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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI020028 | Chr12 | 8482645 | 8494930 | + | bZIP transcription factor 16 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI020028.m1 | 1 | 105 | PF07777.14 | MFMR | Family | 100.6 | 5.90E-29 |
LITCHI020028.m1 | 144 | 280 | PF16596.8 | MFMR_assoc | Disordered | 191.2 | 1.10E-56 |
LITCHI020028.m1 | 331 | 393 | PF00170.24 | bZIP_1 | Coiled-coil | 67.6 | 8.20E-19 |
LITCHI020028.m1 | 333 | 382 | PF07716.18 | bZIP_2 | Coiled-coil | 29.5 | 6.30E-07 |
LITCHI020028.m1 | 571 | 696 | PF05542.14 | DUF760 | Family | 87.7 | 5.60E-25 |
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>LITCHI020028.m1 ATGGGCTGCAGTGAGGTGGATAAGCAAGCTAAAGACAAGGAGCCAAAGACGCCACCTGCA TCTGCATCTGTGCCTGGGCCTCCTACCACCACACAGGATCAGACTTCGACCACTAGTGCA GGCGCAGTGAATCCAGACTGGTCAGGATTTCAGGCATATTCTCCCATACCTCCACCTGGG TTCTTGGCATCAAGTCCCCAAGCTCACCCCTATATGTGGGGTGTTCAGCATATTATGCCT CCTTACGGTACGCCGCCGCATCCATATGTTGCTATGTACCCCCATGGTGGCATATATGCT CATCCGTCCATTCCTCCGGGTTCTTATCCTTTCAGTCCTTTTGCAATGCCTTCTCCAAAT GGGATTGCTGAAGCATCTGGAAATACTCCTGGAAGCGTGGAGGCAGATGGTAAACAATCT GATGTGAAAGAAAAATTGCCCATTAAAAGATCAAAAGGAAGTTTGGGTAGTTTGAATATG ATAACTGGAAAGAATAACGAGCTTGGTAAAACATCAGGAGCATCTGCCAATGGAGCCTAT TCTAAAAGTGCTGAGAGTGCAAGTGAAGGTACAAGTGAAGGAAGTGATGCAAATTCGCAG AATGGCTCGCAGCTGAAGTCAGGCAGGCAAGACTCTGTAGAAGGCGATGCATCTCAGAAT GGCAGTTCTATGCATGGTTCTCAGAATGGAGGACCAAATACACCTAATACGATGGTGAAT CAAACAATGACCATCATGCCAGTGTCAGCTACTGGTACTCCTGGAGCAGTTCCGGGTCCC ACAACAAATTTAAACATTGGGATGGACTATTGGGGTCCTCCAACTTCGACCAGTATTCCT GTAATGCGAGGCAAGGTTCCTTCTGCTCCTGTTGCAGGAGGAATAGTTACTACTGGATCT CGGGATAGTGTTCAGTCACAGCTATGGTTGCAGTCTGGTCCTGGTATTGATCTTACCTCT TTTTATCTGTTTTGTTACATAAATGAGGATGAAAGAGAACTTAAAAGACAGAGAAGGAAG CAGTCAAATAGGGAGTCTGCTCGGCGGTCCAGGTTGCGTAAGCAGGCAGAATGCGATGAG CTGGCTCAGCGTGCTGAAGCTTTGAAAGAGGAAAATACCAATCTTAGAGCAGAAGTGAGT AGGATCAGGAGCGACTATGAGCAACTTCTTGCTGAGAATGCCTCTCTCAAGGAGCGACTT GGGGAAGTTCCTGGGCAAGACGATCTACGGTCTGGCAGGAATGAGCAACATCTGAACGAC ACACAAGAGACTGGACAGAGTGAGCTGGTGCAGAGTGGAAGTGTTTTCTCTCATAGCATC CCTGATTCCGTGTTGGGCCCATATTACAATAGAAGGCCTCGGATGTTAACAGGAGCAATA AGTGAGGTGTTGGTGGTGAATGGAGGAGTGGGTTTATGTTTCAGACACTCCAATTCTCTC