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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI017964 | Chr15 | 1327159 | 1329053 | + | Paired amphipathic helix protein Sin3-like 2 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI017964.m1 | 49 | 93 | PF02671.24 | PAH | Repeat | 55.8 | 3.90E-15 |
| LITCHI017964.m1 | 134 | 176 | PF02671.24 | PAH | Repeat | 58.9 | 4.40E-16 |
| LITCHI017964.m2 | 49 | 93 | PF02671.24 | PAH | Repeat | 56.3 | 2.70E-15 |
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>LITCHI017964.m1 ATGCCTGGGACAGCAGAAAGAGGGGGAGGTGGAACTGGTGGTGGTGGGAGAGGAGCTGCG CCTGGAGGTGGTTCTCGGAGGCTAACAACAACTGATGCCTTGAGCTATCTCAAGGAGGTT AAGGACATGTTTCAAAATCAAAGGGAAAAATATGACATGTTCCTTGAAATCATGATAGAT TTCATGGCGCAAAGAACCAACACTGCTGGTGTCATTGCAAGGGTGAAGGAGTTATTTAAA GGACATAATAACTTAATTTTTGGATTCAACACCTTTCTGCCGAAAGGATATGAAATAACT CTTGATGAGGAGCATGAACCTCCATCAAAGAAAACATTAGAATCTGAAGAAGCAATTAAT TTTGTAGACAAGATAAAGAGACGTTTCCAAAATGATGAACATGTCTATAAGTCATTTCTG GAAATTCTGAATATGTATAGGAAGGAGCGCAAGGATATTAATGAAGTCTACCTCGAGGTT GCTACTCTTTTTGAGGACCATCAAGATCTGCTTGAGGAATTTACCAGATTATTTTAA >LITCHI017964.m2 ATGCCTGGGACAGCAGAAAGAGGGGGAGGTGGAACTGGTGGTGGTGGGAGAGGAGCTGCG CCTGGAGGTGGTTCTCGGAGGCTAACAACAACTGATGCCTTGAGCTATCTCAAGGAGGTT AAGGACATGTTTCAAAATCAAAGGGAAAAATATGACATGTTCCTTGAAATCATGATAGAT TTCATGGCGCAAAGAACCAACACTGCTGGTGTCATTGCAAGGGTGAAGGAGTTATTTAAA GGACATAATAACTTAATTTTTGGATTCAACACCTTTCTGCCGAAAGGATATGAAATAACT CTTGATGAGGAGCATGAACCTCCATCAAAGAAAACATTAGAATCTGAAGAAGCAATTAAT TTTGTAGACAAGATAAAGGTGAAAAGCTTTGTCTTAGTCTCTTATTTTAAGGTGAAAAAT ATTGGTTGTACAGTTTTTGAATGA
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>LITCHI017964.m1 MPGTAERGGGGTGGGGRGAAPGGGSRRLTTTDALSYLKEVKDMFQNQREKYDMFLEIMID FMAQRTNTAGVIARVKELFKGHNNLIFGFNTFLPKGYEITLDEEHEPPSKKTLESEEAIN FVDKIKRRFQNDEHVYKSFLEILNMYRKERKDINEVYLEVATLFEDHQDLLEEFTRLF. >LITCHI017964.m2 MPGTAERGGGGTGGGGRGAAPGGGSRRLTTTDALSYLKEVKDMFQNQREKYDMFLEIMID FMAQRTNTAGVIARVKELFKGHNNLIFGFNTFLPKGYEITLDEEHEPPSKKTLESEEAIN FVDKIKVKSFVLVSYFKVKNIGCTVFE.
