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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI019055 | Chr15 | 12095743 | 12098442 | + | Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 7b |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI019055.m1 | 4 | 149 | PF05983.14 | Med7 | Family | 145 | 3.10E-42 |
LITCHI019055.m2 | 4 | 158 | PF05983.14 | Med7 | Family | 149.3 | 1.50E-43 |
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>LITCHI019055.m1 ATGGCAACGGCGACATATCCGCCACCTCCACCCTTCTACAGACTGTACAAAGATTACATA GAAAATCCAAATTCGTGTCCGCAGCCACCGCCTCCTATCGAAGGCACCTACGTTTGTTTT GGTGGCAATTACACCACTGATGATGTGCTTCCGAGTTTGGAAGAGCAAGGAGTGCGTCAG CTCTACCCGAAAGGACCAAATATTGATTTCAAGAAAGAACTGAGGTCTCTGAACAGAGAA TTGCAGTTGCACATATTGGAGCTTGCGGATGTACTTGTTGACAGACCGTCTCAATATGCC AGGAGAGTGGAAGACATATCCCTAATATTTAAGAACTTGCATCATCTCCTCAATTCGTTA CGCCCCCATCAGGCTAGAGCAACATTAATACACATTCTAGAACTTCAGATACAACGCCGC AAACAAGCTGTGGAGGATATCAAGAGGTATTTTTTCCCCCTAGATGCCTATTGA >LITCHI019055.m2 ATGGCAACGGCGACATATCCGCCACCTCCACCCTTCTACAGACTGTACAAAGATTACATA GAAAATCCAAATTCGTGTCCGCAGCCACCGCCTCCTATCGAAGGCACCTACGTTTGTTTT GGTGGCAATTACACCACTGATGATGTGCTTCCGAGTTTGGAAGAGCAAGGAGTGCGTCAG CTCTACCCGAAAGGACCAAATATTGATTTCAAGAAAGAACTGAGGTCTCTGAACAGAGAA TTGCAGTTGCACATATTGGAGCTTGCGGATGTACTTGTTGACAGACCGTCTCAATATGCC AGGAGAGTGGAAGACATATCCCTAATATTTAAGAACTTGCATCATCTCCTCAATTCGTTA CGCCCCCATCAGGCTAGAGCAACATTAATACACATTCTAGAACTTCAGATACAACGCCGC AAACAAGCTGTGGAGGATATCAAGAGGCGGAGAGAAGAAGCACAGAAACTTCTCAAGGAA TCCCTCATAGCGTTAGATGGAAATTAG
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>LITCHI019055.m1 MATATYPPPPPFYRLYKDYIENPNSCPQPPPPIEGTYVCFGGNYTTDDVLPSLEEQGVRQ LYPKGPNIDFKKELRSLNRELQLHILELADVLVDRPSQYARRVEDISLIFKNLHHLLNSL RPHQARATLIHILELQIQRRKQAVEDIKRYFFPLDAY. >LITCHI019055.m2 MATATYPPPPPFYRLYKDYIENPNSCPQPPPPIEGTYVCFGGNYTTDDVLPSLEEQGVRQ LYPKGPNIDFKKELRSLNRELQLHILELADVLVDRPSQYARRVEDISLIFKNLHHLLNSL RPHQARATLIHILELQIQRRKQAVEDIKRRREEAQKLLKESLIALDGN.
