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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI017964 | Chr15 | 1327159 | 1329053 | + | Paired amphipathic helix protein Sin3-like 2 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI017964.m1 | 49 | 93 | PF02671.24 | PAH | Repeat | 55.8 | 3.90E-15 |
| LITCHI017964.m1 | 134 | 176 | PF02671.24 | PAH | Repeat | 58.9 | 4.40E-16 |
| LITCHI017964.m2 | 49 | 93 | PF02671.24 | PAH | Repeat | 56.3 | 2.70E-15 |
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>LITCHI017964.m1 ATGCCTGGGACAGCAGAAAGAGGGGGAGGTGGAACTGGTGGTGGTGGGAGAGGAGCTGCG CCTGGAGGTGGTTCTCGGAGGCTAACAACAACTGATGCCTTGAGCTATCTCAAGGAGGTT AAGGACATGTTTCAAAATCAAAGGGAAAAATATGACATGTTCCTTGAAATCATGATAGAT TTCATGGCGCAAAGAACCAACACTGCTGGTGTCATTGCAAGGGTGAAGGAGTTATTTAAA GGACATAATAACTTAATTTTTGGATTCAACACCTTTCTGCCGAAAGGATATGAAATAACT CTTGATGAGGAGCATGAACCTCCATCAAAGAAAACATTAGAATCTGAAGAAGCAATTAAT TTTGTAGACAAGATAAAGAGACGTTTCCAAAATGATGAACATGTCTATAAGTCATTTCTG GAAATTCTGAATATGTATAGGAAGGAGCGCAAGGATATTAATGAAGTCTACCTCGAGGTT GCTACTCTTTTTGAGGACCATCAAGATCTGCTTGAGGAATTTACCAGATTATTTTAA >LITCHI017964.m2 ATGCCTGGGACAGCAGAAAGAGGGGGAGGTGGAACTGGTGGTGGTGGGAGAGGAGCTGCG CCTGGAGGTGGTTCTCGGAGGCTAACAACAACTGATGCCTTGAGCTATCTCAAGGAGGTT AAGGACATGTTTCAAAATCAAAGGGAAAAATATGACATGTTCCTTGAAATCATGATAGAT TTCATGGCGCAAAGAACCAACACTGCTGGTGTCATTGCAAGGGTGAAGGAGTTATTTAAA GGACATAATAACTTAATTTTTGGATTCAACACCTTTCTGCCGAAAGGATATGAAATAACT CTTGATGAGGAGCATGAACCTCCATCAAAGAAAACATTAGAATCTGAAGAAGCAATTAAT TTTGTAGACAAGATAAAGGTGAAAAGCTTTGTCTTAGTCTCTTATTTTAAGGTGAAAAAT ATTGGTTGTACAGTTTTTGAATGA
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>LITCHI010237.m1 MVSKDSPQNSDSSMLHQFIISDSITGQNQFQNQHFDAYGSALRGNNTYPQSPGLLPSIQS LGERMSRSMDLVQAPGVAEESEISHTRHLMDLLGASNESNHQSQRLSLSLGSHMLVPPVH YKQRSFSSNISSANYLYCGGDTAREVNHPGMEHVSDDYSFTGGTFTSSSTSLNRSCSTDG TDFFATAVGNSRFLRPTQSLLEEVVNVGGRNIDFSDDRYFGKLHHHSRRGGLRFSYELKA ELCSSGILSANEHELQMKIAKLISLLEEVEGKYEKYYHRMEEVISSFEVIAGLGAAKSYT ALALQAMSRHFGSLRDAIMSQINVTTKRVSHDLPKVSSGLSQLTLFDRETRHNRMSLQQL GMFQTQRQVWRPIRGLPETSVAILRSWLFEHFLHPYPNDSEKLMLASQTGLTKNQVSNWF INARVRLWKPMIEEMYKEEFADSSEDSNPSLASSSNTREGIADHAED.
