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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI019055 | Chr15 | 12095743 | 12098442 | + | Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 7b |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI019055.m1 | 4 | 149 | PF05983.14 | Med7 | Family | 145 | 3.10E-42 |
LITCHI019055.m2 | 4 | 158 | PF05983.14 | Med7 | Family | 149.3 | 1.50E-43 |
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>LITCHI018409.m2 ATGAAGGAGAGACAGCGTTGGAGAGCTGAAGAGGATGCTTTGTTACGTGCTTATGTGAAA CAATATGGTCCAAGAGAGTGGAATCTTGTGTCACAGCGCATGAACACACCCCTAAACAGG GATGCGAAATCCTGCTTAGAAAGGTGGAAGAACTACCTCAAACCAGGCATCAAGAAGGGA TCCCTTACCGAAGAGGAGCAGCGTCTTGTCATTCGTTTGCAAGCCAAACACGGCAACAAG TGGAAGAAAATTGCAGCCGAAGTACCTGGCCGCACTGCTAAGAGATTGGGCAAGTGGTGG GAAGTGTTCAAAGAGAAGCAGCAGAGGGAACAGAAGGAGAGTCACAGAACAGTTGATCCA GTTGAGGAGCGCAGGTACGATCAGATTCTAGAGACTTTCGCGGAGAAGCTAGTGAAAGAG CGGTCATTTGTCATGGCTACATCCAATGGAGGCTTTCTTCACACTGACCCCCCTACACCA CCAACTCTGCTTCCACCATGGCTTTCTAATTCCAATGGAGCCTCAACAATCAGGCCTCCA TCGCCATCTATAACCCTGAGTCTCTCTCCCTCGACAGTGGCAGCAACTCCTCCAATTCCG TGGCTGCAGCCTGAGAGAGGCCCTGATAATGCCCCTCTCGTTCTCGGAAACATGCCACCT CATGGATCAGTCCCTACTTGTGGAGAGAACCTTATGATGTCAGAGTTGATGGACTGCTGC AGAGAGTTGGACGAAGGCCACCGCGCTTGGGCAGCTCATAAGAAGGAAGCAGCCTGGAGG TTGAGAAGGGTAGAGTTGCAGCTGGAGTCCGAGAAAGCTTGCCGGAGGAGGGAGAAAATG GAAGAGATCGAGGCTAAGATGAAAGCACTTAGGGAAGAGCAGAAGGCTTCATTGGATCGG ATCGAAGCAGAATACAGGGAGCAGATAGCTGGATTGAGGAGGGATGCAGAAGCTAAGGAG CAAAAACTGGCTGAACAATGGGCTGCGAAGCACTTGCGACTTACTAAGTTTCTGGAGCAG ATGGGGTGCAGACCAAGGCTCTCCGAGTCGAATGGCAGGTGA >LITCHI018409.m3 ATGAAGGAGAGACAGCGTTGGAGAGCTGAAGAGGATGCTTTGTTACGTGCTTATGTGAAA CAATATGGTCCAAGAGAGTGGAATCTTGTGTCACAGCGCATGAACACACCCCTAAACAGG GATGCGAAATCCTGCTTAGAAAGGTGGAAGAACTACCTCAAACCAGGCATCAAGAAGGGA TCCCTTACCGAAGAGGAGCAGCGTCTTGTCATTCGTTTGCAAGCCAAACACGGCAACAAG TGGAAGAAAATTGCAGCCGAAGTACCTGGCCGCACTGCTAAGAGATTGGGCAAGTGGTGG GAAGTGTTCAAAGAGAAGCAGCAGAGGGAACAGAAGGAGAGTCACAGAACAGTTGATCCA GTTGAGGAGCGCAGGTACGATCAGATTCTAGAGACTTTCGCGGAGAAGCTAGTGAAAGAG CGGTCATTTGTCATGGCTACATCCAATGGAGGCTTTCTTCACACTGACCCCCCTACACCA