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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI018778Chr1589702358975033-Histone deacetylase HDT3

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI018778.m1391PF17800.4NPLDomain44.91.70E-11
LITCHI018778.m2391PF17800.4NPLDomain451.60E-11
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>LITCHI018778.m1
ATGGAATTCTGGGGTGTTGAAGTAAAAGGTGGGCAACCACTCAAGATTAATCCTGGTGAT
AACAAGATTGTGCATCTTTCACAGGCTTCATTGGGTGAGGTGAAGAAAGGAAGTGAACCT
GTATTTTTGTATTTGAAAGTTAATGATAAGAAGCTTGTTCTTGGAACGCTTTCTGCTGAG
AAATTCCCTCAGTTGAGTTTCGATCTTGTTGTTGAAAAAGATTTTGAGCTGTCTCATAAT
TGGAAAAACGGGAGTGTCTATTTCACTGGATATAAAATTCATGCTGATGAAGGAACTGAC
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GATTCTTCTGCTGCGCACCAAAAAGTGAAGGATGCTAAACCCAATCAGAAGGCTGAAGAT
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GCCAAGCACGCTGCAGCAGTGTGA
>LITCHI018778.m2
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AACAAGATTGTGCATCTTTCACAGGCTTCATTGGGTGAGGTGAAGAAAGGAAGTGAACCT
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TGGAAAAACGGGAGTGTCTATTTCACTGGATATAAAATTCATGCTGATGAAGGAACTGAC
ACTGAGGATGATGGTACTCCTGAGTATGATGATGGTGTGAAGGAGGTTCCACTTACCAAC
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GATGAGAATCCAAATCTGGTTAATCATGAGGCTGAAAGTGATGAGAGTAGTGGCGAAGAG
GATGAAAGTGATGAAGATGATGATGAAGACACTGATGATAGTGAGAGTGATGATGAGGAA
GAGGAGACACCAGCAAAGGCTGAAGTAAGAAACAAAAGACCTGCAGATTCTGCTACAAAA
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GGGATTAGTTACACTGCAACTCCACACCCTTCAAAGCAGGCTGGGAAAACACCTGCCAAC
AGTGACCAGACAAAGCAGCAATTTAAAAAATCGGGTGGGTCATACCCCTGCAAGTCTTGC
AACAGGTCATTTACCACGGAAGGAGGTTTGCAAGCTCATACAAAAGCCAAGCACGCTGCA
GCAGTGTGA
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>LITCHI017166.m1
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TKTQAQSSVSISTDLPQASRVTSSRAMPMHTEKLKGKLHYLVYRVHDASYSAEAMERRVH
NHSRPDVDMQHRSSRAHNVNSKNLTEKHIMSNAAVPSSSFALPSAFKRNFPKAEGTDETT
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>LITCHI017166.m1
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GGTGAAATATATCTTGCTACTCATTTGGAGACCAACGAAATCGTCGCTGTCAAGATTGAG
