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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI019303 | Chr15 | 15467632 | 15473200 | + | Protein NSP-INTERACTING KINASE 1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI019303.m1 | 32 | 71 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 47.2 | 2.20E-12 |
| LITCHI019303.m1 | 123 | 182 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 35.9 | 5.10E-09 |
| LITCHI019303.m1 | 123 | 145 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 15.1 | 0.026 |
| LITCHI019303.m1 | 307 | 572 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 150.2 | 7.60E-44 |
| LITCHI019303.m1 | 309 | 575 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 143.4 | 8.00E-42 |
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>LITCHI019303.m1 ATGGGGATGAGAAGAAGTGTATTTGGTCTTTTTATTGTGGCTTTTTTGTGGTTTTGTACA TCTGCAAATGGATTGTTATCTCCTAAAGGTGTAAACTATGAAGTGCAAGCTTTGATGGGC ATAAAATATTCTTTGAGGGATCCTCACGGAGTCCTTGATAATTGGGACGGTGATGCTGTT GATCCATGTAGCTGGACTATGGTCACTTGCTCTCCTGAAAGCCTGGTCATTGGCCTAGGA ACTCCTAGCCAAAATTTGTCTGGTACTCTTTCACCAAGCATTGGCAACTTAACAAATCTT CAGATTGTTCTCTTGCAGAACAACAACATAACTGGACCAATCCCTCCTGAGATTGGTAGG CTTTCAAAGCTTCAAACTCTTGATCTTTCCGATAACTTCTTCACCGGCCAAATTCCTTCC TCTCTAGGTCACTTAACAAGTCTCAAATACATGAGGATTAATAATAACAGTCTCTCTGGA GCCATTCCGATGTCATTGGCTAACATGACACAGCTTGCATTTCTTGATTTATCCTTCAAT AATCTGAGCAGCCCTGTACCAAGATTTCCAGCCAAAACATACAACATCGATGGAAACCCT CTAATCTGTGCCACAGGGTCTGAACCAGACTGCTATGGAACACAATTGATGCCAATGTCT ATGAATTTGAACAGCTCACAAACTGGTCTTCCTTCTGGCAGAGCTAGTAGAAGTCACAAA ATATCCCTTGTCTTTGGCTTGAGTGTTGGGTGTGTCTCTGTTATCATTCTAGTATTTGGA CTAGCTATGTGGTGGAGACAAAGGCGCAATCAACAGATGTTCTTCGATGTTAAGGATCGG CATCATCATGAGGAAGTGTCTCTGGGGAACTTGAGGAGATTTCAATTTAGAGAACTGCAG ATTGCAACGAATAACTTCAGCAGCAAGAACATCCTGGGAAAGGGAGGGTTCGGAAATGTG TACAAAGGGATTCTCCAAGATGGGAGTGTTGTGGCTGTCAAGAGGCTTAAAGATGGAAAT GCCACTGGAGGAGAGATTCAATTCCAGACTGAAGTCGAAATGATCAGCTTAGCAGTGCAC CGAAACCTCCTTAGACTTTATGGATTTTGCATCACACCCACAGAAAGGCTCCTAGTTTAT CCGTACATGTCTAACGGCAGCGTTGCATCCCGTCTCAAAGGGAAGCCAATCCTGGATTGG GGCACCAGGAAGAGAATCGCATTAGGGGCTGCAAGGGGACTATTATACCTCCATGAGCAG TGTGACCCGAAAATCATTCATAGAGATGTTAAGGCAGCAAATATATTGCTTGATGACTAT