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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI019305 | Chr15 | 15518342 | 15520440 | + | Zinc finger protein CONSTANS-LIKE 2 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI019305.m1 | 61 | 105 | PF00643.27 | zf-B_box | Domain | 30.7 | 2.80E-07 |
| LITCHI019305.m1 | 283 | 325 | PF06203.17 | CCT | Motif | 60 | 1.90E-16 |
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>LITCHI019305.m1 ATGATGAAAGAAGAAAGCAGCGACGGTGGAGGCGGAGCCAACAACTGGGCACGTGTCTGC GACACCTGTAGGTCTGCTGCTTGCACTGTCTACTGCAAGGCTGACTTGGCCTATCTATGC GCTGCTTGTGACGCCAGGGTTCATGCTGCCAACCGGGTTGCTTCCCGGCACGAGCGTGTC TTCGTTTGTGAGGCTTGCGAGCAGGCTCCTGCTGCTTTCCTTTGCAAGGCTGACGCTGCC TCCCTCTGCGCTGCCTGTGATGCTGATATCCACTCTGCCAACCCCCTCGCCCGCCGCCAC CACCGAGTTCCCATACTTCCCATATCAGGGTCCATCTATGGTCAGACTGAGGATGGGTTC GTAGGTGCTGAAGATGAAGATGATGATGAGGAGGCTGCTTCTTGGTTGTTGATGAACCCA ACCAAGAGCACCAACAACACAGATAATAGCTATTTGTTTCCTGGAGAGGTTGATGAATAT TTGGACCTTGTAGACTACAATGGTGAGAATCAGTATGTCGATCACTACAATCACCATCAG CAGCATCAACAACACTTTGGGAAGAATTATATCAGTGACAGCATTGTTCCTGTTCAGTGC CAAGTTAAAGATCAACAGAATCAGGAGAATTTTCCACTGGGATTGGACTATGAATCCTCT AAAGCTGCTTACAGTTACAGTGATTCTCTCAGTCACAGTTTGTCAGTTTCGTCAACGGAT GTGGGTGTAGTACCAGAATCAACAACAAGTGACATATCAATCTCCCACTCGAGACCTCCA AAAGGTACAATCGACCTCTTTTCAGGACCTCCAATTCAAATGCCTCCCCAGCTGACTCCA ATGGACAGGAAGGCCAGGGTCCTGAGATACAGAGAGAAAAAGAAGACTAGGAAGTTTGAG AAGACAATCAGGTACGCCTCTAGGAAGGCCTATGCAGAGACCAGACCACGAATCAAGGGT CGGTTTGCTAAGCGCAGAGATGTTGAAGTTGAAATCGACCAGATGTTCTCCACAGCGTTG ATAACAGACGCCGGATATGGCATTGTTCCTTCATTCTAA
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>LITCHI019305.m1 MMKEESSDGGGGANNWARVCDTCRSAACTVYCKADLAYLCAACDARVHAANRVASRHERV FVCEACEQAPAAFLCKADAASLCAACDADIHSANPLARRHHRVPILPISGSIYGQTEDGF VGAEDEDDDEEAASWLLMNPTKSTNNTDNSYLFPGEVDEYLDLVDYNGENQYVDHYNHHQ QHQQHFGKNYISDSIVPVQCQVKDQQNQENFPLGLDYESSKAAYSYSDSLSHSLSVSSTD VGVVPESTTSDISISHSRPPKGTIDLFSGPPIQMPPQLTPMDRKARVLRYREKKKTRKFE KTIRYASRKAYAETRPRIKGRFAKRRDVEVEIDQMFSTALITDAGYGIVPSF.
