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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI019960Chr1273660747368746;7368748+Protein LATERAL ROOT PRIMORDIUM 1

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI019960.m184243PF05142.15DUF702Family172.11.10E-50
LITCHI019960.m284243PF05142.15DUF702Family172.11.10E-50
LITCHI019960.m384243PF05142.15DUF702Family172.11.10E-50
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>LITCHI019960.m1
ATGTTAGGCTTCCACAACATCCTCTTCATTTCTCAACCATCTTCTTCCCACCCACCACCC
TCCATTACTTCCTCTGACCACCCCTACCCCCACAATGACAACAGAAATGTTCCTCAAAAC
TACAACACCAACAATGATCACTTGAGTGAGTCAAGCTTTTGGAGCCTGCAGAAGAAGAGC
AAAGATGGTGGAGGTGGTGGTGGTGATGATGATGATGACAATGACAATAATGATGGTGAT
GGTTCCCTGAGAGCGTGTAGGGACTGCGGTAACAGAGCCAAGAAAGAGTGCAGTTTCAGG
AGGTGCAGGACTTGTTGCAAGACTCGTGGCTTCGACTGTGCCTCCCACGTGAGAAGCACC
TGGGTCCCTGCTTCTAAGCGCCGGGAGAAGAAGCTTGCCACCCCTGGAGCTGCTTCTGCT
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GGTATCTCCTCTCATCCTCAGGATTCCAGGTTTAAGAAGTCATTACCGGGTAGAATTCAG
GCCCCGGCTGTTTTCAGGAACATTAGACTGACAGATGTGAGTGATGGTGAAGCTGAGAAT
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GGAAGTGACAAGAATGCGTTTCCATGTGTTACCGAACTGCAGATCCAAACTAGTACTAGT
CGAAGATATAGGGACTCGTCAAATATGCAGATGGAAACTAGTACAAGTGGGAGGTATAGA
GACTCCTCGTCCCCAATTGTCGATCCATCGAATGCCTATACAGGAGCCTCTGGTAATTGA
>LITCHI019960.m2
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TCCATTACTTCCTCTGACCACCCCTACCCCCACAATGACAACAGAAATGTTCCTCAAAAC
TACAACACCAACAATGATCACTTGAGTGAGTCAAGCTTTTGGAGCCTGCAGAAGAAGAGC
AAAGATGGTGGAGGTGGTGGTGGTGATGATGATGATGACAATGACAATAATGATGGTGAT
GGTTCCCTGAGAGCGTGTAGGGACTGCGGTAACAGAGCCAAGAAAGAGTGCAGTTTCAGG
AGGTGCAGGACTTGTTGCAAGACTCGTGGCTTCGACTGTGCCTCCCACGTGAGAAGCACC
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TCTGCTTCTTGTTCCTCTTATGGTGTCAAGAGGCCTAGGCCTTTTGTAGTACCATCGCCA
TCTTCACACAATGTCACTACTCCTGCCACCTCCTCTTCCTCTGCTAATGATTTGAGTCTT
GGTATCTCCTCTCATCCTCAGGATTCCAGGTTTAAGAAGTCATTACCGGGTAGAATTCAG
GCCCCGGCTGTTTTCAGGAACATTAGACTGACAGATGTGAGTGATGGTGAAGCTGAGAAT
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GGAAGTGACAAGAATGCGTTTCCATGTGTTACCGAACTGCAGATCCAAACTAGTACTAGT
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>LITCHI019960.m3
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TCTGCTTCTTGTTCCTCTTATGGTGTCAAGAGGCCTAGGCCTTTTGTAGTACCATCGCCA
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GGTATCTCCTCTCATCCTCAGGATTCCAGGTTTAAGAAGTCATTACCGGGTAGAATTCAG
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GCCTATGTGGCTACAGTGAACATCAGTGGCCATGTATTCAAAGGGCTGCTCTATGACCAT
GGAAGTGACAAGAATGCGTTTCCATGTGTTACCGAACTGCAGATCCAAACTAGTACTAGT
CGAAGATATAGGGACTCGTCAAATATGCAGATGGAAACTAGTACAAGTGGGAGGTATAGA
GACTCCTCGTCCCCAATTGTCGATCCATCGAATGCCTATACAGGAGCCTCTGGTAATTGA
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>LITCHI019960.m3
AAACAACACCTTATAGCTTTCACAATATTAAGTACACAAATCCAAGTTAATTTATAACAC
