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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI019025 | Chr15 | 11763977 | 11766777 | - | F-box protein At5g06550 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI019025.m1 | 95 | 133 | PF00646.36 | F-box | Domain | 19.8 | 0.00059 |
LITCHI019025.m1 | 214 | 432 | PF13621.9 | Cupin_8 | Domain | 72.7 | 4.40E-20 |
LITCHI019025.m1 | 321 | 431 | PF02373.25 | JmjC | Domain | 47.8 | 1.80E-12 |
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>LITCHI019025.m1 ATGCTCGGCTGCAGAAGCTTGCTTTCTCAGGTGATGCAAAAGAAGAAAAAATCCAAAATC AAAAACAAACGCAGGACCAGAAACAAAAATTCGGGTTCCAGAAAACATGAATCTCCACCT GACCAACTACAAGACATAGAGGAAGAAGAAGACACAGAAGAAGGATTCAGCCTCAGAGCC TTCGCTCGATCAGACTCTCATGGAGTGCAACCACTGGGTAATCTATTCTTCAATCCCGGA TCAGTCAACTCCAGAAACACCGGTCTGGGTAGTCTCCAAGTTCTAAGTGATGAGCTAGTG CTTGATGTTCTGCGGTTCTTGGATGCCACGCACTTGGGAGTGCTAGCCACTGTTAGCAAA TCTTTCTATGTTTTCTCCAATCATGAACCCATTTGGAGGAATCTTGTCTTGGATAATCTA AATGGTCAGTTTTTGTTTAATGGCTCATGGAAATCTACTTACATTGCTACTTGTTATCCT TCATTTGATGTTCAAACTGTTGGTGTATCTGGTAGTTTGAGAATTAGAGATTTCTATTCT GATTATTTGTTTCAAAGTTGGTTATGTGCTAATCTTGAAATGAAACCTGAATGGCTTGAG AGAGATAATATTATTAGAAAGAAGGGTATTTCTGTTGAAGAATTTGTGTTGAACTTTGAG GAACCGAATAAGCCGGTATTGCTAGAAGGGTGTTTAGATAGTTGGGTTGCGTTGAAGAAA TGGGATAGAGACTATTTGGTTAAGGTGTGTGGTAATGTTCAGTTTTCGGTTGGACCAGTA GAGATGAGGCTTGAGGACTATTTTAGGTATTCGGATTTAGTGAAGGAAGAAAGGCCATTG TATTTGTTTGACCCAAAATTTGCTGAGAAGGTTCCCGTTTTGGGTTCGGAGTACGAGGTT CCAGTGTATTTTAGAGAGGATTTGTTTAGTTTTTTGGGTAATGAGAGGCCGGATTATAGG TGGGTTATAATCGGACCAGCTGGGTCTGGTTCGTCATTTCACATCGATCCTAATTCAACA TCAGCTTGGAATGCTGTCATAAAAGGTTCTAAGAAATGGGTTTTGTTTCCTCCAAATGTA GTTCCACCAGGGGTGCACCCGAGCCCAGATGGTGCAGAGGTTGCATGCCCTGTTTCGATA ATGGAGTGGTTCATGAACTTCTATGGTGCCACAAAGAATTGGAAAAAGAGACCGATTGAA TGTGTTTGTAAGGCCGGAGAGGTGATCTTTGTGCCTAATGGATGGTGGCATTTGGTGATC AACCTGGAGGAATCTATTGCCATCACACAGAATTATGTCAGCAGGAGAAATTTGTTGAAT GTGTTAGATTTTCTAAAGAGGCCAAATGCAAGCACACTTGTATCTGGAACAAGAGACCGG GTGAATTTGCATGACAAGTTCAAGAATGCTATTGAAACCTCTTTCCCTGGAACTATTGAT CAGTTGATGCAGAACGCAGAGGAAAAAAGGGCTCAAGAGAAGAAGGTTTCCTTCTGGGAT TCGGTAACAGATTCGAAGGCGGGGGCTTTCAAGTTCTCTTTTTAA
