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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI018229 | Chr15 | 3834536 | 3838081 | - | High mobility group B protein 1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI018229.m1 | 53 | 124 | PF09011.13 | HMG_box_2 | Domain | 61.3 | 1.10E-16 |
LITCHI018229.m1 | 56 | 125 | PF00505.22 | HMG_box | Domain | 82.8 | 1.80E-23 |
LITCHI018229.m2 | 53 | 124 | PF09011.13 | HMG_box_2 | Domain | 61.3 | 1.10E-16 |
LITCHI018229.m2 | 56 | 125 | PF00505.22 | HMG_box | Domain | 82.8 | 1.80E-23 |
LITCHI018229.m3 | 53 | 124 | PF09011.13 | HMG_box_2 | Domain | 61.3 | 1.10E-16 |
LITCHI018229.m3 | 56 | 125 | PF00505.22 | HMG_box | Domain | 82.8 | 1.80E-23 |
LITCHI018229.m4 | 53 | 124 | PF09011.13 | HMG_box_2 | Domain | 61.3 | 1.10E-16 |
LITCHI018229.m4 | 56 | 125 | PF00505.22 | HMG_box | Domain | 82.8 | 1.80E-23 |
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>LITCHI015338.m1 GCGCACAGTACAATCCTCCAACGTGTCAAGAGCTCGTGTTGGTTTTCCCTCGAAAGGCAA AACTCAGAAAAGAAATCGAACCAAAGCTCAGAATCCAAATGAAATGGATTCCTTAGACGA CTCAAGTAGCTGGGAAGATTTTCTCCACCATACCTTGATTGATCAAAACACCTCTCCCGA TCTCTTTTTGCCCCATCAGAATGGCGGCGTGGACATTGATTTTCCGTCATCTGATGGTTT TGTGTCTCAAGAGATACGACCTACGCGTGAGAGTGACTTGGTGGAATTTGATTTTTCATC GGTTGCTCATGAAACACAACTTACGCGAAAGAGGCCGCGAAATGGTTCATTCAGGCAGCC AGGCTCCAAAGCTTGTCGTGAGAAATTGCGGAGAGAGAGATTGAATGACAGGTTTCTTGA TTTAAGTGGTGTTTTGGAACCTGGGAGGCCTGCCAGGACCGATAAACCGGCCATACTGGA TGATGCCATTCGAGTTTTGAATCAACTGAGAAATGAGGCTCAGGAGCTCAAAGATGCTAA TGAAAAGTTGCGAGATGAAATTGAGAGTTTGAAGGTGGAAAAAAATGAACTTCGAGAAGA GAAAATCTTACTGAAGGCTGATAAAGAAAGGATGGAGCAACAGCTGAAAGCTATGGCAAT TCCATCTACTGGGTATTTGCAGGCCCACCCGGCGGCATATCATGCTGGGATGAATAAGAT GCCTGTGTTTCCTAGTTATGGTTTGGTCCCTATGTGGCAATATCTACCGCCATCATCACG TGATACATCTCATGATCACGAGCTCAGGCCCCCGGCAGCCTAGGGCTGGCTTTTTCTCCT TCCTTTCTTTTTCGTCTTCCCTTTAATTATCATTCATCTGAATAATTTTCAGCTGCTTTA GTTTATTGACTAGCATCCAAAAGTTTTGCTGTCCTTAATAGTGTAAATACTGCCGTCAGA TTTGCTTGATTCTTTAATTTAGCTGTTGGCAAATGAATGGAAGGATTGACAAGAAATCAA