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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI019454 | Chr15 | 18117306 | 18123157 | + | Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI019454.m1 | 98 | 270 | PF20167.1 | Transposase_32 | Family | 98.7 | 3.60E-28 |
LITCHI019454.m1 | 487 | 576 | PF03101.18 | FAR1 | Domain | 66.2 | 3.50E-18 |
LITCHI019454.m1 | 698 | 792 | PF10551.12 | MULE | Domain | 89 | 2.30E-25 |
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>LITCHI019454.m1 ATGGGGAAGTCCAAATACGATAATGTTTCAAAGAATCAGCATGATAGGAAAAAGAGTCTT CGGTCACAGCACTCGCATGTCAGTAAGGGTAAGAAGGCGGGTAAAAACCAGACCTCATCA TTGGGAAACAAAAATGTCATTGGTTCAAAAGCAGCATCAACAAACCATCGTTTCATCTCT TCTGAGGCTCGTTCACGATATCAGACATTCTCCGGTCGTCCGTTCATTTTTGAGAGGGCC GTGAAATTTGAAGATTTGGAGGACACCGGTCTTATGGAGGTACTTCGTGGTAGAAAATGG GTGAAATTGGCCTCTACACCAGCAAAGTCCTGTGAAAACATGGTCCGCGAGTTTTATGCA AACTTCCTGCCAGAGCCATTTATGGAAGGGAAGGGCACACCAGTAAGGGGTACTAATGTC ATCATCACCCCAACTCTGATTAATAAGTACTTCAAAGTTCCTGAAATCGCTGAGTCTGAC GAGTATAATGTTGAGCATATCGCAAAAGCTCAAATGGTTACGGATCTATATGGTTCAGAG ACTATTGAAAGTAAACAAATATTGTATCAGAAGTTCACTGTCAAGTATGCATTCTGGTGT ACATTTGCTTCACACAATCTCCTTCCAAGTAAGCACTTCGCCAAAATCAGGGAACCCAGA GCCCGACTTGTACATGCTATTGGCACTAACCGACCCATCAACGTTGGGAAGTGTATTTTC ACTGCAATATATGATGCCGGCACTGCTACAAGGTATGGATTCCCTTTTCCTGCCCTTATA ACTCAATTTTGCTTGAATGCTGGTGTTCCAACGGAAGTGTGCGATTTGTGGTTGTCTCCA CCTAAGCCAATTGATGGCGTCACATATGATACATTGCACGACCGCATTATGAATGGTAAC AAACCGATTGCAGTAAGAAAAGCACAGAAAATGCGTAAGGACAGTTGGGCGTCAACATGT ACTAATGATGCAGAACCACCTGCTTGGGTTTCTGAGATTTTTGGTGCACTTAATGCATTA CAGGAACGTCAAGAACAGGCCATTGCAAACCTTAAGGTAGAGCAGGAGAAATTATTCGCA TCAATGTGCTCCCAACTATCCAGTCATGGACAGTCCCTTGCTCAAGTTACGCAGCTACTA CATGAGCAATTGTCTCCTGCCACAAATGACACAACTTTGCAGCAGGGCGATGTACTGGGT GACGGGATGAATGACAAAAAGGTGGATTATTTTACTCACCAGTGGTTTCCGGATGTTAAC AACGATAGCTTTCATACATCACCCTCTGCAGACCAATGTACACGAACACCGTCGCTTTTC CAGACCACTGGTGATGCTGATGCTGATGATGCTGTTGGAGGTGGCAAAAGTCCGTTGGAT GATCCTAATAACTTCTCTTGTTTAAGTACATCCGATGTTATGGGAAAAGAATTCGTTTCT GTTGATGATGCAGAAGCATTTTACCAGAAATATTCATTTGTGGTTGGCTTTAGTGTGCGT AAGGACATGCTGCGAAAGGATGCAAATGGGTTAATAACATGTCGACGTTGGGTTTGCTCG