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>LITCHI019025.m1 MLGCRSLLSQVMQKKKKSKIKNKRRTRNKNSGSRKHESPPDQLQDIEEEEDTEEGFSLRA FARSDSHGVQPLGNLFFNPGSVNSRNTGLGSLQVLSDELVLDVLRFLDATHLGVLATVSK SFYVFSNHEPIWRNLVLDNLNGQFLFNGSWKSTYIATCYPSFDVQTVGVSGSLRIRDFYS DYLFQSWLCANLEMKPEWLERDNIIRKKGISVEEFVLNFEEPNKPVLLEGCLDSWVALKK WDRDYLVKVCGNVQFSVGPVEMRLEDYFRYSDLVKEERPLYLFDPKFAEKVPVLGSEYEV PVYFREDLFSFLGNERPDYRWVIIGPAGSGSSFHIDPNSTSAWNAVIKGSKKWVLFPPNV VPPGVHPSPDGAEVACPVSIMEWFMNFYGATKNWKKRPIECVCKAGEVIFVPNGWWHLVI NLEESIAITQNYVSRRNLLNVLDFLKRPNASTLVSGTRDRVNLHDKFKNAIETSFPGTID QLMQNAEEKRAQEKKVSFWDSVTDSKAGAFKFSF.
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>LITCHI019025.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTGATTACAACTGTCTCTTGAGTCATTTCTGTAACATTCAAATCAAATAATACTATTAAA TCTCATTTCAATCGGACAATATTACAAAATACAATCATATTGAATCATATTCAATACATA GAAACACAAACATATAAAAAATCATGAAAAATGTGGTAAATTCGGTTTTCCAATGAAGTT ATCGGTTTTTCATTCTCTCAAAAACCGAAAAAACCGTGAAAAACCGTTCAATCGGGTTTA CATTGGCTGGATTGGTTTTTCAATGGCTGAAAAATCGGGATCGGTTTTTAGCCACGTACC GGTTTTTCAGTGTATGAAAAATCGATACCGATTTTTCAGTGGCTGAAAAACCGATCCCAC TGAAAAACCGTCACAACTCTTCAATCGGTCTTCCACTCTGTGGAAAACCGATTATCGCTC ACAAAAAACCGATTTCGTAGTAGATTTTGCAGATTCCGTAGCAAATTTCAGAAAAATTAA GATCTTACAACAAAATCATTCTTATAGTCTTTTAGCTAGCAATATGAACAAAATAATCCA AAAACCAACCAAAAAAACTCATACATTACCTTTCAAACTCAAATGGAAGAAGAATCTTCA AAACTTTCAATGGTGTAAACTTAAATGGATCCAAAAACTTCAATAGATGAAGAAGCTCGA ATGAATAATCCCCTCAATAGATTGTTTTTCAACTGCAATGGATCTCAAAAATCATTGATA ACTATTGATGGAGAAGAGAGAAAATGGAGGATATTGTTAGGATGAAGAAGGTTATTTTCG TAATTTCATATTTGAGCAGAAGGTTATTTTCGTTATTTTATGTTTGGGCATATTAGTGGT TTTAACTTAAGGGTATTTTGGTAATCTTGGGTATACAATGGAAATAGTTTATTTGAAAGG TCAAAAACAAATTTTTTTAAATAGTTGGGTAAAAACAAAAATTTTCTTTTGATTTGGGTA AAAACTATAAATTCCCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTATTTTGAATTGACA ACTTCGGTTTGCTTTAATTGTTTTGTAAAAAATATATATATATAATAATTATTGATTTGT