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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI019597 | Chr15 | 21914540 | 21919346 | - | Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase PXC2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI019597.m1 | 28 | 67 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 44.6 | 1.40E-11 |
LITCHI019597.m1 | 411 | 470 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 27.5 | 2.10E-06 |
LITCHI019597.m1 | 483 | 542 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 30 | 3.40E-07 |
LITCHI019597.m1 | 684 | 950 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 139.7 | 1.10E-40 |
LITCHI019597.m1 | 685 | 948 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 141.1 | 4.60E-41 |
LITCHI019597.m2 | 28 | 67 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 44.6 | 1.40E-11 |
LITCHI019597.m2 | 411 | 470 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 27.5 | 2.10E-06 |
LITCHI019597.m2 | 483 | 542 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 30 | 3.40E-07 |
LITCHI019597.m2 | 684 | 950 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 139.7 | 1.10E-40 |
LITCHI019597.m2 | 685 | 948 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 141.1 | 4.60E-41 |
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>LITCHI019597.m1 ATGCTGCAACAAAATCTCTTGTTTTTGCTTCTTGTCTTGCTTCTTCTTCCATTTCATGTC CAATCTTCAGACCCCACATTCAACGATGACGTTTTGGGTCTGATTGTGTTCAAAGCTGGT CTTGAAGACCCAAAAAACAAGTTGGCATCATGGAATGAAGACGATGACAGTCCCTGCAAG TGGGTTGGAATCCAATGTGACCCGAAAACCAACCGGGTCACCCACCTCTCTCTTGACGGG TTCTCTCTATCTGGGCATATAAATCGTGGCCTTTTGAGGTTGCAGTCACTTCAAGTCCTT GCACTCTCCAACAACAACTTCACTGGCACTATAAACCCTGACCTCTCCCTCTTTTGGAGC CTGCAAGTGATTGACTTTAGTCAAAACAGCTTGTCAGGGACCATCCCTGATGGCCTTTTT CGACAATGTGGCTCACTCAGACTGGTTTCGTTTGCTAACAACAATCTCACTGGACAGATT CCGGATTCTTTGAGCTATTGTTCTTCCTTGATGTCTCTTAACTTGTCATCCAATATGCTT TCTGGGAATTTGCCACCTGGAATGTGGTTTTTGAGGGGTCTACAGTCACTTGATTTGTCT AATAATTCACTCGAAGGAGAGGTGGTTGAAGGGATTGCAAATTTGTATGATTTGAGAGAC ATCAACTTGGGGAGGAACAGGTTTTCTGGGCAGATTCCTGAGGATATTGGAGGCTGTTCT ATGTTGAAAGTTATTGATTTTAGTGAGAATTTGCTTTCTGGGAGCTTACCAGATTCATTG