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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI018210 | Chr15 | 3705390 | 3709120 | - | PHD finger protein ALFIN-LIKE 1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI018210.m1 | 9 | 134 | PF12165.11 | Alfin | Family | 223.7 | 4.70E-67 |
| LITCHI018210.m1 | 186 | 234 | PF00628.32 | PHD | Domain | 42 | 6.90E-11 |
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>LITCHI018210.m1 ATGGAAATGGCTTCCAGTCCGCGAACCGTAGAGGAGATCTTCAAAGATTACTGCTCCAGA AGAGCCGGCGTTGTCCGTGCGTTAACTTACGATGTCGATGAGTTCTATGGACTCTGCGAT CCAGATAAGGAAAATTTGTGCTTGTATGGACACCCGAATGAATCGTGGGAAGTGACTCTT CCGGCAGAGGAAGTTCCACCGGAGCTTCCTGAGCCAGCGCTTGGGATTAATTTTGCAAGA GATGGCATGAACCGCAAGGACTGGTTATCTCTTGTTGCAGTGCACACCGATTCGTGGTTG CTTTCTGTTGCTTTCTATCTTGGAGCCCGTCTTAACCGCAATGAAAGGAAACGTCTGTTT AGCTTGATCAATGATCTGCCCACCGTGTTTGAGGTTGTAACAGAAAGGAAACCTGTAAAA GATAAGCCCAGTGTGGATAGTGGCAGCAAATCTCGGGGCGGCGCTAAGAGATCAAATGAT GGCCAAGTGAAAAGCACCCCAAAGCTTGCTGATGAGAGCTTTGAGGACGAGGAAGACGAA CATAGTGAAACCCTATGTGGGAGCTGCGGTGGGAACTACAACGCGGATGAGTTTTGGATT GGGTGCGACATCTGTGAGAGGTGGTTCCATGGAAAGTGTGTGAAGATAACACCCGCAAAG GCCGAGAGTATCAAGCAATACAAATGCCCCTCCTGCAGCATGAAGAGAGGCAGGCAGTAG
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>LITCHI022261.m1 ATGGACAGTCTTGTGGGGTACAGGTTCCATCCAACTCCTGAAGAATTGGTTAGTCATTTC CTGAAGAAGAAGAGGCTGGACCCTGCTTTTACTGACCACACCATCAGGGAGGTCAATATT TACGAGCATCATCCCTGTGAATTGCCTGGGCGTTCGTTTCAGTCTAATGAACAATTTTGG TATTTTTTTTGCATACTCGATCAGAAGTATGCCAATAGTGGTCGTGCCAGAAGAACAGCC AAGGGAGGATCTTGGAAGAAAACCGGTGAAGATGTCATAGTCAAGACCAAAGGCACCAAC AAACACATCGGTTTTAGAAAGACTTTGGTGTTCTACAAGGGCTCCAATTTTAAAAAAGAG AACAAGACTAATTGGGTCATGCATGAGTACCATGCGTACCATGAGGACCACCGCAACAAA GAATCTGTTTTCAAACATGAAGTTGTTGTCTGTCGCATAGAAAGAAAACCGGATAAGAAT CGCGAGCCTTCTTCAACCCTTGATGAAGGGCAACCAAGTGACAATCCGGTTTATGATTCT GGAAGTAATGTTGCAGAAGATATTGTTCTAAAGGCAGAACCTGATCAGCTACTTCAAAAT CACCTTGACAATACTAATCTCATGGAGGTGGAATCTCACCCACTACCAATGCACCTTCTA TCACACGTCACCAAAAATCAGCTGGAATCTCAGCCACTACCAAAGCAACATAGATCTTTG AATGGAGAAGATCTTGTTACAAAAAGAAATTCTTCAGAGAAAGAATCTCAGCTGCCACCA