCAAATGTTCATGAGGAAATATTTCTGATGAGGTAATCTGTGTT TACTGCACTTGGTTAATGAGCCTGTGGAGATAGACACTAACTCTATATTATAAGTTTTAA AGCTACCCTGAACATTTCTAGAATGAAGTTGGAATTGTTGTATGTTTGTAATCATTCATT TTTATTAGTTTATAATATTGACATATTTATTCTGTCTCTGCATCACCTGCATTGACAAAA CCTATATTCTATGAAGTTTTTTGGACCACCAATTCATTCAATGCATAATGAACATAAATT TCAGGTCGGGGGAGGTTCCCCTCCTCCAGTTTCCCACGCTGCCTTGACTTATTGATGCCA ATGGTGGCGGTTTTGTTGTTGGGTCAGGGCAGGTGCCTCCAAACCCCCATCCTTGTTTCC CAATTTGACCTGAAATTTAAAAATAACCACAATTAAATATAATATTTTTCTCCCTTTAAT ATGATAACATTTCATCGTCATTTATATATAATCCCATTCGAATAACAATTTTCATACATA CAGTTCACTAGACTAACCGATTAATTTTAGTTCATAAGTCTCCTGTAAAAGTAAAGGAAA CCTGCTAACTCTACAAAAACAAATATTAATCTATCATTCAAGTATCACAAAATAAAACCC CCCTAGTAACAATCTCTTTCAATGTGACAAACGTTGAAGGAAATGAAAGATAAACCGTCA ATATTCAATAAGTGACAATATTTTCTTACATGATGAATGCTCAGATAAAATCTAAAATCA TTTAACTAAAATTATTGAAATAATATTCGGGGGTTGGGGAATTCAGGTTGGGGGATCCCA CCCTCACCCCTGTTAACATTTTGGTGTGAATGCACCTTTCCCCCACCACTGTCCCCTAAT TGGAACAGTACTTTTAATCTTGTCTGGGGGGTGGAGCCCTGTGGAGGTTTTTGACAACCC TAATTGAATCAACATGTGGCCGTGAAAAGTATCTCTGAAATGCTTGTGTTGTCTGCCTGA ACGAGATGGAAGATAAAGATGCCTCCGGTTTTGGTGGTAATTTAGAATTTTGTACTCAAG TCCTGGATTTCAATTTTCAGTTCACCTAGAAATCATGGATTAATACATCGAGACTTCCTG TAAGGATTTAAAAACTAGCAGTTTCTTTGCTGTCAAATATTATGTCATCAAAATTTAATG CATGTATCTATACGTTGATCTATAAAATGATTGGTGGTGTTCTCGTTCTGATTTTTTTGG CAACTGGGTCCTGTCACACGTTTTACTGTTGCAGTAAGGAACTTTATTGTCACCAGCAAA AATGTTCTGGTTGGTTGTTGAGTTGAACTCTGCTTAATTGTGCATGGGTATAAACATCAG AGAATTTAAGCACAAAGTATTCCTTATTCTAAGAGACAAAATGTAAGTGATGTTACATGC TTTGGTCATGGAGAAACATTACCATTCGAAGTGTTTGCTTAAAATAGTTCCAATGATGCA TTTAATGAAACGTTACGTTTTCTGGATCAGTATGGTAAATACTGAGTCTCATATGTTCCT CTTCGTAACTGAAATATTCATTAGTAGAGTGGAGTTTAATCGCAGTTACACTCGAGTTTT AGAGTGTAGATCAATTTGTAGGTCAATTGGCTAATTATCATTGGGATGATTTCTTGTTGC ATGATGTGTAATTGATTCAAACAATATGATCGAAGTTGTAGAACTGAGTTGTTATTTTCT TGTTTCAACCTAGCATGTTATTGCTTTAATAAATTCCTGTATAGGTTACTATCTAATTGA TACATCCACTTTCTGCGGTTTAATATTGACAAAAATGCTATGAGTAGGTGATGCGGATAG AACCCTGATCGCCTACAAAGGAAAAAAGCTCAAGAAATGTTGGTGCAGACTCCTATAAGA ATATATGTAGGTAAGAATCAAATTAAGCATATATCTGTATTTAATCTTATCTATACTAGA TAAGATTAAGAAGAACAACTTTGAAGATGTGACGCGGCGGTGGGCTAAATCTCACTCTCA ACCAAGCTGTGATGGAAACGATTTTTTTTTTCATTTGGTTTTTTCTTAGTTATAATGTAA CAACCCTTTTTTGTAGAGATAATCAGTGATGCCATTGGTCAGGCCACTGACCTTTGTGCT TTGAAGGCGCAAGTTCTATTCTCAATAAAGATAGTCTTCTACCATATAAAAA >LITCHI020204.m1 AATGAGAGAGTTTAAGATTCTTTGAATTCCAAACCCATTATTTTTCAATTGGTCTTCAAA TATGGTATTTAAGAAGTTTATGATTTTTGAATCCAAAACCCACTCTCATTGCCGTATTGA AAATCAAATCAGAAAGGAAATGGGCCTGCATTTGGGCCTGGGTGAATCAACCCTTGGTTT TTTTTTTTTTTTTGAAATAGAATCAGCCTGTTTTGTGACCAATTAAATGGAGAGTCGTCT TTTTGTATGAGAATTGCAGAGGCTTTGAAGCTGAGCTGAGCGCAATTTGAGTTTGCGATG GCGAAGGCTGAAGAAGCATCCTCTACTTCATCTTCGCCAAAGAGCATTTACAAAGATTTA GATGATGGGCGACAACGGTTTTTGCTCGAGTTGGAATTCGTTCAATGCCTTGCTAATCCC ACCTACATTCACTATTTGGCTCAGAATCGCTATTTTGAAGATGAGGCATTTATTGGTTAC TTAAAATACCTTCAGTACTGGCAACAGCCCGAGTATATCAAATTTATAATGTATCCTCAT TGCCTTTTCTTCCTTGAACTTCTCCAAAATGCGAACTTCCGCAATGCTATGGCTCATCCT GGCAACAAGGAATTGGCGCATAGGCAGCAATTCTTTTTCTGGAAGAACTACAGAAACAAT CGGTTAAAACACATTTTACCGAGGCCTCGTCCTGAACCTGTTGCTGCGCCACCACCTGCT ACTCTTCCGCCTCAGCCTCCTGCACCACCTGTGCCAGCCACAACTATTCCTCCGACAGCT GCTACTGGTCCTGCTCATTCTCCTATGCAGTATGCTATTCCCCCAGGACCTGCTCTTGCA AAGAATGATATGAGGAGTAGTAGCATTGACCGAAGAAAAAGAAAGAAAGAAGGTTAACGT GACCAACCATACCTTTCCAAATGTTCATGAGGAAATATTTCTGATGAGGTGATGCGGATA GAACCCTGATCGCCTACAAAGGAAAAAAGCTCAAGAAATGTTGGTGCAGACTCCTATAAG AATATATGTAGGTAAGAATCAAATTAAGCATATATCTGTATTTAATCTTATCTATACTAG ATAAGATTAAGAAGAACAACTTTGAAGATGTGACGCGGCGGTGGGCTAAATCTCACTCTC AACCAAGCTGTGATGGAAACGATTTTTTTTTTCATTTGGTTTTTTCTTAGTTATAATGTA ACAACCCTTTTTTGTAGAGATAATCAGTGATGCCATTGGTCAGGCCACTGACCTTTGTGC TTTGAAGGCGCAAGTTCTATTCTCAATAAAGATAGTCTTCTACCATATAAAAA
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>LITCHI020204.m1 - Up_Stream_Len 2000 GATGGGGATTTAACTATGGTGAGGGTGAGGGTCCTGAGATGATGTGCAAAAATTGGTATT ACACTAATCGTCTATCGTTTTTCCTCCTTTCAAGACGTTGACTCTCAGTCTGCATATAGT TGGACAACCTTTGCTGGGTTTTAAAGCTTTTTATGGCTTGTTTCGGGATGAATTTTATAT GGATGTTATTGGATTTTTTTATTCAAAAATCTTATTTTAAGATCAATTGAATTTTATTAC TTGAGCAATTTCTATAATATTAATGACTTTTATAATACATTAAAATTTGTTTGAAGTTTT TAAAAGTTTGAATTGAATACATATAGATTTTAATAAAATTTATGAAATCTTTATTGAATA TTTTAAAAATTTTGATGCATTCAATCCAAACTTTTAAAGAATCTAAACAAATGTAGGTGT ATTAAAAAAGTTAATGATTTTATATATTTTAATTAAGTGATAAAACCTTATGATGGATTG CATAATGAGATTTATGAATAAAAAAGTTTATAACAAGTTTTGTCATATTATAGATTTCTT ATGGAGTTTTAACAAAATCCATATGGAATCGATGAAATTTATGGATTTTATCAAAATTTA CCATTAAGAATAAAAAATCTATATGGCTCTAACAAACTTTAGATTATATACATTACAATT TCTCATGGACTTTTAAGTTATTTAAATTTCAATGAAATATAAATTGAATGGACTTGTTTT TTTTTTCAATTATATTTAATTCAAGTTTTAAGGAAAATGAACATGATTTGAATTCATGAT