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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI019021 | Chr15 | 11743007 | 11748387 | - | Calcium-dependent protein kinase 20 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI019021.m1 | 127 | 385 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 247.6 | 1.50E-73 |
| LITCHI019021.m1 | 129 | 380 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 88.1 | 5.90E-25 |
| LITCHI019021.m1 | 411 | 458 | PF13833.9 | EF-hand_8 | Domain | 18 | 0.002 |
| LITCHI019021.m1 | 432 | 458 | PF00036.35 | EF-hand_1 | Domain | 29.7 | 2.80E-07 |
| LITCHI019021.m1 | 432 | 492 | PF13499.9 | EF-hand_7 | Domain | 42.6 | 6.50E-11 |
| LITCHI019021.m1 | 432 | 457 | PF13405.9 | EF-hand_6 | Domain | 27.1 | 2.30E-06 |
| LITCHI019021.m1 | 433 | 454 | PF13202.9 | EF-hand_5 | Domain | 25.9 | 4.80E-06 |
| LITCHI019021.m1 | 444 | 494 | PF13833.9 | EF-hand_8 | Domain | 34 | 2.00E-08 |
| LITCHI019021.m1 | 471 | 490 | PF13202.9 | EF-hand_5 | Domain | 13.8 | 0.032 |
| LITCHI019021.m1 | 502 | 563 | PF13499.9 | EF-hand_7 | Domain | 51.3 | 1.30E-13 |
| LITCHI019021.m1 | 504 | 528 | PF13405.9 | EF-hand_6 | Domain | 28.7 | 6.90E-07 |
| LITCHI019021.m1 | 504 | 524 | PF13833.9 | EF-hand_8 | Domain | 14.1 | 0.033 |
| LITCHI019021.m1 | 505 | 528 | PF00036.35 | EF-hand_1 | Domain | 25.7 | 5.60E-06 |
| LITCHI019021.m1 | 507 | 526 | PF13202.9 | EF-hand_5 | Domain | 20.9 | 0.00019 |
| LITCHI019021.m1 | 519 | 564 | PF13833.9 | EF-hand_8 | Domain | 30.9 | 1.90E-07 |
| LITCHI019021.m1 | 538 | 564 | PF00036.35 | EF-hand_1 | Domain | 31.7 | 6.60E-08 |
| LITCHI019021.m1 | 539 | 561 | PF13202.9 | EF-hand_5 | Domain | 17 | 0.0032 |
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>LITCHI022238.m2 + Up_Stream_Len 2000 ACTTTCTAAACCAATGTTCTCTTTTTCCCTTTTCATTTTTCTGTTTGTTTCCATTAAATG TGAATAATTTTACATGCAAAGTTTAGTGCTTTAGTTGGGAAGGGAAGCAGTTGTAGTTTT CTTCGGCTTACATAGATTGAGATGGTATCTTTTTTTATTCTAATTGTGTTGTGTAGTGAA AAGTGGATGTAATGTGTTTAGGAGAAATCAGCATTCCAGAATTTTGAGAGTTAGACAATT AGCTGTTGATGTGATTTTAGGACATGAAAAGTGCTAAATGGGATGCATTTACCGTATGGT GAAACTAGAAACTGTCTGATGCAAACTGAGTTATTTTCTTTCGAATATGATGATTTCAAA GGATAATGTTCTTAATTTTAATATTAGGAGTTAGGGTTGGTACATCTGTACGTATTTTTT TCACTTGTATTGGAAATGTTTACTGAATCTTGAATAGGGTTTGATGGTGTTGTAAAAGCA ATGAGGTATTTTTGTTTGATTTATAATTATAGAAACATGTAATAAGTTTCATGTATGCAT