TGTGAGGCAGTTGTTGGAGATTTTGGCTTGGCAAAGCTTCTGGATCATCAGGATTCTCAT GTAACAACAGCTGTGAGAGGCACCGTGGGGCATATAGCACCTGAATATCTTTCAACAGGC CAGTCCTCTGAAAAAACAGATGTTTTTGGATTTGGTATTCTTCTACTTGAGTTAATAACA GGCCAAAGAGCACTAGAATTTGGCAAGGCAGCTAACCAGAAAGGAGCCATACTTGATTGG GTCAAGAAGATCCATCAGGATAAGAAGTTGGAAGTGCTTGTAGACAAGGACTTAAAGACC AACTATGACAGGATTGAGCTTGAGGAGATTGTTCAGGTGGCATTGTTGTGCACTCAAAAC CTTCCAGGCCACAGGCCTAAAATGTCTGAAGTTGTTCGAATGCTTGAAGGCGATGGACTT GCAGAACGATGGGAAGCTTCTCAACGAGCAGAAGCAAGCAAAGGAAAACCCCACGAATTC TCTTCCTCAGATCGATACTCTGATCTCACGGACGACTCATCCTTACTAGTCCAAGCAATG GAGCTCTCTGGCCCCAGGTGA
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>LITCHI025957.m1 MKYLKVQFFLLIFSYRYIGCSCLTTASNGDEVSALLSIKAGLIDPLDSLQDWKWPGKHSS HCNWRGVWCNSKGVVEKLDLSHKNLSGRISDDIQRLQSLTSLNLCCNWFSLSLPKAVSNL TALKSVDVSQNFLVGSFPAGFGAAAGLTFLNASSNNFSGFLPEDLGNATSLETLDLRGSF FEGSIPVSFKNLNKLKFLGLSGNNLTGQIPRELGQLSSLEIMILGYNEFEGKIPAEFGNL TSLRYLDSAVGNLGGEIPAELGRLKLLETLFLFKNNFEGKIPPEIGNIDSLQFLDLSDNM LSQEIPAEIAKLKNLQLLNLMCNQLSGQVPAGIGWLTQLEVLELWNNSLSGPLPGDLGKN SPLQWLDVSSNSFSGEIPASLCNGANLTKLIMFNNAFSGPIPVTLSSCLSLVRVRMQNNE LSGTIPVGLGKLGKLQRLELANNSLTGEIPDDIASSSSLSFIDISRNHLTSSLPSTIFSI SNLQTFIASNNNLVGEIPDQFQDCPSLSVLDLSSNHFYGSIPASIASCEKLVNLNLRNNQ LAGEIPKSLAMMPTLAILDLSNNTLSGGIPENFGTSPALEVLNVSYNRLEGPVPSNGVLR TINPDDLIGNAGLCGGVLPPCSPYSQTALGQRSLRAKHIVAGWIIGLLSVLAVVIGLFGA RSLYKRWYSNGSCFEERLEMGNGEWPWRLMVFQRLGFKSADILACIKESNVIGMGATGIV YKAEMSLLNTVVAVKKLWRSRADTEAGGSGDFVGEVNVLGKLRHRNIVRLLGFLHNDTNM MIVYEFMNNGSLGEALHGKQAARLLVDWVSRYNIALGVAQGLAYLHHDCHPPIIHRDIKS NNILLDANLEPKIADFGLARMMVRKNETVSMVAGSYGYIAPEYGYTLKVDEKIDIYSFGV VLLELLTGKKPLDPEFGESVDIVEWIRRKISENRNLEEALDPNVGNCKHVQEEMLLVLRI ALLCTAKLPKDRPSMRDVITMLGEAKPRRKSSSINNDGKEKPVFSTSPVNGLL.
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>LITCHI025957.m1 ATGAAGTACCTGAAAGTTCAGTTTTTTTTGCTGATCTTCTCTTACCGTTACATTGGTTGT TCTTGTCTGACGACTGCCTCCAATGGTGATGAAGTGTCAGCTTTGTTATCCATAAAAGCT GGTCTCATTGATCCATTGGACAGTCTTCAAGATTGGAAGTGGCCTGGGAAGCATTCAAGT CACTGCAACTGGAGAGGAGTGTGGTGCAACTCCAAGGGAGTTGTTGAAAAGCTGGATCTC TCCCACAAGAATCTCAGTGGCAGGATATCTGATGACATCCAACGCCTGCAAAGCCTCACT TCTCTCAACTTGTGTTGTAATTGGTTCTCTTTATCACTGCCAAAAGCTGTGTCCAATCTC ACTGCACTGAAGAGCGTTGATGTCAGCCAGAACTTCCTTGTAGGTAGCTTTCCAGCCGGT