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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI019307 | Chr15 | 15598016 | 15600417 | - | Zinc finger protein CONSTANS-LIKE 2 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI019307.m1 | 61 | 105 | PF00643.27 | zf-B_box | Domain | 30.7 | 2.80E-07 |
| LITCHI019307.m1 | 283 | 325 | PF06203.17 | CCT | Motif | 64 | 1.10E-17 |
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>LITCHI019307.m1 ATGATGAAAGAAGAGAGCAGCGACGGTGGAGGCGGAGCCAACAACTGGGCACGTGTCTGC GACACCTGTAGGTCTGCTGCTTGCACTGTCTACTGCAAGGCTGACTTGGCCTATCTATGC GCTGCTTGTGACGCCAGGGTTCATGCTGCCAACCGGGTTGCTTCCCGGCACGAGCGTGTC TTCGTTTGTGAGGCTTGCGAGCAGGCTCCTGCTGCTTTCCTTTGCAAGGCTGACGCTGCC TCCCTCTGCGCTGCCTGTGATGCTGATATCCACTCTGCCAACCCCCTCGCTCGCCGCCAC CACCGAGTTCCCATACTTCCCATATCAGGGTCCATCTATGGTCAGACTGAGGATGGGTTC GTAGGTGCTGAAGATGAAGATGATGATGAGGAGGCTGCTTCTTGGTTGTTGATGAAGCCA ACAAAGAACACCAACAACACAGATAATAGCTATTTGTTTCCTGGAGAGGTTGATGAATAT TTGGACCTTGTAGACTACAATGGTGAGAATCAGTATGTTGATCACTACAAGCACCATCAG CAGCGTCAACAACACTTTGGGAAGAATTATATCAGTGACAGCATTGTTCCTGTTCAGTGC CAAGTTAAAGATCAACAGAATCAGGAGAATTTTCCACTGGGATTGGACTATGAATCCTCA AAAGCTGCTTACAGTTACAACGGTTCTCTCAGTCACTGTTTGTCAGTTTCATCAACGGAT GTGGGTGTAGTACCAGAATCAACAACAAGTGACATATCAATCTCCCACTCGAGACCTCCA AAAGGTACAATCGACCTCTTTTCAGGACCTCCAATTCAAACGCCTCCCCAGCTGACTCCA ATGGACAGGGAGGCCAGGGTCCTGAGATACAGAGAGAAAAAGAAGACTAGGAAGTTTGAG AAGACAATCAGGTACGCCTCTAGGAAGGCCTATGCAGAGACCAGACCACGAATCAAGGGT CGGTTTGCCAAGCGCACAGATGTTGAAGTTGAAATCGACCAGATGTTCTCCACAACGTTG ATCACAGACGCCGGATATGGCATTGTTCCTTCATTCTAA
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>LITCHI019307.m1 MMKEESSDGGGGANNWARVCDTCRSAACTVYCKADLAYLCAACDARVHAANRVASRHERV FVCEACEQAPAAFLCKADAASLCAACDADIHSANPLARRHHRVPILPISGSIYGQTEDGF VGAEDEDDDEEAASWLLMKPTKNTNNTDNSYLFPGEVDEYLDLVDYNGENQYVDHYKHHQ QRQQHFGKNYISDSIVPVQCQVKDQQNQENFPLGLDYESSKAAYSYNGSLSHCLSVSSTD VGVVPESTTSDISISHSRPPKGTIDLFSGPPIQTPPQLTPMDREARVLRYREKKKTRKFE KTIRYASRKAYAETRPRIKGRFAKRTDVEVEIDQMFSTTLITDAGYGIVPSF.
