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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI018944 | Chr15 | 10893062 | 10896134 | - | "Transcription termination factor MTEF1, chloroplastic " |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI018944.m1 | 76 | 189 | PF02536.17 | mTERF | Family | 36.6 | 2.60E-09 |
LITCHI018944.m1 | 191 | 301 | PF02536.17 | mTERF | Family | 87.9 | 6.10E-25 |
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>LITCHI018944.m1 ATGCACGAAACACTGACTTGGTCATTTTCCCACCCCAAGTTCCATTTTCCCTCCACTTAC CATGATTTTCCCTCACTTTCTTGCCCAAGGCACCTCCACTTGCCCATATTTTCCATCAAA ACAATCACCCCACTCCCACCCATACCCCCCAGAACCACACAAATCCCTTCCATATCCCCA CCACCACCCCCTCAACCATCCCCTTCTGAATTCCAAGACAAATTGCTCTACCTGGACTCC ATGGGAATCGACTTCCTGTCTCTAATCAACCACCACCCTCCGATCATGTCCACCCCTCTC GCCGACATCAAATCCACCGTCAATCTAATCGCCTCCATGAACTTCACCACGCTTGACTTC CGCCGGATCGTCTCCATGTGCCCGGAAATCCTCACCCGCCGAGACACCGACGTCCTCCCG GTCTTCACATTCCTCCTCCGAGAAGCCAAAGTTAACGGCTCAGATTTAAGGGGAGTCATA AACCGACGGCCCAGATTGCTCGTCTGCAGCGTCAAGACCCGGCTGCGCCCCACCCTATAC TTCCTCCAAAGCATTGGAATTGCCAAGGTAAACAAACACACTTATTTGCTCTCCTGTAGT GTCGAAGACAAACTCATACCACGCCTTGAATACTTCAAAAATATCGGATTTTCGCATAAG GAAGCGACTGCTATGTTTAGAAGATTCCCACAATTGTTTAATTACAGTATTAATGATAAT TATGAGCCGAAATTAAATTACTTTGTAGTTGAAATGGGGAGGGATTTGAAAGAATTGAAA AAGTTTCCGCAATATTTTTCGTTTAGTTTGGAGAATAGGATTATGCCTAGGCACCAATGT TGTGTTGAGAAGGGTGTTTGTTTCCCTCTTCATGTATTATTAAAGACAACTGATGGGCAG TTTCGTCGTAGATTGGATGACTGTTGTAATTCTTCTCTGCCCTTGACCGCGCCTTCTTTG GATTCTCATACTCATACTTTGTAG
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>LITCHI018944.m1 GTCAGAAATACCAAGCTTGAAGCCCGTGAAAAGGTAAGTTGGGGCCAGGCTTTTGTCTTC GTTCGTGTCTCTCACTCTTGAAAGCACAAACATGTGATCCCGAAACTTATTGAAGCCTCG TCGGATTTGAGATAGCAAGCTCGCAATCTTCAAATCACAGTTTTTTGTTTGGATTCTTAT CCTCTACCCATCGTCTCTCTCTCACATTATTATTCCCCAACCAGATAAACAAAAACAGAA TGGAAAACAATCAGTCTCCCTCACAACCAGCCATGTAGAAAATGCACGAAACACTGACTT GGTCATTTTCCCACCCCAAGTTCCATTTTCCCTCCACTTACCATGATTTTCCCTCACTTT CTTGCCCAAGGCACCTCCACTTGCCCATATTTTCCATCAAAACAATCACCCCACTCCCAC