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>LITCHI017964.m1 TAATTTATAGTTACGATTCACTTAATGGAGTGAACTCACGAAGGGTTGCACATAGTGTTT TAGAGGGGTGCAAACATCAATTCTTTAAACAAAACTGAACTTAGTTTGAGCCCATCTGTT GAAGAGTCAAGATTCACTTTGTTGGAACCCTAAATCAGAAATTGAAAAGTCAGAACCCCT GCGCATATTTTGTTTTTAGATTTGGTGGTGCGAAATTGAATGCTTTTTTGGGTGTGTTGT TGGATCATATACTAGAATTGATCAGTTGTTTGGTTTTTGAAATGGAAGATTTTGATCAGC TTTGTGGGATTTTGTGAATGGGAGATTGGTTTTGTGATTGGTGTGTTTAGAAAGTAAACC CTTGACATGGTGAAAATTGTGAAAGATTGTTTTGCTGTAAAGAATGCTGTGGTTTCAGTA TGATTATAGGTGTTTTTTTTTGGGGGGGTATGGAATATTTGTTATTTTGGGCTAGTAATG TAACATTTTTCTTGTGTGTGAAGCTATGGGCAACCACAGATGCCTGGGACAGCAGAAAGA GGGGGAGGTGGAACTGGTGGTGGTGGGAGAGGAGCTGCGCCTGGAGGTGGTTCTCGGAGG CTAACAACAACTGATGCCTTGAGCTATCTCAAGGAGGTTAAGGACATGTTTCAAAATCAA AGGGAAAAATATGACATGTTCCTTGAAATCATGATAGATTTCATGGCGCAAAGAACCAAC ACTGCTGGTGTCATTGCAAGGGTGAAGGAGTTATTTAAAGGACATAATAACTTAATTTTT GGATTCAACACCTTTCTGCCGAAAGGATATGAAATAACTCTTGATGAGGAGCATGAACCT CCATCAAAGAAAACATTAGAATCTGAAGAAGCAATTAATTTTGTAGACAAGATAAAGAGA CGTTTCCAAAATGATGAACATGTCTATAAGTCATTTCTGGAAATTCTGAATATGTATAGG AAGGAGCGCAAGGATATTAATGAAGTCTACCTCGAGGTTGCTACTCTTTTTGAGGACCAT CAAGATCTGCTTGAGGAATTTACCAGATTATTTTAAAGTTGTATGTGCACCCCACTAAAG TTGTATGTGCATCCCTTTGGTAAATATATCCCCATTAAATATTATTTTGAAAAATTATAA TTTATAGTTATGATTCACTTAATGGAGTGAACTCAACAAAGGGTGGTACACATGGTTTTA GAGGGGTGCAAGCATCAAGTCTCTAATCAAAATTGAACTTAGTTTGAGCGCAATTAGTTG GGAGAGTCGAGCTTCACTTTGTTGGTCTGTATATTGTCTTGAATTAATTCAATTATTATT TTTTATTTGAAAAATTGTGTGTGCAATCTTAAATGTCCAGGACGAAAAGAGAATGGGCCG GTGCCAGCCAGAAGCTGGTCAACTGTTAGATAAAATACAACATTAGACTTTAACTTACAA GATAAAAGTTGAACGAGTTTAAAATCGAATTCACTAAAAGACATGAAGTTGGAAGACTAT GGAGTTTCTAATTAACAAGTGTTTCAATAAGTCTAGTAGTGGGTGAATTTGATCTTATAG TTACATCAAAACGATGCTTAATACTTCGCTTTGGATAGG >LITCHI017964.m2 TAATTTATAGTTACGATTCACTTAATGGAGTGAACTCACGAAGGGTTGCACATAGTGTTT TAGAGGGGTGCAAACATCAATTCTTTAAACAAAACTGAACTTAGTTTGAGCCCATCTGTT GAAGAGTCAAGATTCACTTTGTTGGAACCCTAAATCAGAAATTGAAAAGTCAGAACCCCT GCGCATATTTTGTTTTTAGATTTGGTGGTGCGAAATTGAATGCTTTTTTGGGTGTGTTGT TGGATCATATACTAGAATTGATCAGTTGTTTGGTTTTTGAAATGGAAGATTTTGATCAGC TTTGTGGGATTTTGTGAATGGGAGATTGGTTTTGTGATTGGTGTGTTTAGAAAGTAAACC