CCAACTCTGCTTCCACCATGGCTTTCTAATTCCAATGGAGCCTCAACAATCAGGCCTCCA TCGCCATCTATAACCCTGAGTCTCTCTCCCTCGACAGTGGCAGCAACTCCTCCAATTCCG TGGCTGCAGCCTGAGAGAGGCCCTGATAATGCCCCTCTCGTTCTCGGAAACATGCCACCT CATGGATCAGTCCCTACTTGTGGAGAGAACCTTATGATGTCAGAGTTGATGGACTGCTGC AGAGAGTTGGACGAAGGCCACCGCGCTTGGGCAGCTCATAAGAAGGAAGCAGCCTGGAGG TTGAGAAGGGTAGAGTTGCAGCTGGAGTCCGAGAAAGCTTGCCGGAGGAGGGAGAAAATG GAAGAGATCGAGGCTAAGATGAAAGCACTTAGGGAAGAGCAGAAGGCTTCATTGGATCGG ATCGAAGCAGAATACAGGGAGCAGATAGCTGGATTGAGGAGGGATGCAGAAGCTAAGGAG CAAAAACTGGCTGAACAATGGGCTGCGAAGCACTTGCGACTTACTAAGTTTCTGGAGCAG ATGGGGTGCAGACCAAGGCTCTCCGAGTCGAATGGCAGGTGA >LITCHI019292.m1 ATGTTCTCTTCCACCTCCAGCGTCACCCCTTTTACAATTTCTTCTTTCCACCATTTCCCT TCTCCATTTTCTGGGTTTGACGCCAACAATGTCTTCCTCAATAATCAGCTGCATGATCCA TTCACAAGTGTTGTTTCAACCAATCCTCGGATTGCTGAGTCTTTGACCAGCATGGCGCTT TTAGAAAATACTACTACCATGACTAACGGTGATCAGTACTATGGTCATTCAAATTCGATC ACGAACAAGAAGCCGGCAGCGCCAGCGAAGAAGGATCGACACAGCAAAATTTGCACCGCC CAAGGCCTAAGAGATCGGAGAGTGAGACTCTCCATTGACATAGCTCGAGAGTTCTTTGAT CTCCAGGACATGCTAGGGTTTGATAAAGCAAGCAAAACCCTTGAGTGGCTGCTCTCTAAA TCAAGAAAGGCCATAAGGGAGCTAGTAGAGAATAGAAATGAAGCAGCCAAGTGCTTGTAT TCATCAATTTCTGATCATGGCACTGCTGTTTCAAAAACCAAGTCATCATCAGGATATGAG AAAGAGATGGAAAACCATAATAAAAATGATGCATTTCTAGTACACCCTGAAAAAGAGTCC AGAAGCAAAGCAAGAGCAAGAGCAAGACAAAGGACTAGAGAAAAGATGTGCACCAGAAAA GTACTCCACGATAGGAAGAAAAAGGGTCTTAACGCAAGCTCTCAAATCTTGACCCACTTA ATCAAAGCATGTGCAGAACCCAATTCATCAAATGACCAGTACTTTGCTTGTGATATTCAA ATCAAAGATCCCAGCAGCTCTCCACCTCTTGCCAATCAAGCTAGTGAGGAATCCTCTATG CTAAAAAGGAAATGGAACCCATGTTCAGTTTTCACTCATCAGCAACATCTTGGAATATCA AAAGATATAAGCGGAAACAGCAATTGCTTTTCCAGTTTACCTCAAAATTGGGACACTACT GATGGTGCAATTCTCATTACCAACATGAATATGCCGACAACAGGTCTTCAAAGCTGTGGC AGACCCTGGGAGACCCCCAACAGCCAATGTCAACACTAA
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>LITCHI018409.m2 MKERQRWRAEEDALLRAYVKQYGPREWNLVSQRMNTPLNRDAKSCLERWKNYLKPGIKKG SLTEEEQRLVIRLQAKHGNKWKKIAAEVPGRTAKRLGKWWEVFKEKQQREQKESHRTVDP VEERRYDQILETFAEKLVKERSFVMATSNGGFLHTDPPTPPTLLPPWLSNSNGASTIRPP SPSITLSLSPSTVAATPPIPWLQPERGPDNAPLVLGNMPPHGSVPTCGENLMMSELMDCC