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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI018778 | Chr15 | 8970235 | 8975033 | - | Histone deacetylase HDT3 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI018778.m1 | 3 | 91 | PF17800.4 | NPL | Domain | 44.9 | 1.70E-11 |
LITCHI018778.m2 | 3 | 91 | PF17800.4 | NPL | Domain | 45 | 1.60E-11 |
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>LITCHI018778.m1 ATGGAATTCTGGGGTGTTGAAGTAAAAGGTGGGCAACCACTCAAGATTAATCCTGGTGAT AACAAGATTGTGCATCTTTCACAGGCTTCATTGGGTGAGGTGAAGAAAGGAAGTGAACCT GTATTTTTGTATTTGAAAGTTAATGATAAGAAGCTTGTTCTTGGAACGCTTTCTGCTGAG AAATTCCCTCAGTTGAGTTTCGATCTTGTTGTTGAAAAAGATTTTGAGCTGTCTCATAAT TGGAAAAACGGGAGTGTCTATTTCACTGGATATAAAATTCATGCTGATGAAGGAACTGAC ACTGAGGATGATGGTACTCCTGAGTATGATGATGGTGTGAAGGAGGTTCCACTTACCAAC AAAGGAGTAGATGCATCACAACCTAAATCTTTATCTGAAAAGACTAATGCTACCAAGCCT GATTCTTCTGCTGCGCACCAAAAAGTGAAGGATGCTAAACCCAATCAGAAGGCTGAAGAT AGTGATTCTGATGATGATGATTTGGAAGGTTCATCCACTGATGATGACAAGAGTCAAGAT GATGAGAATCCAAATCTGGTTAATCATGAGGCTGAAAGTGATGAGAGTAGTGGCGAAGAG GATGAAAGTGATGAAGATGATGATGAAGACACTGATGATAGTGAGAGTGATGATGAGGAA GAGGAGACACCAGCAAAGGCTGAAGTAAGAAACAAAAGACCTGCAGATTCTGCTACAAAA ACCCCTGTTCCTGATAAGAAGCCCAAATTTATCACACCTCAGAAAACTGGTGATCTCTTT GTCCAAGGCAAGAAAGGGATTAGTTACACTGCAACTCCACACCCTTCAAAGCAGGCTGGG AAAACACCTGCCAACAGTGACCAGACAAAGCAGCAATTTAAAAAATCGGGTGGGTCATAC CCCTGCAAGTCTTGCAACAGGTCATTTACCACGGAAGGAGGTTTGCAAGCTCATACAAAA GCCAAGCACGCTGCAGCAGTGTGA >LITCHI018778.m2 ATGGAATTCTGGGGTGTTGAAGTAAAAGGTGGGCAACCACTCAAGATTAATCCTGGTGAT AACAAGATTGTGCATCTTTCACAGGCTTCATTGGGTGAGGTGAAGAAAGGAAGTGAACCT GTATTTTTGTATTTGAAAGTTAATGATAAGAAGCTTGTTCTTGGAACGCTTTCTGCTGAG AAATTCCCTCAGTTGAGTTTCGATCTTGTTGTTGAAAAAGATTTTGAGCTGTCTCATAAT TGGAAAAACGGGAGTGTCTATTTCACTGGATATAAAATTCATGCTGATGAAGGAACTGAC ACTGAGGATGATGGTACTCCTGAGTATGATGATGGTGTGAAGGAGGTTCCACTTACCAAC AAAGGAGTAGATGCATCACAACCTAAATCTTTATCTGAAAAGACTAATGCTACCAAGCCT GATTCTTCTGCTGCGCACCAAAAAGTGAAGGATGCTAAACCCAATCAGAAGGCTGAAGAT