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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI018573 | Chr15 | 6975660 | 6979362 | + | Zinc finger protein JACKDAW |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI018573.m1 | 69 | 91 | PF00096.29 | zf-C2H2 | Domain | 16 | 0.014 |
LITCHI018573.m1 | 69 | 91 | PF12171.11 | zf-C2H2_jaz | Family | 23.1 | 7.20E-05 |
LITCHI018573.m2 | 69 | 91 | PF12171.11 | zf-C2H2_jaz | Family | 23.2 | 6.40E-05 |
LITCHI018573.m3 | 6 | 28 | PF12171.11 | zf-C2H2_jaz | Family | 23.5 | 5.30E-05 |
LITCHI018573.m4 | 6 | 28 | PF12171.11 | zf-C2H2_jaz | Family | 23.3 | 6.10E-05 |
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>LITCHI018573.m1 ATGCAAATGATGTCTGGTAATGCGTTTTCAATACCTTCTTCTTTTGGAGGGTTCGCTCCT GAACAACAGAACGCCAACCCTAACCCTAAACCTACTCCTCCTCACCAATCAGCTGCCAAG AAGAGAAGAAACTTGCCAGGAACACCAGATCCAGATGCTGAGGTTATTGCTCTTTCTCCC AAGACACTCATGGCCACCAACCGCTTCATTTGTGAGATATGCAATAAAGGGTTCCAAAGA GACCAAAACTTACAGCTTCATAGAAGAGGTCACAATCTTCCATGGAAGCTCAAGCAAAGA ACCAACAAAGAGATCAAAAAGAAGGTTTATATTTGCCCAGAGAAGACCTGTGTTCACCAC GATCCATCGAGAGCTCTGGGCGACTTAACTGGTATAAAGAAGCATTTTAGCAGAAAACAT GGAGAGAAGAAGTGGAAGTGTGAGAAATGCTCCAAGAAATATGCAGTCCAATCTGACTGG AAAGCTCACTCTAAAACTTGTGGTACTAGAGAGTACAAATGTGACTGTGGAACTCTATTT TCCAGAAAAGATAGCTTCATCACCCACAGAGCTTTCTGTGATGCCTTGGCTGAAGAAAGT GCAAGACTCACTTCAGTCCCATCTACAAATCTCAATTTTAGAAGTGATACCGTGAATTTG CCTCATGGATTTGCTAACCAGGGACTGGTACAAGATGTTGCCGGAGTTTCCCAATTCGGA TCAGGTTTTCGGGCAGATTTGGCCACTGCAGGTTTGCCTGAGATGATACAAGTGGCTTCA GGTAATTTATATGGTTCGTCTTCAAATATGGTTAATTTTGGAAGTCATAATCAGTTTCAA GCCACAACTTCAAAAGGTGGAAATCTTTCCTTATCAGCAATTCAGCAAGGACTAAAAGAA GAAACTTCTTCTCTTTATTCAGATGCTCAAAACAACAAGCCATCAAAGCCAGCTGCGCCC 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>LITCHI018573.m3 GGAGTTTGAGCTGAAAAGGCTACAAAAATAGACACACAATCCTACACATTCTGGCTACAC GAACACGAGAGCTGCTTACTGTGTGATACTGTCTCACTCACACATACAAAACTTTCTACT GGTTCTCCTTACAGTCGCGCGCGTGAGAGACAGTGAGGTGGGCCATTTGAATCAATGGCT GACCGACTTTGTGGATACGAGTAAGATAAAAAGAGCAAGAGATCAGAGCATATGATGTAA AACCAACATTTATATGAGAGAGGGAGAGAGAGAGAGAAAAAGGTTAGAAAATAAAGAAGA TATATTCTCTAGAGCCATCATGATTTTTGGTGTTATCTTTTGAAATCAGGCAAAGGGTTC ACCAGATCTCTGTTAGAAGAGTCCGAAATTTCCATTAGACTATTTTAGTTACTCTATTGT TTTGTGTTTTGGGTGTTTTTAGATTAAAAGCTCGGAGTTGGTGTTTTTTTTTTTTCGCTT TTTCTTTGTCTTTTGGCAGAAAATCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTCAGTCTTTGA ATATACCTAAGATTTTATCTGCTTGTGTTTGGAGAAAACCCTTGTTTTTTAGTTTGTATT GTTTTGAGCTCTTTTCGAAAACTAGTTGTTTTGTTGCAACTCATTCACTAGCAACCAGTT TTTGAATTGAATTGAATCCAAATGCAAATGATGTCTGGTAATGCGTTTTCAATACCTTCT TCTTTTGGAGGGTTCGCTCCTGAACAACAGAACGCCAACCCTAACCCTAAACCTACTCCT CCTCACCAATCAGCTGCCAAGAAGAGAAGAAACTTGCCAGGAACACCAGGTGCCTTCCAT GCTGTATATATATATCTTGTGTTACCTTCTCTTGGTTTCTTTTGTTTTTGTTTTGTTTTT TTTCCTAGCTTTTGTTTTCTTGATAGGTTGTTAGTTACATATACATATTTTTTTTCTTTG 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