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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI019098 | Chr15 | 12644445 | 12646654 | - | Homeobox-leucine zipper protein HAT14 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI019098.m1 | 55 | 131 | PF04618.15 | HD-ZIP_N | Domain | 29.7 | 8.20E-07 |
LITCHI019098.m1 | 176 | 230 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 56.4 | 2.10E-15 |
LITCHI019098.m1 | 232 | 266 | PF02183.21 | HALZ | Coiled-coil | 40.5 | 2.50E-10 |
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>LITCHI019098.m1 ATGGAGTTAGCTTTGAGCCTAGGCGATACGTCAAAGCCGTTTTCTACGTTTCTTGACAAG TCTCCTCCCAAGTTAACGAGCAAAGATTTAGGGTTTTGCATGGGTACTCATGGAAGAACA CAAGATGGGAGAAGAGATGATAAAAGGGTTTCATCGGATCCTCCTGTTCAGCTCGATCTT CTTCCTTTTTCACCTGTTCCTCGTAGTCATCACTCTTCTTCACAGCTTCGCTTTCCATGG CTCACTGATCACTTGGTGGCGTCTGATCATCAACCGGATTCAAGTGGTGGGTCAGGAGGA AGGGGTTTAGATGTGAACCGGTTTCCGTTGGCGGCGGAGGCTGATGAGGGCGCTGCACTC TCTTCTTCTCCCAACAGTGTGGTGTCCTCTTTCCAGATGGACTTCTGCATTAGAAACAAT GGAACTACTACCAGTAGAACCAAAAGAGATTTCGAGGTTGAGATTTCTCATAGTCACGAC AGAGCTAGTTCAAGAGCCAGTGATGATGAGGAAAACGGATTGACTCGGAAGAAACTCAGG CTCTCTAAAGAACAATCTGCTTTTCTTGAAGAAAGCTTCAAAGAACACAACACTCTAAAT CCTAAACAAAAACTTGCTTTGGCCAAACAATTGAATCTTCGTCCTAGACAAGTAGAAGTG TGGTTCCAAAACAGAAGAGCAAGGACAAAGTTGAAGCAGACGGAAGTTGATTGTGAGTAT TTAAAGAGATGTTGTGAGACGCTGACAGAAGAGAACAGGAGGTTACAAAAGGAACTGCAA GAGTTAAGAGCTTTAAAGACTTCTCAACCTTTCTACATGCAGCTACCTGCCACTACTCTC ACCATGTGCCCTTCTTGTGAGCGTGTGGCCACCACCACCACCACCACTTCTTCCCCCGTC ACAACCACGGCGGCCACCACCCCCGCTAATAATGCTATTCCCTTACAAGTAGCTAAGCCT AGGGCGTACCCATTTGCTCATGTGCAAGTGCAACCAAACATGTCTCAGCAGTCTCAAGCC CCCCAACCCGCTTCATGA
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>LITCHI019098.m1 - Up_Stream_Len 2000 TCTTCCTTTTAATATATATTTAAAAATTGAAGGGAAAAGAAGCAAGTATTGAATGAAAAT GTTACAAAATCACATAGTGTGGCTTTTCATGCATTTAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAGAAT GATAAAAGCCAATAAAAAATGTATAATGATTGGTATAATAATACCTAAAAATGCGACATG CGTTTGTTTGCGGTAGCCTAAAGTATAATTTGTAAATGGAGATGGATGGTGATAAAAGGG AGCAAATGAGGAACCAGAGTGGTTGGTGGTGGTGCTAATATGATACTTGAAGAGTGGGTG