Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI019823Chr1236798943682894+Trihelix transcription factor ASIL2

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI019823.m143129PF13837.9Myb_DNA-bind_4Domain67.79.30E-19
Download   Copy
>LITCHI019823.m1
ATGGACAAAGAAAATAACCAAGAAATCGCAAACCCATCTCTCCTCTCTGTGGTCAAAGAA
TCAGAAGAGTCTTCGAAAAAACCCTCTACAGCCACCACCACCACCACCACCAACGACAGG
CTCAAGAGAGATGAATGGAGTGAAGGTGCAGTGTCAAGCCTACTTGAAGCTTATGAGTCA
AAATGGGTCCTCAGAAACCGAGCCAAACTCAAGGGACATGACTGGGAAGACGTGGCTCGA
CATGTCTCCTCTCGAGCCAACAACACCAAGTCCCCCAAAACGCAGACTCAGTGCAAGAAC
AAGATCGAGTCCATGAAAAAGAGGTACAGATCAGAGTCTACCAATGCTGATGGATCCTCC
TGGCTTTTGTATCCACGCCTTGATCTCTTGCTTCGTGGAACTAGTTCTATGGTGGCACAG
CAGCACCATCAACAGCAAGTCAATCCTGGTGCTTTGATGTTGATGGAGCCATCGCCTGCC
TTGGTGGTGCAACCTCCTCCTCCGCCTGCTGCTCCGCCACCACCACCACCTGCTGCAACC
GCTCAGAACTCACACGGGTCCAATGGGGTTGATAGGTTGGCCAAGGAAGATGGAGGAGGA
ACGAAATTATCAGACCATGTATCAGACAAGAAAGCCATGGAAACAGACAGTAGCACGCCA
GCACTATACAGTCATGACAAGGAGAAATTCAGGTCGAAGAAACTGAGGACGAAAATGGAG
AAAAACAAGAGAAGGAAAAGGGAAGAATGGGAAATAGCTGAAAGCATTAGGTGGCTAGCA
GAAGTCATGGTGAGGTCAGAGCAAGCAAGAATGGATACAATGAAGGAAATAGAGAAAATG
AGAGTGGAAGCAGAGGCCAAAAGAGGAGAAATGGACCTCAAAAGGACTGAGATCATTGCC
AATACTCAACTAGAGATTGCTAAGCTTTTTGCAGCTGCCTCAGGTAAAGGCGTTGATTCT
TCCTTGAGAATTGGCAGAAATTAG
Download   Copy
>LITCHI019823.m1
MDKENNQEIANPSLLSVVKESEESSKKPSTATTTTTTNDRLKRDEWSEGAVSSLLEAYES
KWVLRNRAKLKGHDWEDVARHVSSRANNTKSPKTQTQCKNKIESMKKRYRSESTNADGSS
WLLYPRLDLLLRGTSSMVAQQHHQQQVNPGALMLMEPSPALVVQPPPPPAAPPPPPPAAT
AQNSHGSNGVDRLAKEDGGGTKLSDHVSDKKAMETDSSTPALYSHDKEKFRSKKLRTKME
KNKRRKREEWEIAESIRWLAEVMVRSEQARMDTMKEIEKMRVEAEAKRGEMDLKRTEIIA
NTQLEIAKLFAAASGKGVDSSLRIGRN.