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>LITCHI010237.m1 ATGGTTTCAAAAGACTCACCCCAAAATTCAGATTCAAGTATGCTACACCAATTCATCATC TCAGACTCAATTACTGGTCAGAATCAATTTCAAAACCAACATTTTGATGCATATGGATCT GCTTTGAGGGGCAATAACACATATCCTCAGTCTCCTGGTTTGTTGCCAAGCATTCAGTCT CTTGGGGAAAGGATGTCAAGATCAATGGACCTAGTTCAAGCTCCTGGTGTAGCAGAGGAA TCTGAGATCAGTCACACTAGACACTTGATGGACCTCCTTGGAGCATCAAATGAGAGTAAC CATCAATCCCAGAGGCTCTCCCTATCTCTTGGCTCTCACATGCTTGTCCCTCCAGTCCAC TACAAGCAAAGGTCCTTTAGTTCAAATATTTCAAGTGCCAATTACTTATATTGTGGGGGT GACACCGCTAGGGAAGTCAATCATCCAGGAATGGAGCATGTAAGTGATGACTACTCATTC ACAGGTGGCACGTTTACGTCATCCTCGACCTCGCTAAATCGTTCTTGCTCCACTGATGGA ACAGATTTCTTTGCCACTGCTGTAGGAAATTCAAGATTTCTAAGACCAACACAGTCCCTA TTAGAAGAAGTTGTTAATGTTGGTGGCAGGAACATTGACTTTAGTGATGATAGATATTTC GGAAAGTTACATCATCATAGCAGAAGAGGGGGCTTGAGATTCTCATATGAATTGAAAGCA GAACTGTGCAGTTCTGGGATATTATCTGCGAATGAACACGAACTTCAAATGAAAATTGCA AAGCTTATATCATTATTGGAAGAGGTTGAGGGCAAATATGAGAAATACTACCATCGAATG GAGGAAGTGATATCATCATTTGAAGTGATAGCAGGCTTAGGTGCAGCCAAGTCTTACACT GCCTTGGCACTCCAAGCCATGTCCAGGCATTTTGGCAGCTTAAGAGATGCCATTATGTCA CAAATCAATGTGACAACCAAAAGAGTTTCGCATGATTTACCTAAAGTCAGCTCAGGGTTG TCACAACTTACTTTGTTTGATAGGGAGACTAGACATAATAGAATGTCACTTCAACAACTG GGCATGTTCCAAACACAACGACAAGTATGGAGACCAATCAGGGGTCTGCCCGAGACTTCT GTGGCAATCCTTCGCTCTTGGCTCTTTGAACACTTTCTCCATCCTTATCCTAATGATTCC GAAAAGCTAATGTTGGCATCACAGACAGGCCTAACCAAGAACCAAGTGTCAAATTGGTTC ATTAATGCACGAGTTCGACTCTGGAAGCCTATGATAGAAGAAATGTACAAGGAGGAGTTT GCAGACTCATCGGAGGACTCGAATCCATCACTAGCCAGCAGTTCAAATACAAGGGAAGGT ATAGCAGATCATGCAGAAGACTGAAAAAGGAACACATCAGTTTAAACTAACTAGTGTTTT GATAGCTTAGTGAGCTTGTGTTTGTTAGTTCCTTTCAAAGTCTTTCTGAGATGTAACTCT AGTGAAGTAAACTGATTGTAACCTTGAAATGGTTAGATGTTTTCAGGATTCATTGAGATA GCCCAAATTCCTGAAATTAAATCTACTCTATTGTTGAATTAGTCAATCTTGTTTTGGAAG GGTTGATGGTAAGTTCATGATTGTCAACATGCATTGATTGATTTGAGACGGACCTTCTTG TGATCAATCTCGAAAGTCAAAATTGTGATTTTCCTGATCTCATTATGGGATTATTACAAA TTTAACAGTTA
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>LITCHI010237.m1 - Up_Stream_Len 2000 ATGTACATATGTACTTGATGATCCCAAGTGGTGATCACATTGACCAATCTAAAGATTATA ATGATCAAGGGTATTTTAAAACATTTGTTCTTATATATTTATTTTGGCTGAATTTTCCTT TTTGCAACATCATTGCTTGGAATGATTTCACTATAAATCTCGAACCAAACAATGAGCTAT ACACCAGCACACAGAAGGATCAATTGATTCAAAACAGGGCTATAGATTTAGTAGACTGAG AATTAATTGATTCAACTTTCTGGCATGCTTTTTATATGTTTCTTTAGATTTGACTGTTTG TTAACAATTTTCTCTCGCTGCCTCCAACTTTTTTTCTGCCCCCAACTTTTTTTTTGTTTT TGATTCTGAGCTAAGTTATCATGCCAAGGTGATATTCAAGAGGAGCAGACAAGGCTTGGC