TTATTTCCTCTCTCTATGATATACTCTCTCATTTAATCTCAGTAGTATATCTACAACAAT TGGCTCTTCGCTGCTAAATAGCCACTTGGAATTTTGTTTGGACTTGGACATAGATCTCAG AAAGTATGTTTAATCAACGCAGGAAATTGAATGTTACCCACCCTTGTCATTGCAATTTGC AATTACTTTGATTAAGAGTGGGGGCAATGGGTGGAGATTTAGATAACAATAACTTTGGCC AAATTGTCATTTTATTCTTCTTTTAGGGAAAAATTGACATTGTAACATTCTTTTGGTTAC GTTCCAGCAAAGCTTGGCAAAGCTTAAATACCCACTCTTGGTTTGTATAGTGTGCAGGTT TACATTAAGATTGCCCGTAAGTATAGTGTTGTTCTCGCAACTTTGCCTTAATTTTACATG TCCATGGCATCAAGATTGCTCAGAAACACCCTTTTAAGCTGGAGTGATTTCTGTTTTCGT CTTGTGACCCTGTTCCTCATCACATGTTGCACCACATTGCTCGTCTGTTTTACTGTCAAC TTCCTGATCAGATTCTTTGCCCCACAGCAGCAAATATAGGCCAACAATCACAATAACTGC CCCTACTACACTGATCAACCCACAGATGATGATGAGTGAATGAGATCTAGAATAATATCT GCAATGTGTGTGTATTTGCTTGTACTTTACCTGCCCAAGTAAAGCTTTTCTCCCAGGACA AAGTATGCTATTCCTGCCGTCAATATTGTTGCAAGAGGACTGAACATGGTCACAAAAACT GGCCCTTTTTCTTCTGTGCACCACAGTTGAACGAGAAAAATTAAACCGGATACAACCACT CCCTGCCATGAAGCGACCACATATATTCAGAACTCGTCTAAAAATTAAAATGAATCAAGG TTCATACACTATTATATGCCTACTTACTCCATAAATGGTGGACCAGAAATCAATGTTGAA CCCAATTGTCCAAGCAGCCGGTTTGTGTTCAATGATCACCGTGAAAATGGCTGATTGCAC TGCCCCGAGAAAGGTTATCCAAGTTGTCAGTGACAGTTGTGCTGGATATCGCTTCAATGT AATTGCCTACATTTTTCAAAGCAGGGTACAAAATGTTTGATATGTATTCTTCACTAGAGA AACTGTGGCGATGAATCATATTTTGTCCTAAAAGATATAGTTTTTGAGTTAGAGACGAAC CTGCAATATGTACCATGCAGCCCATGATATGCAGCTAGCACCACTGAGAATTGAACCCTC CAACCAGTGCTCATGGATGGTGGTGTTTTTTTGAAAATGTATAAGAGGATGCCATAGATT TTTCAATACAGGTCCTTTGTATAGTGTCATGGTTGTTACACCGGCCAAGGAGAGCCCCGT CCCAACAACTTTAGCCATACCCCGAGCATGTCGAAGATCAAGCTTCTCTAACCTGAATCA ATTGTGAATAATGATTATGATCTTGAATTTATCTATTTATTTATAGATTCTGATGACATC TTAATCAGATGGCAAATATAATAATAACCTGAGTACAACTGCAATCACAAAAGTTAGTGC AGCGATGTTGTTGACCATTGATGCGGCAAATGTTGGAGAAGTGTATCTCAAGCTTGCAAA GTACATGTTTAAAGTTGCACTCACCCTGCACAGCCACCATAAGAACATGTTTTATTTACC TGGAGCCTTTTTATTTATTTATTATTATTTTTTTTTTTTGTTTTTTAAGTACTCAAAATT GGTACAGGGTCTTACCCGAGGAGAGCGAGA
