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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI019825Chr1237350683752544-E3 ubiquitin-protein ligase KEG

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI019825.m1652PF13639.9zf-RING_2Domain28.21.90E-06
LITCHI019825.m1649PF13445.9zf-RING_UBOXDomain27.42.80E-06
LITCHI019825.m1651PF00097.28zf-C3HC4Domain22.20.0001
LITCHI019825.m1137418PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain954.90E-27
LITCHI019825.m1138418PF00069.28PkinaseDomain962.70E-27
LITCHI019825.m1465523PF13637.9Ank_4Repeat24.72.70E-05
LITCHI019825.m1467566PF12796.10Ank_2Repeat41.61.50E-10
LITCHI019825.m1504537PF00023.33AnkRepeat24.52.70E-05
LITCHI019825.m1504533PF13606.9Ank_3Repeat20.50.00048
LITCHI019825.m1576623PF13637.9Ank_4Repeat28.91.40E-06
LITCHI019825.m1579658PF12796.10Ank_2Repeat28.91.40E-06
LITCHI019825.m1647750PF12796.10Ank_2Repeat32.88.60E-08
LITCHI019825.m1719750PF00023.33AnkRepeat22.98.80E-05
LITCHI019825.m1719748PF13606.9Ank_3Repeat23.93.60E-05
LITCHI019825.m1720773PF13637.9Ank_4Repeat38.51.30E-09
LITCHI019825.m1756794PF13637.9Ank_4Repeat275.50E-06
LITCHI019825.m1756784PF00023.33AnkRepeat19.70.00092
LITCHI019825.m1914978PF18346.4SH3_15Domain55.94.30E-15
LITCHI019825.m19841041PF18346.4SH3_15Domain27.33.80E-06
LITCHI019825.m110401104PF18346.4SH3_15Domain351.50E-08
LITCHI019825.m111101228PF18346.4SH3_15Domain45.11.10E-11
LITCHI019825.m112361357PF18346.4SH3_15Domain63.12.60E-17
LITCHI019825.m113631484PF18346.4SH3_15Domain71.46.50E-20
LITCHI019825.m114921612PF18346.4SH3_15Domain60.61.60E-16
LITCHI019825.m2649PF13445.9zf-RING_UBOXDomain27.92.00E-06
LITCHI019825.m2652PF13639.9zf-RING_2Domain28.71.40E-06
LITCHI019825.m2651PF00097.28zf-C3HC4Domain22.77.20E-05
LITCHI019825.m2137418PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain95.63.10E-27
LITCHI019825.m2138418PF00069.28PkinaseDomain96.61.70E-27
LITCHI019825.m2465523PF13637.9Ank_4Repeat25.21.90E-05
LITCHI019825.m2467566PF12796.10Ank_2Repeat42.11.00E-10
LITCHI019825.m2504537PF00023.33AnkRepeat252.00E-05
LITCHI019825.m2504533PF13606.9Ank_3Repeat20.90.00035
LITCHI019825.m2576623PF13637.9Ank_4Repeat29.49.70E-07
LITCHI019825.m2579658PF12796.10Ank_2Repeat29.31.00E-06
LITCHI019825.m2682750PF12796.10Ank_2Repeat31.52.10E-07
LITCHI019825.m2719750PF00023.33AnkRepeat23.36.40E-05
LITCHI019825.m2719748PF13606.9Ank_3Repeat24.42.60E-05
LITCHI019825.m2720773PF13637.9Ank_4Repeat38.99.60E-10
LITCHI019825.m2756794PF13637.9Ank_4Repeat27.44.00E-06
LITCHI019825.m2756784PF00023.33AnkRepeat20.10.00067
LITCHI019825.m2861978PF18346.4SH3_15Domain68.45.80E-19
LITCHI019825.m29841104PF18346.4SH3_15Domain53.91.90E-14
LITCHI019825.m211101212PF18346.4SH3_15Domain36.36.00E-09
LITCHI019825.m367125PF13637.9Ank_4Repeat25.22.00E-05
LITCHI019825.m369168PF12796.10Ank_2Repeat42.11.00E-10
LITCHI019825.m3106139PF00023.33AnkRepeat24.92.00E-05
LITCHI019825.m3106135PF13606.9Ank_3Repeat20.90.00035
LITCHI019825.m3178225PF13637.9Ank_4Repeat29.39.80E-07
LITCHI019825.m3181260PF12796.10Ank_2Repeat29.31.10E-06
LITCHI019825.m3284352PF12796.10Ank_2Repeat31.52.10E-07
LITCHI019825.m3321352PF00023.33AnkRepeat23.36.40E-05
LITCHI019825.m3321350PF13606.9Ank_3Repeat24.42.60E-05
LITCHI019825.m3322375PF13637.9Ank_4Repeat38.99.70E-10