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>LITCHI019055.m2 GGCATCTTTGTCCATTTGAAAATAACGAAAAATAATTTGGTATTTTATGAAAATAGTTTT TTTTTTAAATCTCCCTTTTTTCCAGTTATTTTTATTGGTGTCCTTTTTCAGTTTCTTCAA GTTTCTATCATTTTCTCAAAAACCCATCAAGTCCCTAACTGGTTTATTTTGTTGGAAGTA AATTAGCGCTTGATAGAAGAGAGTGAGAGTGATGGCAACGGCGACATATCCGCCACCTCC ACCCTTCTACAGACTGTACAAAGATTACATAGAAAATCCAAATTCGTGTCCGCAGCCACC GCCTCCTATCGAAGGCACCTACGTTTGTTTTGGTGGCAATTACACCACTGATGATGTGCT TCCGAGTTTGGAAGAGCAAGGAGTGCGTCAGCTCTACCCGAAAGGACCAAATATTGATTT CAAGAAAGAACTGAGGTCTCTGAACAGAGAATTGCAGTTGCACATATTGGAGCTTGCGGA TGTACTTGTTGACAGACCGTCTCAATATGCCAGGAGAGTGGAAGACATATCCCTAATATT TAAGAACTTGCATCATCTCCTCAATTCGTTACGCCCCCATCAGGCTAGAGCAACATTAAT ACACATTCTAGAACTTCAGATACAACGCCGCAAACAAGCTGTGGAGGATATCAAGAGGCG GAGAGAAGAAGCACAGAAACTTCTCAAGGAATCCCTCATAGCGTTAGATGGAAATTAGCA CTTGAATTATGCACGTCCTGTTGAAAAAGGATGTAGCTACACTGTTGTTTCTGTTGCCTC GACTGGAAGACAGATTGCACTTAAAATCTGCAACCTGAGAAGCTCGACTCTGCTTTTGTT TGTTGTCTTTAGATTGATGTATCTGGACTTTTTCCTTAAAGACGCTGCTCGAACTTTTGT ATTGGACTATTTCACGTTATTCATCTGTCATAGATTGGGTGCATAAGTGTTTGAACTATC TGATTAGCGATGATATAACTTGAATTTTCGTAAATTTTTGGAAGTGTTGTGCTGCGATAT ATGTCATATATAGTTATAATTATTATAGACGATTCACTGATTCTTATATTCTAACTATTT AGAAGTGCTGTAAAATTTGTGTATTTCAATGACTTTGAGTAGGTACTTGACTTCATACTA TGAAGATAAATCGATTGATC >LITCHI019055.m1 GGCATCTTTGTCCATTTGAAAATAACGAAAAATAATTTGGTATTTTATGAAAATAGTTTT TTTTTTAAATCTCCCTTTTTTCCAGTTATTTTTATTGGTGTCCTTTTTCAGTTTCTTCAA GTTTCTATCATTTTCTCAAAAACCCATCAAGTCCCTAACTGGTTTATTTTGTTGGAAGTA AATTAGCGCTTGATAGAAGAGAGTGAGAGTGATGGCAACGGCGACATATCCGCCACCTCC ACCCTTCTACAGACTGTACAAAGATTACATAGAAAATCCAAATTCGTGTCCGCAGCCACC GCCTCCTATCGAAGGCACCTACGTTTGTTTTGGTGGCAATTACACCACTGATGATGTGCT TCCGAGTTTGGAAGAGCAAGGAGTGCGTCAGCTCTACCCGAAAGGACCAAATATTGATTT CAAGAAAGAACTGAGGTCTCTGAACAGAGAATTGCAGTTGCACATATTGGAGCTTGCGGA TGTACTTGTTGACAGACCGTCTCAATATGCCAGGAGAGTGGAAGACATATCCCTAATATT TAAGAACTTGCATCATCTCCTCAATTCGTTACGCCCCCATCAGGCTAGAGCAACATTAAT ACACATTCTAGAACTTCAGATACAACGCCGCAAACAAGCTGTGGAGGATATCAAGAGGTA TTTTTTCCCCCTAGATGCCTATTGAATCATTCAGAAGCTGCTCAGTATTGAAATTGTCTG AAACAGGATTGATTGGTTCTAACAATTGTCAAGTTTTGAGTAGCAATATTATTGCTTGTG GTTATGATCCCATTTCACATTCTGAATGATTAGTTAATGTTGGAAAATTTAAAACTTCAC TTTTGGCTAGTGTCTATTACTAGTTATTATTATTTTTTAATTATATATCAACTTATATAT CAACGGATTTGTACTGATACCAATAGGCTAATTTTTTATCCTGTAGGGAATTTGTACATG