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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI017696 | Chr1 | 48436221 | 48438166 | - | Transcription factor MYB87 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI017696.m1 | 14 | 62 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 50.1 | 2.50E-13 |
LITCHI017696.m1 | 17 | 77 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 38.4 | 1.20E-09 |
LITCHI017696.m1 | 69 | 111 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 41.9 | 8.90E-11 |
LITCHI017696.m1 | 71 | 117 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 36.8 | 3.70E-09 |
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>LITCHI017696.m1 ATGGGAAGAGCTCCATGTTGTGACAAAACTAAAGTTAAAAGAGGACCATGGTCTCCCGAA GAAGACGCCATTCTCAAGAGTTTTCTTGAAAAACATGGAACGGCAAGTAACTGGATTGCT TTACCCCATAAAGCAGGGCTGAAGCGGTGTGGGAAGAGTTGTCGTCTGAGGTGGCTAAAT TATCTAAGACCAGATATCAAGCACGGAGGTTTCACTGAAGAAGAAGATAGCATCATATGC TCTCTCTACAGTAGCATAGGAAGTAGGTGGTCTCTTATAGCTTCTCAACTTCCAGGAAGA ACAGACAATGATGTAAAAAACTATTGGAACACCAAGTTGAAGAAAAAGCTTTTGGCAGGA AAGGTTAGTTTTAACCGCAACAACAAGAAAGATATAATTACCACTAACGACATATCTCAT CTGATCAGTTCAACACAAACATCTATTTCAAATATTCCCCAAGTTGAAACCTGTGAGCAT GGAAGTTCATCAACCAGCTTTAATGCAAATCCCGGTGCATGGCAAAATGAAATGGACATG TTTTATAATTACCACCAAAATCCTGATCACGAAGGGATACTTTTAGACGCAAGTTTTCAG GTCCCATTTCCGGGGCTGATGGAAGTTTCAGATTACTGCACAAGTGGACATAACATGAAT TATAGTAAGTCGTCGTCTCAAGAAGCTTCAAGTCTTTCCATTTCATCATCATCGCCTTTA ACTCTGGAAACCAACTATGTGTCCTGGTCTGCCGATGGAAATGCTCATGAAGAAGAAGCA AGTTTACTGGACTTCATCTTTGAGTCCCCTTGTGGACTCCTACAAGGATTTGATTTCCAG AAAACAAGTTGCTAG
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>LITCHI017696.m1 MGRAPCCDKTKVKRGPWSPEEDAILKSFLEKHGTASNWIALPHKAGLKRCGKSCRLRWLN YLRPDIKHGGFTEEEDSIICSLYSSIGSRWSLIASQLPGRTDNDVKNYWNTKLKKKLLAG KVSFNRNNKKDIITTNDISHLISSTQTSISNIPQVETCEHGSSSTSFNANPGAWQNEMDM FYNYHQNPDHEGILLDASFQVPFPGLMEVSDYCTSGHNMNYSKSSSQEASSLSISSSSPL TLETNYVSWSADGNAHEEEASLLDFIFESPCGLLQGFDFQKTSC.
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>LITCHI017696.m1 GAAAGATATTAGCTAGAATGAAGAGCCAATTGACTTCATAATGACCAAAGCAGCATGCAT TATTGATTGTCGTTGGCAAGCAGTCAGGGCGAAAGGTCAAGCTGAAACCGCGTTCAATTT TTAATATGGCGAAAGTACTTCACATTTTGCTATTTTGAAGTCATTTATATATGCAGAAAA AAACTGCCAGTGGCCCACTTAGACTGCAGAAGGAAGGCATGAGAACTTCGTGCAGTCGAC ATTGACTGGGCTCTCTCTCTCACTCTGTGTCTTAACCACCACGTAACAGACAAAGAAATT CCGATTATCTTTTAAAAATAATTTTAAACCAACAACGGAAGAGTCAAGACGAAGTCAAAT TTCGAGATGTTCTTATCCATCTTTATAATGACCTTGTAGTAACACAAACACATACGCACA CCCACCAGTCAGTTGTTAAAGTTGTGTGTGGTAGTTCACAAAAATAGCTAAACAAGCTCC GCTCTTTACTGTCTTCTTTTGTGTTTAATTTGTTTGTTGGTGTGGATGAGATATCAGTGA GAATGGGAAGAGCTCCATGTTGTGACAAAACTAAAGTTAAAAGAGGACCATGGTCTCCCG AAGAAGACGCCATTCTCAAGAGTTTTCTTGAAAAACATGGAACGGCAAGTAACTGGATTG