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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI017729 | Chr1 | 48799680;48805163 | 48810488 | - | Receptor-like protein kinase HSL1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI017729.m1 | 33 | 69 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 21.9 | 0.00017 |
| LITCHI017729.m1 | 121 | 142 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.3 | 1 |
| LITCHI017729.m1 | 289 | 348 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 27.5 | 2.10E-06 |
| LITCHI017729.m1 | 289 | 311 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 11.8 | 0.33 |
| LITCHI017729.m1 | 527 | 585 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 29.1 | 6.80E-07 |
| LITCHI017729.m1 | 527 | 549 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.5 | 0.87 |
| LITCHI017729.m1 | 527 | 542 | PF13516.9 | LRR_6 | Repeat | 10.3 | 0.67 |
| LITCHI017729.m1 | 574 | 595 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.5 | 0.86 |
| LITCHI017729.m1 | 693 | 970 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 160.9 | 4.20E-47 |
| LITCHI017729.m1 | 693 | 972 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 147 | 6.50E-43 |
| LITCHI017729.m2 | 33 | 69 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 22.1 | 0.00015 |
| LITCHI017729.m2 | 121 | 142 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.5 | 0.87 |
| LITCHI017729.m2 | 289 | 348 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 27.7 | 1.80E-06 |
| LITCHI017729.m2 | 289 | 311 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 12 | 0.28 |
| LITCHI017729.m2 | 527 | 585 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 29.3 | 5.70E-07 |
| LITCHI017729.m2 | 527 | 549 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.7 | 0.73 |
| LITCHI017729.m2 | 527 | 542 | PF13516.9 | LRR_6 | Repeat | 10.6 | 0.57 |
| LITCHI017729.m2 | 574 | 595 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.7 | 0.73 |
| LITCHI017729.m2 | 693 | 875 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 122.4 | 2.20E-35 |
| LITCHI017729.m2 | 693 | 868 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 101.5 | 4.90E-29 |
| LITCHI017729.m3 | 33 | 69 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 21.9 | 0.00017 |
| LITCHI017729.m3 | 121 | 142 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.3 | 1 |
| LITCHI017729.m3 | 289 | 348 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 27.5 | 2.10E-06 |
| LITCHI017729.m3 | 289 | 311 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 11.8 | 0.33 |
| LITCHI017729.m3 | 527 | 585 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 29.1 | 6.80E-07 |
| LITCHI017729.m3 | 527 | 549 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.5 | 0.87 |
| LITCHI017729.m3 | 527 | 542 | PF13516.9 | LRR_6 | Repeat | 10.3 | 0.67 |
| LITCHI017729.m3 | 574 | 595 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.5 | 0.86 |
| LITCHI017729.m3 | 693 | 970 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 160.9 | 4.20E-47 |
| LITCHI017729.m3 | 693 | 972 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 147 | 6.50E-43 |
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>LITCHI017729.m1 ATGTCAAAAATATCCATAACATCTCTACCAATCCTACTCTACCCCACTCTTCTACTGCTC TTCCTCAGCCATGCAAACTCCCAACTCTACGATGAAGAACATGCAATCCTGCTCAAACTA AAGAAGGAATGGCATGATCCACCACTTATCAACCACTGGACTGCATCAAACTCCACCTCC CACTGCTTCTGGCCTGAGATTACCTGCACAGACAATTCCATCACCGGAATAAAGCTCATC GACATGAACATCACCGAAACAATCCCACCCTTCATTTGTGACCTCAAGAACCTATCCTGG CTAGACCTTCAATACAACTATATTCCTGGCCAATTCCCAAAAGTTCTCTACAAGTGTTCT AAGCTAGAGCACCTGGACCTCTCTCAGAACTACTTTGTTGGTCCAATTCCAGATGATATC GATCGCTTGTCTCGGCTCTTGTACCTCAGTCTTGGGGCCAATAACTTTTCTGACATTCCG GCTAGTATCGGGCGATTGACAGAGCTCAGGGAACTCTGGCTTTACCAGAATCAGTTTAAC GGTTCTTTCCCACCTGAAATTGGCAACTTGTACAATCTTGAAACCTTAGAATTGGCATAT AATACAGAAGTTGTGCCATCAAGGTTTCCTTCAAGTTTCACACAGCTGAAAAAACTCAAG ACTCTGTGGATGTCTGCAACGAATTTGATCGGTGAAATCCCTGAAGCCGTTGGCAATATG GCAGCGATTGAGTTCTTGGATTTATCAACAAACACCTTGACTGGGGAAATTCCCAGCAGT TTGTTCACGTTGAAGAATTTGAGTGAATTGTATCTTTTCAAAAACAAGTTATCTGGAGAG ATTCCTCGGGTTGTGGAATCTTTGAAGCTGAAACAGATTGATCTCTCACAGAACAACTTG ACCGGGACAATACCAAACGGTTTCGGGAAGCTAGCAAATTTGACAACCTTGAGTTTGATG 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>LITCHI021855.m1 MSLIDHPNVIRAYCSFVVDSNLWVVMPFMAEGSCLHLMKIAYQDGFEEAAIGSILKETLK ALDYLHRQGHIHRDVKAGNILLDSNGVVKLADFGVSACMFDTGDRQRARNTFVGTPCWMA PEVLQPGSGYNSKADIWSFGITALELAHGHAPFSKYPPMKVLLMTIQNAPPGLDYDRDKK FSKRISSCDQSFKEMVAMCLVKDQTKRPTAEKLLKHSFFKHAKPPELSVKKLFDDLPPLW SRVKQLQLKDAAQLALKKMPSAEQEAISQSEYQRGVSAWNFDIEDLKAQASLVRDDDDMP ETREDDDSTKEFVADKVAAADSKLTFGKSNANVELYRFECKGKSDQPQQSECLNREGKIL EVDSLESGIQEKVVLKKSGSSTEAMASTSEKDLMPAKVKTVKTRQTQSGPLMPGVVLSHS ASERGRSSDRFENDNQPIDKAKSDVRRAPSFSGPLMLPNRASANSLSAPIKSSGGYRDSM DDKSKANLVQIKGRFSVTSENLDLAKDIPLSSVPRRSQGSPLRKSASVGDWIFESKPSPP NQPPTEMSNGNMPPSLLMPHLQSLLQQTSLQQDLIQSLLNSLQPAEAVDASQNGKLPPLP RCPENNGSILCLSWLSSTSNFLLSDLHIWQVETVASERERSLLLKISELQSRMINLNDEL TAEKSKYIQLIDAAQLALLKKAFSKLYQVSLKNGEDNVKEAKGKPELVLSALTSTPILLE DIRADDTWPGLRLHEVSLLRLIERVSDDRLIEINETGTKLKYKPGTVIGGKNLVHDCGVS RSIGYFLEPLILLSLFAKKPLSIRLKGITNDFKDPCVNTFRSTTFPMLKRFGVLSEGLEL KIESRGAPPLGGGEVILTVPTVENCALQAVTWLSEGMVKRIRGVTFSSRVSAQFENAMIC AVCGIFNCLLPDVHIFTDHKSGPQAGKHSSSNKEKLFHGRSPGYGISLVAETTSGCYISA DTAVSYALGEVCEIEDEEKKELTPPSEDVGKRIASFLLEQIELGGVVDLTRQGLLFLLCA LSELDVSKVLLGKLLPYAIETLRSIRDFLGGRFDIKEDPSTGIVICLCMGCGCKNLSGKV S.
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