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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI019623 | Chr15 | 22247558;22249770 | 22256253 | + | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g06840 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI019623.m1 | 30 | 68 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 33.9 | 3.10E-08 |
LITCHI019623.m1 | 294 | 329 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 29 | 7.00E-07 |
LITCHI019623.m1 | 294 | 335 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 27.1 | 2.80E-06 |
LITCHI019623.m1 | 629 | 894 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 162.9 | 9.80E-48 |
LITCHI019623.m1 | 630 | 896 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 167.9 | 2.70E-49 |
LITCHI019623.m2 | 207 | 242 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 28.7 | 9.10E-07 |
LITCHI019623.m2 | 542 | 807 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 163.2 | 8.20E-48 |
LITCHI019623.m2 | 543 | 809 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 168.2 | 2.20E-49 |
LITCHI019623.m3 | 30 | 68 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 34.3 | 2.30E-08 |
LITCHI019623.m3 | 294 | 335 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 27.3 | 2.50E-06 |
LITCHI019623.m3 | 629 | 720 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 55.6 | 5.30E-15 |
LITCHI019623.m3 | 630 | 713 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 57.7 | 1.10E-15 |
LITCHI019623.m4 | 81 | 122 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 27.6 | 2.00E-06 |
LITCHI019623.m4 | 416 | 681 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 163.6 | 5.90E-48 |
LITCHI019623.m4 | 417 | 683 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 168.6 | 1.60E-49 |
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>LITCHI019623.m1 ATGATGTCGAGATTTAGACTTTCTGGATTCGTTTATGCTGCGGCTTGTTGTTACTTGCTG CATCTTGCTTTTGCTCAAATTACAGATCCTTCAGAAGTCAGTGTCCTGCAGGCAGTCAAG AACAATTTAAATGATCCTGTGAAGCATCTCAGAAATTGGGGAAGTGGGGATCCATGCACA TCAAATTGGACAGGAGTTTTATGTTTCGATACAGCTTGGAACGACGGTTACTTGCATGTT