CCATACCCCCCAGAACCACACAAATCCCTTCCATATCCCCACCACCACCCCCTCAACCAT CCCCTTCTGAATTCCAAGACAAATTGCTCTACCTGGACTCCATGGGAATCGACTTCCTGT CTCTAATCAACCACCACCCTCCGATCATGTCCACCCCTCTCGCCGACATCAAATCCACCG TCAATCTAATCGCCTCCATGAACTTCACCACGCTTGACTTCCGCCGGATCGTCTCCATGT GCCCGGAAATCCTCACCCGCCGAGACACCGACGTCCTCCCGGTCTTCACATTCCTCCTCC GAGAAGCCAAAGTTAACGGCTCAGATTTAAGGGGAGTCATAAACCGACGGCCCAGATTGC TCGTCTGCAGCGTCAAGACCCGGCTGCGCCCCACCCTATACTTCCTCCAAAGCATTGGAA TTGCCAAGGTAAACAAACACACTTATTTGCTCTCCTGTAGTGTCGAAGACAAACTCATAC CACGCCTTGAATACTTCAAAAATATCGGATTTTCGCATAAGGAAGCGACTGCTATGTTTA GAAGATTCCCACAATTGTTTAATTACAGTATTAATGATAATTATGAGCCGAAATTAAATT ACTTTGTAGTTGAAATGGGGAGGGATTTGAAAGAATTGAAAAAGTTTCCGCAATATTTTT CGTTTAGTTTGGAGAATAGGATTATGCCTAGGCACCAATGTTGTGTTGAGAAGGGTGTTT GTTTCCCTCTTCATGTATTATTAAAGACAACTGATGGGCAGTTTCGTCGTAGATTGGATG ACTGTTGTAATTCTTCTCTGCCCTTGACCGCGCCTTCTTTGGATTCTCATACTCATACTT TGTAGAGTGTTTTTGTTCTAATATTTGTTGTATATTGTTTCTCTTGAAATTGCTAATTAT GGAATTGACTAGTCTTTTAGTTTTTGGAAAACTAGAAAAATACGAGTGGTTGCAACGATG TTTTGAATTTGTATCGAGTTTTTGATTGTCGTTGTGGTTTTAAGATTAAGATTGTGTTCG GAAAGGCACTTTAGTCGATATTTACAAGTGTGCAGCGATTTTCCCAGGCTTGGTGAAAAT GATGTTACAAAAGGTCATGCTGTTTCGAGTGGAACGGACTTGACTCTCTTGTTTGTTCAC CTGCAATAATAATTTTGGTGCCTCTTTGATTCTAATGATCTGCTTCAAATGATGAATCAG AGTGCAATATAGGTTGTAAGCGTAAACTTTTTGAGAGGTCTGTTTTCGTTTTGAGAATTG GTGGTTTACTCATTATAACGTTTCTAGGTTGACTTGGTTTCTGTTGTTATCAGTTAGTGT AATGCACAATTAAAATTTAGTTTTGGCTTATATGAGTTTTATTCATACTGGCATGTTCGT TTAATTAAAGCATGGTAGGATGGGGATTAACTTGTATATATTAAACCTGAGCATCAATGC AGTAATTTCCAGGATAGCTAATACCATTGTCTGAAGTATCATGTTGGATGAGGATATATT AGTTCCAGTTAATCTTTCTTCAAAAAAAAAAAAAAGTTCCAGTTAATCGTTCGGGCTTGC ATGAGTGGCATCTCATTCCCTTTTCGTTTTGAACTCATATACAGTGAATGTCCTGAAATG TATTTGTTTAGCTGAGCCATTAAACAGTCGATAGTAAGAACCTGAAGAAGTAACGTTTTT CTGTAGAAACTAGAATATGTATAGGATATAATGCCAGTCCTTGAGCAGTCCAAGTATTTG CCTAAAAAAATAGTCTCACTAATCTGGTATTTAGTTTTTAAATCATGTTGAAGAAGCAGA TTTAAAAGAGCCTCAATGCACGTGAAGCTATTCCACCCATTACGACACAATCGATGTATA AAGTGCAGATGACAATGAAGTCAATGGCAAACTAACATGTGCCGAGTCCAAACTAGGATA AAAGTAGTATCTGTTGAGTGAAATTTGTAAAATTGGGAGCGACCAAACTAACATGTGCCC