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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI019303 | Chr15 | 15467632 | 15473200 | + | Protein NSP-INTERACTING KINASE 1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI019303.m1 | 32 | 71 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 47.2 | 2.20E-12 |
LITCHI019303.m1 | 123 | 182 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 35.9 | 5.10E-09 |
LITCHI019303.m1 | 123 | 145 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 15.1 | 0.026 |
LITCHI019303.m1 | 307 | 572 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 150.2 | 7.60E-44 |
LITCHI019303.m1 | 309 | 575 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 143.4 | 8.00E-42 |
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>LITCHI019303.m1 ATGGGGATGAGAAGAAGTGTATTTGGTCTTTTTATTGTGGCTTTTTTGTGGTTTTGTACA TCTGCAAATGGATTGTTATCTCCTAAAGGTGTAAACTATGAAGTGCAAGCTTTGATGGGC ATAAAATATTCTTTGAGGGATCCTCACGGAGTCCTTGATAATTGGGACGGTGATGCTGTT GATCCATGTAGCTGGACTATGGTCACTTGCTCTCCTGAAAGCCTGGTCATTGGCCTAGGA ACTCCTAGCCAAAATTTGTCTGGTACTCTTTCACCAAGCATTGGCAACTTAACAAATCTT CAGATTGTTCTCTTGCAGAACAACAACATAACTGGACCAATCCCTCCTGAGATTGGTAGG CTTTCAAAGCTTCAAACTCTTGATCTTTCCGATAACTTCTTCACCGGCCAAATTCCTTCC TCTCTAGGTCACTTAACAAGTCTCAAATACATGAGGATTAATAATAACAGTCTCTCTGGA GCCATTCCGATGTCATTGGCTAACATGACACAGCTTGCATTTCTTGATTTATCCTTCAAT AATCTGAGCAGCCCTGTACCAAGATTTCCAGCCAAAACATACAACATCGATGGAAACCCT CTAATCTGTGCCACAGGGTCTGAACCAGACTGCTATGGAACACAATTGATGCCAATGTCT ATGAATTTGAACAGCTCACAAACTGGTCTTCCTTCTGGCAGAGCTAGTAGAAGTCACAAA ATATCCCTTGTCTTTGGCTTGAGTGTTGGGTGTGTCTCTGTTATCATTCTAGTATTTGGA CTAGCTATGTGGTGGAGACAAAGGCGCAATCAACAGATGTTCTTCGATGTTAAGGATCGG CATCATCATGAGGAAGTGTCTCTGGGGAACTTGAGGAGATTTCAATTTAGAGAACTGCAG ATTGCAACGAATAACTTCAGCAGCAAGAACATCCTGGGAAAGGGAGGGTTCGGAAATGTG TACAAAGGGATTCTCCAAGATGGGAGTGTTGTGGCTGTCAAGAGGCTTAAAGATGGAAAT GCCACTGGAGGAGAGATTCAATTCCAGACTGAAGTCGAAATGATCAGCTTAGCAGTGCAC CGAAACCTCCTTAGACTTTATGGATTTTGCATCACACCCACAGAAAGGCTCCTAGTTTAT CCGTACATGTCTAACGGCAGCGTTGCATCCCGTCTCAAAGGGAAGCCAATCCTGGATTGG GGCACCAGGAAGAGAATCGCATTAGGGGCTGCAAGGGGACTATTATACCTCCATGAGCAG TGTGACCCGAAAATCATTCATAGAGATGTTAAGGCAGCAAATATATTGCTTGATGACTAT TGTGAGGCAGTTGTTGGAGATTTTGGCTTGGCAAAGCTTCTGGATCATCAGGATTCTCAT GTAACAACAGCTGTGAGAGGCACCGTGGGGCATATAGCACCTGAATATCTTTCAACAGGC