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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI018330 | Chr15 | 4694180 | 4700225 | - | Putative receptor protein kinase ZmPK1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI018330.m1 | 73 | 157 | PF01453.27 | B_lectin | Repeat | 86 | 2.30E-24 |
LITCHI018330.m1 | 246 | 306 | PF00954.23 | S_locus_glycop | Domain | 41 | 2.40E-10 |
LITCHI018330.m1 | 335 | 387 | PF08276.14 | PAN_2 | Domain | 23.4 | 5.10E-05 |
LITCHI018330.m1 | 342 | 376 | PF14295.9 | PAN_4 | Domain | 13.5 | 0.058 |
LITCHI018330.m1 | 529 | 612 | PF01453.27 | B_lectin | Repeat | 49.4 | 5.60E-13 |
LITCHI018330.m1 | 698 | 761 | PF00954.23 | S_locus_glycop | Domain | 33 | 7.30E-08 |
LITCHI018330.m1 | 779 | 834 | PF08276.14 | PAN_2 | Domain | 25.8 | 9.00E-06 |
LITCHI018330.m1 | 792 | 829 | PF14295.9 | PAN_4 | Domain | 19.8 | 0.00059 |
LITCHI018330.m1 | 962 | 1027 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 31.5 | 1.10E-07 |
LITCHI018330.m1 | 963 | 1026 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 36.9 | 2.70E-09 |
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>LITCHI018330.m1 ATGCCTCGTCTAGTCACAGTTTTGATCCTCCTGTTCTTGTCTTTTGAGACTTCGACGAGT TCCCAGAACTTGTTGAGAAGAGAATCTTATCTGTCTGTTGAAGACAGTTCACGCGTGTTG ACTTCCCCAGACAAGACATTCACTTGTGGCTTCTACAGTCTTGATGGCGAAAATGCATAC TGGTTCTCCATCTGGTACACCAACTCCAGAGACAGGACTGTTGTCTGGATGGCCAACCGT GACAGGCCTGTCAATGGTCAGGGCTCCAGACTCTCTCTACGTGGAAATGGTGCAATGGTT TTGACTGACGTTGATGGGACTATCATTTGGATGACCAACACCACCTCTACCAAGGCTGAT AGAGCTGAGCTTTTGGACTCTGGAAACCTTATTTTGAAGGACATGCAAGGTAAGATTTTG TGGCAAAGCTTTGATTTTCCGACTGATACACTGCTTCCTAGTCAATATATTTCAAAGGGT GTCAAGCTGGTTTCTAGTCTAGGAAGTGGGAATTTTGGTTCTGGGTATTTTAGTTTCTAT TTTGATAATGATAATGTCATGAGGTTGATGTATGATGGCCCTGATACTTCAAGTGTGTAT TGGCCGAATCCTGATTTTAGTGTGTTTCAAAATGAAAGAACATCGTACAACAATAGTCGA ATTGCTGTGTTAGATGATGAGGGCAGGTTTTTATCTAGTGATAGATTGCAATTCAGTGCT ACTGACACGGGGTTTGGGATTAAAAGAAGGTTGACTATGGATTATGACGGGAATCTAAGG CTTTATAGCTTGAATAACGATAGGGGTTCATGGATGATTTCGTGGGAAGCTCTTAGGCAG CAGTGTAACGTGCATGGGATATGTGGTAGAAATGGGATTTGTGTTTATACACCAGAGCCA AAGTGTTCTTGCCCTCCCTGGTATGAGGTTTCGGAACGTGGTAATTGGAACAAAGGCTGC AAGCCTAAGTTCAATAGAACTTGTTCCAATGCTCAGCAGGTGAAATTCATCAAGGTTTCA