CTTATGGCATAAATAAGATGGGGATATCATTAGACCAATCTTAGTTTGTTTTGAAAACAC CCTTTTATTTTCTTAGCTTTTTACAAAAGTTAATATAAAAATAAAATATTTTAATTTATA TTTGGTATGAATTATGAACATCATTTTGTATAATTAAGGTTAAGATATAAATCTATTTTT ATTAAAATTAATAAAGATGGCGACTTTCAAAAGATTTATTAAATCCCATGACAAATTATT TTATAATCATTTTACAAAAATAGCATTCGCCTACTTTAAAAGTAATAACAAATTCACTCA TGTTATTAAATAATTACTTTTAAAAGTTTACCAAACACCTTTTTTATTAAAAAATTATTA ATAATTATATTTAACTTCTTAAAAGCATTATCAAAAGAAGCTTAAAGTATAAATAGTTTT CAATAAATATAATCAATTTATATAAAATTTACTTAACGTATGCATACTTTCATATTGCTT TCGAGTTTTATAATAGTTTCAACAATAAAATTAATTAAACACCAGTCTAATTAATTTTAG CGTAGATAAATTTCCTTAGCATAACTAAAAGTGATTATATTAAAAGTTATGGTAATACCA AACTGGTATAGTACTCTTCCAAAAAAAATTAATTAAATTAATAAAATTTGACCAATAATT AAATGCTTCTTTCTTGAAACCAATTAAATGTTTCTTTCAATATGTTAACAGTATGTAAGT ATTATTCTCAATATATATATATATATATATATATATATAGTTATCACCATGTGCGAATGG GTAACGTTTATTCAAACAGTAAATTTTCTGCTTTCGGCACATAATTGAGAATTTATTAAT TTGAAAATATATATGCAGACTACAAAATATATCATTAAGGGCATGTTTGACATAGAGGAA TGAGAATTACTAAAAGATTGAGAAATGAGAGAGTTTAAGATTCTTTGAATTCCAAACCCA TTATTTTTCAATTGGTCTTCAAATATGGTATTTAAGAAGTTTATGATTTTTGAATCCAAA ACCCACTCTCATTGCCGTATTGAAAATCAAATCAGAAAGGAAATGGGCCTGCATTTGGGC CTGGGTGAATCAACCCTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATAGAATCAGCCTGTTTTGTG ACCAATTAAATGGAGAGTCGTCTTTTTGTATGAGAATTGCAGAGGCTTTGAAGCTGAGCT GAGCGCAATTTGAGTTTGCG >LITCHI020204.m2 - Up_Stream_Len 2000 GATGGGGATTTAACTATGGTGAGGGTGAGGGTCCTGAGATGATGTGCAAAAATTGGTATT ACACTAATCGTCTATCGTTTTTCCTCCTTTCAAGACGTTGACTCTCAGTCTGCATATAGT TGGACAACCTTTGCTGGGTTTTAAAGCTTTTTATGGCTTGTTTCGGGATGAATTTTATAT GGATGTTATTGGATTTTTTTATTCAAAAATCTTATTTTAAGATCAATTGAATTTTATTAC TTGAGCAATTTCTATAATATTAATGACTTTTATAATACATTAAAATTTGTTTGAAGTTTT TAAAAGTTTGAATTGAATACATATAGATTTTAATAAAATTTATGAAATCTTTATTGAATA TTTTAAAAATTTTGATGCATTCAATCCAAACTTTTAAAGAATCTAAACAAATGTAGGTGT ATTAAAAAAGTTAATGATTTTATATATTTTAATTAAGTGATAAAACCTTATGATGGATTG CATAATGAGATTTATGAATAAAAAAGTTTATAACAAGTTTTGTCATATTATAGATTTCTT ATGGAGTTTTAACAAAATCCATATGGAATCGATGAAATTTATGGATTTTATCAAAATTTA CCATTAAGAATAAAAAATCTATATGGCTCTAACAAACTTTAGATTATATACATTACAATT TCTCATGGACTTTTAAGTTATTTAAATTTCAATGAAATATAAATTGAATGGACTTGTTTT TTTTTTCAATTATATTTAATTCAAGTTTTAAGGAAAATGAACATGATTTGAATTCATGAT CTTATGGCATAAATAAGATGGGGATATCATTAGACCAATCTTAGTTTGTTTTGAAAACAC CCTTTTATTTTCTTAGCTTTTTACAAAAGTTAATATAAAAATAAAATATTTTAATTTATA