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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI019134 | Chr15 | 13054333 | 13057089 | - | Zinc finger CCCH domain-containing protein 14 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI019134.m1 | 39 | 59 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 14.5 | 0.044 |
LITCHI019134.m1 | 101 | 126 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 27.3 | 2.70E-06 |
LITCHI019134.m1 | 105 | 125 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 14.8 | 0.035 |
LITCHI019134.m1 | 170 | 234 | PF00013.32 | KH_1 | Domain | 43.1 | 2.90E-11 |
LITCHI019134.m1 | 260 | 284 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 35.5 | 7.20E-09 |
LITCHI019134.m1 | 263 | 284 | PF18044.4 | zf-CCCH_4 | Domain | 27.8 | 1.60E-06 |
LITCHI019134.m1 | 265 | 284 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 16.1 | 0.013 |
LITCHI019134.m2 | 31 | 56 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 27.8 | 1.90E-06 |
LITCHI019134.m2 | 35 | 55 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 15.3 | 0.025 |
LITCHI019134.m2 | 100 | 164 | PF00013.32 | KH_1 | Domain | 43.8 | 1.80E-11 |
LITCHI019134.m2 | 190 | 214 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 36 | 5.00E-09 |
LITCHI019134.m2 | 193 | 214 | PF18044.4 | zf-CCCH_4 | Domain | 28.3 | 1.10E-06 |
LITCHI019134.m2 | 195 | 214 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 16.6 | 0.0094 |
LITCHI019134.m3 | 31 | 56 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 27.8 | 1.90E-06 |
LITCHI019134.m3 | 35 | 55 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 15.3 | 0.025 |
LITCHI019134.m3 | 100 | 164 | PF00013.32 | KH_1 | Domain | 43.8 | 1.80E-11 |
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>LITCHI019134.m1 ATTAATAAAAACCAAATTATTAGTAGGTTGTATTAATATCTGGTGTCTCTGATTTTCAGT GTCAGCTTCTCTTGCTCTCATTGTCGCATCCATAAACCCTTCTATTAGGGTTAGGGTTTT TGCTCTCTACTCTCTACTACACGAAAGCTCTCTTCTTTTCATCAAATACCTAAAGATTCA TACACTTTTATTCCAAAATTTTGGTCTGCGTTGAGACTCGAGTTGTCTTTCTTCGTTGCC TTGGTTGGATCTGGATCTAATGGATACGAGAAAGAGAGGCAAATCTGAATCTACTTTCAA CGTTAATGGCGCTGTCAAGAAATCCAAGCACGAAACAGATTCTTTATCAACCGGTGTAGG AAGCAAATCGAAGCCATGCACCAAGTTTTACAGCACTGCTGGATGTCCTTTTGGTGAGAG CTGCCATTTCCTGCATTATGTGCCTGGCGGTTATAATGCTGTGGCCCAGATGATGAATTT AGCTCCGGCCATCCCTCCACCGTCTAGAAACATGGGTGCGACACCACCCTCTTCGAATGG CTCCTCAGGCTCTGCAGTTAAAACCCGACTTTGCAACAAGTTCAACACTGCGGAAGGTTG