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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI019960Chr1273660747368746;7368748+Protein LATERAL ROOT PRIMORDIUM 1

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI019960.m184243PF05142.15DUF702Family172.11.10E-50
LITCHI019960.m284243PF05142.15DUF702Family172.11.10E-50
LITCHI019960.m384243PF05142.15DUF702Family172.11.10E-50
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>LITCHI019960.m1
ATGTTAGGCTTCCACAACATCCTCTTCATTTCTCAACCATCTTCTTCCCACCCACCACCC
TCCATTACTTCCTCTGACCACCCCTACCCCCACAATGACAACAGAAATGTTCCTCAAAAC
TACAACACCAACAATGATCACTTGAGTGAGTCAAGCTTTTGGAGCCTGCAGAAGAAGAGC
AAAGATGGTGGAGGTGGTGGTGGTGATGATGATGATGACAATGACAATAATGATGGTGAT
GGTTCCCTGAGAGCGTGTAGGGACTGCGGTAACAGAGCCAAGAAAGAGTGCAGTTTCAGG
AGGTGCAGGACTTGTTGCAAGACTCGTGGCTTCGACTGTGCCTCCCACGTGAGAAGCACC
TGGGTCCCTGCTTCTAAGCGCCGGGAGAAGAAGCTTGCCACCCCTGGAGCTGCTTCTGCT
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GGTATCTCCTCTCATCCTCAGGATTCCAGGTTTAAGAAGTCATTACCGGGTAGAATTCAG
GCCCCGGCTGTTTTCAGGAACATTAGACTGACAGATGTGAGTGATGGTGAAGCTGAGAAT
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GGAAGTGACAAGAATGCGTTTCCATGTGTTACCGAACTGCAGATCCAAACTAGTACTAGT
CGAAGATATAGGGACTCGTCAAATATGCAGATGGAAACTAGTACAAGTGGGAGGTATAGA
GACTCCTCGTCCCCAATTGTCGATCCATCGAATGCCTATACAGGAGCCTCTGGTAATTGA
>LITCHI019960.m2
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TCCATTACTTCCTCTGACCACCCCTACCCCCACAATGACAACAGAAATGTTCCTCAAAAC
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AAAGATGGTGGAGGTGGTGGTGGTGATGATGATGATGACAATGACAATAATGATGGTGAT
GGTTCCCTGAGAGCGTGTAGGGACTGCGGTAACAGAGCCAAGAAAGAGTGCAGTTTCAGG
AGGTGCAGGACTTGTTGCAAGACTCGTGGCTTCGACTGTGCCTCCCACGTGAGAAGCACC
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TCTGCTTCTTGTTCCTCTTATGGTGTCAAGAGGCCTAGGCCTTTTGTAGTACCATCGCCA
TCTTCACACAATGTCACTACTCCTGCCACCTCCTCTTCCTCTGCTAATGATTTGAGTCTT
GGTATCTCCTCTCATCCTCAGGATTCCAGGTTTAAGAAGTCATTACCGGGTAGAATTCAG
GCCCCGGCTGTTTTCAGGAACATTAGACTGACAGATGTGAGTGATGGTGAAGCTGAGAAT
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>LITCHI019960.m3
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TCTGCTTCTTGTTCCTCTTATGGTGTCAAGAGGCCTAGGCCTTTTGTAGTACCATCGCCA
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GGTATCTCCTCTCATCCTCAGGATTCCAGGTTTAAGAAGTCATTACCGGGTAGAATTCAG
GCCCCGGCTGTTTTCAGGAACATTAGACTGACAGATGTGAGTGATGGTGAAGCTGAGAAT
GCCTATGTGGCTACAGTGAACATCAGTGGCCATGTATTCAAAGGGCTGCTCTATGACCAT
GGAAGTGACAAGAATGCGTTTCCATGTGTTACCGAACTGCAGATCCAAACTAGTACTAGT
CGAAGATATAGGGACTCGTCAAATATGCAGATGGAAACTAGTACAAGTGGGAGGTATAGA
GACTCCTCGTCCCCAATTGTCGATCCATCGAATGCCTATACAGGAGCCTCTGGTAATTGA
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>LITCHI019960.m3
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>LITCHI019960.m3
AAACAACACCTTATAGCTTTCACAATATTAAGTACACAAATCCAAGTTAATTTATAACAC
AAAATAGAATGTTGTAATTTGTCAATCAAATTGACGAATTCAACAAGTAAACACTAGCAC
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ACCACCTCAGCTGTCACACCACACACCCATCTGACCACCACTAACACTACCAGTCAGCCA
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CTGCTTCTTGTTCCTCTTATGGTGTCAAGAGGCCTAGGCCTTTTGTAGTACCATCGCCAT
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GAAGTGACAAGAATGCGTTTCCATGTGTTACCGAACTGCAGATCCAAACTAGTACTAGTC
GAAGATATAGGGACTCGTCAAATATGCAGATGGAAACTAGTACAAGTGGGAGGTATAGAG