TACAAATTTGCAGTATTGATAGAATAATTCTTTTTTTTTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGT GTGTGTATAAATTGTTTTTTTCAGCTCAGGACCATTTTGATTTTGCAAGATCAGTTATAT TTTGTCTTCATTAAAGCTTTTGCAGTTTAATCAGGTCATGATCAACTTTGGAGACTTTGA AAGCTTTGAATAAGATCTTTATATAGATGATCTAGATGGAACTGATTTTCTGTTAACATT AGGATGAAACGAGGAGATAAGTACTGAGTAGCAATATTTTTGAGATGGGGTGGTGGTGGT AAGAGTGCAAAATGGTTGTTATTCTTATTTGCTCATCAACTTTGTTCAAGACCTCTTAAC ATGTAGTTAGATAAAGGTCAGCTTTATCAATTGTATAGCTATAGCTAGCTTGTTTATCTC AGTACATTCTTATCCTATATTCCAATCTGGTCACCACAATTCTGTGCCCTTTTGACACCC CTTCTGCCAGTAGCTATTCCTTCATACAGAACTTCAAAAACTTTTGTTTTCTGCATAATA AAATTGAGTGTGAATCTGAGTAGTAGAAAACTGATTTATTTTGTCATTTTTTTTAATGAG CTTTTAAGGATCTTTCATTGAGCCTTATTTATCACTTGTTATGCAACACCTGATTGCAGA TTATTCTTGGAAAGTATTACTCATTTACTGTATTCCTATTCTTTCTTTGTTTATTGTTAG ATTAGATTAGTATTTAGTTGCTTAACAGCTTCATCAGTTTTCAGATCATGTGCTGTACTG TTTGAATCCTAGTAATCATAATGTAGACACTATAATGCGAGACAAATACTTGAGAACCTG ATTTTAAGCTTAAACATGAGCCAGAGTTTATCTGTCCTAATGCTTTTAAAATTCCATGAC TGTTGTTTCTTTTGCTTGTCCAGGCGGAGAGAAGAAGCACAGAAACTTCTCAAGGAATCC CTCATAGCGTTAGATGGAAATTAGCACTTGAATTATGCACGTCCTGTTGAAAAAGGATGT AGCTACACTGTTGTTTCTGTTGCCTCGACTGGAAGACAGATTGCACTTAAAATCTGCAAC CTGAGAAGCTCGACTCTGCTTTTGTTTGTTGTCTTTAGATTGATGTATCTGGACTTTTTC CTTAAAGACGCTGCTCGAACTTTTGTATTGGACTATTTCACGTTATTCATCTGTCATAGA TTGGGTGCATAAGTGTTTGAACTATCTGATTAGCGATGATATAACTTGAATTTTCGTAAA TTTTTGGAAGTGTTGTGCTGCGATATATGTCATATATAGTTATAATTATTATAGACGATT CACTGATTCTTATATTCTAACTATTTAGAAGTGCTGTAAAATTTGTGTATTTCAATGACT TTGAGTAGGTACTTGACTTCATACTATGAAGATAAATCGATTGATC
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>LITCHI019055.m2 + Up_Stream_Len 2000 GTAGACAACTTGTTGCCAGAGAGACTATCAGTCCATTAACAATGCAAAATTCAAAATCAA CAACTCTAAAAAAACAGCCCTATTTGATGCAGTAACTTCCAATTAAGTACCAAAACATGA TTCCACAAATTTCTCATTGTTAAACCCTAACCTTAAGAAGAGAAGTAGCTGAAGGTAAAA TTAAAAAAAAAAAAATGTAAGAAAGGAAAATTCACCTTCAGTTAACAGATATTGGAGACA AAGTTTTGGAGAAGTAGCAAAAACCAAGTAACCAACTTTCTTGAAGAGGGAGAAAAAGAA AATGGAAGATAGGAAAGAGACGAAAGTAAGCATCAGATGGGAGGGAGGGGAAATTTTTAG TGAAGATATAAATGATCCCATTTGTCTGGAGGGTTTATTTTATCCTAACAGAGGGTAAAA TTGCTAGTGGCGTAAAATAGTCCAAAGAAGCGGGACTCACCAAAGAACATGCTAGGACTA GAACTAATACTTGCTTATCCTGTCCTGTGTAACGGACTGGGCCAGACGTTTTTTTATAGA ATTTTTATGATAAAATAACACATTACCGTAGAAAATAATAGATGATTATGATTACTATTT TCCTTTTCAAACTCAAACCCCACTTATGAAAAATGACAAAACACATGGTTAGGGCCTGGG