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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI020170 | Chr12 | 10185249;10185563;10185713;10185740 | 10188658;10188706;10188729 | + | Putative Myb family transcription factor At1g14600 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI020170.m1 | 19 | 70 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 27 | 4.30E-06 |
LITCHI020170.m4 | 25 | 76 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 26.9 | 4.60E-06 |
LITCHI020170.m8 | 25 | 76 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 26.9 | 4.50E-06 |
LITCHI020170.m9 | 25 | 76 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 27.6 | 2.70E-06 |
LITCHI020170.m14 | 25 | 76 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 28.6 | 1.30E-06 |
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>LITCHI020170.m1 ATGAGAAATTCTCAGAGAACTGGAGTGAGGCAGTACAACAAATCTGAATTTCCACGTCTG AAGTGGACACCTGATCTTCATGGACACTTCACTGATGCTGTTCAAATCCTTGGAGGAAAA TCTAAGGCAACACCGAAGCGCATTTTGCAGATGATGAATGTAAAGGGACTGAAGATTTCT CACATCAAAAGCCATCTACAGATGTATAGAAGCACAACGAAGCCTAATGCTCGCAATAAA GTTGCTATGCCGATCATGAAGCACTTGAAAATACAAAGGACAGTTGTTAATGATGGTGGA TTATTGTCCCTTAGCTCCCCGCCGAGGCAAGTAACGGATTGGGAATACAATAACAGCAGC AATATCAAATATGAAACCTATTCTGATGAAAGCAATGGCCTTCTGCTGACAAAAAATGTT GTAGATTGTGAAGATGAGATCCAGGATTCACATACAACCTCATCACTTGGTAAAATCAGC AAGGAAGAAGAATTTGGAGGACTAAATGAAATTTGTGAGCTCTCATTATCTTTCACACCT TCAATGGTGATGCAAAGTGATCATGAAGTGAGGGAGTCATGGCCTTCAAATGACAGGCAC AGTCACCAATCTGGTTCAATATATAATCCTTTCACTATTGCAGATCTTCATGAATCTCTC GAGTCCAACAATCACTTAAACTTGGATCTAACCATTTGA >LITCHI020170.m2 ATGATGAATGTAAAGGGACTGAAGATTTCTCACATCAAAAGCCATCTACAGATGTATAGA AGCACAACGAAGCCTAATGCTCGCAATAAAGTTGCTATGCCGATCATGAAGCACTTGAAA ATACAAAGGACAGTTGTTAATGATGGTGGATTATTGTCCCTTAGCTCCCCGCCGAGGCAA GTAACGGATTGGGAATACAATAACAGCAGCAATATCAAATATGAAACCTATTCTGATGAA 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>LITCHI020170.m14 ATGAAAACCAGAGAAACCATGAGAAATTCTCAGAGAACTGGAGTGAGGCAGTACAACAAA TCTGAATTTCCACGTCTGAAGTGGACACCTGATCTTCATGGACACTTCACTGATGCTGTT CAAATCCTTGGAGGAAAATCTAAGGCAACACCGAAGCGCATTTTGCAGATGATGAATGTA AAGGGACTGAAGATTTCTCACATCAAAAGCCATCTACAGATGTATAGAAGCACAACGAAG CCTAATGCTCGCAATAAAGTTGCTATGCCGATCATGAAGCACTTGAAAATACAAAGGACA GTTGTTAATGATGGTGGATTATTGTCCCTTAGCTCCCCGCCGAGGTACATTTTCTTTATT GTTTATCTTCTCAATTGTTAA