TTTGGTATGAATTATGAACATCATTTTGTATAATTAAGGTTAAGATATAAATCTATTTTT ATTAAAATTAATAAAGATGGCGACTTTCAAAAGATTTATTAAATCCCATGACAAATTATT TTATAATCATTTTACAAAAATAGCATTCGCCTACTTTAAAAGTAATAACAAATTCACTCA TGTTATTAAATAATTACTTTTAAAAGTTTACCAAACACCTTTTTTATTAAAAAATTATTA ATAATTATATTTAACTTCTTAAAAGCATTATCAAAAGAAGCTTAAAGTATAAATAGTTTT CAATAAATATAATCAATTTATATAAAATTTACTTAACGTATGCATACTTTCATATTGCTT TCGAGTTTTATAATAGTTTCAACAATAAAATTAATTAAACACCAGTCTAATTAATTTTAG CGTAGATAAATTTCCTTAGCATAACTAAAAGTGATTATATTAAAAGTTATGGTAATACCA AACTGGTATAGTACTCTTCCAAAAAAAATTAATTAAATTAATAAAATTTGACCAATAATT AAATGCTTCTTTCTTGAAACCAATTAAATGTTTCTTTCAATATGTTAACAGTATGTAAGT ATTATTCTCAATATATATATATATATATATATATATATAGTTATCACCATGTGCGAATGG GTAACGTTTATTCAAACAGTAAATTTTCTGCTTTCGGCACATAATTGAGAATTTATTAAT TTGAAAATATATATGCAGACTACAAAATATATCATTAAGGGCATGTTTGACATAGAGGAA TGAGAATTACTAAAAGATTGAGAAATGAGAGAGTTTAAGATTCTTTGAATTCCAAACCCA TTATTTTTCAATTGGTCTTCAAATATGGTATTTAAGAAGTTTATGATTTTTGAATCCAAA ACCCACTCTCATTGCCGTATTGAAAATCAAATCAGAAAGGAAATGGGCCTGCATTTGGGC CTGGGTGAATCAACCCTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATAGAATCAGCCTGTTTTGTG ACCAATTAAATGGAGAGTCGTCTTTTTGTATGAGAATTGCAGAGGCTTTGAAGCTGAGCT GAGCGCAATTTGAGTTTGCG
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>LITCHI020204.m1 GenomeSequence - AATGAGAGAGTTTAAGATTCTTTGAATTCCAAACCCATTATTTTTCAATTGGTCTTCAAA TATGGTATTTAAGAAGTTTATGATTTTTGAATCCAAAACCCACTCTCATTGCCGTATTGA AAATCAAATCAGAAAGGAAATGGGCCTGCATTTGGGCCTGGGTGAATCAACCCTTGGTTT TTTTTTTTTTTTTGAAATAGAATCAGCCTGTTTTGTGACCAATTAAATGGAGAGTCGTCT TTTTGTATGAGAATTGCAGAGGCTTTGAAGCTGAGCTGAGCGCAATTTGAGTTTGCGATG GCGAAGGCTGAAGAAGCATCCTCTACTTCATCTTCGTAAGTGCCTTCTACTTTTGATCTC TCTCTTTATAGACTAATACCTAAAAACAAAATAAACGATTTGATAGGCCAAAGAGCATTT ACAAAGATTTAGATGATGGGCGACAACGGTTTTTGCTCGAGTTGGAATTCGTTCAATGCC TTGCTAATCCCACCTACATTCACTGTACGTTTGTTTACTCCTTATTGCTACTTTCCAACT GCAATTTTATAGTCCTTTTACGCTTGTTTCTCTAGATTCTAGCTTCGATGGCATTTCTTT AAACTATAATTTTTATTTTGAATTGATAGCCTTCTCGTGATATTCAGGCTATGAAAGTAG TGATTAATCTCGGCATATCCTAGTAGACTTTTGATCTGTTCGGTATTAGCTTTCGAAATT AAAAAAAAGAAAAAAAGAAAAAATGATTTGATTAATTAGTGCTACCTGTCAAAATTCTTA AAATCCGGATTGTGAGGAGAAAGTGGCAAAGTGCTTATAAGTCCTTGACTCATGTCATAT TTAGTCAACGTCAAATTCCAGACTACTGATCCCGTATGCTTAGTTAATTTGTGATCCTTA 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