GGAAGATTGCAACTTAATAAATATGATAGTGTTTTTTCTTAAAACCACACTGCACGGATA AAAAAAACATGAAAATTTGATGAGATTAAACACTAATTGTGCAATTTGGATATTATCCTC GTAAATGCAAAACAACTATTTTCACAATAAGAAGAAAAAACCACTTATGTAAACTTTAAA ATGTGTTCGTTCGAAATTAAAACCCAACATCCCTAGTGAATAGGAAATGCCCAACTAGGT TATAGGTGATGAAGCATAATATAGGGTTTTAATACATTATTCGGAAGACTAGGTGGAATT GGAATAACAATCCTACCAACCCTTTGTTTGGCAGTCGCTCAAAATTGACTTATACCGATG TTGACTCGATGCAAGTCCATGTATAGTCCTAGACCATGCAAACCCACAAAGTTGGTGGGT TTTGTATAATCTTGGCTCATCAATACTATATATATATGAGGTGGAATCAAATCTATTGGA TTTACCTTTCTATAGAGGGTGCTCGTCAAATGGAGACCTAGATTAGGGTCTTTATTATCG AAATGAAGGCCTAGATCTAGGTCTCCAGCATCGCTATCAATGTAAACCTAATCTAGGTCT CCATCACCATTGATAATGAAAACTGATCTAGATTTTAATCATTGATGGTAATAGAGACCT AAAACTAGGTCTCCATTGTCATTAAATGAGGATCCATATTAGATCTCAATTGCCTTTGAA TGGAGACAATAGAGACCCAAATCTATGTCTCCATCTCGATGGTCACTATCGAATGGAGAC CCAAATTCATTCTCGATTGGAATCACTAATGATGATCTTATTGTCGAGATCTGCATCACC ATTTTCATGTTTACTGTGAAGCAGGAGATTGGTGGAGATCTAATCTAGATATTTACCCTT TTATTTTTATAAATTTTCTTAAAAAATGGATGGATGATAGAAATCAAACTTGTCTTTAAT TTTTTCAAAAATTCTATTCTTTTTATTTTTTATTTTATTAAAATATTTTTCAAGCATTTT AAATTAAAAGTATAGAATTGCCCCTCAAGTATAGATACAGGTTAACATACATCCAATTTG ATATTTTTGATATTAAGGGATATTTTTGGCATATATAAAAAGGTTGCGGGGCATCTTTGT CCATTTGAAAATAACGAAAAATAATTTGGTATTTTATGAAAATAGTTTTTTTTTTAAATC TCCCTTTTTTCCAGTTATTTTTATTGGTGTCCTTTTTCAGTTTCTTCAAGTTTCTATCAT TTTCTCAAAAACCCATCAAGTCCCTAACTGGTTTATTTTGTTGGAAGTAAATTAGCGCTT GATAGAAGAGAGTGAGAGTG >LITCHI019055.m1 + Up_Stream_Len 2000 GTAGACAACTTGTTGCCAGAGAGACTATCAGTCCATTAACAATGCAAAATTCAAAATCAA CAACTCTAAAAAAACAGCCCTATTTGATGCAGTAACTTCCAATTAAGTACCAAAACATGA TTCCACAAATTTCTCATTGTTAAACCCTAACCTTAAGAAGAGAAGTAGCTGAAGGTAAAA TTAAAAAAAAAAAAATGTAAGAAAGGAAAATTCACCTTCAGTTAACAGATATTGGAGACA AAGTTTTGGAGAAGTAGCAAAAACCAAGTAACCAACTTTCTTGAAGAGGGAGAAAAAGAA AATGGAAGATAGGAAAGAGACGAAAGTAAGCATCAGATGGGAGGGAGGGGAAATTTTTAG TGAAGATATAAATGATCCCATTTGTCTGGAGGGTTTATTTTATCCTAACAGAGGGTAAAA TTGCTAGTGGCGTAAAATAGTCCAAAGAAGCGGGACTCACCAAAGAACATGCTAGGACTA GAACTAATACTTGCTTATCCTGTCCTGTGTAACGGACTGGGCCAGACGTTTTTTTATAGA ATTTTTATGATAAAATAACACATTACCGTAGAAAATAATAGATGATTATGATTACTATTT TCCTTTTCAAACTCAAACCCCACTTATGAAAAATGACAAAACACATGGTTAGGGCCTGGG GGAAGATTGCAACTTAATAAATATGATAGTGTTTTTTCTTAAAACCACACTGCACGGATA AAAAAAACATGAAAATTTGATGAGATTAAACACTAATTGTGCAATTTGGATATTATCCTC GTAAATGCAAAACAACTATTTTCACAATAAGAAGAAAAAACCACTTATGTAAACTTTAAA