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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI019333 | Chr15 | 16075216 | 16081260;16083375 | + | Developmental protein SEPALLATA 1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI019333.m1 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 92.2 | 1.10E-26 |
LITCHI019333.m1 | 85 | 171 | PF01486.20 | K-box | Family | 93.6 | 7.20E-27 |
LITCHI019333.m2 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 92.7 | 7.40E-27 |
LITCHI019333.m2 | 85 | 143 | PF01486.20 | K-box | Family | 70 | 1.60E-19 |
LITCHI019333.m3 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 92.3 | 1.00E-26 |
LITCHI019333.m3 | 85 | 165 | PF01486.20 | K-box | Family | 84.7 | 4.00E-24 |
LITCHI019333.m4 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 91.6 | 1.70E-26 |
LITCHI019333.m4 | 85 | 171 | PF01486.20 | K-box | Family | 92.4 | 1.70E-26 |
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>LITCHI019333.m1 ATGGGGAGAGGAAGAGTGGAGCTGAAGAGAATAGAGAACAAGATAAACAGACAGGTGACA TTTGCGAAGAGAAGAAATGGGCTGCTGAAAAAAGCTTATGAGCTATCAGTGCTGTGTGAT GCTGAGGTCGCTCTCATCATCTTCTCTAACCGTGGCAAGCTCTATGAGTTCTGTAGCACC TCTAGCATGCTCAAGACACTTGAAAGGTATCAGAAGTGCAGCTATGGTGCAGTGGAAGTT AATAAACCAGCTAAGGAGCTCGAGAGCAGTTACCGGGAATACTTGAAACTAAAATCCAGG TTTGAGGGCTTACAACGAACTCAGAGGAATCTGCTTGGGGAGGACTTGGGTCCTCTGAAC TCCAAGGAGCTGGAGCAGCTTGAGCGTCAGCTAGAATCATCCTTGAAGCATGTTCGCTCC ACTAAGACTCAGTATATGCTTGATCAGCTTGGTGATCTTCAAAACAAGGAACAGTTGTTA TTAGAAGCTAACAGGTCATTGACAATAAAGGTAATTACATTATACTTCGACGGCACAAAA TTAAAAATGATATCTAGTTAA >LITCHI019333.m2 ATGGGGAGAGGAAGAGTGGAGCTGAAGAGAATAGAGAACAAGATAAACAGACAGGTGACA TTTGCGAAGAGAAGAAATGGGCTGCTGAAAAAAGCTTATGAGCTATCAGTGCTGTGTGAT GCTGAGGTCGCTCTCATCATCTTCTCTAACCGTGGCAAGCTCTATGAGTTCTGTAGCACC TCTAGCATGCTCAAGACACTTGAAAGGTATCAGAAGTGCAGCTATGGTGCAGTGGAAGTT AATAAACCAGCTAAGGAGCTCGAGAGCAGTTACCGGGAATACTTGAAACTAAAATCCAGG TTTGAGGGCTTACAACGAACTCAGAGGAATCTGCTTGGGGAGGACTTGGGTCCTCTGAAC TCCAAGGAGCTGGAGCAGCTTGAGCGTCAGCTAGAATCATCCTTGAAGCATGTTCGCTCC ACTAAGGTAACTTATTGTTCTTGTGGCATCCTCCATCATTAA >LITCHI019333.m3 ATGGGGAGAGGAAGAGTGGAGCTGAAGAGAATAGAGAACAAGATAAACAGACAGGTGACA TTTGCGAAGAGAAGAAATGGGCTGCTGAAAAAAGCTTATGAGCTATCAGTGCTGTGTGAT GCTGAGGTCGCTCTCATCATCTTCTCTAACCGTGGCAAGCTCTATGAGTTCTGTAGCACC TCTAGCATGCTCAAGACACTTGAAAGGTATCAGAAGTGCAGCTATGGTGCAGTGGAAGTT AATAAACCAGCTAAGGAGCTCGAGAGCAGTTACCGGGAATACTTGAAACTAAAATCCAGG TTTGAGGGCTTACAACGAACTCAGAGGAATCTGCTTGGGGAGGACTTGGGTCCTCTGAAC TCCAAGGAGCTGGAGCAGCTTGAGCGTCAGCTAGAATCATCCTTGAAGCATGTTCGCTCC ACTAAGACTCAGTATATGCTTGATCAGCTTGGTGATCTTCAAAACAAGGTAAAAACTTTG CAATGGAACCAAAAAAAAAAAAAAACACAGTGCTGTAACTCATTTTTATGTGCTTCCTTA TAA >LITCHI019333.m4 ATGGGGAGAGGAAGAGTGGAGCTGAAGAGAATAGAGAACAAGATAAACAGACAGGTGACA TTTGCGAAGAGAAGAAATGGGCTGCTGAAAAAAGCTTATGAGCTATCAGTGCTGTGTGAT