TGATAATTTCCACCAAATTATCAAGAATTTCTATAACAGAAATCCAGTTGCTGCTGCTTG GTAACACAATGTTTTCCATATTTCCGTGGCCTTTGGAAATTACGATTCCCCGCCCACGCT CATTATGTCGAGGTCTACTTAGCAGGACAAACAAGTGCACTCAATCAACCACACATGACA CCACCAAAGTTGAAGCTAGAATGGAGTCCAACAGAGCGAAGTGTCCGAGTGAGATCAGGG TAGACTATTGCTACACTGCATAAAGCATGGCTTGATAACATTAAATATATATCTGATTTA CATTGGAGTTATTACCCACCTGTTCATCCACAACTTGCAAAGAAGCCGTTCAGGCACCAG GAGAGTATACCACGCCATGACCTTTATTTGGTCGAGAGCAGGCGTGCATTCATGATCGGT CATGTAGTGGTCCTGATGGACCATCAACCATGTTTGATGTAATGTGTGACATCACCGTTG CCTTCAACACAAATTGTGAACAGGCCACGGTACACATAATGACGTGATAATATCAGTGGC CATTTTTAGTGGAATTGTATGTACCTAGTGAAAATGTATGAATACTGTTAGATCAAAAGT AGGTGACAATTTTATAAATAAATATATATATCAAATTAATAATTGCAACTGTTTCAATTA TTAAGGTAATTCG
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>LITCHI018944.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTAATTACCAAAATATGTGTGCCATCAGTGGCTCCATGCATCTTGAAAGAACTTCAAAGT TTATACATTAATAAGTATAATAATAATATTGATATAAATTGTAATAGCAGTAATAGTAAA GAGTGAATTCCAAATGTTCATACATTATTGATGATGATGATGATGAAGAAACATTTGCGT TAAATTAAGAGTATAATTTTGTGTTTTCCCTTATTTTAGCTAGCACCATGGGTTCAAGTG TGGCCATGATATCTAATGCAATCACACTTAACGCCTTTAGAATTTTGTTGAAATTATTAC TAGTAATGAAATGTAATTGGTTAAATATATCATGTAGGGGTGGGCATCTCCAACCCAACC CGACCATTTTTTATTGGATTGGGTTGTGTTACATCTTAAAAAAAATTAAATGGATTGGGT TGGGTTGGATTAAAATTTTTTTAACTCAACCCAACCCAAACCCGACAAACGTCTATCCCC AATTCTCAATCCAAGATTTTCTCCCCTTTCTAGAAGACCATTTGTTTATGATAAAGATTA AAGACAACTTTTATGTTAAATTTAATCTTTTCTTTACAATAATTGGACTTTATTTGTATT CATTTTATCCGTAATCAAATTACTAAGACTAAGAAAGTTATGAATTAGATCATTTGTGCC TTTATGGTAAATTAAATCTAACTCAATCAACTCAATCCAATCCAACCCAACTATTATTGG GTTGGGTTGGGTTGAAGAATTTATTGGGTTGGGCTGAGTTAAAAAATTTTCAACCCAACC CAACCTGAACTCAAAAACGTCTACCCCTAAATTCATGAGCTTGGCAATATCAATTATTCT GGCCAATACTTCGTAAATATGTGCTAAGAATTTTTTAAAAATAAATATTGTGTCTTATAA AAGTTTTTACAATGATGTACAACTTTTGATACACTTTGATACAAATGTGAAATGTGAATC AAAGATTTGATTCTGAAGCATTAAAACTGCTACACAGTTTATAAAAAGCAAAATAGTTAT ATTTGTACACACCACTCCTTGTTCGAAGTGGATAAGTACGTCCATTCACCCTAAGAGATA AAGTTATAATTTCATCTTTCTTCTATTAAATCATAGAGTAAAAGGAGTGTTCTCATTTTA ATAGGTATTGTTATATTTCGGTTGTGAAAGAAGTCATTTGACATGTTATCTGTGATATAT