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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI018013 | Chr15 | 1860544 | 1862111 | + | Transcription repressor OFP4 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI018013.m1 | 1 | 45 | PF13724.9 | DNA_binding_2 | Domain | 73.6 | 1.30E-20 |
LITCHI018013.m1 | 356 | 412 | PF04844.16 | Ovate | Family | 84.2 | 5.00E-24 |
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>LITCHI002019.m1 ATGGGGAGGTCTCCATGTTGTGAAAAAGCACACACAAACAAAGGAGCATGGACCAAAGAA GAAGATGATAGGCTTATAGCATACATCAGAGCTCATGGAGAAGGCTGCTGGCGTTCACTG CCTAAAGCAGCTGGTCTTCTTCGATGTGGGAAAAGTTGTAGACTTCGTTGGATCAACTAC TTGAGGCCTGACCTTAAACGTGGAAACTTCACTGAAGAAGAAGATGAGCTTATTATCAAG CTCCATAGTCTTCTAGGCAACAAGTGGTCTTTGATAGCTGGGAGGTTACCAGGAAGAACA GATAATGAGATAAAAAATTATTGGAACACACATATAAGGAGAAAACTTTTGAATAGAGGA ATTGATCCTGCAACACACAGGCCACTAAATGAGCCTCCTACAACAACAACAGCAACAACA CCACCTCTAGATGTGACCACCACCACAATCTCCTTCACCGCTGCAAAAGATACATCAACA GAACAGATGATCAAAAAAGGCCCTCAACAACAACAACAGCAAGTGCTACTACAAGTCAAA CAAGAGAGGTGTCCAGACTTGAATCTAGAGCTCAAAATAAGCCCTCCTTCACAATATCAA AATCAATCAGACCAGCAGCCAATGAAAACTGGGGGGAGATCATCGTCCTCGTCAACATCA ACAACATCAAACAACCTCTGCTTTGCTTGCAGCTTGGGGCTACAAAACAGCAAAGATTGC AGCTGCACCACCAGTTTCATTGTTGACCATAATGGTACTACTACAACTAGTATCAATGGT GCCACTCCGACAGCCACCAACACTTGTTATGATTTCCTAGGCTTGAAAGGTGGTGTTTTG GATTATCGAGGCTTGGAAATGAAATAG
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>LITCHI017697.m1 MMLGEPHRPNPTIHVPPWPPILEDQAADIMSPQSINGNANGSPEFNNPYYLQEALAALQR YLPSNDPELDLDGDVCGLDPDSPVDAYSCDQFRMFEFKVRKCARGRSHDWTECPYAHPGE KARRRDPRKYHYSGTACPDFRKGSCKKGDSCEFAHGVFECWLHPARYRTQPCKDGPSCKR RVCFFAHTPEQLRILPQQSPRSVEASSSAKSLPFLSSPESVSPPMSPRAESPMSRSLGSS SISEMVASLRNLQLGKVKSLPSSWNKQLVCSSGYGSPRGSVLRPGFCSLPSTPTKTPSRP GIGYLDIFDECCEEEPVMERVESGRGLRAKMFEKLSKENSVDRADPTQTSGAPDVGWVSD LVNEMK.
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>LITCHI017697.m1 GTTCACTTTCTTTACTGGTCTCAATCTTTATCCTACGCATCTCAGGTTCCACCGACTTTG GAACTCTACGGGCGTAGCCAGAATCAATATTCCACCCCAATCACAAAAAATAAATCTACT CCAAATCACCAAATTTTCATCTACTTCGCATCAGAGCTTGCCACCTGGCACCAATATGCA CATCCCACAAACGTGGAGAGCTCTCAAGGACCGCCTTCCTAGCCCATTAAGGAACAGTCC AGTAACACAAGCACGGCCTTTATTTTAACTGCAGTACAATCGACAGCTCGGAGATTATCA ACCTCACCATGGTTAATTGTGAACTCAACCAGGGTTATAAGCTCAGTCCCTGGCACCTTA TAAACGCAAGCAAAGCATGCCAGTGTTTCCCTAAACAACAGCAAACACTAGAAACAAAAT TAAACTGAAAATGATGCTCGGGGAGCCTCACCGTCCGAATCCGACGATCCACGTTCCCCC ATGGCCTCCAATCCTTGAAGATCAAGCGGCTGATATTATGTCTCCTCAGTCAATTAACGG CAATGCCAACGGCAGCCCTGAGTTTAACAACCCTTACTATCTGCAAGAGGCTCTAGCGGC ACTCCAACGTTATCTTCCGTCAAATGATCCGGAGTTGGACTTGGACGGCGACGTGTGCGG ACTGGATCCGGACTCCCCTGTGGACGCTTATTCGTGCGACCAATTTCGCATGTTCGAGTT