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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI019415 | Chr15 | 17464088 | 17472466 | + | Zinc finger protein ZAT9 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI019415.m1 | 49 | 70 | PF13912.9 | zf-C2H2_6 | Domain | 24.9 | 1.60E-05 |
LITCHI019415.m1 | 78 | 99 | PF00096.29 | zf-C2H2 | Domain | 16.1 | 0.012 |
LITCHI019415.m1 | 79 | 100 | PF13912.9 | zf-C2H2_6 | Domain | 13.5 | 0.059 |
LITCHI019415.m1 | 273 | 295 | PF00096.29 | zf-C2H2 | Domain | 19.2 | 0.0013 |
LITCHI019415.m1 | 273 | 292 | PF12874.10 | zf-met | Domain | 14.6 | 0.034 |
LITCHI019415.m1 | 348 | 370 | PF13912.9 | zf-C2H2_6 | Domain | 30.9 | 2.00E-07 |
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>LITCHI019415.m1 ATGGATTCAGCTGAAGACTTCAAGAGCCAAATGGGTTTTGAAGAGAATGGGCAGATTAGT TATGGCCTTAGAGAAAACCCCAAAAAATCTTTGAAATTTTCAAGCTCAGATCGTGTTAAT GCTTCTTCAATGCAAGAGAACCAGTGCAAAATGTGTGCCAAAAAGTTTGAATCTCTAAAA GCGCTTTTTGGTCACATGAGGCATCACTCTGGGAAAGGAAAGACAAGAATTCCATGCAAA GATTGTGGGAAAACATTTCAGTCATTGAAATGTCTTACTAATCACACAAGGTTTCACTCT GAGAGGTCCAGGGTGTTTGATGAATCAGGGACTAGTACAAGGCATGATCTTGCTGTGAAG AAAAAGAGATCAGGTAGAAAAAGGTGCAATTTTTATGCAAGCTTGAACGAATCTTCGTCT GTCACTGCAATTGATCAAGAAGTAGTCAAGGCTGCTACATGTTTGATGATGTTATCGCAC GGTATTAATGATTCTGAGGCTGAGAATGGTAATGAGTGTTTCAAGATGAATAAAGCAAGT GAGGGGAAGTTTGATTCTAGTGCTTCCGAGTTTTCGACTGTTTTGTATGAGAAAAAGAAG ATTCTGTTGGGTGGTGAATTTGAGATGCACAAAGTAGAAGATTTGATTGACAAGGGAATT CCAAGTGAAACCAAAATTGTGCCCATTGCAGTAGAGTCAAGTGAAGATTTGATGGAAGAA TTTGGATTGATCAAGAAAGTCAATTTTGATGCTTGTGATGCTGCATTTGGGGGATATTTT TCAAACAATGTAACAATTGGAGCTTCTGATAGTGAGTTCAAGTGTGAGAGCTGCAACAGG ATGTTTGGCTCTCGCCGAGCTCTGGAAAGCCACCAAAGGATGCATGCCACCAAAACACAA GAGATTGAAAACAGTGAGATACAGAAACGCACTAGCATTTCTCCTGAATTTGAGGCTGGT TGTAAGTTTGTGAAGCTTAAATGTCTTGAAGATTCATTGGAGCACATCAAGGGTGGAGGA GTTGTTAAAGGGAGCAAGAAGCACAAATGCCCCATATGCTTGAAAGATTTTGCTACTGTC CAAGCTTTGGGTGGTCACAAGAGGGTGCACACGGTGAACAAACCCAAGAGCAGACCACGA AAAAAGGCAATCAAACAAAAGCATTCTGAATACCGTGATGGATTAGACCACAACATCCCA ATTATGCTTGATGAAGAGGATAGTGGTAATGTCGGGTCCGAGCTGCTATATGAGCCAGTG GTGAGTCTAGTGGCTAACTGA
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>LITCHI019415.m1 + Up_Stream_Len 2000 TTAGTATATGTATATACGAATATGGCGGGCTGGGTGTCGAACCCATACCAACACATGGTG TGGGTTGGCGCCAGCAGTCAAATGACTATCAAATGTGTTTTTAGATATTACAAATTACTT AAGAATACAACATAAAATTCTTAAATTGCACCATAATTATTGAAAAACTGTGCATTGAAT TCTTTTTCTTGATCATACTAATGGATTATCATGGGTCGACGGGCTTTTGGCACTTGTATG TTAAATTTGCTCGTATTAAAAAACAAAGTGAATTATCATTTTCAATTTAAATAAGTAAAA GTAAAAAATGAACAAAAAATAAAATATTGGAGATGACAAGAAGAAATTGAGCAACATTTG AAATAGATTTCAATTACAATTATTAATTTCTAAACCTCTGAAGCTTTCATATATTTAAAA TCAAGAAAACACCCAAAACCCATTTTAGCATGCTTAAGGTCAAATTACTCTCTACATTTT