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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI019996 | Chr12 | 8015985 | 8025962 | - | F-box protein At3g54460 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI019996.m1 | 276 | 928 | PF00176.26 | SNF2-rel_dom | Domain | 281.4 | 8.10E-84 |
| LITCHI019996.m1 | 531 | 574 | PF07496.18 | zf-CW | Domain | 54.3 | 1.10E-14 |
| LITCHI019996.m1 | 1155 | 1251 | PF00271.34 | Helicase_C | Domain | 35.5 | 1.10E-08 |
| LITCHI019996.m2 | 276 | 928 | PF00176.26 | SNF2-rel_dom | Domain | 281.4 | 8.10E-84 |
| LITCHI019996.m2 | 531 | 574 | PF07496.18 | zf-CW | Domain | 54.3 | 1.10E-14 |
| LITCHI019996.m2 | 1155 | 1251 | PF00271.34 | Helicase_C | Domain | 35.5 | 1.10E-08 |
| LITCHI019996.m3 | 139 | 802 | PF00176.26 | SNF2-rel_dom | Domain | 281.8 | 6.00E-84 |
| LITCHI019996.m3 | 394 | 437 | PF07496.18 | zf-CW | Domain | 54.5 | 9.40E-15 |
| LITCHI019996.m3 | 1018 | 1114 | PF00271.34 | Helicase_C | Domain | 35.7 | 9.30E-09 |
| LITCHI019996.m4 | 139 | 802 | PF00176.26 | SNF2-rel_dom | Domain | 281.8 | 6.00E-84 |
| LITCHI019996.m4 | 394 | 437 | PF07496.18 | zf-CW | Domain | 54.5 | 9.40E-15 |
| LITCHI019996.m4 | 1018 | 1114 | PF00271.34 | Helicase_C | Domain | 35.7 | 9.30E-09 |
| LITCHI019996.m5 | 139 | 802 | PF00176.26 | SNF2-rel_dom | Domain | 281.9 | 5.60E-84 |
| LITCHI019996.m5 | 394 | 437 | PF07496.18 | zf-CW | Domain | 54.5 | 9.10E-15 |
| LITCHI019996.m5 | 1018 | 1114 | PF00271.34 | Helicase_C | Domain | 35.8 | 9.10E-09 |
| LITCHI019996.m6 | 276 | 928 | PF00176.26 | SNF2-rel_dom | Domain | 281.4 | 8.10E-84 |
| LITCHI019996.m6 | 531 | 574 | PF07496.18 | zf-CW | Domain | 54.3 | 1.10E-14 |
| LITCHI019996.m6 | 1155 | 1251 | PF00271.34 | Helicase_C | Domain | 35.5 | 1.10E-08 |
| LITCHI019996.m7 | 276 | 928 | PF00176.26 | SNF2-rel_dom | Domain | 281.4 | 8.10E-84 |
| LITCHI019996.m7 | 531 | 574 | PF07496.18 | zf-CW | Domain | 54.3 | 1.10E-14 |
| LITCHI019996.m7 | 1155 | 1251 | PF00271.34 | Helicase_C | Domain | 35.5 | 1.10E-08 |
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>LITCHI019996.m1 ATGGGCGATTCGTCGCCCTTCCCCGACCACAAACTCTGCGGGTTCCTCTGTGTGGTTGTC GCAGCAGTCAACGACAACAACCCCAACCTCCACCACTCCCTGCCTTTCAACGCGCAATGC CACGTCTCCAACGACGGTTTCGTTTCCGAAACCGGCGTCGTTTTGTCCACGGTGAGCACG CACGGCAAGGTTTCGGAGTCAAGGAGTAGCAGGACGAGGAGGATGAGGAGGATGGGAATG GTCAACGGAAGCGTGAGCGTGGTGAAGCAGCTGGTTTCGCTGGTAAATCACAAGTGCGTG AGAATTGATGCGCGGGTGATGCGCGTGGAAGAGCCGAAAGTGGTGTTGCTTGTGGATGTC