TTTAATAGGTTCTAACAATCCTCTAATCCGTAAGATAATTTATCTCAGTAGATTCCGATA GTTTTATGGCCTATAAAATAACAATATTAAAAAAAATGGATGTATTTGTTTAAAAAAAAA AAAAAAAATTACTCCACTTACGATATCAATCAATCCTCATACAACATGAGCTGAGCCATA ACAAATTCAGCACCATAATTTACAAATATTGATTTCGGTTTCTTAGCATCGTTTTTTTTT TAAATTTCAGTTTCAGATTTACAAAAGCTTGTCATGATGCTTGACAATGCAAAATTCGTA TAAAGCTTTTGGCAATTTTTCTTCCAGCGTTTTTAACTTATAGTTTTCATTTTAATTTAT GATTAAATTAATTTTGATTGCAAAAATTTTAATGACTATAAGAGTAATTTTAGCATTTTA GTGAAGGATAATGTCAAAATTTAATATTAATAAAAATGTGGGTGCACAAACAGCTTTTAA GGGGTGTACCAATTTATGAGAGCCGTAGGGCTAGTCCAAGTCAGAAATACCAAGCTTGAA GCCCGTGAAAAGGTAAGTTGGGGCCAGGCTTTTGTCTTCGTTCGTGTCTCTCACTCTTGA AAGCACAAACATGTGATCCCGAAACTTATTGAAGCCTCGTCGGATTTGAGATAGCAAGCT CGCAATCTTCAAATCACAGTTTTTTGTTTGGATTCTTATCCTCTACCCATCGTCTCTCTC TCACATTATTATTCCCCAACCAGATAAACAAAAACAGAATGGAAAACAATCAGTCTCCCT CACAACCAGCCATGTAGAAA
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>LITCHI018944.m1 GenomeSequence - GTCAGAAATACCAAGCTTGAAGCCCGTGAAAAGGTAAGTTGGGGCCAGGCTTTTGTCTTC GTTCGTGTCTCTCACTCTTGAAAGCACAAACATGTGATCCCGAAACTTATTGAAGCCTCG TCGGATTTGAGATAGCAAGCTCGCAATCTTCAAATCACAGTTTTTTGTTTGGATTCTTAT CCTCTACCCATCGTCTCTCTCTCACATTATTATTCCCCAACCAGATAAACAAAAACAGAA TGGAAAACAATCAGTCTCCCTCACAACCAGCCATGTAGAAAATGCACGAAACACTGACTT GGTCATTTTCCCACCCCAAGTTCCATTTTCCCTCCACTTACCATGATTTTCCCTCACTTT CTTGCCCAAGGCACCTCCACTTGCCCATATTTTCCATCAAAACAATCACCCCACTCCCAC CCATACCCCCCAGAACCACACAAATCCCTTCCATATCCCCACCACCACCCCCTCAACCAT CCCCTTCTGAATTCCAAGACAAATTGCTCTACCTGGACTCCATGGGAATCGACTTCCTGT CTCTAATCAACCACCACCCTCCGATCATGTCCACCCCTCTCGCCGACATCAAATCCACCG TCAATCTAATCGCCTCCATGAACTTCACCACGCTTGACTTCCGCCGGATCGTCTCCATGT GCCCGGAAATCCTCACCCGCCGAGACACCGACGTCCTCCCGGTCTTCACATTCCTCCTCC GAGAAGCCAAAGTTAACGGCTCAGATTTAAGGGGAGTCATAAACCGACGGCCCAGATTGC TCGTCTGCAGCGTCAAGACCCGGCTGCGCCCCACCCTATACTTCCTCCAAAGCATTGGAA TTGCCAAGGTAAACAAACACACTTATTTGCTCTCCTGTAGTGTCGAAGACAAACTCATAC CACGCCTTGAATACTTCAAAAATATCGGATTTTCGCATAAGGAAGCGACTGCTATGTTTA GAAGATTCCCACAATTGTTTAATTACAGTATTAATGATAATTATGAGCCGAAATTAAATT ACTTTGTAGTTGAAATGGGGAGGGATTTGAAAGAATTGAAAAAGTTTCCGCAATATTTTT