AGTGATTCTGATGATGATGATTTGGAAGGTTCATCCACTGATGATGACAAGAGTCAAGAT GATGAGAATCCAAATCTGGTTAATCATGAGGCTGAAAGTGATGAGAGTAGTGGCGAAGAG GATGAAAGTGATGAAGATGATGATGAAGACACTGATGATAGTGAGAGTGATGATGAGGAA GAGGAGACACCAGCAAAGGCTGAAGTAAGAAACAAAAGACCTGCAGATTCTGCTACAAAA ACCCCTGTTCCTGATAAGAAGCCCAAATTTATCACACCTCAGAAAACTGAAGGCAAGAAA GGGATTAGTTACACTGCAACTCCACACCCTTCAAAGCAGGCTGGGAAAACACCTGCCAAC AGTGACCAGACAAAGCAGCAATTTAAAAAATCGGGTGGGTCATACCCCTGCAAGTCTTGC AACAGGTCATTTACCACGGAAGGAGGTTTGCAAGCTCATACAAAAGCCAAGCACGCTGCA GCAGTGTGA
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>LITCHI018778.m2 - Up_Stream_Len 2000 ATATGTAAATTAGTGTTGATGGAGTAAAATTGCTTTGAAGAATAAACAACTTACAGAGTC TAAAGAAGGAGTTAGAGCATGTAGAAGAACAGCCAGATCCATTTCGAGGACATGTGAACC GCTGCACTCTCACTGGTCTCTACTTGTTGCCGAGTCGCAGTGTGTTAAAATAGTGGTAAG TGGTAACTCTTACAACTAGGCAGATTCTGCAGCGCTTTCTTTTCAATTTTAAATAAGACG GCTCGTCGGGCATGTAATGGTTTATAAACTAGTGTGGCACAGTTTCCAGAAATATATCTT TTAAAAATAGAATCCTTCAAAGTAAATTTTTTAAAAATAAATCTTTTAAAAATAAATTAT TAATTATTTGATTATTTTAAAAAATTCTTTTAAATTATAGATTATTTGATTAAATTATTT TTAAAATATTTTTAAATTATTAATTTATTAAAAATAATATATGAGAGATGAGTCGTATAT TCATTTTTATCTTTCAATAATAAAAAATTACTCGATAATAAAGATTTTATTTATTCTCTA TCAATTTTTTACTCTTGGTTTAATTAGTCTCAAAAAATAAAAATATCATATTTATTCATT TTATCAATTTCATGATTCTCATAAAGTTTACCTGCACCCACTTCAGAACTATGGGCTGAT TTTATTTCTCTATTTTTTTTTTTTCCACATGTACCAATTACAAAGTATGTATATATATAT ATATATATATATCAACGAAACAATAACCAATAACTAATTACAATATATATATATATGTCA ATGAACCAATAACAAAAAAAATTGTTTTTATAAAAAAAAATGAATGAAAGTAAATGTTAT GTATTTATATTTATAAAAAAAAATGTAATAGGATTATATATATTAGTGAACCAAAAACAA AAAAATTACATTATCAATCGAAATCAATTGAAAAAAAAAACTACAAAATATAAAAAACTA ACTGGTTAAAGAGAAGTTCTCAGATGTTTTTATGAAATAAAAAGTGAATGAAAGTGGAGG TTATATGTTTATATTTATAAAAAAAGTGTAATATGGTTATAACTGTATAAAAATATTAAT AAAATAAAATAAATGTAAATTAGACATTTTAATCTTTTAAAAACAGTTCAAAAAATCTAT TTGAAAAAGCTCAAAATTTGATATTCTTTAAGTAGATATTTTTCAACTTTTTTAATTTCT CAAAAGTTGTATCGAGATGTTAATCAAACAATATAAAAAAAAATCAAATAGAATTTTAGT ATTAAAAAAATATTTTTAACTAGTAGATAAGTTTTATTAAATGTACATCATATTACACAG GCAACAATCGAACATAGTCGATCACACGTCAACTTATAATTATTCTATTTATACCAACTT