CTTTACCCCATAAAGCAGGGCTGAAGCGGTGTGGGAAGAGTTGTCGTCTGAGGTGGCTAA ATTATCTAAGACCAGATATCAAGCACGGAGGTTTCACTGAAGAAGAAGATAGCATCATAT GCTCTCTCTACAGTAGCATAGGAAGTAGGTGGTCTCTTATAGCTTCTCAACTTCCAGGAA GAACAGACAATGATGTAAAAAACTATTGGAACACCAAGTTGAAGAAAAAGCTTTTGGCAG GAAAGGTTAGTTTTAACCGCAACAACAAGAAAGATATAATTACCACTAACGACATATCTC ATCTGATCAGTTCAACACAAACATCTATTTCAAATATTCCCCAAGTTGAAACCTGTGAGC ATGGAAGTTCATCAACCAGCTTTAATGCAAATCCCGGTGCATGGCAAAATGAAATGGACA TGTTTTATAATTACCACCAAAATCCTGATCACGAAGGGATACTTTTAGACGCAAGTTTTC AGGTCCCATTTCCGGGGCTGATGGAAGTTTCAGATTACTGCACAAGTGGACATAACATGA ATTATAGTAAGTCGTCGTCTCAAGAAGCTTCAAGTCTTTCCATTTCATCATCATCGCCTT TAACTCTGGAAACCAACTATGTGTCCTGGTCTGCCGATGGAAATGCTCATGAAGAAGAAG CAAGTTTACTGGACTTCATCTTTGAGTCCCCTTGTGGACTCCTACAAGGATTTGATTTCC AGAAAACAAGTTGCTAGCTTCAAGTTAATTAATTAATTAGTTTATTAGCTGGCTGACATG TTCTTAAAACTCTAACAAATGTCCAATTGGTATAGATTGAGACTAGCTTGTTGAATAAGA TGTTTTTATAAGTATTTTGTTAATTATTCCTATTATTTAACTGGTATTAATTAATTTTGA TGTAATGATGTTGATGGAATAATAGCAAATGAAAACATATATGTATTTGATATGTCCAGC GTAAGTACTCATGCATGTGGGTGTACAGTTTCCTTTGATGTTTTTATCTGCAAACTTTAA TATTTTGGATGTAGAGCC
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>LITCHI017696.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTGGAAGCTGGAAGCTAGAAACCCATCAAATGATAACGACTAAAAACCCTAAACAAATCC ATCGATGGCAACCCATCACACTTGCTCACACCCACCCATTAAACACATCTATCAAACATC AAACGACGGCAGATGGGGAAGAAGAAGAGGTCAAACATCAGCAAATGGGGAAGAAGAAGA GCAGTGGGTCGGTGATAGGGACGAAGAAAAAGTAAAGGTTGATAGTGTGTGTGTGTATGT GAGAGAGAGGGAAAGAGAGAGAGAGAGGGACAGGGGTGGCTGAAGCTAAGGGAAGAAATG AGATGTTTTTTTTTTAATCAGTTGATCTCCATTGGTTATTTTAAGATGAACAGTGGAGAT TCAATGAATTTTTTTATTTAAATTTAAAAATTAAATTTTTATTACTTTTTTAATCATTTA ATTTTTAAAATAAGGTTAAAAGACTAATTTACTAATTTTCCTCTCATTTAGTTAATTTTA ATAGAGAGTTGCTAATAGCAGGGGATAAATTGTAATGACATCGAAAAAAAATTTTCACTC GAATAAAAGTTTGAACTGAGTAACTAAATTGTAATTTATTCGATATAATAAATACAACGT CAGATATAATAAAATATAATCAATAATTTTATAATACAATCATTTATTTGTAATTATCAA ATATATTAATGTCAAATATACTATAGAACGTGTATATATATATATGTTTGCGCATGGGTC ACAAGTTTAAACATTTATATCTTTCAAAAAAAAAAAAAGTATATAAATTTATAGACTCAC TTTTTTGAGCTTTTTATGGGAGGAAGCCATGGCCCATGTTGGGTCCAGTCTCACCCGCTA ATTCTAATGATGATCATTTTCCAAAATTTAAAGTCGCGACAATACAATGAAGCACCAAAA ATCCCATACTTGTTTGAAGCACTTGATTTGATACTCGTAGATCACCTCTTCTTTCTAATA ATTCAGACTAAAATCTTTGGGAGCAGACAATACTATACCGTATCCCTATCTCTGCAATGA ACCAGAGTCCAGAAATAAGAAATACATTAGAAAATGAGCAGACATGGGTTCCGTCGGTCT GCCTTCGCTTTCTTATAGAGAACTAGCAAGTTGAATGTTTCTGCAAAATATAATATTAGT ATATAAAATCTCTATTCTTAATAATTCACGGAGAGATGTTTTTAAGTATTTACAGAATTA GATATCTTTCAATTATAAAAATGAATTCAATCTTCATCATAAATAAATAAGAACATACGT AGAGTAAAAAAATAGATATTCGAATTGCTTATGTAATACTTAATTTTAAAATTTTTATTA AATATCAACAAAATTATGATCATTCGGTGTCAATCTCTAGAATTGTTTTTGGAACTACAA TTTCTAAAATTTATTAGTCCTATAGTCATTCTGTAACACTATGTTCACCAAAATGCAATT