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>LITCHI019307.m1 AGAAAAATGTCAGCTCAGCATCCAAATTTCTGACATGAATGATATATTTAATTGCGACTT GTGAAAGTAATTAAAAAAAAGGAGGGGCCAACAACATATTCCAAAAGCCAAGGCAAAACC TCATGGGTCCCAAATATGAAAGTGGATCCATTATCAGAACAGAAGACAACCACAAGATAA TGTAGCAACTTTTTGAAGCCGCTAAGTTAAAGCCGCGTGTCTGCCCTGAGATTCTCTCCC TCCCTCTCACCGTTACTACACCTTCCTCCCTTGCCTCCTTTGGCTACTCACTACACCTTG TACTCAGAGTTTCAAAGTTGAGAGATGATGAAAGAAGAGAGCAGCGACGGTGGAGGCGGA GCCAACAACTGGGCACGTGTCTGCGACACCTGTAGGTCTGCTGCTTGCACTGTCTACTGC AAGGCTGACTTGGCCTATCTATGCGCTGCTTGTGACGCCAGGGTTCATGCTGCCAACCGG GTTGCTTCCCGGCACGAGCGTGTCTTCGTTTGTGAGGCTTGCGAGCAGGCTCCTGCTGCT TTCCTTTGCAAGGCTGACGCTGCCTCCCTCTGCGCTGCCTGTGATGCTGATATCCACTCT GCCAACCCCCTCGCTCGCCGCCACCACCGAGTTCCCATACTTCCCATATCAGGGTCCATC TATGGTCAGACTGAGGATGGGTTCGTAGGTGCTGAAGATGAAGATGATGATGAGGAGGCT GCTTCTTGGTTGTTGATGAAGCCAACAAAGAACACCAACAACACAGATAATAGCTATTTG TTTCCTGGAGAGGTTGATGAATATTTGGACCTTGTAGACTACAATGGTGAGAATCAGTAT GTTGATCACTACAAGCACCATCAGCAGCGTCAACAACACTTTGGGAAGAATTATATCAGT GACAGCATTGTTCCTGTTCAGTGCCAAGTTAAAGATCAACAGAATCAGGAGAATTTTCCA CTGGGATTGGACTATGAATCCTCAAAAGCTGCTTACAGTTACAACGGTTCTCTCAGTCAC TGTTTGTCAGTTTCATCAACGGATGTGGGTGTAGTACCAGAATCAACAACAAGTGACATA TCAATCTCCCACTCGAGACCTCCAAAAGGTACAATCGACCTCTTTTCAGGACCTCCAATT CAAACGCCTCCCCAGCTGACTCCAATGGACAGGGAGGCCAGGGTCCTGAGATACAGAGAG AAAAAGAAGACTAGGAAGTTTGAGAAGACAATCAGGTACGCCTCTAGGAAGGCCTATGCA GAGACCAGACCACGAATCAAGGGTCGGTTTGCCAAGCGCACAGATGTTGAAGTTGAAATC GACCAGATGTTCTCCACAACGTTGATCACAGACGCCGGATATGGCATTGTTCCTTCATTC TAAAGCAAAAAGCACTCCAGTTACTACTCTAGTTCTACTAAACTTATTGTAGCCTTCTTA ATCTAATGACATGTATGTTTTGCAGTTTTAGTTCTTTTTTGTTATCTGACTTGTTCCCTG CAACTGCTATATCATTGTAAATACATATATAATTATAGTTATAGAATCGATTTCTTGCAA TTACAGCTTTCCCTTTTAGATGCAATAACTTCACATATTGGATTAGACTATAAAAAAGTG AAGCGACAGCTGAAAAGAATAAAAATTAACAAGGTCCAAGTGTGATGACCAACAACCAAG ACCCAAAATAGGGTCCACGTATTAGAGTGCAAAATCTTCCGGTTAAAGAGGGTCAAAAAA TTTGACACACACACGTTCTTTGCAAAAAAATGAACATTAAGGGTGAGACTTGGGCTTTGG