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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI018413 | Chr15 | 5402748 | 5408957 | - | Transcription factor MYB3R-5 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI018413.m1 | 75 | 121 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 54.4 | 1.10E-14 |
LITCHI018413.m1 | 78 | 137 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 55.5 | 5.40E-15 |
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LITCHI018413.m2 | 75 | 121 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 54.4 | 1.10E-14 |
LITCHI018413.m2 | 78 | 137 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 55.5 | 5.40E-15 |
LITCHI018413.m2 | 127 | 173 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 62.9 | 2.60E-17 |
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LITCHI018413.m3 | 75 | 121 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 54.4 | 1.10E-14 |
LITCHI018413.m3 | 78 | 137 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 55.5 | 5.40E-15 |
LITCHI018413.m3 | 127 | 173 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 62.9 | 2.60E-17 |
LITCHI018413.m3 | 130 | 188 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 60.5 | 1.50E-16 |
LITCHI018413.m3 | 179 | 222 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 59 | 4.30E-16 |
LITCHI018413.m3 | 182 | 228 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 31.9 | 1.30E-07 |
LITCHI018413.m4 | 59 | 105 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 54.5 | 1.10E-14 |
LITCHI018413.m4 | 62 | 121 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 55.6 | 5.10E-15 |
LITCHI018413.m4 | 111 | 157 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 62.9 | 2.50E-17 |
LITCHI018413.m4 | 114 | 172 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 60.6 | 1.40E-16 |
LITCHI018413.m4 | 163 | 206 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 59 | 4.20E-16 |
LITCHI018413.m4 | 166 | 212 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 32 | 1.20E-07 |
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>LITCHI018413.m1 ATGAGTTCCAGTTCGATTCCCGCCACTTCCTTGCAAGAAGAGAGGGAGATGGCTGAGCTG AAAATTGAGGAGTGTTGTCTTGAGAATAAACAACTAACGGCTGCTTCAAGCTCTTCGGTA TCTGAAGGCAGTGGCAGTGCTATTCTCAAGTCTCCTGGGGTATCTAGTCCGGCAACAACA TCACCCACTCATAGGAGGACCACTGGCCCAATAAGGCGAGCAAAAGGTGGTTGGACACCA GAGGAGGATGAGACATTAAGAAATGCGGTGGCAACTTTTAAGGGAAAGAGTTGGAAGAAA ATTGCTGAGTTTTTCCCTGATAGATCAGAGGTGCAATGCTTGCACCGATGGCAGAAGGTT TTGAATCCGGATTTAGTTAAAGGACCTTGGACTCAAGAGGAAGATGAAAAAATTACTGAA CTGGTAGCAAGATATGGACCCACAAAATGGTCTGTAATTGCGAAGTCTTTACCTGGTCGT