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>LITCHI015338.m1 + Up_Stream_Len 2000 TTTTTGGTTTTGAGTGTTTGTGTAAATGTGTAACTTGTTTATTTATTTTTTATTTAATAT GATTCAAATATGTGTCATCAATGCTAGAGAAATGATGAAAGTAGAGTGGCTAATTGTAAA AGTTGTTTCGACAATAGTTGAAAACTTGGGTTCTGTAAGAACAAGATTGGTTTGATGAAT TTTGATGAAGGGAAGCACGAAGATGATAATAATAAAGACTAGAACAAATAGAAGAAAAAA AATAATATTATATGGAGTGTGGTTACATACTTTCGATGGTTCGAAAAAATTTAATGGGGG TGAACATACTAATTTTTAGGGGTGTAGATATCACCACTCTTTTTCATTTTATGATGAAAA TAGTTGTATGGATAATTTTTTCCTAATTATAAATGGATATCTAGGTTGGGTTAAACTATC TTCCAATTATGAATATATACATACATATATATATATATACATACATATATATATATATAT ATATACATACATACAAACAATGTATTTAATGACTGAGCTAGGTTAATGAAATATTTCCTC CATGTTATCATTATAAAAAGAGTAATGTTAGATTTTTCAAATTTTTTTGTTCAAATTCAT GTCAAAATGTCATGGTATGTGATTTTAAAGAGGTTAACAACTCATATACCATATCATTTG GGCTAAAAGTTTGGGAAGTTTAGAATTATTAAAATATTTATATTAATATTTATCATGAAG ATAGGAACGTATGAGTATCAATATTTACACCTCTGTAGAAGTGTTTATACTCCACTTCAG TGGGAGCATGCTTTTATCTATTGTAAAAATATAATATATCACATGGGATTGTGTTAAAAT ACACTTTTCTTGTCAATATTTACCATCAAGTTGAGGTGACAAAAAAGAAAATAGATATTG TGAAGATGACTAGTTATTTGTAGAAGGTCTATTTGATCGTCAATTTAGCAAGTCTTCTCG TCATTTCCCGATCACCACTTTTGCAAATGATAACCAATGGATTCATTAAAGGCACAAACT CACTTCCAAAGCCATAACCACTCTCTCTTCTTCACAATACATACCACTTGTCAAATTTGC TCGTTATGTTTTACTTATAAGTCACGCGTATCAAATCTGTAAAAGAAAAAAAGAAGACTT TTATCTTTGGAATTCTATTATCAAATTGTATTATCACGCACTTGAACCAAAACAAGCTTA GATATTGTTTTACTTGATGCTTGAAAACAAGTTTGTGTTGACAAGTTTTTTGTTTTCCTT GGTTTTGAAAGCTTATTCTTAGGTGGGTTTAATTAAAGAGGGAATGCAGATTCAAGGTCT TTTGAGGAAAATGGAATTTGGGTCATATTAGTTTTTGTATAATTGTTTGATTGGTTTGTA TTTGAAATGCAGGTGTCTTGAGCTTGCATGTCAACTATTTGATTAAATGCGAATGAGAGA CTCGGTTTCATTTAATTCTATAATTGGTGGGTATGTTAAGAGCCGTTTAATGCTGTAAGG GTCGGTTATGTTAAAAATGGGTATTGCAAGGAAGCTTTAGATATTTATCATACTATGTAA TGTGAAAGTAATATGTGACCTAATGATGCCTCATTATTGATTGTTCTTTCAACAAGGTTT AATTAAAAACTGAATACAGTCAACTTAACAACTCAGCAAGCTTATGTCTTCATATGCTAA ATGTAAGCATTGAAGAACATTTTTTAAATTGATTGTTTATCAATAGGAAGTAAATTCTTT GATATTGATGACATGATGTTATAAGTTTATTTCATTAAATGAGTCATAATTATAATTTAT AATTTTTTAATATAATCTTTAAGAGGGTGCGTGCGTGTACAACTTAAGTGGGGTGTAAAT AGCCGCGGCACGTGCGGGCATGTTAATAATACACGCGGCGCACAGTACAATCCTCCAACG TGTCAAGAGCTCGTGTTGGTTTTCCCTCGAAAGGCAAAACTCAGAAAAGAAATCGAACCA AAGCTCAGAATCCAAATGAA
