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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI017697 | Chr1 | 48449782 | 48452727 | - | Zinc finger CCCH domain-containing protein 49 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI017697.m1 | 136 | 156 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 27.9 | 1.80E-06 |
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>LITCHI017697.m1 ATGATGCTCGGGGAGCCTCACCGTCCGAATCCGACGATCCACGTTCCCCCATGGCCTCCA ATCCTTGAAGATCAAGCGGCTGATATTATGTCTCCTCAGTCAATTAACGGCAATGCCAAC GGCAGCCCTGAGTTTAACAACCCTTACTATCTGCAAGAGGCTCTAGCGGCACTCCAACGT TATCTTCCGTCAAATGATCCGGAGTTGGACTTGGACGGCGACGTGTGCGGACTGGATCCG GACTCCCCTGTGGACGCTTATTCGTGCGACCAATTTCGCATGTTCGAGTTCAAGGTAAGG AAGTGCGCCCGTGGCAGGTCACATGACTGGACTGAGTGTCCGTACGCTCACCCTGGAGAG AAGGCCCGGAGGCGCGACCCGAGGAAGTATCACTATTCGGGTACGGCCTGCCCCGATTTT CGCAAGGGAAGCTGCAAGAAAGGTGACTCTTGCGAGTTCGCTCACGGCGTGTTTGAGTGC TGGCTTCACCCTGCACGTTACCGTACGCAGCCTTGCAAAGATGGTCCCAGCTGCAAGAGA CGGGTCTGTTTCTTCGCTCACACACCTGAGCAGCTGAGAATCTTGCCTCAGCAGAGCCCT AGAAGTGTCGAAGCTTCTTCGAGTGCTAAGTCTCTGCCGTTTTTGTCGTCTCCGGAGTCG GTTTCGCCTCCTATGAGTCCAAGGGCTGAGTCGCCGATGAGTCGGTCGCTTGGGTCGAGT TCGATCAGTGAGATGGTTGCTTCTTTGAGGAACCTCCAGTTGGGTAAGGTAAAATCTTTG CCATCGTCATGGAATAAACAGCTAGTTTGTTCTTCCGGGTACGGGTCTCCGCGTGGGTCG GTTCTTCGACCTGGATTTTGTAGTCTGCCTTCTACGCCAACCAAGACCCCATCTCGACCC GGCATCGGGTACTTGGATATTTTTGACGAGTGTTGTGAGGAGGAGCCAGTGATGGAGAGA GTCGAGTCCGGGAGGGGCTTGAGAGCAAAAATGTTCGAAAAACTGAGCAAGGAGAATTCT GTTGATCGGGCCGATCCGACACAGACAAGCGGGGCTCCGGATGTGGGCTGGGTATCGGAC CTTGTAAATGAAATGAAATGA
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>LITCHI024703.m1 MAMVMAQQQRESSSGSINKHQLDNGKYVRYTAEQVEALERVYTECPKPSSLRRQQLIREC PILSNIEPKQIKVWFQNRRCREKQRKEASRLQTVNRKLSAMNKLLMEENDRLQKQVSQLV CENGYMRQQLHTPPAGTDASCDSVVTTPQHSLRDATNPAGLLSIAEETLAEFLSKATGTA VDWVQMPGMKPGPDSVGIFAISQSCSGVAARACGLVSLEPTKIAEILKDRPSWFRDCRSL EVFTMFPAGNAGTIELIYTQVYAPTTLAPARDFWTLRYTTSLDNGSLVVCERSLSGSGAG PNPAAAAQFVRAEMLPSGYLIRPCEGGGSIIHIVDHLNLEPWSVPEVLRPLYESSKVVAQ KMTIAALRYIRQIAQETSGEVVYGLGRQPAVLRTFSQRLSRGFNDAINGFNDDGWSVVNC GDGAEDVIIAVNSTKSLSTTSNLVNSLSFLGGILCAKASMLLQNVPPAVLVRFLREHRSE WADFNVDAYSAASLKANSYAYPGMRPTRFTGSQIIMPLGHTIEHEELLEVIRLEGHSLAQ EDAFVSRDIHLLQICSGVDENAVGSCAELIFAPIDEMFPDDGPLLPSGFRVIPLDSKTVE LTELYLNLTLFFDIIKNVKHVHYYIYVVLQPDTQDTVTANRTLDLTSSLEVGPLTNQGSG DAQSCHSTRSVLTIAFQFPFESNLQDNVATMARQYVRSVISSVQRVAMAISPTGLSPTIG PKLSPGSPEALTLANWICQSYSYYLGAELLRSDSLGGDSLLKHLWHHQDAILCCSLKPLP VFIFANQAGLDMLETTLVALQDITLDKIFDDPGRKSLCADFTKLMQQGFTSLPAGMCMST MGRHVSYEQAVAWKVLAAEENTVHCLAFSFVNWSFV.