TTTGGAGCAGCAGCTGGACTTACTTTCCTGAATGCTTCAAGCAACAACTTCTCAGGATTT CTTCCTGAGGATCTTGGAAATGCAACTTCACTGGAGACTTTGGATCTCAGGGGAAGCTTC TTTGAAGGCTCAATTCCAGTGTCTTTCAAGAACTTGAACAAGTTGAAGTTCCTTGGCCTT TCTGGGAACAATCTCACTGGCCAGATACCGAGAGAGCTTGGCCAGCTTTCTTCCCTGGAG ATTATGATTCTTGGTTACAATGAGTTTGAAGGTAAAATCCCTGCAGAGTTTGGAAATCTT ACCAGTCTGAGGTATCTTGATTCGGCGGTTGGCAATCTTGGTGGGGAGATTCCAGCTGAA TTGGGGAGGCTTAAGCTTCTGGAGACATTGTTCTTGTTTAAGAACAATTTTGAAGGAAAG ATTCCACCAGAAATCGGCAACATTGACTCCTTACAATTTCTGGATCTATCAGACAACATG TTATCTCAGGAAATTCCAGCTGAGATTGCTAAGCTGAAGAATTTACAGCTCTTGAATCTG 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AAGTATGATAAGATCCAAGTATTTCTTCACATGCTTACTGGTCCAGTCATACAATCCTGC AATCCAACTTCGATATTACATGCATCAGCAACTTTCAAGAACCACGATTATTTCTAAAAA CTCAGGATCATAACACGACTCGATTTAATCAGTTAGATCAGGATTTCGACAGCTATGTTA CTTTAAAATAAACTAACATAAAACTATGTCCTATTGCAGCAAGATCTCCATTTCAGATTG CTAGTCCTGATTTCTAAAGCAAAAAGCTAGACACAGAACCCATAACTGTCAAACTAAGCA CTTGAGTGAAGAAACAATGAACCGTGAATCCCGAATATTGATAAGCAAATGCACGAGATC ACAAAATTTATTTATTTAAAAAAAAAAAAAAGTATCAAAATGGGTTTTTATCATGCCAGT GCAAAACCCTATAATAAGACACCACAACCATGTATGACAATTTTTCAAGCAATCAATTCT TAATAACACTTAATCCATTCCAAGCGAACCAAAAATAATTTGGATTCCAAACCTAGGGTG ATATCCATTATCCATTATAGTCGGCAACAACTCTCTTCTACATATAGATGGCAACAAAAT CCTCCCTTGTCAACTTTATAAGGCCATCAAAATTATGAGAAGAATACATCTACTATAAGT TTCCTATTCTGCTTATTTCGATAAACCCATCTTTCTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAGAAA AAAAAGGAAAAAAATCCGGGATGTTTTATTAAACACAACAAAAC
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>LITCHI020723.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTTAAATTTTAAAGGAAATTTTATAATTATAATAAAATAAGTTAAAAATATATTTTATAT TTCTACTTATTATCTATCACTATTACTATTAATAAGGTTAAAATAGGTAATTTACATTGT AAGGGTAATATAATAACTTCGTAAAAAAGATAAAAAGTAAAAACTTGTTCACAATTTGAT TCTTTGGGCTCACTCATTCAGAATTATGTAAGCACTTCTTCAAAGCAAAGTTAATTATCA AATCAAGATGGAAATGTATCTTATATCTTTGAACCACCGAGGAATTCATTTTGATATTGA TTTTTGCTTTTGCAAGACTTTATGAGTATGTACTAACTATTAAGGAAGTAAATATTTAAT TGGTAAAAACGTAAAGTAAATTTATATAGAAAGCAATTCATTTGATACATTATTAGTTTA AAGTTTTTATTAAAAATTTAAACTTTAGAAGTAAATATCCATAATTTTCCGCCAAATATT TAATCAATATCAACATTATTCTTGGTATATCCGTAAATTTGAAGGTCTATATCGATACCG ATGGTTAAAACCTTGATATGGTGGAAAAGAATAGGAAATATTTACAATTGTTTTTGGTTC TCTTTATGATTGGTAAGAAAACCAAACAACGATATGCCAAAAGCATAGCTTGTGCCAAGA