CTTGACATGGTGAAAATTGTGAAAGATTGTTTTGCTGTAAAGAATGCTGTGGTTTCAGTA TGATTATAGGTGTTTTTTTTTGGGGGGGTATGGAATATTTGTTATTTTGGGCTAGTAATG TAACATTTTTCTTGTGTGTGAAGCTATGGGCAACCACAGATGCCTGGGACAGCAGAAAGA GGGGGAGGTGGAACTGGTGGTGGTGGGAGAGGAGCTGCGCCTGGAGGTGGTTCTCGGAGG CTAACAACAACTGATGCCTTGAGCTATCTCAAGGAGGTTAAGGACATGTTTCAAAATCAA AGGGAAAAATATGACATGTTCCTTGAAATCATGATAGATTTCATGGCGCAAAGAACCAAC ACTGCTGGTGTCATTGCAAGGGTGAAGGAGTTATTTAAAGGACATAATAACTTAATTTTT GGATTCAACACCTTTCTGCCGAAAGGATATGAAATAACTCTTGATGAGGAGCATGAACCT CCATCAAAGAAAACATTAGAATCTGAAGAAGCAATTAATTTTGTAGACAAGATAAAGGTG AAAAGCTTTGTCTTAGTCTCTTATTTTAAGGTGAAAAATATTGGTTGTACAGTTTTTGAA TGATGGCTCTTGTTCTTGTAGAGACGTTTCCAAAATGATGAACATGTCTATAAGTCATTT CTGGAAATTCTGAATATGTATAGGAAGGAGCGCAAGGATATTAATGAAGTCTACCTCGAG GTTGCTACTCTTTTTGAGGACCATCAAGATCTGCTTGAGGAATTTACCAGATTATTTTAA AGTTGTATGTGCACCCCACTAAAGTTGTATGTGCATCCCTTTGGTAAATATATCCCCATT AAATATTATTTTGAAAAATTATAATTTATAGTTATGATTCACTTAATGGAGTGAACTCAA CAAAGGGTGGTACACATGGTTTTAGAGGGGTGCAAGCATCAAGTCTCTAATCAAAATTGA ACTTAGTTTGAGCGCAATTAGTTGGGAGAGTCGAGCTTCACTTTGTTGGTCTGTATATTG TCTTGAATTAATTCAATTATTATTTTTTATTTGAAAAATTGTGTGTGCAATCTTAAATGT CCAGGACGAAAAGAGAATGGGCCGGTGCCAGCCAGAAGCTGGTCAACTGTTAGATAAAAT ACAACATTAGACTTTAACTTACAAGATAAAAGTTGAACGAGTTTAAAATCGAATTCACTA AAAGACATGAAGTTGGAAGACTATGGAGTTTCTAATTAACAAGTGTTTCAATAAGTCTAG TAGTGGGTGAATTTGATCTTATAGTTACATCAAAACGATGCTTAATACTTCGCTTTGGAT AGG
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>LITCHI016141.m1 - Up_Stream_Len 2000 ATAAAATAGGAATATCCTCTTTTTGTGCTTTTGCTTTACTGTAACCATCCAATTCTTTAA GGTCAACATAGCATTGGAAATTTTTAATCCAGTCCCATAAAATTTCCAGTGCCAAAGACC CCTTACAACTTTATCAGACGCGGCTTCTCATAAGTCATATCCAATGACTTTCATTATTCC TCTGTGCATTTCAATTATCTAATAACTTATCATGTTATGTCAAATTTTTCTTACCCTATT TGGACCACTTTTTATACTAATGCGACTAATGATGACGTAGTCACATATATAAAATTTATC AAAATCTTTCGGAAACTTGTTACTCTATGTTGGATCAGCCATGATGCATCTCTCAAAAGC GAGTTTATTGGTATGCACAAAAGAACTTGTCTACAATAAAATGTGCATGCCATTGGGGTA TAACATATCTTTATAGATTCTTTTCTTAAAGTTAATACCAATTGAGCTGGTGGTTACAAA AATTATTGAGATTAATCATTAATTGTACTGTGTTAATCATAAATCAAATCCAAAAATTTA AACAGATAGAAAATGACTTAATTATAATATTTAATATTTGATATTGTGATACGTTAATAT AGAGTTTGAATATTTATTCTTATAAATTAAAAGACAATTAATCTCATGATAATGAGAGCA