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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI019205 | Chr15 | 14008692 | 14010865 | - | Scarecrow-like protein 23 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI019205.m1 | 69 | 428 | PF03514.17 | GRAS | Family | 382 | 3.00E-114 |
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>LITCHI019205.m1 ATGCTTCAGAGCTTAGTCCCACAATCTTCAATAAATTCTACTGCCTCCTCCGCCATGAAA ACCAAGCGCCTCGACCGGGAAAGCGACGACGCCAGCGACGATCGTTCCAGCAAACGCCCC AAGGAGACTCAGGAGGAGCAGGTGCAAGTCGTGGAAGAGCAAGCGGTGGTGATGGAAGGA GAATCGACGGGACTGAGACTCCTAGGGTTGTTGCTTCAATGCGCCGAGTGCGTCGCCATG GACAATCTCGATGACGCCACCGAGCTCTTGCCAGAGATCTCCGAGCTGTCGTCTCCGTAC GGGTCGTCTCCGGAGCGCGTCGGAGCGTACTTCGGGCACGCGCTCCAGGCGCGCGTGGTG AGCTCCTGTTTGGGTAGCTACTCGCCTCTTACGACGAAGTCGCTGACTCTGTCTCAGTCT CAGAAGATCTTCAACGCTTTGCAATCCTACAATTCCATCTGTCCGTTGATCAAGTTCTCT CACTTCACCGCCAATCAAGCCATTTTTCAAGCGTTGGAAGGCGAGGATTGCGTCCACGTC ATCGATCTGGATATCATGCAAGGCCTTCAATGGCCGGGATTGTTCCACATCCTCGCCTCC CGGTCTAAAAAGATCCGGTCCATGAGAGTAACCGGGTTCGGTTCGTCGTCAGAGCTACTC GAATCGACAGGCAGACGACTGGCCGACTTCGCTACCTCGCTCGGGCTGCCATTCGAGTTT CAACCACTGGAGGGCAAAATAGGAAATGTGAGGGATTTGAGTCAACTCGGGGTGAAACCG AATGAGGCTATAGTCGTACATTGGATGCATCATTGTTTATACGACATAACGGGGAGCGAT TTGGGGACGTTGAGATTGTTGACTTTGTTGAGGCCGAAATTGATCACGACCGTTGAACAG GATTTGAGTCATGCGGGTAGTTTTTTGGGTAGGTTCGTGGAGGCCTTGCATTATTATAGT GCTATGTTTGATGCGCTGGGAGACAAATTAGGTGCGGACAGTGTGGAGAGGCATACGGTG GAGCAGCAGCTGTTCGGTTGTGAGATTAGAAATATAGTGGCAGTCGGTGGGCCCAAAAGG ACGGGTGAAGTGAAAGTGGAGAGATGGGGTGATGAGTTGAGACGGGTCGGGTTTAAACCC GTTTCGCTTAGTGGTAACCCGGCTGCGCAAGCCAGTTTGTTACTAAGTATGTTCCCTTGG AAAGGGTATACACTGGTGGAGGAAAATGGGTGTTTAAAATTGGGTTGGAAAGATTTGTCT TTGTTGACTGCCTCTGCTTGGCAGCCGTCCGATTAA
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>LITCHI019205.m1 MLQSLVPQSSINSTASSAMKTKRLDRESDDASDDRSSKRPKETQEEQVQVVEEQAVVMEG ESTGLRLLGLLLQCAECVAMDNLDDATELLPEISELSSPYGSSPERVGAYFGHALQARVV SSCLGSYSPLTTKSLTLSQSQKIFNALQSYNSICPLIKFSHFTANQAIFQALEGEDCVHV IDLDIMQGLQWPGLFHILASRSKKIRSMRVTGFGSSSELLESTGRRLADFATSLGLPFEF QPLEGKIGNVRDLSQLGVKPNEAIVVHWMHHCLYDITGSDLGTLRLLTLLRPKLITTVEQ DLSHAGSFLGRFVEALHYYSAMFDALGDKLGADSVERHTVEQQLFGCEIRNIVAVGGPKR TGEVKVERWGDELRRVGFKPVSLSGNPAAQASLLLSMFPWKGYTLVEENGCLKLGWKDLS LLTASAWQPSD.