TAGTGGGGGTAGCAATATATGTTATTATGTAGTGTTTGCATCAACCCAAACATGGCTTCA TTAATTTTTTACTCAATCGAAACACACCCTGTTAAGCATATCGTATCATTAGTCTAAATC CAAACATTATCCATGAAATTCAGGATAATTTACACAAACAGCCCCGACGTTTGCTTATAG TACCAAATATGACAACTTTAACCTTTTTTACACTAATATCATGTCATCATTTGAGGTTCT ATAAACACTACAAAAATACCCTAACAGTTAGTTTTGACCTTAAACTAGTGACGGTCAATG ATCAAATATGTTAAAAAGATTTAAGTATGCCTTATTTTAAAATTAAATATAAACAAATTA AAAATTGTTTATACAAAGCACCCCTTATTTAATTTTCTAGCTATTTTTCCTTTGCGGCAG CGGGTTTGAACCCTATTTAAGGAAACAATTTTCTAGTATTTTCAGTTTTCCATGATGGCT TGAGATTCCACTAGGCATGAACTAGATATGCTAGTTAATACCAAATCTAATCTTAAGTTA AAAACAATCAAAACTTAAAAAAATTAAAATAAATTGAATATCAACAAAAGATTTTACCTG GAATAATTATTGGGTAACTATATTTGTTCTGCACAGTGACAAGTCTATTAGGCCCACTAA ACATTTAATTTTTTTTTTATTTTGTGATTACGAAAAATTAGTATTAAAAAAAATAACAAC AGAGGTTTTTTCTTTTTTTATTGTTCAAATCAAAATAACAATTTAAAAAAAGGAGAAAAA AAAATATTACCTTAGAATGAAAGTAGCAAAGTTGTGAGCAGCATAACTATGCTGCAGTGA TAAATGGTCTGCTTTGTCCTTAGCTTATAAAGGTAGAATTCAACTTTACTCATTATTCAA TTGACATAAAAATAATAATTTTTTCATATGATATAAATTTTATCTCCGAATCACTTACTT GATAAATAAAAGTGACAATTTTTTCATACAATATAAGTCTGATCTCCGGTTGGTATGAGC TTCAGTTTTAGATTTTATTTTAGCAATCTTGATAAATAAAAATATATATATCCGGAAGAC TGTACGGTATACAGGATATTTATGATTTATGTAATAAATAAAAAAAATTAAGCAAGGTTG CAGTTTGAAGTCCCACAGTTTAAGACGTTCGCGTTCCATGCAAGAAGTCTCCTTCCATTT ATGCTATCAAACTTTTAATGTGAGTGAGAGTAACAGTTGCTCTACTTCTCTCTGTATAGC TCTCTCTACGCTTCTTCATTTGAACTAGTTACAGTCTAGAAACAGACTAGTTACAGAGCA AATCTCTTTCACCTCCATATTTTTCTTAGAGAAAGATTAAGTTTTTGACGGGTTTTTAGA TCGTCAAGACTACAGAACTCATAAAGTCTGCTTTTCTTGAAGTTTCTTTCTTGGATGAGT TTGTTAATGTAGAGGGTTCGTGTTTGATGTTTTGATCTGGGTTTCTTTGTTTGGTGTTAT TGTGAGGGCTCATTTTGGTT
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>LITCHI019415.m1 GenomeSequence + CCACAGTTTAAGACGTTCGCGTTCCATGCAAGAAGTCTCCTTCCATTTATGCTATCAAAC TTTTAATGTGAGTGAGAGTAACAGTTGCTCTACTTCTCTCTGTATAGCTCTCTCTACGCT TCTTCATTTGAACTAGTTACAGTCTAGAAACAGACTAGTTACAGAGCAAATCTCTTTCAC CTCCATATTTTTCTTAGAGAAAGATTAAGTTTTTGACGGGTTTTTAGATCGTCAAGACTA CAGAACTCATAAAGTCTGCTTTTCTTGAAGTTTCTTTCTTGGATGAGTTTGTTAATGTAG AGGGTTCGTGTTTGATGTTTTGATCTGGGTTTCTTTGTTTGGTGTTATTGTGAGGGCTCA TTTTGGTTATGGATTCAGCTGAAGACTTCAAGAGCCAAATGGGTTTTGAAGAGAATGGGC AGATTAGTTATGGCCTTAGAGAAAACCCCAAAAAATCTTTGAAATTTTCAAGCTCAGATC GTGTTAATGCTTCTTCAATGCAAGAGAACCAGTGCAAAATGTGTGCCAAAAAGTTTGAAT CTCTAAAAGCGCTTTTTGGTCACATGAGGCATCACTCTGGGAAAGGAAAGACAAGAATTC CATGCAAAGATTGTGGGAAAACATTTCAGTCATTGAAATGTCTTACTAATCACACAAGGT TTCACTCTGAGAGGTCCAGGGTGTTTGATGAATCAGGGACTAGTACAAGGCATGATCTTG CTGTGAAGAAAAAGAGATCAGGTAGAAAAAGGTGCAATTTTTATGCAAGCTTGAACGAAT CTTCGTCTGTCACTGCAATTGATCAAGAAGTAGTCAAGGCTGCTACATGTTTGATGATGT TATCGCACGGTATTAATGATTCTGAGGCTGAGAATGGTAATGAGTGTTTCAAGATGAATA 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