TGCTGGCAGTTCCGAGGTTTGCCGTAGATGGCATATTCTATTCATGCCTCTAAATTGAAG GAAAATTATATTAATTAATCCTTTTGTGCTGTAAAATGCACATTAATGAAGCTAGATTGT TGGCAATGTGTAGAGAAAATTTTGTGAGGAGGAGAGCAATTATTTTTTGTTAGTTTTGCC CCACGGCCCCCACCCAATGTATACATACAAGCTAAGTGGAATGCCTCTTTAAGGTTGGTG TGATAGGGACTTGATCCCTATACCTCAATGCTATCCTTGTTGCATGATTTTAATTCAATT ACATTTCAGATGGTTGTAGGCAGATGTTTTAATGTCAAAGGGAATGGTGAAGACTGATTT TAGAGGAAGCTTCATAAATGTTGATATGTGCATGTTTTAGACATTTGAAAATGGCAAATG AAGATAAAAAGTTCTTGCAGTGCTGGACAAAGCAGAAAAAACAAGGGATAATAAGATTGT AGAGGGTCTTGTAGTAAATTTGCATTTTTTAACATGCATTTGGTGCAACTTTTAACTTTT TACTTAGTTATTGTTGGGACTCACGTGTCTTTCATTGTAGGCTGATTTGATACTGATATC AGTGCTGGTCACCACAAACTGCTTTATCTGTTGATATTTGAATCTCAGAGTGACATGCGT TTGGTGCAACTTTTAACTTTTTACTTAGTTATTGTTGGGACTCATATGTCTTTCATTGTA GGTTGATTTGATACTGATATCAGTGCTGGTCACCACAAACAGCTTTATCTGTTGATATTT GAATCTCAGAGTGTGCGCAAAAATAATTTTTTTTATGCAATTTTGGAATTTCTATCAGGC ATTGGTGTTTTCTTCCATGTATATGTCATGTATCCTTCGTTTCCTCATTTTTTTCCAGAG GTGCCTGTATAGTTAGAATATTGTGTTGTATTTTAGAATTTTTGTATCCTGCATTGTGTT ACTTCAGAACTCCAGTTTTTCATTTACTGCCCATGTAGATTGGTTTCCTTGTTTCTTGAA GAATTTGCTTCAGAATGGAAATAACATGTCTGATTGACTTATCTTGAGTGATTTAAATTT ATTTCAAGTGGTACTGTCTGGCTAGTGTAAGTAAAGATAAAGCTTCCTTAGTTTTGGGAT GTTATACATTTTGTAGTTGGCTTTTTTTCCTCACATGTATCAGTTTTCCTTTACTGTATT GTTAGGGATGGTTTAGATGAATTAGACAGCCCAAGGTCCTCCTTACCTTGGGGTTACTGG TTTTTCCACACAGACCAAATTCTTAAAAAATTGTTAGTTCTCAGTATAGATATGGATGGT TTAGTATTATCTGACTTGTTACTAAAATGTTGTAGGATATTCAAATATATTGTTAATAGT ATTTTCACATGCTAATGATCCATTGCTTATTGGTTTTAGTGCTTATTTTTTTGTTATAGG CAATCCCTCCTATTACACGA >LITCHI022238.m1 + Up_Stream_Len 2000 ATAATAGAATAAAATCAGATTAGAATTAAATAAGGTTCATATTTGCCTATCAAAAACTAG GTTTTAAGTAGGAAAGAAAAAGTAGGCAAGCGTTGGATGGAAGATAAACCTTTTTTTTTT TTTTTCCCCAAGTAGAATGGAAGATAAACTTAGTTAATCCGAAACCGGAAAAAATAATGC AAAGAATCGAAAAGTTTTCTAAAAGTTTTCCTACAATCTTTCCTTGGCAAGACAAACTTC TTCTTTAACACTTCCAAGTTCTAACTACAAGTCTATCATCACTTCCACGACTTCACCTAT GTGTTCCACATTGAATTTCTGTTTTACCAAAGCTAACAACAAATTTATAATTCTATTGTA CAGTAGAAGTATATCAAGGTAACATAATCAATCCCTCACAAAATACCAATACAAAACCAA AGAAAACAGTGAACAGAGCAAACAAATTCACACCCAAAAATCAAGGAAAAAAGGGAAAAA TATTATATGTATTTAATTGATGGGCAAATACCAAAAATTAATTTAATTCTCCACAAATCA AAATGTACAGAACGAAAATAATTATTTAAACTATAAAGACACTTAAATTTTGAAACTATG CATTTTCTTACTCACCATGGTAAAATTGAAGACTAGGGTATTATAGGGTCCACTAATTGC AATTATTTATTTTTAGCAAACTCCATTATGACGATAAGATCTATCGAAAATGAAGAGTTG TAATTAAAGATCACTAAAAAAGAATTTGGACGTGTCTTTTTCTAAAAACTATACATATAT