AACAGCAAGACGAAGCACCCGCAGTTGCTTTATGAGGCCAAGATATATAAAATTCTTCAA
GGAGGAGGTGGTGTTGCAAGCATTAGGTGGTGTGGAGTGGATGGGGACGATAATGTTCTC
ATTTTAGACTTGTTGGGACCGAGTCTTGAAGATTTGTTTGTTTACTGCGGGAGGAAGTTT
TCACTGAAGACGGTCTTGATGTTGGCTGATCAGATGATTACGAGAATAGAGTATGTACAT
TCTAAAGGGTTCCTGCATAGAGACATCAAGCCTGATAACTTTCTCATGGGTCTTGGCAGA
AAGGCGAATCAGGTCTATATTATTGATTTTGGACTTGCAAAGAGATATCGAGACCCCACA
ACAAACCGCCATATTCCTTACAGGGAGAATAAAAACTTAACGGGGACTGCTCGTTATGCT
AGCTGCAATACTCATCTAGGAATTGAGCAAAGTCGCCGCGATGATTTGGAGTCCCTCGGC
TATGTACTTTTGTATTTCTTAAGAGGAAGCCTCCCTTGGCAAGGCCTGAAAGCTGCCACA
AAGAAACAGAAGTATGACAAAATATGTGAGAAGAAGGTTTCAACCCCCATTGAGGTCCTG
TGCAAGTCTCATCCTGTGGAGTTTGCATCCTACTTCCATTATTGCCATTCTTTAACATTT
GACCAGCGGCCTGATTATGGTTTCTTGAAGCGCCTTTTCCGTGACTTATTCACTCGAGAA
GGATTTGAGTCTGATTACGTGTTTGACTGGACGGTTCTTAAGTACCAGCAGGCACAAAAG
ACAAAGACTCAGGCCCAGTCATCTGTTAGTATTTCTACCGATTTGCCACAAGCTTCTCGA
GTGACTAGCAGTCGAGCAATGCCTATGCATACAGAGAAACTTAAAGGCAAGCTCCACTAC
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AATCACTCTCGTCCAGATGTGGATATGCAGCATAGATCATCAAGAGCTCATAATGTGAAT
TCTAAAAATCTGACCGAGAAACATATCATGAGCAATGCAGCAGTGCCATCATCTTCATTT
GCTCTTCCCAGTGCCTTTAAAAGAAATTTTCCAAAAGCAGAGGGGACAGATGAAACCACA
AATGTAGATCGAGGAAATGGGAAAAGAACTGGTGCTTCGAGTAGCTGGATGCCATCATTT
CAACGAACTTCTTCTGCTAAGTAATCAGAGTTGAATTCCATGAATTTGGAGGAATCTGGA
AATACAAATGTTGCAAGTGTCATGAAGTTCCGCTAGCTTGAATTCTTTGCTGAAAGTTAT
GCCAGATCGTATAATGTAATTTTATAAGGGGACGACAAGCACAGACACATTGAATGGTGC
TGGGACCTGGCCCATGAAAGCTTGCTTTGTTTCCTGCATGCATAGATGGGAAAATTGACT
AAGGGCAGATTCATGTTTGATTGTTCGATGTATTATATGATTCTCTTGCTCCCTTCTTAT
TGCTTTATGTTTCTGGAATAAAATCCTGGATGTTTACCTGGATCAGTTTACCTCGTCCTT
CAGAATGTTAAAAAAGGACTAATCTAGTGTTTCAGATTTTATATGATTGAGATTTTGGTT
TGAGAGAAAGGTTTAACTGATGGATGGGAGAGGTCACCATGCATTGATGGGAAAATGAAG
ATTGTTATGTAAGCCAGCCACCATGTTTGCTAAGTATATGGACTTTTGGAACTTTAAATA
TTATGATGGCTATGAGGGAAAACAAGATTTGGAAGCCGTCACTGAAGATGTAGTTATGGC
TGATGTTTTCATAACTAAAAATGAAAGCTTATGCGAGGAAGAGGAAACCATTATGGACTG
AGGGGCATTTTGATACCCAATATCCTCTCTAGATGCTACATGTGTTGATGCTCGTGTCCT
TGAATATTTTTCACCAACTATTCCGGGGTTCAAGAGTTCAATTTTCTGGTTGTTACAGGG
TGAAGAATTTCACAAAAGAGGCAGACAGATCCGAGTATGGTAGATTATTTGCTGTCTCTA
