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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI018292 | Chr15 | 4363196 | 4367713 | + | Transcription factor MYB1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI018292.m1 | 60 | 106 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 55.4 | 5.40E-15 |
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LITCHI018292.m1 | 112 | 156 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 54 | 1.50E-14 |
LITCHI018292.m1 | 115 | 160 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 32.2 | 1.00E-07 |
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LITCHI018292.m2 | 115 | 160 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 32.2 | 1.00E-07 |
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>LITCHI018292.m2 ATATTTTGCAATCTTCACAGTTCATTCACTTGCAGTTAAGTCGGTTTTTTTTTTTACCTC TTCTTCTCTTTTATAACAAAACAAAACGTTAAAAAAAAAAAAAAAAGGCAAATGGAAACT GAAACGGAGACTCGAAAGCCGGAAGCAACAGTGGTCGAACTCGACGGAGCAGATACCGTG GACGCTGGAGAGGCTGCCGCAGACGGCGGCGGAAGCGGCGACGATTCCGTTTTGGTCGTC GAAGAAGGAAGCAGAAGCAGAAGCGGCGGCGGCGGCAGAGACAGAGTGAAGGGACCTTGG TCTCCTGAAGAGGACACCATACTTAGCCAACTGGTGAGCAAGTTCGGGGCGAGGAATTGG AGCTTGATCGCCCGAGGAATATCGGGTCGCTCCGGCAAGTCTTGCCGGCTCAGATGGTGT AATCAGCTCGACCCAGCCGTTAAACGCAAGCCATTTACTGACGAGGAAGATCAAATCATA GTCGCAGCTCATGCAGTCCATGGAAACAAATGGGCAGTAATTGCTAGGCTTTTACCAGGA AGAACAGATAATGCTATTAAGAACCACTGGAATTCCACCCTAAGGCGTCGTGGTGCAACG GAATTTGATGGGATGAAGAAGATGGAGTCTGGACATATGATGGAGGATACCAGCATAGAA AAGACCAAAGCATCATCTGAAGAAACACTATCTTGTGGTGATGTCAGTTCCTTTAAATCC TTGGAGGGAAGAGATGTAACTTCTTTGGAAGTTTTGGATAATCAGTGTGGAGACAAGTCC TTAACAGAAGGTCCATCTAGTCAAGAAGCAAGAGAACCACCTACTCTTTTCCGTCCAACG GCACGTGTCAGTGCTTTTAGTGTTTATAACACTGTGCATGGCCCAGAGATAGCTTCACCT CATCCAAGGCCAATTCCAATGCAAGGACCCTTAGTCCAAGCATCAATGCCGGATCCTGGG 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AGTCGAACCTAATGCATAATATAGAAATATCTTCATATATACATCCTGATGCGGAGATTG AGTTTGATATAAAGTGGAAGCCATTGTCGTATGGGGTCATAGCTCTTAAGTGCTATGGTT ATTTTGATGGGGACGTGTGTTCTTTTCAGTGATACAAACCCCTCACTCCATTTACATGTG CAAGAAAATGAGTGTTTTGATTCTTCTTTCTTCAAACACTACAAGCTGTGCAAGTGAAGA TAATCAGATATTGCTAGGGAAAGTTACGTAAGTGCTTTTCATATTCTGATTAGGAGGCTA GCGATTGATAAGAAGAATTTTGTGTTGTCTACTTGTGTCGTTCTGTGTCTGAGTCCTCAA GTTTTCATTTGGTAAACAAACACAGCTACTGGACCCCAGATGACTCAACTAATTTGTTTC CTCTTTGTCTCTAAACAAAACCATAAAAAGCACCCAACTCCATCTCTCTATATAAGTTTT AACTACTCGCCAAACGCCCTTCTTATAACAAAAGAACAAGATGGAGGATTTCACAAAGCT GC