CATGTCGATTTCTATGGCTATGATCTTAATTTCAGTACGTCTATATCAATGGACTCTTGT ATGAAATTATGCTTGGATGATTGCCGGTGTGAAGCATTTAGTTATAGGCTAACGGGGCAG GGGCTTTGTTTCACGAAAAATGTGCTTTTCAATGGCTTACAGACTCCAAGCTTTCCGGGT GACATATATGTAAAATTGCCAGTGGATGTGGAGGCATCAGAACCTGCTAGTCTCGTTGGC ACCAATCTTGTGTGCCCCACTAGTGCCTCTAAAATTGTGATAGGATCTTCATCTATGCAT GACACTACTGTTAAGAGAGTAAGATGGGCTTACCTCTATGGCTTTGCAATTGCTATTGGT GCAATTGAAGTTATCTTATTTGTATTTGGATGGTGGTACCTCTTCAGAAGACATGACGTG CCATCCTTTTTGGAAGATGGATATTGTGCAATATCAAGTCAGTTCAGGAGATTCAGCTAT GTTGAACTCAAAAAGGCAACAAATAATTTCAGAGAAGAGGTTGGTAGAGGAGCATCCGGG GCTGTCTATAAGGGTGTTTTGGATGATGATAGGGCGGTACAAGCAGAGTCGAAGGGGTTG CTAAGATTAAGCCTTGGAAACTTCTTTGCTGTTGAAAAAGAGAACAGTTCAGTGGTATGG TCAACTGACACATTCACAGTTGCAGATGTGGAAGCTCAGCTTCTTGAAACAGGCAATCTC GTTTTGGTCGACAAAGCAAAAAGGATCATCTGGGGAAGTTTTGATTCCCCCACTGACACA CTCCTACCATTTCAGCCACTCACCAAGGACACATCCTTGGTCTCTAAGAGAAACCAACAT ACACACTTATCAGGACACTATCAGTGGAGATTTGATGATAATAATGTTCTAAATCTCATC TATGATGGTCCTCTAGTATCAAGTGTCTACTGGCCGGATACAAACACTCCCATGTTTGAA AACGGCAGAACGCCTTACAACAGTACCAGAGTAGCAGTTCTAAATGCGAGAGGAACTTTC CAATCAAGTGACAATTTCAGATTCAATGCATCTGATTCCGGAGTTGGTCCCAAGAGGCGC TTAACATTAGATTATGATGGGATGTTGAGATTGTATAGCCTCGATGAGTCAACAAGGCTA TGGAAAATCTCATGGATGCCTGCTGGCCTAGACAATTGCTTAGTGCATGGGTTGTGTGGT GTGAATGGTGTATGCATTTACAATCCGCAACCTACTTGCACTTGCCCTTATGGTTTCGAG ATCAATGATCCTTTGGACTGGTCCAAGGGGTGCTCTCCTTCATTTAATCTGACTTGTGAT CCGAATGAATCTGACTTTCTGGAGCTCCAGAACACTGACTACTATGGATATGACTTGGGC ATCTGGAAAAGTGGCATTTCCTTGAAGGACTGCAAGAATCGATGCCTAAATGATTGCAGA TGCAGGGGGTTTACCTATATAACAGACGGTGAAGGACTATGTTTTCCAAAAGGCATTCTC CTGAATGGTTATAGAATGCCAAGTAAAAGCTCCATTATGCATATAAGGATTCCCAAAGGA ATGATAAACTCTTCGGCAGAACTGGTGAAGTTATGGACATATGACTTGAACTGTTCTTCC GAGGAAATTGTTCTAGAAGATGAGAGCAGTAAGGGAGAAAAAACCAGTAAGAACGGTTAC ATGAAATACTTAATAGCATTTGTGGGTTCCTTTGCAGTCCTTGAAATAGTATTGATTGGT TTAGGATGGTGGTTTTTCTTCAGAAAACATGTTAATGAGGAACTGATTAATATGGGTTAC ACTGTGTTAGCTATGGGATTCAAACGTTTTACTTATGCAGAGCTGAAGCAGGCAACGAGG AACTTCAACAAAGAGATAGGAAAAGGGGGCTTTGGAACGGTCTACAGAGGGATTCTTGAT GATAAAAGAATTGTAGCTGTGAAGAGACTAGAAGGCATTTTGCAAGGAGATGCAGAATTC TGGGCAGAAGTGAGCATCATAGGGAGGATCAATCACAGGAATTTGGTGAAATTGTGGGGT TTCTATGATCGTGATGCAAGGCCTCAGATGAGCAAGGTTGTCGAGCTTCTATCCGGATAT GATGAGTCAACACCATCAAGCCCGGATCATGAGACAATCATGGTTTTATTATAG
