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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI017696 | Chr1 | 48436221 | 48438166 | - | Transcription factor MYB87 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI017696.m1 | 14 | 62 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 50.1 | 2.50E-13 |
LITCHI017696.m1 | 17 | 77 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 38.4 | 1.20E-09 |
LITCHI017696.m1 | 69 | 111 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 41.9 | 8.90E-11 |
LITCHI017696.m1 | 71 | 117 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 36.8 | 3.70E-09 |
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>LITCHI017696.m1 ATGGGAAGAGCTCCATGTTGTGACAAAACTAAAGTTAAAAGAGGACCATGGTCTCCCGAA GAAGACGCCATTCTCAAGAGTTTTCTTGAAAAACATGGAACGGCAAGTAACTGGATTGCT TTACCCCATAAAGCAGGGCTGAAGCGGTGTGGGAAGAGTTGTCGTCTGAGGTGGCTAAAT TATCTAAGACCAGATATCAAGCACGGAGGTTTCACTGAAGAAGAAGATAGCATCATATGC TCTCTCTACAGTAGCATAGGAAGTAGGTGGTCTCTTATAGCTTCTCAACTTCCAGGAAGA ACAGACAATGATGTAAAAAACTATTGGAACACCAAGTTGAAGAAAAAGCTTTTGGCAGGA AAGGTTAGTTTTAACCGCAACAACAAGAAAGATATAATTACCACTAACGACATATCTCAT CTGATCAGTTCAACACAAACATCTATTTCAAATATTCCCCAAGTTGAAACCTGTGAGCAT GGAAGTTCATCAACCAGCTTTAATGCAAATCCCGGTGCATGGCAAAATGAAATGGACATG TTTTATAATTACCACCAAAATCCTGATCACGAAGGGATACTTTTAGACGCAAGTTTTCAG GTCCCATTTCCGGGGCTGATGGAAGTTTCAGATTACTGCACAAGTGGACATAACATGAAT TATAGTAAGTCGTCGTCTCAAGAAGCTTCAAGTCTTTCCATTTCATCATCATCGCCTTTA ACTCTGGAAACCAACTATGTGTCCTGGTCTGCCGATGGAAATGCTCATGAAGAAGAAGCA AGTTTACTGGACTTCATCTTTGAGTCCCCTTGTGGACTCCTACAAGGATTTGATTTCCAG AAAACAAGTTGCTAG
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>LITCHI017696.m1 MGRAPCCDKTKVKRGPWSPEEDAILKSFLEKHGTASNWIALPHKAGLKRCGKSCRLRWLN YLRPDIKHGGFTEEEDSIICSLYSSIGSRWSLIASQLPGRTDNDVKNYWNTKLKKKLLAG KVSFNRNNKKDIITTNDISHLISSTQTSISNIPQVETCEHGSSSTSFNANPGAWQNEMDM FYNYHQNPDHEGILLDASFQVPFPGLMEVSDYCTSGHNMNYSKSSSQEASSLSISSSSPL TLETNYVSWSADGNAHEEEASLLDFIFESPCGLLQGFDFQKTSC.