AAGGAGGGGTTCATACAGAAAAAGTATTTGGAGCGACGAGATAGGCAGCGTGAGTCCAAA GGCATAACTCGAGAAGGTTGTCGAGCTGCAATGCGAATAAAATTCAACCGTGAAAAAAGT ATGTGGGTTGTCGACGAGTTCGTAACGGAACATTGTCATGCCTTAGCGACTCCAAACCAG GCGCAGTTTCTTCGTTCGCATCGTCATGTTCCGACTGCTAACATTGCACAAGCTGAATCG TGGAAATATATTGGGGTTCGCACCTGTCAAGTTATGGAGCATATGGTCCACCAAGCTGGC AGTCATGCAGGTGTTGGTCACAGTCGTAAAGACTTGCAAAATGGGTTGGATTCCAAACAT AGGTGTACCTCAACCAATGGGGATGCTGACGCAGTTATTGCGTACATGACAGAGAAACAG CAAATGGATGGTAATTTTTTTTTCAAGTTTACTATAACTGAAGATGGGTCATTAGGGAAC ATTTTTTGGGCTGACTCGCAGTCTCGTATTGATTACCATTATTTTGGCGATGTTATATCT TTCGATTCGACGTACAAGACGAATGCATACAACCGACCTCTTGTTATATTTGTGGGGGTG AATAACCATAACAAAAGTACAGTCTTTGGATTCTGTTTGGTGGTGGATGAGACAATAGCC ACATATACGTGGGTCCTCAAAACTTTTCTGGAAGCAATGCAACATAAACATCCTGTAGCT GTTGTGACGGATGGCGATATCGCGATGCATAAAGCACTAAAAACAGTAATGCCTGAGGCA ACTAGGCGATTATGTGCATGGCATCTGGAACGAAATGTGCAGACAAATATCTGCAATGTT GCCTTCACTAGGGAGTTCACGAACTGCATGCTTACGTACATGACCGAGCTTGACTTTCAA CAATATTGGTCGATGATGGTTGCAACGTATAAATTAGAGGACAACGCTTGGGTTAGAAAG TTGTTTGGGAGACGGAAGCAATGGGCAGAAACATTTTTGAGAACCACATTCTTTGGCGGG ATGCGAAGCACGCAACGTTCTGAGAGCATAAACCGTTTATTTAATAAATATTTGAGCCGT CGTTTGAAATTATTCGAGTTCGTCAGCCAAACACATAGGGTGATGGAAAGACTTCGGCAC AATGAGGCAAGAGACAACTTTGAGAACATTAATTCGCATCCAATGCTGGAAACCCACTTG TTACAAATAGAGACACATGCATCAGAAGTTTATACTCGAAACATATTCCTAAAAGTAAGG GATGAAATCAACTCAGAAGCAACACTAAGCATCATAAATTGTGCCACTGATATGACGCAT AAGACATTTACATTTAAAAAGTTTGCGTGCGGTGAGACAACTTGGGATGTGGTATACAAC CCAGCTGAAAATAACTTCCTATGCTCATGCAAATTGTTTCAAACACTTGGTATCCCTTGT TGCCATATATTCAGTGTAATGAAAGCTATGAACATTGACTGTTTACCAGAGTCATTGATA CTGCGTCGGTGGACAAAGAACGCAAAGGCCGACGACAACGTTCATAAGGTGGTGCACGAA TGTGAAGCAAATGTTGTTCATATGGCACGGTATGGAGCATTAACCAGTCAGTGTACAAAA CTATGCTACTTGGCTTCTCAAACAGCAGAAGGATTTGCAGAGACAAAAGGCAACATCCAT CTTCTCACTGAGAGAATAGAAGGAATCTTGGTAAAAGAAAAGGCAGCAATGAATAATGAT GAGGGGCAGGATACAATGCCCAACATTGAACATGTAAAAGATCCATTAAAAGCTACAACC AAAGGAGGGGTAAGAAAACCGAAGAAAACCTCCCCAAAGATACGTCATTGTGGAAAATGT CGACAAGTTGGGCACACGGTGAAGACATGTCCACATATGCAGCTAGAAGATATAAGTAAA GTTGGTAGTAATAAGCCGCTTCAAGAAACGCCTGGTATGACTCCGATCATGACTGATGCT AACGTAGCGCCAACTGAATGCTGA