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>LITCHI018292.m2 + Up_Stream_Len 2000 ATTTTTACCATATAAACTTGATAACGATTAGGGAAGTTTGCATTGGAGATGTTAATTTTA ATCCTCTATTAATTTATCCTATATGACACTCCATTTTTTCACAATTCATACTTGTATTAA ATATGCTCTTAACTTTTGTTTGATAAGTCAAACACTAATGGCTAGTGTGGAGTTTTTTTC GATCGAATGTGGTTAATACATTTACATGTGTCTTATTTTCACTGGATCTAGATGTCATTT TAACACTGGGTAATTATTATATCCATACAATATTGTAAGTCAAATAGATCTTTCCCAATA AGCTTAAATAATTTAATTTCTTTTGGGAACATAGAAAATGAAGTTCCTCTACCAAATTGA TTCTTTTTTTTTTCTAAATGACATTGACTGCATCAAAATATACATTAATGGGGATTATAT TAGATGACAATAACATTCTTCTACAACTTGTTAACTAATCTTTGCAGATCCGAACCACTT TTATAAAATTAAAATAGGGATTCGATCAAGTACGTTTCTTTGATTTTGTTGGTGACTGAC AACTACTTACTAACTTATAAAGACCTTTTTGCTTCTTCGCCAATTCTCTTGAATACAACA AAGCACAACTTTCCATAAATGGTAGATTAGTATGTTAAGCCGGTAATCCAAATTCGTTTA AACTTCACAAAACTCGTATTAAATTACACAATCTCCCAACACAATATTAAAATATAGTAC TGTTCACCATTGAGAAACATATATTTTCGACTTTATAAGCTTACACAATTTATTAACTCA CATTAAAAGAGCATTTTAATCACTATCATTTAACGTGATTTGATGATAAAAGTATTCATT AAATATAATAATCCAATATGATTTGATGGTAAAAATACAATTACTACCGTTGAGCCCTCC TGATTTAGAACTCTAAGATGTAATTCAAAACTAACATCCCCAAAGCGGGAGAGATAACCT CTATAAAATGGAAATATTGCCCACAAATTCATGTGGGATTTATAGCTCGAACTTGCAATA GAATGCTCAAGAGGAGTAGTGACCAAGAGGGAGGGTGCCGATGCATTACTCCACTTGGTG CGAATCTAATAATATTTAACTGGTTCACATGTGATATAAATAACTATCCCATAAAGTTTA CCATAAATTTCATAAGTGTAAGGTGGCTAACCATCTATTAGACTCAACAAACAAAAGGGT GGTTATCCTTCCCGTGGACCCATGGGCCTTGACATCAAAATGTTAGGGCTTTGTCAAAAT CTAGTCAACACAGGGCTTCCATCAGAAAAGACCATGGAACAAACTTGGGCCGGACTCAGT GAAATCAACAAAGATATTTTATCAGCCCACTCAGCTCATAATTTTCCCGCCACTCAACTC TTCATCATGACAATTGACCACAATATAATAAAATATACCCTTTTGATTGAATCTAAAGTC AAATTACAAAGCTAACCTTATTGTTCTACTTCCAAATCTTCATTGATTTTCACCTTTCAA AGTATGAAAATAAGCAATCTAGTTTGTGCTTATCTATTTAACTTTTACAAAATTTTAAAA ATAAAACGAATCGAAATAATTTTGAAATTGAACAAAAAAATTCAACAAAATACAAAAAAT TTGATTTCTTATATTGGTTACTTCGCTAATTTGGTAAGGTTATTCATCAATAATAACTTT TAAATATTATTCAATAACATAATCAATTTAAGGATGGTTATTGATAAGTAATCTTATCAA ATCAGTAAAGTAATCAAATCCTATTATTATTATTATTATTATGGTGAACAATACTTAAAT AAGGGTATATTAGTCAATATAAAAAAAACAAGATAAAGCCGTAAGAGAATCCCCGACCAA ACCGAAACAATTGTGACTTGCCCTATAATATATTTTGCAATCTTCACAGTTCATTCACTT GCAGTTAAGTCGGTTTTTTTTTTTACCTCTTCTTCTCTTTTATAACAAAACAAAACGTTA AAAAAAAAAAAAAAAGGCAA >LITCHI018292.m1 + Up_Stream_Len 2000 ATTTTTACCATATAAACTTGATAACGATTAGGGAAGTTTGCATTGGAGATGTTAATTTTA ATCCTCTATTAATTTATCCTATATGACACTCCATTTTTTCACAATTCATACTTGTATTAA ATATGCTCTTAACTTTTGTTTGATAAGTCAAACACTAATGGCTAGTGTGGAGTTTTTTTC GATCGAATGTGGTTAATACATTTACATGTGTCTTATTTTCACTGGATCTAGATGTCATTT TAACACTGGGTAATTATTATATCCATACAATATTGTAAGTCAAATAGATCTTTCCCAATA AGCTTAAATAATTTAATTTCTTTTGGGAACATAGAAAATGAAGTTCCTCTACCAAATTGA TTCTTTTTTTTTTCTAAATGACATTGACTGCATCAAAATATACATTAATGGGGATTATAT TAGATGACAATAACATTCTTCTACAACTTGTTAACTAATCTTTGCAGATCCGAACCACTT TTATAAAATTAAAATAGGGATTCGATCAAGTACGTTTCTTTGATTTTGTTGGTGACTGAC