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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI018205Chr153639334;3643743;3643786;36457153648353-Trihelix transcription factor GT-3a

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
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LITCHI018205.m647131PF13837.9Myb_DNA-bind_4Domain69.23.30E-19
LITCHI018205.m747131PF13837.9Myb_DNA-bind_4Domain69.33.10E-19
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TCTTTGGTGCTGTAG
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TTAAACAAGCTTAGAAGAGACCAAGACATGTAG
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CAAAGGAGGATGAGAGAGGAAGCTAGGGCTGAGAAGAGAGATGCTCTTATCACAGCACTA
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GACATCCGGTGCCAGCAGAAGTAG
>LITCHI018205.m6
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CATCAACAACAACAGCAACAGCAACAACAACAACTTCCTCATATGAGTGTTAGCGTGGAC
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GCGGAGCTGGATCGAAGTTTCATGGAGACAAAAAGAAACAAGCTTTTGTGGGAAGTTATC
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CAATTTCCGTTTTACAATGAGCTGCAAGCGATTTTCACGACAAGAATGCAGAGAATGTTA
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CAAAGGAGGATGAGAGAGGAAGCTAGGGCTGAGAAGAGAGATGCTCTTATCACAGCACTA
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SLVL.
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DIRCQQK.
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>LITCHI018205.m4
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AGAGAGAGGTCTCTGGTATCATTTTCAAAAATCTGAACGAATAATAAAAACGCTCGCTTT
GACACCTAAGCGAAACGAAAAAAGAAAAGGGAAATCTTTCTTGACGATTCACACTTTCTA
TTCACACCATTATTCTTCTTCATATAAATCTATCCATCTCTTTCTCTATCTAGTCTTTTT
TTTTTTAGTTCCTTTTGATACGTTTCGATCTAGCAAGCAAGCCATCTTTTCTAGGGCCGA
AATCAAATCCTGTGGGGAGCTTTTTCGTCTTGTTTTGATTTGTTTTTGTTTTTGTTTTCT
GTGGTTGCGTGAGTTTGTGGGGTGGTTTTTACTGGTTATGGAGGGACACCATCATCATCA
TCATCATCATCCTCATCAACCGCAACATCAACATCATCATCAACAACAACAGCAACAGCA
ACAACAACAACTTCCTCATATGAGTGTTAGCGTGGACACGAGTGACAGGTTTCCTCAATG
GAGTGTTCAAGAAACCAAGGAGTTCTTGGTGATCAGAGCGGAGCTGGATCGAAGTTTCAT
GGAGACAAAAAGAAACAAGCTTTTGTGGGAAGTTATCGCCACCAAAATGAAGGAGAAGGG
TTACAATCGCAGCGCTGAACAGTGCAAGTGCAAGTGGAAAAACCTCGTTACTCGATACAA
GGGATGTGAAACGGTGGAACCGGAGTCTATGAGGCAACAATTTCCGTTTTACAATGAGCT