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>LITCHI020170.m1 MRNSQRTGVRQYNKSEFPRLKWTPDLHGHFTDAVQILGGKSKATPKRILQMMNVKGLKIS HIKSHLQMYRSTTKPNARNKVAMPIMKHLKIQRTVVNDGGLLSLSSPPRQVTDWEYNNSS NIKYETYSDESNGLLLTKNVVDCEDEIQDSHTTSSLGKISKEEEFGGLNEICELSLSFTP SMVMQSDHEVRESWPSNDRHSHQSGSIYNPFTIADLHESLESNNHLNLDLTI. >LITCHI020170.m2 MMNVKGLKISHIKSHLQMYRSTTKPNARNKVAMPIMKHLKIQRTVVNDGGLLSLSSPPRQ VTDWEYNNSSNIKYETYSDESNGLLLTKNVVDCEDEIQDSHTTSSLGKISKEEEFGGLNE ICELSLSFTPSMVMQSDHEVRESWPSNDRHSHQSGSIYNPFTIADLHESLESNNHLNLDL TI. >LITCHI020170.m3 MYRSTTKPNARNKVAMPIMKHLKIQRTVVNDGGLLSLSSPPRQVTDWEYNNSSNIKYETY SDESNGLLLTKNVVDCEDEIQFLQDSHTTSSLGKISKEEEFGGLNEICELSLSFTPSMVM QSDHEVRESWPSNDRHSHQSGSIYNPFTIADLHESLESNNHLNLDLTI. >LITCHI020170.m4 MKTRETMRNSQRTGVRQYNKSEFPRLKWTPDLHGHFTDAVQILGGKSKATPKRILQMMNV KGLKISHIKSHLQMYRSTTKPNARNKVAMPIMKHLKIQRTVVNDGGLLSLSSPPRQVTDW EYNNSSNIKYETYSDESNGLLLTKNVVDCEDEIQFLQDSHTTSSLGKISKEEEFGGLNEI CELSLSFTPSMVMQSDHEVRESWPSNDRHSHQSGSIYNPFTIADLHESLESNNHLNLDLT I. >LITCHI020170.m5 MKTRETMRNSQRTGVRQYNKSEFPRLKWTPDLHGHFTDAVQILGGKSKATPKRILQMMNV KGLKISHIKSHLQHLKIQRTVVNDGGLLSLSSPPRQVTDWEYNNSSNIKYETYSDESNGL LLTKNVVDCEDEIQDSHTTSSLGKISKEEEFGGLNEICELSLSFTPSMVMQSDHEVRESW PSNDRHSHQSGSIYNPFTIADLHESLESNNHLNLDLTI. >LITCHI020170.m6 MYRSTTKPNARNKVAMPIMKHLKIQRTVVNDGGLLSLSSPPRQVTDWEYNNSSNIKYETY SDESNGLLLTKNVVDCEDEIQFLQDSHTTSSLGKISKEEEFGGLNEICELSLSFTPSMVM QSDHEVRESWPSNDRHSHQSGSIYNPFTIADLHESLESNNHLNLDLTI. >LITCHI020170.m7 MYRSTTKPNARNKVAMPIMKHLKIQRTVVNDGGLLSLSSPPRQVTDWEYNNSSNIKYETY SDESNGLLLTKNVVDCEDEIQFLQDSHTTSSLGKISKEEEFGGLNEICELSLSFTPSMVM QSDHEVRESWPSNDRHSHQSGSIYNPFTIADLHESLESNNHLNLDLTI. >LITCHI020170.m8 MKTRETMRNSQRTGVRQYNKSEFPRLKWTPDLHGHFTDAVQILGGKSKATPKRILQMMNV KGLKISHIKSHLQMYRSTTKPNARNKVAMPIMKHLKIQRTVVNDGGLLSLSSPPRQVTDW EYNNSSNIKYETYSDESNGLLLTKNVVDCEDEIQDSHTTSSLGKISKEEEFGGLNEICEL SLSFTPSMVMQSDHEVRESWPSNDRHSHQSGSIYNPFTIADLHESLESNNHLNLDLTI. >LITCHI020170.m9 MKTRETMRNSQRTGVRQYNKSEFPRLKWTPDLHGHFTDAVQILGGKSKATPKRILQMMNV