AATCAGTACTTGTCTTCTGACATGGAAGATCATGATGCTAATGAGATTTTTTCAGAGTTA GAACCTCTAGATCCTCCAGGGTGGTATAATCCACTCGGTGATTGCAATTGGCTCAATCAC AGCTCTAGTGGCCTTAGTGATGACCCGAAAGTGTGGAATGCACCCTTAGACACTCCTGAT TTAATGATTTTAAACTCATCGAAGACAACATTCACTGAAACTTATTGCTGTGATCGCAGT GATGAAGGAACCGAAACCATTGCCGCACTGTTCAATGAATTTTCTTCAATGGCTAATGGA GAATATTAGCTCAATAGCATGTGTCAACCGCAATTATATCCCACAGTAGATGAAATAATT GTTCCACGTACCAGTACAAAAGGTGGAATTGTTTTGGTTGTATGTGATGATGATGTAAAA GACTAATATTGAAACTATGATTTCTATGTTTCATTCTTTCTTTCATTTTCTATCTGTAAT TAATGCACAAGGTTGTCCTAATTTGGCACGAAATTATCTTGATTAATTGGGGAGAAGAAG TCGATC
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>LITCHI022261.m1 + Up_Stream_Len 2000 ATTTCACACAAGTTTTGAAGGAAATAAGTTTGATTGAAAATTATTTTGAAGAACCTGAAA ACATACGTGCTATTGTTTTAAATTGTAAATTTGTCGAAACCTCTCCTTTAATGGTGAAAT GCAAAAGAGTTAAGAGTGTAAATATTATTTGTGTTTACATAAGTCGATTTTAATGAAATG ATTTATTGTAGGCAATTATCGAACAAGTTCCCATAACTATTCATTTAATTCCAACTTTTT TGTTTATCAAATAATTTTGTTTTTGAATTTTGCAAATAATTTTTTTGTGATTATCAAATA ATTTTTTTTTTTTAAATTTGCAAATGAGTCCGTTACTTAACTTTTAAGTGGAATCGATTT ATTTCCCAAGTTTAAAAAAATTATTAAAAAATTTTCTAATTACTCTTTATAATAATAGTC ATTTGTTTGTAAATGACTATTGACACCGTTGGTTAAAAAGTCATAGTCCCATGCTTACAG CATGGGTTAGATATCCAAAAATAACAATCCCCTCATCAAAATATATGGGCTGCTCCCCCA CTCTCGTACGGGTTGATTCTTTCCGTATGGATGCAACTCTCGAATTGCGTCATTAGTATC CTATCCCGATAATCCCGATAGTTTCCTAAATTATTTTCAATAATTAAAAAAAAAAAGATA GTCATTTGTTTGACTGTAATTTCAATAATAATTTAAATAAATATTATAATGATAACTAAA AACTAGAACTTCATATGGGAGACAGAGAGAAGGTTATCTGTACCATCCTCCTGCTTTTGG CAATAGGCAAATCTCCTCCCGCCGAAAAGAGATCAATGTAAAATTTCCATTCTCCTATCA ATTAGAAGAAATAGGTGGATCTATTTTATATATATATTTTTTGATATAAAATAGTTCAGT TTTGCCATTCAATATTTTCAGATTTTAAAATTTTTCTAATATTTTTTAAGTGTTTACTAT CAAAATACACTACTTTTTATTTATTAGGTTGTAAACGTTGATTTACATCAATAAAATTGT TTAACTACGCCATTGTTTTTAGAAAAAAAATATCAAGATACACATTGGCTGTTAGGATTG AGTAGCAGAAGTTTGATTCAGGGACAAAGTTGATACAATTGAAAATTAGGGTGATCAATT TGGTTATTTCTATAAATGTCCAAAAAAAAAAAAAACCTAAACACATATAATAATCTTTTA CAAACAACAGTTTTTGTGGAAATATGAAGATATACACTTGTAAACTTTGTATTTAAAAAT CTCTAGCAAATGAAAAAGCTGAAAGAAGATACTAGAACCATTACAACTTGTGAAGGAAGA GAGTGTATGTTCTGCTTGGAGATTGAGATATGCGAGGACAGTGAAGCCAGAGGAGAATAA