AACTATTTACATAAAAGTTTATAAAATACACTTGGTTGCACTTGAACTCTCATTACTAAG GTGGATGGGAGCGTGTATCATTACTTGTGTTGAAAAAACAATATCCACATCACTTGTAGA TCTTGTCATGCGTAGTAAATCTTAAATAGATAGTATATTTATTGAACTATACCATTTGAG ATGGAGGGAATCAATTTGAACTTACAATTTCATTATTACAAGCATGAAGCTTATACTATA ACCTAACATAGACATAAAAATATATCATCAAATAAAATATTAATCAATAGCTTAATATTG TAAGCATAATTCTTCCTTATAAATAAAACTTAATTCTTTTCTATGAGCTATATATATTTG AACTTGTTGATAAAGTTTATGAACACCTTCATTGTTCAAATTATTTATCCACGGTGGTGA CCAATATAATATGATGTGTAAGTAACTAACACATCATCAATCATATCATTATCCAAATTA TTTATCCATTGTAATTACTAATATAATATTATGAGTCATTAATACATCATCATTTATATC ATTTAATAACTGATATAGTAATTACATTTCATAGATCATATCGTTTAAATATAATTTTAG ATCTCTTAAAAATATATATCTAAGTTTAGATAATTAATTTGAATAATATAATCACTGTAT ACATTACACAAAAAATATTGATATTATGGAATAAATAATAAACAAAAAGGGTAGATTTTT TTCCTTTTTAAAGTCATGGACTTCTAGGAAACACCATTGTCATCCAACACGCGGTAAGTA ATATATAAATAATTACACAGTCATGTGCACTTGTCAACAATCAGTTACATCAATAATCGA GAGAGCTCATCTGTACCCGTCAGGATCCCAACACGTGTCCAATTTAATCACAGCCGTCCG ATCAATTGTAAAACCGACTATAAAACTAACCCTCCGTTGCATCATCATAAGAAGGATAAA AAAAAGAAAAAAGAAATACAAAACCACTCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAACACCCCTATCT TCTTCTTCCTCTCTTTTGAGGTCTGAAGAAAACAAACACCGAATCCCATCCCAAACTTTC TCAAATTTCAGATTATCCCTTCCAGGGAATGCAGAGAGATGAGAGGACCGTCGCTAGCCA AGTTTGAGCTTTGCCTCCGTACCACACGGTGCTCCGGCGGCCGCAATTGCCACCGGAAAC ACGTCGAAGACGGGTGATCCGGTTACAACACCATCCCACCACTCACAATTCAAATCCTAC TACTAGTATAGCAAAAACAAACAAATATTTTTTGTCTGTTGAGTTTCCTTCAATTCTCTT AATCAGTAAGTTATAGTTGT
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>LITCHI016823.m1 GenomeSequence + GTCAGGCAGTTCCGGACCATTGGCGAATTTTAAAACAATGTTCCTCTGATTCTGTCCCAA CAGAGTTTGCTTTTTTTTTTTTTTGTATAAAGAGAGAGAGAGAGAGATGGGAAGAAGTCC TCGATGTTCCAAGGATGGTTTGAATAAAGGAGCATGGGCAGCTTCTGAGGACAAAATAGT GAGAGACTATATCAAAATTCATGGTGAAGGCAAATGGAGCAATGTTGCCAAAAAGACAGG TTTTTTTCATTTTTTTTTTTATGTCTTTAATTCTTCGATTTTTCTTTGCATAATTCTGGG TAGTTTTAATGTGTATCAAAATGTCAATTTTTTGACTAAAAAACCACTGCACAATTTAGG TGCATGTGAAGAAGCACTTCTGTAGTCCTTGATTTTTGGAACCTAGAATTTAGTGCTCCG CAGCTTTAAGAGTACTTATAAGGGTACTTTTTTTTTGTGTGTTTTTTTTTTTTTTAAACT GGTACTTATTTATGTTATGGTTCCTATGTACTCTCCTTTTTCATTTTTAAAAAGTATTAA AATAACCATTTTTTAAGATTAAAATTGTAAAGTAATCATTTTTTAAGATTTTATATTTTT