AGAGAGAATAAAAAGAATTCAGTCATATGTTGAAGAATATGGAGGATCCAATGTGATGAA TCAATCTTGCATGGATCAAAAGCTCAGAAATAATTTAGTGTTTGTTAATATGGTTTCAAG CGGATTTCTGGCATTTGGAGCTGTGTCAGACACTGCTGTCCACAAGTATCTTCCTGAAGA TTCTTTCTACACAGCCTAAGATAAGCAGAGGATGTCCATGTCTGCAAAAGAAAAAGGTAC CTTAGTTGCAACACTTTTCAGTGATGCTGTAAATCATCAATGGATGGAGGCATCGATTCG AAAAGCAAATGGTATGATTCCTTGATTGTTCTTATAGTACGAGTAGTAGAAAATATCAAC ACAAATTAACTGCCACAATTTGATCTAATACTGCGGTTACTGTATTCCAAAATCTATTGT AATAGTAATTTAATCACTTCAGTTTATAGATATTTTCAATCAGG
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>LITCHI022093.m2 - Up_Stream_Len 2000 CAATTGCGTAAAGCAATAAGGGGATATAATGATAAAAATGGAATATATTTGAGTAAAGTT GCCGTTAAAATAATAATAAAAGGAGCCTGATTCTCTGCGTCGAGGAACACCGTAAGCTGA TTAAAAGTGGCCTCATCAGTTGACTAAAACAGTGACCATTGACATCACGAGTGTCAAACG GACGGCGTTGATCCCACGTAAGATGTTGCAATCACGCATCATGCATTTCACGAGGTGGGG GTCTAATAATTAATCACTCATAATTAAAAATTAATTAAAAAAATCTCTGATTACAATCAA CGCTTAAAGACAACAAACAACAACTTAATTAAAAAATTAATAATAACAAATAACAATAAT AAAATTAAAAATATTTTACAAGAATTAAAAAAAAAAAAAAAACTCTCTCTCTCTCTGTCT CTCTCTCTCTCTCTCTATCTCTGTTTCTCTCACTAAAAAGATTGTGTTCTTCTCTCTCTG CATTTCTCAAACTTTGGTGTCTGGCCTTTTTGGTTTCTCCTCGTTGTGGGAAGTGGGGCT TTTTGTGGGATATCTGCATATGGTTCTTCTTCACTGTAAGTAGTGATCAAAGTTTCGATT TTTATTTGCTTTTTTGCTTTGTTGGGGTTTTAAGTTTGATTATGGAGCTGCAAAGTTGGT GACTTTTTGAGATTTTAGCGTGTTCGATGTGTGGTTTATGTGTTTTTTTCATCTGGGGTT ATGTGGTTTTGGTTAATGGGTTTGTGGAGTGTGCTTTTGAGGTTGAATTTTGATTGATTT TGGCGGGTTCTAAGTGGGGGGGTGGGGTGGTTGTGTTTTGATTGCAGGTGGTGTTGGAGG GATTTTGATTGGTTTTATAGTGTGTTTTGTGGGATTTTGATTGTGTTTGGAACAAGGTTG TTGATTTGTGTGGTGGTTTTGGTTGGTGTTATGTGTGGATGGCTGAGTTTATAGATCTAT GTTGAATGAGTTTGTTTTTTTGGGTTTTTGAGGTTTGAGCTTTTAGTGTTTTGATATTGT ATGAAATGGAGATTGAAGTTAGGATCTTAGTTATAGATTTTATGCTGGTGGTATACATGT TTATTGTTTAGTGTTGCTGTGTTGGAGTTTGACTTGAATTGAGTTGTGGATTGTGTAATT GTTCATTTCATATAAATGTGCATTTGCTTGTTCAATTAATGTAGGAAGTTCTTCATGCAT GTCTGGATTTTGTTGTGGTTTGGAGGCTGTAAAGGTTACATTTGCCTGATAATATGAATG TCACTGTTAAAGCAGAGGATTGAAGAATTGCATGATATGTAACTTCTCTAGTTATGATTG