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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI017890 | Chr15 | 520943;522451 | 527193 | + | FACT complex subunit SSRP1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI017890.m1 | 7 | 98 | PF17292.5 | POB3_N | Domain | 79.8 | 1.70E-22 |
| LITCHI017890.m1 | 106 | 174 | PF03531.17 | SSrecog | Domain | 87.5 | 4.80E-25 |
| LITCHI017890.m1 | 350 | 439 | PF08512.15 | Rtt106 | Domain | 71.4 | 6.60E-20 |
| LITCHI017890.m1 | 556 | 624 | PF09011.13 | HMG_box_2 | Domain | 60.7 | 1.70E-16 |
| LITCHI017890.m1 | 559 | 627 | PF00505.22 | HMG_box | Domain | 77.1 | 1.10E-21 |
| LITCHI017890.m2 | 7 | 98 | PF17292.5 | POB3_N | Domain | 80 | 1.50E-22 |
| LITCHI017890.m2 | 106 | 174 | PF03531.17 | SSrecog | Domain | 87.6 | 4.30E-25 |
| LITCHI017890.m2 | 350 | 439 | PF08512.15 | Rtt106 | Domain | 71.6 | 5.80E-20 |
| LITCHI017890.m3 | 7 | 98 | PF17292.5 | POB3_N | Domain | 80 | 1.50E-22 |
| LITCHI017890.m3 | 106 | 174 | PF03531.17 | SSrecog | Domain | 87.6 | 4.30E-25 |
| LITCHI017890.m3 | 350 | 439 | PF08512.15 | Rtt106 | Domain | 71.6 | 5.80E-20 |
| LITCHI017890.m4 | 2 | 57 | PF03531.17 | SSrecog | Domain | 65.7 | 3.00E-18 |
| LITCHI017890.m4 | 233 | 322 | PF08512.15 | Rtt106 | Domain | 71.9 | 4.80E-20 |
| LITCHI017890.m4 | 439 | 507 | PF09011.13 | HMG_box_2 | Domain | 61.1 | 1.30E-16 |
| LITCHI017890.m4 | 442 | 510 | PF00505.22 | HMG_box | Domain | 77.5 | 8.60E-22 |
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>LITCHI017890.m1 ATGACGGACGGCCACCTCTTTAACAACATCTCTCTCGGCGGCCGCGGCGGCACCAATTCT GGACAGCTTAAAATTTATTCAGGAGGAATTTTATGGAAGAAGCAGGGAGGTGGCAAAGCT GTTGAGGTTGATAAAGCTGACATTGCAGGGATTACGTGGATGAAGGTTCCGAGGACAAAT CAACTTGGAGTTCGAAGCAAAGATGGTTTGTACTACAAGTTCACTGGATTCCGTGACCCG GATGTGGCTAGTTTGACCAATTTTTTCCAGAACAATTGTGGTATAACACCAGAGGAGAAA CAGCTTTCTGTCAGTGGGCGTAATTGGGGAGAAGTTGATTTAAATGGGAATATGCTGACT TTTTTGGTTGGTCAAAAGCAAGCTTTTGAAGTGTCTTTAGCGGATGTCTCACAAACACAG ATGCAAGGAAAAAATGATGTCATTTTGGAGTTCCATGTTGATGACACAACTGGAGCTAAT GAGAAAGACTCACTGATGGAGATAAGTTTTCACATACCGAATTCTAATACTCAATTTGTT GGTGATGAGAATCATCCGCCAGCTCAAGTTTTTCGTGATAAAATTACTTCAATGGCTGAT GTTGGTGTTGGAGGTGAAGATGCTGTCGTTACATTTGAGGGTATTGCAATCCTCACACCA AGGGGTCGGTATAGTGTTGAACTTCATCTATCATTTTTAAGGCTACAAGGGCAGGCTAAT GATTTCAAGATTCAGTACAGCAGTGTTGTTCGCCTTTTCTTACTTCCTAAGTCGAACCAG