GACGGGTCATGGCTCTTTGTAGAAGCTAGATTGAATATGTTCAACTTGCAGTAATCGGAG
AAATTCAGCGAAAAATGATCTCTATATTTCAGTCCATAAGCTGGTGATCGAACATTTGAT
TGCAGACCCATAGTTCGCACGCCCCCTCCTGAGTCTTGATTATTATATAAAGCTATGTTT
CTGAAAAGAAGTATATACAAGTTCGCTCTACTCTCAAAAAACAATCGAATTTGTGTTAAA
TCTAAATATCTAATACTGGTCCTGGGTTCCTGGTCCTGGCCCCCGGACATATCTCCTAAG
ATTGCTTGATTCAATCAAAAATTTTACAGACACAGGACCAAGTGGTGTTACCATCAATAA
TTGAAGTGGTTCCTAGTTGGGGAAAATGAAAATTAACTCGAAGGGAGAACGAACAAGAGT
AAAATATTGCTGCAATTAAAGATAACAGTTGGTGCTACCATTAAGGCACACAGTCGTGTA
TAAATCTATAATACACTAAGCTTCTTGAGGCTCCTATGGATTCCACAGGACGGTCCTGTT
TGGGTTGAATTGTGATTGTTAAATGATAATGACCAACAAAGGAAAATGGTGGATCCTAAT
AACCTACCCTCATTGTAGCCTTTGTAGAAGCCTTAAGAGATGATCCGCTTTGGAAATCTA
AAATCACGATGATTAAAGAATTGATTAACGGAATAATAACTTAATCAAAATGTTTACATG
TTGGTGGAGTGTGGGACCTTCAAACAGGGTAGTGCGTGGTTTGAATTGCGAGACATGATT
GTACTTTCTTCCCCTCTTTATCTTGTTTTATTTGCAAAGAACTGGACATGATTACACTTA
AAGCAACAATCAGAGGGTTGACGCAAGTCACGAAGGCCCTACTTGAGTTGAGTCTCGGTG
TGTCAGAACAAAAAAAAAAAAAGGAAATGCCAATTTTCCCCTATTAAGAGGAAAAATGTT
GCGTGCATCATCATTACGTGGATATTGTTATTTAATGAAAATGATTTTGTAATACAATTC
GATGGAAAGATACATCATGTATTTAATGTATTATTTAGGTAGGCCAAAAGAAAGATCCTC
ACCGTGTCCTAAGATTTAGCTTTTCCTTGAATTGTTTTCAAATCTATTACTTTGTGAACC
GAAACACTTCTAATTCTAGATTTAACTTTTATGGAACCAATTGACAGTCACGTAGC
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>LITCHI017166.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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TGTCTGCAGGGGCTTTTCCATCCTGCCCGGAAGGTTAGGGAAGTGTACTGGAAGATTTAC
AACTCCCTATATATTGGCTCGCAAGATGCTCTTGTGGCAGCTTATCCAACACTGGATGAT
GAGCAGAATAACATATACAGTAGGCCTGAGTTAGTGATGTTCATCTGAGTGCAGCAACTG
AGTTTCAGCTAGAGAGGGGAAGAAGAACGATGCAATCATGTTAGGGCTTGTGATGGACAT
TTATTTTATATTTTTTCTGCTGTAGTCTTATTTAATTCCATGAGTTACTATATTGGTTGA
TGTATGCATATATGGTACTCTTGACTTTGTTGATGCTGGTACTTTTAGAAATGGAAACCA
CATGGTGGTGGTGTTTCCTGCAATTTGCTGTCTTATCTCGTGAGTTTCATTGCAGATTCA
ATACGCAGACTGCTTAAGGTGTTGATAATGAATAATCTGCAGCATTTGCGAATCAGGTGA
TTGAGTAGCTGGAGCTTTGCTGAAAGCTCCACCAACTGAATGTTTGGCTGAGGATGTCTG
GTGAATTTACAACTTCGGTTGTAATGTGTTTTTTAAGTACTTGACAAACTTGTCTTGATT
TACTGCCTATTGTAATAATATGATTGTTTTGTTTTGCATAAAATGCTGTCTGCGTGTCAC