CAAGGTAAGGAAGTGCGCCCGTGGCAGGTCACATGACTGGACTGAGTGTCCGTACGCTCA CCCTGGAGAGAAGGCCCGGAGGCGCGACCCGAGGAAGTATCACTATTCGGGTACGGCCTG CCCCGATTTTCGCAAGGGAAGCTGCAAGAAAGGTGACTCTTGCGAGTTCGCTCACGGCGT GTTTGAGTGCTGGCTTCACCCTGCACGTTACCGTACGCAGCCTTGCAAAGATGGTCCCAG CTGCAAGAGACGGGTCTGTTTCTTCGCTCACACACCTGAGCAGCTGAGAATCTTGCCTCA GCAGAGCCCTAGAAGTGTCGAAGCTTCTTCGAGTGCTAAGTCTCTGCCGTTTTTGTCGTC TCCGGAGTCGGTTTCGCCTCCTATGAGTCCAAGGGCTGAGTCGCCGATGAGTCGGTCGCT TGGGTCGAGTTCGATCAGTGAGATGGTTGCTTCTTTGAGGAACCTCCAGTTGGGTAAGGT AAAATCTTTGCCATCGTCATGGAATAAACAGCTAGTTTGTTCTTCCGGGTACGGGTCTCC GCGTGGGTCGGTTCTTCGACCTGGATTTTGTAGTCTGCCTTCTACGCCAACCAAGACCCC ATCTCGACCCGGCATCGGGTACTTGGATATTTTTGACGAGTGTTGTGAGGAGGAGCCAGT GATGGAGAGAGTCGAGTCCGGGAGGGGCTTGAGAGCAAAAATGTTCGAAAAACTGAGCAA GGAGAATTCTGTTGATCGGGCCGATCCGACACAGACAAGCGGGGCTCCGGATGTGGGCTG GGTATCGGACCTTGTAAATGAAATGAAATGAAGTGAAGTGAAGTGGCTTCTGTGGTTCTT CTCACTCATCCAAGAACCAAATTGTTGAGATTTGATATCGATTTCTTCGTTAAAAGTTGA ATCTATTTATTTGGATTGATTTTGGTGGACTGGTTTTTGGCTTCCTCTTGGTGTGAATAG TATCCAAAGAAAAGAAAAAGAGAGGAACAAAAGGAAGGAGTATTATTTTGGAAGTAACAG ACTAAAGATTCTGTGTATATATTTATTTATATTATTATCATTATCATAATCATCATCAAG AAGCTATCGGTGAAGGAAGAGTAGAATCTCTTTTTTGGGGAATTTTCTGAGAAGATCAGA AATTACGAAGTTGGAGAAAAAAGGAAAATTGCCGAACAACTGTTTGTATAGCTAGCAGAC TTGGATTCCCTTAGTTCATGTTTTTTATTTTTTTGGCTTTATAATTAATTATCCGACTTG CTGATCTTATATTATATTATTATTGTGTAAAAATTTCGGAGCTATGTAATGTTTCTGATC AATGCAATGTTTATTTTTAGCATAAGTGGTCATTTCTTCTTGTTTCTTTATTTGTGCTTG AAGTAGACACCCGCTTCAATTTGATCGAAATAAATGGAATTTGGAATAGGTTTCCGGTTT TTCCCGTAACAAATGGCCACTAGTGAGGAAAGAGTAATTTCTCTGAAGAGGGAGGAAACT TTGTCGAGTAATTTGTTTGACGATGGAGGAGACTTTGTCAGCGTCCCCTTCGTTTCAACT TTACTTGATTGTAATTCTAACTCCTGTAACACGCAACATCATGACCCATCACAAGTCTCT CCGTGGGAGCTTTGAAAGTTTGATATGTGTTACTGTTTTGACGATAAGCGCACCGTTGGA TGGCCCATGATGAGTTTCATGGATGGCCATCGTATGGTGTGGAAATTGCTAGACGTGATC GAGATGGATGTGGACCTGCCTTTGTTGATATGGTATGATGATGAATTGATGCTATTGATT TTGACATTGAAAATTACTGATATTGTTTTAGTAATTAGTGGAATAATCAAGTGCGGTTAA GTTGTATTTAATGATGGCCTTATGTCTATTGGCTACATCCACCGGAGCCGACCCTAGATA TCTCTCCAAAATCTTGGTTACTCTTTACACTAATCAAATGTATTTAATGG
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>LITCHI017697.m1 - Up_Stream_Len 2000 TAAAAACAATGGAATTTATGGTGTGTTTATTTAATGGATTAGGGGATGAAAATGAAGAAT GAGATTGATTGATAATGTTTACTAGCTCAAAATTCATTTCGTAATGGGAATGAAAGTATG GGCCCCACGTCAATTTGAAATTGTGGAATGAGAATCTCATTCCCCCAACCTACTTGGGAA TCTCATTCTCATTCCTTTTGTTAGGATGAAAAGTCTTTTATACCTTTCTTTAATTTTTTT TAAAAAAAACCTATTTTATTTGATATTAAAAAAAAAAAAAAAACCGACTATTATAATAAA AAACTGCACATTATTAGTTTTTCATTACCAATTTCTTAATTATTATAATGGACTATTAAA ATAATATACAATTTTTTTAATTATAATATATAATTTTTTATTTGATATTAAAAAAAACTA TATATTATAATAAAAAATTACACACTAGGTTAGTGGATTATTAAAATAATATGCAATTTT