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>LITCHI017696.m1 GAAAGATATTAGCTAGAATGAAGAGCCAATTGACTTCATAATGACCAAAGCAGCATGCAT TATTGATTGTCGTTGGCAAGCAGTCAGGGCGAAAGGTCAAGCTGAAACCGCGTTCAATTT TTAATATGGCGAAAGTACTTCACATTTTGCTATTTTGAAGTCATTTATATATGCAGAAAA AAACTGCCAGTGGCCCACTTAGACTGCAGAAGGAAGGCATGAGAACTTCGTGCAGTCGAC ATTGACTGGGCTCTCTCTCTCACTCTGTGTCTTAACCACCACGTAACAGACAAAGAAATT CCGATTATCTTTTAAAAATAATTTTAAACCAACAACGGAAGAGTCAAGACGAAGTCAAAT TTCGAGATGTTCTTATCCATCTTTATAATGACCTTGTAGTAACACAAACACATACGCACA CCCACCAGTCAGTTGTTAAAGTTGTGTGTGGTAGTTCACAAAAATAGCTAAACAAGCTCC GCTCTTTACTGTCTTCTTTTGTGTTTAATTTGTTTGTTGGTGTGGATGAGATATCAGTGA GAATGGGAAGAGCTCCATGTTGTGACAAAACTAAAGTTAAAAGAGGACCATGGTCTCCCG AAGAAGACGCCATTCTCAAGAGTTTTCTTGAAAAACATGGAACGGCAAGTAACTGGATTG CTTTACCCCATAAAGCAGGGCTGAAGCGGTGTGGGAAGAGTTGTCGTCTGAGGTGGCTAA ATTATCTAAGACCAGATATCAAGCACGGAGGTTTCACTGAAGAAGAAGATAGCATCATAT GCTCTCTCTACAGTAGCATAGGAAGTAGGTGGTCTCTTATAGCTTCTCAACTTCCAGGAA GAACAGACAATGATGTAAAAAACTATTGGAACACCAAGTTGAAGAAAAAGCTTTTGGCAG GAAAGGTTAGTTTTAACCGCAACAACAAGAAAGATATAATTACCACTAACGACATATCTC ATCTGATCAGTTCAACACAAACATCTATTTCAAATATTCCCCAAGTTGAAACCTGTGAGC ATGGAAGTTCATCAACCAGCTTTAATGCAAATCCCGGTGCATGGCAAAATGAAATGGACA TGTTTTATAATTACCACCAAAATCCTGATCACGAAGGGATACTTTTAGACGCAAGTTTTC AGGTCCCATTTCCGGGGCTGATGGAAGTTTCAGATTACTGCACAAGTGGACATAACATGA ATTATAGTAAGTCGTCGTCTCAAGAAGCTTCAAGTCTTTCCATTTCATCATCATCGCCTT TAACTCTGGAAACCAACTATGTGTCCTGGTCTGCCGATGGAAATGCTCATGAAGAAGAAG CAAGTTTACTGGACTTCATCTTTGAGTCCCCTTGTGGACTCCTACAAGGATTTGATTTCC AGAAAACAAGTTGCTAGCTTCAAGTTAATTAATTAATTAGTTTATTAGCTGGCTGACATG TTCTTAAAACTCTAACAAATGTCCAATTGGTATAGATTGAGACTAGCTTGTTGAATAAGA TGTTTTTATAAGTATTTTGTTAATTATTCCTATTATTTAACTGGTATTAATTAATTTTGA TGTAATGATGTTGATGGAATAATAGCAAATGAAAACATATATGTATTTGATATGTCCAGC GTAAGTACTCATGCATGTGGGTGTACAGTTTCCTTTGATGTTTTTATCTGCAAACTTTAA TATTTTGGATGTAGAGCC