CAGTCCTCTGAAAAAACAGATGTTTTTGGATTTGGTATTCTTCTACTTGAGTTAATAACA GGCCAAAGAGCACTAGAATTTGGCAAGGCAGCTAACCAGAAAGGAGCCATACTTGATTGG GTCAAGAAGATCCATCAGGATAAGAAGTTGGAAGTGCTTGTAGACAAGGACTTAAAGACC AACTATGACAGGATTGAGCTTGAGGAGATTGTTCAGGTGGCATTGTTGTGCACTCAAAAC CTTCCAGGCCACAGGCCTAAAATGTCTGAAGTTGTTCGAATGCTTGAAGGCGATGGACTT GCAGAACGATGGGAAGCTTCTCAACGAGCAGAAGCAAGCAAAGGAAAACCCCACGAATTC TCTTCCTCAGATCGATACTCTGATCTCACGGACGACTCATCCTTACTAGTCCAAGCAATG GAGCTCTCTGGCCCCAGGTGA
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>LITCHI019303.m1 MGMRRSVFGLFIVAFLWFCTSANGLLSPKGVNYEVQALMGIKYSLRDPHGVLDNWDGDAV DPCSWTMVTCSPESLVIGLGTPSQNLSGTLSPSIGNLTNLQIVLLQNNNITGPIPPEIGR LSKLQTLDLSDNFFTGQIPSSLGHLTSLKYMRINNNSLSGAIPMSLANMTQLAFLDLSFN NLSSPVPRFPAKTYNIDGNPLICATGSEPDCYGTQLMPMSMNLNSSQTGLPSGRASRSHK ISLVFGLSVGCVSVIILVFGLAMWWRQRRNQQMFFDVKDRHHHEEVSLGNLRRFQFRELQ IATNNFSSKNILGKGGFGNVYKGILQDGSVVAVKRLKDGNATGGEIQFQTEVEMISLAVH RNLLRLYGFCITPTERLLVYPYMSNGSVASRLKGKPILDWGTRKRIALGAARGLLYLHEQ CDPKIIHRDVKAANILLDDYCEAVVGDFGLAKLLDHQDSHVTTAVRGTVGHIAPEYLSTG QSSEKTDVFGFGILLLELITGQRALEFGKAANQKGAILDWVKKIHQDKKLEVLVDKDLKT NYDRIELEEIVQVALLCTQNLPGHRPKMSEVVRMLEGDGLAERWEASQRAEASKGKPHEF SSSDRYSDLTDDSSLLVQAMELSGPR.
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>LITCHI019303.m1 ATTCTTTTCTTTACAAGCTCCTGACTCAATGACAAGCATGCTTAGGTCCCTTTATAGTAC CAATAAAAACAAGTGTTTTTCCTTGGGGTCTACACAGGATTTAGTGGGTGGCATGAAAAG CAGCAAGTGTGTTGTGATCTAAGTATTACCTTCAACAAGAGATTATTATTCATTTGAAAG TTGGTTGTGCTTGTAGAGGTAGCTTCACGAAATTCATCAATTCAATGGGGATGAGAAGAA GTGTATTTGGTCTTTTTATTGTGGCTTTTTTGTGGTTTTGTACATCTGCAAATGGATTGT TATCTCCTAAAGGTGTAAACTATGAAGTGCAAGCTTTGATGGGCATAAAATATTCTTTGA GGGATCCTCACGGAGTCCTTGATAATTGGGACGGTGATGCTGTTGATCCATGTAGCTGGA CTATGGTCACTTGCTCTCCTGAAAGCCTGGTCATTGGCCTAGGAACTCCTAGCCAAAATT TGTCTGGTACTCTTTCACCAAGCATTGGCAACTTAACAAATCTTCAGATTGTTCTCTTGC AGAACAACAACATAACTGGACCAATCCCTCCTGAGATTGGTAGGCTTTCAAAGCTTCAAA CTCTTGATCTTTCCGATAACTTCTTCACCGGCCAAATTCCTTCCTCTCTAGGTCACTTAA CAAGTCTCAAATACATGAGGATTAATAATAACAGTCTCTCTGGAGCCATTCCGATGTCAT TGGCTAACATGACACAGCTTGCATTTCTTGATTTATCCTTCAATAATCTGAGCAGCCCTG TACCAAGATTTCCAGCCAAAACATACAACATCGATGGAAACCCTCTAATCTGTGCCACAG GGTCTGAACCAGACTGCTATGGAACACAATTGATGCCAATGTCTATGAATTTGAACAGCT CACAAACTGGTCTTCCTTCTGGCAGAGCTAGTAGAAGTCACAAAATATCCCTTGTCTTTG GCTTGAGTGTTGGGTGTGTCTCTGTTATCATTCTAGTATTTGGACTAGCTATGTGGTGGA