AGGACTCATGTGAGGTTGATTGCTACCATAATATAATAAAATTAAAAAATAAATAAAAAC ATATTTCACTATAATTCCATCAACAATCAACATGCTAAATCCACCAAAAAAACAAAGAAG AACATTAGAATTCCCTCTTCCATGATTTGTTACGTAATTTATAAAAATTAAAATTAAATG GGGCATCGGGGAATGAATGTGCACATAGAAAGGGTTTACCGACAATATTAAAAAAGGGAC ACTCAAAAATACTGTGGATTGAAATTGGGCCCATGAGGTTAAGCCTGAAAATAGAGGCGG CCCAACAAAAGACTCGACCGAACCCGAACCTGGTGTTAAGAAGGCCAGTTCTACAAACAC CGTAATTACCCCACCATCCAATGCAGCCGTACACATGATAATACTGTTGTACGTGGCACA CCAACGTTAAGCCTCCTTTGTCCTTCATTTATCGAACCCTAAAATAAATTTTACATTTCC ACCAATTTATATTCCTGTAGAATCTCTTCTGGAAGGGAAAACCCACACTCTCCCACCCCC CAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCTGTCATTCTCATTCCCTGTGTCTG GCAGTGCCGCGTCAACGCCA >LITCHI018778.m1 - Up_Stream_Len 2000 ATATGTAAATTAGTGTTGATGGAGTAAAATTGCTTTGAAGAATAAACAACTTACAGAGTC TAAAGAAGGAGTTAGAGCATGTAGAAGAACAGCCAGATCCATTTCGAGGACATGTGAACC GCTGCACTCTCACTGGTCTCTACTTGTTGCCGAGTCGCAGTGTGTTAAAATAGTGGTAAG TGGTAACTCTTACAACTAGGCAGATTCTGCAGCGCTTTCTTTTCAATTTTAAATAAGACG GCTCGTCGGGCATGTAATGGTTTATAAACTAGTGTGGCACAGTTTCCAGAAATATATCTT TTAAAAATAGAATCCTTCAAAGTAAATTTTTTAAAAATAAATCTTTTAAAAATAAATTAT TAATTATTTGATTATTTTAAAAAATTCTTTTAAATTATAGATTATTTGATTAAATTATTT TTAAAATATTTTTAAATTATTAATTTATTAAAAATAATATATGAGAGATGAGTCGTATAT TCATTTTTATCTTTCAATAATAAAAAATTACTCGATAATAAAGATTTTATTTATTCTCTA TCAATTTTTTACTCTTGGTTTAATTAGTCTCAAAAAATAAAAATATCATATTTATTCATT TTATCAATTTCATGATTCTCATAAAGTTTACCTGCACCCACTTCAGAACTATGGGCTGAT TTTATTTCTCTATTTTTTTTTTTTCCACATGTACCAATTACAAAGTATGTATATATATAT ATATATATATATCAACGAAACAATAACCAATAACTAATTACAATATATATATATATGTCA ATGAACCAATAACAAAAAAAATTGTTTTTATAAAAAAAAATGAATGAAAGTAAATGTTAT GTATTTATATTTATAAAAAAAAATGTAATAGGATTATATATATTAGTGAACCAAAAACAA AAAAATTACATTATCAATCGAAATCAATTGAAAAAAAAAACTACAAAATATAAAAAACTA ACTGGTTAAAGAGAAGTTCTCAGATGTTTTTATGAAATAAAAAGTGAATGAAAGTGGAGG TTATATGTTTATATTTATAAAAAAAGTGTAATATGGTTATAACTGTATAAAAATATTAAT AAAATAAAATAAATGTAAATTAGACATTTTAATCTTTTAAAAACAGTTCAAAAAATCTAT TTGAAAAAGCTCAAAATTTGATATTCTTTAAGTAGATATTTTTCAACTTTTTTAATTTCT CAAAAGTTGTATCGAGATGTTAATCAAACAATATAAAAAAAAATCAAATAGAATTTTAGT