AGGATATTTTTCCAATTTAAAATTAGACTGTCATAGTTCAGATTATGCAGACCAGACACT TGAATCTATGACATGTGTTGTGGGCCTTTCAGGGCTTAACAAGCAACAAAGTTCACAAAA CCAGAGAGTGACAACTGGAGGAGGCCAAAAGGAACAGATATGGCAATCATTACTTAAAGC ATCCAAGCAGAACAACACAAAAAAAAAAAAAAAACCCACCTAGAATCAATCTAATCAGCA ATCCAAAAACCAAAATCAGAACACCACCCCCAATTTTTTTTTTTTCTTTTTTCTCTCTTC AGGATTATTTTATTTTGCTTACAAAGAAGCAATTGATTAATTTTTCTCCTCGTTCTTGGT AGATTGTGACATTCAGTGTCCTTTCAACATCTCTATGCATGTGCACAAGCACCTAACAGC AAAAAGTTAGATATTCCCTTGTGTCTGCAGGGGCACAAGTAGACAATCTTAAAACTGGGA GTGTGAAAAAGATAGCCCACTTTTACAGATAACACAGCAGCAGCAACCACAGTGAACAGA ACAATTTAACTTTTTAAAGGCTAAGGGGCTCTTTCTCCTGTGACAAGAGAGAGAGGGAGA TTTTTTACACTGTTTTAGTGGGAAAGTACTTTTGAGTCTCCCAAAGAAATGTAACAGCTG ACATTAAAGCTGAAGGGGTTGATGCTTTTGTTTCTTGTTTTATAGTCAAGAGAAGTTTTG GGACCATCTTAACCTGTCATTATCTGATTTCTACTTGGCCAATTAGCTTTTTCTTCTTTG GAGAAGTAGCAGAGGTCTATGTCTCTAGGTGTTATAGCTTTTGGCTGCTTAGTTTAGACC CGCAATTTTTTTTTTTTTTTTTCACATAGATTGAGAGAGAGAGGAGACAGAAAGTCATTG CCTTTCTCTTTAAATTATTTCCAGCAATGGCATGTTGGCACTCAAAGACTGGTGCTTTCT TTTGCTTGCTTTGGCTTTCATCTCTTATGCTTACTAAAGACAGAATGCAATCCATTTTAG CTTTTAATGGGGTCTTTTGAACTTTGTTAGTTCACCAAACCTGTCAATCAGGTTCAGGGG TTGGAGCTACTTGGCAATTACATCTTAGTATATGTCTTGTTTTCAGTTGTCTTAGTCTAG TACTTTCTTTTTAATTCTTTCTGTTCAACGGTTGGGACCAATTCAAACTCTTTGCATCAA CTCTTTCGTTCTCTGATCAGTTTTCTTTCAATGTCACAATGGTTGTCTCTCTCAAAAGTG CTTTACTTTAAAGGAAAACTTCACAGCTAATTGTCACCACTACTTCAGCTTTCTTGAATG CAAGTTATTACAGGTTTCTCACTTCAGCAGTGTTAGTCCGGACTTCAAGTGGCTTTACTC TTTTTGTTATCATATCACTACTTAGAATTTTATGTTCAAGTGGAATTGTCACTCTTCTCT TTCACTGTCTTTGCTTGATGTTTTGTTCTCTAGAAATGGATGAAACTAAACTATCAGTGT CTTAAATCTGCTCATCAGCATTTATACTTATTTTTTTCCAAGTTTTGAAAAAGACGTCTT GCCTTCTAGCAACTATCACT
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>LITCHI014793.m1 GenomeSequence + ATGGAGAAGAGCAGAAGATCTAGTGACCAATCAGGAGTCATTGTGAAGAATAGGAACTCT TCTGGTTGTTTAATTGTGAGAAAAAAGAGTGAGGATGCCAGTGCAGCTGGTTCTTCGGGT CGGCGAAAGTTTTACCATTCAAAGAAAGAAAAGAAGAGGCCTAGGGTGGTTATGAGTGAT TCTGGTTCAAGTGATGAGCTGTCAATGCTGTCCCGGAGAAGGGTGGGCCCTGAGACTATA AGGGTTTGTAATGGTTTGAGTGGTAGAGAGACGGTCGTGGAGGATGAGCGTGAGTTTGGT GGTAGGAAAAGGGATAGGGTGGAGCGTGTTAGACATAAGGAGGATGGTTTGGTTGGTAGA AATGAAGATAGGAAAAGGAATAGATTAGATGTGTTTGAGTTTGATGAGTATGATGGGGGT GATGCGGAGATGATGATGAGGCAGGATGAGTTGGGGGATAGTAGAGTGGACTTTGCAAGG AGAAGGTTTTTGGGCTCAACGCATTTCGGAAGAAGTGGGATTGAGAGGGAATTTGAGAGT AGTTCAAGTAGGCAAGTTGCTGATAAGAGAAAGAAATTGTATTTTGAGAGAACAGGTAGC