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TGGCATTACAGAGATTAAACGTGACAACTTAATTTCCTATCTACATAAACTACATTTCCT
GTGATTGTTGATTTTGTGTTATTTTTCATAATGATTTCTAGCCGAATGGTTGAACTGAAA
ATCGATGTAAGGAATCGAAATTTCGATCGTGAAGAAATGATTATGAAGATTCGTAGCATC
GTTATCCAATGACATGAAAATGATCTTATTATTGCTTAGCTAGTTATTACCATCTG
>LITCHI019960.m2
AAACAACACCTTATAGCTTTCACAATATTAAGTACACAAATCCAAGTTAATTTATAACAC
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AACCATCAACCAGAAGATGGCCACCTCCACCAGCCACCTCCACCATCCAGCTACCAGATC
ACCACCTCAGCTGTCACACCACACACCCATCTGACCACCACTAACACTACCAGTCAGCCA
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CCACCATCCAGCTACCAGATCACCACCTCAGCTGTCACACCACACACCCATCTGACCACC
ACTAACACTACCAGTCAGCC
>LITCHI019960.m3 +  Up_Stream_Len 2000
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ACTAACACTACCAGTCAGCC
>LITCHI019960.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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CAAAAACAAAAATAATGTAGATGTGTGTTTTTTTTATCAAAATAAGTAAAATAGTTATTA
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ATTATTTTCAAAAAGATATCCAAACAACACCTTATAGCTTTCACAATATTAAGTACACAA
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TCAACAAGTAAACACTAGCACCAACAACTGTGGCCACCCCACCACCACCACCACCACCCA
CTACTACAAATACTCTCCTCCAACCATCAACCAGAAGATGGCCACCTCCACCAGCCACCT
CCACCATCCAGCTACCAGATCACCACCTCAGCTGTCACACCACACACCCATCTGACCACC
ACTAACACTACCAGTCAGCC
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>LITCHI015404.m1 GenomeSequence - 
ATGGACGGTTATATACAACCGTTGGAAACCAAAATTCGAAACCCCTGGTTAAAAACAATG
GAGCATTTCTTTGAAGAGCAACTCAATGGTGATGTCTTGTGGTACAACAACTACCATGAA
GCTCCTGTTGCAAGTCAAAGTGCGTTTGTGCCATACAAACCCGGAACAGAATCCGGGACG
GAGAACGTCAAAAAGGGTTGTGATACGAAGAACTCAAACAAGAGAATGATAGAGTTTTTG
AAGAGAAGCTGGTCTGCAACACGAGAACCGGACAGAGACCGGTGTCAACGACACATGATC
AACGAGAGGATGAGGAGAGGGAAGGAGAAGCAGTACTACCTGGCCTTGCATTCTGTTCTG
CCACGTCGCACCAAGGTATCATGTGATCATGTCATCAATTGGTGTACTTTTTTTTTTTTT
TAAATAAGTAATCATTTGTTGTGTTGATTTTCTTTTACTGCAGAATGATAAGAACACCAT
TGTTCAAACGGCAGCCAAGACAATTCAGGAGCTGCAATGTCATAAGAGAGAGTTGGAGAA
GAGAAACTACGAGATAGAAGCCAAAATGGGGATGGATGATGTTGGGGGAACAAAGATTAG
AGTTAATATATGCAATCCCATATCAGGAGTTGATTCCATATTGGAGTTACTAAAATGTTT
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AGCAGTAATAGACACTGAAACTCAGGTAAAATGTTTAACTCATTAATTATATATATTTAG
CCTCATCGTATTTGTCTCATTGTATGTTAAATGGGTTCATTGATTCATGAACAACAATGG
CATAGTGTGAAAAAGAGTCCCCCTGCTGACAAATTTGCGATTGACAATGACAGATGGCAG
CAGCCGAGGTAGAAAATGCTGTGCAGACAGCACTGCAAGAGGTGGAAAGAAAGTTGCTTT
TTAATTACGAGGAATGTTAGAAAACAAGGGGGCGCGTGATGTTTCCTGTCAGCGTGTCTA
CTCTTTTGACCAGACAAGAACTACAATATGTAGAGGACATACAGTCCTGGAATATAGTAT
GTATAGAGCAGGGCTATGTTTCACGTTCAAGCATGAAAATGATTAGTTTGAATTTCTCTG
GTTCAATGCGTGGTTGTTAAGTTTCTTCTGGTTCAATACGAGCTTATTAAGTGTGTGGAT
TTTGTGGATTTGAATTGACTAATTTTAAGCTTAAACTAAGGTTAAATTTGAGCATGTGCT
TCGAGTTGTATAGATACGAGGAAGTTGCCCACATAAGCTGACATGTGATGAAGATTAAAT
AATAGAGATTAAGTCTATTGGTACATGGAGTGGTTAAAAACATAATACTTATAACTTTAA
GAAACTTCGAAGAAAACCAGTGGTTGGCTACTAGTCAATATAAACCTACTATAAACCAAC
TCAATAAGTCCTGCATCTCGTGCCCACGCAAGGTGGTGTTGACCAAGATTGAACCAGGAT
TGGCAGGCAGAAGTACTTGGAAATAAAGAAGTGTAATACTATATATCTCAATTTTATATA
CCACATCGTGACATTTCAGTTAATTCATATAATATGTGATAAATAAATCAATTCCCTTTA
ACACATGTTTATTGACACATCACTTGCAGATTAGTCTTTTCTAGTTAGAAATTTATGCAA
TTAAATAAATTTATGCAATTAAATCGCAAGGCTTGGTTACTGTTGGGTGAATTTCTGAAA
CTATAGATAGTTCCAATCCAGGATATTCCCTCCTAATTCATGTGATTTTGCACCTACTCA
TCCACCTTTATGATGAGATTTTAAATCATACCGC