CAGAGATTGAATTCATCTACTTTGATTAGTTTAAAGGGGAACTTGTTGACTGGAGAGGTT CCTGATTGGATTGGAAAGTTGAGGAGTCTTGAAAGTTTGGATCTTTCTGTGAATAGATTG TCTGGTAGGATTCCGTTTTCAATAGGGAATCTTCAGTCATTGAAGCTGTTGAATGTGTCC 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GCTGCAGCACTCACATTATCTGGTGGGGAAGATTACAGTTGTTCTCCCACCAAGGACCCT AACTATGGCAAGCTCGTAATGTTTTCCGGGGACGCTGAATTTGTTGCTGGGTCTGAAGCA CTGCTCAACAAGGACTGTGAAATTGGTCGTGGTGGTTTTGGAGTTGTCTATCGAACAATG CTGCAAGATGGGCGTTCGGTTGCCATCAAGAAGCTAACAGTTTCGGGTTTAATCAAGTCC CAAGAAGATTTCGAGAGGGAAATGAAAAAGCTTGGGAAGATAAGGCACCATAATCTTGTG GCACTTGAAGGATATTACTGGACACCATCCTTGCAGCTCCTCATTAGTGAATTTATCTCC GATGGGAGTCTGTATAAGCATCTCCATGACGGAACTAGCAGAAACAGTGTTTCTTGGCGT CAAAGGTTCAACGTAATCCTTGGGATGGCTAAAGGTTTGGCCCATCTGCATCGAATAAAT GTGATTCACTACAATCTGAAATCAACCAATGTTCTAATAGATAGTTCTGGTGAGCCCAAG ATAGGAGACTTTGGTCTGGCAAGGCTGTTACCAACGCTAGACCGTTGCATCTTAAGTAGC AAAATCCAAAGTGCACTCGGCTACATGGCTCCTGAATTTGCATGTCGAACAGTGAAGATA ACCGAAAAATGTGATGTCTATGGTTTTGGAATCTTGGTTTTGGAGGTGGTAACTGGGAAG AGACCTGTGGAATATATGGAGGATGACGTAGTGGTGCTATGTGACATGGTGAGAGGAGCG TTGGAAGATGGCAAGATAGAAGAATGTGTTGATGGCAGGCTTCAAGGTAACTTTCCAGCA GATGAGGCGATTCCATTGATAAAACTTGGCCTAATATGTGCATCTCAAGTGCCATCAAAC CGGCCTGACATGGAAGAGGTGGTCAATATCTTGGAGCTGATCCAATGCCCTTTAGAAGGG CAAGAGGAGTTGGTATGA >LITCHI019597.m2 ATGCTGCAACAAAATCTCTTGTTTTTGCTTCTTGTCTTGCTTCTTCTTCCATTTCATGTC CAATCTTCAGACCCCACATTCAACGATGACGTTTTGGGTCTGATTGTGTTCAAAGCTGGT CTTGAAGACCCAAAAAACAAGTTGGCATCATGGAATGAAGACGATGACAGTCCCTGCAAG TGGGTTGGAATCCAATGTGACCCGAAAACCAACCGGGTCACCCACCTCTCTCTTGACGGG TTCTCTCTATCTGGGCATATAAATCGTGGCCTTTTGAGGTTGCAGTCACTTCAAGTCCTT GCACTCTCCAACAACAACTTCACTGGCACTATAAACCCTGACCTCTCCCTCTTTTGGAGC CTGCAAGTGATTGACTTTAGTCAAAACAGCTTGTCAGGGACCATCCCTGATGGCCTTTTT CGACAATGTGGCTCACTCAGACTGGTTTCGTTTGCTAACAACAATCTCACTGGACAGATT CCGGATTCTTTGAGCTATTGTTCTTCCTTGATGTCTCTTAACTTGTCATCCAATATGCTT TCTGGGAATTTGCCACCTGGAATGTGGTTTTTGAGGGGTCTACAGTCACTTGATTTGTCT AATAATTCACTCGAAGGAGAGGTGGTTGAAGGGATTGCAAATTTGTATGATTTGAGAGAC ATCAACTTGGGGAGGAACAGGTTTTCTGGGCAGATTCCTGAGGATATTGGAGGCTGTTCT ATGTTGAAAGTTATTGATTTTAGTGAGAATTTGCTTTCTGGGAGCTTACCAGATTCATTG CAGAGATTGAATTCATCTACTTTGATTAGTTTAAAGGGGAACTTGTTGACTGGAGAGGTT CCTGATTGGATTGGAAAGTTGAGGAGTCTTGAAAGTTTGGATCTTTCTGTGAATAGATTG