Download   Copy
>LITCHI019823.m1
CACGTACCTCTCACTTGATATGTAGATAGTTTTTCCACGTTTTGTGGATTGCCCTTTTTC
ACTACTTAAAATAAAGTCTGAACTATATTTTAGAATCTTATTTCTATTGGTCCCAATAGT
ACTCCAACTAATACCAATAATTAAAAGAAAAAAAAAATCACAAACTCTAAGGTAATTCTA
CTGCCATAGCTTCATTACAATAGTAAACCATGATCACCATATCAAAAAAGAACAAATTTA
GTGTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCTTTGGTTGGCCACTAATGCTAACTTTTCCTTTTTTTT
TTTTCCATGATCTTTCTCATTCTTTGTAATGTTAGTAGTTCTTTTCTCTCTCACTCTCTC
TTTCTCTCTACAAGACATTGTTCTCTTAAACCTTCTTGTTTGAAACCAATTCTACATATA
CAAACACAACAACATGTTAACAGCTAAATAACCTTACAGTGATTATCTTTCTTTTTGTTT
TTTTCTTTATTTTTTTTCTGCTTATGATCATGGTCATGAGGAGAGATGGACAAAGAAAAT
AACCAAGAAATCGCAAACCCATCTCTCCTCTCTGTGGTCAAAGAATCAGAAGAGTCTTCG
AAAAAACCCTCTACAGCCACCACCACCACCACCACCAACGACAGGCTCAAGAGAGATGAA
TGGAGTGAAGGTGCAGTGTCAAGCCTACTTGAAGCTTATGAGTCAAAATGGGTCCTCAGA
AACCGAGCCAAACTCAAGGGACATGACTGGGAAGACGTGGCTCGACATGTCTCCTCTCGA
GCCAACAACACCAAGTCCCCCAAAACGCAGACTCAGTGCAAGAACAAGATCGAGTCCATG
AAAAAGAGGTACAGATCAGAGTCTACCAATGCTGATGGATCCTCCTGGCTTTTGTATCCA
CGCCTTGATCTCTTGCTTCGTGGAACTAGTTCTATGGTGGCACAGCAGCACCATCAACAG
CAAGTCAATCCTGGTGCTTTGATGTTGATGGAGCCATCGCCTGCCTTGGTGGTGCAACCT
CCTCCTCCGCCTGCTGCTCCGCCACCACCACCACCTGCTGCAACCGCTCAGAACTCACAC
GGGTCCAATGGGGTTGATAGGTTGGCCAAGGAAGATGGAGGAGGAACGAAATTATCAGAC
CATGTATCAGACAAGAAAGCCATGGAAACAGACAGTAGCACGCCAGCACTATACAGTCAT
GACAAGGAGAAATTCAGGTCGAAGAAACTGAGGACGAAAATGGAGAAAAACAAGAGAAGG
AAAAGGGAAGAATGGGAAATAGCTGAAAGCATTAGGTGGCTAGCAGAAGTCATGGTGAGG
TCAGAGCAAGCAAGAATGGATACAATGAAGGAAATAGAGAAAATGAGAGTGGAAGCAGAG
GCCAAAAGAGGAGAAATGGACCTCAAAAGGACTGAGATCATTGCCAATACTCAACTAGAG
ATTGCTAAGCTTTTTGCAGCTGCCTCAGGTAAAGGCGTTGATTCTTCCTTGAGAATTGGC
AGAAATTAGTAGTAGGGTTTCAGGCAGGCAAAGACATATTTGTGGGTACGTATATACGTA
CGTATTGATGAAAAAGTAGCAACTAATTATATTTATGTGGGTATGTTAGATTATGTGTAT
TTTAATTTGATGACACTGATAAAAAGCAAAGAGAGGCTTTGGGAGATTTAACTTGATGTA
GGTAGGGTAAGTAGATAAAGAATGGTAGGTGAAATAAACCCCTA
Download   Copy
>LITCHI019823.m1 +  Up_Stream_Len 2000