CAGGAGCTTCAGCTGCTGAATATGAATCTTTCTGGAAGTTTAGCACCTGAGCTTGGCCGA CTCTCTCGACTTGTGATATTAGATTTCATGTGGAATGATCTGACTGGAAGCATACCAAAG GAGATAGGAAGTCTTTCAGCCTTGACACTCTTGCTCTTGAATGGAAACAAATTATCAGGT TCTTTACCTGAAGAGCTTGGCTATCTTACAATGTTAAATAGGCTTCAAGTAGACCAGAAC CATATGACAGGCCCTATACCAAAATCATTTGCTAACTTGAGCAGTGTGAAACACCTTCAC TTGAACAATAACTCATTTAGTGGTCAAATTCCAGCTGAGCTCTCTAATTTATCTACTCTT CTTCACTTGCTTTTAGATAATAATAACTTTTTTGGGAATCTTCCACCAGAAATCTCAAAG CTGCCAGAGTTGCGCATCCTTCAACTTGACAACAACCAATTTAATGGTTCTGAAATTCCT GCAACTTATGGAAACTTTCGCCATTTAGCAAAATTAAGTCTACGGAATTGCAGCTTGCAG GGATCTGTTCCTGATCTTAGTGGGATACCAAGCCTTTTGTATTTGGATCTTAGCCTGAAT CAACTAACAGGACCTATACCATCAAATAAGCTTTCTGATAATATGACAACCATCGATTTG TCAGACAACAATCTGAATGGATCCATCCCTGGAAGCTTCTCAGATCTTCCTTCTCTTCAG 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ATGAATCTTTCTGGAAGTTTAGCACCTGAGCTTGGCCGACTCTCTCGACTTGTGATATTA GATTTCATGTGGAATGATCTGACTGGAAGCATACCAAAGGAGATAGGAAGTCTTTCAGCC TTGACACTCTTGCTCTTGAATGGAAACAAATTATCAGGTTCTTTACCTGAAGAGCTTGGC TATCTTACAATGTTAAATAGGCTTCAAGTAGACCAGAACCATATGACAGGCCCTATACCA AAATCATTTGCTAACTTGAGCAGTGTGAAACACCTTCACTTGAACAATAACTCATTTAGT GGTCAAATTCCAGCTGAGCTCTCTAATTTATCTACTCTTCTTCACTTGCTTTTAGATAAT AATAACTTTTTTGGGAATCTTCCACCAGAAATCTCAAAGCTGCCAGAGTTGCGCATCCTT CAACTTGACAACAACCAATTTAATGGTTCTGAAATTCCTGCAACTTATGGAAACTTTCGC CATTTAGCAAAATTAAGTCTACGGAATTGCAGCTTGCAGGGATCTGTTCCTGATCTTAGT GGGATACCAAGCCTTTTGTATTTGGATCTTAGCCTGAATCAACTAACAGGACCTATACCA TCAAATAAGCTTTCTGATAATATGACAACCATCGATTTGTCAGACAACAATCTGAATGGA TCCATCCCTGGAAGCTTCTCAGATCTTCCTTCTCTTCAGACACTGTCACTAGCGAACAAC TCTCTTACTGGTTCAGTCCCTGCAGACATGTGGCAGAGCAAAACTTTCAGTACAAGTGCT AGACTGACACTTGATTTGAGAAACAATAAGCTGTTGAACATTTCAGGAGATCTAGTTCTT CCAGATAATGTCACCTTAAGGCTTGGGGGCAATCCTATCTGCACCAAGGAAAACGTACCA AACATCGGCCTATTCTGTGGTTCTGAAGCTGGAGGGGATGAGACCTCAACATACTCAAGA 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>LITCHI019623.m1 MMSRFRLSGFVYAAACCYLLHLAFAQITDPSEVSVLQAVKNNLNDPVKHLRNWGSGDPCT SNWTGVLCFDTAWNDGYLHVQELQLLNMNLSGSLAPELGRLSRLVILDFMWNDLTGSIPK EIGSLSALTLLLLNGNKLSGSLPEELGYLTMLNRLQVDQNHMTGPIPKSFANLSSVKHLH LNNNSFSGQIPAELSNLSTLLHLLLDNNNFFGNLPPEISKLPELRILQLDNNQFNGSEIP ATYGNFRHLAKLSLRNCSLQGSVPDLSGIPSLLYLDLSLNQLTGPIPSNKLSDNMTTIDL