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>LITCHI019205.m1 TCATGCAAGCGAAAATAGAAGTAGAGATATCCATGTCCTAAAGACAAAATTTGATCCCAA ATAACAAAATCCAAAGATGACGTGATTAATGAAGATTAATTAATAATCAAAGCAGCCTTA ATCCAACGTTTAGCGATAATGAAACGGAGTTAACGACAGAAGTAAACGGAGTTACCTAAC AAGGAATCCACATCGCTTTCTCTGTGGTCAATCATCGTCATCTCTTTAATTGCAAAAAGG TAGTCCAACTTTTCCTCCAATTTTCCCTCAATTTCTCTCTCCCCAAACACAGCAACCGAT TCTTCATTTTCTGACACCTCTCTGCGCTCAACTTTCCTTTCCCGTACCTTCGAGTTTTGT CCATTTTCTGCCCGAACCTCTTCGCTTTTCGAATCTCAATCTCTTCTCTCTGTCAATTTC TCGCTATCAATTATCATGCTTCAGAGCTTAGTCCCACAATCTTCAATAAATTCTACTGCC TCCTCCGCCATGAAAACCAAGCGCCTCGACCGGGAAAGCGACGACGCCAGCGACGATCGT TCCAGCAAACGCCCCAAGGAGACTCAGGAGGAGCAGGTGCAAGTCGTGGAAGAGCAAGCG GTGGTGATGGAAGGAGAATCGACGGGACTGAGACTCCTAGGGTTGTTGCTTCAATGCGCC GAGTGCGTCGCCATGGACAATCTCGATGACGCCACCGAGCTCTTGCCAGAGATCTCCGAG CTGTCGTCTCCGTACGGGTCGTCTCCGGAGCGCGTCGGAGCGTACTTCGGGCACGCGCTC CAGGCGCGCGTGGTGAGCTCCTGTTTGGGTAGCTACTCGCCTCTTACGACGAAGTCGCTG ACTCTGTCTCAGTCTCAGAAGATCTTCAACGCTTTGCAATCCTACAATTCCATCTGTCCG TTGATCAAGTTCTCTCACTTCACCGCCAATCAAGCCATTTTTCAAGCGTTGGAAGGCGAG GATTGCGTCCACGTCATCGATCTGGATATCATGCAAGGCCTTCAATGGCCGGGATTGTTC CACATCCTCGCCTCCCGGTCTAAAAAGATCCGGTCCATGAGAGTAACCGGGTTCGGTTCG TCGTCAGAGCTACTCGAATCGACAGGCAGACGACTGGCCGACTTCGCTACCTCGCTCGGG CTGCCATTCGAGTTTCAACCACTGGAGGGCAAAATAGGAAATGTGAGGGATTTGAGTCAA CTCGGGGTGAAACCGAATGAGGCTATAGTCGTACATTGGATGCATCATTGTTTATACGAC ATAACGGGGAGCGATTTGGGGACGTTGAGATTGTTGACTTTGTTGAGGCCGAAATTGATC ACGACCGTTGAACAGGATTTGAGTCATGCGGGTAGTTTTTTGGGTAGGTTCGTGGAGGCC TTGCATTATTATAGTGCTATGTTTGATGCGCTGGGAGACAAATTAGGTGCGGACAGTGTG GAGAGGCATACGGTGGAGCAGCAGCTGTTCGGTTGTGAGATTAGAAATATAGTGGCAGTC GGTGGGCCCAAAAGGACGGGTGAAGTGAAAGTGGAGAGATGGGGTGATGAGTTGAGACGG GTCGGGTTTAAACCCGTTTCGCTTAGTGGTAACCCGGCTGCGCAAGCCAGTTTGTTACTA AGTATGTTCCCTTGGAAAGGGTATACACTGGTGGAGGAAAATGGGTGTTTAAAATTGGGT TGGAAAGATTTGTCTTTGTTGACTGCCTCTGCTTGGCAGCCGTCCGATTAAATGTCTTCC ATCAAAATTATGGGGACAACTAAAACAACGACTCATAACAAAACAGATAAAAGGGACGGC ATTTACTATCCTGTCAGTCTGATTTGTATATGCTTATTGTTTCAAGTCAAGTCACTAAAA TTCTTCAATATATTCCTTTTTTTTTCTCTCGCTTTCTCTCTATATTCAATTTGAATCATG TATGCTTAGTAAAACACAATTCTATGACGCTTTTAGGTTCTCAATAGGAGTCTTACGTGA AGTAATTAGAGCAGTTTTGTTTTAGGGTTTTTTATTTTTTATTTTTTATTTTTTTAAATT ATTGAGATATAAACATTTATTAGTTTTTGTGGGAGATTTCTCTCCTCATTGTTGAAGTAG ATTTACAACTTTTATTTTATATTTATGATTGAATATTGAGTTCTATTATACATATTTATT AGTTTAGCTGTGAG