TTCGATCAAACTGTTACATCAGATAAGAATTTTTACATGTTTAATTAATTTAATAAATTG ATGTCAATTATCTAAACAATTCAGTGTAATGTTATCCATATCATCATCAAGCAATAGAAG GGTGACACCAGTCCAGTGGGCGGTGGACACTACTTTGTAGGGACGTTGTTGGTTGTCGAC TTAGGATTTTCATGGTCATTTTGACCTATCACTGCCTAGCATCACTTTCATGCTTCAGCT TTACCATGCATGGACGTCTCTTCAATATCATCAATTCGGTTTCTATTTTATTCTTCCAAT GCCTTTCAAACTCTATATCATTTCGACCCTCGCTGCTCCACGAAAACACGTCTGCATTTC TCTGCTTTATCCTTCAATTTGTTGAAAAAAATGCAAGCATGAATCATGATATTCATATTC CACACTTTCCATCATACATGTTCTTGAGTTGAGAGTTAATTTTACCTGCTTCGAGGTTCA TGGATGTTTGGCACAAAACCGTCTCTTATAGTCTTTTATGCCCACATGGTCCAGTCCACA AATTCTTTTTTAATCAAACTCATTTTTGGTCCTCGATGCCATAATAAGCTTCAAAGAAAT CCAAAAAGTGCATCAAATATTTTACTTTATTTTTGGAAGTAGAAAGGCCACCCACCTCCT TCTGTAATTGACGCTGATCAAGACTTTTAAAAATTAATCTATACGTCTTTTTGAAAAAAA AAAAAAAAAAACTTATCAAATTTTACACATAAAATTGTTGGACCCAAACAAATAAACTTT TTATGCTATGTAATGAAAGAATGTATCCGAAGATTCAGAACAATATTTGTACACACTAAA GTGATGTATTTTGTGCATCCATAAGTACATGAATCGAATCTCAACCTCTTATTTTCCATA AATCAAGATAAGGTACAAGATATAGAGTGCATGTCTTGTCTAATCACATGCATGATTGGA TTTATATGCCTATTAAAACAAAACGAACGCAGGTTTGAAGCCCAAGAAACTAGTCTCAAG TATAGTTAACAGTGTTGGTTATGATCACTGATCACCACCGGCCATTGATATTTTGAAAAC AGATAGCCATCTCTTTAGCGAATGGAATCAAGCCCAAGGTTAGGTGGTTTAACCCAAACA GCTGGAGTCTGTATAAATATATATATACACAATACCTTTGTAGCCCCCAAGAATCCTGTC CATGAACAGCTTTCAAATATTCTTATTTTACACCATTTTCTTATGGATCCAAAATATTCA CCACCCCACTCTTAAAGTGATAAAAAGCTCCTTATATTTTTAATAGTCCTGCAAGTTTTT GAACCGAGTGAATATAGAGC
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>LITCHI020723.m1 GenomeSequence - GTGCATCCATAAGTACATGAATCGAATCTCAACCTCTTATTTTCCATAAATCAAGATAAG GTACAAGATATAGAGTGCATGTCTTGTCTAATCACATGCATGATTGGATTTATATGCCTA TTAAAACAAAACGAACGCAGGTTTGAAGCCCAAGAAACTAGTCTCAAGTATAGTTAACAG TGTTGGTTATGATCACTGATCACCACCGGCCATTGATATTTTGAAAACAGATAGCCATCT CTTTAGCGAATGGAATCAAGCCCAAGGTTAGGTGGTTTAACCCAAACAGCTGGAGTCTGT ATAAATATATATATACACAATACCTTTGTAGCCCCCAAGAATCCTGTCCATGAACAGCTT TCAAATATTCTTATTTTACACCATTTTCTTATGGATCCAAAATATTCACCACCCCACTCT TAAAGTGATAAAAAGCTCCTTATATTTTTAATAGTCCTGCAAGTTTTTGAACCGAGTGAA TATAGAGCATGGCAATTACTCTGGTCAGTGTGCTCTACTACTTCAGAGCTGTCGTCTTAT TCATCTTGGTCGTACTATTTGTCCCTATATTTGGACAGAAGTTGTTGAGCTGCGATACTA GCTCCTCCCTAGAGGCCTCAGGATATCATTGTAGTAGTAGCGGAGCTGGTTCACAGGATC AGTGTGACACATTTGCAATTCTTCGTACAAACTCCTACTATTTTTCTCTTTTCAATCTCA