SDNNLNGSIPGSFSDLPSLQTLSLANNSLTGSVPADMWQSKTFSTSARLTLDLRNNKLLN ISGDLVLPDNVTLRLGGNPICTKENVPNIGLFCGSEAGGDETSTYSRNSTIDGCPIAACP TENFFEYVPASPLSCFCASPLRIGYRLKSPSFAYFPPYMYSFEGYLTTTLNLDIYQLSIA SFAWEKGPRLRMYLKLYPKANYMHSNTFNESEVQRIRGRFTTWRFPRDDLFGPYELLNFT LQGPYATMNVKTRRTGITGGILAAIIVGAVACAVATSAIITLLIAKRHARYQHSLTRKRL SSSRVSMKLDGVKDFKFKELAQATDNFSSSTQVGRGGYGKVYKGVLPDNTVVAIKRAEEG SLQGQKEFLTEIKLLSRLHHRNLVSLVGYCDEEEEQMLVYEFVPNGTLRDWLSARGKESL NFGMRLRIALDSAKGILYLHTEANPPVFHRDIKASNILLDSKLNAKVADFGLSRLAPVLD EDGTVPTHVSTIVKGTPGYLDPEYFLTHKLTDKSDVYSLGVVLLELLTGMQPISHGKNIV REVNVAHQSGMMFSIIDSRMGSYPAECLEKFVALALSCCHDKPEHRPSMLDIVRELENIL KMVPESETTVSESTTPIFSGQSASSSSTMLSRDQYMSTNVSGSELVSDVIPIITPR. >LITCHI019623.m2 MNLSGSLAPELGRLSRLVILDFMWNDLTGSIPKEIGSLSALTLLLLNGNKLSGSLPEELG YLTMLNRLQVDQNHMTGPIPKSFANLSSVKHLHLNNNSFSGQIPAELSNLSTLLHLLLDN NNFFGNLPPEISKLPELRILQLDNNQFNGSEIPATYGNFRHLAKLSLRNCSLQGSVPDLS GIPSLLYLDLSLNQLTGPIPSNKLSDNMTTIDLSDNNLNGSIPGSFSDLPSLQTLSLANN SLTGSVPADMWQSKTFSTSARLTLDLRNNKLLNISGDLVLPDNVTLRLGGNPICTKENVP NIGLFCGSEAGGDETSTYSRNSTIDGCPIAACPTENFFEYVPASPLSCFCASPLRIGYRL KSPSFAYFPPYMYSFEGYLTTTLNLDIYQLSIASFAWEKGPRLRMYLKLYPKANYMHSNT FNESEVQRIRGRFTTWRFPRDDLFGPYELLNFTLQGPYATMNVKTRRTGITGGILAAIIV GAVACAVATSAIITLLIAKRHARYQHSLTRKRLSSSRVSMKLDGVKDFKFKELAQATDNF SSSTQVGRGGYGKVYKGVLPDNTVVAIKRAEEGSLQGQKEFLTEIKLLSRLHHRNLVSLV GYCDEEEEQMLVYEFVPNGTLRDWLSARGKESLNFGMRLRIALDSAKGILYLHTEANPPV FHRDIKASNILLDSKLNAKVADFGLSRLAPVLDEDGTVPTHVSTIVKGTPGYLDPEYFLT HKLTDKSDVYSLGVVLLELLTGMQPISHGKNIVREVNVAHQSGMMFSIIDSRMGSYPAEC LEKFVALALSCCHDKPEHRPSMLDIVRELENILKMVPESETTVSESTTPIFSGQSASSSS TMLSRDQYMSTNVSGSELVSDVIPIITPR. >LITCHI019623.m3 MMSRFRLSGFVYAAACCYLLHLAFAQITDPSEVSVLQAVKNNLNDPVKHLRNWGSGDPCT SNWTGVLCFDTAWNDGYLHVQELQLLNMNLSGSLAPELGRLSRLVILDFMWNDLTGSIPK EIGSLSALTLLLLNGNKLSGSLPEELGYLTMLNRLQVDQNHMTGPIPKSFANLSSVKHLH LNNNSFSGQIPAELSNLSTLLHLLLDNNNFFGNLPPEISKLPELRILQLDNNQFNGSEIP ATYGNFRHLAKLSLRNCSLQGSVPDLSGIPSLLYLDLSLNQLTGPIPSNKLSDNMTTIDL SDNNLNGSIPGSFSDLPSLQTLSLANNSLTGSVPADMWQSKTFSTSARLTLDLRNNKLLN ISGDLVLPDNVTLRLGGNPICTKENVPNIGLFCGSEAGGDETSTYSRNSTIDGCPIAACP TENFFEYVPASPLSCFCASPLRIGYRLKSPSFAYFPPYMYSFEGYLTTTLNLDIYQLSIA SFAWEKGPRLRMYLKLYPKANYMHSNTFNESEVQRIRGRFTTWRFPRDDLFGPYELLNFT