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>LITCHI010652.m3 CTAACCTTTCCTTTCTTGAACACAGACTAGGCTCACCTGCTTTCTATTTTCCCTTTCTTT TCTCTCTCTTTCTTCAGAATTTGTTTGTGTAATTGGTGGCTTTTGGGTTGCTGTGGTTGG ACCTAACTCTGCTCCGGTCTCTGAACCAGCACTCCAAGAAGGGAGAAGAAGAATAAGTAG TAGAACAAATCAATGGCGAGAGAGAAGATCAAGATCAAGAAGATTGACAACGTGACGGCC AGGCAAGTCACCTTCTCCAAGCGAAGACGTGGACTTTTCAAGAAAGCCGAAGAGCTTTCT GTTCTCTGCGACGCTGAAGTTGCTCTCATCATCTTCTCAGCTACTGGCAAGCTCTTTGAG TATTCAAGCTCCAGCATGAAGGATATAATTTCAAGGTATAATCTGCACTCAAGTAACCTG GGCAAATTGAACCAACCTTCTCTTGAACTGCAGCTGGAAAATAGCAACCACATGAGATTG AGTAAGGAAGTTGCTGATAAGAGTCAACAACTGAGGCAGATGAGAGGAGAGGATCTTCAA GGATTGAATATAGAGGAATTACAACAACTTGAGAAAATGCTTGAATCAGGACTTAGCCGT GTGATTGAGACTAAGGGTGAACGGATTATCAATGAGATTACAACACTCGAAAGAAAGGGA GTTCAGCTGTTAGAAGAGAACAAGCAACTAAAACAAAGGATGGACATGTTATGCAAGGTA AGAAGAGTCGTCATCATGGAGTCGGATATTGGTATCCAGGAAGAAGGGTTGTCTTCAGAA TCTGCTACCAACGTATGCAGCTGCAGCAGTGGCCCTCCTCTAGAGGATGATAGTTCTGAT ACTTCTCTTAAATTAGGGCTTCCCTTCTCTAGTTGAACTGGGGCACCATACGAGGAATCT ATTGCTGCGTGGAATTGGAGATTTACATTGTGTGTTGTGAAGGAGACATTGGCCACAAGA 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GGCTAGGGTTTCTTCTTCTAAATTTAATAATAAATTAGCAGAAATCCACCCAACTCTTCT TTTTTTACCCTTTTTCCTGGCATTTTATGTTTTTTCTTTCCTTTTACACACACATTTATA GAAACATGTGACCTAATGTTTTAATCCGGGTTCGGTTTCTTCTTTCTTGGAGGGAGAAGA AGAATAAGTAGTAGAACAAATCAATGGCGAGAGAGAAGATCAAGATCAAGAAGATTGACA ACGTGACGGCCAGGCAAGTCACCTTCTCCAAGCGAAGACGTGGACTTTTCAAGAAAGCCG AAGAGCTTTCTGTTCTCTGCGACGCTGAAGTTGCTCTCATCATCTTCTCAGCTACTGGCA AGCTCTTTGAGTATTCAAGCTCCAGCATGAAGGATATAATTTCAAGGTATAATCTGCACT CAAGTAACCTGGGCAAATTGAACCAACCTTCTCTTGAACTGCAGCTGGAAAATAGCAACC ACATGAGATTGAGTAAGGAAGTTGCTGATAAGAGTCAACAACTGAGGCAGATGAGAGGAG AGGATCTTCAAGGATTGAATATAGAGGAATTACAACAACTTGAGAAAATGCTTGAATCAG GACTTAGCCGTGTGATTGAGACTAAGGGTGAACGGATTATCAATGAGATTACAACACTCG AAAGAAAGGGAGTTCAGCTGTTAGAAGAGAACAAGCAACTAAAACAAAGGAAGAGTCGTC ATCATGGAGTCGGATATTGGTATCCAGGAAGAAGGGTTGTCTTCAGAATCTGCTACCAAC GTATGCAGCTGCAGCAGTGGCCCTCCTCTAGAGGATGATAGTTCTGATACTTCTCTTAAA TTAGGGCTTCCCTTCTCTAGTTGAACTGGGGCACCATACGAGGAATCTATTGCTGCGTGG AATTGGAGATTTACATTGTGTGTTGTGAAGGAGACATTGTTTGGGTTTCTCTTAAATCTC 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>LITCHI005334.m2 GenomeSequence + CTAAATGCAAGAGTGTGGCTTCAATTAAGTGACCTAATTATGGGCCATTAGAAGGACACA GTGGGTTTGTCTGAGGCCCATTAACAGCTTCCATTGCAGCGCAGGGGCTGCCACCAACAC GCACTCTCTCTGTTTCTCTGCCACTCTGTGCGTGAAAAATGGATCATCCACCATCATCAT CTCGGCGGCCCCGCAAACCCCCGACGAAATCCGAACTCTACTCCACTGTCATCGTGCACG ACGACGATGACGACGAAGAAGAATACCACGACTACGACTCCGACTCCAAAAACGATCGTT TTTACCCCGCGAGCGATGATCTCCAACACGATGCCATTGGAGACGACTACGACTCCCTCC CTCCTCTCCTCAAACGCCTCCCCAAGGACTTCGGCGGCGCCGCGCCCGTCGACGACGACG ACGATGCCGGAGATTTCGATACAATGATCGTCAAAACCAAGACCAGAACGCAAAACAAGA ACAATCGCAACATATCGTCGTCGGTGATCATAAACAAACCGTTCTTGGATTTTAAGAAGA CGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGACAACTTCGGGACATTTGTGGTTCGATCGGGCGAGAGAG AGTCGGGGACTGTGAGGAGGAGGAGCGGAGGATACGAAGATTCGACGATGGGAAGGGCGG TGGCGAGCATGCAGAGGTTTGGTAGTAACTCTTCGTTGCACGCCGAGGAAGGCAGGCTGC AGAGTAAGGTTTCTACCAGTTCGATTCCGGATAGTGTTACCAGAGAAGATCCAACCACTA AGTACGAATTGCTCAACGAACTCGGTGCGTTTTCTTTCTTTGTTCTCGCATTTGAATTCC ATGTGATGGTTATGGTTAGAAACTGGTTTAGCTGGATAGTATTGTTTCGCATTTGAATGG 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