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>LITCHI015338.m1 GenomeSequence + GCGCACAGTACAATCCTCCAACGTGTCAAGAGCTCGTGTTGGTTTTCCCTCGAAAGGCAA AACTCAGAAAAGAAATCGAACCAAAGCTCAGAATCCAAATGAAATGGATTCCTTAGACGA CTCAAGTAGCTGGGAAGATTTTCTCCACCATACCTTGATTGATCAAAACACCTCTCCCGA TCTCTTTTTGCCCCATCAGAAGTATTTTATTTATTTATTTATTTATAATTTTATTGGATT GGATTGGAGGTGGTTTTTCTTTTTTTTTTTTGATTGTGTGATTTTTGAAAAAACAGTGGC GGCGTGGACATTGATTTTCCGTCATCTGATGGTTTTGTGTCTCAAGAGATACGACCTACG CGTGAGAGGTGATAATTTATAATTTTTTTTTTCAGTTCTATAACAGAAATATAAATAAAT AAAAATTGACGATTTTTCGTTCAGTGACTTGGTGGAATTTGATTTTTCATCGGTTGCTCA TGAAACACAACTTACGCGAAAGAGGTAAACTTTTTTCTTTTTTCTTTGTATTTTAAGAAA AATAATAATAAACTAGTGGTGGGTTTTGATTTTAGTAAAATTAATAATTTTGGTGGTGAT TTTGACAGGCCGCGAAATGGTTCATTCAGGCAGCCAGGCTCCAAAGCTTGTCGTGAGAAA TTGCGGAGAGAGAGATTGAATGACAGGCATGCTACTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCGC TTAAATTGTTTTGTGGGTTGATTTATTTTTGGTTAATTGTTTCTTTTTTTTTTTTAAAAA AAAAGAAATTAACAAGTATGTAGAATGTAGATGTATGTGATTAGGTTAATGGGTCATGTT CGTTCTAAAAGTGCAGATTTTGTGTATTGGGTTTTGAAGGTTTCTTGATTTAAGTGGTGT 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GAGTGAATGAGATCTAGAATAATATCTGCAATGTGTGTGTATTTGCTTGTACTTTACCTG CCCAAGTAAAGCTTTTCTCCCAGGACAAAGTATGCTATTCCTGCCGTCAATATTGTTGCA AGAGGACTGAACATGGTCACAAAAACTGGCCCTTTTTCTTCTGTGCACCACAGTTGAACG AGAAAAATTAAACCGGATACAACCACTCCCTGCCATGAAGCGACCACATATATTCAGAAC TCGTCTAAAAATTAAAATGAATCAAGGTTCATACACTATTATATGCCTACTTACTCCATA AATGGTGGACCAGAAATCAATGTTGAACCCAATTGTCCAAGCAGCCGGTTTGTGTTCAAT GATCACCGTGAAAATGGCTGATTGCACTGCCCCGAGAAAGGTTATCCAAGTTGTCAGTGA CAGTTGTGCTGGATATCGCTTCAATGTAATTGCCTACATTTTTCAAAGCAGGGTACAAAA TGTTTGATATGTATTCTTCACTAGAGAAACTGTGGCGATGAATCATATTTTGTCCTAAAA GATATAGTTTTTGAGTTAGAGACGAACCTGCAATATGTACCATGCAGCCCATGATATGCA GCTAGCACCACTGAGAATTGAACCCTCCAACCAGTGCTCATGGATGGTGGTGTTTTTTTG AAAATGTATAAGAGGATGCCATAGATTTTTCAATACAGGTCCTTTGTATAGTGTCATGGT TGTTACACCGGCCAAGGAGAGCCCCGTCCCAACAACTTTAGCCATACCCCGAGCATGTCG AAGATCAAGCTTCTCTAACCTGAATCAATTGTGAATAATGATTATGATCTTGAATTTATC TATTTATTTATAGATTCTGATGACATCTTAATCAGATGGCAAATATAATAATAACCTGAG TACAACTGCAATCACAAAAGTTAGTGCAGCGATGTTGTTGACCATTGATGCGGCAAATGT 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