TCTGGTAGGATTCCGTTTTCAATAGGGAATCTTCAGTCATTGAAGCTGTTGAATGTGTCC 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>LITCHI019597.m1 MLQQNLLFLLLVLLLLPFHVQSSDPTFNDDVLGLIVFKAGLEDPKNKLASWNEDDDSPCK WVGIQCDPKTNRVTHLSLDGFSLSGHINRGLLRLQSLQVLALSNNNFTGTINPDLSLFWS LQVIDFSQNSLSGTIPDGLFRQCGSLRLVSFANNNLTGQIPDSLSYCSSLMSLNLSSNML SGNLPPGMWFLRGLQSLDLSNNSLEGEVVEGIANLYDLRDINLGRNRFSGQIPEDIGGCS MLKVIDFSENLLSGSLPDSLQRLNSSTLISLKGNLLTGEVPDWIGKLRSLESLDLSVNRL SGRIPFSIGNLQSLKLLNVSMNQLSGGLPDSITNCVNLLAIDVSWNRLTGNLPSWIFKMG WQSVSLSGNRLSGGIPHFYLKEGGGGLEVLDLSSNAFFGEIPLSLGALSSSLMVLNVSKN HLFGPIPASVGELKSTQVIDLSENWLNGSIPSTIGGMVSLKELRLEKNSLSGKIPAQIEN CSSLTSLILSHNNLNGSVPAGIANLSNLQYVDLSLNHLSGSLPKELTNLSHLVSFNISHN HLQGELPVGGFFNTISYSSVSGNPSLCGSVVNRSCPAVHPKPIVLNPNSSDSPNGKPNHH RKIVLSISALIAIGAAAFIAIGVVAITVLNIHVRSSMSRAAAALTLSGGEDYSCSPTKDP NYGKLVMFSGDAEFVAGSEALLNKDCEIGRGGFGVVYRTMLQDGRSVAIKKLTVSGLIKS QEDFEREMKKLGKIRHHNLVALEGYYWTPSLQLLISEFISDGSLYKHLHDGTSRNSVSWR QRFNVILGMAKGLAHLHRINVIHYNLKSTNVLIDSSGEPKIGDFGLARLLPTLDRCILSS KIQSALGYMAPEFACRTVKITEKCDVYGFGILVLEVVTGKRPVEYMEDDVVVLCDMVRGA LEDGKIEECVDGRLQGNFPADEAIPLIKLGLICASQVPSNRPDMEEVVNILELIQCPLEG QEELV. >LITCHI019597.m2 MLQQNLLFLLLVLLLLPFHVQSSDPTFNDDVLGLIVFKAGLEDPKNKLASWNEDDDSPCK WVGIQCDPKTNRVTHLSLDGFSLSGHINRGLLRLQSLQVLALSNNNFTGTINPDLSLFWS LQVIDFSQNSLSGTIPDGLFRQCGSLRLVSFANNNLTGQIPDSLSYCSSLMSLNLSSNML SGNLPPGMWFLRGLQSLDLSNNSLEGEVVEGIANLYDLRDINLGRNRFSGQIPEDIGGCS MLKVIDFSENLLSGSLPDSLQRLNSSTLISLKGNLLTGEVPDWIGKLRSLESLDLSVNRL SGRIPFSIGNLQSLKLLNVSMNQLSGGLPDSITNCVNLLAIDVSWNRLTGNLPSWIFKMG WQSVSLSGNRLSGGIPHFYLKEGGGGLEVLDLSSNAFFGEIPLSLGALSSSLMVLNVSKN HLFGPIPASVGELKSTQVIDLSENWLNGSIPSTIGGMVSLKELRLEKNSLSGKIPAQIEN CSSLTSLILSHNNLNGSVPAGIANLSNLQYVDLSLNHLSGSLPKELTNLSHLVSFNISHN HLQGELPVGGFFNTISYSSVSGNPSLCGSVVNRSCPAVHPKPIVLNPNSSDSPNGKPNHH RKIVLSISALIAIGAAAFIAIGVVAITVLNIHVRSSMSRAAAALTLSGGEDYSCSPTKDP NYGKLVMFSGDAEFVAGSEALLNKDCEIGRGGFGVVYRTMLQDGRSVAIKKLTVSGLIKS QEDFEREMKKLGKIRHHNLVALEGYYWTPSLQLLISEFISDGSLYKHLHDGTSRNSVSWR QRFNVILGMAKGLAHLHRINVIHYNLKSTNVLIDSSGEPKIGDFGLARLLPTLDRCILSS KIQSALGYMAPEFACRTVKITEKCDVYGFGILVLEVVTGKRPVEYMEDDVVVLCDMVRGA LEDGKIEECVDGRLQGNFPADEAIPLIKLGLICASQVPSNRPDMEEVVNILELIQCPLEG QEELV.