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>LITCHI005211.m1 - Up_Stream_Len 2000 ATAGGTAACTTGCCGAGGGACAGGAGCACATCGTGTTCGGAGAAGTTATTAGGAAAGGGT TCTTTTTAACCATCACCTTCTTTTTGGCTGTGAGAATATAGAGCATTTTCGGAGAAGTTA GTTGGGAGTAACATATTTGAGGTTTTAGGGTATGAATGTATAGACATCGAAGTGGTTGCC GTGTAATGATTTTGTGATTTGATCTTTCCAACTACGAAATGCTTTAAATGCATAATTTAA AGTTTTGTTTGTGTTGAATCTACTTTCATTTGGACTACTTTAATAGCATTTTTTGAAGGC CAAAATTATCTTGGACTTGGTCACCGCTACGTTAAGACTAAAAGCTTGGAAAGAATTCAT AGTTCTTAAGAAAGGGAGTGCCCCTAATTACTTAGGTAAATGCTGTTGGCGCCGTCATGT CATGTCCAGCAATTTATTACAATATACTATCTAAAGTTTTGATTTGTATAATATGATATA TTTATTACCATCAGATGTGATTTCATAGTATGAATATTCATCTAACTTGATAATATTTGA GGTTTGAATAGTTATATTACATATAATATTTTAAAATGTATATATATATATACATATATA AATGCATGTGTGAGAGAGGCGGAGAGATAAAATGGCTGTCCATGAAAATGCTCTCTGCTC AACCGAATTCTGTTAATACTTTATGCAGATTCTACTTCAGTGTAGAATTTATCAAATTAT TTTTCTGCCTCAGATGATCAGTTAGAAACTAATTATACATAACACCATTGTAACTCTACA GTACATGACCTAACTTGCTAATAAGTAAGAAATTTAGATTATAAAAAGGATTTGACTATC TTATTTATTTATTAAGCTTACCTCTAGACTCGTAATTAATTAGTGATAATGGACTGGGAC TTGTAAAGGATTAGAGAATTAAAGCCTAGGCCTGTCTCATAATGGCTAAGAAAGAATTTT CAGTGTCTGGTGTCTGTCACTTTGTTCGTTTCCTGTTGTAATATAATTGATTTCCTGAAA CTGACGCCGTTTACAATAAATTTTGTGCGTCAGTTATTACGTAAATATTTCAATTGAGTT TTTAAACATAGATATGCCAATTTGAACATAAATATCAAATAAATAAATAAGTTTAAAACG ATTTTAATGGAGGAAAACCTTAATAATTAAGAATTTTATCTTATATTATATATTTTATGA ACCTAACAACAAGCCTTTAGAGGTTTATTAGACTTTATCAAAATCAATTATTTTGTCTAT CGCTTGAATATATTAATGTTGAGCATTTATTTTCCCAGTAAAATGCATTAAAAAGTTAAA GGGCAACTAGCACAAACACACTTGGTATTTGGTGAAATTGTGCGTAAATAAGAGGTTTAG GTGTAATTACATGTGAGCTATTTGAATTTTCAAAAATTCAACAATAGTAGTTTATTGTTA GTGAGTTGTTAAAGAGCTATTGTTAAATCCACAACATCAGTTGAAGATGACGATGAAGAA TTAGTTATTTTAAGATGAGGAAATCTGTTTGTAGTGGATGAATTGTAGTTTATTTTCTTA TTTTTAAATTGAATTTTTGTTTTTAAATAAATAATATATCTAAAATGCATTGAATACATT ATCATAAAAATATTCATTACCCATTATTATACCTCACATCACACCTGCATAAGCCACTTT ACCTTGACACATTATGGATTTAATGATAACTCTTTAATGAGTTATTTAGTGCTGGAGGTA TCCTTGTTAAAATTTTAAACTTCTTGTGTAATTATCCCAAATCTCTTATATGTGTAATTT CATATAATAATAGAGTTTTTTTGCAATTTGCGTATTATAATAAAGCATCCCCAAATAGCC GTTGCCGTTAAAGGGTATATGAATAGAAACGGTAAAAATATTGTATGAGAAAAATATGAC CGTTACAAAACCCCAATTTTAAATCTACACTTGAGCCAAACACAACAGCAACGAAAACAG AAAGAGACCATCAATCAATC
