Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI018253Chr1541367714139110-Transcription factor DIVARICATA

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI018253.m12873PF00249.34Myb_DNA-bindingDomain25.11.60E-05
LITCHI018253.m1136181PF00249.34Myb_DNA-bindingDomain47.12.20E-12
LITCHI018253.m1137174PF13921.9Myb_DNA-bind_6Domain24.42.80E-05
Download   Copy
>LITCHI018253.m1
ATGAATCGAGGAATGGAAATTCTGTCACCAGCCTCATATTTTCAGAACTCAAACTGGTTG
TTCCAGGAAAGCAAGGGAACCAAATGGACTCCACAGGAGAATAAGCAGTTTGAGAATGCT
TTGGCTTTCTATGACAAAGATACGCCTGACCGTTGGATTAAGGTTGCTGCCATGATTCCA
GGCAAGACAGTAGGAGATGTGATCAAACAATACAGGGAATTGGAAGAGGATGTTAGCGAT
ATTGAAGCTGGACTGATTCCAATTCCTGGCTATGGAAGTGATTCCTTTACGTTGGAGTGG
GTTAATAGCAACCAAGGCTTTGATGGTTTCAGGCAGTTTTATAGTCCTGGTGGAAAAAGA
GGCACCGCCACGAGACCTTCTGAGCAAGAAAGAAAGAAAGGTGTTCCATGGACAGAAGAG
GAGCACAGGCAATTTCTAAAGGGTCTTCAAAAGTTTGGTAAAGGAGACTGGAGAAATATC
TCGCGTAACTTTGTGACCACTAGAACACCGACCCAGGTTGCGAGTCATGCTCAAAAGTAC
TTTAATAGGCAGCTTACCGGTGGGAAGGACAAGAGGAGATCTAGCATCCATGATATTACT
ACTGTCAATCTTGAAGACACTGCATCTCCTTCACCGGAAAATAATAAACCTTCATCACCA
AATCCTGCTACAGCTGTCATTCAGGCACGACAGCAACCAAAACTGGCTGGCACGAGCAAT
GAGCTGTTTGATTGGAAGCCACCAAATGAAGGAGCGGCCATGGTTTTCAATCCAACGAAT
GGCAATGTATTCATGCCACCTTTCTGTGGGATTTCTTCATATGCACCTAAGCTTCAGGAC
CAAAATCTGCTAAGAGCAACTCTTCATGGATCTCAGTTTGGAGCTTATAGTACTTTTCTC
CAGATGCAATCAATGCAACATCAGTAA
Download   Copy
>LITCHI018253.m1
MNRGMEILSPASYFQNSNWLFQESKGTKWTPQENKQFENALAFYDKDTPDRWIKVAAMIP
GKTVGDVIKQYRELEEDVSDIEAGLIPIPGYGSDSFTLEWVNSNQGFDGFRQFYSPGGKR
GTATRPSEQERKKGVPWTEEEHRQFLKGLQKFGKGDWRNISRNFVTTRTPTQVASHAQKY
FNRQLTGGKDKRRSSIHDITTVNLEDTASPSPENNKPSSPNPATAVIQARQQPKLAGTSN
ELFDWKPPNEGAAMVFNPTNGNVFMPPFCGISSYAPKLQDQNLLRATLHGSQFGAYSTFL
QMQSMQHQ.
