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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI020172 | Chr12 | 10234074 | 10241791 | - | Regulatory protein NPR3 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI020172.m1 | 65 | 147 | PF00651.34 | BTB | Domain | 42.3 | 7.70E-11 |
| LITCHI020172.m1 | 224 | 272 | PF11900.11 | DUF3420 | Repeat | 48.4 | 8.00E-13 |
| LITCHI020172.m1 | 272 | 354 | PF12796.10 | Ank_2 | Repeat | 35.6 | 1.20E-08 |
| LITCHI020172.m1 | 371 | 501 | PF12313.11 | NPR1_like_C | Family | 152.1 | 1.50E-44 |
| LITCHI020172.m2 | 44 | 92 | PF11900.11 | DUF3420 | Repeat | 48.9 | 6.00E-13 |
| LITCHI020172.m2 | 92 | 174 | PF12796.10 | Ank_2 | Repeat | 36 | 8.60E-09 |
| LITCHI020172.m2 | 191 | 395 | PF12313.11 | NPR1_like_C | Family | 278.7 | 2.70E-83 |
| LITCHI020172.m3 | 44 | 92 | PF11900.11 | DUF3420 | Repeat | 48.9 | 6.00E-13 |
| LITCHI020172.m3 | 92 | 174 | PF12796.10 | Ank_2 | Repeat | 36 | 8.60E-09 |
| LITCHI020172.m3 | 191 | 395 | PF12313.11 | NPR1_like_C | Family | 278.7 | 2.70E-83 |
| LITCHI020172.m4 | 65 | 147 | PF00651.34 | BTB | Domain | 42 | 1.00E-10 |
| LITCHI020172.m4 | 224 | 272 | PF11900.11 | DUF3420 | Repeat | 48.2 | 9.70E-13 |
| LITCHI020172.m4 | 272 | 354 | PF12796.10 | Ank_2 | Repeat | 35.2 | 1.50E-08 |
| LITCHI020172.m4 | 371 | 575 | PF12313.11 | NPR1_like_C | Family | 277.5 | 6.20E-83 |
| LITCHI020172.m5 | 65 | 147 | PF00651.34 | BTB | Domain | 42.2 | 8.30E-11 |
| LITCHI020172.m5 | 224 | 272 | PF11900.11 | DUF3420 | Repeat | 48.4 | 8.40E-13 |
| LITCHI020172.m5 | 272 | 354 | PF12796.10 | Ank_2 | Repeat | 35.5 | 1.20E-08 |
| LITCHI020172.m5 | 371 | 501 | PF12313.11 | NPR1_like_C | Family | 152 | 1.60E-44 |
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>LITCHI020172.m1 ATGATGGAAAATGGAAACGAACTGTCATCGTCTCTGAGCTTTGCCTCATCTTCTTGTCTC TCAAATGGGTCAAGTAGTCTCAACATAACTCCCCCTACTACAGATCCTGAACTTGCACCA AATCTCGATAATTTAAGCTTGAACAAGCTCAGTAGCAGCCTCGAGAAGCTCTTAATCGAC ACCGAGTATGGCTACACCGACGCAGAGATCGTCGTTGAGGGGATTCCAGTGGGTGTCCAC CGCTGTGTGTTGGCTTCAAGGAGCCTGTTTTTTCATGAGCTTTTCAAAAAGGGTTCAGTC AATGAAGGAAAACCAAAGTATCTGATGTCTGAATTGGTGCCTGATGGAGAGGTTGGATAT GCAGCTTTTAAGGACTTCTTGAACTATTTGTACACTGCAAAGCTGAAGCCACCCCCTCCG GAAGTCTCCACCTGTGTTGATGAGGCTTGTGTTCATGACGCTTGCCGCCCTGCTATCAGT TATGCTATCCAGTTGATGTATGCTTCTGCAACTTTTCAGATGAAAGAACTCGTTTTGCTT TTTCAGCGTCGGCTTCTGAACTTTATTGGGAAGGCATTTGTGGAAGATGTGATCCCAATT CTGATGGCTGCATTCCATTGCCAACTAGACCAGCTTCGCTCTCACTGCATCCAGAGAATT ATGAGGTCTGATCTTGAAAATGCATGTCTCGAGAGAGAGCTTCCTCCTGATGTCTATAGT GAAATCAAATCACTTCGCTCCAAATCTCTGCAGGAGTCTGAAGGCATTGTAGGGGAAGCA GACTCTATCCATGAGAGGAGAATCAGGAAAATCCACAAGGCACTAGACTCTGATGATATT GAACTCTTGAAACTTCTCCTAAGTGAATCTAATGTCACTTTAGATGATGCTTGTGCTCTG CACTATGCTGCCGCCTATTGTGATCCAAAGGTTGTGAAGGAGGTCCTCAGTCTGGAAATG GCTGATCTCAATCTTAGGAACACTAGAGGACATACAGTGCTTCATGTGGCTGCAAGGCAT AAGGAGCCATCAACTATAGTAGCACTGCTGAACAAGGGAGCCTTCGCATCAGAAACTACA