ATGTGTTCGTTCGAAATTAAAACCCAACATCCCTAGTGAATAGGAAATGCCCAACTAGGT TATAGGTGATGAAGCATAATATAGGGTTTTAATACATTATTCGGAAGACTAGGTGGAATT GGAATAACAATCCTACCAACCCTTTGTTTGGCAGTCGCTCAAAATTGACTTATACCGATG TTGACTCGATGCAAGTCCATGTATAGTCCTAGACCATGCAAACCCACAAAGTTGGTGGGT TTTGTATAATCTTGGCTCATCAATACTATATATATATGAGGTGGAATCAAATCTATTGGA TTTACCTTTCTATAGAGGGTGCTCGTCAAATGGAGACCTAGATTAGGGTCTTTATTATCG AAATGAAGGCCTAGATCTAGGTCTCCAGCATCGCTATCAATGTAAACCTAATCTAGGTCT CCATCACCATTGATAATGAAAACTGATCTAGATTTTAATCATTGATGGTAATAGAGACCT AAAACTAGGTCTCCATTGTCATTAAATGAGGATCCATATTAGATCTCAATTGCCTTTGAA TGGAGACAATAGAGACCCAAATCTATGTCTCCATCTCGATGGTCACTATCGAATGGAGAC CCAAATTCATTCTCGATTGGAATCACTAATGATGATCTTATTGTCGAGATCTGCATCACC ATTTTCATGTTTACTGTGAAGCAGGAGATTGGTGGAGATCTAATCTAGATATTTACCCTT TTATTTTTATAAATTTTCTTAAAAAATGGATGGATGATAGAAATCAAACTTGTCTTTAAT TTTTTCAAAAATTCTATTCTTTTTATTTTTTATTTTATTAAAATATTTTTCAAGCATTTT AAATTAAAAGTATAGAATTGCCCCTCAAGTATAGATACAGGTTAACATACATCCAATTTG ATATTTTTGATATTAAGGGATATTTTTGGCATATATAAAAAGGTTGCGGGGCATCTTTGT CCATTTGAAAATAACGAAAAATAATTTGGTATTTTATGAAAATAGTTTTTTTTTTAAATC TCCCTTTTTTCCAGTTATTTTTATTGGTGTCCTTTTTCAGTTTCTTCAAGTTTCTATCAT TTTCTCAAAAACCCATCAAGTCCCTAACTGGTTTATTTTGTTGGAAGTAAATTAGCGCTT GATAGAAGAGAGTGAGAGTG
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>LITCHI019055.m2 GenomeSequence + GGCATCTTTGTCCATTTGAAAATAACGAAAAATAATTTGGTATTTTATGAAAATAGTTTT TTTTTTAAATCTCCCTTTTTTCCAGTTATTTTTATTGGTGTCCTTTTTCAGTTTCTTCAA GTTTCTATCATTTTCTCAAAAACCCATCAAGTCCCTAACTGGTTTATTTTGTTGGAAGTA AATTAGCGCTTGATAGAAGAGAGTGAGAGTGATGGCAACGGCGACATATCCGCCACCTCC ACCCTTCTACAGACTGTACAAAGATTACATAGAAAATCCAAATTCGTGTCCGCAGCCACC GCCTCCTATCGAAGGCACCTACGTTTGTTTTGGTGGCAATTACACCGTAAGACTTCGTTT TTGTTATGTATTTATCAATCTAACCATAATTCTTTGTGCCCTTGATTTGACTTCCTACGA TTGCTTGTTTAGACTGATGATGTGCTTCCGAGTTTGGAAGAGCAAGGAGTGCGTCAGCTC TACCCGAAAGGACCAAATATTGGTATAGTTTCTCTGCTTGGAGAAGTGTATCTTCTTTTG TCCACTTATTTATATTGAAAATGATGGTTGTAGGGCTGTCTGCTTGAAATATTATTTAAC TAGGTTGATGAAATTGGTTATGACATCTAAACATCGGTCTATGTAGATTTCAAGAAAGAA CTGAGGTCTCTGAACAGAGAATTGCAGTTGCACATATTGGAGCTTGCGGATGTACTTGTT GACAGACCGTCTCAATATGCCAGGAGAGTGGAAGACATATCCCTAATATTTAAGAACTTG CATCATCTCCTCAATTCGTTACGCCCCCATCAGGTTGAATATTTTTGTCTCAACATTAGT TTTCTTGACCATTTTTGAGAATTAATTGACAATGTAATAATTTCTTCTGCCTTGTAGGCT 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