AAGTTTCATGGAGAAAAAATATCTTTCCCAGGTTAGTTCATATTTATCGTAATGAGTTGG TTAATAAAATAATATTTTTTATTTTTTATATTTTTTTTTTTTATTTTTTTTCTTATATTT TTTTCTTATTTCTTTCATTGATTTGATTCATCAAATCAATAATAATGGGACAGTCTTATG AATGATATCGATTTAATCAAGTGATGGTTACGATGGTCCCACCCAATAATTCATTCAGAT CTCTCTCTCCAACCTATCATTAAAGCCTGCATGACTTCAATTATTGCAATGATCCCAAAA GCATGACATATCTGACCTGGTCACATCCTCTAGATGTGTTTTTTTAATTGCCACTTCCCC ACGCGCGTGGGACCACCTACACAACTTCATTTTTATCACAAATAACACTCCATTGGATAC CCAATTCTGGGTTTTTATTTATTTATTTATTATTCAAGCCTACGCTACCACACCCTAATT TCCTTAAATCACATCTATAAAACAACACTGCCTCTTATATTAATACAAATATAACTTTCC TTGAAATAGTAAGCCATGGTCTCCTTGTCTGCCTATGTAAAATATAATTAATGTTCTAAT TCTGGTCAAATCGCATTGTTATTGCCAATTGTTTTCTATGTTCACAAATCATAATTATAT TTATATATAACCATTAAGAAAAAAAAACCCTAGTTTTAATTTTTTATGTGGGTGTGTTAA AAGTGCACTGTTAGGTTCTGGTTGTTGAGTCAGCGGTCTAAACCATAACCGAGTCCATTC CATTAGAATTGCGATTGCGTCACTTTTTTTTTTTCCCAATTAATTATATGTTAAATAAGT TGGAAACTGCATACAGTTTGATTAAATGGTCATCATTTGAAACGAACAAAACATGTACAG TGGGAGGCAAATAATTGTGTTTGGTAAGAAACACATTAATCACTTCTCATATGATGATGA TAATTATAAGTAAAACAGTTAATGAATAGAAAATAATAATGAAATATCATAAAATTTTAC TGGACGATCTGGGCCGTAAGATGAGTGATGATTTTCTGATGATATTATGATTATGATGAT GAAGGTGATTATTATGATGTGGCCCTGGTTTGGTAAGCATAATAATTTAGTAACACTGGC CAAGTAATAATCACAATTAATTAATAGAATAGCTCCACACCAATCAAGCTATATTAAATA AGTGATTTTGTAGTGGAAAAGCGTTGGCAAGGATTTATGAAGAGAGATATGTTGTTGTTG TTGAAGTAATCAAAGGTAGCACATTGTAATATATAATAAGAAAAGAATTTGAATAATTTT TGACTTGTTAGAGAAAAGAAAAACCTTTCGCGTAGGTAACCTTTTATCAGGTACTACAAG GCAAATGGGTTCCTGACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTGTATGAACCAGTGT ATATTTATATAGATTCACGTGCGTTTGTCAACCTGGTTTTGTCGGTCAATCTAATTTACT CGCACAAGGGAAAATCCATTAATAAAAAGGTGATGTGGGCTGTGGTTGTGTGTGCTTTTA ATTAAAAGATTTTGAATTCGGATTTCATTTTGTTTGAAGTCTCGGGTTTACTAGTCTTCT TTCTTCCAGTACTTGTTTATATCATCCATCAGCCAAACCAATCCAAACCAACACATTTTC AAACCCCAAACAAAGAGAAA
