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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI019305 | Chr15 | 15518342 | 15520440 | + | Zinc finger protein CONSTANS-LIKE 2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI019305.m1 | 61 | 105 | PF00643.27 | zf-B_box | Domain | 30.7 | 2.80E-07 |
LITCHI019305.m1 | 283 | 325 | PF06203.17 | CCT | Motif | 60 | 1.90E-16 |
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>LITCHI019305.m1 ATGATGAAAGAAGAAAGCAGCGACGGTGGAGGCGGAGCCAACAACTGGGCACGTGTCTGC GACACCTGTAGGTCTGCTGCTTGCACTGTCTACTGCAAGGCTGACTTGGCCTATCTATGC GCTGCTTGTGACGCCAGGGTTCATGCTGCCAACCGGGTTGCTTCCCGGCACGAGCGTGTC TTCGTTTGTGAGGCTTGCGAGCAGGCTCCTGCTGCTTTCCTTTGCAAGGCTGACGCTGCC TCCCTCTGCGCTGCCTGTGATGCTGATATCCACTCTGCCAACCCCCTCGCCCGCCGCCAC CACCGAGTTCCCATACTTCCCATATCAGGGTCCATCTATGGTCAGACTGAGGATGGGTTC GTAGGTGCTGAAGATGAAGATGATGATGAGGAGGCTGCTTCTTGGTTGTTGATGAACCCA ACCAAGAGCACCAACAACACAGATAATAGCTATTTGTTTCCTGGAGAGGTTGATGAATAT TTGGACCTTGTAGACTACAATGGTGAGAATCAGTATGTCGATCACTACAATCACCATCAG CAGCATCAACAACACTTTGGGAAGAATTATATCAGTGACAGCATTGTTCCTGTTCAGTGC CAAGTTAAAGATCAACAGAATCAGGAGAATTTTCCACTGGGATTGGACTATGAATCCTCT AAAGCTGCTTACAGTTACAGTGATTCTCTCAGTCACAGTTTGTCAGTTTCGTCAACGGAT GTGGGTGTAGTACCAGAATCAACAACAAGTGACATATCAATCTCCCACTCGAGACCTCCA AAAGGTACAATCGACCTCTTTTCAGGACCTCCAATTCAAATGCCTCCCCAGCTGACTCCA ATGGACAGGAAGGCCAGGGTCCTGAGATACAGAGAGAAAAAGAAGACTAGGAAGTTTGAG AAGACAATCAGGTACGCCTCTAGGAAGGCCTATGCAGAGACCAGACCACGAATCAAGGGT CGGTTTGCTAAGCGCAGAGATGTTGAAGTTGAAATCGACCAGATGTTCTCCACAGCGTTG ATAACAGACGCCGGATATGGCATTGTTCCTTCATTCTAA
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>LITCHI020342.m1 ATGCTTAAGATAACAGATCTTGGACTAGCTCGAGCATTTACTCTTCCAGTTAAAAAGTAC ACTCATATATTGACTCTCTGTTATAGAGCTCCAAAAGTCTTACTAGGGTGTACTCATTAC TTTGTTGTTGTGGATATGTGTCTGTTGGCTATATATTTGTCATTTTATCCAAGTGATTCT ATTATTATAGATATGCTACATGGTAATTTTTGTTCTATCTCAATGGTAGCTGAACTTGTC ACCAAGCAAGCACTTATCCTAGGAGATTTTGAGCTGCAACAGCTTCTGCATATTTTGAGC AAATGTTTGCAATATGAACCTGCAAAGCGGATCTCAACAAAAAAAGCTATGAAGCATCCT TACTTAGATGATCTAAACAAGGCCTAACTCTGAGGAATGCAAAGGGGATTTGATATGTTA TCTTGTTTTGCTAATTCAACGAACAAAAACTCTGTAGCAGTCTATTTACTTCTCTCAAGC ATCTCAGTGGTGTGGGCACCACTACTACGGTCTTGTGGTTTCTAAATGTGATCATTTCAT CTGATTGACAGTTTTCTTATTGTGTCTTTGATGAATTTGTAGCTATATAAAGCCGCACTA ATAACTGCTTTGAAACAAAGGAGTGGGGTTTTATTGAGAGTACTGCATAATGGCTAAACA CTCTGAGCGTCAAAGGAAATCAGCTTACACTTATCTCATGCTGTAAGTAATTGATATTGC TATCTATTATATGATTATGGTTACATTTGTTTACCATGCAAGAAGGGGTGTGTATTTGAG TGTACCTTGGAAGTTGAATTACTTGATTATCTGGGATGTTGAGATATACTTACTAGCAAG TTGATTGTCAGTATCACTGTCAGTATGAATATTAGGAAAACTTCAATGAAAGCTGATAGT GAATGCTGAACACGTT