CATAGCAGTTGAGGACTTAAAGGTAATTTTAGCACAGTGACTAAATTGAAAGGAATCTTG AGAGTGGACTTTCAACCAACTTGAGGCGCAAGTTTCTTAATTAGTTTATTTTTTACGAAG AGATAAGTACTTCAACGCTTCATCAAATCTGCACCACACCTTGATTCGGTAGGACGAGCA TCGCTCTTTACTCTAAAAGATTAAGAATCTTAGTCTTATAAAATGTAGATATGTGTAGCT TATTACAAACTGATCTTCGTCGATTGAATAATAATAGTTGGATAAAATATTGATTATAGT AGCTAATTAATATTCTTTTTTAAAAAAGAGAAGTAGCTAATTAATATTACATCATAAATA GAAGCAATACTTATTGACACGGTTATACACGGTTCGGACAATTACAGACAAGACATGTTG TGATTCTCGAATGTTCTCAGTACAGTGCTAACTCACTGATGGTGCGTCGAAACCTGGCTA AGAGACCACAAGAGAGAATCCTGAGGAAATGTATTCTATAAATCGTCACAACAGCCCTCT TCTTTTTCGCCAAGCAAAATTAATTACTCATCAAACCAGAGACATCTAGCTATTTTTTTT CTCTCGTCTTCTGCCGCACT
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>LITCHI006492.m2 GenomeSequence + AAGTGTTTTCTGCTTTTCCTCTCTTTCTCTCCCTTTTTTTCTCTGCTTGTCTCCTAAACC CTGTTGTGTTAAATCTATTAAAAAAAAAAAACACATACCACAACATATTTCTCAACAACC AAACAAAAAAATTGAACACATGGAGGACTTTGTAGTGAAAGGTGGCATCAGGGTGCCTAT CGGCTACAGGTTTCTTCCAACTGATGCAGAGCTTGTCGATTATTACTTGAAGAGGAAGGT TCTTGGTCTGCCTTTGCCTGCTTCAATTATTCCTGATCAGCTTGATGTTTTCAACACTGA TCCCTGGAGCTTACCTGGTTCGCACAACTATATGCTATATATACACTTTTTGTACTTTTA AAAATATATTTTTTTTCAGTTGGTTTTGGATTCTGTTTAGGTGATTTGGAGGAAAAAAGG TACTTTTTTGGCAAGAGAAATGGTGACACAATTTGGAGTGGTAAAAAAGTTGGAGCTGGT TCTGGTTACTGGAAGTGTAATGGCAAAACCAAGCAGATTCATGTGGATTCTGGAGGACAG AGCAAGGCAGCTGCTGTTGGCAGGAGAACCACCCTGGTTTTTCGCCAAGGAAAACGTGCC CGAACTGGTTGGTTCATGCGTGAATATAGACTTGTACTAGGCACTATTACCACCAACACC AACTCAACAACCCAGGTACGATATATATATACATATTCTTTCTGTAACAAACAATCTTAA GTTTTTATTTTAGAATCACATGTTACTGTTACGTAGTTTCAGCATATCGGACTTCACTGA AAATTAATGATTTTGATTTTCAATGGATTTCGACTAAAATAAAAGTTTAAAGACGTCTCT ATCAAAGAAGGAATATATAAATATATATAAAACGAGATTGTTCTTTGCACATCAGCTCGC CAGCGGTTGGTAACCTCTCTCCCACTAATTTTGAAATTCGTGTGATGAAAATTTGGAATA TGTAAATAGTGTTTGATTTCAATAAAACTGCACAGATTTTTAATTCTTGGTATGCCAGCA TTAAAAATTAAATAATAGTTTGTTATGCTGGTCATAATTGAGCTAATTATGTTACTTATA TGGGCAGTGTGAGATGGGGTCTGGAGATTGGGCTGTTTACTGCATATTTCAAAGGAAGAA AAAGGGCACCAAGAAGCATGGATCATCAATATCAGCAGTTTGTCAACATGATCTCTCAAA CAGCAACAACATTAAGGGTCTGACTTGTGGGATGGCGGTCATGAATACACCAAATAGTAA TAGTATTGAGTCTTCTATTGAGGAAACTGATTTTTTCACTGCTATTCAGCCTTCTGTGTC