GTTTTTTTTTTAGTACAATAACTATATCTGAGACAAATCCAAGGGGTATCCGGGACCTTT AACCGAGATATATAATATTATATTATATATATAGAAGTTTTGGATTTGTGTTTTTTATTA TCCAAGAATCTTACCATTGAATATGTCATACATGCATTTTCTCTGCATTATTTCACTTGG GTTGGCTATTTAAAAACCCAACTTTTACTTGGCTTTTCTTACTTGAACCGCATTTTTCTC CATTTTTAATTGTTATTCTCTCCTTGTTCAATTTTCAAGGTAATTTGAGGATTTTGTTTT CTACCCACTTAGCAATTTCTTTACAACCAAACAAAAATCTGCTCCTTTAAGGGTTGAACT TTTCATTATAAAAAGTTGCATTTTATATTAACCATCTAGGACTTCATTTTAGTATTAAAA TTTATGACTTGTATGATGTGTAAATTAACTGAAAATAAAGCATTTATGGAAAAAAATTAA TTTTTTATGTAACTCGACTATATATTACATTCATATTTATTTTCTAACTATTAGATATTA TATGGTTTTTAAAATAAAATATGTTTTTTATTATACAAATAATTATTTAAACATTTTTTA AACTTTCATAAAAAAATTATATTTTTAATTAAATTTTCATATTTTTCATAAATTTTAGAT CAATTTTCATCGATATCAATAATTTTATTAATATTTGCGATAAATTGTAGCATGCATATT TCCATCCGTTTTTTCAAAAATTGGTATCCCTATAAGTCGAAGAGCACATGTGTCAAACGT TTTCCTTGAGGAGAAATCGTTTAATAGTAACAAACAAATGAAACGGCTTACGAAAATGAA ACGCGTTTCTATAAACAGAGGAGAGGCTAAAACCCTCGACTCTCCGGTCTCCTCAACCTT GAAAACTCTCTGCAGCTACA
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>LITCHI019025.m1 GenomeSequence - CCTATAAGTCGAAGAGCACATGTGTCAAACGTTTTCCTTGAGGAGAAATCGTTTAATAGT AACAAACAAATGAAACGGCTTACGAAAATGAAACGCGTTTCTATAAACAGAGGAGAGGCT AAAACCCTCGACTCTCCGGTCTCCTCAACCTTGAAAACTCTCTGCAGCTACAATGCTCGG CTGCAGAAGCTTGCTTTCTCAGGTGATGCAAAAGAAGAAAAAATCCAAAATCAAAAACAA ACGCAGGACCAGAAACAAAAATTCGGGTTCCAGAAAACATGAATCTCCACCTGACCAACT ACAAGACATAGAGGAAGAAGAAGACACAGAAGAAGGATTCAGCCTCAGAGCCTTCGCTCG ATCAGACTCTCATGGAGTGCAACCACTGGGTAATCTATTCTTCAATCCCGGATCAGTCAA CTCCAGAAACACCGGTCTGGGTAGTCTCCAAGTTCTAAGTGATGAGCTAGTGCTTGATGT TCTGCGGTTCTTGGATGCCACGCACTTGGGAGTGCTAGCCACTGTTAGCAAATCTTTCTA TGTTTTCTCCAATCATGAACCCATTTGGAGGAATCTTGTCTTGGATAATCTAAATGGTCA GTTTTTGTTTAATGGCTCATGGAAATCTACTTACATTGCTACTTGTTATCCTTCATTTGA TGTTCAAACTGTTGGTGTATCTGGTAGTTTGAGAATTAGAGATTTCTATTCTGATTATTT GTTTCAAAGTTGGTTATGTGCTAATCTTGAAATGAAACCTGAATGGCTTGAGAGAGATAA TATTATTAGAAAGAAGGGTATTTCTGTTGAAGAATTTGTGTTGAACTTTGAGGAACCGAA TAAGCCGGTATTGCTAGAAGGGTGTTTAGATAGTTGGGTTGCGTTGAAGAAATGGGATAG