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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI018852 | Chr15 | 9837493 | 9839478 | + | Glucosamine 6-phosphate N-acetyltransferase |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI018852.m1 | 81 | 101 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 14 | 0.049 |
LITCHI018852.m1 | 173 | 275 | PF00583.28 | Acetyltransf_1 | Family | 55.2 | 8.40E-15 |
LITCHI018852.m1 | 188 | 276 | PF13508.10 | Acetyltransf_7 | Domain | 34.1 | 2.80E-08 |
LITCHI018852.m1 | 197 | 278 | PF13673.10 | Acetyltransf_10 | Domain | 25.5 | 1.10E-05 |
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>LITCHI018852.m1 ATGCCTCGCAGAAACTTTGTTCCTTGGATGGCTATGATTACTGGGTTTTCTCAAAATCAG AATTTTGTAGAAACTATTACAACCTTTTGCAATATGAGAATTGCCCAAGAAAGCTTGAAT CGGTTTGCATTTTCCAGTGTTATAAGGGCCTGTGCGTCTCTCGGGCTTGTTGAGTTTGGG GGGAAAATGCATTTTCATGCTTTGAAATGTGGGTTTGGTTGTGCGTTATTTGTGGGGAGT AACTTGTTGGATATGTATTCAAAGTGCGGCGAGATGGGAGATGCTTTTAAGGTTTTTGAA GAGAAGCATTGTCTTGTTGAGTTTGGGTGGCAAATGCATTTTCTTTATTCCCAGTATATT AGGCTGAGAACTGAGATCTCACAGAAAAGGATGCAGAGTGGTGCCTCATCCAAAGAAGAA GACAAGTTTCGAGTCCGAAAATTGGAGATCTCAGACAAAAGCAAGGGTTTCATAGAGCTA CTGCAGCAACTTAGTGTTTGTGATTCTGTGTCTGACAAACAATTTGAAGATAGATTTCAA GAACTGATCTCCTGCGGCGATGACCATATTGTTTGTGTGATTGAAGATCATCAGTCTGGG AAAATCATTGCAACTGGGAGCATATTCATCGAGAAAAAGTTTTTGAGGAATTGTGGTAAA GTTGGGCACATTGAAGATGTTGTAGTTGATGCCAGTGCTCAAGGGATGCAATTAGGAAAA AAGGTTATCGAGTTTCTTGCTGATCATGGTGAGGCTATGGGATGTTACAAGGTAATACTT GATTGCAGTCTTGACAACAAAGGATTCTATGAAAAATGTGGGTTCAAGCAGAAAGAGATT CAAATGACCAAGTACTTTGTTTGA
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>LITCHI018852.m1 + Up_Stream_Len 2000 ACATCCACATTGTAGTTACTCCAAACAGGTCATGTCCCTAATTAGTAATTCAATTTAAGA AATCAATAAAAGATACGAATTTTCTTCAATGCTTTATATTACAGCTGCTTTATTGATTTC TTAAAATCATGTCATGAAAAGCGCTTACGCAAACCTGTTAGTTGAGGTCGCGACCTTTTG GACAACTCGCTATTAAACTATCTTAGCTGAGGCTTCGATCCACTGGAGTTAGCTAGTTAT AACGCTGTTAGCTGAGGCCGACCTACTGGACAGTTCACAAAAGCATGTCACTATGATAGG AGAGGTTACAACCTACTGGACAACTCGTTATTACGCTATCTTAGCTGAGGCTTCGATCCA CTAGAGATAGCTAACTAACACTGTTAGCTGAGGTCACAACCCCCTACATAGTTCGACAAA ATATTGTTATAGTAGGTGAGGTTCCGACCCCCTACATAGCTCGCAACAATGTTTTTATAT ATTATGCTGATTGAGTTCCTGAACCAAGTTATAGTCTGGAACCACAGTTCGTGATGGTCA AGCGACCTTTCAAGCTTTCATAAGGTGTTTTTACCTTTAAGCAATACATTAATTAACACA TTGATCACCTAGATTTTTTGTTTACAAGAAAAACCAGGGGAATGAAGCACAATCATGAAA GGCTTCAAAGAAAAGCACTCAGCTCTGCAGCCTCAGTAGAGTCACCACAAGGATGGGACA AAATCTGAAAAGGCACCAAGGCATGTCGGGACGTATAGCTTTTACCAGCGGACTTTAGCT CCTAATTTGAAAATCACATTGAGAGCTGGGGGGTTTATGTTATGGGTATTTTTTGGGACT ACAAAAATGGGCTGATAAAAGCCCAAAGAACCAATCCAATAACTGATCCAATTGAAGAAG TCCAGAATCTCCAACACCCAGCTTAGGGGCAAGCTCGTAGATCGCTAAGGTCATCTCAAG TCGCTGGAAGCCCAGATCCAGCTCGCCATCAAGTCCAATGGTCAGGTCACAACATCAAGG