TTTAATCAAGGTGGCATGAACAGGTTTGGGATGGACAGGGAATCTGGTCGGATACCTATA CCATTGTTGAGGGAGAAGTATATGGGGGATTCAGATGAACCCATTAGGCTTCAGGGGAAA AATGGGGTTTTAAAGGTGATGGTTAACAAGAAGAAAAAGGTGGGTGAGCCTGTGAAGAAG TATGATCGCATGGACGTTGAGGAAAACCGAAGTGCATCCAGAGCTGAAGATAGTCTTAAA AGGGATATTTCAATCCATCCACCGCCATTCTTAGAAGCAGAAGTTCTTGAGAAACCTAGT TCTGTTGGTAGGACACAGAAACACCGGGTTAATATGCATAAATCTCTGTCAGCTAAGAAA AGTAAGGATGAGGACTCTGATTCAGATGATAGTGATACTGCATTGAAGCTGGGTCCAAAA AGAATGGGAGATAGTAAATCTATGAAAGAGGTTAGTTCTGAAAACGAAAAAACACCTGGT GGAAAGCTTACATCGTCCAAAATCAAAGAAGGAAAAGTTAGGCGGGGCAGTGGCACAGAA AAGCAAAAATTACGCGAACGGATTCGGGGTATGCTTGTGGATGCAGGCTGGAAAATAGAT TACAGACCTAGAAAGAACAGAGATTACCTTGATGCAGTGTACATTAACCCCAGCGGAACA GCTTACTGGTCGATCATTAAGGCATATGATGCACTTCTGAAGCAATTAAATGAAGACGAA GATGAGGCCAAAGCTAGTGGTGACGATACTCCATTCACACCTTTATCCGATGAAGTACTC AGCCAATTAACCAGAAAAACACGAAAGAAGATGGAGAAAGAGATGAAAAGGAAGCAAAGA GATGTCAGTCACAGTGCAAATGTCAGAGAAGCTGCTGCTAGAAGGTCCTCAAGTACCAGG CATGCTGAGGGGAGTAAGGACAGCCATGAAGAGAAACTAAGTTCATTCTTGAAGCAGGGT GGCAAATCATCAAAGAATAAAATGAATGAAAATGGTGTTGTCAGCCAGAACTTCAAAGGT CAGAGTTCTCATCATTGTCAAGATAGTGAAAGACCATCTTCTGCTTCTGCTTTGCATGGA AGGAAAAGTAGAAAACTTGGCAGATGTACATTGTTGGTTCGTGGTTCTAATGATGGCCCA AATTCAGAGTCTGATGGCTTTGTTCCATATTCTGGAAAGCGTACACTGCTTTCTTGGCTG ATCGATTGTGGGGCTGTGCAGCTGAGCCAGAAGGTGCAGTATATGAATCGTAGAAGAACA 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TTCTCTTCGGCCACCTGCCCATGATATATATATATATATATATCATCTGTTGAGTTTGCT GACTACTAAGGTTGTAAGGTTCAATAGTATGCCCCAATTTAAAACCCAATGAAATAAAGA ATGGGTGAGGGGTTTCTATGTATCATAAGAAAAAAGTTAGGCTACCTGCACTATACTTCT GTCATTACAAATCATATGCACAGGGTTTCATGTGTGTCATTTGATGATTTGATCTAGGTT AATGTTGCTAGGATGAGGATACTTTTGCAATCAATTCCTTGTTTCTTATTAAAAAATATG ACGGTTGGATTCTCCCACGAAAGCAGGGAAACAATATGATCAGCTGACCCAAGAGAGCGG ATCAGACTGTGTCATTTGTGAAATGGTGTTTTTATGTAATAGATTTGCTGTGTCACTATG TATTCGTATGATATTTGTTGTTAACTACAACCTTTTACTCCTTAAGCACATAAGGTATTT AGAATTTCATTGTTTTATAGATGCTCCCTGCTGGTGATTGGCGCTGTCCAAATTGTACTT GCAAATTTTGTGGGGTAGCTGTTGAGAATGTTGACGAAGGGGATGATACAACTGCCTCCG AGCTACCTACTTGCAGCATGTGTGAGAAAAAATGTATCATTCTCTTGGTCTTTCATTTCT TTATGTTTATGTATATAATTTGCTCTGCTTGCCTCTCTAACTATTGCTAAGATTCTGATT GAAATTTGCATGTTTTTCTCCTGCAGACCATATATTGTGCGTGCAGGAAACTGATGCTCT TCCTGTTGATTCGAACAGTTCAGTCCCTTCCTTTTGTGGGCAGAAATGCAGAGAGGTATA CCATTTTCCTCTTACCCAGAATTTAGTGTTTCTTGCTGCATTCTTCTGGTTGACATCTTT GCTGGAAAAATGCTATCTGGAAAAATGCTATCTTCTTATCTGTTTTTTTATTGTGTTGAA 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