LITCHI019825.m3358396PF13637.9Ank_4Repeat27.44.00E-06
LITCHI019825.m3358386PF00023.33AnkRepeat20.10.00067
LITCHI019825.m3463580PF18346.4SH3_15Domain68.45.80E-19
LITCHI019825.m3586706PF18346.4SH3_15Domain53.82.00E-14
LITCHI019825.m3712830PF18346.4SH3_15Domain45.67.20E-12
LITCHI019825.m3838959PF18346.4SH3_15Domain63.61.80E-17
LITCHI019825.m39651086PF18346.4SH3_15Domain71.94.50E-20
LITCHI019825.m310941214PF18346.4SH3_15Domain61.11.00E-16
LITCHI019825.m4649PF13445.9zf-RING_UBOXDomain27.82.00E-06
LITCHI019825.m4652PF13639.9zf-RING_2Domain28.71.40E-06
LITCHI019825.m4651PF00097.28zf-C3HC4Domain22.77.30E-05
LITCHI019825.m4137418PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain95.63.10E-27
LITCHI019825.m4138418PF00069.28PkinaseDomain96.61.70E-27
LITCHI019825.m4465523PF13637.9Ank_4Repeat25.22.00E-05
LITCHI019825.m4467566PF12796.10Ank_2Repeat42.11.00E-10
LITCHI019825.m4504537PF00023.33AnkRepeat24.92.00E-05
LITCHI019825.m4504533PF13606.9Ank_3Repeat20.90.00035
LITCHI019825.m4576623PF13637.9Ank_4Repeat29.39.90E-07
LITCHI019825.m4579658PF12796.10Ank_2Repeat29.31.10E-06
LITCHI019825.m4682750PF12796.10Ank_2Repeat31.52.20E-07
LITCHI019825.m4719750PF00023.33AnkRepeat23.36.50E-05
LITCHI019825.m4719748PF13606.9Ank_3Repeat24.42.60E-05
LITCHI019825.m4720773PF13637.9Ank_4Repeat38.99.70E-10
LITCHI019825.m4756794PF13637.9Ank_4Repeat27.44.00E-06
LITCHI019825.m4756784PF00023.33AnkRepeat20.10.00068
LITCHI019825.m4861978PF18346.4SH3_15Domain68.45.80E-19
LITCHI019825.m49841104PF18346.4SH3_15Domain53.82.00E-14
LITCHI019825.m411101154PF18346.4SH3_15Domain24.62.60E-05
LITCHI019825.m5649PF13445.9zf-RING_UBOXDomain27.82.00E-06
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LITCHI019825.m5137418PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain95.63.10E-27
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LITCHI019825.m5465523PF13637.9Ank_4Repeat25.22.00E-05
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LITCHI019825.m511101154PF18346.4SH3_15Domain24.62.60E-05
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CTCCTTCTCCAATGCGGCCACTGCTTCTGCAAGGATTGTCTCTCGAGGCTTTTCTCCTCT
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GTCAACGCCCTCCGCAAGAACTACGCCCTCCTCTCTCTCATCCTCTCCGACGCCGCCGCC
GCCACCGCCGCCCCCTCCGCCGTCGTCAACAACCACCACCACCAGGACTCCGACACTGAC
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GGGTCGCACGCGTCGAGCTCGATCGAGGTGGGGGCGCAGACGGATGTGAAGCTGGTGAGG
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TCTGTTCAGTCTGCTATGCAGAGAAATGAAGGCAGGCTCACTTTGGAGCAGATTCTCAGG
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GGGCTTGCTGCGATTCTGAAAAAACCTGCCTGCCGGAAAGCTCGAACAGAATGTGATTCC
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GGCTGA
>LITCHI019825.m2
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TCTCCCGACACCTCCCTACTCTGCCCTCGCTGTCGCAATAAATCCCTCGTTGGTAACTCC
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GCCACCGCCGCCCCCTCCGCCGTCGTCAACAACCACCACCACCAGGACTCCGACACTGAC
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CGGCACAAGGTGGCTGTCAAGAGGGTGGCTATAGGGGAGGAAATGGAGGTGGAGTGGGTC
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TCCCAGATCCATTCATGCATGGACTGTACAATGCTCAGTCCGCATTACACAGCTCCTGAG
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GCAGAATCAGATGCCTGGAGTTTTGGATGCACATTGGTGGAGATGTGCACTGGTTCTATG