CGTTTAGTTTGGAGAATAGGATTATGCCTAGGCACCAATGTTGTGTTGAGAAGGGTGTTT GTTTCCCTCTTCATGTATTATTAAAGACAACTGATGGGCAGTTTCGTCGTAGATTGGATG ACTGTTGTAATTCTTCTCTGCCCTTGACCGCGCCTTCTTTGGATTCTCATACTCATACTT TGTAGAGTGTTTTTGTTCTAATATTTGTTGTATATTGTTTCTCTTGAAATTGCTAATTAT GGAATTGACTAGTCTTTTAGTTTTTGGAAAACTAGAAAAATACGAGTGGTTGCAACGATG TTTTGAATTTGTATCGAGTTTTTGATTGTCGTTGTGGTTTTAAGATTAAGATTGTGTTCG GAAAGGCACTTTAGTCGATATTTACAAGTGTGCAGCGATTTTCCCAGGCTTGGTGAAAAT GATGTTACAAAAGGTCATGCTGTTTCGAGTGGAACGGACTTGACTCTCTTGTTTGTTCAC CTGCAATAATAATTTTGGTGCCTCTTTGATTCTAATGATCTGCTTCAAATGATGAATCAG AGTGCAATATAGGTTGTAAGCGTAAACTTTTTGAGAGGTCTGTTTTCGTTTTGAGAATTG GTGGTTTACTCATTATAACGTTTCTAGGTTGACTTGGTTTCTGTTGTTATCAGTTAGTGT AATGCACAATTAAAATTTAGTTTTGGCTTATATGAGTTTTATTCATACTGGCATGTTCGT TTAATTAAAGCATGGTAGGATGGGGATTAACTTGTATATATTAAACCTGAGCATCAATGC AGTAATTTCCAGGATAGCTAATACCATTGTCTGAAGTATCATGTTGGATGAGGATATATT AGTTCCAGTTAATCTTTCTTCAAAAAAAAAAAAAAGTTCCAGTTAATCGTTCGGGCTTGC ATGAGTGGCATCTCATTCCCTTTTCGTTTTGAACTCATATACAGTGAATGTCCTGAAATG TATTTGTTTAGCTGAGCCATTAAACAGTCGATAGTAAGAACCTGAAGAAGTAACGTTTTT CTGTAGAAACTAGAATATGTATAGGATATAATGCCAGTCCTTGAGCAGTCCAAGTATTTG CCTAAAAAAATAGTCTCACTAATCTGGTATTTAGTTTTTAAATCATGTTGAAGAAGCAGA TTTAAAAGAGCCTCAATGCACGTGAAGCTATTCCACCCATTACGACACAATCGATGTATA AAGTGCAGATGACAATGAAGTCAATGGCAAACTAACATGTGCCGAGTCCAAACTAGGATA AAAGTAGTATCTGTTGAGTGAAATTTGTAAAATTGGGAGCGACCAAACTAACATGTGCCC TGATAATTTCCACCAAATTATCAAGAATTTCTATAACAGAAATCCAGTTGCTGCTGCTTG GTAACACAATGTTTTCCATATTTCCGTGGCCTTTGGAAATTACGATTCCCCGCCCACGCT CATTATGTCGAGGTCTACTTAGCAGGACAAACAAGTGCACTCAATCAACCACACATGACA CCACCAAAGTTGAAGCTAGAATGGAGTCCAACAGAGCGAAGTGTCCGAGTGAGATCAGGG TAGACTATTGCTACACTGCATAAAGCATGGCTTGATAACATTAAATATATATCTGATTTA CATTGGAGTTATTACCCACCTGTTCATCCACAACTTGCAAAGAAGCCGTTCAGGCACCAG GAGAGTATACCACGCCATGACCTTTATTTGGTCGAGAGCAGGCGTGCATTCATGATCGGT CATGTAGTGGTCCTGATGGACCATCAACCATGTTTGATGTAATGTGTGACATCACCGTTG CCTTCAACACAAATTGTGAACAGGCCACGGTACACATAATGACGTGATAATATCAGTGGC CATTTTTAGTGGAATTGTATGTACCTAGTGAAAATGTATGAATACTGTTAGATCAAAAGT AGGTGACAATTTTATAAATAAATATATATATCAAATTAATAATTGCAACTGTTTCAATTA TTAAGGTAATTCG