ATTAAAAAAATATTTTTAACTAGTAGATAAGTTTTATTAAATGTACATCATATTACACAG GCAACAATCGAACATAGTCGATCACACGTCAACTTATAATTATTCTATTTATACCAACTT AGGACTCATGTGAGGTTGATTGCTACCATAATATAATAAAATTAAAAAATAAATAAAAAC ATATTTCACTATAATTCCATCAACAATCAACATGCTAAATCCACCAAAAAAACAAAGAAG AACATTAGAATTCCCTCTTCCATGATTTGTTACGTAATTTATAAAAATTAAAATTAAATG GGGCATCGGGGAATGAATGTGCACATAGAAAGGGTTTACCGACAATATTAAAAAAGGGAC ACTCAAAAATACTGTGGATTGAAATTGGGCCCATGAGGTTAAGCCTGAAAATAGAGGCGG CCCAACAAAAGACTCGACCGAACCCGAACCTGGTGTTAAGAAGGCCAGTTCTACAAACAC CGTAATTACCCCACCATCCAATGCAGCCGTACACATGATAATACTGTTGTACGTGGCACA CCAACGTTAAGCCTCCTTTGTCCTTCATTTATCGAACCCTAAAATAAATTTTACATTTCC ACCAATTTATATTCCTGTAGAATCTCTTCTGGAAGGGAAAACCCACACTCTCCCACCCCC CAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCTGTCATTCTCATTCCCTGTGTCTG GCAGTGCCGCGTCAACGCCA
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>LITCHI018778.m2 GenomeSequence - GGGGCATCGGGGAATGAATGTGCACATAGAAAGGGTTTACCGACAATATTAAAAAAGGGA CACTCAAAAATACTGTGGATTGAAATTGGGCCCATGAGGTTAAGCCTGAAAATAGAGGCG GCCCAACAAAAGACTCGACCGAACCCGAACCTGGTGTTAAGAAGGCCAGTTCTACAAACA CCGTAATTACCCCACCATCCAATGCAGCCGTACACATGATAATACTGTTGTACGTGGCAC ACCAACGTTAAGCCTCCTTTGTCCTTCATTTATCGAACCCTAAAATAAATTTTACATTTC CACCAATTTATATTCCTGTAGAATCTCTTCTGGAAGGGAAAACCCACACTCTCCCACCCC CCAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCTGTCATTCTCATTCCCTGTGTCT GGCAGTGCCGCGTCAACGCCAATGGAATTCTGGGGTAACATTTGAAGTTTTTATCTTCGA TTGTTTTTCCTTTATCCAATTTTGTATTTTGTTTTTTTTTTTTAATGGTCAATTTTGGCT CCTGCGAAAAATGTAGAGGTGATCTTAGTTTGTCTTTATAAAACATGCTTGAATGCATTT GTGTTTGTTTTCTCATGGATTTTCTACTCTTTATCATTTTATCTGTTTGCTTGCCGAGAA AATGTAGAAGAATTATTCGTTATAGTGGAAGGTATTCTTCATTTTTATTGTGCTTATTTC TTTGATTCGTCGTTTATTAGGGATTGTGGCTTTTGTAGAGGAGTGAATATAGATAGTCAT GATTTTTTATTTTGTTTACTTGATTTATGTATCAGCATTTATGTTTTTGTTGTGTGTTAA CTTTGGTTTATTAGTGTGAGTTGTGTGTTTCGGCTTGTTTGGCGGCACAGATTTGGCTAT ATACTTTATACTGTGACTGTTATTAATTCTTTATAAATTAAACAATAGATCCTTTGAGCT CTCAATTTTTGCCGCAGTAGGTTTGGTAGTTGGATATGTGCTGTTGTTAATTTGCCTTTT