CCTCATACCTTTGTTATTGTTACTCTTGATCCCCCTATTCGTAAAGGCCAAACCCTGTAT CCGCATATCGTGTTGCAGTTTGAAACTGATTATGTGGTTCAAAGTGAGTTGTCAATGAGT GAAGATCTTTTGAATACGAAGTACAAAGACAAGTTGGAACAATCATATAAGGGACTTATC 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>LITCHI017890.m2 ATGACGGACGGCCACCTCTTTAACAACATCTCTCTCGGCGGCCGCGGCGGCACCAATTCT GGACAGCTTAAAATTTATTCAGGAGGAATTTTATGGAAGAAGCAGGGAGGTGGCAAAGCT GTTGAGGTTGATAAAGCTGACATTGCAGGGATTACGTGGATGAAGGTTCCGAGGACAAAT CAACTTGGAGTTCGAAGCAAAGATGGTTTGTACTACAAGTTCACTGGATTCCGTGACCCG GATGTGGCTAGTTTGACCAATTTTTTCCAGAACAATTGTGGTATAACACCAGAGGAGAAA CAGCTTTCTGTCAGTGGGCGTAATTGGGGAGAAGTTGATTTAAATGGGAATATGCTGACT TTTTTGGTTGGTCAAAAGCAAGCTTTTGAAGTGTCTTTAGCGGATGTCTCACAAACACAG ATGCAAGGAAAAAATGATGTCATTTTGGAGTTCCATGTTGATGACACAACTGGAGCTAAT GAGAAAGACTCACTGATGGAGATAAGTTTTCACATACCGAATTCTAATACTCAATTTGTT GGTGATGAGAATCATCCGCCAGCTCAAGTTTTTCGTGATAAAATTACTTCAATGGCTGAT GTTGGTGTTGGAGGTGAAGATGCTGTCGTTACATTTGAGGGTATTGCAATCCTCACACCA AGGGGTCGGTATAGTGTTGAACTTCATCTATCATTTTTAAGGCTACAAGGGCAGGCTAAT GATTTCAAGATTCAGTACAGCAGTGTTGTTCGCCTTTTCTTACTTCCTAAGTCGAACCAG CCTCATACCTTTGTTATTGTTACTCTTGATCCCCCTATTCGTAAAGGCCAAACCCTGTAT CCGCATATCGTGTTGCAGTTTGAAACTGATTATGTGGTTCAAAGTGAGTTGTCAATGAGT GAAGATCTTTTGAATACGAAGTACAAAGACAAGTTGGAACAATCATATAAGGGACTTATC CATGAAGTTTTTACCACAATATTGCGTGGTTTATCTGGTGCCAAAGTTACCAAACCAGGA AAATTCCGTAGTGCTCAAGACGGTTATGCAGTGAAGTCTTCATTGAAAGCTGAAGATGGT GTCCTGTATCCTCTTGAGAAGAGCTTCTTCTTTTTGCCCAAACCCCCTACCCTTATCCTT CATGAGGAGATCGACTATGTGGAGTTTGAGAGGCATGCTGCTGGAGGTTCAAACATGCAT TACTTTGATCTTCTTATCAGACTTAAAACTGAACAAGAACATTTGTTTAGAAACATCCAG AGAAATGAATATCACAATCTTTTTGACTTCATCAGTGGGAAGGGCTTGAAAATTATGAAC CTTGGAGATATAAATCCCACAAATGGTGTGACTGCAGTTCTTCAGGATGAGGATGATGAT GCTGTTGATCCTCATCTTGAGCGTATTAAGAATGAAGCTGGTGGTGATGAGAGTGACGAA GAGGACGAAGATTTTGTCCTAGATAAGGATGATGAAGGATCTCCAACTGATGATTCTGGG GAGGATGATTCTGATGCTAGTGAAAGTGGAGAAGAGAAAGAGAAACCTTCAAAGAAGGAA TTTAAGAAAGAGCCTTCATCTTCAAAAGCATCTACCTTGAAGAAGAAATCCAGAGATGCT GATGATGATGGTTCAAAGAAGAAAAAACAGAAAAAGAAGAAGGATCCAAATGCACCAAAG AGGGCCATGTCTGGTTTCATGTTTTTCTCTCAAATGGAAAGAGAGGTTGGTTTCGTGTCT ACGGTTACAGTCCATTGGTTATTACTCCATTATGATTTTCATAGATGA >LITCHI017890.m3 ATGACGGACGGCCACCTCTTTAACAACATCTCTCTCGGCGGCCGCGGCGGCACCAATTCT GGACAGCTTAAAATTTATTCAGGAGGAATTTTATGGAAGAAGCAGGGAGGTGGCAAAGCT 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