TCGTCTTCCAACTTGATTCTCAAAAGATGGCCATCGTACTGGTATTCGTGTAGCCGTGGA TTGGAAGCAAAAGGGTTGAGAGTGAGAGCATCAGGGAAGCCGAATGATAATTTGGTGCCA GTTGCTCCTCTTCATTTAGAATCCCCAGTTGGGCAGCTCTTGTCTCAGATTTTACAAACC CATCCACATTTGCTTCCTGCTGCTGTTGATCACCAGCTCCACAACCTTCTAACTGACAAA GATGCCTGTAAACCCGTCCAAGAAGATCTTCTTTACAAGAGAATAGCTGAAGTCAAAGAG AAGGAGAGACAAAAAGCATTGGAGGAGATAATCTACTGCTTGATTGTACAGAAATTTGTG GACAATAACATTTCAATGATTCCTAAGGTGACAGCAACATCAGATCCTGCTGGACGAGTG GATTTTTGGCCAAACCAAGAACAGAAGCTAGAATCGGTTCACTCTCCTGAAGCATTTGAG ATGATACAGAGCCACTTGTCTCTTGTACTCGGAGAGCGACTTGTGGGTCCTCTTGATACC ATTATTCAGATTAGCAAAATCAAACTTGGAAAGTTGTATGCTGCTTCTATAATGTATGGG TACTTCCTGAGAAGAGTTGATCAACGTTTTCAACTTGAGAGAAGTATGAAAACCCTTCCT GAGGGTTTCGATGGAGACCAGTTGAGATCTGAAGATCCTGCTTCACCAAACCGGCTCTGG GATCCAGATTCCTTGATCAGAATACAACCTGATGATGTGGCTGATTTTGGTGTTGGAGGC TTCATGGACAGCAGTGGAGGTAAATCATATAGGTTGAGATCATATGTAATGTACTTAGAT GCAGACACACTTCAAAGATATGCAACCATAAGGTCAAGGGAAGCTATTTCGTTGATTGAA AAACAGACGCAGGCCTTGTTTGGAAGGCCTGATATCCGAATTCTTGAAGATGGTTCAATT GACACATCTAATGATGAAGTAGTTGTAGTCACATTCTCTGGATTGACTATGCTAGTCTTG GAAGCTGTAGCATTTGGATCTTTCCTTTGGGATTCGGAAAGTTATGCCGAGTCGAAATAT CCATTTGTTAAAGGATAA
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>LITCHI020028.m1 + Up_Stream_Len 2000 AGGAATTATATTGTACTATTTAATTATTTTCTATAAAGGTGTATTTGCATTTTTATTATA GTTAATTTGTAAATGTATACCAATAAGTCAGACAAAATAATCATTACAATCAAGTTTTAA AATATTAAAACGCTTACTAATCAGAAATGAAAAATAAAAAATAAAAAGAAAGAAATGAGT TCCAATAGAAAAGAAATTAAGATAAATCGGAATTAAATTATAATATTACATTCATCTGTT TACTAACTTTTGAGAATTAAAATTGGAATCAAATTAAAATTCCGTTTTTAAGTGTTTAGT AAAGTAAAAAGTAGGTGTTAAAAAAATAAATTGAATAATTTAAACTTCTCAAAAATTTGC TTAAGGAGTAACGTTAGACTTTCAAAATATTTGTTTGGATGTTGACAACTTATATGTCAT ATTATTTGGACAAACTATTTGAGAAGCCTAACATTACTCAACTTTATTTTATGAGTAATG CTAGGTTTTTTAAATATTTTGCCCAAATTTATGTCCAAATGAGTTATTAATATCTTATAA ATCATGAGATGATAAAATAATTAATAGAATGTTGACAATTCAAATGCTATATCATTCAAG TATGAATTTGAGCAAAGAATAATGTTAGATTTTCTAAATATTTTGCTTAAATCCATGCCC AAATGATGTAGTATGTAAATTGACAATATCATATTAATTATTACATCATGTTATGATTTA TAAGATATTGACAATTCACATGTCATATCGTTTGAATATGAATTTGAGCAAAATATTTGA GAAACCTAGCATTACTCATAATAGGCTTTCAAAATATTTTATCTAAATCTATACCTAAAT GATGTAGTATATGAGTTATTAATATATTATATATCATGAGATAACGTTGTAATAAATAGA