Download   Copy
>LITCHI018253.m1
ACCAATTACGGATTGTCCTTTGGCTGCTTCGAACCTGATTGGCCACCCGATCCCTTCACA
AATATAGTTAGACAAACTTATTTTCTCTCTCGAGTGCCAGCGCCCATAACACGACACTCT
GTTTTAACCAATCACAACTCGACACTCTCCACTTACCCTTCTTTTGGCTCTCTGCTGATT
CTCTGTTGCATAGATCTCTCTCTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATTTTTTGACGTT
GCAAATACACACAGCTGGGAATTTTCTTTTTTTTGATTCACTTCCCTCTTTCACTCAACA
CTCTGCTTTTGTTTTTTTTGGGGTATGCTTTTGCCAACTTAGAAAAAGAAAGCAACTAAA
AAGCACCCACATATACTAATATTTGTTTGTTTTCACTACTTTTTCACTGCTTCAATTATC
AAGAGCTACTCTGTTTTGCTCTGTTTTTTTAATTCTTTTTGGTTTGTGTTCTCAACTGGG
TATCTTTATATTGGTTGGTTTTTATGGAGGGGATGTGTTTAGTGTAGTGGGAATTGATCT
GGGTAGTTGTTATTTTTGTGTGTTTTGAGGGGTCAAGTATGGTAGTGCTGTTGGTGGTTA
TGGTTATGGTTTAGGGTTTACGTTGTTTTTGACAAGAGTGAGATTTTTTTTTTTTTTTTT
TTCCTTCCTTGAATTTTCCTTGGTTTTTGGAAAGTTGAGACCTTTTTCAGATTCCTCAAT
TTTTATGATGCGTGATGTGTGAGGAAGAGAGAAGCTTTTGGGTCAGATTCCAATCAAAAT
GCTCTCATGATTTGATGCTGCTTCTCTGGTCATAAAAACCTCCACTTTCCCTGCATTTTC
TATCTGGGTTGTTTCTCTCTCTTTGAACATTAAAAATTCAAAGAGAGAGAGAAGCCTGTG
TGTTCTTTTTAGCATGCTAAGCTAGAGTCTAGAGTCTACTCAGTGAAACAAACAAGAAAA
GAAAAAAAAAAAAAATGAATCGAGGAATGGAAATTCTGTCACCAGCCTCATATTTTCAGA
ACTCAAACTGGTTGTTCCAGGAAAGCAAGGGAACCAAATGGACTCCACAGGAGAATAAGC
AGTTTGAGAATGCTTTGGCTTTCTATGACAAAGATACGCCTGACCGTTGGATTAAGGTTG
CTGCCATGATTCCAGGCAAGACAGTAGGAGATGTGATCAAACAATACAGGGAATTGGAAG
AGGATGTTAGCGATATTGAAGCTGGACTGATTCCAATTCCTGGCTATGGAAGTGATTCCT
TTACGTTGGAGTGGGTTAATAGCAACCAAGGCTTTGATGGTTTCAGGCAGTTTTATAGTC
CTGGTGGAAAAAGAGGCACCGCCACGAGACCTTCTGAGCAAGAAAGAAAGAAAGGTGTTC
CATGGACAGAAGAGGAGCACAGGCAATTTCTAAAGGGTCTTCAAAAGTTTGGTAAAGGAG
ACTGGAGAAATATCTCGCGTAACTTTGTGACCACTAGAACACCGACCCAGGTTGCGAGTC
ATGCTCAAAAGTACTTTAATAGGCAGCTTACCGGTGGGAAGGACAAGAGGAGATCTAGCA
TCCATGATATTACTACTGTCAATCTTGAAGACACTGCATCTCCTTCACCGGAAAATAATA
AACCTTCATCACCAAATCCTGCTACAGCTGTCATTCAGGCACGACAGCAACCAAAACTGG
CTGGCACGAGCAATGAGCTGTTTGATTGGAAGCCACCAAATGAAGGAGCGGCCATGGTTT
TCAATCCAACGAATGGCAATGTATTCATGCCACCTTTCTGTGGGATTTCTTCATATGCAC
CTAAGCTTCAGGACCAAAATCTGCTAAGAGCAACTCTTCATGGATCTCAGTTTGGAGCTT
ATAGTACTTTTCTCCAGATGCAATCAATGCAACATCAGTAA
Download   Copy
>LITCHI018253.m1 -  Up_Stream_Len 2000
TGAATCAACTCTTCAATTAGTGGGGCAATTAGTAAGTCTATGCCCATGCTATTCAACAAT
ATATTGAATTGTTTGGTGGAACAATTCAACTTATTTTCTACTAACTTAAACCGGCATTAA
