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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI018943Chr151088668610891265-Transcription factor E2FA

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI018943.m1149212PF02319.23E2F_TDPDomain91.72.10E-26
LITCHI018943.m1228328PF16421.8E2F_CC-MBDomain1173.70E-34
LITCHI018943.m2149212PF02319.23E2F_TDPDomain91.82.00E-26
LITCHI018943.m2228328PF16421.8E2F_CC-MBDomain1173.60E-34
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>LITCHI018943.m1
ATGTCCGGCGCCGCTCGAGCCTCCGCCCCGCACACGGCGCCGCCACCGCCTTCTTCAGCC
CCGGTCGTGCCTCCAATCAGGCGCCACCTGGCTTTCGTTACTACAAAGCCTCCGTTTGTT
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AGTGAAATTCAATCGGGTGAATTGGTCAGCAGTCCTGGATTAATTAACATATCCAACTCT
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GAGAAGAAGCTTAAGAACAGAATACGTTGGAAGGGACTTGATAATTCCGTGCCAGGGGAG
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GATTTTGTAATGCCCGATGTCTGTACCCTGAGACCACAAACTCCACCGTCTAGGATTGCA
GATATACAAACTAGTGATATTAATTCTGCTCATAGATGA
>LITCHI018943.m2
ATGTCCGGCGCCGCTCGAGCCTCCGCCCCGCACACGGCGCCGCCACCGCCTTCTTCAGCC
CCGGTCGTGCCTCCAATCAGGCGCCACCTGGCTTTCGTTACTACAAAGCCTCCGTTTGTT
CCGTCTGAAGATTACCACCGATTCTCTTCTCCCGCAACTACTCGTCGAGCCGCCGATCAG
GAACCTGATGCTCTTGTCGTCAGATCTCCTCTATTAAAGCGGAAGAATGGGCCGGATGAC
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AATGAAACCCTTATAGCAATTAAAGCTCCACATGGAACTACTCTTGAAGTTCCTGATCCT
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CAGATGTGCTCTGGCCCTGATTCTTCCCAGGATTTTGCTGGGGGAATGATGAGAATTGTT
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ACAGATATGTGGAAGACCGACTGTATCCTTCGTCTAATATGCTGTCCTCTCCTTTATACG
TGTTTGCTTCCATCTTCTCCCAGTTCTCTCTTGTTTGAGTTCATGATATTGTTGTTGGAT
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>LITCHI017889.m1
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>LITCHI017240.m1
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GGCAAGGGTAGGTCTGTGACCACAGATTTTAAAACCCATTAAAACGACGTTAGTTTCTTT
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AAATGTCCAAAGATGATGATCGGCGAAGTCCCCACTCGATCAAATCCCACCATCCAAGTT
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AGCCCTTCTGTCAACTTTAACGGCAATGCCAATGGCATCGACTCACTAATGGCTCTCCAG
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GAGAAGGCCCGGAGGCGTGACCCGAGAAAGTACCACTACTCGGGCACTGCCTGCCCCGAC
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TGCTGGCTCCACCCGGCACGGTACCGTACCCAGCCATGCAAGGACGGCACCAATTGCTGC
CGCCGGGTCTGCTTCTTTGCTCACACTCCGGAGCAGCTACGTGTCCTGCCTCAGCATAGT
CCCAGAGGAAACGGAAACGGAAACGGGTCCGGATCGGGTGACCCGGACTATGGGTCTCCT
GTGAGGCGTCGGTTTGATTTTGACTCCTATGGTGGTGGTGGGGGGTCCTTTGTTTCATCT
CCTACTTCCATTTTGACTTCACCTCCGATCTCCCCGCCTTCTGACTCGCCGCCGTCGTCG
CCCAGTTGTGGTGGATCGTATAACTCAGTGGGTGAACTCGTGGCTTCGATGCGAGGTATG
CATGTCGGGAAGGTGAAACTGAGTGGTGGTGGTGGTGGAGGATCCGGTTGGGGTTTGCAA
ATGGGTTCTGGTTACGGTTCTCCTCGCGGTTCGATTCTCAAACCCGGTTTTTGCAGCCTA
CCTTCAACTCCCACAAGGACTCCGGTCCGGTCGGGGTTCGATCTCTGGGAGTGTCCCTGC
GAAGAGGAGCCAACAATGGAGCGAGTGGAGTCTGGGAGGGACTTAAGGGCGAGGATGTAC
GCGAAACTGAGCAAGGAGAACTCACTCGGCCGTGGCGAATCTGCCACGTCAGCTCCAGAT
GTTGGGTGGGTGTCTGAGCTGGTGAAGTGAACCCCCAAGTGTCCACGTACAAGCGGGGGT
