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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI017697 | Chr1 | 48449782 | 48452727 | - | Zinc finger CCCH domain-containing protein 49 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI017697.m1 | 136 | 156 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 27.9 | 1.80E-06 |
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>LITCHI017697.m1 ATGATGCTCGGGGAGCCTCACCGTCCGAATCCGACGATCCACGTTCCCCCATGGCCTCCA ATCCTTGAAGATCAAGCGGCTGATATTATGTCTCCTCAGTCAATTAACGGCAATGCCAAC GGCAGCCCTGAGTTTAACAACCCTTACTATCTGCAAGAGGCTCTAGCGGCACTCCAACGT TATCTTCCGTCAAATGATCCGGAGTTGGACTTGGACGGCGACGTGTGCGGACTGGATCCG GACTCCCCTGTGGACGCTTATTCGTGCGACCAATTTCGCATGTTCGAGTTCAAGGTAAGG AAGTGCGCCCGTGGCAGGTCACATGACTGGACTGAGTGTCCGTACGCTCACCCTGGAGAG AAGGCCCGGAGGCGCGACCCGAGGAAGTATCACTATTCGGGTACGGCCTGCCCCGATTTT CGCAAGGGAAGCTGCAAGAAAGGTGACTCTTGCGAGTTCGCTCACGGCGTGTTTGAGTGC TGGCTTCACCCTGCACGTTACCGTACGCAGCCTTGCAAAGATGGTCCCAGCTGCAAGAGA CGGGTCTGTTTCTTCGCTCACACACCTGAGCAGCTGAGAATCTTGCCTCAGCAGAGCCCT AGAAGTGTCGAAGCTTCTTCGAGTGCTAAGTCTCTGCCGTTTTTGTCGTCTCCGGAGTCG GTTTCGCCTCCTATGAGTCCAAGGGCTGAGTCGCCGATGAGTCGGTCGCTTGGGTCGAGT TCGATCAGTGAGATGGTTGCTTCTTTGAGGAACCTCCAGTTGGGTAAGGTAAAATCTTTG CCATCGTCATGGAATAAACAGCTAGTTTGTTCTTCCGGGTACGGGTCTCCGCGTGGGTCG GTTCTTCGACCTGGATTTTGTAGTCTGCCTTCTACGCCAACCAAGACCCCATCTCGACCC GGCATCGGGTACTTGGATATTTTTGACGAGTGTTGTGAGGAGGAGCCAGTGATGGAGAGA GTCGAGTCCGGGAGGGGCTTGAGAGCAAAAATGTTCGAAAAACTGAGCAAGGAGAATTCT GTTGATCGGGCCGATCCGACACAGACAAGCGGGGCTCCGGATGTGGGCTGGGTATCGGAC CTTGTAAATGAAATGAAATGA
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>LITCHI017697.m1 - Up_Stream_Len 2000 TAAAAACAATGGAATTTATGGTGTGTTTATTTAATGGATTAGGGGATGAAAATGAAGAAT GAGATTGATTGATAATGTTTACTAGCTCAAAATTCATTTCGTAATGGGAATGAAAGTATG GGCCCCACGTCAATTTGAAATTGTGGAATGAGAATCTCATTCCCCCAACCTACTTGGGAA TCTCATTCTCATTCCTTTTGTTAGGATGAAAAGTCTTTTATACCTTTCTTTAATTTTTTT TAAAAAAAACCTATTTTATTTGATATTAAAAAAAAAAAAAAAACCGACTATTATAATAAA AAACTGCACATTATTAGTTTTTCATTACCAATTTCTTAATTATTATAATGGACTATTAAA ATAATATACAATTTTTTTAATTATAATATATAATTTTTTATTTGATATTAAAAAAAACTA TATATTATAATAAAAAATTACACACTAGGTTAGTGGATTATTAAAATAATATGCAATTTT TGTATTATAATATACAGTTTTATATTTAATATTAAAAAATGCATATTATAGTAAGAAACT ATACACAATTATACTTAATCCATAATTTTAATTAAGGGTATTTTTGTAACTTATAATTAA