ACCAAATGTATTTTTATTTGAAAATAATTATTCTTTCAAAATTTTTTAAAAATTTTAGTA TTAAATTTAGAGTTAAAAAAACAATCATATATGAAAGAAACTCTTTTTCTTCCTTATGTT TTAGTCAAAGTATTCAACTCTTTTTGATTTTTTGGAAAGAGTCAAAGTACTCCTATGAAT ACTTCTTTATCTTCGTATACTCTCTTTTTTCTTATTTATATTTTAGTTGAAGCTTGTGAA TTCTCTGTGATTCGATGATGCTGCCTTTTTTCTTTTTTTGGTTATCAAAATATGATAAAA GAATTGTAAATATCATTATGTAGAGGTAGTTTTTTTTTTCATTTAAAATTTAATAGTACT AAATTATATCTATTAAGTTGTTTCAGTTTATTTTTTTAAGTAGTCAAACCACTTAAAACT ATAAAAAAAACAACTGAAAAAATTAAGTAAGAATTTTTAACTTTTTACTTAATTATAAAT CATTTAATAACATTAAAAATTTTTATTTCAAATCTATCCTCCAAAATAACATAATTTTGA ATTCATCCTAATTTTATATTACTCAATTTTTTTTGATACTTACAAAAAATATATTTGAAA AATAAAATTTAAATACATCTCATCTCAAATTATCTTGGAATTAAACTAATATATTTTAAT TTACAATTTAAATATTCATTTTTTATTATTTTCTTAAATATATTAATATATTTAAATATA TAAATATGGTTAATACTATTATACTTTTTAATCATATTTTAATTATGAATAAATATTATT AATATGTACATAAAAAATGTTTCAGAATTTATTAAATTATTTATTTTTAGATTTCAGGTT TCAATCACTATTCAGTCTTCAATTTTTAACAGCACTATTCAATGTTCAGATAAAAATAAA TGACCCCGTAATATAGAAATAATAACTTTTCCTATTTAAATTTTAGTTAAAGATTCTTAC TACTCTCTAAAATCCGTGCTTACTTTTTTTTTTTTTTTTAATCATAACACAGAAACGAGA GCATAGATTGTTACACAATCCATGGAAAAAAAAAGAACTATATTTTCACTATATACACTT AAACCTTTTGTTATATATAATGGCTATGGTTTAAAATCACAATACAAGTTTTTTAATGTC TCAAGCAGGTCTAAAGATAAGTGGGAAGAGTTGCAAGCTTCGATGGATTAATTATCTGAG ACCTGATATAAAGAGAGGCAACATTTGTAGCGACGAAGAAGAGCTGATCATCAGGCTCCA TAAGCTTCTAGCCAACAGGTGCTTACGTATAATCTTATTGATCCATCGCCCTATCATACC ATAGACATGTATATTCCATCATATATTTGTATCCATGACAATGGTTATGTAACATTAGAA AATCGCATTTTTAATGTTAAATGAGGGTCTCAATTCTAGTGTTAGGAAACTAGGGAAAAA TCTGAAAAACCCACTGAAATAGAAATTTTGTGACAAAACCATGACAAAATGAAAATGCCC TTACTATATTGAAAAATTTTAAAAATACAAAAAATTAATCAATTACCAAATTAACCTTTC ATCATCAAAATAAAAAATTGAACAATAAATAAAAAATATATTTTTAAAAAATTTAAAAAA TATATTTGTATAAAAATAAATAAATAAATAAACTACAATTTTAAATAATTAAAATAATAA TTATTATCAATAAAAACCATAAAAATAATAATAAATTAAAAACTAATTAAGTTAATTAAT GAATAATTGAAAAAATTAAAAAAAAAATTGACGTTTATATTCTTATATTTAATCCAAATC CAGATCTTTATCAACATAAATTCTGTTTATATATCTTCACCGTTCATGAAGACAGATGAA TGATGGAGATCCAATATGAGACCTCAATTTAAAAAATAAAAATAAAAATGTAAAATTGCA AAAATGCATTTAGTATTTAATAATTATAAACAACTATAATTAAATATAATTATTTAGTAT TTAATAATTAAAAGTCAAACAAATTGATTAAAACCAAAAAACAAATTGAAGATCTGGGTA CCAAATCTTCAGAGTTTAAAGGTCTTCATTAAAGTAAAATAATAATAATAATAATAACAA