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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI018989 | Chr15 | 11392361 | 11404919 | - | Nuclear transcription factor Y subunit A-2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI018989.m1 | 150 | 204 | PF02045.18 | CBFB_NFYA | Family | 87 | 1.00E-24 |
LITCHI018989.m2 | 150 | 204 | PF02045.18 | CBFB_NFYA | Family | 87 | 1.00E-24 |
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>LITCHI007185.m1 GATCGCAATAAATACGGCGATGGTCTAGCCTTCTTCCTTGCTCCATATGACTCTCAACTC CCTCCAAACTCAAGTGGGGGATTTCTTGGACTTTTTAGTCTCGAGACTGCAATAACCAAC AATTCCAGTAATCAAATTGTTGCAGTGGAGTTTGATAGTTACAATTATGCATGGGACCCA AGCAATAATCATGTAGGCATCAACGTTAACTCCATTGTCTCGGTAGCCAACGTGACTTGG AGAAAAGTTCTACCAGAACAGTGCGCCATTAGTGCTACATGTTTAACTCTCCCTTTCATC ATGTCAACTTTTCTTTTCATTCTTTTTCTTCTTCCCTCAGCTGATTCAGTTTCCTTCCAA ATAACTCGCTTTGATCCTGACAGAAATAACTTGATTTATGAGGGAGATGCAGAGCCTAGT GTTGGAGCAGTTGAGTTCAATTGTCAGAGTTATCAATATCAGGTTGGTCGAGTAAGGTAT GCTGATAGAGTGCCCTTCTGGAATCCTAAAACTAGAGAGCAGGCTGATTTCTCTACGCGT TTCTCCTTTGTTATCACCCAAACCGGTTCCCCACATGCAGCAGAGCTTGCTTGCTTCGTT GCTCCTGTTGGATCCGGGATCCCTCCGAATTCAGGTGGCGGCCTATTTAACACAACCACC AGTGACTCTTCTCATAACCAAATTGTTCTGGTTGAGTTTGACACTTTTCCAAACCCTAAA TGGGATCCTAACTTTGAACATTGGTACACCAGTTCATTGCTAGCTAGGTTTGGTCCGGCA GTAGTAATGCTATACACATCTTTTATAGGTTTCTTTCAATTTCCAACTAATTCAATTTCC TTCAAAATAAATCAGTTTGATCCGGATAACCCTGACATAGTGTATGAAGGAGATGCAACA GCATATGTTGGAGCGGTTGAATTCAACAGTGTCAGTTATCTATGTTGTGTTGGTTGGGCC ACCTATGCAAAGAGGGTGCACCTCTGGGATTCTGGAATTAACGAAATGTCTGATTTCACC ACCCATTTCTCCTTCAGTATCGACACTGGTGGCCGCTTATTCAACACCACAACCAGTGAC TCATCCCAGAACCAAACAGTTCTAGTTGAGTTTGATTCTTTTCCAAACCGAGAATGGGAT CCTCCTGTTGCCCATGTGGGGATCAACAACAACTCAGTTTCATCTGCAGATTACACTCCT TGGAAAGCAAGTTTCCAAAGTGGAGATACTGCTGATGTTTCTATTACTTACAATGCTACT ACTAAGAATATGAGTACCAAAAACACCTCTGATACTCAAGAGAATTCTGCGCTTTCCCAC CAAATTGATTTGATGAGGATTCTACCAGAATATATCTCTGATGGGCTCACAGCAGCTACA AGTCATCTTCAGAAAGACATCAACTTTTGTCATGGGAGTTCAGTTCAAGAAACAAAAGAA AAGACAGTGGAGAGGATAATACTAGAAGCAGGTATAGTAGCTTCAGTGGGTATTCTGATA GCTGTAGTGGTTATATCGTTTTGCATTTCATGGAGGAAGAAGTATAAGAAGAGGGAAGAA GTAGGAGAAGCAATCAACTTATCATCAATCGACGATGACCTTGAAAAGGGATTAGGGCCT