GACAAAGGCGCAATCAACAGATGTTCTTCGATGTTAAGGATCGGCATCATCATGAGGAAG TGTCTCTGGGGAACTTGAGGAGATTTCAATTTAGAGAACTGCAGATTGCAACGAATAACT TCAGCAGCAAGAACATCCTGGGAAAGGGAGGGTTCGGAAATGTGTACAAAGGGATTCTCC AAGATGGGAGTGTTGTGGCTGTCAAGAGGCTTAAAGATGGAAATGCCACTGGAGGAGAGA TTCAATTCCAGACTGAAGTCGAAATGATCAGCTTAGCAGTGCACCGAAACCTCCTTAGAC TTTATGGATTTTGCATCACACCCACAGAAAGGCTCCTAGTTTATCCGTACATGTCTAACG GCAGCGTTGCATCCCGTCTCAAAGGGAAGCCAATCCTGGATTGGGGCACCAGGAAGAGAA TCGCATTAGGGGCTGCAAGGGGACTATTATACCTCCATGAGCAGTGTGACCCGAAAATCA TTCATAGAGATGTTAAGGCAGCAAATATATTGCTTGATGACTATTGTGAGGCAGTTGTTG GAGATTTTGGCTTGGCAAAGCTTCTGGATCATCAGGATTCTCATGTAACAACAGCTGTGA GAGGCACCGTGGGGCATATAGCACCTGAATATCTTTCAACAGGCCAGTCCTCTGAAAAAA CAGATGTTTTTGGATTTGGTATTCTTCTACTTGAGTTAATAACAGGCCAAAGAGCACTAG AATTTGGCAAGGCAGCTAACCAGAAAGGAGCCATACTTGATTGGGTCAAGAAGATCCATC AGGATAAGAAGTTGGAAGTGCTTGTAGACAAGGACTTAAAGACCAACTATGACAGGATTG AGCTTGAGGAGATTGTTCAGGTGGCATTGTTGTGCACTCAAAACCTTCCAGGCCACAGGC CTAAAATGTCTGAAGTTGTTCGAATGCTTGAAGGCGATGGACTTGCAGAACGATGGGAAG CTTCTCAACGAGCAGAAGCAAGCAAAGGAAAACCCCACGAATTCTCTTCCTCAGATCGAT ACTCTGATCTCACGGACGACTCATCCTTACTAGTCCAAGCAATGGAGCTCTCTGGCCCCA GGTGAATTTCCCACAGAATATAAATTTATTTTTATTTTTTCCTCTTCCCTTCCAAAGAGA ACAAAATTCCAGTTGAAGCCACTCTGCAAATGTTCCTGTGTTGATTCATAGTTTTATGTT GTATAATAGTGTTATATCATCAGAGCTGTATGGCCTTGAATTATTTTTCCCCATCCAATT GTACATATTTTTAGTTTGAGAAGATAATATTTCTAGGATGAGAATTTCAAGAATTTGGTA TTCTTATTGAGTGCAAAATTTAAAGGAGATGTCTGGTCAAATTTTTGAGCTTGTAAAATT AATTTCTGAGCTTGATTGTTGTAGATAGTTTTGAACCATTAGAAACCATGATTATATGTA ATGAGTTATCTGTTCATGTTTTCTCTTTGTTATTTGGTTATCTTTTGATTTTTTTCTCTT TTTTATGACTTAATTTAAAGGCCCTAGTGTGTGAGTTATGTATTATTTGCAAATATGCAA GGATAATTACAGAATCCATATGGTTAGTACACAAATTGTATCATGAGTTAGATGTACGCA AAATGCCATTTGCAGCCAGTCTTTGATATGTTTAAATGACAACTTATTTTTCTATCCAAT GTGAGATCATGGCACCTATCCATAACATTTATGGCTTGAAGCAACCTCATTGCACAGTAT TTAAATCCAATTACTCCATAAATTGAAGGATAAGAATTCCTGTACCTATGGTCTTCACTT GAAGAGCTAAAAAAACTGTGCTTTTTCTGGTTCCCTTGTTGTAAAAAGGTATAGTTACCA AACAAAAGAAAGGTTTATGCCAAAGTTATTCCAGACATGCACAGTAAAAAGGATTAAACA TCAAAATCTCATAATTCACAAACAAGATAATAAACCATATCTGCAAAATAGGAAAATCGC CGATTCCTGAAAGAGGGTAGCCTAAAATGCCAGACTTATAATCTTCACATGTCTCGAAGC CCGCTCAAATTGCAGAAACAGTGAGTCTGGAATCCTTGTATTGCCATAAGTTAGAGCAAC AAGTGTCTCAAGTAGAGGTGAACGAGCAAGTAGAAGTTTTATAAATTCCATTTCGATTAG TGTCTCTGTGATGCCTCTAATCCTCACTACCTTTAGCTGGTTAAAGGACTCCGGTAGGCA