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>LITCHI019098.m1 GenomeSequence - GAGATATGTTGTTGTTGTTGAAGTAATCAAAGGTAGCACATTGTAATATATAATAAGAAA AGAATTTGAATAATTTTTGACTTGTTAGAGAAAAGAAAAACCTTTCGCGTAGGTAACCTT TTATCAGGTACTACAAGGCAAATGGGTTCCTGACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT CGTGTATGAACCAGTGTATATTTATATAGATTCACGTGCGTTTGTCAACCTGGTTTTGTC GGTCAATCTAATTTACTCGCACAAGGGAAAATCCATTAATAAAAAGGTGATGTGGGCTGT GGTTGTGTGTGCTTTTAATTAAAAGATTTTGAATTCGGATTTCATTTTGTTTGAAGTCTC GGGTTTACTAGTCTTCTTTCTTCCAGTACTTGTTTATATCATCCATCAGCCAAACCAATC CAAACCAACACATTTTCAAACCCCAAACAAAGAGAAAATGGAGTTAGCTTTGAGCCTAGG CGATACGTCAAAGCCGTTTTCTACGTTTCTTGACAAGTCTCCTCCCAAGTTAACGAGCAA AGATTTAGGGTTTTGCATGGGTACTCATGGAAGAACACAAGATGGGAGAAGAGATGATAA AAGGGTTTCATCGGATCCTCCTGTTCAGCTCGATCTTCTTCCTTTTTCACCTGTTCCTCG TAGTCATCACTCTTCTTCACAGCTTCGCTTTCCATGGCTCACTGATCACTGTAATAATTT GTTCTCTTCTTCTCTCTCCTTGTTTATATATATATATATTAGCCAACTAGGGAATCTGAT TTTGATATATGCTTTATGATGGTTGTGCAGTGGTGGCGTCTGATCATCAACCGGATTCAA GTGGTGGGTCAGGAGGAAGGGGTTTAGATGTGAACCGGTTTCCGTTGGCGGCGGAGGCTG ATGAGGGCGCTGCACTCTCTTCTTCTCCCAACAGTGTGGTGTCCTCTTTCCAGATGGACT TCTGCATTAGAAACAATGGAACTACTACCAGTAGAACCAAAAGAGATTTCGAGGTTGAGA TTTCTCATAGTCACGACAGAGCTAGTTCAAGAGCCAGTGATGATGAGGAAAACGGATTGA CTCGGAAGAAACTCAGGCTCTCTAAAGAACAATCTGCTTTTCTTGAAGAAAGCTTCAAAG AACACAACACTCTAAATCCTGTAAGTCCATATCTAATTATTATTAGTATTAACATTTTAT TTTTAAAAGCATATATTGATGGTTAACATATCTATACTCGAAAATTTTACAGAAACAAAA ACTTGCTTTGGCCAAACAATTGAATCTTCGTCCTAGACAAGTAGAAGTGTGGTTCCAAAA CAGAAGAGCAAGGTACTTATTATTTTTGTTCCTATTTATCTTCACGTGAACTATATATTA TTATTATTATTCATGATAGTCCAACGGTGCATAGTTGCTTCATTTATTGCACTACCTTTG TGTTTGAATTTTTTTAACCTTCTGTAGGTAGGAATGTTAGATATGGCTGGTTTGGTGTTG TCAATAATTGTATAATTTTTTTTCCCATGTTATTTGAATTATTTGAAAGGAATAATGATG AAGAGAATTGAAAAATATTGAACAGGACAAAGTTGAAGCAGACGGAAGTTGATTGTGAGT ATTTAAAGAGATGTTGTGAGACGCTGACAGAAGAGAACAGGAGGTTACAAAAGGAACTGC AAGAGTTAAGAGCTTTAAAGACTTCTCAACCTTTCTACATGCAGCTACCTGCCACTACTC TCACCATGTGCCCTTCTTGTGAGCGTGTGGCCACCACCACCACCACCACTTCTTCCCCCG TCACAACCACGGCGGCCACCACCCCCGCTAATAATGCTATTCCCTTACAAGTAGCTAAGC CTAGGGCGTACCCATTTGCTCATGTGCAAGTGCAACCAAACATGTCTCAGCAGTCTCAAG CCCCCCAACCCGCTTCATGAACAATATCCAGTAACTGATAAAATATTTATTTAATTAAAT GCTTTTCAATACAAATATGTACTACTCCCTTATTTCCATTATCTGTATATTTTTGGCGTG AAGATTTTCTTCGTTATTTCTCTAGTATTAGAAGTTTCTTGTAATGGGAAAGGGAGAGAA ATTACAAGAGTTAATATATATTTTGTTGACTAACCTATATATCAGAAATTAAGTGGAAGA ATTTTTTGTTCGAAGATCTGCGTTATATTTATATATTTTCTATTTGACAA