GCTGAGGTCGCTCTCATCATCTTCTCTAACCGTGGCAAGCTCTATGAGTTCTGTAGCACC TCTAGCATGCTCAAGACACTTGAAAGGTATCAGAAGTGCAGCTATGGTGCAGTGGAAGTT AATAAACCAGCTAAGGAGCTCGAGAGCAGTTACCGGGAATACTTGAAACTAAAATCCAGG TTTGAGGGCTTACAACGAACTCAGAGGAATCTGCTTGGGGAGGACTTGGGTCCTCTGAAC TCCAAGGAGCTGGAGCAGCTTGAGCGTCAGCTAGAATCATCCTTGAAGCATGTTCGCTCC ACTAAGACTCAGTATATGCTTGATCAGCTTGGTGATCTTCAAAACAAGGAACAGTTGTTA TTAGAAGCTAACAGGTCATTGACAATAAAGCTGGACGAAATAAGTGCAAAGTCACACATT CGACCGTCGTGGGAAGGCAGTGAGCAGCAGATATCATGTGGTCCTCAGCATGCTCACACT CAAGGATTATTCCAGCCTATAGAATGCGATCCCACTTTGCAAATTGGATATAATTCAGCA GCTTCAGACCAGATAGCAGCCACAACTCATGCCCAGCAGGTCACTGGTTTCATCCCTGGA TGGATGCTCTGA
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>LITCHI019333.m2 CAACAGCGCACCAACCCTAGAACCTCCAATCTCATTCAATGGTTAAAAACACTGTGATAA TAGAAAGAAACAAATACAAAAGCAAATTAACTCTCTCTCTCTCTCTAGGGTTTCAAAGTA CACAACATGGTTCATGTTTTTAACATTTTTGGTTACATTTGAGTACTGACTTTCAAACCA AAGATCGATCAGCTTCAAAAGAAAACATCAAATACAAAATAAATAATACAAGAGAAGAAA AATTAAAGAGAGTGATCATGGGGAGAGGAAGAGTGGAGCTGAAGAGAATAGAGAACAAGA TAAACAGACAGGTGACATTTGCGAAGAGAAGAAATGGGCTGCTGAAAAAAGCTTATGAGC TATCAGTGCTGTGTGATGCTGAGGTCGCTCTCATCATCTTCTCTAACCGTGGCAAGCTCT ATGAGTTCTGTAGCACCTCTAGCATGCTCAAGACACTTGAAAGGTATCAGAAGTGCAGCT ATGGTGCAGTGGAAGTTAATAAACCAGCTAAGGAGCTCGAGAGCAGTTACCGGGAATACT TGAAACTAAAATCCAGGTTTGAGGGCTTACAACGAACTCAGAGGAATCTGCTTGGGGAGG ACTTGGGTCCTCTGAACTCCAAGGAGCTGGAGCAGCTTGAGCGTCAGCTAGAATCATCCT TGAAGCATGTTCGCTCCACTAAGGTAACTTATTGTTCTTGTGGCATCCTCCATCATTAAA TTTGCATGATTTTCACCCTAATCTAATGCATGCTATCATTGTTATATAAACTAAATTATT TATCTAGAAATATATGGGGCTTGGGATAAAATTTAAGTTAGAGTTTTTTTTTTTTTATTA AATTAATGTTTAATGTAAACTTCAAAATTTTAATGGTACGAAATGCATTTTGGCTTATTG GTTGAATCTCAATTATAATATTTCAAAAATATAAGATATTTATAAAAAAAAATTATGAAA 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>LITCHI019333.m4 CAACAGCGCACCAACCCTAGAACCTCCAATCTCATTCAATGGTTAAAAACACTGTGATAA TAGAAAGAAACAAATACAAAAGCAAATTAACTCTCTCTCTCTCTCTAGGGTTTCAAAGTA CACAACATGGTTCATGTTTTTAACATTTTTGGTTACATTTGAGTACTGACTTTCAAACCA AAGATCGATCAGCTTCAAAAGAAAACATCAAATACAAAATAAATAATACAAGAGAAGAAA AATTAAAGAGAGTGATCATGGGGAGAGGAAGAGTGGAGCTGAAGAGAATAGAGAACAAGA TAAACAGACAGGTGACATTTGCGAAGAGAAGAAATGGGCTGCTGAAAAAAGCTTATGAGC TATCAGTGCTGTGTGATGCTGAGGTCGCTCTCATCATCTTCTCTAACCGTGGCAAGCTCT ATGAGTTCTGTAGCACCTCTAGCATGCTCAAGACACTTGAAAGGTATCAGAAGTGCAGCT ATGGTGCAGTGGAAGTTAATAAACCAGCTAAGGAGCTCGAGAGCAGTTACCGGGAATACT TGAAACTAAAATCCAGGTTTGAGGGCTTACAACGAACTCAGAGGAATCTGCTTGGGGAGG ACTTGGGTCCTCTGAACTCCAAGGAGCTGGAGCAGCTTGAGCGTCAGCTAGAATCATCCT TGAAGCATGTTCGCTCCACTAAGACTCAGTATATGCTTGATCAGCTTGGTGATCTTCAAA ACAAGGAACAGTTGTTATTAGAAGCTAACAGGTCATTGACAATAAAGCTGGACGAAATAA GTGCAAAGTCACACATTCGACCGTCGTGGGAAGGCAGTGAGCAGCAGATATCATGTGGTC CTCAGCATGCTCACACTCAAGGATTATTCCAGCCTATAGAATGCGATCCCACTTTGCAAA TTGGATATAATTCAGCAGCTTCAGACCAGATAGCAGCCACAACTCATGCCCAGCAGGTCA 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