AAAAGAGATATCAAATCGAGCAATGTGATGCTAGATTCTAGTTTTAATGTCAAGCTTGGT GATTTCGGACCAGCTTGGCTGATGAAAAACCATGAATTAGTTCCTGAAACTGCTACAGTG TTGGCTGGAACCTTAGGATACATGGCTTCAGAATATATAAGCACAGGTAGAGCTGGTAAA GAGTCTGAGGTATATAGCTTTGGTGTGGTTGCTTTAGAAATTACAACGGGCAGGAAGGCT ATTGATCCTTCGGAGCAGAAGTCTCAAATAACATTGGTACAGTGGGAGTGGGAACTTTAC GGGGAAGTTTATATACTTTCAGGTGTTGATGATGAGACAGGC
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>LITCHI007185.m1 DRNKYGDGLAFFLAPYDSQLPPNSSGGFLGLFSLETAITNNSSNQIVAVEFDSYNYAWDP SNNHVGINVNSIVSVANVTWRKVLPEQCAISATCLTLPFIMSTFLFILFLLPSADSVSFQ ITRFDPDRNNLIYEGDAEPSVGAVEFNCQSYQYQVGRVRYADRVPFWNPKTREQADFSTR FSFVITQTGSPHAAELACFVAPVGSGIPPNSGGGLFNTTTSDSSHNQIVLVEFDTFPNPK WDPNFEHWYTSSLLARFGPAVVMLYTSFIGFFQFPTNSISFKINQFDPDNPDIVYEGDAT AYVGAVEFNSVSYLCCVGWATYAKRVHLWDSGINEMSDFTTHFSFSIDTGGRLFNTTTSD SSQNQTVLVEFDSFPNREWDPPVAHVGINNNSVSSADYTPWKASFQSGDTADVSITYNAT TKNMSTKNTSDTQENSALSHQIDLMRILPEYISDGLTAATSHLQKDINFCHGSSVQETKE KTVERIILEAGIVASVGILIAVVVISFCISWRKKYKKREEVGEAINLSSIDDDLEKGLGP KRDIKSSNVMLDSSFNVKLGDFGPAWLMKNHELVPETATVLAGTLGYMASEYISTGRAGK ESEVYSFGVVALEITTGRKAIDPSEQKSQITLVQWEWELYGEVYILSGVDDETG
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>LITCHI012733.m1 + Up_Stream_Len 2000 TGTCACATATTTATTACCACAAGTATGTCTATTATTTAGCCAAACAACAACCTTCTTTTG GGCTAGTCATTATTCGCATAAACAATAAACATACACATCTTAATATTCCAAAATAAACAA ATTTAATTATAGAGGTTACTTTGATAACATATCATTTTAATTTATTTTATTTTGAAATAT CAAACATGATACAAATTGACTAAGTACTTAAATAAATTATTTTCAGATGGAAAAAGTGGT TTCTCCACTTCCCATATCCACTCACAGCTTAATCCAATGAGGAAATATATATATGTCTGA ATTACATCAAAATTCAATTGGAAACAAAAGCAAGCAATCATTATGGAATACACATACCAA CAACCAAAATTCTATAACAATCCAAAATAAGAATCAAACTTTGTTACATTAAAAATATAT ATATAATCCGAAATTCCATATCAATCCAAAAAAAAAAATTAATAATAAATAAGTCAAACT TCTTTTTTTTTTAACTCATCTCTCAATGATTTAAAAAAAAATTAAAAATAGCCACTAGTC ATAAAAGAAAACCGCTAGTCTTAATTATATGCATATGTATTCTCGAAACATGTACTTCAA CGCATGTGAAATTGATTAACTGCCATGTCTTCTTTAATTTCATCGCATTAGAAAAACTTA TGCTTGAATTCTATATATATATATCAATGAATAATAATATAACAGTCCTTGCTTTAATAA TCTAGAAAAATACAAAATTCTATATATATAAAATTTCATGCTTCCATTACATCAATAATA AACCAAACTAATTAATTTCTCAATGATTCAATATGAATTAGCTCTGATACCACTTGTTGG ATAAAACTTTAATAGATGAAAACCTATACCAAAATCTAGAAACTCATATTAAATCAACAA GAATTATTATAAAGAAAACATACCTGATCCTTATTGACAAATTTGAGTAGGATCGAGTCT