CTGTGTTCTTAGAAATCCTAAGACGGATCTGGAAAAATTTGTATCACCAACCTACATAAA AAATTAAACATGACAATTTCTAGTCTTTAGTATCATACTGAACATAAGATGGTAAAACAT TTACATTGGCAACAGCATACCGAGATAGAAAGCTCCTCTAAATTAGGGCAGCTTCTAAGT ACAGAAAAGAAAACCTTGACTTCTTTCAGGTTGTTAAATTTGATCTCCTTTAGGTCAAGA AAGGAAAGATGATTGAGCAAAGTACGAAGTCTTTCTGGAACTTCACCATTCGCAAGAAAC TACGAATAAATGCACGAATAGTATCATATAAGTAAGTTGATCAGATATGCCAAAGAAAAA GTAGAATGAGCAACAAAAGAAGATTACCTCAAGAAAGTAGCTGGACAAAGTAAGCCTCTT GACAGCAGTGAGACATCTGAAAACTCTGACTAAATTGCAAGGTTTACCCTGCTCAAGCTG CTGGGTTACGGTCCTTCCATACATAGGTATCATACGGATATCAACACTATCTAAAACCAT GCTATTTTCAAGGAAGATATCTTCAAACTCAGAATCTATTTTTAGGTACTTAAGGTTCGG ATTATGGATCCTCAGAAAGGCCAAATGCTCAATGCTTAATAGCGTTAATCTTTCAAGAAT AGGACAATTACGAATTAACCTTTCTAGTACGTCACTTACGATGAAAACCTGAGTCAGTTG AAGGCTTTTGAGACAATTAAATCCTTTGAAATCAGATGGAAGCTTGCATATGCAGCCATA AAGTTCCAAGCAACTCAGTTGTGCACAAGAGAAAAGGACAGGAAGCAACTTAAGCCGTTT AACACAACTGAAATCCTGAATGATTAATTCCTTAACACCTTTCTCCGTTAGAAAAAGTAT TAACTGGTCTAAATCATGACTATTTGGGCAGCAATAAGCGGCCAGCTTGAACTTCTCAAT AGGGCCTTTGTGATATAATTGAACCTGATGAATGATTTTCATAATTTCCCCCCATCTTAC TTTCCCTGATAGAGAACTAGGGAAGCATTTATCATCAAAAACGAATCGTGAAAGGCCAGT CCACTTATATCTCCACTTACTTGATAAAATGCTAGTCCTAGCAGCATCTCTTAATGGCAA GTTCACAAGGATGGTATCTAGCACATCCCATGGCAGATTGCTAATCCTATCTACATTTGG TTGGCTTTCCATCTTAGTCGCATCAGACTTTTCAAGTTTTGCCCTCTTCTCTTCTACTGA CTCTTTGGCTGACATAAATTTATGAGATGTTCTTTCTTCACCAAATTAATGTGGATATTT CATTTGATAAGAGCAGA
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>LITCHI019303.m1 + Up_Stream_Len 2000 GACTGTTATTTAATATGAAATTATCCTAAATTCAAATTATTGTAGACTAGATGACTGTGA CTGCCTATCCATCATTTTAAGTGGGTTCATATGTAATTCACCTAAATGAACCTTATAAGA AGTGATTGAGGTTTAGTCTTTATTTATTATCAGCAATGGCAATGAGGAAGGTGTTTGCAC GCTCACATGAATGCGTTTGTAAATGTAAAAAGCACTTTTATTTTTTCCTCTCATCATTCA AGAGAGAAGCATAAGCATTGTCATGGCAGCTTTTGCTTTTAAAAGTTTTACTCTTTTTGA ATAGTTGGGTGTTGAATATTTGTCTGCTGCGAAGAAGGGTGTCTGTGACCGTTAGCTGAT AGTGGCTTATGGAATCTATCAGATTTATTTTTATTTTTTATTTTTTAAGAAAAAGAAAAA GCAGAGACCCATTTACAGCTTAAAAGTTGTGACTCAAATATATGCTCTATATTATTTACT ACCATGCACATTTTTTATAGTGCCAAGTGTAAACCCAACAGAGACACTCTCGGTGGGTGA CCAAATCCCACCATCATCAATCTCGAGCTCCCATTCATTTCTCGAGATTCTCACATTCCC TATTTATTATCCATAAACCAACAAAATTTGATTATATAAGATGGGTTTTGGGTATTTTAC TGCATGGCCAAACTCATGGAATGTTTGATTCTCCATTGTTACAAGCAATCCTCTGTCTTC CCATTCACATACACCTTCTGTGCCCATTTGTGTTTCAGTAGTTCTCATGCTAGTCCAATA AAATACTCATCTCCAGGTATTGTAATAGGATGATTTTTATTCCCTTGCATGTATTATGCA