AACTACTTACTAACTTATAAAGACCTTTTTGCTTCTTCGCCAATTCTCTTGAATACAACA AAGCACAACTTTCCATAAATGGTAGATTAGTATGTTAAGCCGGTAATCCAAATTCGTTTA AACTTCACAAAACTCGTATTAAATTACACAATCTCCCAACACAATATTAAAATATAGTAC TGTTCACCATTGAGAAACATATATTTTCGACTTTATAAGCTTACACAATTTATTAACTCA CATTAAAAGAGCATTTTAATCACTATCATTTAACGTGATTTGATGATAAAAGTATTCATT AAATATAATAATCCAATATGATTTGATGGTAAAAATACAATTACTACCGTTGAGCCCTCC TGATTTAGAACTCTAAGATGTAATTCAAAACTAACATCCCCAAAGCGGGAGAGATAACCT CTATAAAATGGAAATATTGCCCACAAATTCATGTGGGATTTATAGCTCGAACTTGCAATA GAATGCTCAAGAGGAGTAGTGACCAAGAGGGAGGGTGCCGATGCATTACTCCACTTGGTG CGAATCTAATAATATTTAACTGGTTCACATGTGATATAAATAACTATCCCATAAAGTTTA CCATAAATTTCATAAGTGTAAGGTGGCTAACCATCTATTAGACTCAACAAACAAAAGGGT GGTTATCCTTCCCGTGGACCCATGGGCCTTGACATCAAAATGTTAGGGCTTTGTCAAAAT CTAGTCAACACAGGGCTTCCATCAGAAAAGACCATGGAACAAACTTGGGCCGGACTCAGT GAAATCAACAAAGATATTTTATCAGCCCACTCAGCTCATAATTTTCCCGCCACTCAACTC TTCATCATGACAATTGACCACAATATAATAAAATATACCCTTTTGATTGAATCTAAAGTC AAATTACAAAGCTAACCTTATTGTTCTACTTCCAAATCTTCATTGATTTTCACCTTTCAA AGTATGAAAATAAGCAATCTAGTTTGTGCTTATCTATTTAACTTTTACAAAATTTTAAAA ATAAAACGAATCGAAATAATTTTGAAATTGAACAAAAAAATTCAACAAAATACAAAAAAT TTGATTTCTTATATTGGTTACTTCGCTAATTTGGTAAGGTTATTCATCAATAATAACTTT TAAATATTATTCAATAACATAATCAATTTAAGGATGGTTATTGATAAGTAATCTTATCAA ATCAGTAAAGTAATCAAATCCTATTATTATTATTATTATTATGGTGAACAATACTTAAAT AAGGGTATATTAGTCAATATAAAAAAAACAAGATAAAGCCGTAAGAGAATCCCCGACCAA ACCGAAACAATTGTGACTTGCCCTATAATATATTTTGCAATCTTCACAGTTCATTCACTT GCAGTTAAGTCGGTTTTTTTTTTTACCTCTTCTTCTCTTTTATAACAAAACAAAACGTTA AAAAAAAAAAAAAAAGGCAA
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>LITCHI018292.m2 GenomeSequence + ATATTTTGCAATCTTCACAGTTCATTCACTTGCAGTTAAGTCGGTTTTTTTTTTTACCTC TTCTTCTCTTTTATAACAAAACAAAACGTTAAAAAAAAAAAAAAAAGGCAAATGGAAACT GAAACGGAGACTCGAAAGCCGGAAGCAACAGTGGTCGAACTCGACGGAGCAGATACCGTG GACGCTGGAGAGGCTGCCGCAGACGGCGGCGGAAGCGGCGACGATTCCGTTTTGGTCGTC GAAGAAGGAAGCAGAAGCAGAAGCGGCGGCGGCGGCAGAGACAGAGTGAAGGGACCTTGG TCTCCTGAAGAGGACACCATACTTAGCCAACTGGTGAGCAAGTTCGGGGCGAGGAATTGG AGCTTGATCGCCCGAGGAATATCGGGTCGCTCCGGCAAGTCTTGCCGGCTCAGATGGTGT AATCAGCTCGACCCAGCCGTTAAACGCAAGCCATTTACTGGTATATATTAGATAATGATA AATAACAATTGCCACTGTTTGATCGAAAACATTTTTTTTTTTTAATATAATCTCTTGAGG TTGGTTTTATATATAATTCTGTGAATGTGGTTTCGCTTTTCAAGTTTGATCTTTTGAAAT GTTGAAATTTGAACTCAGTGGTAGTCATCAATTTACTACACTTTTTAGTTTATATTGTTG GACTAATTTGAAGGTTTTGTTTGATTTTCTGTTTTTACAATTCTTTTAAACTTTTAAATT ATGCAACGATAGATAATGCAGATCAACTTGATTAGCTGATAGGAAATTTAATTAGAGCTG ACTGTATTAAATTGCTAATGGCTTGAAATCTATGTTTTCATAGCTACACTAGTTTTTGAA TTCTCTATGTTATCAATTCGGTTATATTATATCTATGCATATGTGTAAATAGTTATAACT 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