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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI018533Chr1565551896558635+Floral homeotic protein APETALA 2

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI018533.m1143191PF00847.23AP2Domain39.84.60E-10
LITCHI018533.m1234284PF00847.23AP2Domain34.81.60E-08
LITCHI018533.m2143191PF00847.23AP2Domain403.90E-10
LITCHI018533.m2234284PF00847.23AP2Domain351.40E-08
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>LITCHI018533.m1
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ACGGGAGAGAAAGTTGTGCAACTTCCCAACAGCAACCAGATGGAAAGTTCGGGGAGTTTC
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CTCCCACGTACACCCGATGGTCACAACAATACGAGCAATTTGAGAGGATATCAATCCGAA
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CCTTCAGCAGCTCATAATCATCTTCACTATCCAAATACAACGATCCTCCAAAACCATTTT
GCTTCACCTATCACTAACCCAAACAACATCCCATATTTCTACTGCAGGAGCTGA
>LITCHI018533.m2
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ATTCTGCGTCGCCAGAGCACTGGCTTCTCCAGAGGAAGCTCTAAGTACAGGGGAGTGACG
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CTCCCACGTACACCCGATGGTCACAACAATACGAGCAATTTGAGAGGATATCAATCCGAA
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CTGACCACCCTTCCATCTGGAGTGGTGTATATTCAAATTCTTTTCCAATTTACGAGGAAA
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>LITCHI018533.m2
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CTCTCTAACATCTCACACACACACACATATATATAGAGAGAGAGTTGAAGTATACGATGT
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GGTTGGATCTGACGTGTAAGGAGGTGGACAACGGGGGTCCTGCGGAGCAGAGGATTGCTG
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CAGCAGCTCATAATCATCTTCACTATCCAAATACAACGATCCTCCAAAACCATTTTGCTT
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TTCCCTCGTATCATTATTCATAAATTGGAATT
>LITCHI018533.m2
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AAACAACATGTAGGTGTTACGTTCTTTCTCACGTCCCATCGACTCTTCTTTTAGAGCCCA
CATATTCACCTTCTCTCTCATTCTTTGTTGTTTGCTTTGCTTCATCATCAAACACCACGA
ACAAAACAGTAGATGTACTCTTCAAGAACTAAACAGTATCAGTACATCATGAAGCCACAA
CAAAGCAGGCCTTAGCAACTTCTTCTTAGCCGGCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTTTATA
ACCAACCCACCACCATCTCCACTTCCCATTTTACTCTCTCTTCCTCCTCCACGAAACAAT
CTCTCTAACATCTCACACACACACACATATATATAGAGAGAGAGTTGAAGTATACGATGT
TGGATCTTAACCTGCGTGTGGTTTCGGACGACGCCAGCTTGAATTCAATAGAGATAACGG
GAGAGAAAGTTGTGCAACTTCCCAACAGCAACCAGATGGAAAGTTCGGGGAGTTTCAACT
CCTCCGTTGTCAATGCCGACACCACCGGCGACGACTACTCCTCCTCCTCCTCTGACTTCA
ACGCTCTCGCTTACAGCTTCAGTATCTTAAACAACAACAAACAAGAACGTGTTATCAAGT
CAAGCAACCGGACCATACAATTTTTCCCGGAGAATGGCGCGGTGCCGCGAAGAAAAGAGT
GGTTGGATCTGACGTGTAAGGAGGTGGACAACGGGGGTCCTGCGGAGCAGAGGATTGCTG