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>LITCHI018330.m1 ATGCCTCGTCTAGTCACAGTTTTGATCCTCCTGTTCTTGTCTTTTGAGACTTCGACGAGT TCCCAGAACTTGTTGAGAAGAGAATCTTATCTGTCTGTTGAAGACAGTTCACGCGTGTTG ACTTCCCCAGACAAGACATTCACTTGTGGCTTCTACAGTCTTGATGGCGAAAATGCATAC TGGTTCTCCATCTGGTACACCAACTCCAGAGACAGGACTGTTGTCTGGATGGCCAACCGT GACAGGCCTGTCAATGGTCAGGGCTCCAGACTCTCTCTACGTGGAAATGGTGCAATGGTT TTGACTGACGTTGATGGGACTATCATTTGGATGACCAACACCACCTCTACCAAGGCTGAT AGAGCTGAGCTTTTGGACTCTGGAAACCTTATTTTGAAGGACATGCAAGGTAAGATTTTG TGGCAAAGCTTTGATTTTCCGACTGATACACTGCTTCCTAGTCAATATATTTCAAAGGGT GTCAAGCTGGTTTCTAGTCTAGGAAGTGGGAATTTTGGTTCTGGGTATTTTAGTTTCTAT TTTGATAATGATAATGTCATGAGGTTGATGTATGATGGCCCTGATACTTCAAGTGTGTAT TGGCCGAATCCTGATTTTAGTGTGTTTCAAAATGAAAGAACATCGTACAACAATAGTCGA ATTGCTGTGTTAGATGATGAGGGCAGGTTTTTATCTAGTGATAGATTGCAATTCAGTGCT ACTGACACGGGGTTTGGGATTAAAAGAAGGTTGACTATGGATTATGACGGGAATCTAAGG CTTTATAGCTTGAATAACGATAGGGGTTCATGGATGATTTCGTGGGAAGCTCTTAGGCAG CAGTGTAACGTGCATGGGATATGTGGTAGAAATGGGATTTGTGTTTATACACCAGAGCCA AAGTGTTCTTGCCCTCCCTGGTATGAGGTTTCGGAACGTGGTAATTGGAACAAAGGCTGC AAGCCTAAGTTCAATAGAACTTGTTCCAATGCTCAGCAGGTGAAATTCATCAAGGTTTCA CATGTCGATTTCTATGGCTATGATCTTAATTTCAGTACGTCTATATCAATGGACTCTTGT ATGAAATTATGCTTGGATGATTGCCGGTGTGAAGCATTTAGTTATAGGCTAACGGGGCAG GGGCTTTGTTTCACGAAAAATGTGCTTTTCAATGGCTTACAGACTCCAAGCTTTCCGGGT GACATATATGTAAAATTGCCAGTGGATGTGGAGGCATCAGAACCTGCTAGTCTCGTTGGC ACCAATCTTGTGTGCCCCACTAGTGCCTCTAAAATTGTGATAGGATCTTCATCTATGCAT GACACTACTGTTAAGAGAGTAAGATGGGCTTACCTCTATGGCTTTGCAATTGCTATTGGT GCAATTGAAGTTATCTTATTTGTATTTGGATGGTGGTACCTCTTCAGAAGACATGACGTG CCATCCTTTTTGGAAGATGGATATTGTGCAATATCAAGTCAGTTCAGGAGATTCAGCTAT GTTGAACTCAAAAAGGCAACAAATAATTTCAGAGAAGAGGTTGGTAGAGGAGCATCCGGG GCTGTCTATAAGGGTGTTTTGGATGATGATAGGGCGGTACAAGCAGAGTCGAAGGGGTTG CTAAGATTAAGCCTTGGAAACTTCTTTGCTGTTGAAAAAGAGAACAGTTCAGTGGTATGG TCAACTGACACATTCACAGTTGCAGATGTGGAAGCTCAGCTTCTTGAAACAGGCAATCTC GTTTTGGTCGACAAAGCAAAAAGGATCATCTGGGGAAGTTTTGATTCCCCCACTGACACA CTCCTACCATTTCAGCCACTCACCAAGGACACATCCTTGGTCTCTAAGAGAAACCAACAT ACACACTTATCAGGACACTATCAGTGGAGATTTGATGATAATAATGTTCTAAATCTCATC TATGATGGTCCTCTAGTATCAAGTGTCTACTGGCCGGATACAAACACTCCCATGTTTGAA AACGGCAGAACGCCTTACAACAGTACCAGAGTAGCAGTTCTAAATGCGAGAGGAACTTTC