TCCATTTTGTGAAAAGAAGAAAGATATTAGCTAGAATGAAGAGCCAATTGACTTCATAAT GACCAAAGCAGCATGCATTATTGATTGTCGTTGGCAAGCAGTCAGGGCGAAAGGTCAAGC TGAAACCGCGTTCAATTTTTAATATGGCGAAAGTACTTCACATTTTGCTATTTTGAAGTC ATTTATATATGCAGAAAAAAACTGCCAGTGGCCCACTTAGACTGCAGAAGGAAGGCATGA GAACTTCGTGCAGTCGACATTGACTGGGCTCTCTCTCTCACTCTGTGTCTTAACCACCAC GTAACAGACAAAGAAATTCCGATTATCTTTTAAAAATAATTTTAAACCAACAACGGAAGA GTCAAGACGAAGTCAAATTTCGAGATGTTCTTATCCATCTTTATAATGACCTTGTAGTAA CACAAACACATACGCACACCCACCAGTCAGTTGTTAAAGTTGTGTGTGGTAGTTCACAAA AATAGCTAAACAAGCTCCGCTCTTTACTGTCTTCTTTTGTGTTTAATTTGTTTGTTGGTG TGGATGAGATATCAGTGAGA
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>LITCHI017696.m1 GenomeSequence - GAAAGATATTAGCTAGAATGAAGAGCCAATTGACTTCATAATGACCAAAGCAGCATGCAT TATTGATTGTCGTTGGCAAGCAGTCAGGGCGAAAGGTCAAGCTGAAACCGCGTTCAATTT TTAATATGGCGAAAGTACTTCACATTTTGCTATTTTGAAGTCATTTATATATGCAGAAAA AAACTGCCAGTGGCCCACTTAGACTGCAGAAGGAAGGCATGAGAACTTCGTGCAGTCGAC ATTGACTGGGCTCTCTCTCTCACTCTGTGTCTTAACCACCACGTAACAGACAAAGAAATT CCGATTATCTTTTAAAAATAATTTTAAACCAACAACGGAAGAGTCAAGACGAAGTCAAAT TTCGAGATGTTCTTATCCATCTTTATAATGACCTTGTAGTAACACAAACACATACGCACA CCCACCAGTCAGTTGTTAAAGTTGTGTGTGGTAGTTCACAAAAATAGCTAAACAAGCTCC GCTCTTTACTGTCTTCTTTTGTGTTTAATTTGTTTGTTGGTGTGGATGAGATATCAGTGA GAATGGGAAGAGCTCCATGTTGTGACAAAACTAAAGTTAAAAGAGGACCATGGTCTCCCG AAGAAGACGCCATTCTCAAGAGTTTTCTTGAAAAACATGGAACGGCAAGTAACTGGATTG CTTTACCCCATAAAGCAGGTCTGTCTGTTTCCTTCATCTTCCTTTTTCTCTTCTCATCAA CTTCTTCGTGTACAGCTATACCTATATTGTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTAATCA TCAAAAGTGTTTTTAAAACAAACTGTTGTCTGTTTTAGGGCTGAAGCGGTGTGGGAAGAG TTGTCGTCTGAGGTGGCTAAATTATCTAAGACCAGATATCAAGCACGGAGGTTTCACTGA AGAAGAAGATAGCATCATATGCTCTCTCTACAGTAGCATAGGAAGTAGGCAAGTCCATTA ATTTAATATCTCCCCTTAATAATTCAAGTTTGTTATTCCAATTTTCCATCATGTAATTAA TCCATGCACATATGTGATTATTATTTATTGGATTAGGTGGTCTCTTATAGCTTCTCAACT TCCAGGAAGAACAGACAATGATGTAAAAAACTATTGGAACACCAAGTTGAAGAAAAAGCT TTTGGCAGGAAAGGTTAGTTTTAACCGCAACAACAAGAAAGATATAATTACCACTAACGA CATATCTCATCTGATCAGTTCAACACAAACATCTATTTCAAATATTCCCCAAGTTGAAAC CTGTGAGCATGGAAGTTCATCAACCAGCTTTAATGCAAATCCCGGTGCATGGCAAAATGA AATGGACATGTTTTATAATTACCACCAAAATCCTGATCACGAAGGGATACTTTTAGACGC AAGTTTTCAGGTCCCATTTCCGGGGCTGATGGAAGTTTCAGATTACTGCACAAGTGGACA TAACATGAATTATAGTAAGTCGTCGTCTCAAGAAGCTTCAAGTCTTTCCATTTCATCATC ATCGCCTTTAACTCTGGAAACCAACTATGTGTCCTGGTCTGCCGATGGAAATGCTCATGA AGAAGAAGCAAGTTTACTGGACTTCATCTTTGAGTCCCCTTGTGGACTCCTACAAGGATT TGATTTCCAGAAAACAAGTTGCTAGCTTCAAGTTAATTAATTAATTAGTTTATTAGCTGG CTGACATGTTCTTAAAACTCTAACAAATGTCCAATTGGTATAGATTGAGACTAGCTTGTT GAATAAGATGTTTTTATAAGTATTTTGTTAATTATTCCTATTATTTAACTGGTATTAATT AATTTTGATGTAATGATGTTGATGGAATAATAGCAAATGAAAACATATATGTATTTGATA TGTCCAGCGTAAGTACTCATGCATGTGGGTGTACAGTTTCCTTTGATGTTTTTATCTGCA AACTTTAATATTTTGGATGTAGAGCC