TCCACAGTCAAATCTCCTTAGGTTGCTCAATAATTTTCTTCTTGAATAGGGGAGGAGAAA AGAGAGCAAAAAAATACGTTGATTTGACTCGGGGACCATAATCCTAATTATATTCTTTAT ATACTAACTTAATTAGGTCCTCATTAACTCTAATTTAATTAGTATTAGATTTCTACACAT TAAAACACATACCTAATGGATATCTCTAAAGGCCAATTAATAGATAACTTATTTGGTCCT AACTTATTTGGTCCTATTAAAATAGATAGCTCATAATATTATAATTATTTAATATGTAAG CCCATATTAAGAAATATAAAAACCCCAACACCTCTTATATCTGCTATTACAGTCACACCA AGTATGTTAATTTATCTCTTCTATAAGGCCTTCATCTTTCATTTTCTTCAAGCTTGTTAC GTAACTTCTTTTCTTTCTTGTAGACTTTGAGGTAGATACTGGAGGTTTATATGCTGGAAG CATTACTGGCATCGTAATTGCATCACGTGCTGTTGTGACACTGTTGTTGGTTGGCTTGTG GATGAAAGGTTGCTTCGGGGGAAAAGATCTCGAAAACAAAGGTAAGACTGATATATACTT AAGTACTTTCTTTTTTGTCTGCAATTGTTGATTTCTTGAAATTGTGATTATCTTGGAAGA GTCGAATATGTTTGCTCTTCTTGACATTAATATGTTTGGTTAAATTTTATTTTCTTTGCT TTAGTACAGAACTTCGTGCATTAGATCTTCAAACTGGTTATTTCACCCTTAGACAAATTA AGGCTGCTACCAATAATTTTGACTCTGTAAACAAGATTATAGGAGGGTTTGGGCCTGTTT ATAAGGTAATTATGGTTCTCTAGTCTATGCACACATTGGAAAACAGTAGCTAGTGGGAAA AAAAATATTCTCTTCACTATATTCTGAAATGCTTATCTGCTTGACTCCAGGGTACACTGT CAGATGGGGTAGTAATTGCTGTCAAGCAGCTCTCCTCGAAATCTAAGTAAGGGAACCATG AATTTACGAATGAGATAGGA
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>LITCHI027203.m1 GenomeSequence - GGCACGAAAATGGTAGTGTTTATAGAGAGAGAAGAGACTGATGCGCATCATTCAATGCCA TGTGCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTATTTGTATTCTTCAATCCCCATATAACCTTCCTCTA AACTCTCCTCTTCTTCCTCCCCTTCAACTTCTCATTCATCAAATTTCCCGTTTCAATTTC ACTTTCTGGGGTTTTGAATTAGTTTCTGTAAGACCAAAGGCTTTTTATTTAAAGCTGATG ACCTTCTGATTTATACACATATACCCATGAGATACAACACAGTCACATATAAATATATAT ATAAACACAAGAGAATCATTCACTTTTCTTTATCAGAGAATATATAGACCCCCCCTCTCT CTGATCCAAATGGCCGTCCTTTGACTGAAGACTCTCCTCCCAAGATTCCTTGAGAGAGAA AGTTGGCTTCTTTATCTATTTAGAGAGAGAAATTGTTTTGTTTTGTTTTATTATGTAGAG AGAGCAAGTTAGAGAAATGTTGGCAATGGAGAAGGATTTTGATTCAAAGCTTACAATAGA AGGCAATAATTGCCCAAACGTGCAGAGATCTAAGAGCTTTGCATTTAGGGCTCCTCAGGA GAATTTCACCATTCAAGATTTTGAGCTGGGAAAGATCTACGGCGTCGGTTCTTATTCAAA GGTTTTTTATTTATATATTTTTGTCATGTTTAGTTGATTAATAATTTTTATTTATTTTTT GTAGTTTGCTTTGTGAATCCTTACAGTTATGTTAGTTTTGTTTGATATGATGATGTACAA TTTTTCTGTTACAAGTTGTTGGGCTTTTATGATTTCAAGTGGGTGTCATGTCATTAGCCA CTCACACCTGCTTATATTTATTATGCATAGACCAAATGCAATTTGAATCTTTGTATATGC 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