TCCATTTTGGTTATTTTCAATTATTTTTGTTGGCTAATTGTGGAAACTAAGGTAAGCAAT
GATCGATCGGTGGCCTTTTGATTCTTCTGACTTTGTGAATATATGCAGTTGATTATGATG
GAGATACCGCTGTGTAAATATTATGTTGACGGCAAGAGAGATGTGGAAAGTCTCTGTTTT
GTGGTGCTTCTTTTTGGACAGAAAACATAAGAAAAGATTGCAACTTTTGTATAGAGAAGG
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ATTCCTAATCGTTGTAATATAATGTTTATATTTTTGTTCATTTCTTTGTTCATGCACACT
TGCTCATATTCAGAGTTTGATCTTTGAATGCTTCTGAATGCTTCTATTCCTCAAGATTTA
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CGTGAGATTTTTTTATGTTCGTGGAGATCTCTACATCATTGATATTATAATGATAAACAC
TGAATGAATCAAATCCGGG
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>LITCHI017240.m1 -  Up_Stream_Len 2000
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ATTACTTAATCTTAAAGACATATTGTTGATGGAGACTTTAAAATATCTAATATAAATATA
ATAATACTTGAAACTAATCAGACTTCAAAGTTGGAATTCGCTCGTCACGTTGTTAATTAA
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GGGTAGGGCTATTGACTATTTCGATATTGTCGTGTTTAGGGTTAAAAGTGGAACTAGATT
GATAGGACCAAAAGAACGTCGTTTTGAAGTTATCTTTTGATAAAGGCGCCGTTTGGCATT
AACCAAAGCTATCCAACGACCAACTCATTTAAGTAATGATACTTTGGTTATGTACGCGCA
TGTTAGAGCAGTGAAAGGGACACTTGCTAAAATGTACAGGGAGTGATCTCTGATGACCGA
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TGCCCCCTTGTGCATGCCTGCCACTCGCGACTCCGTTTTCGTCTTCCACGTGGCCCACCC
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TATTTATGAATGTCTTAATTTAAAGAAAATTTGTTCACCATGGAATAATTATCTTTATTA
TAATAATATTATGATGCTTATTAAACTATTTTATAAAAATAATAATAGTTTTTAATAATA
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TATTTCAAATATGAATCAATTTGATTTAAATGAATAACAACAATCATATATATTTTTTAT
TTACAGTCTCTAATTTTTCAAGTAAAAACATCATAATTGACTTTCGATTTTAAAAGTATA
CATTTAAGTAGTTAATATCAACATAAAAAAATAATTATTTTATCAATTCAATAATATTTA
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TCAAGATTTCGACGAGAATCATATCATTTGTCTCGCGATATGCGAGACTACTTGCCCCAA
AATACCCCTGGCGGATGGGTCCCTTGCAGGTTAGCTTCAATATACCAACAAAGAGAGATA
ATAGGGTCCCTAGTAAAAGATTATACTTTCTTCTCAGAGTCATTTTAAAGGCGATAAAGA
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AGATCAACGGCAAGGGTAGGTCTGTGACCACAGATTTTAAAACCCATTAAAACGACGTTA
GTTTCTTTCCACGTTTTAACCGTAGGGGCAGTGGAGAGGTACATTTGTCAACTCAACCAT
GGTTAACTCGAACCTAACCTTGGTTAAATATGCAGTTTATATTCTAGAGAGCATCCGCAG
TCTTGTGTAAATGTCCAAAG
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>LITCHI017240.m1 GenomeSequence - 
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TCGACGAGAATCATATCATTTGTCTCGCGATATGCGAGACTACTTGCCCCAAAATACCCC
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GGCAAGGGTAGGTCTGTGACCACAGATTTTAAAACCCATTAAAACGACGTTAGTTTCTTT
CCACGTTTTAACCGTAGGGGCAGTGGAGAGGTACATTTGTCAACTCAACCATGGTTAACT
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GTTGGGTGGGTGTCTGAGCTGGTGAAGTGAACCCCCAAGTGTCCACGTACAAGCGGGGGT
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GTGGTGCTTCTTTTTGGACAGAAAACATAAGAAAAGATTGCAACTTTTGTATAGAGAAGG
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TAATCTCTCTCTAATCTTAATTTTCACGGAATATTATCATCCTTTGTAATTCTCTTGTTT
ATTCCTAATCGTTGTAATATAATGTTTATATTTTTGTTCATTTCTTTGTTCATGCACACT
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GATTATGGTTAATGTGTAGCTTGAAAGGGTCTCTGGATTGTTCTTGTTGACTATTTGTAA
CGTGAGATTTTTTTATGTTCGTGGAGATCTCTACATCATTGATATTATAATGATAAACAC
TGAATGAATCAAATCCGGG