CAATCAAGTGACAATTTCAGATTCAATGCATCTGATTCCGGAGTTGGTCCCAAGAGGCGC TTAACATTAGATTATGATGGGATGTTGAGATTGTATAGCCTCGATGAGTCAACAAGGCTA TGGAAAATCTCATGGATGCCTGCTGGCCTAGACAATTGCTTAGTGCATGGGTTGTGTGGT GTGAATGGTGTATGCATTTACAATCCGCAACCTACTTGCACTTGCCCTTATGGTTTCGAG ATCAATGATCCTTTGGACTGGTCCAAGGGGTGCTCTCCTTCATTTAATCTGACTTGTGAT CCGAATGAATCTGACTTTCTGGAGCTCCAGAACACTGACTACTATGGATATGACTTGGGC ATCTGGAAAAGTGGCATTTCCTTGAAGGACTGCAAGAATCGATGCCTAAATGATTGCAGA TGCAGGGGGTTTACCTATATAACAGACGGTGAAGGACTATGTTTTCCAAAAGGCATTCTC CTGAATGGTTATAGAATGCCAAGTAAAAGCTCCATTATGCATATAAGGATTCCCAAAGGA ATGATAAACTCTTCGGCAGAACTGGTGAAGTTATGGACATATGACTTGAACTGTTCTTCC GAGGAAATTGTTCTAGAAGATGAGAGCAGTAAGGGAGAAAAAACCAGTAAGAACGGTTAC ATGAAATACTTAATAGCATTTGTGGGTTCCTTTGCAGTCCTTGAAATAGTATTGATTGGT TTAGGATGGTGGTTTTTCTTCAGAAAACATGTTAATGAGGAACTGATTAATATGGGTTAC ACTGTGTTAGCTATGGGATTCAAACGTTTTACTTATGCAGAGCTGAAGCAGGCAACGAGG AACTTCAACAAAGAGATAGGAAAAGGGGGCTTTGGAACGGTCTACAGAGGGATTCTTGAT GATAAAAGAATTGTAGCTGTGAAGAGACTAGAAGGCATTTTGCAAGGAGATGCAGAATTC TGGGCAGAAGTGAGCATCATAGGGAGGATCAATCACAGGAATTTGGTGAAATTGTGGGGT TTCTATGATCGTGATGCAAGGCCTCAGATGAGCAAGGTTGTCGAGCTTCTATCCGGATAT GATGAGTCAACACCATCAAGCCCGGATCATGAGACAATCATGGTTTTATTATAG
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>LITCHI018330.m1 - Up_Stream_Len 2000 AGGAATGTTTAACTTGGTGGGACTTCATACTAAAGTAATTGTTTCGGTTTGCATGAGCAC TAAATGTTGCTAGTCTCAATTGTCGTGGTCTTTATAAGTATTATGAATTATAAGTTTTAG TGATGTCAGTCATATTGCTCAATTTTCTAGTTCTAATGTAGACACTGTTATCTGAAATAG ACTGAGGCTGGTAGGCATCTAGAAGCATTCTCGATTCAGCTTGTGATTCTTGCAATCTGG AAGCAAGCGTTGCATATTTGCCATACACAGGCTGCCTCAGCTATGGATGGAAGTCCAAGC CCAGAGACTACCAGATTGAGGAGAATCTCTGGCAATAAGCATGGTACTCCTGATACAGAA GAGTGTTCTGATTTTAATGCTCAGAGGCCAGAGGAATTGGCCTCTCAAATTGAGAGGGAA TTTCTCCGGGAAGTTGAGTATGCTGAAGAACTTGCAAAGGTTATTGAGCCTGGTATGGCC TTGGTAATTTAATTAAAATTATTTTTTTTTCCTTTTGCTTGGGCATGGGAGTGATTGTAG CCTGTAAGTTTAAATTATCCAAGGTTTTCTGCTAAGTTTGAAAACAGTGCTTGACAACTC TTAACACTATAATGACTCTTCGAATAATTATTTGTATATTTTATGGGGTCTCATGAAGCC TAAAGCATCATGATCATAAGAATAGCATAAACATCTAATGCTATAAAAACATTTTAATCA GTAGAAAGGTGGCCGTGTGTAGACATTATTATATAATGCTATATTTTCATTATATTGCAG GAAGTACAGAGATGCCTGATGCGATGGAGACGATATTTCAAGCTGCTCTTGCTCTTGGCA GACATGGGGGAGTGAGTACTTTTTCTTTTCACTCTTCGTTCATTTGGTCATTAAATTCTA