AGTGAAAGATCTAAGTTCAACTAAGATCTTTAAAGTTTGAAGTTTAGAGATGGATTGAAC TCAGATTTTCATTAAAGCAAAAAAAAAAAAAAAATAATAATAATAATAATTAATTAAAAT TTAATAACAAAATGGACCCAAATCTTCAAAATTTGAAGATATGAGTTAAACTCAGGTTTC ATTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAAAAAAGTGGAATATCAGGGTTAAATCCA TATTTCATAAAGCCATTTTTTTTTTATATAAAAAAGTGGAAGATTAACCCAAATCTCCAT TAAAGTCATAATAATAATAATAATAAAGTAAAAATTAAAAAAAGGAAGATCTAGAATCGA AGATCTAGATAACCTAGATCTTCACTTAAATGCCAAATTAGAAAAAAAAAAACACAAAAT TAAGCAATAAGCAAATCAATGTTCGTCCAACTACATCAAACAGATATCCAAGACAAAGTT TATCAAATAGTAAGCAACCAAAGTATGATTCTAGGTGTGTTTGTCATCGAACAAACTCTC TTAGATTTGACAATTTGGACAAACCTAACCTAGTGGATTTATTTGATGATCTAAGTTTGA AACTTAGATCGTCTAGCGATCTGGTTTCCATGAAAATCAAATCCATGGTCGTCGATCTAG AAACCAGAACCAATTAGCAAGTCGTGCTGACCAATGGCTTAATCAATATTCGGTCACTGA TTTGAGTTGATTAGGGTGAGAGAGAGAAAAACATTGATGATGAGAGAGAAACTGGTTAGG TTAGGTGAGATGAGTGTGACAATTGTGGGGACAATTGTCTCACATGCATTTAACACTTAT ATTTACCTATTTGCCCTTTCTTTCTAACAGATTCATGAACTTATGAACGGAAATCACCAA TTGGGTAATATTTTCAAAATCAAGGGTGATTTCTTATTATTTTCAAATCAGGAATATTTT GATAATGTCCCTATAACACTATTGTTCCAAATGTAACTGTCCTGGCTTCCACAACGGGGA AGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATGTATACATTCGAGCTTTTGGCTTCAAGACAATTT GTTAGTGCAACTTTCTGAGGAAAAGGTATTTTGACCTCTATTTAAAGCTTGATTGCATTT GTCTTCAGGTGGTCCGGTAGACTTCTCGGAAGAATTGACAACGAGATCAAGAATTATTGG AATACAAACTTGGCTAAAAGATCACCAGATTTGTCTGCAAGTAAGACACAGCCTACAACA ACAACAACAACAACAACAAGAGTTCAAAACCAATCAGGTCTGGATCCGGAACCTGGTGTA CCCAATTCATTACCAAGCAATAACAACTACAATATGGAGCCAAAGAATATCATTATAAGG GCTTATAATGAGACTCATGACCAAGTAATGGCGCACTCTCATCATTGTCTGGAGAAAATC ACAATTCATCGTCAGACTTGATGATGGATTTCAACGTGGATGATTTTTGCAAGATTTCAG ATTCTGACTATTGTATTGATGTTAATCTTGATCAGCCGACCAGCAGTTTGGTAGATGTTG GAGATGGTGAGGATATTATTAATAACGTGATGTCATGCGAAACTGAAGAAGAATTACCGC CAACTTTTCCCGAGAAAATGAAGGAAAATTGGAGCAATGCAAGTGAAGGTATTCAAGAAA ATAATCATCAAAGTGACATGGACTCAGAATTCCTGACATTGGCTTCTTCATTTCTTGAAT CACCTGATGTGGAGTGGCCTGGATATGATCTAAATATTAGTACTTATGCAGACAAGCAAA TTAATCAGATTTAGTTACGTCAATTTATGTGTCCGAGGTCACTTAATTAGTTACTAGTTA GCATGTATGTCATGTTAAATAATAGGGATATTATTAAAATACTCACCGAAAATGAAATTA ATATGAAACCACAAATTTTTATGTTTAAAAATGAGGTTTTGTGGTATTATTTTATGTTTT AAGAGGT