ATGTTGATAACTCATATGCTATATCATTTGAATATGAATTTGGATAAAGTGTAATATTAA GGTTTTTAAATATTTTATCAAAATTCGTCCAAATAATATAGTATATAAATTATCAATATT CTATTAATAATCCCATGATGTAATGGTTTTCTCTCATGTACCATATACATCATCTACCGT ACACGTAAATGATGAAGCTATAAAGAAGATCATGATGCTGATCGAACGAAGGGCAAAATA GGAGTTTTGCAAACTGAATGCAAAATACAATCGAGGGGAAAAAAAAAAAAAAAAACGATT ACCGTACGGCGACCCAGAGAATCCGATCTGTAAACCTCCCCCTTTCTAAACAAACCCTAA TCGAAATCACTCTTCTCCAAGCTCTCCCAATTCTGCTCTTGTTTCATTCTCCATCAAATG TGTTGATAATTTTAGCCCATCTTTTCCCATATTACCCTCCGCGTCCCTTCCCAACTTCGA AGCCATCAACTTCCGATCAGATTTGGATTTCGTTTCAATTTCGGGGTTTTTCTTGATTCG GTAATTGGAATTCTGTTTCTGTCAATTTGTGTTTCTGTCAATTTATGTTTCTCGAATTCA TCAATTAATGATGTGGGTTTTGACTGTTTAATCGATTTGTGTATCTGAAATTCGATTGCA TGCCTGCTATATTTCAAAGGTGTCACCTTTTTAGGGTTTTCAGTTGAGGATTGTTTTTGG TTTTTGTTGTCTAACAGAACAAAGCTGAAATTTTTATACAGTTAGTTGTCTCTTCTGATT TTGTGTAAGACTAGGGTTCGTTCTATACATATCTACTTGTTGTTGATTCTATAAGTAATA GATTATATATCAGATAATGGAATTGGTGATTTTGTTTGTGTTCATTTATCTGTTTTTAGG CGATTATTGTAGAAATATGACAATGTAGTGTAGTGTTTCGATTGTGTTTAGTTTTAATTT CCTCAGCTGCCCATTACATTTAAGGGTGCAATTTAGATTGATTTGTGTAAGGATATGGAT AAGAAGTGTTTTGTATATGAAGCTGTATGTTTTATTGAAGGATGGTGTGAGGATTTATTG GGGACTGGTGATATTCAGTC
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>LITCHI020028.m1 GenomeSequence + CGTAAATGATGAAGCTATAAAGAAGATCATGATGCTGATCGAACGAAGGGCAAAATAGGA GTTTTGCAAACTGAATGCAAAATACAATCGAGGGGAAAAAAAAAAAAAAAAACGATTACC GTACGGCGACCCAGAGAATCCGATCTGTAAACCTCCCCCTTTCTAAACAAACCCTAATCG AAATCACTCTTCTCCAAGCTCTCCCAATTCTGCTCTTGTTTCATTCTCCATCAAATGTGT TGATAATTTTAGCCCATCTTTTCCCATATTACCCTCCGCGTCCCTTCCCAACTTCGAAGC CATCAACTTCCGATCAGATTTGGATTTCGTTTCAATTTCGGGGTTTTTCTTGATTCGGTA ATTGGAATTCTGTTTCTGTCAATTTGTGTTTCTGTCAATTTATGTTTCTCGAATTCATCA ATTAATGATGTGGGTTTTGACTGTTTAATCGATTTGTGTATCTGAAATTCGATTGCATGC CTGCTATATTTCAAAGGTGTCACCTTTTTAGGGTTTTCAGTTGAGGATTGTTTTTGGTTT TTGTTGTCTAACAGAACAAAGCTGAAATTTTTATACAGTTAGTTGTCTCTTCTGATTTTG TGTAAGACTAGGGTTCGTTCTATACATATCTACTTGTTGTTGATTCTATAAGTAATAGAT TATATATCAGATAATGGAATTGGTGATTTTGTTTGTGTTCATTTATCTGTTTTTAGGCGA TTATTGTAGAAATATGACAATGTAGTGTAGTGTTTCGATTGTGTTTAGTTTTAATTTCCT CAGCTGCCCATTACATTTAAGGGTGCAATTTAGATTGATTTGTGTAAGGATATGGATAAG AAGTGTTTTGTATATGAAGCTGTATGTTTTATTGAAGGATGGTGTGAGGATTTATTGGGG 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