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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI017720 | Chr1 | 48692242 | 48701027 | + | Serine/threonine-protein kinase VPS15 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI017720.m1 | 28 | 241 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 26.4 | 4.00E-06 |
LITCHI017720.m1 | 29 | 292 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 73.1 | 2.50E-20 |
LITCHI017720.m1 | 531 | 559 | PF02985.25 | HEAT | Repeat | 19.4 | 0.00095 |
LITCHI017720.m1 | 1123 | 1159 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 26.7 | 7.40E-06 |
LITCHI017720.m2 | 28 | 241 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 26.5 | 3.80E-06 |
LITCHI017720.m2 | 29 | 292 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 73.2 | 2.30E-20 |
LITCHI017720.m2 | 531 | 559 | PF02985.25 | HEAT | Repeat | 19.4 | 0.0009 |
LITCHI017720.m2 | 1123 | 1159 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 26.8 | 7.00E-06 |
LITCHI017720.m3 | 28 | 241 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 26.5 | 3.80E-06 |
LITCHI017720.m3 | 29 | 292 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 73.2 | 2.30E-20 |
LITCHI017720.m3 | 531 | 559 | PF02985.25 | HEAT | Repeat | 19.4 | 0.0009 |
LITCHI017720.m3 | 1123 | 1159 | PF00400.35 | WD40 | Repeat | 26.8 | 7.00E-06 |
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>LITCHI017720.m1 ATGGGGAACAAGATCGCGCGAACGACGCAAGTATCGGCGACGGAGTACTACCTGCACGAC CTTCCGTCGTCATACAATCTGGTGCTGAAGGAGGTGCTTGGGCGTGGCCGCTTCTTCAAG TCTATTCTCTGCAAGCACGACGAAGGTTTGGTCCTCGTCAAGGTCTATTTCAAGCGAGGC GACTACATCGATCTCAGAGAGTACGAGCGACGTCTCTTTCACATCAAGGACACCTTCCGT GCTCTCGATCATCCTCACGTCTGGCCCTTCCAGTTTTGGCAAGAAACGGATAAAGCTGCT TACCTTTTGCGGCAATATTTCTTTAATAATCTTCATGATCGTTTGAGTACGCGCCCTTTT CTTAGTCTTGTGGAGAAGAAGTGGTTGGCTTTTCAGTTACTTCTTGCAGTAAGTCAGTGC CATGAGAAAGGGATCTGTCATGGCGATATTAAGTGTGAGAATGTGCTAGTCACTTCTTGG AATTGGCTTTATCTTGCTGACTTTGCATCATATAAACCCACATACATTCCGTATGATGAC CCTTCTGATTTCTCATTCTTCTTTGACACTGGAGGAAGACGACTCTGTTATCTTGCGCCT GAGAGATTTTATGAGCATGGAGGTGAAATGCAAGTTGCACAGGAGGTGCCTTTAAAGCCA TCTATGGACATCTTTGCTGTAGGGTGTGTAATTGCAGAGCTTTTTCTTGAGGGTCAGCCA CTCTTTGAACTCTCTCAGCTTCTTGCTTATCGTAGAGGACAATATGATCCAAGCCAACAT CTTGAAAAGATCCCAGATACTGGAATCCGCAAGATGGTGCTTCATATGATTCAACTGGAG CCGGAGTTGCGATTTTCTGCTGAAAACTACCTGCAGAATTATGCTGCTCTTGTATTTCCA ACTTATTTCTCTCCGTTTTTGCATAATTTCTACTGCTGCTGGAATCCTCTTCATTCTGAT 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CCCGGTTTTATGTCCCAACAGGTTAGTGGTGTGAAAAGCCTCGTAAGTGATAAATCATCA GAAGGAATACCTTTGTACTCCTTTAGCATGGACAAGCAAGCAGTGGGAACTCCTCCTGTG GCTTCTGATTCTTCATTGCAAGTTAACTCCCTAGCAATCAGTTCATCATCCATGCCTTGG ATGGATCCATTTAATAAATCCTTTAGTTTGGCCAGTTCAGTTCCTGCACCTAAGTTCGTG TCAGGTTCTTACAGCATCAGTAATGGTTCTAAACAGTTCTATAGAGTGGTACATGAACCA GAAGGGAGGGAGAATGATCAGTCAGCCTATGTAAATAGTAAATTTCAGGAGATTGGGATA TCTGGTACAATGAAAGGAAGTTCTGTTGCTGTGGAAGATGCTTCCACTCCTGCTAATCTT ACAGGTTTGCCAACTTTTGCTAGAACCTCAACAATTCCAGATTCAGGCTGGAGACCTCGT GGGGTGTTGGTTGCCCACCTCCAAGAGCATCGTTCTGCTGTCAATGATATTGCAGTTTCT AATGATCACAACGTTTTTGTCAGTGCATCTGATGATTCCACTGTCAAGGTGTGGGATTCA AGAAAGTTGGAAAAGGACATTTCATTTAGATCTAAGCTAACGTATCACCTGGAGGGAAGT CGAGCATTGTGCAGTATTATGCTGCGTAATTCTGTGCAAGTTGTTGTTGGAGCATGTGAT GGCATTATACATATGTTCTCTGTGGATCACATCTCCAAAGGTCAGGGTAATGTTGTTGAA AAGTATTCAGGTATTGCTGATATCAAAAAGAAGGATACCAAGGAAGGTGCCATAGTTAGC CTTGTGAACTACAATGCAGATAATTGTGTCAGTCAAATGTTTATGTACAGCAACCAAAAT TGTGGGATCCATCTATGGGATACAAGATCAAATTCAAATGCATGGACATTAAAAGCAATT 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