TCTATTCCGATTCCAAAGTAAAGTAAACAGTTCAATGGAAATACTGCTAATTCCAATTCT GATTCTTGCAGTTGATGTAAATAACTTATTTTGATTCCGATACTTCATTCTGATTCCAAG TCATTCCAATTCCAGATCATTTCGATTCCTCAAAATAAAGTAAACGCATCATTAATGAGT TTGGAAATAATATTACATCTCCACTTTTTTAAAACAAAAACAAAAAAAACAAAAAACAAA AAACAAAAATGTAAAGTTTTATTTTGAATAAATTAAGTATATTATAAAATATTTAAATTA TTTTTATTTCAATCAAATCTCAATCTACACCAAACATCTCCATTTTTTTCCATTTTTTTA AAAAATAAATTTTAAATATATTATAAAATATTTAAATTAATTTTATTATAATTTAATCTT AAGCTACACAAAACATAATATGATATAATTTTATACTAATTCTAAGTTATATCAAATATG AGATAATAATTTTTTAATTTAATCAAGTCTAATTCAATCCAATCCATTCTTATTCATTTA TTGTAGTTTAATTCAAACAATTTTATTATAACCTCGTGTGCCAATCGTAGTATAAAGCGA GACCTAGAGAGTGAGACGAAGCACCCATAGTAAGAGGAAAAAATTGCCCATAAATAATAT AATTTTGTGAGATTGAACCCACACTTGAAGAGTTGATAAGGATAACTCTTGATCTTACTA CTAAATAAGATCATTTTTATCATATAATGTAACCTTTTTTTGAAATATTATATGATGTAA AATTTTTGTTTTTAAAGAATTATAGTATAACATATTAATAAACAATGAAAATGTTGTTAG TAACCTAATCACATAATAATTGCATTTTTTTTTAATTCGTTCCGTCCATCTTATTATAGA GAAAATAGCGGTTTTCCAAAATATCAAACCCATAGTTTTTCGCAAAGAAAAAAACAAAGA AAAAAAAAATGTTCACTTTCTTTACTGGTCTCAATCTTTATCCTACGCATCTCAGGTTCC ACCGACTTTGGAACTCTACGGGCGTAGCCAGAATCAATATTCCACCCCAATCACAAAAAA TAAATCTACTCCAAATCACCAAATTTTCATCTACTTCGCATCAGAGCTTGCCACCTGGCA CCAATATGCACATCCCACAAACGTGGAGAGCTCTCAAGGACCGCCTTCCTAGCCCATTAA GGAACAGTCCAGTAACACAAGCACGGCCTTTATTTTAACTGCAGTACAATCGACAGCTCG GAGATTATCAACCTCACCATGGTTAATTGTGAACTCAACCAGGGTTATAAGCTCAGTCCC TGGCACCTTATAAACGCAAGCAAAGCATGCCAGTGTTTCCCTAAACAACAGCAAACACTA GAAACAAAATTAAACTGAAA
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>LITCHI017697.m1 GenomeSequence - GTTCACTTTCTTTACTGGTCTCAATCTTTATCCTACGCATCTCAGGTTCCACCGACTTTG GAACTCTACGGGCGTAGCCAGAATCAATATTCCACCCCAATCACAAAAAATAAATCTACT CCAAATCACCAAATTTTCATCTACTTCGCATCAGAGCTTGCCACCTGGCACCAATATGCA CATCCCACAAACGTGGAGAGCTCTCAAGGACCGCCTTCCTAGCCCATTAAGGAACAGTCC AGTAACACAAGCACGGCCTTTATTTTAACTGCAGTACAATCGACAGCTCGGAGATTATCA ACCTCACCATGGTTAATTGTGAACTCAACCAGGGTTATAAGCTCAGTCCCTGGCACCTTA TAAACGCAAGCAAAGCATGCCAGTGTTTCCCTAAACAACAGCAAACACTAGAAACAAAAT TAAACTGAAAATGATGCTCGGGGAGCCTCACCGTCCGAATCCGACGATCCACGTTCCCCC ATGGCCTCCAATCCTTGAAGATCAAGCGGCTGATATTATGTCTCCTCAGTCAATTAACGG CAATGCCAACGGCAGCCCTGAGTTTAACAACCCTTACTATCTGCAAGAGGCTCTAGCGGC ACTCCAACGTTATCTTCCGTCAAATGATCCGGAGTTGGACTTGGACGGCGACGTGTGCGG ACTGGATCCGGACTCCCCTGTGGACGCTTATTCGTGCGACCAATTTCGCATGTTCGAGTT