GCAAATTAATCCATCTCTTTTTAACAAAACAATGGGAAATTATTTTTAATATCACATATC
AAAGCCCCTTAAATAAGTTTAAGAAAAAAGAATGACCACACTAATATGTTATGACAGTTT
CATGATAGAAGAAGAACATACTTCTATTCAATAAAGAACATTCAGGAGCTAAGACATAAC
TGAAGCTCATCATCTTTCTTTCCCCTAGTTTTCAATGTTTATTCTAATGGTTAAGTCAAA
ATTTAATTTAGACATGAGTAAAATTTGATTTCAAAAATTTTTACTTATCTATAATTAAAG
TGAATCTTACTTATTAAGCTAGTTGATACGCTTAATCCTTTATGTTGATAGTTAATCATA
TCTGAGCAAATTGTGACTAGAAGGTTAATTAGATAAATGAAATAGGCCCCCCTACAATAC
TTTTTTTAACAACAAATGACTTGGTGATTGATTAACCTATTTGACAGGGCATCCAAACAA
ATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTGCATGGATAGGAAGAATCAAAATGAGAGGCCCCAT
TGAAATATAGGGTCAAATACAAAAGCCAATTCTAGTGGTGATGGATCCTCCAAAGTGTTT
CAAAAAGGCAAAGAAAAAAAGCAAAGCCAAGGCTAAAAAAGAGAGGGTGAAAAGGGCATT
GGCCTAGAGAAAAAGAAATCGTGGGTGTGAATTGAATTTTTTTGGGAGGTGATGGGATAT
ATTGGGAGTGGGTGACAGACCCACGTGAGTGACCACCACCACCACCACCACCAATTCCCA
CCACTATCATGCATCCATCCATCTCTCTCTCTCTCTCTTCAAGTCTCTACACTTATTAAG
GCCAGTGGATTTCTTGGTTGGCTTCATATCAACGCTAACAGCCAAAATAAACCCGACCAA
CAACAATAAAACCAACATACCTGCTAATAAGATATCAAATATAAAGTGAAAAAGGCAAAA
TCAAAAGTTAGGATGTTATTATCATCATTAACTCATTTGACAAACTCATCACTTTCTTTG
GTTGCCCACTACCTTCAATCTTTCCTCATTTTTCTCTCTAATGCTAATGGCCATTTTGAG
ATTCTCTCTCTATTTGACCTCAATTATGCCTTTAATCTTTCGTCTAATATATGGTGTTTC
CATCTTAGGCTTTTGTACTAATTTACATTTAATTAAGTTTTGAATGATATGATCATAATC
TATGTATCTATATTATCTTTTTTGTCATTAAATTATTAATTTTTCAATTATAATATTTAT
TTACATGCGATAATTGCTACCATACTAAAGCTACAAATTTACTATTGTTACAAAAGATAT
GATTCTAAAATTTAAAATTTCAATCATAACCTAATCATTTGCAATAATATTTTCAAAACT
ACTAACTAAAATTCACGAACTCTATGCAAAGCAGGGGTGGCTCAGTGGTATAAGACCGCC
CTTTATCAAGCCTTGACTCCCAAGTGCTTGGTTCACACGTACCTCTCACTTGATATGTAG
ATAGTTTTTCCACGTTTTGTGGATTGCCCTTTTTCACTACTTAAAATAAAGTCTGAACTA
TATTTTAGAATCTTATTTCTATTGGTCCCAATAGTACTCCAACTAATACCAATAATTAAA
AGAAAAAAAAAATCACAAACTCTAAGGTAATTCTACTGCCATAGCTTCATTACAATAGTA
AACCATGATCACCATATCAAAAAAGAACAAATTTAGTGTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCTT
TGGTTGGCCACTAATGCTAACTTTTCCTTTTTTTTTTTTCCATGATCTTTCTCATTCTTT