TTTGTTCCAAGTTTGTAGTGAAATTGTGATGTGGAGTTTCAAGTGAAAGATGCTTTTAGT AAAATTTGCTTTGTTTTGACATGATAAAACCATTAGGCGTTAACTATATATTTGCTATAT TTTTAGGGAATGTGATGCAGTGTAATTTTAATCGTTGTAAAAAGTTGATCAAAATTGTTG TTTTATGATCTTCACTTCCTTACTTCCCTACTTTGGGTTGGCAATTGTCCCTTCCTTCAA AATTTACTCCAAAAGTTTTTCCCGAATATACCAAAATGTTCTTATCTGTTTTCTTGCTTC AAGTAATAACTAAAGATTGTTGCTATACCAAGCAGATTTAAAAATTTTGTCTGTCGTGGT TATTTATGATGATTCTCTTGCTATCTTCTGTTAAGACTTGATGTATGATCTTCTGGATTC ATGTAAATGTAGATCCCTGTTCAATTGATAAAATAGTTTTGGTTTAGGCTATAGTAAAGC ACTTTTTCTAGTGTTTTCTATTTTTATCTAGTTACCTACGCTCTCTAGTTTGTATTCTTG AAATATATATATTATTCTTGCAGACGTACGAGTTTCAAGTTTGGTCGTTAAGTTGCTCCA CATGTGATAGCTTAGTTATAGTTGGGGAGTGGATTTTCACTTGAAATAGGCCCATACTTC TGTAACTTTGTTACATAAAT >LITCHI022093.m1 - Up_Stream_Len 2000 CAATTGCGTAAAGCAATAAGGGGATATAATGATAAAAATGGAATATATTTGAGTAAAGTT GCCGTTAAAATAATAATAAAAGGAGCCTGATTCTCTGCGTCGAGGAACACCGTAAGCTGA TTAAAAGTGGCCTCATCAGTTGACTAAAACAGTGACCATTGACATCACGAGTGTCAAACG GACGGCGTTGATCCCACGTAAGATGTTGCAATCACGCATCATGCATTTCACGAGGTGGGG GTCTAATAATTAATCACTCATAATTAAAAATTAATTAAAAAAATCTCTGATTACAATCAA CGCTTAAAGACAACAAACAACAACTTAATTAAAAAATTAATAATAACAAATAACAATAAT AAAATTAAAAATATTTTACAAGAATTAAAAAAAAAAAAAAAACTCTCTCTCTCTCTGTCT CTCTCTCTCTCTCTCTATCTCTGTTTCTCTCACTAAAAAGATTGTGTTCTTCTCTCTCTG CATTTCTCAAACTTTGGTGTCTGGCCTTTTTGGTTTCTCCTCGTTGTGGGAAGTGGGGCT TTTTGTGGGATATCTGCATATGGTTCTTCTTCACTGTAAGTAGTGATCAAAGTTTCGATT TTTATTTGCTTTTTTGCTTTGTTGGGGTTTTAAGTTTGATTATGGAGCTGCAAAGTTGGT GACTTTTTGAGATTTTAGCGTGTTCGATGTGTGGTTTATGTGTTTTTTTCATCTGGGGTT ATGTGGTTTTGGTTAATGGGTTTGTGGAGTGTGCTTTTGAGGTTGAATTTTGATTGATTT TGGCGGGTTCTAAGTGGGGGGGTGGGGTGGTTGTGTTTTGATTGCAGGTGGTGTTGGAGG GATTTTGATTGGTTTTATAGTGTGTTTTGTGGGATTTTGATTGTGTTTGGAACAAGGTTG TTGATTTGTGTGGTGGTTTTGGTTGGTGTTATGTGTGGATGGCTGAGTTTATAGATCTAT GTTGAATGAGTTTGTTTTTTTGGGTTTTTGAGGTTTGAGCTTTTAGTGTTTTGATATTGT ATGAAATGGAGATTGAAGTTAGGATCTTAGTTATAGATTTTATGCTGGTGGTATACATGT TTATTGTTTAGTGTTGCTGTGTTGGAGTTTGACTTGAATTGAGTTGTGGATTGTGTAATT