TCGCTTCATCCTTTTTCAGTTCACGACCTCAACCAAGACCGCCTCGGTACATATCCAGCT CGCGTAAATGAGTCAGATTGTCGAGATCGCGCTAGACCGAACCTCTTGGGCCCAGATTTC CCGACCTCGTGCCTACAAGATCTATACAATCCTAAATCCCAAGGGACCATTAATGCAGTA TGACTATGATAAAATTTTAGTCAATACAATAAATACTATGTCAAAGTAGTTGATCTCTTT ACGTGTACATCACTCAATTGCATTCTCCCTTTCCTCTATAAATAAGGGGAAAAATTCATT GTAAAGAGAGAGCTCATTTACTAGTGATATAGTCACTCTGTAAAAATATATTGAAAGTAT CCCATGGATGTAAGCTCTATTGCCAAACCATGTAAAAATCTCTATGTAATCTCTTGTTCT TCTTCTTTCCTCTCTTTGGTATGCTTTGTTGCTCTTTAATTACAGGTATTGGGAGTAGAA TTTCTTGGTCGATCGATTCCGAACGTCGATACCTTTAAAAATAATTTGTTAAATCTTTTC ATATTGATTCTAGGGTAATAATGAATACCACTGAGAAAAAGGTGTGAACTAGAGTAAATA AATAGATAAATAACTAGGGCTGCATGAATATTTGAAAAAAATAGTGGGATTTCATAATTA TCCGTAACTATCGGGGTACAATATAATTTCTCTGCATAATTGCGAAGATGATCGTCGTCT TCTAAAATCTCAAAACACTATTTCACATATATTTGCAGGACTGTCAGCCACTTGGTTCGT GGAAGAGGTGAGCTTGGCAAAACATGTCTCATCGAAGCCTCACTTTTTAATATCCATTTA AATTTTATCTTGGCATCCCCAATTGCTTCACTTTTTGTTTATTCCGTTATTTTGCTATAT TCATCTGTTACTTGTTGTTGCGCTAATTTCTCTTATTTGCCAATTTAATATAATTATACG CACACAAACTGTTTGACAAA
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>LITCHI020608.m1 GenomeSequence + GATTTGCGCTCTCTCTCTCTGGGTCCAAATAATTTCTTATTAACGAAAAGACACTATTTT TCTGACAAAGACTCAACTCCTGCCGCGGCTTTATATGCTCTCGCAGGTCTAGGAACCTCG ACTTTGTCTCAAACGCGTCCAAAACCAGAACCCTCTCATTTCTTCTCTCAAACCCACCTC CACCTTCACATTTCCCAGTCTACCTCCTTGAGTTTCACTGCAAACTCCAATCCTCCATCA AACTTCTCTTCATATACTTTCCTTTCCTCATCGCTTCATTTTTTCCCATCTAAGTTTTTA TATTTTCAACTCTGTTTCTAGACAGAACTTGTTGAGCCTCTTTCCTCTGTTTCTAAATTC TACAATTGTCAGTAGCTAGGAGGTGTCTGTGGAGACTGAATAAAAAACATGTGTGCTTTT ATTGATCTTTGTCTTGAGAATTAAAGGTCTTGGTCTTTTTTTTGATGACTTTGGATCTGT CTCTGAATGGGGATGTCTTGTGTCTATTAATAGTTGAAACTTTGATTTTACTTGGGAAGA AGAAGTGGTACACACGAGGAGAGCTTGCTTGATTTGGTTTTGTTAGTTCTTCTTTAATAG AGTTAGAAGGGCCAAAAAATGGGATCTTCAAATGAATTTTTTGCATCTACACAGTTCAGT TTAGACCCCAAGTGGCTAGTTGATCCTAAGCAGCTTTATGTTGGGCCAAAAATTGGAGAG GGAGCTCATGCTAAAGTATACGAGGGAAAGTATGTCAATTTGTTGTGTCTTCTGTTTCTT TTCTCTTGATTCTAGTTCTTGATCTTCATATAATCAATTAGGTTCTTTGATATTTAGAGT AAATTTAATTATCTGTGTTTGTTGACTTTTTTTCTGTTTTCTTTATTTTTTATAAACTAT 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ACAAATATTACATAATACATCTCTTATAAGAAAATGTCAATCTATTCCATAGGACTCTGA GTAGTCTCCGATACCTTTATTAACTTTGGATTCTCATTCTTTCATGAATACAAGTATCAT ACCAGATGGATATTTAGGATTTAGGAGTGGAGGTTGCTGTGATGTATTATCATTGTAATA TAGGGTCATCCAAAGGCCTTGACTCCTTACATCCGACCACTGACCCGGGAAAGAGAGAAG CCATTCTGATTATTTAACTCAAATTAATTTGTTTGTACCAAATGGTTTGAAAGTCTACGC TTTGTTACAACATTGTCAATCTGTATTGATGTTTTAATACAATACGTTGCATATTCCCAA CTTGAGCTTTGCTTTTCCTGATTTTAGGCTTGTTTGCTCCTAAAAGATGCAGCATCCCTG TTACTGGGGAACATAATCCGGGCCTGTTTGACATGCCATGTAAAGACTTGATAGTTGATA ATTAATGAGAACTTCTGTGCACATGAGACTTTAAGCTAAAAATATCTTTTAAATGTCATG CACAACATATACAGGACCTAATTTGGCTGCAAATTAACACCTTTAGCTTCAGTTTCAAAG AAAGTGTTATATTTCAAAGATTGCTCTACAAGGTTGTCTAAAGTGTTGACAAATAC