ATACATGCAATAACATTTGAAACTTCAGTGCTTTATTATCTTTAAGTTAATTAAAAACTG ATACATATTTGAATGGTTTTATTTTTATTAAGGGATAATGCCACCTGCAATTTGATATAA TACCAAAATCGCCCAATATTTTTGAAAATCTCTAGTATCCCCTTGACCTTTGTTGATTTA TGAAATAGATTAAATACTTCCTATAGTTTATGGAAATGTCCAAAAACCCATCGCTATCAA AGTTGATTTTGAAAATTAAAATTTGACCGTTAATGTGGAAAAACAAAACTATATGAGTAC TTTGATTATTTCAATAATTTAGGTAAAGATAGTAATGGTATGAGGTAAAATGAGATTCTC CAAAACTATAGGGGATAATTAACGATTATGTTAAATTACAAGAGAAAGTAGGATTATCCC TATTTATTAATGATCATTTTCAAATTTTAAAGAACATTAAATTGTCCAAATCTATTTGTA TTTAATCTAAAACTTTAGCAAAAATATAAAGTATTTGTAATAATAAGGTGCAAAAATTTT TATTTCCTCGAATTACATAGTTCTTAACTTGGAACACACTCACCAACTCAAGTGGACACT TTACGTCAAGGGTTAAATTATTCTAAGTTAAAAATTCATGTCAAAAAAACAAAAAATGTA ACTTAACAAATTGAGAAGCCCCACATTTAAAAAATTAAATTATTTTATATAATTATAAAC TAATCTAACATTAATGGTCAGAAATTTGCTAGAGGTTATACTATATACATGCAGTCTAAA GGATTAAATACAATTATAGAAATTGTATTATAAAAAGAATGAATGATTGAAACAGGAAAG GAATTTACTGTTATATCCTTGTCTTTTAAATATTATATGCAGGATAGTTATAAAGTGGTT TATATTGCTGTTTTTAAGATTATGGGCATTATATATATTCTTTTCTTTACAAGCTCCTGA CTCAATGACAAGCATGCTTAGGTCCCTTTATAGTACCAATAAAAACAAGTGTTTTTCCTT GGGGTCTACACAGGATTTAGTGGGTGGCATGAAAAGCAGCAAGTGTGTTGTGATCTAAGT ATTACCTTCAACAAGAGATTATTATTCATTTGAAAGTTGGTTGTGCTTGTAGAGGTAGCT TCACGAAATTCATCAATTCA
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>LITCHI019303.m1 GenomeSequence + ATTCTTTTCTTTACAAGCTCCTGACTCAATGACAAGCATGCTTAGGTCCCTTTATAGTAC CAATAAAAACAAGTGTTTTTCCTTGGGGTCTACACAGGATTTAGTGGGTGGCATGAAAAG CAGCAAGTGTGTTGTGATCTAAGTATTACCTTCAACAAGAGATTATTATTCATTTGAAAG TTGGTTGTGCTTGTAGAGGTAGCTTCACGAAATTCATCAATTCAATGGGGATGAGAAGAA GTGTATTTGGTCTTTTTATTGTGGCTTTTTTGTGGTTTTGTACATCTGCAAATGGATTGT TATCTCCTAAAGGTGTAAACTATGAAGGTAAAGTAGGAAATATTATTATTATTATTATTT GAATGTTTTATCAGTTAATATTGCACTGCTGTTTGTTCTTTGGCTTCAAATGGGCTAGGA AATGAAGAACGGTTTTTCATTTGGGGTGTTTTTGTTTCAGTGCAAGCTTTGATGGGCATA AAATATTCTTTGAGGGATCCTCACGGAGTCCTTGATAATTGGGACGGTGATGCTGTTGAT CCATGTAGCTGGACTATGGTCACTTGCTCTCCTGAAAGCCTGGTCATTGGCCTGTAAGTT GTTGCTCATTTAACAACATTAAATATCAAAATCTAGCATGAAAACTTGAAGAGCAGCCAG CAGCCTTTATTAAAATAGTTGAATTTGTGTTGCTGCAGAGGAACTCCTAGCCAAAATTTG TCTGGTACTCTTTCACCAAGCATTGGCAACTTAACAAATCTTCAGATTGTGTGAGTAACA AAGACAATTAGGCAGTTTTTGGTTTTGTTTTTTATTTTTCAGTTTTGGTTATTGGTATTA ACACTTGTTTATATCTTCAGTCTCTTGCAGAACAACAACATAACTGGACCAATCCCTCCT 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