TGTATTATAATATACAGTTTTATATTTAATATTAAAAAATGCATATTATAGTAAGAAACT ATACACAATTATACTTAATCCATAATTTTAATTAAGGGTATTTTTGTAACTTATAATTAA TCTATTCCGATTCCAAAGTAAAGTAAACAGTTCAATGGAAATACTGCTAATTCCAATTCT GATTCTTGCAGTTGATGTAAATAACTTATTTTGATTCCGATACTTCATTCTGATTCCAAG TCATTCCAATTCCAGATCATTTCGATTCCTCAAAATAAAGTAAACGCATCATTAATGAGT TTGGAAATAATATTACATCTCCACTTTTTTAAAACAAAAACAAAAAAAACAAAAAACAAA AAACAAAAATGTAAAGTTTTATTTTGAATAAATTAAGTATATTATAAAATATTTAAATTA TTTTTATTTCAATCAAATCTCAATCTACACCAAACATCTCCATTTTTTTCCATTTTTTTA AAAAATAAATTTTAAATATATTATAAAATATTTAAATTAATTTTATTATAATTTAATCTT AAGCTACACAAAACATAATATGATATAATTTTATACTAATTCTAAGTTATATCAAATATG AGATAATAATTTTTTAATTTAATCAAGTCTAATTCAATCCAATCCATTCTTATTCATTTA TTGTAGTTTAATTCAAACAATTTTATTATAACCTCGTGTGCCAATCGTAGTATAAAGCGA GACCTAGAGAGTGAGACGAAGCACCCATAGTAAGAGGAAAAAATTGCCCATAAATAATAT AATTTTGTGAGATTGAACCCACACTTGAAGAGTTGATAAGGATAACTCTTGATCTTACTA CTAAATAAGATCATTTTTATCATATAATGTAACCTTTTTTTGAAATATTATATGATGTAA AATTTTTGTTTTTAAAGAATTATAGTATAACATATTAATAAACAATGAAAATGTTGTTAG TAACCTAATCACATAATAATTGCATTTTTTTTTAATTCGTTCCGTCCATCTTATTATAGA GAAAATAGCGGTTTTCCAAAATATCAAACCCATAGTTTTTCGCAAAGAAAAAAACAAAGA AAAAAAAAATGTTCACTTTCTTTACTGGTCTCAATCTTTATCCTACGCATCTCAGGTTCC ACCGACTTTGGAACTCTACGGGCGTAGCCAGAATCAATATTCCACCCCAATCACAAAAAA TAAATCTACTCCAAATCACCAAATTTTCATCTACTTCGCATCAGAGCTTGCCACCTGGCA CCAATATGCACATCCCACAAACGTGGAGAGCTCTCAAGGACCGCCTTCCTAGCCCATTAA GGAACAGTCCAGTAACACAAGCACGGCCTTTATTTTAACTGCAGTACAATCGACAGCTCG GAGATTATCAACCTCACCATGGTTAATTGTGAACTCAACCAGGGTTATAAGCTCAGTCCC TGGCACCTTATAAACGCAAGCAAAGCATGCCAGTGTTTCCCTAAACAACAGCAAACACTA GAAACAAAATTAAACTGAAA
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>LITCHI011606.m2 GenomeSequence + GGCATTTTGATAATATCTTATTTATGTGTAGTTTGTTTGGTAACAGAATAACGGAGGTAG GACAAAAGATGAATTTTCTTGGAGAACAAGAAATTGTGAAGGAGCTTCATGGGCCACCGG GGTTAATGTTTGATCCTACGAAACCAGAGCTGGTTACTGACTTTTTGAAAAACAAATTAT TTGGCCTACCAATTCCTTTCGGTTTTATCGAGGCTATTGATGTCTACTCCCAAACACCTG ATCGACGTCCTCTACGTAAGTGTTTTTCCAATTATTTTTGCTTTCCTACATTTTGCAAAT GTTGACTCATTTTGTTGCTATTCATGCATGTTTATGGCAAAAAAAGGTATAGAGTCTGAT AGATGTAAGACTATCTAACACCTTCCCTCACATAACAAATTTATTTTTTCAACCGATGTG GAACTATTTAACACTCTTTTTCATACACAGCATGCCTGCTCGGTAGCACTTATTGCCATG CAATTGAGTTCGGATCATGTCTACACCTTCCCTCATGCACACCTACACCTATACAACTGA TTTTAGATCATGCAACTTAGATAAAGTCCAACCCATTGTTGAAAATACCTAGCTCCGACA TTATGTCAGAAAATGATCTTGGATTTTACTCCGCTATAAAATTTAGCTCATGAATGAAGG TTTACTCTCATCTTATAAATCAATATAAATTCATTTTTTTCAACCAATGCGAGACTATCT AACAGTTTGATTGTCAAATTACAGCAAACTTTTTTGTATTATATTACATATAATGTCAGT AGTAGCATTTCTTCTATATGTTATTACTGCTTTAATTGGATTTTGTTGCAAATTATTGTT CATGGTGCATGCTACGTACTTGTGAAATTGTTCATGACTTTGGTTATGCATTTCCTTTGG 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