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>LITCHI019205.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTTTTAAGAGCTGAAAATTGATTAAAAATAATTAAAATTTCGTTTTGAATTAAAAATGAA TAATTTCTTTTTGTGTAAAAATTGAAATTTTACTATTTTAAAATCATTTTTTAGTAATCT ATGAAATTAATTTTATTCCAATGAATTGCAAAATAAGTAATACTACACTATCCAATGTTT TATCCAAATTTATTACTTAAATGATATGATAAGTTTATGTGTAAATATCACATCATTAAT ACATCATCTTATAATTAATGTAATTATTACAAATCATTTTGTTACATCATTTTAGGCAAA AATTTTAGATAAATTTTTGAAAAACCTAACATTATTCTTATAAAATACTGTGAATTTGAA ATAATTAAGTGAACTACCAGATTCGACAAATATTAAATATACAATATTTTTATTATATAA ATGAATAAATATATAAAATCACACAAATTATGTGAGGTTGAACTTGAATAACCCATCCAA ATAAATGAGGACGAGGTGGGGGTACCCTAAACCGGATGGGACACACCACCCTTGGCCTCG AGCGGTCTACTATTCTAAAGTTTCAAAAAAATTAAAAAAGAAACTATTCTAATTATTTTT TTCTATATTTTAATGTCAACATATTTGTTTCTATGCAAATGACTACATGTGAAAGGACAC TGACACCCTTCCAAATTCTGTTTTTATTTGGGAGAGAAGGAATTTAATGCAACATCTTAT ATTTTAGTTGAAAGTCATGACAACACATATGTTGAGACGACTTTCCAACTTTAAGTCCTC AACTGTAAAAGATAAAAGACGCCATCATACAAAAACGGATTTTATTTATGTAATTATAAG ATAATTAAATATTCACTAAGATCAATGGTAAGAAATCTAACAATATCTGTCAAGATGAAA GACTATCAAGTATGTGGTTGGCTCTAAAATTTCAACACTATTATATGTGTGGCTAGCTCA AAAATTTACTTTTATAATACCTATTGCTGAGACGAAAACTACACGTGGGAACTAACATAA AAATTTAGTCTTATATAACTTGAACATGTTTAATTTCATAATAAATAGAGACAACCCATT AAATGAATGCTAAATACATAATCTCAGTACACTGTCCATTCATTGTACAATATATTACAA AACTATACTTTTATGATATCATTTTTATAACAAAAAAGTGAAATGTGTAATAAGTTTCAT GCTTAGAAAATAAAATTTATACACCTACCAGTACAAATTAAGAGTATATCAAGATAATAT ATGGGACAACTGTATTTAATACTCCTTAACTTTTATACTTGTTAGCAATTATAGATCTCA GCCCTATTACATATAGGAAGGAAGAATGTACTACATATTTATTTTATGGGTTCAACTATC CTATTAGTTAAGTAATCTTATCCATCAATTACATCTATTGGATTGAAAATGATGGTTATT AAAGTTAATTCAATGGTTATAATTATTGAATAAGGTTATTCAATTAGTAAAGTAATTAAG TCCTTAATGTAATAGTTCATTAGGGTAACAATTTTGTTTATTGTTTTCTATGAAAGATAA AGGAATCATGCAAGCGAAAATAGAAGTAGAGATATCCATGTCCTAAAGACAAAATTTGAT CCCAAATAACAAAATCCAAAGATGACGTGATTAATGAAGATTAATTAATAATCAAAGCAG CCTTAATCCAACGTTTAGCGATAATGAAACGGAGTTAACGACAGAAGTAAACGGAGTTAC CTAACAAGGAATCCACATCGCTTTCTCTGTGGTCAATCATCGTCATCTCTTTAATTGCAA AAAGGTAGTCCAACTTTTCCTCCAATTTTCCCTCAATTTCTCTCTCCCCAAACACAGCAA CCGATTCTTCATTTTCTGACACCTCTCTGCGCTCAACTTTCCTTTCCCGTACCTTCGAGT TTTGTCCATTTTCTGCCCGAACCTCTTCGCTTTTCGAATCTCAATCTCTTCTCTCTGTCA ATTTCTCGCTATCAATTATC