TTCTTGGGGTTCCAGAAGTAAAAAAAGTTGGCGCCACATAGATGTTATATGAAATAAACT GGAAATTGTCGCGACTTGGCAGGTTGATGAGCTTATGGGCAATATGGGGAGTGCAGCTTC CCTGTATTCAAAAGCAGTGCGATTACTAGTCTTCCTTCTATTGGAAGCACCATCTCTCAT TCTGAACCCACCATTTTCGCTCACAAACTCAGACCGATATAGGCTCCGAACTTACATTGA TATCCTTAATAACCGGCAAGGTCATTCGAGGTCTCAGAGGATGGCTCTTCTCAAGTGTCA AGATCAAGCATGACTTTTGAGAGTTTTATGCCTTCTAATGATGAGTTACCTATTTTACAA TGTAAAAATATTTCTTTGTACAGCTCTATTCTTTTCAGTGGGGATTGGGATGTTATTGGT TTCAACCTGTATTAAACGTTGATAATGTAATATTCTTATTTCTGTGATTTCAGGAATTGA TTATTTATAAATATTTGTTCTCCCATTCTGCTGCCTGATACCTTACATCCCACAAATAGA TTATCCACTGCAAATGTTTTCACTACATTAGAATCTTTTCCTGAACTTGTTCTTTTGGAT TTTTATACCTATTTCAATAATTGAAAAGTAATAACTCCTACCATGAGGCAAAAATTTATC TATATAATCTTTAAAAAATATTTATTGAAAGTATAATCTTTAAAAAATATAATATTAACA AATTCTACCTTATCATACGTCGCCTCAGCGAGTCCCACACGTCTCTATTATCTCCTCAAC CAAGACGCAGAAAAATTAGACTTTGACCAGCAGCGCCGACCTTTCTATTTATGTAAAATA AATAAATATCTGCCGCCACCAAAATTGTTATATATGACAAAATTATTCGGCCAAATAAGG CCAGTCTATTTATACTAATAATTCATGTGACCATTTGGTGAAGACTCATTGTCAAAACAG TTAACTTATAAATTAAATCAGCTTGTGCATCTAAACTATTAATTAAGTTCAAACACTTGT CTTAAAATCATATCATGCACCAATCAAAGTCCTGAACAAAAATAACCATGAAACAGAAAA CCGTAACATTTCCATACAAC
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>LITCHI018330.m1 GenomeSequence - ATGCCTCGTCTAGTCACAGTTTTGATCCTCCTGTTCTTGTCTTTTGAGACTTCGACGAGT TCCCAGAACTTGTTGAGAAGAGAATCTTATCTGTCTGTTGAAGACAGTTCACGCGTGTTG ACTTCCCCAGACAAGACATTCACTTGTGGCTTCTACAGTCTTGATGGCGAAAATGCATAC TGGTTCTCCATCTGGTACACCAACTCCAGAGACAGGACTGTTGTCTGGATGGCCAACCGT GACAGGCCTGTCAATGGTCAGGGCTCCAGACTCTCTCTACGTGGAAATGGTGCAATGGTT TTGACTGACGTTGATGGGACTATCATTTGGATGACCAACACCACCTCTACCAAGGCTGAT AGAGCTGAGCTTTTGGACTCTGGAAACCTTATTTTGAAGGACATGCAAGGTAAGATTTTG TGGCAAAGCTTTGATTTTCCGACTGATACACTGCTTCCTAGTCAATATATTTCAAAGGGT GTCAAGCTGGTTTCTAGTCTAGGAAGTGGGAATTTTGGTTCTGGGTATTTTAGTTTCTAT TTTGATAATGATAATGTCATGAGGTTGATGTATGATGGCCCTGATACTTCAAGTGTGTAT TGGCCGAATCCTGATTTTAGTGTGTTTCAAAATGAAAGAACATCGTACAACAATAGTCGA ATTGCTGTGTTAGATGATGAGGGCAGGTTTTTATCTAGTGATAGATTGCAATTCAGTGCT ACTGACACGGGGTTTGGGATTAAAAGAAGGTTGACTATGGATTATGACGGGAATCTAAGG CTTTATAGCTTGAATAACGATAGGGGTTCATGGATGATTTCGTGGGAAGCTCTTAGGCAG CAGTGTAACGTGCATGGGATATGTGGTAGAAATGGGATTTGTGTTTATACACCAGAGCCA 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