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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI018478 | Chr15 | 5997634;5998165;6024950;6024991;6025067;6025091 | 6004127;6004237;6031667 | + | Serine/threonine-protein kinase AFC1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI018478.m1 | 96 | 424 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 166.4 | 8.80E-49 |
LITCHI018478.m1 | 98 | 252 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 56.4 | 2.90E-15 |
LITCHI018478.m2 | 96 | 424 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 166.4 | 8.80E-49 |
LITCHI018478.m2 | 98 | 252 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 56.4 | 2.90E-15 |
LITCHI018478.m3 | 32 | 357 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 165.8 | 1.30E-48 |
LITCHI018478.m3 | 32 | 266 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 69.6 | 2.80E-19 |
LITCHI018478.m4 | 96 | 316 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 133.1 | 1.30E-38 |
LITCHI018478.m4 | 98 | 252 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 57.3 | 1.60E-15 |
LITCHI018478.m5 | 96 | 424 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 166.4 | 8.80E-49 |
LITCHI018478.m5 | 98 | 252 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 56.4 | 2.90E-15 |
LITCHI018478.m6 | 96 | 424 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 166.4 | 8.80E-49 |
LITCHI018478.m6 | 98 | 252 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 56.4 | 2.90E-15 |
LITCHI018478.m7 | 96 | 316 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 133.1 | 1.20E-38 |
LITCHI018478.m7 | 98 | 252 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 57.3 | 1.60E-15 |
LITCHI018478.m8 | 60 | 388 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 166.8 | 6.60E-49 |
LITCHI018478.m8 | 62 | 216 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 56.7 | 2.40E-15 |
LITCHI018478.m9 | 60 | 388 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 168 | 2.80E-49 |
LITCHI018478.m9 | 62 | 219 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 57.2 | 1.60E-15 |
LITCHI018478.m10 | 96 | 424 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 167.6 | 3.80E-49 |
LITCHI018478.m10 | 98 | 255 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 57 | 1.90E-15 |
LITCHI018478.m11 | 96 | 337 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 145.8 | 1.60E-42 |
LITCHI018478.m11 | 98 | 255 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 57.3 | 1.50E-15 |
LITCHI018478.m12 | 96 | 424 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 167.6 | 3.80E-49 |
LITCHI018478.m12 | 98 | 255 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 57 | 1.90E-15 |
LITCHI018478.m13 | 21 | 341 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 158.9 | 1.60E-46 |
LITCHI018478.m13 | 21 | 250 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 63.1 | 2.60E-17 |
LITCHI018478.m14 | 96 | 424 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 167.6 | 3.80E-49 |
LITCHI018478.m14 | 98 | 255 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 57 | 1.90E-15 |
LITCHI018478.m15 | 96 | 424 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 167.6 | 3.80E-49 |
LITCHI018478.m15 | 98 | 255 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 57 | 1.90E-15 |