KGLKISHIKSHLQMYRSTTKPNARNKVAMPIMKHLKIQRTVVNDGGLLSLSSPPRQVTDW EYNNSSNIKYETYSDESNGLLLTKNVVDCEDEIQVFMFNMECKHHYPLYIFSDHFGNLAV . >LITCHI020170.m10 MYRSTTKPNARNKVAMPIMKHLKIQRTVVNDGGLLSLSSPPRQVTDWEYNNSSNIKYETY SDESNGLLLTKNVVDCEDEIQFLQDSHTTSSLGKISKEEEFGGLNEICELSLSFTPSMVM QSDHEVRESWPSNDRHSHQSGSIYNPFTIADLHESLESNNHLNLDLTI. >LITCHI020170.m11 MYRSTTKPNARNKVAMPIMKHLKIQRTVVNDGGLLSLSSPPRQVTDWEYNNSSNIKYETY SDESNGLLLTKNVVDCEDEIQFLQDSHTTSSLGKISKEEEFGGLNEICELSLSFTPSMVM QSDHEVRESWPSNDRHSHQSGSIYNPFTIADLHESLESNNHLNLDLTI. >LITCHI020170.m12 MYRSTTKPNARNKVAMPIMKHLKIQRTVVNDGGLLSLSSPPRQVTDWEYNNSSNIKYETY SDESNGLLLTKNVVDCEDEIQFLQDSHTTSSLGKISKEEEFGGLNEICELSLSFTPSMVM QSDHEVRESWPSNDRHSHQSGSIYNPFTIADLHESLESNNHLNLDLTI. >LITCHI020170.m13 MYRSTTKPNARNKVAMPIMKHLKIQRTVVNDGGLLSLSSPPRQVTDWEYNNSSNIKYETY SDESNGLLLTKNVVDCEDEIQFLQDSHTTSSLGKISKEEEFGGLNEICELSLSFTPSMVM QSDHEVRESWPSNDRHSHQSGSIYNPFTIADLHESLESNNHLNLDLTI. >LITCHI020170.m14 MKTRETMRNSQRTGVRQYNKSEFPRLKWTPDLHGHFTDAVQILGGKSKATPKRILQMMNV KGLKISHIKSHLQMYRSTTKPNARNKVAMPIMKHLKIQRTVVNDGGLLSLSSPPRYIFFI VYLLNC.
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>LITCHI017729.m1 ATTCTTGTTGACTTGGGATGAGTTAAAAGACAAATTTTTTTCTCCCGTCAACTAACCAAA CAAATAATAGAGACTTGGAATTCTACAAATGAGGGCTTAATTGTTCCTTGGAATCATCAT ATTTACTGCCGTGGTTGAAGGGGTTGACCATCCTTGTCTGTCCTTTCCATACCGTTTGCG ACGCACCAAGAATGTGACCTACTGCCATTGTTCACTATATTTTCATGCTATTCGCTAGCA ATGTTGAAGAACAAACCATGTATCACATCTTTTAGGAAAGCCAGAGTTGTAACCAGAGCA ACAAACTAATCCTCCCAAAATGTCAAAAATATCCATAACATCTCTACCAATCCTACTCTA CCCCACTCTTCTACTGCTCTTCCTCAGCCATGCAAACTCCCAACTCTACGATGAAGAACA TGCAATCCTGCTCAAACTAAAGAAGGAATGGCATGATCCACCACTTATCAACCACTGGAC TGCATCAAACTCCACCTCCCACTGCTTCTGGCCTGAGATTACCTGCACAGACAATTCCAT CACCGGAATAAAGCTCATCGACATGAACATCACCGAAACAATCCCACCCTTCATTTGTGA CCTCAAGAACCTATCCTGGCTAGACCTTCAATACAACTATATTCCTGGCCAATTCCCAAA AGTTCTCTACAAGTGTTCTAAGCTAGAGCACCTGGACCTCTCTCAGAACTACTTTGTTGG TCCAATTCCAGATGATATCGATCGCTTGTCTCGGCTCTTGTACCTCAGTCTTGGGGCCAA TAACTTTTCTGACATTCCGGCTAGTATCGGGCGATTGACAGAGCTCAGGGAACTCTGGCT TTACCAGAATCAGTTTAACGGTTCTTTCCCACCTGAAATTGGCAACTTGTACAATCTTGA AACCTTAGAATTGGCATATAATACAGAAGTTGTGCCATCAAGGTTTCCTTCAAGTTTCAC 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