AGATTTACCCAACAAAAGAGTATATAATCCGAGTTGCTTCCTTCAGACGGGATGTGCTTC
TATTTAAGTGGTGATTCCTTCTTGCTTAGTTCATTTTCTAGTTGGATATTCTACTAAGGC
TGTTTTCATACCTCCATAATTTGATGTCCATGATATGCAGGGTGTATCATCCATTGAAAA
GCAAATGTGGAGGAAATGATGTTTGGATTCAGAATATTTGTCGTGTTTATGAATTAGATT
GGATTGGAATTAATTATTAATTCAGATTGGATTTGAGTTGGGTGATGCGATCCGTGTGGT
TCTGTGTTGTATCTAACGTTGAATTGGGTTTTTAATTCATGTGATCTGGTTAAATTCTGG
ACCTTAAAACACTTTTTTTTTTTTTTTGAAGTCTGTGTCAAGCTACATTTTCTTCATTAA
GCAAATTACATATCAATTACTTGTAGTCAAAGTATTCTTTCAGTCATTCTATATGACATA
ACTTGTCCTAGTGAAAGATAAATAAAAACAGTCTCAACATTAGAAATGTTGGTCGCCATC
AATTTGGTGTAGTTATATATCTTTCCAACGAAACATTATTGAAATTAACAAGTCCAATAT
TGATCTCAACAATCTCCTGTTAGAATATTTTCAGGGATTTAATTCTTCATATGTAAATGA
TTATAAATTGAAAAATATTTTACAAAGTGCAAGTGCTATTCATTTATGAGATGGGGACAT
GTATATGGTTTTATTTTTCAATGTATGGACCAAGATTAAAACAAGTGTATAAACGACCAA
GACAACTTTGTGGACTATTAGATTCAATGGAATCAAACAAGACAAGCCCAACAAAAAAAG
AATACTACAGAATGATACTTTTATTCTTTTTTTGACAAGATACTTTTATTCTTATTAGTG
GTGAATTTAATATAATTAACACAACTAAAATAATTGAATTTTCTTTAGCGTATCAAACAT
GGCAATGCATGTTCCTGAAAAAGAATAAACTTGTCACGAAAATTCCTTGTAAACAAATTT
AATTTTCTGTTACAAGGCACCTCTTGTATTATATAACCCAACTATCATCCATGAATTTGC
TTTCTTTCAGCTTTATATAACAGACCTCTCATTTCTCTAAAATCTCATTTGTCTCCCCAT
CCCCTCGCTCTCTCACATCTTCATAATTACAAAACTTGCCCCCGCTTTTTCTCTCTCTCT
CTCTTTCTCTCCTCCCCCGATCGTTCTCTGACGACTTTCTCTTCACCAAAACCCTAATTG
AAGCGACAGTCTATCCACAC
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>LITCHI018561.m1 GenomeSequence - 
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CCGGAATCTTCTCTGGTCCAATTCGTACAGTGAGCCGATCTCCACCATGGATGACGAGTT
CGAGTTCGGCGATAAGGTCCCTCCCTCCTTCGATCGCATGGTAATCTTTTCATACATATT
TATATATTTTTCTTTTTACGTTTTCGTATTCATTCTCTTTGTTCTGTCAGCTGATTTACG
AGATCTGTATTGATGTAATTCGATTTGCATTACTAATTCAAAGATATAACCTTTATCATT
CCATTTTATGATGATCTTGTGTTTTCTGCTCTTGTTTGTTGAAATTATGTTTTTTTTTTA
ATCTGATTGGAAATTGAAAATGAATTTTCATTTTATGCATGGATTGAAATGCTTGATCAA
ACTGTTTTACCTGTGTATAGTTTAAATAGAATTCGAATCATAAGATTTTTTGATCTACGA
TGAAAATTTTCGCTCCAAGAAATTGTTTGACTTATTCATGAACTAATTTTGGCGCAATTG
AATTGTTTCTCATGAATGATTGCATTTTTAAATTCATAATACTTCACTGCAGATGCATTG
TTGGTCTATCGATGGAAATTGTTATCTTGTTTACTAACAAAATTCTGAATTGGGGGTCAA
TATATCCAGTTCAATCCGTGCATGCTATAAAAAAATTAGGCCTCTTAGGATTTTGAATAA