AGACTATTTGGTTAAGGTGTGTGGTAATGTTCAGTTTTCGGTTGGACCAGTAGAGATGAG GCTTGAGGACTATTTTAGGTATTCGGATTTAGTGAAGGAAGAAAGGCCATTGTATTTGTT TGACCCAAAATTTGCTGAGAAGGTTCCCGTTTTGGGTTCGGAGTACGAGGTTCCAGTGTA TTTTAGAGAGGATTTGTTTAGTTTTTTGGGTAATGAGAGGCCGGATTATAGGTGGGTTAT AATCGGACCAGCTGGGTCTGGTTCGTCATTTCACATCGATCCTAATTCAACATCAGCTTG GAATGCTGTCATAAAAGGTTCTAAGAAATGGGTTTTGTTTCCTCCAAATGTAGTTCCACC AGGGGTGCACCCGAGCCCAGATGGTGCAGAGGTTGCATGCCCTGTTTCGATAATGGAGTG GTTCATGAACTTCTATGGTGCCACAAAGAATTGGAAAAAGAGACCGATTGAATGTGTTTG TAAGGCCGGAGAGGTGATCTTTGTGCCTAATGGATGGTGGCATTTGGTGATCAACCTGGA GGAATCTATTGCCATCACACAGAATTATGTCAGCAGGTAAAATCCTTCTTTATTTTAAGC TTCTTTTTAATTGCATAATATATATCTGCTTTAAGAATTCAACTTGATGGTGATATTCAT TTAAATCTGAGCAAATAATTGCTTGATTTTGGTTCTTTCAAACTAATTAAGCATATAGCA CTGTCTGCATCTTGTCTTTTTGGTGAATGCAATCATCCTATTTTATGTAAGCACTCATAA TTTGAGTCACTGGTGTCATATACTGGAGAATTAGTGGACCCAACGCCAATCGAAGTTATA ATGTAATGTTTTGCTTATTGAAGGGATTGATAAATCTTCAGATATCAGTCGAATGACATT AGTTGCAAGACTTAGCAGATCATTCAGTTTTTGATAGCCATATACACATAGTACCTTAGT CGAACTTCTTTCCTTATTTCGTTTTTCATTTTGCTTCAACTGTAAAATAGATCCGTCTTC TCTTGAATGGTAACTGTTTTCCAAGTAGCATTGCATATGTTTTAATGATATTGGTTTGCA TACTTAAAAGAGTTAAGGTAACAAAATCACGTGTATACCAAAATTATGAGGATGAGAAAA ATTGTCTGGAGGTCTTTGTATATCAGCATTATAGATGTTTACTGGTTAATGCCTGACTTC AACGCATTTCTTGTTTAGATTGATAATGATAGAACTCTTATTCATCTTATTATTTTTAAG AAGTAACTTTATGTCAAGCAGGATAACCATTACACCTCTGCAATATCTCTGGTTTAGGGG TGGCAGAAAAGATTTACAGATATTTGATTTTGTGTGTTGCAGGAGAAATTTGTTGAATGT GTTAGATTTTCTAAAGAGGCCAAATGCAAGCACACTTGTATCTGGAACAAGAGACCGGGT GAATTTGCATGACAAGTTCAAGAATGCTATTGAAACCTCTTTCCCTGGAACTATTGATCA GTTGATGCAGAACGCAGAGGAAAAAAGGGCTCAAGAGAAGAAGGTTTCCTTCTGGGATTC GGTAACAGATTCGAAGGCGGGGGCTTTCAAGTTCTCTTTTTAAAGGAAGACCATGAAAAC AGTCTCTGTTGTTACTCCTGACCTCCATAGAGAGTAATGATTTAGCAACATTTTTGACAT TTTGATTCATCAATTTTACCTACTGTACCTGCAGTTGAGTGTCCATTGTTATGAGGACGC GACGGGCACAATAGTCAGGGCCATACATTAATGCTGACCATGCACTATACATATGGCCCC TTTTAAAATTTTAATGTTTTCATTTCTGTTTTAATTTTTGATATATTTTTTCATGTGAGT TTATCAATTTTTTTGTGCTGATGGCATCTAGTATATACTAG