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>LITCHI020342.m1 - Up_Stream_Len 2000 GAAAAGACAAAATAATATTATTATTAATTGTCAATCCATAAATTTCAGACAAAATTAATT TTCTTTAATTTTTTTAGAGAATTTTTCTAAAACGTTTATATTGTTTGTAGAAATTGCTCC TAATTTAATTATTCAGAAACTCACAAAAAGATATCAAACAAATTCTATTTTCAAAAATTC ATTTGTATTCAATCCAAAATATTAGATAAATTTCACCTGTTGATTTCTTCTCCTTAAAAT ATTTAAAACATGGACGCGAATTCTTTTATATTTAATCCGAAATATTAATTCACAGGATAA TATGTGGTCACAAAATTTGACAACCTGGATGATTTTCCAGTAGTGTTGTTTAGGCTATAG TTTTTCTATTTAGGAGTAGCATAACTATGCTCTGAATATGGTGTTCAATTTGTGTCCCCT CATTTTTTTAAGCTTAATGTCATTATGTTAACTATTTGTAGTCATGCAAGACATAGCTCC GGTCGCTGTAGTGTGTCAATATGGTATTTGGCAACTTGAAACAAACTTCTAATAAACGGG TCCCTTTAGGAAAATATTGTTAGTGAACCAGATCAATCAGAAAAAGTTAAAAGGGCGGAA ACCCAATATAACACTGAGATTTATTGAAAATTTTTGTTCTTACGTTCCATGTACATTACC TTAATTCTATGATCTTCTATAAAGTTTATATCTTTTCTTTGGGTTTGGCTACTTTACTAG GATAAGTATACTATTATCATTGGATTAATTGTAAAGATGGTTATTCAAACCAATCCAATA GTTGTAATTATTTGGTAAGGTTAAAGTAGCTCAATCTATTTTGTAATCATATATCCATCA ATTCATCAATCCTTACATATAATTTATAATTCAAATAATTAGTGTATTTACTTTTCACAT TCACAATAGGAGTAAATTCTCACACCATGCCTATATACCCACGTCTTTGCCGTGTTTATT TACTCGTACGTATTTGACCATGCATATTAGCTCCATATATGGGAGATTCCTGCTGGTTTG AATACTACCATAATCCCATTTGTGAAGAGATTTCTCTTCATATTGTTGGAGTGGACATCT CATGTGTATTTAATATAATTTATAAGTATTTTACCATACATGTTAGCTTTTATATATGGG AGATTTCTCCAAATACTATAATGGAGTGTTTGAGTGATCACTAAAATGGCTTTTGATTCG GGGAAAAATTTCTAAGTGAAACCATAATTATCAACTTCGAATAAAAGAGCTTTCAAAGCA AAACACGGGAAGCTATCTTGTTTAATGAATCTTTTATAATACCAATTTTACCCTTTAAAC TATAAATATGAAAATAAAATTTCCACTCATATCCTTCCATATGTTTTGTTCTTTCCTATT CTTCTGCTTTCTTGCTTGATCTCGCCGTAGAAATCACATCACTTGAATTGATCTCCTTTT GGCTTTGTATCTTCGCTAGACCACCGTGAATCCGTAATAGTAAGCTCTTTTTCATCGTCA TGTTCGTCTTGTTTTGTTGTGTTTTGTTAGGGTTTTTGATTTGATTATGATACGATTTGA ATCTGGGGCCTTTTTTTAGGGTCTTAGTGTGATTCATTTTATTTTTGCATCTGGGTTGAT GTTATATATGTCTTTTCTTTTGTGGGTTTTTGTTTTTGGTCTTTTCTTGTTATGTTGTAG TTGGGTTTTCTCATTTAAGTGGATTTTGTTATTGGTGATGTTAAGTGCTAGAACTGTTTA TTCTAGAGGAGATGAATTCTATGCAGCATATCTAGTTGGGATTGAGCTTTTAACAGACAC TACTAGGATTTGTTTATCATCTTTGCAATGGTGTTGTTTTCTGCCATGACCATAATATCT TGCATAGGTACCACTTCTCCTTTATTTTTTATCCCACATTTGCCTTAAATTGGAAAAATT GTTTAGTTAACCTTTTAATTTTGTTGTGCCAACCGAGGGACCTTAAGCCTCACAATCTAT TGATGGATTGAAAGACTCAG