GTAATGTTAGTAGTTCTTTTCTCTCTCACTCTCTCTTTCTCTCTACAAGACATTGTTCTC
TTAAACCTTCTTGTTTGAAACCAATTCTACATATACAAACACAACAACATGTTAACAGCT
AAATAACCTTACAGTGATTATCTTTCTTTTTGTTTTTTTCTTTATTTTTTTTCTGCTTAT
GATCATGGTCATGAGGAGAG
Download   Copy
>LITCHI008918.m1 GenomeSequence + 
CTCCTTCAAGTCCGCTCCAGTTAGGACTACCGCACTTGAAGAGACCGGACCCTCTTATTG
GCGGACGCTAGTCCCTCTTTTAAATCCACTTTAATCTCTCACTTGCTGCCTCCTCCGGTT
ACCTCTCTCCACTCGCTTACTTACCTAACCGGTTATTCTTCCTACCTTTCCACCTCCCCA
GCCCGTTCCCGATAACTTCTCCAACCAATCACCACAACCCACGTGCCCACCTCTCGTTGC
CCATATAGGTGGATTCGTACGTCTTTCCAGACACTTCCGAGGGCATTTTGGAAACTAAAA
TTCCGTGATAGTGGACTAGCGGTAACATTATCCAATAAACAAATGCCAGGTGAGTCTGCA
GTAGCATTTAATTAATGAAACCAGATAACACCGGATTGGTCCCCCTCTCAAAATTTAACT
TTCATGTAAGACGAATTTGGGTTGAATTTCCATGAAATTTGACTATGTTTAAATTATTAC
ACGCCCGAGTAATGTTGTCGTTTCCGGTTCCACACCACTTATCTTACCACCGACCAATAC
CGACCTTCCACGTCACCAAAACCAACAATAGAGCATGCCGTGGCGGGATGTGACTGGTGG
CGTAAAAAAGCAAATGAATAATATCAAATCATGCACAATAACTCTCAGTGCGTCCGTCTT
TAATAATTTCTCTCTCTCTCTACTCTATTGGATAGGCGATTTTATCAAAAAACAAAAAAG
GAAAAAAATACCCCACCAAAATAAAAAATTTAAAAAAATAAAAGATTGCATTTCATGTTA
ATTAAATTATTATTTATTTAATTTATTTTTCTGGGTTCTCATGAAACTGAAAGAAAAAGC
AGAGAGCTTAGTAGTTGGAGAGATGATTGAAGAAGAAGCTCTCTATCTCTCTCTTTCTCT
GTCTATCTCTTGAAGTAGATCTGTGACAGTGAAACAATCTCTCAAATGGGTTTTTATGGT
TCTGGTTTCTTCTCTGTTTCCTAGCTGGTAAGTTCGTCTCTTCTTCTTCTTGTTCAGATT
TCCATGTAAGTTCGAAACTTGTTTGGTTGTTGTTGTTGAGGATGATGATGATGATGATCA
AGCACACGCTTGCTTTGTCTGTTGTCTAGTAGTTATAGGGACACTTACGTGCACGAGCTA
AGTAATGAGTGTGATATGATCACATATGAGAAGATCTTCTAACACGGGTTTCATTTGTCC
AAGATTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGTTTCAGATCTTTTACTAGTTTC
TGCTATCTGGGTATGTCTCTGTTTGTATTTTTAACTGATGCCTTGTGTTAAGTTTCAATG
TCATGGTTTTGACTTTATATTGTTTGTTAGATCGAGTGTTCTCTGTTTTTCTCTGTTTGG
TTTCCGAGAAAATGGGTGTAAGGATAAGCTTCAAGTTAATAAATCTCAGTTAATTTATGA
AAAATATTCATTTGGGAGATAATTGAAGATATATATTAAAAAAATCAAAATTTTGAAGTT
GATATTTTTCCCTTTTGTTTCCTGGATTTTTGCTGGAACGAAACAGACAGTTGACCATGA