GTTCATTTCATATAAATGTGCATTTGCTTGTTCAATTAATGTAGGAAGTTCTTCATGCAT GTCTGGATTTTGTTGTGGTTTGGAGGCTGTAAAGGTTACATTTGCCTGATAATATGAATG TCACTGTTAAAGCAGAGGATTGAAGAATTGCATGATATGTAACTTCTCTAGTTATGATTG TTTGTTCCAAGTTTGTAGTGAAATTGTGATGTGGAGTTTCAAGTGAAAGATGCTTTTAGT AAAATTTGCTTTGTTTTGACATGATAAAACCATTAGGCGTTAACTATATATTTGCTATAT TTTTAGGGAATGTGATGCAGTGTAATTTTAATCGTTGTAAAAAGTTGATCAAAATTGTTG TTTTATGATCTTCACTTCCTTACTTCCCTACTTTGGGTTGGCAATTGTCCCTTCCTTCAA AATTTACTCCAAAAGTTTTTCCCGAATATACCAAAATGTTCTTATCTGTTTTCTTGCTTC AAGTAATAACTAAAGATTGTTGCTATACCAAGCAGATTTAAAAATTTTGTCTGTCGTGGT TATTTATGATGATTCTCTTGCTATCTTCTGTTAAGACTTGATGTATGATCTTCTGGATTC ATGTAAATGTAGATCCCTGTTCAATTGATAAAATAGTTTTGGTTTAGGCTATAGTAAAGC ACTTTTTCTAGTGTTTTCTATTTTTATCTAGTTACCTACGCTCTCTAGTTTGTATTCTTG AAATATATATATTATTCTTGCAGACGTACGAGTTTCAAGTTTGGTCGTTAAGTTGCTCCA CATGTGATAGCTTAGTTATAGTTGGGGAGTGGATTTTCACTTGAAATAGGCCCATACTTC TGTAACTTTGTTACATAAAT
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>LITCHI022093.m2 GenomeSequence - GGTCTAATAATTAATCACTCATAATTAAAAATTAATTAAAAAAATCTCTGATTACAATCA ACGCTTAAAGACAACAAACAACAACTTAATTAAAAAATTAATAATAACAAATAACAATAA TAAAATTAAAAATATTTTACAAGAATTAAAAAAAAAAAAAAAACTCTCTCTCTCTCTGTC TCTCTCTCTCTCTCTCTATCTCTGTTTCTCTCACTAAAAAGATTGTGTTCTTCTCTCTCT GCATTTCTCAAACTTTGGTGTCTGGCCTTTTTGGTTTCTCCTCGTTGTGGGAAGTGGGGC TTTTTGTGGGATATCTGCATATGGTTCTTCTTCACTGTAAGTAGTGATCAAAGTTTCGAT TTTTATTTGCTTTTTTGCTTTGTTGGGGTTTTAAGTTTGATTATGGAGCTGCAAAGTTGG TGACTTTTTGAGATTTTAGCGTGTTCGATGTGTGGTTTATGTGTTTTTTTCATCTGGGGT TATGTGGTTTTGGTTAATGGGTTTGTGGAGTGTGCTTTTGAGGTTGAATTTTGATTGATT TTGGCGGGTTCTAAGTGGGGGGGTGGGGTGGTTGTGTTTTGATTGCAGGTGGTGTTGGAG GGATTTTGATTGGTTTTATAGTGTGTTTTGTGGGATTTTGATTGTGTTTGGAACAAGGTT GTTGATTTGTGTGGTGGTTTTGGTTGGTGTTATGTGTGGATGGCTGAGTTTATAGATCTA TGTTGAATGAGTTTGTTTTTTTGGGTTTTTGAGGTTTGAGCTTTTAGTGTTTTGATATTG TATGAAATGGAGATTGAAGTTAGGATCTTAGTTATAGATTTTATGCTGGTGGTATACATG TTTATTGTTTAGTGTTGCTGTGTTGGAGTTTGACTTGAATTGAGTTGTGGATTGTGTAAT 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