CAAGTTTGGTGACAAATGCCATTTTGCACATGGTGAATGGGAACTTGGCAAGCCTATTGT TCCATCTCATGATGAACCACGTCCCATGGGACCTATTCCAGGCCGTGTAAGTGGTCGGAT GGAGCCACCTGCACCTGGACCTGCTGCCAGTTTTGGTGCATCAGCTACTGCAAAAATTAG TGTTGATGCTTCCCTAGCTGGAGCCATAATTGGGAAAGCTGGTGTGAACTCTAAGCAGAT CTGTCGCCAAACAGGGGCCAAGCTGTCCATCCGGGATCATGAGACAGATCCCAATCTCAA GAATATTGAGCTTGAAGGGTCATTTGAACAGATTAAGCAAGCAAGTGCTATGGTAAGAGA 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AATTTCCTTGAAGCCCAAAAAAGAATAACAACTAAGTGCTGGCGTAATTTATCATCAATA GCAGGTATGTTTTGGGTCTGAAAATGAGTTGGAAATCGAGATACTGTCA
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>LITCHI019134.m2 - Up_Stream_Len 2000 AGGTGCCAACTGTCCATTATTAATGGCAAGGTTCGACACTCTGTGTAAGTCAATAAATAA TATGTTCTCTCATCTTATGTGTGGATTACCCTTCACCCTCGTGTGGACCTCTTCTTCTGT TTCATGCGGATAGATTCATTCCATATGGGTGTAGTACCTCGAGTCGTGCCATCAGTATTT TTATCTCGGTAGGTTTTTATAGTTTCTTAGATTAGTTTCAGTCTTAAAAACAAATAATAA GAATAATAAGAATAATAATTATAATAATAACAATGTTCAAATAATAATAATAATAAAACA TTAATAAAAACCAAATTATTAGTAGGTTGTATTAATATCTGGTGTCTCTGATTTTCAGTG TCAGCTTCTCTTGCTCTCATTGTCGCATCCATAAACCCTTCTATTAGGGTTAGGGTTTTT GCTCTCTACTCTCTACTACACGAAAGCTCTCTTCTTTTCATCAAATACCTAAAGATTCAT ACACTTTTATTCCAAAATTTTGGTCTGCGTTGAGACTCGAGTTGTCTTTCTTCGTTGCCT TGGTTGGATCTGGATCTAATGGATACGAGAAAGAGAGGCAAATCTGAATCTACTTTCAAC GTTAATGGCGCTGTCAAGAAATCCAAGCACGGTTCGTCCTTCCACCACTTGTTATCTTAT TTGTTTCAAATATTGTTCGAATAACTTAAAAGACTTTTTTTTTTTTTAAATTTATTTTTA GGGTGAAGTTTGAAAATTTAATTACGTTAGCTTATTCTTCGTATGAGTAACTTTTGTTTG GATTGCTATGTGTACATTTTATGGTTTATAGGTTTCATTGTTGGTTCATTGCCGATGCAC TAACTGCATAGCCAAAGCTATTGTTTTTGTTGAAGAAGCTGATTTTTTTTTTTTTTTTTA ATTCGATAAAAGACTGGAAGGCTAAGTTCAGTGGGGACTAAACAATGGAGTTTGTTGATT GATTAACTAAATTTGAAATAAGTTATCTATTTTCTCTATTACTTAATATATCTTATCAAG ACACACTATTTATTTGTTTATGGTTTGTTAATGGGTATTAATAATTTAGTAACTGAGAGA AATTTCTACTAAGAACAAGTAATTAATGTTTTGGAACAGAAACAGATTCTTTATCAACCG GTGTAGGAAGCAAATCGAAGCCATGCACCAAGTTTTACAGGTTCAAATCTTTGCCCATCT AAATAAATATCTTGAATTTGTATTATCTTTGTTTAATAAATTCTTTGGTAATTGAAATTA TAAGATAAAATTCTGTAAGTGCACTAATGAAGTGGGTATTTTTAGCTGCGATACAGGTAC ATATTTTGGTTTGGTAATAAAGTTAACAGATTGAATGTAACAGAGATTGTGTTACTAAGT ACAAATGATAACGGTCGTTTGGTGGAGTATAATTCGTGCTAAGACAGATATATATATTAT TCATTCTTGTAACCAATATATTCTGTCCCTTACATCTTTTATGATCTCAAAATCTTTTCC CTGTAATGGCAATTAATTGTCACCGCTATTGAACCAAATCTTTTATTGAGAAGTATTAAA GAAGGTAATCTGTCAAAATATGCTGCAATTAAGGTATGATATCGAAATTTTATGGTTACT AGATTGGGGATATCATAGTTTCAGTCTTTCAATTAAAGAAGTGGAGCAAGAACCAAATTT TAGTTTACCTTAATGAACCCTGCTAGTATTCATCATGGAGTCCTTATTCTTTTGTTATAT TGTCTCCGTTGAATCCAAGTCCCTTTGAAAGTTCTCTGGTGGGAGTTTTTTGTTATTTTT