GCAATTGTGCTTGTTGTTATTTGATACTGTGGTGTGTAATTTGGTCCTATATTTTGTTTC ATTCCCTGTCGTGTGTTTTGGCATCCAGGTGTTGAAGTAAAAGGTGGGCAACCACTCAAG ATTAATCCTGGTGATAACAAGATTGTGCATCTTTCACAGGTTATAATTCGATTTTTGATG GCCATAAGCCATTTTGTTGGATGTTTCATATTTTTTGTGCTACTGTTTTGATAGTTTCTG GTGCTTTTATTGCTGATCTCAGGCTTCATTGGGTGAGGTGAAGAAAGGAAGTGAACCTGT ATTTTTGTATTTGAAAGTTAATGATAAGAAGCTTGTTCTTGGAACGCTTTCTGCTGAGAA ATTCCCTCAGTTGAGTTTCGATCTTGTTGTTGAAAAAGATTTTGAGCTGTCTCATAATTG GAAAAACGGGAGTGTCTATTTCACTGGATATAAAATTCATGCTGATGAAGGATATCCTTT TTGTCTCATTTCTTCTTATTTTAAAATTTAAATTGTGTGGTTATATAAATTTATACTTGT TTCATGCATTTGTTCGATTACTAGAATCTCCTTGACTGTATTTTTTTGGTCCTCACAACT GACACTGAGGATGATGGTACTCCTGGTGAGTTGTTGTGAAAGTGTTTGTTTGTTATTTTT CATGTGTATTCAATCTTGTTCGAAATTATATGTTTATTTTTATCTTGAGACTGGCAGAGT ATGATGATGGTGTGAAGGAGGTTCCACTTACCAACAAAGGTAAAAACCATTCTCTCTCTC TCTCTCTCTCTTGCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTGGCTGAACTTTT AAATTCTGTAAATCTGAAAATTATTTGTTAAATTTCCACTTTGTAGGAGTAGATGCATCA CAACCTAAATCTTTATCTGAAAAGACTAATGCTACCAAGCCTGATTCTTCTGCTGCGCAC CAAAAAGTGAAGGATGCTAAACCCAATCAGAAGGCTGAAGATAGTGATTCTGATGATGAT GATTTGGAAGGTTCATCCACTGATGATGACAAGAGTCAAGATGATGAGGTATTTTCCTTA CAGCACCTTCCTTAATTCTATGGCACCTAAAGTCTTTTTTTTTTTTAAATGAACTACTAC ATTCATACTCAGAATTCCCATGTTGATTCCTTTGTCCCCTGGAGTCTAAATTGTGCCTAT TGTCAGTCCCTACAACCTTGATCATCATGAACTCATAGGTGGCTGCAAGGGGTTATTGAA CCCCTAATTTTTGGTTGAAATATTTAAGAAGAATTGGAGTTATACTTGTTTAGGAAGGAT TGGTCTGTGCTATTGTTTCTATGCCAACCGATTGTTTCTATTATCTCTGTGCAATCAACA TCTATCATTATGTTCATTGATGCAATTTAATATATTTCTGTTTAGAATTAAACAGTGGAG GCATTATTTTTCAGTAAAGGAACTGAGGAAATTGTTATGTATACTTTACTTTATCAAATA TGAATATATGATTATGTGGTCTACTTGAGGACTAGTCTATCATAGTCTATTGTTGTTGTA TTTTATTTATCACAAAAAGAAGTTTGCCTCCTCTTATATACAATTGGCACACACCGATTT CCTTAGAAGTGTCAACCTGCTATTGGGTCCTTAGAAGTGTGAACCTGCTAGTGGGTAAGG GGACCACAATTTGATATACCGGTGCAAATAAGGAGTTGGGGAATGTGGCTTTTATTGCTA CTGTTCTCCTTTGTCTCTGTATGTATATTATGAATTATTTAAAGTGTATTGTTTGGATGT GGTTTAGAATCCAAATCTGGTTAATCATGAGGCTGAAAGTGATGAGAGTAGTGGCGAAGA GGATGAAAGTGATGAAGATGATGATGAAGACACTGATGATAGTGAGAGTGATGATGAGGA