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>LITCHI019305.m1 AGATAACATAACTAGCCGCTAAGTTAAAGCCGCGTGTCTGCCAGTAGATTCTCTCCCCCC CCTCTTACCGTTAGTACAGCTCCCTCCCTTGCCTCCTGTGGCTACTCACTACATCTTGCA CTCAAGGTTTCAAAGTTGAGAGATGATGAAAGAAGAAAGCAGCGACGGTGGAGGCGGAGC CAACAACTGGGCACGTGTCTGCGACACCTGTAGGTCTGCTGCTTGCACTGTCTACTGCAA GGCTGACTTGGCCTATCTATGCGCTGCTTGTGACGCCAGGGTTCATGCTGCCAACCGGGT TGCTTCCCGGCACGAGCGTGTCTTCGTTTGTGAGGCTTGCGAGCAGGCTCCTGCTGCTTT CCTTTGCAAGGCTGACGCTGCCTCCCTCTGCGCTGCCTGTGATGCTGATATCCACTCTGC CAACCCCCTCGCCCGCCGCCACCACCGAGTTCCCATACTTCCCATATCAGGGTCCATCTA TGGTCAGACTGAGGATGGGTTCGTAGGTGCTGAAGATGAAGATGATGATGAGGAGGCTGC TTCTTGGTTGTTGATGAACCCAACCAAGAGCACCAACAACACAGATAATAGCTATTTGTT TCCTGGAGAGGTTGATGAATATTTGGACCTTGTAGACTACAATGGTGAGAATCAGTATGT CGATCACTACAATCACCATCAGCAGCATCAACAACACTTTGGGAAGAATTATATCAGTGA CAGCATTGTTCCTGTTCAGTGCCAAGTTAAAGATCAACAGAATCAGGAGAATTTTCCACT GGGATTGGACTATGAATCCTCTAAAGCTGCTTACAGTTACAGTGATTCTCTCAGTCACAG TTTGTCAGTTTCGTCAACGGATGTGGGTGTAGTACCAGAATCAACAACAAGTGACATATC AATCTCCCACTCGAGACCTCCAAAAGGTACAATCGACCTCTTTTCAGGACCTCCAATTCA AATGCCTCCCCAGCTGACTCCAATGGACAGGAAGGCCAGGGTCCTGAGATACAGAGAGAA AAAGAAGACTAGGAAGTTTGAGAAGACAATCAGGTACGCCTCTAGGAAGGCCTATGCAGA GACCAGACCACGAATCAAGGGTCGGTTTGCTAAGCGCAGAGATGTTGAAGTTGAAATCGA CCAGATGTTCTCCACAGCGTTGATAACAGACGCCGGATATGGCATTGTTCCTTCATTCTA AAGCAAAAAGCACTCCAGTTACTACTCTAGTTCGACTAAACTTATCGTAGCCTTCTTAAT CTAATGACATGTATGTTGTGCAGTTTTTGTTCTTTTTGGTTATCTGACTTGTCCCCTGCA ACTGCTATATCATTGTAAATACATATATAATTATAGTTACAGAATCAATTTCTTGCAATT ACAGCTTTCCCTTTTAGATGCTCTTCAATAACTTCATATATTGGATTAGATTGTAAAAAA GTGAAGCAACAACTGAAAAGAAGAAAAATCAATAAGGTCTAAGTGTGATGACCAACAACC AAGACCTAAAATAGGGTCCGAGTGTTAGAGTGCAAAATCTTCTGGTTAAAGAGGGTCACA AAATTTGACATGCACACATTCTTTGCAAAATAAATGAACGTTAAGAGTGAGAATTGGGCT TTGGAGAGAGAAGAAAAAGAATTCAGTCATATGTTGAAGAGTATGGAGGATCCAATGCGA TGAGTCAATCTTGCATGGATCAAAAGCTAAGAAATAGCTTAGTGTTTGTTAATATGGTTT CAAGTGGATTTCTGGCATTTGCAGCTGTACCAGACACTGCTGTCCTCAAGTATCTTCCTG AAGATTCTTTCTACACAGCCTAAGATAAGCAGAGGATATCCATGTCTGCAAAAGAAAAAG GTAACTTAGTTGCAACGCTTTTCAGTGTGGCTGTAAATCACCAATGGAAATTTGTCACGA ATTGGAAGCATTGATTCGAAAAGCAAATGGTATGATTCCCC
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>LITCHI026370.m13 - Up_Stream_Len 2000 TATGTTGCAGGTTTCGATCCTCTGCAATGACTGCAACAGTACCAGCAAAGCCCCATTTCA CATCTTAGGACACAAGTGCAGAGAGTGCAACTCATATAATACTCGCAGGATTTCAACACC TGATCATGAAGAAGTCAACATTCCTAATGAGAGAAGTTAGTTAACAGCATATGGGCTATC AAAGATACTGTGTTTTTCTTTTTCAAAGTTATTAAGTGCTCCTCTTATATGTTAACAACG AAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTCTCCTCTTAGATACAAAAAGTACATTGACTCT TTTTTGTTCACTTCGTTAGGAAAAAAAAAAATTAAAAATACAATGGTTGATTGTGTATTT AGCAAATGGTTTGATTTCCCCAACATGAACTTATATCTGTAATGAATGCCAAATATAGAA TTCCCTTTCCCCAAATACAAGTCAAAATTTGTATTTGTCATTGTAATTTTGATCTCCATT