LQGPYATMNVKTRRTGITGGILAAIIVGAVACAVATSAIITLLIAKRHARYQHSLTRKRL SSSRVSMKLDGVKDFKFKELAQATDNFSSSTQVGRGGYGKVYKGVLPDNTVVAIKRAEEG SLQGQKEFLTEIKLLSRLHHRNLVSLVGYCDEEEEQMLVYEFVPNGTLRDWLSGMIVLNC SLFEFFFNIMFTSLLSVWIVC. >LITCHI019623.m4 MLCFCMFRKENEILYTIRCMNMLGRFSDAALIFFLTICRSLRNCSLQGSVPDLSGIPSLL YLDLSLNQLTGPIPSNKLSDNMTTIDLSDNNLNGSIPGSFSDLPSLQTLSLANNSLTGSV PADMWQSKTFSTSARLTLDLRNNKLLNISGDLVLPDNVTLRLGGNPICTKENVPNIGLFC GSEAGGDETSTYSRNSTIDGCPIAACPTENFFEYVPASPLSCFCASPLRIGYRLKSPSFA YFPPYMYSFEGYLTTTLNLDIYQLSIASFAWEKGPRLRMYLKLYPKANYMHSNTFNESEV QRIRGRFTTWRFPRDDLFGPYELLNFTLQGPYATMNVKTRRTGITGGILAAIIVGAVACA VATSAIITLLIAKRHARYQHSLTRKRLSSSRVSMKLDGVKDFKFKELAQATDNFSSSTQV GRGGYGKVYKGVLPDNTVVAIKRAEEGSLQGQKEFLTEIKLLSRLHHRNLVSLVGYCDEE EEQMLVYEFVPNGTLRDWLSARGKESLNFGMRLRIALDSAKGILYLHTEANPPVFHRDIK ASNILLDSKLNAKVADFGLSRLAPVLDEDGTVPTHVSTIVKGTPGYLDPEYFLTHKLTDK SDVYSLGVVLLELLTGMQPISHGKNIVREVNVAHQSGMMFSIIDSRMGSYPAECLEKFVA LALSCCHDKPEHRPSMLDIVRELENILKMVPESETTVSESTTPIFSGQSASSSSTMLSRD QYMSTNVSGSELVSDVIPIITPR.
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>LITCHI019623.m2 TCCTGTAAAGGGATTGAATATGCTATAGTCTCCCAATGAGGAATCTTCTAATGATGCCAC ATGGAACAATCTCTTTAGACTCCCCCAACGGGGCATCCTCTAATGATGTCACATGAAACA ATTTCATTGGTTGGGATATTTGATCCGTACAATAACTATATGCATTGTATTACCCATATG TAGGTGAAGATATTGAAAGAAGAATAGTCAATTACTGGATTTGCATCCAAAACAATGGCA AGCGTAGAAGGCACTTCACGCAGCCGTCAGCCGCCTGTCATTGTCAAAGCATATATAGGG AAACCGGGTAGAGTTCTGTTTTCCCCAATCCCACATAGGCACGTCGACACGTGGCAGAAA AAGCCTAGATCTGCCTAACAACGTTGATAATAATGTACTACCCTCCAAGTGGGGTCCAAA CTCTCTTGTACTTTCTTCTGTCTACCGCCGTTGTCCCAAAAATGCCTGGAAAGTGGACCC CCCAACCCCCCACGTTCAAATCACGTGCTGTTAAAAAATGTTAGTGGCAGAGCAGGTAAG TGTAGACACAAGTCCAAAAGTCTGTAGAAGTAATAATAGCCAATCAACCTGGACACTCTT GAGATGTTAAATTTCAAATATGCTGACAGGAACCTCAGCCCTTTCTTTCCTTTTTTTTTT TTGTTATATATTTTATATATAAATATTCTATGTCACATATTTTAATTGTAACAATCAAAG ATTGATGATAATGTCTTGTTTTTCCTTGCTAAATTGGATGAATAACCATGACGACAGTGC CATCTCAGAATTTTTTTTTTTTTTTTAGTGAGGGGGGAAAAAAAAAAGACTGCAATGATG TACCTGACATCTACAATGCATCATAACACAAAGCTTGATGGGTTTGCTTCAACATACTCA GAATAACCAGATGAGTGATGAGTGATGAATGATGATTCCCCACCATTGACTTAATTGCCT 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