TGATTTATTATGTTAATTTATTAAAAAAATGCAAAAAGAATTTAATGAGACTGTTGAATG
AATATTAACAATTCATGATTGGGGTCAGATTAGCATAAAAAGGTGTCTTAATCCATATTA
AGCTTGTATTAAATAAGAGTTGACCATAAAAATTGAAAGCAACACAACACATCCAAAATT
TTCCAGCTGGCCCAAACTACTACTGGGGTCAAAACTAATGATTTGTATAATTGTGTATAT
TAGTGCTAGAGACAATCAACCTTTCTTTTCTTTACCACTAATCAGTATAATATGAACTTA
AAAAATAATAATAATAAAAACACACAAACAAATTAGTACTATATTATTTGGATTAAAATT
AAATGCACAAATCAGATTAAATATTTATTGATTCAAATTACATATGTCAATTCCAGTGGG
ATAGTCATATATTTTATATGAATTAGATTCAATATTCTATAGAAATTATTTATTTAATAT
CATTTTTATTTATGAGATATCACTTATTGTGAAGTAGTTTAAACTTATGATCTTATTAGA
TTGAAGAAACATTCTTTATCATGAAATTTTATTAAAATATTATTTATCTAATATCATTAT
AATCGTAATTTGCTCTTTTTCCATTTTTAGTGGTGTATAATTAAGACAAATTAAAGTCTA
ATTAAGCAAAACATTTTAATTTAAAGTACAGAAACTCTAATCCAATCCAAGTTCTGATTT
CAAAAGTACACAATGGAAATCTTTTTTTTTTTTTTAACACAAATTAATTAGAAATCAAAA
TTAAGAAAAAAAACAAGACAAAAACATCTCACGTGACACAGAAGCAAACGTCAATACCAC
TGTCAAGGTCGGGTATTTATCCAAACAAAATGACCAAAATGCCCTCACCATCTACCACCC
AAACTGACCAATTACGGATTGTCCTTTGGCTGCTTCGAACCTGATTGGCCACCCGATCCC
TTCACAAATATAGTTAGACAAACTTATTTTCTCTCTCGAGTGCCAGCGCCCATAACACGA
CACTCTGTTTTAACCAATCACAACTCGACACTCTCCACTTACCCTTCTTTTGGCTCTCTG
CTGATTCTCTGTTGCATAGATCTCTCTCTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATTTTTT
GACGTTGCAAATACACACAGCTGGGAATTTTCTTTTTTTTGATTCACTTCCCTCTTTCAC
TCAACACTCTGCTTTTGTTTTTTTTGGGGTATGCTTTTGCCAACTTAGAAAAAGAAAGCA
ACTAAAAAGCACCCACATATACTAATATTTGTTTGTTTTCACTACTTTTTCACTGCTTCA
ATTATCAAGAGCTACTCTGTTTTGCTCTGTTTTTTTAATTCTTTTTGGTTTGTGTTCTCA
ACTGGGTATCTTTATATTGGTTGGTTTTTATGGAGGGGATGTGTTTAGTGTAGTGGGAAT
TGATCTGGGTAGTTGTTATTTTTGTGTGTTTTGAGGGGTCAAGTATGGTAGTGCTGTTGG
TGGTTATGGTTATGGTTTAGGGTTTACGTTGTTTTTGACAAGAGTGAGATTTTTTTTTTT
TTTTTTTTCCTTCCTTGAATTTTCCTTGGTTTTTGGAAAGTTGAGACCTTTTTCAGATTC
CTCAATTTTTATGATGCGTGATGTGTGAGGAAGAGAGAAGCTTTTGGGTCAGATTCCAAT
CAAAATGCTCTCATGATTTGATGCTGCTTCTCTGGTCATAAAAACCTCCACTTTCCCTGC
ATTTTCTATCTGGGTTGTTTCTCTCTCTTTGAACATTAAAAATTCAAAGAGAGAGAGAAG
CCTGTGTGTTCTTTTTAGCATGCTAAGCTAGAGTCTAGAGTCTACTCAGTGAAACAAACA
AGAAAAGAAAAAAAAAAAAA
Download   Copy
>LITCHI018253.m1 GenomeSequence - 
ACCAATTACGGATTGTCCTTTGGCTGCTTCGAACCTGATTGGCCACCCGATCCCTTCACA
AATATAGTTAGACAAACTTATTTTCTCTCTCGAGTGCCAGCGCCCATAACACGACACTCT
GTTTTAACCAATCACAACTCGACACTCTCCACTTACCCTTCTTTTGGCTCTCTGCTGATT
CTCTGTTGCATAGATCTCTCTCTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATTTTTTGACGTT
GCAAATACACACAGCTGGGAATTTTCTTTTTTTTGATTCACTTCCCTCTTTCACTCAACA
CTCTGCTTTTGTTTTTTTTGGGGTATGCTTTTGCCAACTTAGAAAAAGAAAGCAACTAAA
AAGCACCCACATATACTAATATTTGTTTGTTTTCACTACTTTTTCACTGCTTCAATTATC
AAGAGCTACTCTGTTTTGCTCTGTTTTTTTAATTCTTTTTGGTTTGTGTTCTCAACTGGG
TATCTTTATATTGGTTGGTTTTTATGGAGGGGATGTGTTTAGTGTAGTGGGAATTGATCT
GGGTAGTTGTTATTTTTGTGTGTTTTGAGGGGTCAAGTATGGTAGTGCTGTTGGTGGTTA
TGGTTATGGTTTAGGGTTTACGTTGTTTTTGACAAGAGTGAGATTTTTTTTTTTTTTTTT
TTCCTTCCTTGAATTTTCCTTGGTTTTTGGAAAGTTGAGACCTTTTTCAGATTCCTCAAT
TTTTATGATGCGTGATGTGTGAGGAAGAGAGAAGCTTTTGGGTCAGATTCCAATCAAAAT
GCTCTCATGATTTGATGCTGCTTCTCTGGTCATAAAAACCTCCACTTTCCCTGCATTTTC
TATCTGGGTTGTTTCTCTCTCTTTGAACATTAAAAATTCAAAGAGAGAGAGAAGCCTGTG
TGTTCTTTTTAGCATGCTAAGCTAGAGTCTAGAGTCTACTCAGTGAAACAAACAAGAAAA
GAAAAAAAAAAAAAATGAATCGAGGAATGGAAATTCTGTCACCAGCCTCATATTTTCAGA
ACTCAAACTGGTTGTTCCAGGAAAGCAAGGGAACCAAATGGACTCCACAGGAGAATAAGC
AGTTTGAGAATGCTTTGGCTTTCTATGACAAAGATACGCCTGACCGTTGGATTAAGGTTG
CTGCCATGATTCCAGGCAAGACAGTAGGAGATGTGATCAAACAATACAGGGAATTGGAAG
AGGATGTTAGCGATATTGAAGCTGGACTGATTCCAATTCCTGGCTATGGAAGTGATTCCT
TTACGTTGGAGTGGGTTAATAGCAACCAAGGCTTTGATGGTTTCAGGCAGTTTTATAGTC
CTGGTGGAAAAAGAGGCACCGCCACGAGACCTTCTGAGCAAGAAAGAAAGAAAGGTGTTC
CATGGACAGAAGAGGAGCACAGGTATTGATTGATTGACATATATATATATATATATTGTT
GTCATTTTAATTTGCATAGATATTTGTTATGGCAATTGTAAAATGTTAATGAGAGTTGGT
TTGATGCATTTTGTTTGTCTGTTACATGTTAGTGTTTTAGATGGTAATTATAGATAATCA
TAAATCAATTGATAGTTCTGACATTGGAAACTTAACATATAGATTTTTCAAGTTTGATAG
TTGAAATTTCTAAGGTTTAGTTATAAGGGGAACAAAATATTGTTCATTGAAGATGTTTGG
TTGATGTTGTCAGTAATATGATTCTGAGTTTGACACATGGATCTATAGGGTCTATATGGT
TTATAAAATGCTCTAGGGAGGTATCTTTCTGGCTGGTGTGATTGTTTAGTTCTCAGTGGT
TGAGTGGTATCCAACAGTTGATAATGTGAGATTTGATGCAGGCAATTTCTAAAGGGTCTT
CAAAAGTTTGGTAAAGGAGACTGGAGAAATATCTCGCGTAACTTTGTGACCACTAGAACA
CCGACCCAGGTTGCGAGTCATGCTCAAAAGTACTTTAATAGGCAGCTTACCGGTGGGAAG
GACAAGAGGAGATCTAGCATCCATGATATTACTACTGTCAATCTTGAAGACACTGCATCT
CCTTCACCGGAAAATAATAAACCTTCATCACCAAATCCTGCTACAGCTGTCATTCAGGCA
CGACAGCAACCAAAACTGGCTGGCACGAGCAATGAGCTGTTTGATTGGAAGCCACCAAAT
GAAGGAGCGGCCATGGTTTTCAATCCAACGAATGGCAATGTATTCATGCCACCTTTCTGT
GGGATTTCTTCATATGCACCTAAGCTTCAGGACCAAAATCTGCTAAGAGCAACTCTTCAT
GGATCTCAGTTTGGAGCTTATAGTACTTTTCTCCAGATGCAATCAATGCAACATCAGTAA