TAAGGCAGTTGTCTGGTCTCATCATCGAGTTGGTCATGTTTGTTCTCAGTTACATAATCT GAGAGTATATTTTCTTACTTGCTTTGTATTATTCTCCACCGTGGATTTAATGCGCCGATA TAATTGATGATAAAGTGCTATATTTCAAGGTCAAAAATCGTAACTATTTATCAAGCTTGA TTACAATTTGTTTCATTGTACAAGTGTTGTCAAGGGAATGGAACTAGGGAATGTGTTGGC AGAAGACTTATTAAAATGAGCTAGAAAAGTAAACTATCATTGTTAATTAATTAATGAAAA CAGTGCTAGACAAGACTTTCGTTTTTGATGATTAATTTTTCAGCTATTGATGACACACAC ACAAAAATTCCAGCAACTTATATGGAGAAAAAAGTTGGTGTGCCTGTGCCCCCCTCAAGC ATAAATATCAGCTTCGCTGCCTACATCAACAGACAAAAAAGATGCTCATAATCTCTCCCT TTTACGTCTCTTTCTTCATCTCCCATTCTTGCTCACTTGGATTCTACGCTCTCATTTCGT GTGTCCTTTACTCGTCCTGATTGCCATTGTGGGCTTAGAAACAAATTTCAGTTTTCAGTC ATTTATATGCAACTGAGTTTTGACAGTTTAACTGTGATTATCATCTTTAGTCATCATCTC ACTAAACTTTAGATTTAGAATCATCCCTATCCAATTAAGTAGCTAGAGTTTGCGGAACCA TACTAATCAACGTCTTTAACACCTTCATAAATCGTTGTATCAAGAAAAAAAAAAATCATA AAGCAGAAAATAATGGTTATGTACTATTATGTACAACAAATTAAATCATCATCATCAACA TGTACCAATTTCCAGAAAAGGACAATATTCATTATTTTTTACTATCATAGCTTAAATATT ATTAATGGTTCAACGTGTAACAATTTAAAATTTGTCGTTGGTATGATAACATAATAAATA TTCTTTCAAAAAGGTAAATTGATTTTAATCTCCATTGCGGTCAGATACATTTAGATCTAA AAGATTATCTCAATGATATTTGTGTGGCCTGGATTGTATCCAAATTCCAATGATAATTTG ATCAAGTTATAAGGACAATAGTCTCTGAGTTTCCAAAATTGCAGTAGCTTTCCACGACTT TGACATTTCGAAAATTGAATTTTTAACAAAGCTCCGACCCCAACACATTTTTTCCATTGT CTGCGCTAACCTATTAAAAACCACACCAACTTTTTCCCATTGCAGATTACAAAAAGGTTA AAAATATCACTTTCTTCATTTGAAGAGCACGAGAAAAAAATTAAACTTTGTATTCAAGAT ACTTCTTGCTCACCAAGACACGATAAGGTCTCTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTCTC TCTGTGTGTCTGTGTCTGACCTACTTGTTTGATCCTCACACGCAGCAACTTAGCGCCATT TCAAAGCTTTAAATATTCAGCTTTTGGGTCTCCTTCAAGGCAACAAAAATCCAAACCCCA TCAAGAAAACAGAGCAAGAA >LITCHI026370.m12 - 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>LITCHI026370.m13 GenomeSequence - CCAAATTCCAATGATAATTTGATCAAGTTATAAGGACAATAGTCTCTGAGTTTCCAAAAT TGCAGTAGCTTTCCACGACTTTGACATTTCGAAAATTGAATTTTTAACAAAGCTCCGACC CCAACACATTTTTTCCATTGTCTGCGCTAACCTATTAAAAACCACACCAACTTTTTCCCA TTGCAGATTACAAAAAGGTTAAAAATATCACTTTCTTCATTTGAAGAGCACGAGAAAAAA ATTAAACTTTGTATTCAAGATACTTCTTGCTCACCAAGACACGATAAGGTCTCTCGCTCT CTCTCTCTCTCTCTGTGTCTCTCTGTGTGTCTGTGTCTGACCTACTTGTTTGATCCTCAC ACGCAGCAACTTAGCGCCATTTCAAAGCTTTAAATATTCAGCTTTTGGGTCTCCTTCAAG GCAACAAAAATCCAAACCCCATCAAGAAAACAGAGCAAGAAATGAACGAGGAAACGTTGA CGCCACCAGCAGGACAGCAAAAGAAGCGACTCTGCGACTACTGTAATGATAGAAATGCTG TTTTGTACTGCAGAGCTGACTCGGCCAAGCTTTGTTTCTTGTGTGATAGAGAAGTACACT CCACGAACCAGCTCTTCTCGAAGCACTCTCGCTCCCAGCTCTGTGACAGCTGTGGTGCCT CCTCTGCTTCCATCTTCTGCGAAACAGATTACTCTGTTTTCTGCTCCAATTGTGACTGGG AAAACCACAGTCACACCACGTTGTGTGTGCCTCCTCTGCATAACCGTAGACCAATTGAGG CCTTCACTGGTTGCCCATCTGTGAGCGAACTGTTGACACTCGTTGGGTTGGATGATCTGG ACAACAAGGCTCTGTTTTCATATGATGAGAACGCTAGTAAAAATTATAACTTTGTTGATG 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