TCCATTTACAGCCGAAACAGACGGTAAGGAAAAGTAGGCGAGGGCCCCGGTCCAAAAGCT
CGCAGTATCGTGGGGTTACCTATTACCGAAGAACAGGGAGATGGGAATCACACATTTGGG
ATTGTGGGAAGCAAGTCTACTTGGGGGGATTTGATACTGCTCATGCTGCAGCCAGGGCCT
ATGATCGAGCTGCAATCAAGTTCCGAGGAGTTGATGCTGATATCAATTTTGATGTTACTG
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CTGAAGCCAATAAAGCTGATGGCAACAAAAATCTAGATCTGAACTTGGGGATTGCTCTCC
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CCACCCTTCCATCTGGAGTGGTGTATATTCAAATTCTTTTCCAATTTACGAGGAAAGAGC
AATAGAGAGGAGGGACATTCATTCCTTTCCCAGTTGGGCATGGAAGATTGAGGCCCCTTA
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AACAACTATGGCACCTTCAGCAGCTCATAATCATCTTCACTATCCAAATACAACGATCCT
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GAGCTGAATGGTAGAATATAGCCCCCATCCAATATTTTCTCTTCTATATAGAAAGGAGAA
GGTGGGTAGGCAAATGTTAAATTCACAGTATCACTAAATAAAGCATTTATCTTCTTGTGA
ACTTACCAAGTTAAGATTAGTTTCTGTCTGGATAGCAAGAGTGAATTTCAGATGACACAG
TTTGTTAGTTGTTGTAGTATGAAAAACCACGTGAAAATGTTTGTAACAATTGACTGAAAA
ACTAGTGTTGGTTTGAATTTCAGCTAATTGATTATAACTTGTAAATTTTGGTTTGTAGTT
TGTGAACTCTACTCTGTTTTAGCTCTATTTTCTATCGGTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTGCGATGTAAAATTTCAATTTTTCCCATTATTTTGTAGTCTGATGTAGGTACACAAAAA
TCGCCTAGAATGAAAGCTTCCCTCGTATCATTATTCATAAATTGGAATT
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CTCACGCGCCGAACTATGTATATATATATATATAAATATAAATATGGTTTTGTAAAGGGA
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GGGATAAATTAATGATAGGTTAAATTAATAAAGGATGAGTGGAAGCATCAAACATGAATT
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CAGAGTCGGAAGCTCTTGATGTATATGCTAAGATATTATTTGAAATATAGCTTTTATGAA
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GAAAAAATGGATGAAAATCGTAGCAAACAACATGTAGGTGTTACGTTCTTTCTCACGTCC
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TCTCTCTCTTTCTCTCTCTTTATAACCAACCCACCACCATCTCCACTTCCCATTTTACTC
TCTCTTCCTCCTCCACGAAACAATCTCTCTAACATCTCACACACACACACATATATATAG
AGAGAGAGTTGAAGTATACG
>LITCHI018533.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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CTCACGCGCCGAACTATGTATATATATATATATAAATATAAATATGGTTTTGTAAAGGGA
TAATCCCAATTTCTCCCCTATAGTTTGAAGAAATACCTAGAGTCCCCCTTTTATTCATTA
ATTTTTTCAAGTAAAAGGGGATTTTGACTATTTTCTTAAATTACAGGGGGGAAATTGGGA
TTATCCCTTTTGTAAAACCCCATGGTTATATCATATAGCACAAAGAATCTTCGACTTAAA
ACACATTCTGCATCAAAAAGCTAGTGAAATTGAGATGATTAGTATTAAATTCTCCACCCC
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ATTAACTTTTTTGTTTTAACTGCAAAACTATAGAATTAAATTTACATTTTAAATTTCATC
AATTTTTTTTTCCCATTCTCCAACAATAAAATGAAGGTGACCTACTTATATACTTTTATA
ATTTTAGGCCTCGTTTGGTGCGTGGAATAAAATTGGATAATTTATGTGAAATTGAATTGG
ATTAGATTGGATTGAATAAGATTGAATTTGATGTTATTTCATGTTTGGTGAAAGTAAGAT