GTTTTGGGGGTTAGTGAAGAGGTTAGGAATCCAGATATCTGTTGTTTGCTTAGGGATACT GCTTTCAACTTTGGTTGTTGGAGGGCATTTGCTTTTCTAATTTTCTTATTATTTGCACTT GCAGCACTGCTGGATGTCCTTTTGGTGAGAGCTGCCATTTCCTGCATTATGTGCCTGGCG GTTATAATGCTGTGGCCCAG >LITCHI019134.m3 - 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Up_Stream_Len 2000 TCATGAATAATAGCAATATAATTAGACCAATGTTAGGTTAACAAAATCTTTTTCTAAATT TATATAAGATGATGATGTGATATATAAGTTATGAACGTTATATTATCTTATGAATATAAG ATATTAATAACTCATATGATATATTATTTTGATATAAATCTGAATAAAAATTTTGAAAGA TCTAATATTATTTATATAATAAAGTAGACTTGTAATTCCGTAAATAAATCAAAATTTTGC AGTTTTATTTTATTTTTTTTTTAAATTAGTAAAACATCTTAAATGGATCTAAAATTATGG GCTTATTATTTTAATCTATTCTCAATAGTTTTATTTTTTTAAACATTCACAAGACAAATA TAACCGTAAACTAAATATTATAATCTGGCTAATTTTAAAACCCTACTTATCCTTACTAAA TCAAGTGATACATCGTAATAGGACAATATATTTATAGGATATAAAGAAGTTTAGGTTGTT AAATATCTATATATACAAATGATATAAATTACGAACCGTGTTGATATTAAACCCATTAAG ATACAATAATTTGTCTTATAGTTAATATGGTATTAATTTATTTATGCAAGAATAAAAATA CGACAATATGATTTATTTTATTTATTTATTTTTTTTTGAAGGAACAATGTGATTAATTTT AATATGAGAAGGGGTCATGCAGCTATATAGGTTCAATATAGATACATAATTGAGGCTTAA CACAAATAATGGATGTGAATTATGTTAAAATCCATACAAAGGCCCAACAAAAATGGGCTC CATGAAAAAGCCTAATAACCATCCACAGCAACCAAAGCAACAGTCGACGTTAGCCAAAAA CAGAGGCCGACGTCATCAAAAGTGGGACCACGTGAGTGCGTCCCGCGCCGGGACTCAGGT GACACAATTAACTCAATTTAAGCCTTAATTTGCCTGCTTATTTTTATTTTTTTTTATCTT TTGACATTAAAAGCTACCTTCTTTTTTTTATTATTATTTTTTCTAATGGTTAAGACAAAC TCAAAAATTAATCGAGACCAAGTGAAGTTTGACTTTGTGACGGGGCTATAGGAGTTGCTC TTATATAAAAAAGAGCAACCTACATATAAGTAAGAAGGAGGGACCACATAGAATGAGTAG ACAATTCATACATTTTTTTACGGAGTAACACTAAATTTTTCAAATATTTTGTCTATAGAA TCTTAATGATTCATATGTCACATCATTTAGGTATGAATTTAAATAAAATATTTAAAAAAC CTAACATTATTTATTTATTTATTTTTATGATGGGAGGAAGCTTTATTGAGATGTAAAACT TATGTCTTGGATTAAGAAAGGACAGTGGACTGAGTAACAGCCCACTGACCAACTACTAAA AGTTATCGTTTATTACATAACAATAATGATATATAAAAAAAAAAAATTCGCGCTATTGGC ATAGGTGCCAACTGTCCATTATTAATGGCAAGGTTCGACACTCTGTGTAAGTCAATAAAT AATATGTTCTCTCATCTTATGTGTGGATTACCCTTCACCCTCGTGTGGACCTCTTCTTCT GTTTCATGCGGATAGATTCATTCCATATGGGTGTAGTACCTCGAGTCGTGCCATCAGTAT TTTTATCTCGGTAGGTTTTTATAGTTTCTTAGATTAGTTTCAGTCTTAAAAACAAATAAT AAGAATAATAAGAATAATAATTATAATAATAACAATGTTCAAATAATAATAATAATAAAA CATTAATAAAAACCAAATTATTAGTAGGTTGTATTAATATCTGGTGTCTCTGATTTTCAG TGTCAGCTTCTCTTGCTCTCATTGTCGCATCCATAAACCCTTCTATTAGGGTTAGGGTTT TTGCTCTCTACTCTCTACTACACGAAAGCTCTCTTCTTTTCATCAAATACCTAAAGATTC ATACACTTTTATTCCAAAATTTTGGTCTGCGTTGAGACTCGAGTTGTCTTTCTTCGTTGC CTTGGTTGGATCTGGATCTA
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