GCTTTTACTTGGGCCTGAACCGGTTTGTCATTGCTGAGGCCAATGGTTTCTCTGCTGAAA CTGAGTTTCTTCCAAAGGATCAGCCTCTGTTGATCCCTATTGATTGCAAGTGCAATGGTG GGTTCTTCCAGGCTGATTTAACTAAGACAACTGTCAAAGGAGAGAGCTTTTTGAGCATTG TTGAGTCACTCGAAGGCTTGACAAGTTGCAAAGCTATTCAAGACAAGAACCCAAGTGTTT CACCTTGGAATCTTGTTGATAAGCTTCACTTACAAGTTCCACTAAGATGTGCCTGTCCAC CTTCAACTGAGAATCTCCCACAGACCAGGCTCTTGCTGTCTTATCCGGTAAGTGAAGGCG ATACTGTCTTTAACTTAGCCACTAAATTCAACACCACACCAGAAGCTATAATTTCTGCAA ATAACAAGTCTTCATCTGAAACCAGATTCAAACCTGAAAGCCTGCTACCTTTCACTTCTC TTTTGATTCCCCTTAATGGTGAGCCTACTCTTGGCTCCCTCTCCAAACCCAGTGAACCAA ATTTGCATTTTCCAACACGTGGTAGCATCCCAGCAATTAGTACTCCAACAAAGAAGAAGT CAAAGATGATGAAAGTGGGAGCCTATATTGCTCTCAGTGGAGTTGTCGTTGGTGGGTGCA TTGCTATTGCAGCTGCCGTGGCCATAATCCTATTGAAGAAGAAGAAGAAACAGGTGCCAA TCAAGCATCAGAGTGGAGATTTGGAGCTCCAACAGCTTAGTCAAAGTGTAAGAACAACAA GTGATAAAAAAGTCTCTTTTGAGGGATCACAGTGCACTCTTGACAGCCAAATCATTTACA CTTCTGCCCCTCAGAAAATGCTGTTGGAGAGTTATGCTATCGAGGAGCTGAGAAGAGCAA CTGAAGATTTCAATTCTAGTAACCAAATAGAAGGAGCAGTGTATCATGGTCGTTTAAGTG GCAAGAACTTGGCCATCAAACGAATACTACCAGCAACCATCTCAAAGCTTGACGTGCGGC TTTTCCAGACTGCAACTCACCATCATCCAAACATAATCAAGCTTCTGGGGACATGTATGA CTGATGGCCCTCGCTCATTTCTGGTGTTTGAGTATGCTAAAAACGGGTCCTTGAAGGACT GGCTTCATGGTGGATTGGCAATGAAGAACCAGTTCATTGCCTCCTGCTACTGTTTCTTGA CGTGGGGTCAGAGGTTAAGAATCTGTCTAGATGTGGCCATGGCTTTACAGTACATGCACC ATGTCATGAATCCAAGCTATGTTCATAGGAACATAAAGAGCCGGAACATCTTCCTGGATG AAGAATTCAGTGCTAAGGTTGGGAATTTCGGCATGGCGAAATGTGTTGAGGATGATACTG AGAATCCACAGTTCTATTCAACCAATCCTGCTACTTGGAGCTTGGGGTATTTGGCTCCTG AATACATTCATGAACGAGTAATAGACCCAAGGATTGACATTTTCGCTTATGGGGTGGTTT TGTTGGAGGTTTTATCAGGGCAGACCCCAATAAACAGGCCTAAAAAGAAGGAAGTAGGGA GTGTTTGGCTTTCAGAGAAAATCAGGTGCATATTGCAATCAGAAAATGCAGATGATGAGC TAAGGGACTGGATGGACAATGCATTGGGAGACAACTATTCATTTGATGCTGCTGTCACGT TGGCCAACATTGCAAAAGCTTGTGTAGAGGAAAATCCTGAAATGAGACCAACTGCTGGTG AGATTGTGGAGAAGTTATCAAGATTGGTGGAAGAATTACCACAAGGTGAGCATATATCAA TCTGTGAGAGTTATTCAAAACCTCTAGTGAAGGCATCTGCAACCAAACAACATTAAGTCT ATGAACATTTTATTATAAAATTAGAGCCAGTAAATTAAAAATCTAGTTTGTGTGCTACTT TTTATTGTGTTTTAGAGTTAATTATCTATAATTAGGCTATTAGTCTTGGCCTCTTGAACA GGGTAGTGGGATCCTGTATATATGTAATTAAGAAAATGTTTTTGGACATGGAAGAGCAGG TTTCTACTTTGTATTTTCTCTCTGTTTTCAGGAAAGAATAAATAATATAATGTTGATACC AAG