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>LITCHI019454.m1 + Up_Stream_Len 2000 ACAAGTTTAATTGATTATTTTTATATTTATTAATTTTAGTTTCACACATCCAAGTAATAA GTTGTAAAATATAAAATTTTAACACACAATTAACGCGTAAGGCTTGCAGTCATCATAAGT GTGTAACTAGAGTGCCACACTATAATATAATAATGTACTTATTTCGATATTCGTGTGCGG CTACACCATTGTTTTAGCGTGGCCATGCTCATATACCAATTCAAGTCTTACAATTTTCAT GGGTTAAATTATCTTATACCAGTAAGGGGTCTTATGGACACACCATTGTTGTAGCGTGGT CAAACACTAATAGCGATACAATACGATTGCATTTTAAAATGTTAAAAGGTTGACCAATAG AATAACTAAAATTTAATTACGTTTAAAAATAGTAAGTTAAATTGAATTTTTTATAGAAAA CAACTTAAATTGGATAAAAATAATATGTGATCATATTTTTAAGATATTATTTATCAGTTA AGTTGTGACGTATTGAGGTTTTTTAATGGCAATTGTCGCTATATATACAAATTAATATTA TTTTAACACCTAATATCCCTACATAAGATTTTTTAACTAAGATTACTTCAATGAAATTGT AAAGCTTTCACACGTTAGTACTTAATATTTTGTATTTTCACCATGTACAAATAAATGTAT TACTTATACAGTGATATAATTGAAATTATGCATTTAATTTTGAATCAACATGTAATTTCA TTTTATATGAAATTAAGTTATCATTATAAAAAAATATTAATTCTTCAATTATATCACTGA TTTACAATTTAAATTTAATAGGAAAAGACTTGGTTACGGATCAAAAAATATATGGGGGGA TTCAACGCCAGTACTGTGCAAAATCGGCCCAATCGAGCCGACAGGGGCCAGCTCGGGCCC ACTCGGCTCGACCGAGTCGGCCTTTTTTTTAAAAAAATTTTTCTACCAAAACGGCGTCGT TTTGGCCAAGCGAAAACGACGCCGTTTTGGCGTCTGATATAAGTGTAGATCTCGATTTTC TGCACTCTCTGTCTGGGCTCTCCACCTCTGTCCGCCTCTCCCGATTTGGTTCTGCTTCTG CATCTGCTGTTGTTGTTGGCGCGTGGCGTGAATGGCGTGACAGTTGCTACCGTCGTCCGT CACTCCTTCATTGCCGTCTCCGTCCGTAAGTTTTTATATTTTTGTTTTCATTTTTTTTTT TGGTTTTTTCATTTTGTTTTTTCTGTTTGCTATGAATTTGTTGTGAATGTGTGTTTCGAT TTTAGGGTTAAAATCTGAATTTTGTTTTCCTCAAATGTTGGTTGCTTGGTACGATGAATT TTGGGGGTTTTGCATGACAATGGTGTAATAGTTTCAGTTATTCCTTGTATGAAAAGTTAT ATTGATTTTAACATGTTTGGATTGTGTTTAAGATATTGGGATTTCTTTTCCATTCTGAAA AAGGATTTGTAGTTTATTTATAGGGAGATATTTTGCATGCATATATTACATGCCATTGTG TTTTGATGGTGTGAACAGTAAGTGATTTGCATATATTAATCGATGTCATTGTGCTACATA AGGGTGTTATGTGTTGAAATGGTGCAAATGAAATACACTTGGACTAGGTGTGCCATTTTC TGTCTTTTGCTCTTATTTCTGTTGGTAGTTCATTATAAAATCGTGTCTCTGATATGGGTT TCATAATTGTAGTAGTATTACATTCTATGAAGAAGTCTGTGTGAGAGGTTGCTGTTAAAC ATTATAATGTTATTTGTAGGACTACGACGTTGATTACAGATTTCTGTGGCACTTGTTGGT GTCGTATTAGTGTACAAACATGGTGTGATAGTTTTTTGTTAGAATATTTGTTATTGCAAA GTATTGATTATGAACAAAAACCATACAGCTTTTTATATGCATACCCATAGCATAGCATGC AAATTTTTCAGTGTGAACAATTGGTAACGTTATTTGTTATCATATTGAGTTGTATCATTA CGGTTGCAGCTGCAGAAAAA
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