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AAATTTTACATATTAAGACTGGTCAAACCTTCACAACCACCACGACCTCATCTATTATCA
CCCTCCTTCATTAGCAATCTACAACGCCGAAAAAGAGATCGACGATCGACAATGCCAAAT
AAATCACAAAAATCGCTTGGAGATAAAGACGAAGAAGGAGATCGACGAGCGAAGAAACCG
CTAACATAGACGAAAACGAATACGAAGAAGAAGATTGACGAGTGGAGACGAAACTATGAC
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AGAGGAAGGCTAGGGAGAAGGAGAAGTAAACGAAGGCAACGACAAGGCGTTAAAGAAGGA
GCAAGCAATAAGATAATTTTAACTCATATGATGAACGAGTTAATTTTATCCCAAACTAAT
GGGATAAATTAATGATAGGTTAAATTAATAAAGGATGAGTGGAAGCATCAAACATGAATT
TGGACAAAAAAATAATCCAAATTGAGTCCTATCCCAAGTAACAAACAATATCTTATAGGT
TAGATTACATCAATTTAATAAAAAGTCACTATAAATTTGATTAATCTATTTTCATTCAAT
CAGAGTCGGAAGCTCTTGATGTATATGCTAAGATATTATTTGAAATATAGCTTTTATGAA
TTAAAAGAAAAGATCCACACATAAGTGAAAAACTTATGTGTGAAAAAATTATCACTAACA
TAGACTCACACATAGGTGAATAGCAATGTTCGAATCCTATTTTTATAAGGCAAAGACGGG
AAGTGGTGTCAATTGCAATGCCCATAGATGAGCATAATTCTTGAGGAGTGAATAAAAATG
TATGTACAATACCATGTTAAATTGATATAATCAAATATTTATATATTCATCCGTTTAAGA
GAAAAAATGGATGAAAATCGTAGCAAACAACATGTAGGTGTTACGTTCTTTCTCACGTCC
CATCGACTCTTCTTTTAGAGCCCACATATTCACCTTCTCTCTCATTCTTTGTTGTTTGCT
TTGCTTCATCATCAAACACCACGAACAAAACAGTAGATGTACTCTTCAAGAACTAAACAG
TATCAGTACATCATGAAGCCACAACAAAGCAGGCCTTAGCAACTTCTTCTTAGCCGGCTC
TCTCTCTCTTTCTCTCTCTTTATAACCAACCCACCACCATCTCCACTTCCCATTTTACTC
TCTCTTCCTCCTCCACGAAACAATCTCTCTAACATCTCACACACACACACATATATATAG
AGAGAGAGTTGAAGTATACG
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>LITCHI017008.m1 GenomeSequence + 
CCCATGTATGTTTAATTGAATATGGCCTTCTTATTATTATGTGGTGGCTCCTATGAAACA
ATGCTTTATCTTTTTCTCCTCTCCAGCCTCCTATCTCAAGTTTCCTTGACCTCTATAACG
GATCCTTACACCATCTCCATCGACCCCTTCGGTCCGGATAGTTGCACCAATGGAACCCTA
ATTTGCATGGGCTCGGTGACTGCAGGTAATGGGTACTTGAGCCTCACTCCGGAGCTCGAA
AATGGCAATTCTACGTTGCCACTTAACACATTTGGTCGGGTTCTGTTCAACCGACCTGTG
GCCGCCTGGCCGGCCACGATTACCACCACCTTCACTGTTAGGATTTCAAAGTTCCCAAAC
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TCTTCAAATAAGTTAATTATGAAGTTCATCTTGATCAATACTTGAAGGGTTATATTGTCT
ATAAATATTTAATACAACATAATTGTTTTAGGTAACTATAGAGATTTATGCTCTCATTGA
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TTTTATTATCTATCTTTCCAATAGTTAATTGATCAAAAACATCAAATATTTTTAAATACA
ATTTCACATTATATGTATCCGAATTGATCCATCTCATTTAGTTAACTTTTTAAATTTATA
ATTGATTTCTGAGTGAAAATTTCAAAAAATAACATCAAAATTAGTATGAGTTTTAACATT
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AGCATACGCAGGGAATCCACTTATCGGCGTCCTCAACCAATCCATCCTCATGTCGGAGAC
AGTTCCAAGCTCCGTTTACGTTGGTTTTACAGCCTCTACAGGGTCTGTACCGGAGAGCCA
CCGTGTCCTCAACTGGGTGTTCACGTCAATACCATTGCCATTTGACTCTCTCAAGTATGG
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AGAGAAAATGAAGAAGAAAGTGGACATTGAGAGCCGAGCTAGGACAGCTGCCAATGTGCC
CAAAATGTTCTCCTACAATCAGCTGCAGAAGGCCACTCACAACTTCAGCAGAGAAAACCT