AACTGATGCTGGTTTCATTGGTTGTTAAAGGAATATAATGAATTTTTTGTGTGTGTGTGT
GTGTGTGTGTGTTTGTTTTATGGTATTATATACTGTTTGGTTTGTGGAAATTTTGTAAGA
AAGCAAAAGAAAATGATAGATAAGGGAAACTGATTTTTCTTCTTTTGACAAAATCAAAGA
CAGACTAGACTAGGTAGTGTTAGAGAATCTAATGAGATTTGTTTGAGTCATTGTTTTTTC
CTATTTATTTCTTGTTAAGGAAATTAGTTTACTATCATTTATGTGGATTTTTTTTTTTGG
TTTTGTTAATTATCTATATGTTTGTGAAAGTTCATTGCATCTAATGAGTCTGTTTATCTA
GGGGTGATTCTAATTAATGTGTATGCTCTATTTCAGCTAGTTTTTAAGCAAATGAAAGCA
TGTGCTGTGGACAGGAGCGGTTAAATCTCAGGCCGTCTCCAAAACCATCTATTATTTCTT
TTGACGAAAGTAGACCTACGAACATAGACATGAATCACTTGACTGTTGAGACAGACGATA
CTTTTGCAAGCTTGCTTGAGCTTGCGGCTAACAATGATGTCGAGGGCTTCAAGCGATCAA
TTGAGTGTGATCCGTTGGGTGTTGATGAGATTGGATTATGGTATGGCCGGCAGAAGGGCT
CGAAGCAGATGGTAAATGAAGAGAGGACTCCGCTAATGGTGGCTGCCACATATGGTAGTA
TTGATATCATTAGGTTGATTCTTTCTCAATCTGATGCTGATGTGAATAGGTCTTGTGGCA
ATGACAAGAGTACTGCCCTTCATTGTGCTGCCTCGGGTGGAGCAGTGAATGCCGTTGATG
TTGTGAAGTTGCTCTTAGCTGCTGGTGCTGATCCGAATTTGGTGGATGCAAATGGTCATC
ACCCTGTGGATATAATTGTTGTTCCTCCTAAGTTCCAAGAGGTTAGACTGGCACTTGAAG
AACTTCTTGCTGCTGAAGGCACTGTTGTTGAGCGTAATCTTAGGGTGTCAACAGCTCACT
CTAATTCTAATTCTAATTCACCACCGTTTTCACCCACACTTGAAAATGAATCACCAACAT
CAGCTTTGGATTCCCCTATGAAGTCTAAGCTAAATGATGTTCCTATGTCTTCTACATCGG
AGAAGAAAGAGTACCCCATCGACCCATCTCTCCCAGACATCAAGAACAGCATCTATTCTA
CTGATGAATTCCGGATGTATTCATTCAAGGTGCGGCCTTGTTCACGTGCCTACTCTCATG
ATTGGACTGAGTGCCCATTTGTGCATCCTGGGGAAAATGCTCGAAGGAGGGATCCTAGAA
AGTTTCATTACAGTTGTGTTCCTTGTCCTGATTTCCGTAAGGGTGCTTGTAGACGTGGAG
ATATGTGTGAATATGCTCATGGTGTTTTTGAGTGCTGGTTGCACCCAGCTCAATATCGAA
CTCGGCTTTGCAAGGATGGTACAAATTGTGCCAGGCGAGTCTGTTTCTTTGCACACACTC
CTGATGAACTTAGGCCATTGTATGTGTCCACTGGTTCAGCCGTCCCCTCTCCTCGCTCAG
GTACCTCTGGTGCTAATGCCATGGACTTCGCTGCGGCATTGAGCCTTTTACCTGGCTCTC
CTTCATCAGTTTCTGTCATGTCTCCTTCACCATTTACCCCACCAATGTCTCCTTCTGCCA
ATGGCATGTCGCACTCAAATGTGCCTTGGCCCCAACCAAATGTCCCTGCTTTGCATCTTC
CTGGAAGCAATCTCCAATCCAGTCGCTTAAGATCATCTCTTCATGCAAGGGACATTCCTG
CTGAAGACTACAATTTGCTGCCAGATTTTGATGTACAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCTGT
TAAATGAGTTATCTAGCCTCTCACAACCATCTTTGAGTTCTAATTCCTTGAACCGTTCTG
GTAGGTTGAAAACTCTAGCTCCGTCAAATCTTGATGATTTGTTCTCTGCTGAGAGCTCAT
CTCCCCGGTACTCTGATCAAGCATTGGCCTCTGCAGTTTTCTCTCCGACACACAAATCTG
CTGTTCTTAATCAATTTCAGCAGCAGCAGCAGACCATGTTATCACCAATCAATACAAGTT
TTTCACCTAAGAATGTCGAACACCCTCTATTGCAGGCCTCTTTTGGAGTGCCATCATCAG
GGAGGATGTCTCCTCGAAACGTGGACCCTATATCACCCATGAGCTCAAGGGTTTCCTTGT
TAGCTCAACGTGAAAAGCAGCAACAGTTTCGCAGCCTCAGCTCTCGTGAACTCGGCTCCA
ACTCTGCTGCTGCTGCTGTTGGTTCTTCGGTTAATTCCTGGTCAAAATGGGGTTCCTCCA
ATGGGAAGCCAGATTGGGCTGTAACTACAGATGAATTGGGTAAGCTTCGGAGGTCATCCT
CATTCGAGCTTGGCAATGGAGAAGAGCCTGATCTGTCATGGGTTCAATCGCTTGTTAAAG
AATCACCAACTGAGGTGAAAGAAAAGGTAGCTACACCTGCCTCGGGTGTCACTGCTGTCC
CTTCTTCAAGTGAGGGTTCAAATATGAACCCCCAAATTGACTCAGTCGACCATGCTGTTT
TGGGAGCGTGGATTGAGCAAATGAAGCTAGATCAGCTTGTGGCTCAGCAAAACTGAAATG
AGTTTCACTGAGCCCTGAGTTAGTGAACAACAGAAAGTTTTGGTAAATAATGTGATCTTG
TTTTTTGGGGTGATGGTGTGGATGTGGAAGATTAACAACAGAAACAGCAATGGGAAAGGC
AATGCAAGAAGTCAGTTAGTCTATTGGAAAGGGAAAATTCATTTTCACCATTTATTATTA
CAACAGAAGTTAGAAAAAGGGTGAGTAAAACAACAACCTCTGGGTTTTGTAGCAAAAAGA
CTAGAGCCCAGACTGGATGATGTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTCAAATATTTTCTCA
AATCAACATTCCTATTATTGTCATTTTTTACCTTTCTAAGATGAGCAACATGTTCCATTA
CAAAGAAGCTAGAAGAAGTCTTTATGTTTGGTTTATCCTTCTTTTCTCTTGTAATTCCAT
TAGCATCTTTGGAGATTAAGTGAGAGGGTATTGCAGTTAGTTCTCTTACCCAAGAGTTCC
AAAGTGTTTGGTTTTGGTCCATTTTTTGGGATGAGAGAAACAGGAAATTTTGTCTCTTTT
TGTTGTAGTTTGGAATCAATAATTTTGGGTGCTAGTGAGATTGTTGGGAAGAAGAATAGG
AGGATGGAGAACTAATGATCCTCTGATGATGTAACATCAAACTATAGCTTATTATCGCTT
TTATGAATACCTTTATTATTTTTTTAATCTCATGTGCTACCACTCACTTATTCCATTTCC
CTAATCTTCCCTCTTATCTCAACGGTATTGGTTTTAGCTAGTTGTGGATTCTTGGGATGG
CAAACTTGTGCTTTCATGGATTCCAAATCCCATGAGTGGGATTTTGTGCGTGAAATGTGG
ATGTGAGAAAGGCTTTTATGTACATATATTTATAAAATTTCTGCAATCTTTACAGCATTG
GTAGATCTTGATGCTAATCATGCTAGCTAATTATTTTAACTTGTGTAGTGTCTTGGAATG
TGGAGTTTTTATTCTACCTTTAGAGAATGATTAAACTTTATGTTAATGGTATATTATTGT
TCTCGTTGTGAT