GCAAGCGATTTTCACGACAAGAATGCAGAGAATGTTATGGGCTGAAGCCGAGGGAGGAGG
AGCTAGTGGGTCGAAAAAGAAGGCGGTGCAACTATCTTCGGATGAAGAAGATGATAACGA
AGAGAGTGAAGGAGAGAAAGTTGGTACTGCAAGGAAGAAAAAGAAGAGCAAGAGCAGTGT
CAATGCTGTTGTGGGTGGTGGTAGCAGTGGCAATAACTTGAAAGAGATATTGGAGGACTT
CATGAAGCAACAGATGCAAATAGAGATGCAATGGAGGGAAGCGTTCGAGGCAAGGGAAAA
CGAGAGGAGGTTGAAGGAGATGGAGTGGAGACAGACCATGGAAGCCTTAGAGAATGAGAG
GATAATGATGGATAGAAGATGGAGAGAGAGAGAGGAGCAAAGGAGGATGAGAGAGGAAGC
TAGGGCTGAGAAGAGAGATGCTCTTATCACAGCACTATTAAACAAGCTTAGAAGAGACCA
AGACATGTAGGTTTTCTATTAGAGACACAACCGTGTAAAACGCAACATGTATCTAGACAT
CCGGTGCCAGCAGAAGTAGTACTAGTACTACAGTACCATGTTACATATAGAGGAAATTTC
ACTTTGCTGCTGCCAGACAGCTAAAGTACAGACACATTAACCGTGTTTTTGCATGGTCGC
ATAGTCAGCTAATTATATAAATCTCACCGACATGTTTAGTGTTCTGTGCCAAAAACAAAT
TATTTTTTTATTTTGCTCTTGGGACTTATATATTTAAACGCGGGATGTTTGGCAATAGAT
TACAGCTTTTTAAAAATAAAATTCTGACCAAGAATTATATATATAATCAAGTACATAATA
>LITCHI018205.m5
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TTCACACCATTATTCTTCTTCATATAAATCTATCCATCTCTTTCTCTATCTAGTCTTTTT
TTTTTTAGTTCCTTTTGATACGTTTCGATCTAGCAAGCAAGCCATCTTTTCTAGGGCCGA
AATCAAATCCTGTGGGGAGCTTTTTCGTCTTGTTTTGATTTGTTTTTGTTTTTGTTTTCT
GTGGTTGCGTGAGTTTGTGGGGTGGTTTTTACTGGTTATGGAGGGACACCATCATCATCA
TCATCATCATCCTCATCAACCGCAACATCAACATCATCATCAACAACAACAGCAACAGCA
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GGAGACAAAAAGAAACAAGCTTTTGTGGGAAGTTATCGCCACCAAAATGAAGGAGAAGGG
TTACAATCGCAGCGCTGAACAGTGCAAGTGCAAGTGGAAAAACCTCGTTACTCGATACAA
GGGATGTGAAACGGTGGAACCGGAGTCTATGAGGCAACAATTTCCGTTTTACAATGAGCT
GCAAGCGATTTTCACGACAAGAATGCAGAGAATGTTATGGGCTGAAGCCGAGGGAGGAGG
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AGAGAGTGAAGGAGAGAAAGTTGGTACTGCAAGGAAGAAAAAGAAGAGCAAGAGCAGTGT
CAATGCTGTTGTGGGTGGTGGTAGCAGTGGCAATAACTTGAAAGAGATATTGGAGGACTT
CATGAAGCAACAGATGCAAATAGAGATGCAATGGAGGGAAGCGTTCGAGGCAAGGGAAAA
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GATAATGATGGATAGAAGATGGAGAGAGAGAGAGGAGCAAAGGAGGATGAGAGAGGAAGC
TAGGGCTGAGAAGAGAGATGCTCTTATCACAGCACTATTAAACAAGCTTAGAAGAGACCA
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GTACTAGTACTACAGTACCATGTTACATATAGAGGAAATTTCACTTTGCTGCTGCCAGAC
AGCTAAAGTACAGACACATTAACCGTGTTTTTGCATGGTCGCATAGTCAGCTAATTATAT
AAATCTCACCGACATGTTTAGTGTTCTGTGCCAAAAACAAATTATTTTTTTATTTTGCTC