ATTGGGAAACAATGCCGAGAGAGGTGGCATAATCATTTGAATCCAGATATAAAGAAGGAT GCATGGACTTTAGAGGAGGAATTGGCACTCATGAATGCCCACCGGATACATGGAAACAAA TGGGCTGAAATTGCCAAGGTTTTACCGGGAAGGACTGATAATTCCATAAAGAATCACTGG AATAGTTCTTTGAAGAAAAAGTTGGATTTCTATTTGGCTACTGGGAAACTTCCACCTGTT GCAAAGAACGGTCTCCAAAATGGCAACAAAGATACAAACCAACCATCTACTTCTAAGAGA AAATGTTTTGTTTATTCAAATAAAGATTCGGATTCAACTGCCCAAACTTCGTCAGGAACT ACAGATCTAGGTAAGCTAGATGAGGACAGCAAGGATCAGCTTGAGTCCTCATTTCTAGTT CCAGACATGGCTGCTTCATCAAATCATCTGCCAAATGAGTCTGTGGATTCTGAAGGCGTA 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TCACTAGATTCTGATCCTTCGGACACATCTTCTATGCAACATCAATGTACCTCTAGTCCT GTTACATCACCGATTAGTTTCTTCACTCCACCTTGTGTGAAGGGCAGTGGCTTGAGTGCT CAAACTCCTGAATCTATATTGAGAAATGCTGCTAAGACCTTCCCCAATACTCCTTCCATA TTTCGAAAGAGAAAGTCAGTAGGTCAGGCTAAATTGGATACTAATAAAACTGGAAATGTA AATGGGAATACAGTAAATGACAGGTCTCCTGAGACTTGTGAACAGCAAAGCACTGAGAAT AATTTGGAAAATTCCCGGTTTCAAGATCGAAGTTCATGTGAGAGTCCTGCTTGTGAAACT TGTAGCATCATTGAGCCAACTGGGAAGGCTTTTAATGTTTCTCCTCCATACCGGTTAAGA TCCAAACGCACTGCTGTTTTTAAGTCGGTAGAGAGACAACTTGAGTTCACTTTTGACAAA GAGAAGTATGATCACATTACCAAATCTAAAGAATTATCTGTGAATGGAAGTTCTTCTGTA CCTGAAGATTTGCCCACAACAAAAAAAATGGAGGTGACCTAG >LITCHI018413.m3 ATGAGTTCCAGTTCGATTCCCGCCACTTCCTTGCAAGAAGAGAGGGAGATGGCTGAGCTG AAAATTGAGGAGTGTTGTCTTGAGAATAAACAACTAACGGCTGCTTCAAGCTCTTCGGTA TCTGAAGGCAGTGGCAGTGCTATTCTCAAGTCTCCTGGGGTATCTAGTCCGGCAACAACA TCACCCACTCATAGGAGGACCACTGGCCCAATAAGGCGAGCAAAAGGTGGTTGGACACCA GAGGAGGATGAGACATTAAGAAATGCGGTGGCAACTTTTAAGGGAAAGAGTTGGAAGAAA ATTGCTGAGTTTTTCCCTGATAGATCAGAGGTGCAATGCTTGCACCGATGGCAGAAGGTT 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CATGGAAACAAATGGGCTGAAATTGCCAAGGTTTTACCGGGAAGGACTGATAATTCCATA AAGAATCACTGGAATAGTTCTTTGAAGAAAAAGTTGGATTTCTATTTGGCTACTGGGAAA CTTCCACCTGTTGCAAAGAACGGTCTCCAAAATGGCAACAAAGATACAAACCAACCATCT ACTTCTAAGAGAAAATGTTTTGTTTATTCAAATAAAGATTCGGATTCAACTGCCCAAACT TCGTCAGGAACTACAGATCTAGGTAAGCTAGATGAGGACAGCAAGGATCAGCTTGAGTCC TCATTTCTAGTTCCAGACATGGCTGCTTCATCAAATCATCTGCCAAATGAGTCTGTGGAT TCTGAAGGCGTAGAGTGTAAGCCAGAGTCACCTGATATAGATCTTAGTTGTTCAGAATCT ATGCCAAGGCTTGAAACCAGTGAAGTCAACCATGAATATGTTGAAGAGAGAACAACTGGG AGACAACTGCAAGTTGGAACTCCAAGTTATGGTTCTTTGTACTATGTGCCACCTCAGTTA AGAAGTACTATTTCACTAGATTCTGATCCTTCGGACACATCTTCTATGCAACATCAATGT ACCTCTAGTCCTGTTACATCACCGATTAGTTTCTTCACTCCACCTTGTGTGAAGGGCAGT GGCTTGAGTGCTCAAACTCCTGAATCTATATTGAGAAATGCTGCTAAGACCTTCCCCAAT ACTCCTTCCATATTTCGAAAGAGAAAGTCAGTAGGTCAGGCTAAATTGGATACTAATAAA ACTGGAAATGTAAATGGGAATACAGTAAATGACAGGTCTCCTGAGACTTGTGAACAGCAA AGCACTGAGAATAATTTGGAAAATTCCCGGTTTCAAGATCGAAGTTCATGTGAGAGTCCT GCTTGTGAAACTTGTAGCATCATTGAGCCAACTGGGAAGGCTTTTAATGTTTCTCCTCCA 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