GGCTTGTTTGAGTGACGTCACAGTTGAGACACCTTCAAATGGGTTTGATGAGGAAGTGAT CAGCAGTGCTTGCAACACTTGCTCTCCATGATGGTTACCATATAAGGAAGTATTGATACC TGATTTGCAAGGCTTTTTGTTTTATGATGTTCAAGTGTGCTCAGATGAGATATATATATA TATATGTTTTGAACCAAGAGCTGCTTAATTTTGTGGGAAAATAAGAAATATAGAAGACAT GCAAATCAGACAAGTGTAATGGTTTCAGTCTTGTTATATATATATATATATATATATATA TCCATATGTTGAATGGCAATATTTTAT >LITCHI006492.m1 GenomeSequence + AAGTGTTTTCTGCTTTTCCTCTCTTTCTCTCCCTTTTTTTCTCTGCTTGTCTCCTAAACC CTGTTGTGTTAAATCTATTAAAAAAAAAAAACACATACCACAACATATTTCTCAACAACC AAACAAAAAAATTGAACACATGGAGGACTTTGTAGTGAAAGGTGGCATCAGGGTGCCTAT CGGCTACAGGTTTCTTCCAACTGATGCAGAGCTTGTCGATTATTACTTGAAGAGGAAGGT TCTTGGTCTGCCTTTGCCTGCTTCAATTATTCCTGATCAGCTTGATGTTTTCAACACTGA TCCCTGGAGCTTACCTGGTTCGCACAACTATATGCTATATATACACTTTTTGTACTTTTA AAAATATATTTTTTTTCAGTTGGTTTTGGATTCTGTTTAGGTGATTTGGAGGAAAAAAGG TACTTTTTTGGCAAGAGAAATGGTGACACAATTTGGAGTGGTAAAAAAGTTGGAGCTGGT TCTGGTTACTGGAAGTGTAATGGCAAAACCAAGCAGATTCATGTGGATTCTGGAGGACAG AGCAAGGCAGCTGCTGTTGGCAGGAGAACCACCCTGGTTTTTCGCCAAGGAAAACGTGCC CGAACTGGTTGGTTCATGCGTGAATATAGACTTGTACTAGGCACTATTACCACCAACACC AACTCAACAACCCAGGTACGATATATATATACATATTCTTTCTGTAACAAACAATCTTAA GTTTTTATTTTAGAATCACATGTTACTGTTACGTAGTTTCAGCATATCGGACTTCACTGA AAATTAATGATTTTGATTTTCAATGGATTTCGACTAAAATAAAAGTTTAAAGACGTCTCT ATCAAAGAAGGAATATATAAATATATATAAAACGAGATTGTTCTTTGCACATCAGCTCGC CAGCGGTTGGTAACCTCTCTCCCACTAATTTTGAAATTCGTGTGATGAAAATTTGGAATA TGTAAATAGTGTTTGATTTCAATAAAACTGCACAGATTTTTAATTCTTGGTATGCCAGCA TTAAAAATTAAATAATAGTTTGTTATGCTGGTCATAATTGAGCTAATTATGTTACTTATA TGGGCAGTGTGAGATGGGGTCTGGAGATTGGGCTGTTTACTGCATATTTCAAAGGAAGAA AAAGGGCACCAAGAAGCATGGATCATCAATATCAGCAGTTTGTCAACATGATCTCTCAAA CAGCAACAACATTAAGGGTCTGACTTGTGGGATGGCGGTCATGAATACACCAAATAGTAA TAGTATTGAGTCTTCTATTGAGGAAACTGATTTTTTCACTGCTATTCAGCCTTCTGTGTC GGCTTGTTTGAGTGACGTCACAGTTGAGACACCTTCAAATGGGTTTGATGAGGAAGTGAT CAGCAGTGCTTGCAACACTTGCTCTCCATGATGGTTACCATATAAGGAAGTATTGATACC TGATTTGCAAGGCTTTTTGTTTTATGATGTTCAAGTGTGCTCAGATGAGATATATATATA TATATGTTTTGAACCAAGAGCTGCTTAATTTTGTGGGAAAATAAGAAATATAGAAGACAT GCAAATCAGACAAGTGTAATGGTTTCAGTCTTGTTATATATATATATATATATATATATA TCCATATGTTGAATGGCAATATTTTAT