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ATCAAATCTTCTGGTTTAAATGTGACGGAGCCACCTGCATCTGATTTGAAGGTCTTTGAA
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CTGCTTGCCAAGAATGCATCAGGAACCTTAAGATCGATTTCTTCTTCACTTTTAGAAGCA
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CCTCCTCTTGTTTTTGCTTTAGCAGCTGGATCCCCGGAATGTGTTCATGCTCTCATCAAA
AGAGGCGCTAATGTCAGGTCTAGGTTGAGGGAAGGCTTTGGTCCATCTGTTGCTCATGTT
TGTGCGTACCATGGCCAACCTGATTGCATGCGTGAGTTGCTATTGGCTGGAGCGGATCCG
AATGCAATAGATGATGAGGGTGAATCTGTACTCCACAGAGCTATTGCAAAGAAATACACA
GATTGCGCTCTTGTTATATTGGAAAATGGGGGTTGTAGATCGATGGGCATTCAGAATGCA
AAAGATTTGACACCATTGCATTTGTGTGTAGCAACATGGAATGTGACAGTCGTTAAAAGG
TGGGTTGAAGTTGCATCTCCAAGAGAAATTGCTGATGCCATTGACATACCCAGCCCAGTT
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CGGGAAAATCTTGAATGGCTCATTATTATGCTTCGTAACCCAGATGCTGCTGTTGATGTT
AGAAACCACAGTGGTAGAACACTACGTGACTATTTGGAGGCTCTTCCCCGGGAATGGATT
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>LITCHI019825.m3
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>LITCHI019825.m4
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>LITCHI019825.m5
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TCTCCCGACACCTCCCTACTCTGCCCTCGCTGTCGCAATAAATCCCTCGTTGGTAACTCC
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GCCACCGCCGCCCCCTCCGCCGTCGTCAACAACCACCACCACCAGGACTCCGACACTGAC
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GGAAAAATTGTGAGGATTGACATGGATGGGGCATTGAATGTAAGTGCTCCCCCTCTCTCT
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>LITCHI000894.m1
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VIQLIVTLSQFLLTILQVENSYNGSTFPLAFAMIAVVFIFKKGGKNVDDHSPPRDLHLPL
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FTNYKDLYKELKMMFNIRLYFNKQPKSHWELIYEDDNGDMFLVGDNSWDEFYHNVRKLYL
YKKKSLRNNFMVNPQQFMHDNISPPAPLPAEQQQTMVEPVTAYDPHSSRPNDIDIEAPST
LDLEMMTAPAPAPTSVSLDLLKADSEEGLLRLAQAEMEASDVTRPWKKPRLINSDLILLV
TEGSMLAAS.
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>LITCHI000894.m1
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CATTTCTGCAACAGGGGTGTGGCCACTTGTACATTTATGAAAAGCATTGTAAATATAGCA
TGGATTTACTGATGTACATTATTTATTTCCAAGGATTTAATGAAAACTTAAAAGCATTTT
ATTTTTATTCTTGAACCTGTTAAATAACTTTTTGTTATGCCTTGCTAACTTGTTTTGGGC
TAGGCTCCCACAATTTAGGTTGTAGTTTCAAGTGAAAATTTTTAAAAGTGTCAC
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TTATATGACAAAAAAGAAAGCGCGAATTAGAAGCGAAGAGCGTCGAATAAGAGACCTCCA
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CCGTACGGCGCATAATATCACGGCGCGAAGAACCTCCTTACAAGTAGCGCGCGGATTGAA
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GGAAAAAAAAGAAAAAGGTTGTTTAAAGATCTGGGTTTAAAACCCAAATCTTCAACATAA
CTTCTAATAAAACAAAAAACAAAAATCAAAGAATAAAAAAAAAAAAAAACTGAAAAAAAT
CAAAGAACTAAAAAACTGAAAAAAAAAAAAAAAGTTGTTTGAAGAGAGAGGGTTTACGGA
TTGAGGATTTGTTTTCCGTTGAAGTTGGAGGAAGAGATAGGAAAGGTTGACAAAGAGGGA
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GAAAAAACTAAATAGAAATGGGCCGGGTTATGTAAGTCCAACTTTCCTCGAACGCTACCC
GAAATTTCACTTTTCATTTC
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TAATTCTTTATGTAAGATATTTGACTCTGTTGTGTAATGGCTGATGGGGTTACATTTTAT
AATGTCGGTTAGGGGATTTAATCATGTATAAAATAATTTATATATTTTAATTAAAATAAT
TAAAAATAGGCTTGTTGAATTAATTTAATTTAGTTACGAAATTAACCCATTGGCTTAGAC
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