AAAATAGAATGTTGTAATTTGTCAATCAAATTGACGAATTCAACAAGTAAACACTAGCAC
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ACCACCTCAGCTGTCACACCACACACCCATCTGACCACCACTAACACTACCAGTCAGCCA
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CCATTACTTCCTCTGACCACCCCTACCCCCACAATGACAACAGAAATGTTCCTCAAAACT
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AAGATGGTGGAGGTGGTGGTGGTGATGATGATGATGACAATGACAATAATGATGGTGATG
GTTCCCTGAGAGCGTGTAGGGACTGCGGTAACAGAGCCAAGAAAGAGTGCAGTTTCAGGA
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CTGCTTCTTGTTCCTCTTATGGTGTCAAGAGGCCTAGGCCTTTTGTAGTACCATCGCCAT
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CCTATGTGGCTACAGTGAACATCAGTGGCCATGTATTCAAAGGGCTGCTCTATGACCATG
GAAGTGACAAGAATGCGTTTCCATGTGTTACCGAACTGCAGATCCAAACTAGTACTAGTC
GAAGATATAGGGACTCGTCAAATATGCAGATGGAAACTAGTACAAGTGGGAGGTATAGAG
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TTCTTTTGTAAGTCTTACTCGAATTCGAAAAGGATAAAGGAGGTTCGAACCTGATAAGCA
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GTTATCCAATGACATGAAAATGATCTTATTATTGCTTAGCTAGTTATTACCATCTG
>LITCHI019960.m2
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AACCATCAACCAGAAGATGGCCACCTCCACCAGCCACCTCCACCATCCAGCTACCAGATC
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GTTCCCTGAGAGCGTGTAGGGACTGCGGTAACAGAGCCAAGAAAGAGTGCAGTTTCAGGA
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CTGCTTCTTGTTCCTCTTATGGTGTCAAGAGGCCTAGGCCTTTTGTAGTACCATCGCCAT
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CCTATGTGGCTACAGTGAACATCAGTGGCCATGTATTCAAAGGGCTGCTCTATGACCATG
GAAGTGACAAGAATGCGTTTCCATGTGTTACCGAACTGCAGATCCAAACTAGTACTAGTC
GAAGATATAGGGACTCGTCAAATATGCAGATGGAAACTAGTACAAGTGGGAGGTATAGAG
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CCACCATCCAGCTACCAGATCACCACCTCAGCTGTCACACCACACACCCATCTGACCACC
ACTAACACTACCAGTCAGCC
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ACTAACACTACCAGTCAGCC
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CAAAAACAAAAATAATGTAGATGTGTGTTTTTTTTATCAAAATAAGTAAAATAGTTATTA
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ACTAACACTACCAGTCAGCC
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>LITCHI019960.m2 GenomeSequence + 
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ACCACCTCAGCTGTCACACCACACACCCATCTGACCACCACTAACACTACCAGTCAGCCA
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CCATTACTTCCTCTGACCACCCCTACCCCCACAATGACAACAGAAATGTTCCTCAAAACT
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CTTCACACAATGTCACTACTCCTGCCACCTCCTCTTCCTCTGCTAATGATTTGAGTCTTG
GTATCTCCTCTCATCCTCAGGGTATATACGCTTAACCATCGTGTCTCTCTCTGTCACTCT
CTCTACATTAACAAAATGTTATATTTTTCCATGGATCAGTCTTTGTGTTATCATTGTGGT
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ATTCCAGGTTTAAGAAGTCATTACCGGGTAGAATTCAGGCCCCGGCTGTTTTCAGGAACA
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GTTGCAATGTCATTGTCAATGTTTGCTTAAAAGGAAAAGACATTCCATGTGCCTTCTTCC
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