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>LITCHI019597.m2 GTTTTTCGTCGTTGAAGAAGCTTTTAATGCTTCTGCTTTACTCTCTCTCTCTCTCTCTCT CTCTCTCTCTCTCTCTGGTTTCTATTCAGATTTCACACCGAACCAAACCAAACCAAAAAT ATACTCCAAACTCGAAACTCACTCACTCACTCACTCACTCACTTTCTTTTTTGTTTTGTT TGATGAAGTGTCTTATAGCGTAGCAGAGATGCTTCTCCGATCCCTCCTCCAACCTTCCAT ACCTTTAACGTTTTAGCCACAACCTCACATAGATTATACACACTACTAGGAGTAGTTGTT GGTCTCGTCTTGTCTTCTCAACGTATCCAGCCAGCTCAAACACACCCACCACCTTTTCTG TTTTGAAACCGAAGATGATGTTCTATAGTCGTATGATGTATTCAAGATTTTTGTAGCTGA GGAGAGAAAAGAGAAGCCTTTTTTTTTTCGTCTCTGTTTTGTACTTTCTGTTTTCAAAGC TGTTTCTACCTCTCTTTGCAAAAGATGCTGCAACAAAATCTCTTGTTTTTGCTTCTTGTC TTGCTTCTTCTTCCATTTCATGTCCAATCTTCAGACCCCACATTCAACGATGACGTTTTG GGTCTGATTGTGTTCAAAGCTGGTCTTGAAGACCCAAAAAACAAGTTGGCATCATGGAAT GAAGACGATGACAGTCCCTGCAAGTGGGTTGGAATCCAATGTGACCCGAAAACCAACCGG GTCACCCACCTCTCTCTTGACGGGTTCTCTCTATCTGGGCATATAAATCGTGGCCTTTTG AGGTTGCAGTCACTTCAAGTCCTTGCACTCTCCAACAACAACTTCACTGGCACTATAAAC CCTGACCTCTCCCTCTTTTGGAGCCTGCAAGTGATTGACTTTAGTCAAAACAGCTTGTCA GGGACCATCCCTGATGGCCTTTTTCGACAATGTGGCTCACTCAGACTGGTTTCGTTTGCT AACAACAATCTCACTGGACAGATTCCGGATTCTTTGAGCTATTGTTCTTCCTTGATGTCT CTTAACTTGTCATCCAATATGCTTTCTGGGAATTTGCCACCTGGAATGTGGTTTTTGAGG GGTCTACAGTCACTTGATTTGTCTAATAATTCACTCGAAGGAGAGGTGGTTGAAGGGATT GCAAATTTGTATGATTTGAGAGACATCAACTTGGGGAGGAACAGGTTTTCTGGGCAGATT CCTGAGGATATTGGAGGCTGTTCTATGTTGAAAGTTATTGATTTTAGTGAGAATTTGCTT TCTGGGAGCTTACCAGATTCATTGCAGAGATTGAATTCATCTACTTTGATTAGTTTAAAG GGGAACTTGTTGACTGGAGAGGTTCCTGATTGGATTGGAAAGTTGAGGAGTCTTGAAAGT TTGGATCTTTCTGTGAATAGATTGTCTGGTAGGATTCCGTTTTCAATAGGGAATCTTCAG TCATTGAAGCTGTTGAATGTGTCCATGAATCAGTTATCTGGAGGGTTACCTGATTCGATA ACGAATTGTGTGAATCTGTTGGCTATAGATGTTAGTTGGAATAGGTTGACAGGCAATCTG CCATCCTGGATTTTCAAGATGGGTTGGCAAAGTGTGTCACTTTCAGGGAACAGATTGAGT GGAGGCATACCGCATTTTTACTTGAAGGAGGGTGGTGGTGGTCTTGAGGTGTTGGATCTG TCATCAAATGCATTTTTTGGTGAGATTCCGTTGAGCCTTGGGGCTCTTAGTAGTAGCCTG ATGGTGTTGAATGTGTCCAAGAACCATTTATTTGGTCCTATTCCTGCAAGTGTTGGAGAA TTGAAATCCACTCAAGTTATTGACTTGAGTGAGAATTGGCTAAATGGTAGCATCCCTTCA ACAATTGGAGGGATGGTTTCGCTCAAGGAACTGAGGCTGGAGAAAAACTCCCTATCTGGT 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