TATTTACCGGTCGCCGTCTGGTCGACCGGATGGCAGTTTCCAAAATCTGGTTCGGTTGCC GGTTCTTTGTTCAGACACATTAGTTGTGACTGGGGCCACAGAAAATCAATGCTTGTGGAT GGTGGTAATAATTCTCTTGGAAGTAGCATTTGGAATGTTTCTGATTGTCATGTTCTCCAT TGCAAGTTGCATTGTGGTGGTGCTTCAAACAAAAGCCTATTTGAACTACATCAAGTTTTC AAGAGTTTGCCTAGTGTATCAAGTAAAGGGAAGCCTGATTTGTCTAGAGTGAATCCGGCG GATGACTTGTGCAGCTCCAGCATTTCGGAATTAACTGATGATCTTATATTTTACATACTA ACTAAGCTTGGTCCAGTGGACCTTGTCAGGGTTGCAGCTACCTGTTGCCATCTGAGGTCC TTGGCGATAGCGATTATGCCGTGTATGAAACTTAGACTGTTTCCTCATCAGCAAGCAGCA GTTGAATGGATGTTACATCGGGAGCGGAATGCTCAAGTTTTGCCGCATCCTCTGTTCATG GAGTTCTCGACAGAAGATGGGTTTTGTTTCTATATGAGTAGTGTTTCTGGTGAGATAGTT 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GGTTTAGTTAGTCCAATTCTTGGTACTTTTGCAGATGCTGATGCCCAAGGGTTCCGCAAA CTATTTCAAGAATTTGGACTCATAAGGAGAGTGGACAAGGGTATTAGTAGATGGTATTAC CCACGAACTCTTGACAACCTTGCATTTGATTCAGCTGCTCTTAGTATTGCTCTTTGTGAA CCATTAGATTCTGTCAGGTTATATTTGTCAAGAGCAACTTTAATTGTTGTACCATCATAT TTAGTGGATCATTGGAAAACTCAAATCTATAAACATGTCAGACCTGGACAATTGCGACTT TTTATCTGGACTGATCATAAAAAGCTTTCTGCTCATGGTCTGGCATGGGACTATGATGTT GTTATAACAACCTTTAACCGTTTGAGTGTTGAGTGGGGTCCTCGTAAGAAAAGTCCAATG AGGCAAGTGCATTGGCTTAGGATAATTTTAGATGAAGGGCATACTCTTGGCTCAAGTCTT AACTTGACGAACAAATTGCAAATGGCTATTTCATTGACAGCTTCAAGTCGTTGGATACTA ACAGGAACTCCAACTCCAAACACTCCCAATAGTCAACTGTCACATCTTCAACCAATGCTT AAGTTCCTTCATGAAGAAGCATATGGACAAAATCAGAAATCATGGGAGGCTGGTGTTCTT AGACCATTTGAAGCAGAGATGGAGGAGGGTCGATCACGTTTGCTGCAGCTGCTCCATAGG TGTATGATTAGTGCAAGAAAGATAGATCTGCAAAATATTCCTCCTTGCATTAAGGTGGTG ACATTTCTGAATTTCATGGAGGAGCATGCAAGAAGTTATAATGAACTTGTAGTTACAGTG CGGCGCAATATACTTATGGCCGACTGGAACGATCCATCACATGTTGAAAGTTTACTGAAT CCGAAGCAGTGGAAGTTTCGAAGCACAACTATTAGGAATGTCAGGCTGTCATGCTGTGTT GCTGGGCACATCAAAGTAACTGATGCTGGCGAGGATATTCAAGAAACAATGAATATTTTA GTTGAAACCGGTCTTGATCCTAATTCGGAGGAATATGCTTTTATTAAATATAACCTCCTT TATGGTGGTAACTGTCTCAGATGCAATGAATGGTGCCGTCTGCCAGTGATTACCCCTTGT AGGCATCTTTTGTGCCTTGATTGTGTTGCTTTGGACAGTGAAAAGTGTAGTTTCCCTGGT TGTGGTAACTTATATGAGATGCAAACTCCTGAGATATTAACTAGGCTGGAGAATCCGAAC CCAAAGTGGCCTGTACCTAAAGATCTTATTGAGTTACAACCTTCATATAGGCAGGATGAC TGGAATCCTGATTGGCAGTCGACTTCTAGCAGTAAAGTAACTTATCTTGTCAAAAAGTTA AAGGCACTGCAGAAGGCTAATGAAAAGGTCAGTTGTCCTGTGGATGAAGTTAATGAATTT AATCAAATCAAGGAGCAATTTTGTGCCTCTCAGATGAGCAATTCAAGCACTTTGTTGAAG CAAAACTGCAATATGGCTAGTGTGGATTTTGACAATGGACTTCCAGAGAAAGTTATAATC TTCTCTCAGTTTCTTGAGCATATACATATTATTGAGCAGCAGTTAACAATTGCTGGTATC AAATTTGCTGGTATGTATAGTCCAATGCATTCTAGCAACAAGATAAAGTCACTAGCTATG