TTGGGACTTATATATTTAAACGCGGGATGTTTGGCAATAGATTACAGCTTTTTAAAAATA
AAATTCTGACCAAGAATTATATATATAATCAAGTACATAATA
>LITCHI018205.m6
AGATGAGACCGGGAGGTGACTGTGTCGAAGAAGAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG
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TTCACACCATTATTCTTCTTCATATAAATCTATCCATCTCTTTCTCTATCTAGTCTTTTT
TTTTTTAGTTCCTTTTGATACGTTTCGATCTAGCAAGCAAGCCATCTTTTCTAGGGCCGA
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GTGGTTGCGTGAGTTTGTGGGGTGGTTTTTACTGGTTATGGAGGGACACCATCATCATCA
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ACAACAACAACTTCCTCATATGAGTGTTAGCGTGGACACGAGTGACAGGTTTCCTCAATG
GAGTGTTCAAGAAACCAAGGAGTTCTTGGTGATCAGAGCGGAGCTGGATCGAAGTTTCAT
GGAGACAAAAAGAAACAAGCTTTTGTGGGAAGTTATCGCCACCAAAATGAAGGAGAAGGG
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AGAGAGTGAAGGAGAGAAAGTTGGTACTGCAAGGAAGAAAAAGAAGAGCAAGAGCAGTGT
CAATGCTGTTGTGGGTGGTGGTAGCAGTGGCAATAACTTGAAAGAGATATTGGAGGACTT
CATGAAGCAACAGATGCAAATAGAGATGCAATGGAGGGAAGCGTTCGAGGCAAGGGAAAA
CGAGAGGAGGTTGAAGGAGATGGAGTGGAGACAGACCATGGAAGCCTTAGAGAATGAGAG
GATAATGATGGATAGAAGATGGAGAGAGAGAGAGGAGCAAAGGAGGATGAGAGAGGAAGC
TAGGGCTGAGAAGAGAGATGCTCTTATCACAGCACTATTAAACAAGCTTAGAAGAGACCA
AGACATGAGTTTGATATTTCATGTAAAACGATAGCACAGACATTGCTGCTGCCTATGTAA
TAATTAAAATTTCTTTTCCTCTTATTTTTTCCAAAAGTATTTTTGGGAAATACCATCTTT
TCATCACTTGATCATCATCATCATTACCCTTTGTCACCGCTCTCCAATGTCTCCAAATGC
CATGAAAATGCAAAATAACAAGTTCCATTTCAAATGATTGCACGTACAAATTTTACAAAA
CAAAATCGTTCTTGCTCCACTTTCATTCAACAATACATCTCCTTAAAAGCGGATCTAGCC
TCATTTATATGCAGCTTTGTTTGAATGCCACCTTTGCGGTTTCTATACATCTTTGATTTT
GACCTTCTTCTTTTCTTGATGCTACTTGATTTACCAGACACAACCGTGTAAAACGCAACA
TGTATCTAGACATCCGGTGCCAGCAGAAGTAGTACTAGTACTACAGTACCATGTTACATA
TAGAGGAAATTTCACTTTGCTGCTGCCAGACAGCTAAAGTACAGACACATTAACCGTGTT
TTTGCATGGTCGCATAGTCAGCTAATTATATAAATCTCACCGACATGTTTAGTGTTCTGT
GCCAAAAACAAATTATTTTTTTATTTTGCTCTTGGGACTTATATATTTAAACGCGGGATG
TTTGGCAATAGATTACAGCTTTTTAAAAAT
>LITCHI018205.m7
AGATGAGACCGGGAGGTGACTGTGTCGAAGAAGAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG
AGAGAGAGGTCTCTGGTATCATTTTCAAAAATCTGAACGAATAATAAAAACGCTCGCTTT
GACACCTAAGCGAAACGAAAAAAGAAAAGGGAAATCTTTCTTGACGATTCACACTTTCTA
TTCACACCATTATTCTTCTTCATATAAATCTATCCATCTCTTTCTCTATCTAGTCTTTTT
TTTTTTAGTTCCTTTTGATACGTTTCGATCTAGCAAGCAAGCCATCTTTTCTAGGGCCGA