GTTGGGAAAGGGTGGATTTGGAAGTGTTTTCAAGGGCACCTTGTCAAATCCTACTACAAT
TGTAGCTGTCAAGAAGATCTCCGCAACATCACATCAAGGTTAGTATTAGTATTAGTATTA
GGTCATTCTCTAATGCAGACGATGAAAATATTTTTACAATATAAATGTCAAAACTTGTTC
ATCTAACTGCTATATAAGAATAAAGCTTAAGGCCTTATTTTCATATAGGATAAATGTTAA
TTCAGATTTATTCAGACCTTATTGATTTCCAAGCAATTACTTTACTTGTTGTCACAATGT
TTCATTGTTAGATGATTAAGTATTCTAAGAACTGATAATCAATGTATTTCCCTCTTTTCA
AATAGGTGAAAGGGAGTACTTTGCAGAAATTTGCACAATAGGCCGTCTAAGGCACAAGAA
CATTGTGCAACTTCTAGGTTGGTGCCATGAGGGTGAGCATCTCCTTTTAGTATATGAATA
TATGGTCAATAGTAGCCTTGATCGCTTCATTGGCAAGGGATTTCTTGATTGGACAACCAG
GTACAAGATCCTCTCAGGTTTGGCCTCGGCTTTACTTTATCTGCATGAAGAATGTGACAA
CCCTGTGGTTCACCGTGACGTGAAGCCTAACAATGTTATGTTAGACACCGAACACAATGC
TCATCTAGGGGATTTCGGGCTTGCCAGGTTGATCCAGAACGATTCATGTGCCACCACCAT
GCTAGCCGGAACACCAGGATACTTAGCCCCTGAGGTGGGGTTCTCAGGAAAAGCCACCCC
GGAATCTGATGTGTATAGTTTTGGAATGGTGGTACTCGAAGTAGTATGTGGGAGAAGATC
AAGAGGGATTTTGGAAGAGAATAGTTTGGTGGATCATGTGTGGAATTTATATGCAAGAAA
TGCATTGCTTGAGTGTGTGGACAAACAGCTAGGAGACAAATTTGATGAAAAACAAGTGAA
GAGAACATTAATTGTCGGGCTGGCTTGTTTGCACCCAGATCGTACATTTCGTCCCAAAAT
AAGAAAAGTTGTACAAGTCTTCTTGAACCCCAATGAACCTCTCATGAACTTGCCCGAATC
CAGGCCTAACGCTGTTTACGTATCGGTGTCTTCTTCTAGTTCAATCACAACTAATAGCTC
CCTGCAACCGCCCTTATCGTCGTCACAGGATGAGACACAACACAATGAGACACCGATTTG
ATATACAGAGTTTGATCAGAAATTCTCTATACATACAAAAGCACCGCCCTTGATGTAATT
GAATTAGTCTTATGTCTTTGGAATAAAAAAAAAAACACAAAATGTAGTTAATTAATCTGC
ATGTTTTGTTCTTGGTGCAAAACAGTGTCTAGCTATAGCATACATGTTTGTACATGTTAC
ATTTTTTGTGAACATAAATATCAACAAAAATAAAAATGCATTTACCAGCAGTCGAACCGC
GATCAATTGCTTGGAAGGTAATTATCCTTACCGTTGGACTACGAAGGCCCTGCAACTACC
AACCTGCGCAAAATTTTAATTTTTACTAATAAAGATCAAAACCAAAAGGCCGGCTCTTGT
GGTCTCCAATGGTGACGGCAACATGATAGTAGTAAAACAGGGGACCAACGAAGAGACAAC
GATAAACAAACACATGAAAAACTCAGATGACGCCAGTATAACGGTCCAGGTAGCCGAACC
AGCTCAGGACCAAGACCACTTAGTTTCAATAACTAACAACCAAGACAACACTCAGTTTCT
CTTCTTGTACTTACTTCCATGTCTTCTTCTCAGACACCAACTTTAATCTTCAACCTCCAA
TTGTCTTCCAGGTGACACCCTTATCAGCTTTCTCTGTTTTTGTTTAATCGTTCTCACTTA
TCTCTGCTTTTGTCATCTCCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCCTCTACAAGTT
ATAAAATTTTGCTTTTCGTTTGATTTTAAACAATCTTGGAATATTATTGTAAAAAATTTG
TTGGGTTGATAGTATTTTATGGTCTTCAAGTCCACCAAGTATGTGATTCTAATTTTATCT
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ATATAGCTGTGACTTGAATCGGCAAAAATGTGTTTGTTGGACAATATAAACAGAATTTTT
TTGGTGGATTGTGTTATATTAATGTCTTTTTTGTGTATATGCAAGAGTTTTCATGCGAGG
TCAATTCCATGTAATGTATCTTCAATTAAATCATGTCCTGCGTCATTGTATTTTGTTACG
AAAACCATGAAAACACTCGAAGAGACGGCTTCTTTGTTCGATGTGAATCCTAATGTTGTT
AATAGGACTGTTGACGGCTTCTTGGTTGGAATAAATTGCAGCTGCCTGCCTAACCATGAT
GCGTACACTTGGCATATGGACTACACGGTCCAACGTGGGGACACATGGAAGAACATCTCA
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