TTCCAGGATGATGCTAGTTGCCTGGCTCTTGTAATGGATGGAAGTGCTGCATTGGGTCTT GATTTGAGCTTTGTAACTCATGTTTTCTTAATGGAACCAATTTGGGATAGAAGCATGGAG GAACAAGTCATCAGTCGTGCTCATCGGATGGGTGCTACTCGTCCTATTTATGTAGAAACT TTAGCAATGCGTGGTACAATTGAAGAGCAAATGCTGGAATTACTACAGGATGCTGATATG 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>LITCHI011504.m1 - Up_Stream_Len 2000 ACTTGCCCTTCGGTGAAACTTTTATGATCATACATTCATCAGTACGCTAGCTTCAGGTGG GACGGTGTCCACCCCACTTGGTACCCATTCAAAACACACCACATGTTGTCCAATTAATTG TTAATTCAATTATAAGTTATTTTATTTATGTGATGCATTTAATGTGGGTAGAATAAGTGC ACCCGCCTCACCCTAGCTTCTAGGAAACATCAGAATACAAACAAAAAGGAGTGGGCCTTA GATTGGGCTTTAGTAATCATTTTTGTTGATTACATGGGCTTTTGACCCAGTAAATTTTGT TTCAACGGGTTGATCAATGGCAACTCGATGATTTGAATTGTTCTATGTCTTATTAGTAGC GTATTGATCTTCTTTTCAATGATGCTTATCACAGACAAGATGTATGCAAAAAGAAAGAAA CGTGTTTTGACCATTATCTCTTTTTAAATTTAGGGAAAAAAAAGTTTGTATAAATAAATT GTTAAACGGGATGAGAAACAATAATGCCATTCTATATTTTAATTCTTATTTGACACCTAA TTAGGCACATTAATCAGAAAAAAACTTATAATATATGATGTTTAGTTGATTTAGAACGAA CTGAGTGACATATATTATGTAAATAATTTCAACTTGTTTTTATCATTCTTCAAGTAGGAT ATAAATCTTCAAGTGCACATACGTGGATTGTTTTTTTTTTTTTTTAGGGCAGTACATATA GATTGTTGTTATAATCTCAATCTTGAATTCTTTAGTGTTGTATGAATTTTTTGTCATCTT TTCTGTTAAACGGTAGAATGAAATGCACTATTGAAAATCTGTATTAATTATTAATCGTGT ACAATTTAAAATGACTTAGAGATTAGTACAACTAATGTTTGACCATCACTAAGTCAAGCA CAAGAAAGGTTTTTGAGGTTTCATTCTTTTTATGCTTTTTGAAGGACATTTAATTTGTTT GTCTATTTAATTCGTTTGTTGTTTATAGACTAACGCTCCTGGTGTACTTTTTTGAACTAG TCATTACGAGAACCTCGAAATTGAATGGTATATTGTAAAATGTCCGATTCTCTGAGTTCC TTACAATCAACACTGTGCTGTAACACGAGTTGCCAAGTGGATCTCAAAGTGCTAACTGTA AACATGTCCGGAACAGTTTGTCATCAACATATTGACCTCTTGTTTTTTTACCTTAGGATG GCCTTTTTATGTCCACCACTTCGTACAACCTAGTTTGTTAGGCAATCACCCTCTGACCAA CTTGCCCACCAAGTCACTATTCATACACAATTTTTTATCATTAGTTAAATGACTTTTCAT TAAATGGATAGTTTTATAAACCAATTCGTACCCACTTGAAACTAGAGCCAGTTGTGAAAA TTAAAAGTTATTAGCTGCTGATTAATCCATACAATTTTAATCCTTTTACAATTTGAATAA CTAATTATATAACTTGTTTTTTTTTTTTTTTTAATATTTTCTAGGAGCCCATTTCTCTAT AAATATTATGGGCTAATAATAATAATGATAGAAATTGATATGAAGCCCAGTTTACTCAAA TTATAAAGTCGGTAAAGAATTCAATTCAAAGATGATCTCTGTCTCTTCAATACCAATCTA ACCATCCAAAGACACCGACATTTACATTTTCTCTTAGCTCCAGAGCCGAGCTTCTTGCAT CTTCAATTTATTTTTTTAAAAAAGGAGTCAAATTTCTGGTGTGAACGTATCATAGTCGGC ATCTGTAATTTTTTTTTTCTGAATCATCACATTTTTTTTTAGAGCAAAAAGAAAAATTGA TAATTATCAGCCAAGAAAGAGAAAGGTGGTGCCGTGGTGGTGTGATGGTGGTAAAGACAC AGAAGAACTGTTATTGTGACGGCTCATGAAATCAACATATATAAGTCTCGAGCTCAAAAG GGTATTTATGTTTGATAAAAAAACGATCTGGGTAGGTCTTATTTTGTCATATTGTCGAAA GGATTGATAGCTCGGGTTAC
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