AATCAAATCCTGTGGGGAGCTTTTTCGTCTTGTTTTGATTTGTTTTTGTTTTTGTTTTCT
GTGGTTGCGTGAGTTTGTGGGGTGGTTTTTACTGGTTATGGAGGGACACCATCATCATCA
TCATCATCATCCTCATCAACCGCAACATCAACATCATCATCAACAACAACAGCAACAGCA
ACAACAACAACTTCCTCATATGAGTGTTAGCGTGGACACGAGTGACAGGTTTCCTCAATG
GAGTGTTCAAGAAACCAAGGAGTTCTTGGTGATCAGAGCGGAGCTGGATCGAAGTTTCAT
GGAGACAAAAAGAAACAAGCTTTTGTGGGAAGTTATCGCCACCAAAATGAAGGAGAAGGG
TTACAATCGCAGCGCTGAACAGTGCAAGTGCAAGTGGAAAAACCTCGTTACTCGATACAA
GGGATGTGAAACGGTGGAACCGGAGTCTATGAGGCAACAATTTCCGTTTTACAATGAGCT
GCAAGCGATTTTCACGACAAGAATGCAGAGAATGTTATGGGCTGAAGCCGAGGGAGGAGG
AGCTAGTGGGTCGAAAAAGAAGGCGGTGCAACTATCTTCGGATGAAGAAGATGATAACGA
AGAGAGTGAAGGAGAGAAAGTTGGTACTGCAAGGAAGAAAAAGAAGAGCAAGAGCAGTGT
CAATGCTGTTGTGGGTGGTGGTAGCAGTGGCAATAACTTGAAAGAGATATTGGAGGACTT
CATGAAGCAACAGATGCAAATAGAGATGCAATGGAGGGAAGCGTTCGAGGCAAGGGAAAA
CGAGAGGAGGTTGAAGGAGATGGAGTGGAGACAGACCATGGAAGCCTTAGAGAATGAGAG
GATAATGATGGATAGAAGATGGAGAGAGAGAGAGGAGCAAAGGAGGATGAGAGAGGAAGC
TAGGGCTGAGAAGAGAGATGCTCTTATCACAGCACTATTAAACAAGCTTAGAAGAGACCA
AGACATGTAGGTTTTCTATTAGAGGTTTGTCTCTCTGCTGGAAACTCTCGTTTCATGAGA
TGAATGTTATTTTATATGTTTCTGTTTTGTAGGTTCTCTCTTGATGATTCCATTGATATT
TTGTCATTTTTGCTTCCTTTTTGCTATAGTGAAGTTAAAAGCTTCAATTTTAATTCTCTC
ATTTTATTAAATCGTTAGCTAGCTCTTTCTCTTTCATATGGTTTTATATATTAATGGCGT
GATCATTGAAAGGAGACCAAAAGCACCAATTTGAAAAGGTTTGAAGATCTGTTAAATCAT
AATGGGAATAAAGAACACAATATCTACATATCCAACTATAGAGAATCCCCCACAAACTTT
TACACTAGTGTCTGAGATAATGCTTGTGAAAGTAGATATTCTTTAGAGCAAAAATATTAG
GTTCCTGGTGAATATATATAGATGAGCACAGTTGAGAAGTTGATGGTCTATTCTCTTGTT
AGTTGCTTATGGCTCTCAAATTCTTCAAGAGTGGTTTTGGCTTCCATTTAAATGTAATCA
TTTTTAGCACAAATGCTACCTATAGGCCTATAAGTACTACATGAAACTCCATTTAAGGGA
TTAATATACATGAAGGACTTGTTACTTTTTTCAAAGTTTATAGATGGAGAAAACAATTGA
TTGTGACTATTAGTTTGTGAACAAGGTAGGTTCAGGGGAAATGTATTGCCATATCAAGAT
CAGCACTTCAAGTTGTTGATGGAAATGATCATTGTCGTGGACCAAATTGAGATATAATGA
TCGAAGTACTAGATCTTGTTAAGTGAATTTCAAAAATTTAAATTCGAAAACATGGATATT
GTCCTGTGTCTTCTTCAAACTAGGTAAAATTTCAACTAGTAGTTATGGATATGTCAAAAA
GTGTGAATAAATTTTTCAACTATAAGTTAGCTGGCTTGTGTTTGCGAGAGATCAGGAAGT
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>LITCHI018205.m2 -  Up_Stream_Len 2000
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>LITCHI018205.m3 -  Up_Stream_Len 2000
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