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>LITCHI019205.m1 GenomeSequence - TCATGCAAGCGAAAATAGAAGTAGAGATATCCATGTCCTAAAGACAAAATTTGATCCCAA ATAACAAAATCCAAAGATGACGTGATTAATGAAGATTAATTAATAATCAAAGCAGCCTTA ATCCAACGTTTAGCGATAATGAAACGGAGTTAACGACAGAAGTAAACGGAGTTACCTAAC AAGGAATCCACATCGCTTTCTCTGTGGTCAATCATCGTCATCTCTTTAATTGCAAAAAGG TAGTCCAACTTTTCCTCCAATTTTCCCTCAATTTCTCTCTCCCCAAACACAGCAACCGAT TCTTCATTTTCTGACACCTCTCTGCGCTCAACTTTCCTTTCCCGTACCTTCGAGTTTTGT CCATTTTCTGCCCGAACCTCTTCGCTTTTCGAATCTCAATCTCTTCTCTCTGTCAATTTC TCGCTATCAATTATCATGCTTCAGAGCTTAGTCCCACAATCTTCAATAAATTCTACTGCC TCCTCCGCCATGAAAACCAAGCGCCTCGACCGGGAAAGCGACGACGCCAGCGACGATCGT TCCAGCAAACGCCCCAAGGAGACTCAGGAGGAGCAGGTGCAAGTCGTGGAAGAGCAAGCG GTGGTGATGGAAGGAGAATCGACGGGACTGAGACTCCTAGGGTTGTTGCTTCAATGCGCC GAGTGCGTCGCCATGGACAATCTCGATGACGCCACCGAGCTCTTGCCAGAGATCTCCGAG CTGTCGTCTCCGTACGGGTCGTCTCCGGAGCGCGTCGGAGCGTACTTCGGGCACGCGCTC CAGGCGCGCGTGGTGAGCTCCTGTTTGGGTAGCTACTCGCCTCTTACGACGAAGTCGCTG ACTCTGTCTCAGTCTCAGAAGATCTTCAACGCTTTGCAATCCTACAATTCCATCTGTCCG TTGATCAAGTTCTCTCACTTCACCGCCAATCAAGCCATTTTTCAAGCGTTGGAAGGCGAG GATTGCGTCCACGTCATCGATCTGGATATCATGCAAGGCCTTCAATGGCCGGGATTGTTC CACATCCTCGCCTCCCGGTCTAAAAAGATCCGGTCCATGAGAGTAACCGGGTTCGGTTCG TCGTCAGAGCTACTCGAATCGACAGGCAGACGACTGGCCGACTTCGCTACCTCGCTCGGG CTGCCATTCGAGTTTCAACCACTGGAGGGCAAAATAGGAAATGTGAGGGATTTGAGTCAA CTCGGGGTGAAACCGAATGAGGCTATAGTCGTACATTGGATGCATCATTGTTTATACGAC ATAACGGGGAGCGATTTGGGGACGTTGAGATTGTTGACTTTGTTGAGGCCGAAATTGATC ACGACCGTTGAACAGGATTTGAGTCATGCGGGTAGTTTTTTGGGTAGGTTCGTGGAGGCC TTGCATTATTATAGTGCTATGTTTGATGCGCTGGGAGACAAATTAGGTGCGGACAGTGTG GAGAGGCATACGGTGGAGCAGCAGCTGTTCGGTTGTGAGATTAGAAATATAGTGGCAGTC GGTGGGCCCAAAAGGACGGGTGAAGTGAAAGTGGAGAGATGGGGTGATGAGTTGAGACGG GTCGGGTTTAAACCCGTTTCGCTTAGTGGTAACCCGGCTGCGCAAGCCAGTTTGTTACTA AGTATGTTCCCTTGGAAAGGGTATACACTGGTGGAGGAAAATGGGTGTTTAAAATTGGGT TGGAAAGATTTGTCTTTGTTGACTGCCTCTGCTTGGCAGCCGTCCGATTAAATGTCTTCC ATCAAAATTATGGGGACAACTAAAACAACGACTCATAACAAAACAGATAAAAGGGACGGC ATTTACTATCCTGTCAGTCTGATTTGTATATGCTTATTGTTTCAAGTCAAGTCACTAAAA TTCTTCAATATATTCCTTTTTTTTTCTCTCGCTTTCTCTCTATATTCAATTTGAATCATG TATGCTTAGTAAAACACAATTCTATGACGCTTTTAGGTTCTCAATAGGAGTCTTACGTGA AGTAATTAGAGCAGTTTTGTTTTAGGGTTTTTTATTTTTTATTTTTTATTTTTTTAAATT ATTGAGATATAAACATTTATTAGTTTTTGTGGGAGATTTCTCTCCTCATTGTTGAAGTAG ATTTACAACTTTTATTTTATATTTATGATTGAATATTGAGTTCTATTATACATATTTATT AGTTTAGCTGTGAG