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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI018229 | Chr15 | 3834536 | 3838081 | - | High mobility group B protein 1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI018229.m1 | 53 | 124 | PF09011.13 | HMG_box_2 | Domain | 61.3 | 1.10E-16 |
| LITCHI018229.m1 | 56 | 125 | PF00505.22 | HMG_box | Domain | 82.8 | 1.80E-23 |
| LITCHI018229.m2 | 53 | 124 | PF09011.13 | HMG_box_2 | Domain | 61.3 | 1.10E-16 |
| LITCHI018229.m2 | 56 | 125 | PF00505.22 | HMG_box | Domain | 82.8 | 1.80E-23 |
| LITCHI018229.m3 | 53 | 124 | PF09011.13 | HMG_box_2 | Domain | 61.3 | 1.10E-16 |
| LITCHI018229.m3 | 56 | 125 | PF00505.22 | HMG_box | Domain | 82.8 | 1.80E-23 |
| LITCHI018229.m4 | 53 | 124 | PF09011.13 | HMG_box_2 | Domain | 61.3 | 1.10E-16 |
| LITCHI018229.m4 | 56 | 125 | PF00505.22 | HMG_box | Domain | 82.8 | 1.80E-23 |
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>LITCHI018229.m1 ATGAAGGGGACCAAAGGTAAAGGTATGGCAAGAGCACCAAAGGAAGCTCTGAAGCCCGTC GATGACAGAAAAGTTGGAAAGAGGAAGGCGCCTCCTGCTAAGGTTGATACAAGTAGTAAA CGGCAAACTAAGGTGGTGAAGAAGGCTAAGAAAGATCCAAATAAACCAAAGAGGCCTCAG AGTGCTTTCTTTGTGTTCCTTGAAGAGTTTAGAAAAACCTTCAAGAAGGAAAACCCTAAT GTGACCGCTGTGTCAGCTGTTGGGAAAGCTGCAGGAGAGAAGTGGAAATCCATGTCGGCT GAAGAAAAAGGCCCATATGAAAGTAAAGCAGCAAAAGCGAAGGTTGATTATAATAAGCTT ATGGATGCATACAATAACAAGCAGAGCGTGTCAGATGATGGTGATGAATCAGACAAGTCA AAGTCTGAAGTGAATGATGAAGATGAGGCTAATGAGGAGGAACATAAACAGCAGGAAGAA GAGGAGGAAGGAGAAGATGAAGAAGAGGAGGATGAGGAGGATGAGGACGACGAAGACTGA >LITCHI018229.m2 ATGAAGGGGACCAAAGGTAAAGGTATGGCAAGAGCACCAAAGGAAGCTCTGAAGCCCGTC GATGACAGAAAAGTTGGAAAGAGGAAGGCGCCTCCTGCTAAGGTTGATACAAGTAGTAAA CGGCAAACTAAGGTGGTGAAGAAGGCTAAGAAAGATCCAAATAAACCAAAGAGGCCTCAG AGTGCTTTCTTTGTGTTCCTTGAAGAGTTTAGAAAAACCTTCAAGAAGGAAAACCCTAAT GTGACCGCTGTGTCAGCTGTTGGGAAAGCTGCAGGAGAGAAGTGGAAATCCATGTCGGCT GAAGAAAAAGGCCCATATGAAAGTAAAGCAGCAAAAGCGAAGGTTGATTATAATAAGCTT ATGGATGCATACAATAACAAGCAGAGCGTGTCAGATGATGGTGATGAATCAGACAAGTCA AAGTCTGAAGTGAATGATGAAGATGAGGCTAATGAGGAGGAACATAAACAGCAGGAAGAA GAGGAGGAAGGAGAAGATGAAGAAGAGGAGGATGAGGAGGATGAGGACGACGAAGACTGA >LITCHI018229.m3 ATGAAGGGGACCAAAGGTAAAGGTATGGCAAGAGCACCAAAGGAAGCTCTGAAGCCCGTC GATGACAGAAAAGTTGGAAAGAGGAAGGCGCCTCCTGCTAAGGTTGATACAAGTAGTAAA CGGCAAACTAAGGTGGTGAAGAAGGCTAAGAAAGATCCAAATAAACCAAAGAGGCCTCAG AGTGCTTTCTTTGTGTTCCTTGAAGAGTTTAGAAAAACCTTCAAGAAGGAAAACCCTAAT GTGACCGCTGTGTCAGCTGTTGGGAAAGCTGCAGGAGAGAAGTGGAAATCCATGTCGGCT GAAGAAAAAGGCCCATATGAAAGTAAAGCAGCAAAAGCGAAGGTTGATTATAATAAGCTT ATGGATGCATACAATAACAAGCAGAGCGTGTCAGATGATGGTGATGAATCAGACAAGTCA AAGTCTGAAGTGAATGATGAAGATGAGGCTAATGAGGAGGAACATAAACAGCAGGAAGAA GAGGAGGAAGGAGAAGATGAAGAAGAGGAGGATGAGGAGGATGAGGACGACGAAGACTGA >LITCHI018229.m4 ATGAAGGGGACCAAAGGTAAAGGTATGGCAAGAGCACCAAAGGAAGCTCTGAAGCCCGTC GATGACAGAAAAGTTGGAAAGAGGAAGGCGCCTCCTGCTAAGGTTGATACAAGTAGTAAA CGGCAAACTAAGGTGGTGAAGAAGGCTAAGAAAGATCCAAATAAACCAAAGAGGCCTCAG AGTGCTTTCTTTGTGTTCCTTGAAGAGTTTAGAAAAACCTTCAAGAAGGAAAACCCTAAT GTGACCGCTGTGTCAGCTGTTGGGAAAGCTGCAGGAGAGAAGTGGAAATCCATGTCGGCT GAAGAAAAAGGCCCATATGAAAGTAAAGCAGCAAAAGCGAAGGTTGATTATAATAAGCTT ATGGATGCATACAATAACAAGCAGAGCGTGTCAGATGATGGTGATGAATCAGACAAGTCA AAGTCTGAAGTGAATGATGAAGATGAGGCTAATGAGGAGGAACATAAACAGCAGGAAGAA GAGGAGGAAGGAGAAGATGAAGAAGAGGAGGATGAGGAGGATGAGGACGACGAAGACTGA
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>LITCHI010016.m1 MDPATEPPLEPSDNPIDDAVYDDDSSPETDATLSPVPPEPEDPQTLPETNLTQSPTRNTT LDAPVSDSLDDSSDPITEDQQPQNPNPAEPGPPPRKRRRRKRFFTEINGTPSFAKNRRPR LSCLSKEVDTEALIAISVGFPVDSLTEEEIEANVVAKIGGTEQANYIVVRNHILARWRSN VTVWLTREHALESIRSEHKNLVDSAYNFLLEHGYINFGLAPAIKEAKLTSLDGMERANVV IVGAGLAGLVAAKQLVSMGFKVAVLEGRARPGGRVKTLKMKGEGVVAAADLGGSVLTGIN GNPLGVLARQLGLPLHKVRDICPLYLPDGRAIDTDIDSRIEVLFNKLLDRVCKLRHDMIE EFKAVDVPLGSALEAFRNVYKVAEDQQERMLLDWHLANLEYANASLMSNLSMAYWDQDDP YEMGGDHCFIPGGNERFVRALAEDLPIFYQRTVESIRYGVDGVMVYAGGQEFRGDMVLCT VPLGVLKRGYIEFVPELPQRKKDAIQRLGYGLLNKVAMLFPYNFWGGEIDTFGHLTEDST TRGEFFLFYSYSSVSGGPLLVALVAGDAAVKFETMSPVDSVKRVLQILRGIYHPKGIVVP DPVQAVCTRWGKDRFTHGSYSYVAVGSSGDDYDILAESVGDGRVFFAGEATNKQYPATMH GAFLSGMREAANIMRVSKRRSIALTNKAYNDSEENCNLDKLFDTPDLTFGRISALFDPGS NDLESHALLRVKFQGKKLDSDCLSLYGLVSRKQAIQLSELDGDENRMKMLHYNFGVRLVA RRGLCNAGESLITSIKAAKLNLN.
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