RELDEGHRAWAAHKKEAAWRLRRVELQLESEKACRRREKMEEIEAKMKALREEQKASLDR IEAEYREQIAGLRRDAEAKEQKLAEQWAAKHLRLTKFLEQMGCRPRLSESNGR. >LITCHI018409.m3 MKERQRWRAEEDALLRAYVKQYGPREWNLVSQRMNTPLNRDAKSCLERWKNYLKPGIKKG SLTEEEQRLVIRLQAKHGNKWKKIAAEVPGRTAKRLGKWWEVFKEKQQREQKESHRTVDP VEERRYDQILETFAEKLVKERSFVMATSNGGFLHTDPPTPPTLLPPWLSNSNGASTIRPP SPSITLSLSPSTVAATPPIPWLQPERGPDNAPLVLGNMPPHGSVPTCGENLMMSELMDCC RELDEGHRAWAAHKKEAAWRLRRVELQLESEKACRRREKMEEIEAKMKALREEQKASLDR IEAEYREQIAGLRRDAEAKEQKLAEQWAAKHLRLTKFLEQMGCRPRLSESNGR. >LITCHI019292.m1 MFSSTSSVTPFTISSFHHFPSPFSGFDANNVFLNNQLHDPFTSVVSTNPRIAESLTSMAL LENTTTMTNGDQYYGHSNSITNKKPAAPAKKDRHSKICTAQGLRDRRVRLSIDIAREFFD LQDMLGFDKASKTLEWLLSKSRKAIRELVENRNEAAKCLYSSISDHGTAVSKTKSSSGYE KEMENHNKNDAFLVHPEKESRSKARARARQRTREKMCTRKVLHDRKKKGLNASSQILTHL IKACAEPNSSNDQYFACDIQIKDPSSSPPLANQASEESSMLKRKWNPCSVFTHQQHLGIS KDISGNSNCFSSLPQNWDTTDGAILITNMNMPTTGLQSCGRPWETPNSQCQH.
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>LITCHI019292.m1 CATCCTTGTTCTCTACTCCCACATTTAGTGGGACAAAGTGGGTGTGATTAACTTTTCATT TCCATATACTATCACCCACTTCCTTAGCAGCATTAATTGTGTTTGTGTCCATGTATTTGA CCTCAAATATGTATATATGAAAAGATACAAAACTCTTTTGTCTCAACAGATATTATTGAC CATTGAGTGCTTTTTCTCAATCAAATCAACTTCAATCCAATTTCTTTCTCGATCTGTTAT ATGGCAGAGAGCTGAATAGAAAAGAGTTAGAAACCTTTCAATGGTCTGGTATAGTGTCGT GCAAATCTATCACTTCTGAGAGAGCTGAGCTGCTGGCTAGGGTTTGTTGATCAGTCAAAT TTTTAGTCAGAATGTTCTCTTCCACCTCCAGCGTCACCCCTTTTACAATTTCTTCTTTCC ACCATTTCCCTTCTCCATTTTCTGGGTTTGACGCCAACAATGTCTTCCTCAATAATCAGC TGCATGATCCATTCACAAGTGTTGTTTCAACCAATCCTCGGATTGCTGAGTCTTTGACCA GCATGGCGCTTTTAGAAAATACTACTACCATGACTAACGGTGATCAGTACTATGGTCATT CAAATTCGATCACGAACAAGAAGCCGGCAGCGCCAGCGAAGAAGGATCGACACAGCAAAA TTTGCACCGCCCAAGGCCTAAGAGATCGGAGAGTGAGACTCTCCATTGACATAGCTCGAG AGTTCTTTGATCTCCAGGACATGCTAGGGTTTGATAAAGCAAGCAAAACCCTTGAGTGGC TGCTCTCTAAATCAAGAAAGGCCATAAGGGAGCTAGTAGAGAATAGAAATGAAGCAGCCA AGTGCTTGTATTCATCAATTTCTGATCATGGCACTGCTGTTTCAAAAACCAAGTCATCAT CAGGATATGAGAAAGAGATGGAAAACCATAATAAAAATGATGCATTTCTAGTACACCCTG 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Up_Stream_Len 2000 CCCATAATTTAATGGCCAATTTGGTAAAATTCCTCCTAATTTTAACGTCAGCTCTAACTA