TTGGATGGGCAAACTGCTGTTGCAATCTGTCGGAGGATGACCAGGCCAAAGGATTACAAT GAAAATACAGAAAAGGGTAAGGTGTCTAACAAAGATAAGATGTGCATTGATGTCCTGGAG GGAGAAATGAGAAGGAATTCAATGTCTGGGACCATGTCAATGCCAATGTCATCACAGGTG CCAGCTGATGACTTACTCATGAGGCTGGACTATCTGGAAAACAGAGTGGCATTTGCACGA TTGCTGTTTCCTGCTGAAGCTAAACTAGCTATGGACATAGCTGATGCACATTCAACCTTA CCTGGCATTACAGCATCAAGGTCAAAAGGATCAAGTGGGAACCTTAAAGAGGTTGATTTG AATGAGAAACCCTCTGAGCAAGCCAAGAGAATCCAATTGAGAATGCAAGCTTTGCGTAAA ACAGGAAAGAACTTAATACAAGGGTAG >LITCHI020172.m2 ATGCAGCGTCGGCTTCTGAACTTTATTGGGAAGGCATTTGTGGAAGATGTGATCCCAATT CTGATGGCTGCATTCCATTGCCAACTAGACCAGCTTCGCTCTCACTGCATCCAGAGAATT ATGAGGTCTGATCTTGAAAATGCATGTCTCGAGAGAGAGCTTCCTCCTGATGTCTATAGT GAAATCAAATCACTTCGCTCCAAATCTCTGCAGGAGTCTGAAGGCATTGTAGGGGAAGCA GACTCTATCCATGAGAGGAGAATCAGGAAAATCCACAAGGCACTAGACTCTGATGATATT GAACTCTTGAAACTTCTCCTAAGTGAATCTAATGTCACTTTAGATGATGCTTGTGCTCTG CACTATGCTGCCGCCTATTGTGATCCAAAGGTTGTGAAGGAGGTCCTCAGTCTGGAAATG GCTGATCTCAATCTTAGGAACACTAGAGGACATACAGTGCTTCATGTGGCTGCAAGGCAT AAGGAGCCATCAACTATAGTAGCACTGCTGAACAAGGGAGCCTTCGCATCAGAAACTACA TTGGATGGGCAAACTGCTGTTGCAATCTGTCGGAGGATGACCAGGCCAAAGGATTACAAT GAAAATACAGAAAAGGGTAAGGTGTCTAACAAAGATAAGATGTGCATTGATGTCCTGGAG GGAGAAATGAGAAGGAATTCAATGTCTGGGACCATGTCAATGCCAATGTCATCACAGGTG CCAGCTGATGACTTACTCATGAGGCTGGACTATCTGGAAAACAGAGTGGCATTTGCACGA TTGCTGTTTCCTGCTGAAGCTAAACTAGCTATGGACATAGCTGATGCACATTCAACCTTA CCTGGCATTACAGCATCAAGGTCAAAAGGATCAAGTGGGAACCTTAAAGAGGTTGATTTG AATGAGAAACCCTCTGAGCAAGCCAAGAGAATCCAATTGAGAATGCAAGCTTTGCGTAAA ACAGTTGAGACTGGTCGACGCTTCTTCCCTCATTGCTCAGAAGCGATTGATAAATTTTTG GATGATGACATGCCTGATGCTTTACTCCTAGAGAAGGGCAGTCCTGAAGAACAGAAAAAT AAGAAGATGCGCTTCATGGAGCTTAAAGAGGACGTTCAGAAGGCATTTTCCAAGGACATG GCTGAGAACAACCGGTCTGGTTTGACCTCATCCTCCTCATCATCATCTTCGCCAAAGGAG GGTGCCAAATACAGGGTTAGGAAAAGGTGA >LITCHI020172.m3 ATGCAGCGTCGGCTTCTGAACTTTATTGGGAAGGCATTTGTGGAAGATGTGATCCCAATT 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>LITCHI020172.m2 TCTTATATGAGATTATTTTACAATTGAATAAAAAAATGAGTTGATGATAAAACTAAAAAA TTTCAATAAAAGAGACAAAAGAAAGAATATATATATATATATATATACACTATTTTAATC CCAGTTTCACCCTATCAACTGCAAGACAAATAATTCATGATTTTCTCGCTAAATCCTGTC GGTAGTTTTCTCCTCCTCTACTAAAACAAAAACCAAAAAAGCTTCCAAGTCAACTTTGCT GCCAAGTCCCATGTTAAGCTCTTCTTTCATGTTCATCTGAACCGATCTGCTTCATTGATG ATGTCCCACTAGACTCAAAAGTCGTCTCTCTAAAGTACTCTTTTCAAAGCTTTCCTTCCT CTGGGTTTGTTCTGTTTTTCTTTTTATTCTTCTTCAAAGTCTGTCTGTTTTGACTGTCTT TTATCCATCTTCAAGTCTGCTTTTGTTTTTCATCTGTTAGACATACCACCACCACCATGA TTCTCTTCAAATTTGTTAATTTCATGACCTTCTTTTATTTTGGCGTCGGATAGGTGTTGT AGTCTTTGAAAACTATATCAGATACTTGTCTTGGTCTCTCTATATGATGGAAAATGGAAA CGAACTGTCATCGTCTCTGAGCTTTGCCTCATCTTCTTGTCTCTCAAATGGGTCAAGTAG TCTCAACATAACTCCCCCTACTACAGATCCTGAACTTGCACCAAATCTCGATAATTTAAG CTTGAACAAGCTCAGTAGCAGCCTCGAGAAGCTCTTAATCGACACCGAGTATGGCTACAC CGACGCAGAGATCGTCGTTGAGGGGATTCCAGTGGGTGTCCACCGCTGTGTGTTGGCTTC AAGGAGCCTGTTTTTTCATGAGCTTTTCAAAAAGGGTTCAGTCAATGAAGGAAAACCAAA GTATCTGATGTCTGAATTGGTGCCTGATGGAGAGGTTGGATATGCAGCTTTTAAGGACTT 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