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>LITCHI005211.m1 GenomeSequence - AATAAAGCATCCCCAAATAGCCGTTGCCGTTAAAGGGTATATGAATAGAAACGGTAAAAA TATTGTATGAGAAAAATATGACCGTTACAAAACCCCAATTTTAAATCTACACTTGAGCCA AACACAACAGCAACGAAAACAGAAAGAGACCATCAATCAATCATGAGAGAAGTCGAGCAA GAACCGCCAGTCGCAGAAGATGCAATGCAACAGCTGAGATCAAAGGCAGCGGAGCTCCTC CTAACAGAAGAATGGCAAGAGTCCGTACAAGTCTACTCTCAGTTCATCAATCTTTGCCAA GCAGAACTCCTAAGGACCAGCAATGAAGCAGATCACGTGTCCAAGCTCCACAAATCTCTC TGCTTAGCTTTCTCCAACAGAGCCGAGGCACGCTTCAGGTTGAGAGATTTCAATGAAGCC CTGCAAGACTGTGAGCAAGCATTGAGAATAGAGACTACCCATTTCAAGGCTCTTCTCTGT AAAGGTAAGATATTGCTTAGTTTGAATAGATACTCCATGGCTTTGGATTGCTTCAAAGCT ACTCTACTTGATGCTCATGCTAGTGGGAATCTTGAAATTGTTAATGGGTTTGTAGAGAAA TGCAAGAAGCTTGAGTGTCAATCGAGAACTGGCGCATTTGATTTCTCAGATTGGGTTCTA AGTGGGTTTCGTGGGAAGTGTCCAGAATTGGGAGAGTATGTTGGTGCTGTGCAGATAAAG AAGTCTGAGATTAGTGGAAGAGGTCTTTTCGCAACAAAGAACATTGATGCTGGGACTTTG GTTTTAGTCACTAAAGCAATTGCCAGTGAGAGAGGTATACTGTCAGGTGGGGGGGATTCG AGTGAGAGAGCTCAATTGGTTATGTGGAAGAATTTCATTGATAAAATTGTGGAGTGCACT TCAAAATGTCGAAGGACTCGTCACTTGATTAGTACATTATCAAGTGGTGAAAATGAGGAT GAGCTTAAGGTTCCTGATATTAGTCTCTTTAGGCCTGAGATGGAAGAGAGTGAGTGCTCG AACAAGAAGCTTGATATGGACAGGATTTTGAACATCTTGGATGTGAATTCTCTTGTTGAG GAGGCTGTTTCAGCCAAAGTTTTGGGGAAGAATAGGGGTTTTCATGGTGTTGGGTTATGG TTGTTAGCTTCATTCATCAACCATTCTTGTCATCCCAACGCTAGGCGTGTACATGTGGGT GATTTTGTCGTGGTTCATGCTTCCAGAGATGTTAAGGCTGGTGAAGAGATCACATTTGCC TATTTTGACATGCTTTCATTGTTGGAGAAGCGCAAGGAAATGTCTCAGACTTGGGGTTTT AGTTGTAACTGTAAGAGGTGTAAGTTTGAGGAAGGAATGAGTTCAAAGCCAGAGTTAAGG GAGATTGAGATGGGACTTGAAAGAGGCATAGATGCAGGTTGTGCAGTTTATAAGTTAGAG GAAAACATGAAAAGATGGACGGTTAGAGGGAGGGAGAAGGGCTATATGAGGGCATCAATA TGGAGTGCATATTCTGAGGCTTATGGTTCGGAGAGGTTGATAAAGAGATGGGGAAGGCGG ATTCCGGCAATGGAAGCTGTGGTGGATAGTGTTGTAGAAGCAGTGGGAAGTGATGAGAGA GTGTTGAAAGTTTTGATGGGAGGCTTAAAGAGAAGTGGTTGTGGAGTGGCAGAGATGGAG AGAGCAATGAAGTTTAAAAGAGGCTTGTACGGGAAGGTGGTGAAAAAACAAGCATTGAAA TCTCTTCTTGAGATGGATATATGTTAATTTAGCTATTAAGCAACTGTTATTTTTCAATTA GGATGTTTCTTTTCAATCTTTCTCTCTTCTTCTCAACTCTCTTGCCATTTTCAAGCTTTT TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATGTTTGATACTTTTTCACAATGACATCAACAACAATCAT ATGGTATCCACATATTTCTCGAATTTGTCACATTATATGAGGATTGTTTGATACTTTTTC ACAATGACGTTAACAATAATCATATGATATCCATATTTTTCACAAATTTGTCACACATTA TTAGGAT