TTTAGTTTGTTCTATTTTCTTTTTTTTTTCCAAAAAAAAAAAAAAGCCCAATCTTCAGGC
CTGGTTTTACTTAGTTCACTTTGAGTTGATTGTTTAAATTAGAGTTCAAGAGATGTGTTT
ATCAATCAATAATTAGCTCGTGTTAGTGACTTTTGTATAATGAGAGAGATTTTGTGCCAT
CAGATCTAATTTCAATTGAAGATGATATGTATCTCAATGATATGTTCTCGTGGGGTTTGG
GAAAATTATATTTTTAACAATGGTAGTATGTTGTAGATAGATTTAGTAAAGCATTTAATG
CTGACATAGGATATCCCTGTTTGCAAGACAGAAAGCGATGGGTTTGGTGGTCAATCCATT
GGGTTTCAATGCATTAGTGGAATGCTCTCAAAAATTAATGTAAGATGGACATTTTTGCTT
AATTGGCTGGGGATATGTAGTTACACATTAGTGAATATACCTTGTCATGATGTTACAGAC
CAAGAGGAGTCTCATAAAACCACTTTGTTCTTGAATCAGTACCATTGGAAATTTTGTTGG
AATTTTGAAAGAATTTAAATCATACTGTGCACCTTTGAGTCTAATTTTATAGGATATTTG
GTCTGCTGATTTTACGGATCAGGTAATGTTGAACCACACTTTGAACAACTGTTGTTACTG
GTGATGGAGATTAGATAAAAGTGTGAGGACAACAATACAAAGTGTAGGATGTCGTGCAAA
GCGTTGCACCACATACTACTAACAAGCAAGAGACATGAAAAAGTATTGCTTTGGACCTAA
TGATAGTTGCCTGCCTGAGCCATTTGTATTTTTACATCATTATCTGTTGTTCAATTCGCA
CTTATGGGAAGTTTGACTTGTTTTTGTGTTGTACAGGGAAAAGTGATCAAGGATGCCGAA
GCCAAAGGGTTCAATCCAGGATTGATAGTGCTGCTAGTTGTAGGGGGTCTGCTATTGACC
TTCCTTATTGGCAATTATGTGCTTTACACATATGCACAGAAGACCCTTCCACCAAGAAAG
AAGAAGCCACTCTCCAAGAAGAAGATGAAGAGGGAAAAACTGAAGCAGGGTGTCTCTGCA
CCAGGAGAGTAGATTATCAATTGTTGTTTTCACTTGTTCCCTACATGTTAAATTGTCAGT
GTCGTGAATTTTCCTCCAGATTTTAAGTCAAGAGAGTCGTCCCTGTTTTTCTCCATGCTG
GTTAGAAATATGATCTCGTAACTGGAAGTTAACCCCATATTTGGGTAGACTAGGAGGTAA
AATTACTGTTTTCCAATCATAGACAGTTTGGTTTTCCTCATCTCCTTACAAGTTAAATTT
AGTTTCATTTTAAATTTACTTATTGATGGCAAAGATGCCCTTCGCATATGAATATGGAGA
AATAAACTTTTATCACAAACTTGAATCAATTTGCTAGCAGCTACTCAACAAATGGGTGCT
TCGTATCCGGTGATCGTCGGCTGTTCAAAGCCCAACCTTTTCGGAAAAGCAAATGTTCAC
TTATAACTTATAAGATTGAAGTGGGGCCAAAATAGTGGTCGAATATAATTAACACAGAAC
ATGCATTCCTGCTCTACATTGCAAGATGGCGTATCAGATTGGAGACATAAAGGTTCGATG
GGTATGCGAATTAGCATTACTTCTCGAGGCTGATGAACACTTGTTTATGTATATATGTGC
CAATTTAGTAATACTAAAATTGGCTAATAAAAAAATAAAAAGAAGATACTTAAAAAATAA
TAATAATAATAAAAAGAAGACATATAGGAGCCTTTTCGCAATATTTTGTGCCTCTTTTTG
TTAACTATAAATTGTGCTTTCCTTGAACATATTAAACGTATATGAAGTGAGGTTTCAATT
CACATCTTATATACTCACAACTGGATTGACGTGTTGGCTCACAAGTGGATTGAAGTGTTG
GTTAATCTCATCCAACTGTTTATCACACAACGCCAAGTTCAAGTAATAGTGTTCACAAAA
TGGATAATTATATCTTAACCTATCTATATATCAGTCAAATTATGTATAAATCTTTCGAGT
TG