CAAGGTAAGGAAGTGCGCCCGTGGCAGGTCACATGACTGGACTGAGTGTCCGTACGCTCA CCCTGGAGAGAAGGCCCGGAGGCGCGACCCGAGGAAGTATCACTATTCGGGTACGGCCTG CCCCGATTTTCGCAAGGGAAGCTGCAAGAAAGGTGACTCTTGCGAGTTCGCTCACGGCGT GTTTGAGTGCTGGCTTCACCCTGCACGTTACCGTACGCAGCCTTGCAAAGATGGTCCCAG CTGCAAGAGACGGGTCTGTTTCTTCGCTCACACACCTGAGCAGCTGAGAATCTTGCCTCA GCAGAGCCCTAGAAGTGTCGAAGCTTCTTCGAGTGCTAAGTCTCTGCCGTTTTTGTCGTC TCCGGAGTCGGTTTCGCCTCCTATGAGTCCAAGGGCTGAGTCGCCGATGAGTCGGTCGCT TGGGTCGAGTTCGATCAGTGAGATGGTTGCTTCTTTGAGGAACCTCCAGTTGGGTAAGGT AAAATCTTTGCCATCGTCATGGAATAAACAGCTAGTTTGTTCTTCCGGGTACGGGTCTCC GCGTGGGTCGGTTCTTCGACCTGGATTTTGTAGTCTGCCTTCTACGCCAACCAAGACCCC ATCTCGACCCGGCATCGGGTACTTGGATATTTTTGACGAGTGTTGTGAGGAGGAGCCAGT GATGGAGAGAGTCGAGTCCGGGAGGGGCTTGAGAGCAAAAATGTTCGAAAAACTGAGCAA GGAGAATTCTGTTGATCGGGCCGATCCGACACAGACAAGCGGGGCTCCGGATGTGGGCTG GGTATCGGACCTTGTAAATGAAATGAAATGAAGTGAAGTGAAGTGGCTTCTGTGGTTCTT CTCACTCATCCAAGAACCAAATTGTTGAGATTTGATATCGATTTCTTCGTTAAAAGTTGA ATCTATTTATTTGGATTGATTTTGGTGGACTGGTTTTTGGCTTCCTCTTGGTGTGAATAG TATCCAAAGAAAAGAAAAAGAGAGGAACAAAAGGAAGGAGTATTATTTTGGAAGTAACAG ACTAAAGATTCTGTGTATATATTTATTTATATTATTATCATTATCATAATCATCATCAAG AAGCTATCGGTGAAGGAAGAGTAGAATCTCTTTTTTGGGGAATTTTCTGAGAAGATCAGA AATTACGAAGTTGGAGAAAAAAGGAAAATTGCCGAACAACTGTTTGTATAGCTAGCAGAC TTGGATTCCCTTAGTTCATGTTTTTTATTTTTTTGGCTTTATAATTAATTATCCGACTTG CTGATCTTATATTATATTATTATTGTGTAAAAATTTCGGAGCTATGTAATGTTTCTGATC AATGCAATGTTTATTTTTAGCATAAGTGGTCATTTCTTCTTGTTTCTTTATTTGTGCTTG AAGTAGACACCCGCTTCAATTTGATCGAAATAAATGGAATTTGGAATAGGTTCCCGGTTT TTCCCGTAACAAATGGCCAACTAGTGAGGAAAGAGTAATTTCTCTGAAGATGGAGGAAAC TTTGTCGAGTAATTTGTTTGACGATGGAGGAGACGTTGTCAGCGTCCCCTTCGGGAGCTA TGTAATGTTTCTGATCAATGCAATGTTTATTTTTAGCATAAGTGGTCATTTCTTCTTGTT TCTTTATTTGTGCTTGAAGTAGACACCCGCTTCGATTTGATCGAAATAAATGGAATTTGG AATAGGTTTCCGGTTTTTCCCGTAACAAATGGCCACTAGTGAGGAAAGAGTAATTTCTCT GAAGAGGGAGGAAACTTTGTCGAGTAATTTGTTTGACGATGGAGGAGACTTTGTCAGCGT CCCCTTCGTTTCAACTTTACTTGATTGTAATTCTAACTCCTGTAACACGCAACATCATGA CCCATCACAAGTCTCTCCGTGGGAGCTTTGAAAGTTTGATATGTGTTACTGTTTTGACGA TAAGCGCACCGTTGGATGGCCCATGATGAGTTTCATGGATGGCCATCGTATGGTGTGGAA ATTGCTAGACGTGATCGAGATGGATGTGGACCTGCCTTTGTTGATATGGTATGATGATGA ATTGATGCTATTGATTTTGACATTGAAAATTACTGATATTGTTTTAGTAATTAGTGGAAT AATCAAGTGCGGTTAAGTTGTATTTAATGATGGCCTTATGTCTATTGGCTACATCCACCG GAGCCGACCCTAGATATCTCTCCAAAATCTTGGTTACTCTTTACACTAATCAAATGTATT TAATGG