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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI018292Chr1543631964367713+Transcription factor MYB1

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI018292.m160106PF00249.34Myb_DNA-bindingDomain55.45.40E-15
LITCHI018292.m163121PF13921.9Myb_DNA-bind_6Domain594.40E-16
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LITCHI018292.m1115160PF13921.9Myb_DNA-bind_6Domain32.21.00E-07
LITCHI018292.m260106PF00249.34Myb_DNA-bindingDomain55.45.40E-15
LITCHI018292.m263121PF13921.9Myb_DNA-bind_6Domain594.40E-16
LITCHI018292.m2112156PF00249.34Myb_DNA-bindingDomain541.50E-14
LITCHI018292.m2115160PF13921.9Myb_DNA-bind_6Domain32.21.00E-07
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>LITCHI024307.m1
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TCAGAATCTCCAAAAATTGAGAGTCCATCTGTGAAAGCAAAGATAGAGGATAGTAAGTTA
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>LITCHI016752.m1
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GGTGGGACTACTCTTGTTTGTTTGTACTATTTTTAATTTAACTTTGAGAAATCTACGTTT
GAAAAGTTGGAG
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>LITCHI024563.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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GAAAATTTCATTTTCCATGTTATTATTTTTTTTATTGAGTTTGTTTGGAAAAACCCCTTA
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ACCATCTCCCTTCTCTCTCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGGCAC
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>LITCHI024563.m4 +  Up_Stream_Len 2000
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ATACATGACATTATGTTGTATAATTACGTCTATTTTGTTTTAATATTTGATGGTGGTTTT
ATCTTCAACAGCGATCACAA
>LITCHI024563.m5 +  Up_Stream_Len 2000
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ACCATCTCCCTTCTCTCTCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGGCAC
CCTATATTACTGCATTGTTA
>LITCHI024563.m2 +  Up_Stream_Len 2000
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ATCTTCAACAGCGATCACAA
>LITCHI024563.m3 +  Up_Stream_Len 2000
ATGTAATTAATTTTTCTTTTTTATTTTCGATAATATTTCAAATTTTAATAACCTTTAATA
GAAAATTTCATTTTCCATGTTATTATTTTTTTTATTGAGTTTGTTTGGAAAAACCCCTTA
AAATTTTGACAATAACACAAATTTACCGTTTTCAATAAATTTTGAAAATTTCTAATTTTT
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TTCACTTTCCTTTCCAAATCCAACGGTCCAAAACCCCCCTTCAACCTACCGTTTCCTTCA
TCTCAGCCGTTACACACCCACCACCACATTTCGGCACATTTTTATTACACTTGTTCCTGT
CCTTTTGTTATTTCATTGTTTCGTTGATGAATATTATGCTCCATTATCTGCTTCTTTAAA
ACCATCTCCCTTCTCTCTCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGGCAC
CCTATATTACTGCATTGTTA
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>LITCHI024563.m1 GenomeSequence + 
TAACCTAAAAATTGCCGACTTGGTGCCCTTCAAACCAAGAGACGCAAAGAAAGAACCAAA
AGCATTGCGTAAGCTCCAAACACAACTCTTATATTCGTTCTTTGTTCACTTTCCTTTCCA
AATCCAACGGTCCAAAACCCCCCTTCAACCTACCGTTTCCTTCATCTCAGCCGTTACACA
CCCACCACCACATTTCGGCACATTTTTATTACACTTGTTCCTGTCCTTTTGTTATTTCAT
TGTTTCGTTGATGAATATTATGCTCCATTATCTGCTTCTTTAAAACCATCTCCCTTCTCT
CTCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGGCACCCTATATTACTGCATT
GTTAATGGTAATGAAGGATATACACGTACTTAGCTTTGTTTTAATTGTATCACAGATACA
TGACATTATGTTGTATAATTACGTCTATTTTGTTTTAATATTTGATGGTGGTTTTATCTT
CAACAGCGATCACAAATGTTGGTGCCACCATGGCTGGAGTCTTTATTATCTGCAGCATTC
TTCACCATATGCCCTAGGCACAGGGACGCCCCGCGTAACGAATGCAATATGTACTGTCTT
GATTGCAGGAACGATGCGTTTTGCTTCTATTGCCGATCTTCCAGACACAAAGATCATCCT
GTAGTTCAAGTGGGTATATTCATTTCTCAATTTGCCTTTTTAATTCAATGGTTTTATTGT
TTTGTTGGGCATGATCAGATAGCTAGATTAATTCATCAGAAATTGATATGGGGTGTGTAC
GTGTTACGTATACAGATCAGACGGTCATCATACCATGATGTTGTTAGGGTGTCTGAGATT
CAAAAGCTCCTGGACATCAGTGAAATACAAACTTATGTGATAAACAGTGCTAGGGTTCTT
TTCCTGAACGAGAGGCCGCAGCCGAAGAGCAGTACTAGTACTACCGGAAGCAAAGGGGTT
TCTCATCTTTGTGAAATTTGTGGGAGAAGTCTATTAGACCCCTTCCGTTTCTGTTCATTG
GGTTGCAAGGTTGGTTGTGGTTGTTCTCATTTTTTGTCTCCACTTACTGTCGGTGGCATA
TTTTGTTTTAAAATTTTGTATCCAATGGATGCGTCTTCATTCTAGTTGATGTCATGGTCT
TGATAAGCCCTGATAAACGGTTTTGATACTATTACTCTTTATTACAAGTTCGAGATTATG
AAATTTTCTATTAAAAGCCCTTCTGAATTATAAAAAAAAAAAATTATCTTGTAAAACGTA
ACCATGATGATAATGACCTGATAATTTTATTTTATTTGTTTCCATTTTATTAATTAAGAT
ATTTACAATATCTTTCAATTTCGCTTCAGCTTGCAGGGATAAAGAGAAATGGGAGTGGGA
CATTTATGTTAAGCAGCGAAGAAGTATCAGGAAGTAGACAAGGAATAATGGGAAGAAGAT
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TTGGAACATAAAATAATTCAAAATAAACTTTATATTCAAAACGTTGTACATCCATTATAT
ATATAATTAAATGAATTATATCCAGCTCATTCTTGTCAAGACTCCACATGGGGGGTCGAT
GTGCCCTACAAATTAAGGGCAGCTAATATAAGCTGTGGGGGATGATTTAAACAAGTATTA
GGTGTACGTTACTTTTGGAGTTGGGGCTGACTTAGTGTTCAATAATGCCTACATCAATGA
AATTGGCACATGCTAGGTGTAAATGTTGTGTATCCACACATGAACGGTTATTTTTATGTA
AAGCGACAACAGCTCAGCTTTTTTATTTGTTTGGTTCACGAAACGTGCACAACATATGAT
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