AGAGGAGACACCAGCAAAGGTGAGGGCACTACTATCTATATCTTTTTGGGACATTGTACC TAGCTGCTTTGTATGGTCGTTTATTCATTTTTTTTAATAGTTCGTCTCTTCCAAGCATCG CTTACTAATTATATTTAGTTTCTTCTCTTGAAGGCTGAAGTAAGAAACAAAAGACCTGCA GATTCTGCTACAAAAACCCCTGTTCCTGATAAGAAGCCCAAATTTATCACACCTCAGAAA ACTGGTGATCTCTTTGTCCGTATGTGTTTTTGCAATGAGAGTTATTTTTCTTGTTTTCTT TTACTTTTGATGGTTAAAATGATTCATACTGGTGTTTGACATTTAATTGCTGTCTCAGAC CGGATTTCTTTAGGTGATCAATGAATTTTTTTATGAAGTATGGTGTTTACCTTTAATGCT TCTCCCACTTAGGATTCATAATTTAGGCTTCGTATCTCTTTCTCCTGAGGGATGGTTCCT ATCACTTTTTGTAGAAATTCTTTCCATGTACAAGACTCACTGTAGTATATATTGTGTTAT TATCCACTAATTAGAACTACATATTGTATGTGCTCAAGCTTTATTGTGTGGTATATGCTC TAGAAATATTAATAGGTTTGTGTATTGCTGAAGACTTGGATATAATCTGGTGCAGAAGGC AAGAAAGGGATTAGTTACACTGCAACTCCACACCCTTCAAAGCAGGCTGGGAAAACACCT GCCAACAGTGACCAGACAAAGCAGCAATTTAAAAAATCGGGTGGGTCATACCCCTGCAAG TCTTGCAACAGGTAAATTTCCTGCATTAAGCTAATTTAAAACTTCTTCTATTTTGAGTAA TCTTGTTCTCTTATATTGTTCTTGTTGCAGGTCATTTACCACGGAAGGAGGTTTGCAAGC TCATACAAAAGCCAAGCACGCTGCAGCAGTGTGAAGGGTAGAGTTCAAGTAACTTAACGC ATTTTGGTCACCTTTAGTCTTGCGTGGGTAAATTACTATTAGAGGAAGAGTGAGAAACAG GCTAGTAAATAATCGTGCTAGTCTTTTAATGCTGTCCTGGATTTGTGTCTTCTTGGATGC CTGGATTGGATATGTTTTGATGAAAAATTAATCGCAGTATATATTTGCTAGGTCACAAAT ACTTAAACCACCTTACGAAATGCTTTATTCTGTCTAGTTTTAGTTCTCATATCTTCGTCA ACGCCACTCCAGTCTTTTTGCTCCTTGCATCAAGAATTGAATTCAGATAAATTCGTTAAA TGGGATTTTAGCGTAGGGATGTAAAAGAAGTCCGGAAAATTCAACTAAGGGGAAAAAAAA ATCTCAAACTCTTTAGAGTAACATTTAACGAAACAGAAGTATGGTTCTTATTTTATTGGT TGTCTGTAAATAGAATTTGGGTAGCGCAGAATATTTTTTTGAAAGAGAGTAACGCTGAAT TTGGTTCTAAGAAATATGGTGTCTATTAAGTTTCAATGTTCCATATTTTGTAATATTTTA GAAGCGGAAGAAGGCAAATAACGTTGAAGCTGACCAGTCCCCTCGTTGCCTGGACTATTT TCACAATTAAATGGTAACAGCTTCTGCTTTAGTTTCCTTTGACTGAAAAGTTGACGTTTC GAGCAATCGAGTGTTAAATGTGAATCGTTTCAATTATTGTAAGATAAATTGTCATTCGCT CAACTTATACTCTGTTAAATAGTGTATATAAGATTCAGCCTTAAAATAAATAACTTCGAT CCGTTGTAGTGTTATAGCCTTCTGTGCAAAGATGTCATTTAGATGAACACGTATCGGGCC TAAGGCCTACTGCGAACTCATCAGATATATTGGAGAAAGGTTCAATACAAAGTTGCCCA >LITCHI018778.m1 GenomeSequence - 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