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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI020003 | Chr12 | 8157632 | 8158642 | - | Ethylene-responsive transcription factor RAP2-11 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI020003.m1 | 21 | 70 | PF00847.23 | AP2 | Domain | 51.4 | 1.10E-13 |
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>LITCHI020003.m1 ATGGGTACTCCTGATAACAGCTTGCGTGGAAGGAGGAAGTCATCTTCAAGAGGACACCAT AGATTTGTTGGTGTCAGGCAGAGGCCATCCGGGAGGTGGGTGGCAGAGATCAAGGACTCT TTGCAAAAGGTAAGGCTATGGCTTGGAACGTTTGACACAGCGGAGGAGGCAGCACGAGCC TATGATGATGCTGCTCGAGCCTTGAGGGGTGCAAATGCTCGAACCAACTTTGAGCTGCCT CAGTCTGAGTCAAACACTAGTGGTGCAAATCGTGTTTTTGCTGAGAACATGGAGCCTTTC TCGTTTGAAGAGGTTTGTGGGAGTGGCAGTGAACCTGATGGGCTTCTTGGTGCACTCAAA GCCAAGTTGTTTGATGGCAAGAGCCCCACTCTGCTTCCACCACCAGGTCCACCTCCCCAA AACATGCGTCCAAGTAGTACTACTGTTCCCACAAACAATACCCACGACAACAAATCAACA ATTGTACATGCAGGTTGGGTTAATTCAGGGCCTGCAAACAAGGTTCATCATGTTTTGGAC CATGATCATCGTCACCATGATGTTGGAGTTTGGAGCCATTCATCACAAGCTTCATCAACA AGCATCATGGCTGCTTGGTCCAGTGAACCAACATATGAAGTGGGTTGGACCAGACAGATG AACCATGTAATCCCTGACAACAACTTGTTTAGCACTAGTGCTACTGCTGCTGCTGCTACT ACTACCACGACTGCTATATCTACATGGCCAGTAATTTCAGCCGGGGCCAGCGAGACCACA ACGGTTGATTTCTCCTATTCGGATAATCACTGCCCACGAGAAGACCAAACAAACGATACA AGCACCAAAATGATGATGCCAGTGACACAAATGGATGGCGCAACATTTGATCAAGGTGTT TGGTGGTCAGCAGCAGATCAGGATCAATTTGTGCACTGTGAGAATAAGGGTTGGATTGGT CCTAATAATACTTGGGATCCTCTACTTTATATGTCCTCTGTGCTAGGTTGA
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>LITCHI020003.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTTTACATTATACAGATTTCTTTTAATGTTTTAACAAATAACATTGAAAAATAAAAACCC TAAACATCTTAACATCAAATTTTTCTATAACTGAATTACTATATTTCTCCAATCAAATTT TAATAAGAATCTTTATTGATTTTCTTTATTAATCTACTTATGGAGTAGCTCATATTGTAT TTATTTGTTAAAGTTTCACTATGTTATTGGTGTTTTTGGTTTATATATATTGATGGGAAT TTATTTGTGTATAACAGAACATCAAAGTTTCTTCTCTTGTTTTTTCTCCTTTTGGTTTTT TTTATCTCAAAGTTTTTATTGAATCTGTTATTGATGTATAATAGAACCTCAAAGTTTTTT TTTTTTTTTGTTATCGAATCTGTTATCGATGTATATTACTTTACAATTTCAATTTTTGTT GTAGTAGTAATTCAATTTAAGATCATTTTATTTATTTTTATTTGAATATATAAATTTAAT TGACTCTACAATAATAATTCATCTTATTTTAATTATGAATCAAAATATTATATATTTTTA TTTAAATGTTTTAATATTTGTTAAATAATTTATTGTAATTGTTTGTATCATATTAAATAA AATTACTTAACAACTAATAATAAAAGGATATAAATGTCAAATTATTAGTATTCAGACAAT TTTAACTTTAAAAAACAAATAAGATTATTATACATTCAAAGGTAAGGAAAAAAAAAAACA AACATATTTATCAGATTTCATATTTCAGTCACTATTTAATTTCAGTCTTCAGCAGCACTA