ATAATTTTGTTCAATTTATTATATTTGTACTAGATCTTAATAAAATTTACATGTTTGATT CAACATCTACTTCGACTTCTGAAAATTAAAGGAGTCTAAACATTCTCTCATTCAATCAAC CCATGTGATACATATTACTTTTTCCATTATGTGGCATGATTCTATTTGAAAGCAAAACAA ATAATTAACCCAATTTTTCCTAAATCAAACGCAATTTTCCCAAAACCAAAAACATTGAGA ATAAATTATAATTTATACATCTTCTTCCCTTGTAATGGTTAAAATTGAAATTAAAGGTAA AAATACTTCATATATATTTATAAATATAAAATTTATTCACATTTGAAATATTTTTGTACT TTGATCTTTATTACAAATTACATGTTCGATTTAGGATTATTGTAAAGTATTTGAAATTAT TATTTTTAATTATGTTGTAAACTTCTATTTGAAATATAAAATTGAGGGCATTATGTAACC ATCATTTTGTCCCAAATCAAATCCTTCTCTCACCCCGCCCCCACATAAAAAATATATATG TCCAGCTAAAATGTGAATTCTTTTATAGTAGCCATTAATTGATAATTAATATCTTAGGGC TGACATTAATTAACAATAGGTAATGCCTGAAAAACCCAGGTTAAAATCAACAAAAGTACT CATTAAAACCGTAAAAGAAAATTACAAAATTAACAAACGAAAGTAGCCCAAAGTAATTTT TTTAATAAAAAATATATTTTGAAAAAACAATTATCTTAAATACTAGTTAATAATATTAAT ATTAAAATTAATAAAACTATTTTGTGTTGTGGTTGTCTCTCTCGTCTCCTCCCTTCTAAA TTCCAATACCCTGCCTTTTCTTTACCTCCTCTTTCCTCTCTGTCTCCTATTTTCCCTCAC ACAAGCCAAAAAAAAAAAAAAAAATCTATCTTCCCAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA AAAACAACAACATAGTATTGATAGTGGTATGTGAATGATGGTTTTGGACCTTTGGTCCTA ATCCATCTTCTGTCTCTCCCTCTCTCTCTGTGTCTACCAAGTGTTGGTTCACAACAAGAA GAAGAGAAGATAACACAAATTAGAACAACATTTAATCAGGTAGAGTTAGGTTTGTATATT GTCTATGTAATGTCAAAACCCATGATCCTCTACACGTAATCCCACCGCAACTACCCTAAA CCCTCTCGATCTCTTCCACT
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>LITCHI022238.m2 GenomeSequence + TGTGGTTGTCTCTCTCGTCTCCTCCCTTCTAAATTCCAATACCCTGCCTTTTCTTTACCT CCTCTTTCCTCTCTGTCTCCTATTTTCCCTCACACAAGCCAAAAAAAAAAAAAAAAATCT ATCTTCCCAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACAACATAGTATTGATAGTGG TATGTGAATGATGGTTTTGGACCTTTGGTCCTAATCCATCTTCTGTCTCTCCCTCTCTCT CTGTGTCTACCAAGTGTTGGTTCACAACAAGAAGAAGAGAAGATAACACAAATTAGAACA ACATTTAATCAGGTAGAGTTAGGTTTGTATATTGTCTATGTAATGTCAAAACCCATGATC CTCTACACGTAATCCCACCGCAACTACCCTAAACCCTCTCGATCTCTTCCACTATGTCTC GCGAATCGTCTCCGATCCCTTCTCATCCTACCTCCAACAATACCCTAAACGACACCCACT CTCCTCGAAACGACACCACCACCACCACCACTCCCCCAATCCACAGAAGCAACCGCCCTT CCCGCGCGTGCACTCTACGCACCGCCCAGCGCCTCTACGCGGCCGCTCAGGCTCAGGCCC AGGCCGTCAAGCCCAAGAAGAAGGAACCGCGAGAGCGATTGGATGAGTCGCCGCAGCACC AGCAGCAATGCAGCGCCACTAGTAAGATAGTCACCCCTCTGGTAGGCGACCCACCTCCGT CGCAGCTCCCTCGCTGGAGCCTCCGTGCTATGTGGGAGTTGGCTTCTGTCCTCAATTTCT TGCATGTGGGTGCTTTTGGTTTTGTAAAGTTTTGATTTTTATTGTTTTCTCTTGTGCATT TTGTTTCTTTAAGTTGGTGAAAAGTTTTGTGCCTTTTTTTATTTGTTGTTGTTGTGGGTT 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