GTAAAAAAAAAAAAATCATCTCTAGTAATGTATGACACGGCAAGTCAAGTGAAGTTATAT CGAAAACTTTCAAGTTTTTCTATTAATTGATAAATTTAGCTTTCATTTTATGAATTAAAT AGTAGTGTCACGTATATAAAAATTATTAAATGTGATACCCATAAAAATTTTGATTTATAT CAATATAAATTACAGTTATGAATTAAATAGTAGTGTCATATAGTTCTCATATAGTTGAAA ACTCTACTTTGTGGATATATAAATAAAGAACTTGTATAAAAAAAACATCCACCTGAAACC TATTGGTTACACATGATAATTCTTCCATAAAGACATCTTGAAAATTTTGTTTTAAAATGA TAAATTACAATAACTCATTTTAAATGGAATCCATCATAATGATAAGATTCATTGAAAATT TGTGACTATAATTAGTGATTTTGAGACACTAATATACATATAAAGAGAGAAAGCGAGAGA GTAAAGCAAAAGGCGCTTAATGGTCTTTGTAACTCAAAGAGGAACAAGACGTGCGAAGGG AAAGGAGAGAAAGAGACAGGAACTCTTCTTATTTAGTTTGGGAGGAACAGTCTAAATAAG GAACTCTTGTTATTTAGTTTATGTATGAATGGCCTCTAGCTGTAACCTATGAAGACTGAA GAGAGTAATTTTCATAGACAGGGATGTACGAAGCATTTTTGACAGTGAAGGCGACACAGA ATGGCAGCTATGTTTGTGGCATTCGATAGTCACTAATTTGTCCTTCTATGTAGATCTAGC TGGTAATAGACATAACGACGTGTCATATATACATACTCTCTTTACGGTCTCACTTGTATG GCCGTCGTTCCACGTATGTTTGTTAATTGCTGAGTGACCTAATGCCCTGCTGAACACTAG TAATAAACTCATTCAATACATTCAATGTGAAATTTTAGGATGAGACTGCTCTAATTTAGG TTTTATCTTTAAATAAATTTTATTGCACGAATATTGCTGCATGTTCTAATGCTCTTTACC ATTCACAGGGGAAAAATGATTTATCTTTTCGGTAGTATTGTAATCTTTGAATTTTCTAGA TGAGTTAAAAAATATATATGGAATGTAGTTTTGCGAATTAGTGTTTCTTGTTTAGCTGTT GTTTTTCTTTTACAATCTTTATCAGAGAACAACTTTTATATAATTGTCTTATAATTGATA TAATAAGATAAATAAATTAAATAATGTTATTTTATTCTCTTATCATTTTTATTGATTTTT TTTACTGTCAATATAGTAATTTAAATTAATAAAAATATAAATATTAAAAAAATTAATAAA AATAAAAAAAAATAATATTATTTTATTAATCCATCTCAATACATCACTATTAAAGCTCAT TTTTTTTTTTTTTTTAATATAAAAATTATAGAGAAAGACCCACAAGTGAGAGAAAGCTCC TTCTCCTTTGAATTAGTAACATACATTCAACCAGCCAAAGAACCAGTCACGTCATTTCTC TTTCTTCCATTCACTTTTCTGAAGTAAGGGGGGGTTAATTATTGACAAGATTGGCCACCA GTCCGTCACCATCCTTGTTCTCTACTCCCACATTTAGTGGGACAAAGTGGGTGTGATTAA CTTTTCATTTCCATATACTATCACCCACTTCCTTAGCAGCATTAATTGTGTTTGTGTCCA TGTATTTGACCTCAAATATGTATATATGAAAAGATACAAAACTCTTTTGTCTCAACAGAT ATTATTGACCATTGAGTGCTTTTTCTCAATCAAATCAACTTCAATCCAATTTCTTTCTCG ATCTGTTATATGGCAGAGAGCTGAATAGAAAAGAGTTAGAAACCTTTCAATGGTCTGGTA TAGTGTCGTGCAAATCTATCACTTCTGAGAGAGCTGAGCTGCTGGCTAGGGTTTGTTGAT CAGTCAAATTTTTAGTCAGA
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