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>LITCHI006626.m1 GenomeSequence - CTTATATGGTTTTCTAGACCCGAAATCCAATGTCTATAAATTGAGAAGCGAGAAGAGCCA ACCCCTCATGTATGGTTTTTGGAGTGATTGATAGAAACTAGAAAGAGAGCAAGAAATCAA TAGCTAGATTGATGAACAGTAGCAAAAATACACTTGGTCATACCCTACCACCACCACACT GACCCATCTCACTGACTCAAAATTCACTCTCTCTCTCTCTTTCTATAACATGCAATCTGG GTCCCTCTCTGTTGCTGTGCCTTTATATCTCTCTTTACTATATACGCATATACACCTCTC CATTAGCATTTCACGACAACGTGGACTGCAGGTGCTGACTGGTATTTCGCCATTTTATTA GCTTATAAAGCTACAAGACAACCAACGATTCACAGCCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC TCTCGTACCATTCACTGTGTTGTTTTCTATTCAAACACAATATTATTACATTTCGCTCTC AGTTTACTATTCAGCTCGTACTCTCTGCCTCGACCATTTAACTATAAACTCACCATCACC CACCACATTTTGCATACCACTTTTCCTCGTTTTTGCTCTCATTTGCAGCAAAAGCTTCTC TTCTTCTAAGTCATTTTTTTGTGGTTTTCAATTTTAGAGAAGAGTGAGTGGCTTGTGCCC ATTAAAGGATATATAGATAGAGAGGTGGTGCAATGATGCACAGATGTAGTAGTGGCTCTT CAGGGAACATGATGGGGCCATGTTCATGCGATCTGTTTCATCACCATCAATATCATCACA GCCAAAGCAGCAGCAGCAGCAGTAGTGGTGGTGGTTCCTTTTCGATGCTATTTTCTATGC CTAACCACAAGTCTTTTGATGAAGCAGACATGTACCCATTCATGTCTTCTTCCTCTTCTG TTGATTGTACTCTCTCCCTTGGTACCCCCTCCACTCGTCTAACCAGTGAAGATGATGAGA GGCAGCGGATCCGTGGCCATGATCAGAGACGCTCTTCCTCTTCTTGCATGCCCAACTTTA GTTGGGATTTCTTGCAGACCACTAGAAACTCTCCTTATCCTCCTCAAATCACCAATAAGT CTAGCCGTGGTGGAGCCAATTCTAGCACCAATAACAACTCCGCCAGCGACCCTCTTCTCG CTCGTCGTTGCGCTAATTGTGACACCACTTCCACTCCTCTTTGGAGGAACGGTCCCAGAG GCCCCAAGGTAGTGCTTTTTTTTTTTTTCAAAAATTTTCTTCATGAAATATATGTAATGA CTTTAATTTGTTACCTGTTTATTTTTGAAGTAACATTTTATGAATTTATGTAGTCACTTT GCAACGCTTGTGGAATTCGGTTCAAGAAGGAAGAGAGAAGAGCCACGGCAGCAAATGCAA ACACAAACGGTGGGGCTGCATCAGGAGTAATGGAGCAGCAACACCACCACCAGGGTTATC ACCACAACAATTCATGGGTTCACCACGCACAGGCCCAGAAAATGCCTTGTTATTCGACAT CAAACGAGTTCAGGTTCATCGAAGACAGCGACCAGAATTCAAGTGATACGGGCATTCCTT TCCTTTCTTGGAGACTAAATGTGGCGGACAGGCCTAGTCTAGTCCACGACTTTACAAGAT AAAAACATAAAAAGAGAGGAGAAGAAAAGGAAAAAATAAAGCGACGGTCAAAATCATCGA TCATAGGTGCAGTATTGCTGTGCAGTGCAGTGCAGCAAGTGACGCTAATGACCCTAGCGA CGTTACGTGTATCACGATGATGATGATGATGTCGAAGATGGTTGATGATGATAGTGATGG TTTAACTGGTTGGTTATATATAATATGGTCCCTGTCTCGTCTCGTCTCGGTCCAGTTTCG TCTCGTCAAAATTCTTTTTTCATTTTTGTTTTTTTTTTTTTAACCTTTTTTGCTCTCTCC ATCACATACTGAATGGAGTTTCAAAATGGGACAACTCAATGTTCTTATTTTTGCTCTTTT TCTTTTTAAAATTTTTTAAGCTCTTTTAGCTATTTCAAACTTCAATTCTGATCACAAGGA TGATTGTGATGATGAGGAGGATGAACGGCAGTGATGAGAAGTGCCCACCCCAGCTGATGA TACGTGTTATGGACAGTAATGTGGAAGATTTAACGACTAAGTATTTTATAGTATTACTAG AACTGAAGTTTACTTGAGAGAGTTGTTGCTGTAATTATTTGGTCTCTTTTCCATTTTTTT TTAATTGTTTTTTCGGTTAACTGAATTTCACAAAAACTGAGAGAATTGCTGGTTCATTGC ATATGATTCTGGTGATAAATCTGATCGTCCAATCACTTTGTCCATCAACGTCTTTCTCTG AAACCGGAGGACACTCTGCGGTTTCTGAGAACAGTAATCAATTTGTCCTACTTGGGGATT GCATTTTCTGAAGAGATCTGACCCTTTAATTGGCCTCGTTCACAGCTGCAGGTTAATTAT TTGCAACAGTACTCTTCGCTAGTTCTCTTTTACATATAATATAAAATATAATCAATAACA CAAACAAATACAATCAAAACTCTGAACCTAAAAGCAACTGCCTAAGGTGGGCTAATGGTT GCAAGAATTTGTCATGAGCAACTTCAACCGTAAATGATATCAG