TTCAGTCTTCAGACGAAAAAATAAACGACCCCTAATTTTTTTTTATATTAGTTTAAAAAC TCATATTTTTTCAATACTAGTTGTTGGGAGTTTCACTTACCTCATATTATAACTTCAAAA TTCAAATTATTATTTAACCAAAAAAAAAAATTAAACACCAATCGGACTAACGGTATGAGA AGACTTGCTACGAAAGAGTATTATAGAAGCTGCTCTAATATTTACTCTCATCCTCTCATA AATAAATAAATAAATAAATAAATATATATATATATATATATATACATCCATTCTCACAAT AACCATAGTAATAACTTTCTATATATATTGAGTTAAATACATAACGTCCATCACAAACAT AGAAAAACATCTGTAAATCGATTGATTTGTTAAAGATTTGATTTAGTGGTTGTATTGTGT CTATAAGTTTCACAAACGAATGCTAAATCGGACAAGCGTCACAAGCCTTTGCTCTTTTGG GGTCGGTTTTGTCAACAGTTTGAACTGACTTGGTCTTGGACCTACCAATCATCACGTATA AAATAAACTAGCGATGACATTGAGAAATTAACGATATGGACATGATAATTATATATTTTT TAAATATCATTATGAATCATGATCTCCCAGTAATCACAACTTACTCTCAATAGGAAATTA TATTTCGCGAATGAGTGGAATTGTTACTCAAAAGGAAGAAATGATACTGATATATACTAT TTTTAATTTTAATAAATAATATTGTTTTATTTTTTCTAAAGTTAATATCAAATGGATCAA AAATCTACTTGAAGTTATCAAAATCAATCACTATTTACATGAGTTGAATATTTACTACTT TCATAATAAACGGAAAAAACTACTTATACAGTCGATAAAATATATTTGATGAGAGCTGAA CCTCTACTAATAAGATGCCTAGAAAAATAACGCACCACGCACCACGTATGCTGGAAGATG ATGTGTATAAATATTATTGTTAATCAAGGAACATTAATGAAAATTTTGATTTGTTGCACA AGTTGTATACAATTCGATACAAACAACATGGCCTGCAAAATGATCAAATATATATTATAA ACACTAGATTGACATTTTCTGATTTGTCGACTTATGCAAAATTAAGATACCAATTCAAAG GGCGATCGTTATAAAAAAACAGCAGCTCCTCAAAAACTCAAAAAGGTTGGTTTGCAATTA ATAAGAGGAGGAGATCAATA
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>LITCHI020003.m1 GenomeSequence - ATGGGTACTCCTGATAACAGCTTGCGTGGAAGGAGGAAGTCATCTTCAAGAGGACACCAT AGATTTGTTGGTGTCAGGCAGAGGCCATCCGGGAGGTGGGTGGCAGAGATCAAGGACTCT TTGCAAAAGGTAAGGCTATGGCTTGGAACGTTTGACACAGCGGAGGAGGCAGCACGAGCC TATGATGATGCTGCTCGAGCCTTGAGGGGTGCAAATGCTCGAACCAACTTTGAGCTGCCT CAGTCTGAGTCAAACACTAGTGGTGCAAATCGTGTTTTTGCTGAGAACATGGAGCCTTTC TCGTTTGAAGAGGTTTGTGGGAGTGGCAGTGAACCTGATGGGCTTCTTGGTGCACTCAAA GCCAAGTTGTTTGATGGCAAGAGCCCCACTCTGCTTCCACCACCAGGTCCACCTCCCCAA AACATGCGTCCAAGTAGTACTACTGTTCCCACAAACAATACCCACGACAACAAATCAACA ATTGTACATGCAGGTTGGGTTAATTCAGGGCCTGCAAACAAGGTTCATCATGTTTTGGAC CATGATCATCGTCACCATGATGTTGGAGTTTGGAGCCATTCATCACAAGCTTCATCAACA AGCATCATGGCTGCTTGGTCCAGTGAACCAACATATGAAGTGGGTTGGACCAGACAGATG AACCATGTAATCCCTGACAACAACTTGTTTAGCACTAGTGCTACTGCTGCTGCTGCTACT ACTACCACGACTGCTATATCTACATGGCCAGTAATTTCAGCCGGGGCCAGCGAGACCACA ACGGTTGATTTCTCCTATTCGGATAATCACTGCCCACGAGAAGACCAAACAAACGATACA AGCACCAAAATGATGATGCCAGTGACACAAATGGATGGCGCAACATTTGATCAAGGTGTT TGGTGGTCAGCAGCAGATCAGGATCAATTTGTGCACTGTGAGAATAAGGGTTGGATTGGT CCTAATAATACTTGGGATCCTCTACTTTATATGTCCTCTGTGCTAGGTTGA