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>LITCHI018478.m1 ATGGAAACGCAGAGGATAATTGAGTTTCCACACAAGAACATGGACAAGCGTCCCAGGAAA CGACCTCGTTTAACCTGGGACGTCCCTCCTCCTCTTCCTCTTCCACCTCCAAAGGTTATT CCGGCTATATACTGTGGGCAGGAGTTTGGGAATGGAGCAATCCCTAATTACGCATATCCA GCAATGATTTACGGCGGGCTTCCTCGCAATGGTTCACCTCCTTGGAGACCAGACGATAAA GATGGCCATTATGTTTTTGCCGTAGGAGAGAATTTGACTCAGCGCTACAGGATTCTCAGC AAAATGGGTGAAGGGACATTTGGGCAAGTCTTAGAATGTTTTGACAATGAAAAAAAGGAA GTTGTGGCAATCAAAATTGTTCGCTCCATAAACAAGTACCGAGAAGCAGCCATGATTGAA ATTGATGTTCTACAAAGGCTTGCCAGGCATGATGTTGGGGGCGCTCGTTGTGTGCAAATT CGGAATTGGTTTGACTATCGTAATCATATTTGTATTGTTTTTGAGAAGCTTGGACCAAGC TTATACGATTTTCTCCGCAAAAACAACTACCGTTCATTTCCTATTGATCTTGTGCGGGAG CTTGGCAGACAACTGTTGGAGTCTGTAGCATTTATGCATGAGTTATGCCTTATACACACC GACTTGAAGCCAGAAAATATTCTTCTTGTTTCCTCTGAATATATCAAAGTGCCAGACTAT AAGTTTCTGTCTCGATCTGCCAAAGATGGTTCTTATTTCAAGAATTTGCCCAAGTCAAGT GCCATTAAGCTCATTGATTTTGGAAGCACAACTTTTGAACATCAGGATCACAGCTATGTA GTGTCAACGCGGCATTATCGTGCACCAGAAGTTATATTGGGTCTTGGATGGAACTATCCT TGTGATTTATGGAGTGTTGGTTGCATTCTTGTGGAACTTTGCTCTGGTGAGGCTCTTTTT 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CTTGGCAGACAACTGTTGGAGTCTGTAGCATTTATGCATGAGTTATGCCTTATACACACC GACTTGAAGCCAGAAAATATTCTTCTTGTTTCCTCTGAATATATCAAAGTGCCAGACTAT AAGTTTCTGTCTCGATCTGCCAAAGATGGTTCTTATTTCAAGAATTTGCCCAAGTCAAGT GCCATTAAGCTCATTGATTTTGGAAGCACAACTTTTGAACATCAGGATCACAGCTATGTA GTGTCAACGCGGCATTATCGTGCACCAGAAGTTATATTGGGTCTTGGATGGAACTATCCT TGTGATTTATGGAGTGTTGGTTGCATTCTTGTGGAACTTTGCTCTGGTGAGGCTCTTTTT CAAACACATGAGAATTTGGAGCATCTTGCCATGATGGAGAGGGTTTTAGGGCCTCTACCC CAGCATATGGCAATCAGAGCTGACCGGCGTGCTGAGAAATATTTTAGAAGAGGTCCACGA TTGGATTGGCCTGATGGTGCAACCTCAAGAGAAAGCATGAGGGCAGTTTGGAAACTGCCT CGATTGCCGAACCTAATCATGCAGCATGTTGATCACTCTGCTGGTGATCTGATTGATCTC CTGCAAGGGCTCCTACGATATGACCCAGCAGAGCGGCTCAAAGCAAGGGATGCGCTGAGA CATCCCTTCTTCACAAGAGACTTGAGAAGGTGTGGCTATCCCTTGTAA >LITCHI018478.m3 ATGTGGGTTGACAGTTGTTTTCTATTTGGCCTCTTGCTGGTATGCATAACTTGTTTACTG ATTTTCTTCTTTACTTGTTTTTCAGACAGGATTCTCAGCAAAATGGGTGAAGGGACATTT GGGCAAGTCTTAGAATGTTTTGACAATGAAAAAAAGGAAGTTGTGGCAATCAAAATTGTT CGCTCCATAAACAAGTACCGAGAAGCAGCCATGATTGAAATTGATGTTCTACAAAGGCTT 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CAAACACATGAGAATTTGGAGCATCTTGCCATGATGGAGAGGGTTTTAGGGCCTCTACCC CAGCATATGGCAATCAGAGCTGACCGGCGTGCTGAGAAATATTTTAGAAGAGGTCCACGA TTGGATTGGCCTGATGGTGCAACCTCAAGAGAAAGCATGAGGGCAGTTTGGAAACTGCCT CGATTGCCGAACCTAATCATGCAGCATGTTGATCACTCTGCTGGTGATCTGATTGATCTC CTGCAAGGGCTCCTACGATATGACCCAGCAGAGCGGCTCAAAGCAAGGGATGCGCTGAGA CATCCCTTCTTCACAAGAGACTTGAGAAGGTGTGGCTATCCCTTGTAA >LITCHI018478.m6 ATGGAAACGCAGAGGATAATTGAGTTTCCACACAAGAACATGGACAAGCGTCCCAGGAAA CGACCTCGTTTAACCTGGGACGTCCCTCCTCCTCTTCCTCTTCCACCTCCAAAGGTTATT CCGGCTATATACTGTGGGCAGGAGTTTGGGAATGGAGCAATCCCTAATTACGCATATCCA GCAATGATTTACGGCGGGCTTCCTCGCAATGGTTCACCTCCTTGGAGACCAGACGATAAA GATGGCCATTATGTTTTTGCCGTAGGAGAGAATTTGACTCAGCGCTACAGGATTCTCAGC AAAATGGGTGAAGGGACATTTGGGCAAGTCTTAGAATGTTTTGACAATGAAAAAAAGGAA GTTGTGGCAATCAAAATTGTTCGCTCCATAAACAAGTACCGAGAAGCAGCCATGATTGAA ATTGATGTTCTACAAAGGCTTGCCAGGCATGATGTTGGGGGCGCTCGTTGTGTGCAAATT CGGAATTGGTTTGACTATCGTAATCATATTTGTATTGTTTTTGAGAAGCTTGGACCAAGC TTATACGATTTTCTCCGCAAAAACAACTACCGTTCATTTCCTATTGATCTTGTGCGGGAG CTTGGCAGACAACTGTTGGAGTCTGTAGCATTTATGCATGAGTTATGCCTTATACACACC GACTTGAAGCCAGAAAATATTCTTCTTGTTTCCTCTGAATATATCAAAGTGCCAGACTAT AAGTTTCTGTCTCGATCTGCCAAAGATGGTTCTTATTTCAAGAATTTGCCCAAGTCAAGT GCCATTAAGCTCATTGATTTTGGAAGCACAACTTTTGAACATCAGGATCACAGCTATGTA GTGTCAACGCGGCATTATCGTGCACCAGAAGTTATATTGGGTCTTGGATGGAACTATCCT TGTGATTTATGGAGTGTTGGTTGCATTCTTGTGGAACTTTGCTCTGGTGAGGCTCTTTTT CAAACACATGAGAATTTGGAGCATCTTGCCATGATGGAGAGGGTTTTAGGGCCTCTACCC CAGCATATGGCAATCAGAGCTGACCGGCGTGCTGAGAAATATTTTAGAAGAGGTCCACGA TTGGATTGGCCTGATGGTGCAACCTCAAGAGAAAGCATGAGGGCAGTTTGGAAACTGCCT CGATTGCCGAACCTAATCATGCAGCATGTTGATCACTCTGCTGGTGATCTGATTGATCTC CTGCAAGGGCTCCTACGATATGACCCAGCAGAGCGGCTCAAAGCAAGGGATGCGCTGAGA CATCCCTTCTTCACAAGAGACTTGAGAAGGTGTGGCTATCCCTTGTAA >LITCHI018478.m7 ATGGAAACGCAGAGGATAATTGAGTTTCCACACAAGAACATGGACAAGCGTCCCAGGAAA CGACCTCGTTTAACCTGGGACGTCCCTCCTCCTCTTCCTCTTCCACCTCCAAAGGTTATT CCGGCTATATACTGTGGGCAGGAGTTTGGGAATGGAGCAATCCCTAATTACGCATATCCA GCAATGATTTACGGCGGGCTTCCTCGCAATGGTTCACCTCCTTGGAGACCAGACGATAAA 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