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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI017648 | Chr1 | 48087029 | 48089836 | + | Protein EFFECTOR OF TRANSCRIPTION 2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI017648.m1 | 29 | 177 | PF19239.2 | GIY_YIG_domain | Domain | 217.3 | 1.10E-64 |
LITCHI017648.m2 | 2 | 145 | PF19239.2 | GIY_YIG_domain | Domain | 207.7 | 9.20E-62 |
LITCHI017648.m3 | 23 | 167 | PF19239.2 | GIY_YIG_domain | Domain | 208.7 | 4.70E-62 |
LITCHI017648.m4 | 29 | 69 | PF19239.2 | GIY_YIG_domain | Domain | 46.2 | 4.20E-12 |
LITCHI017648.m5 | 23 | 167 | PF19239.2 | GIY_YIG_domain | Domain | 208.7 | 4.70E-62 |
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>LITCHI017648.m1 ATGGGAGCCGCAGACTTGGCCTTCTTCGTCGCAGCTGCTCGTATCAACAGAGAAGATTGC AAGCGAACCAAACACGACTCCCAGTTTTACAAATGGCAGGTTCTTGTCGGGCCTTCAGAT TGGGAAGATCACTCACGCGGTAAGGAAGGAGTGGCTAGATATAGGGTTCACAACCTCCCT ACTGTTATCTCTCCTGGACTTTATGAGCTTGGTATAGCTGTATCTTCCTCTCGCAAGATA CTCTCAGATGATGTGGTTGTTGTTTACCTCGGACATTCTGACAATGTCCGAACACGAGTT CAGTGCTATGGTCGTAGTGGTGCTCATTTGAATAACCCCAATGACTCTGCCCTCAAAAGG GGGCCTGGATTGTTTGAGGATATATTCAGTAGAGGTTATAGTATTGTGTTTAGATGGGTT CCTATGAAAAGCAAGGCAGATGCTCTTAAAATGGAAGCTCAACTTCTAGATATATTCGAT TATGCGTGGAACAAAAGCAGCAATGGTGCACGTCGCCGCGATGATGTCCTTAGGAAACTC GACAGAGCTCCTTCAAGGAATATTCAGTTTCCTAAGTTTGTCAGGAAGATTCTACATTAC AGTCAAAAGCCGGTGGGCATCAAAATCAAAGAAACCAAGTTTCTTTTCCCAGGACAGAAA TGCAACAATTGTGCTGATGAGAAGAGTAACAATTTCTTTCCTCAAGTTTTCAAGTTTAGC AAATCACAGCCCAAGTTAGTTTTTCTTGGACAAGGTGAAGAAGATAGACATATAATTATC AAAGGGTCCATCTCAAAGTCGAATAAAGGAGGGAAAATACAAGTGGAAAGTGCTGACTCA GAATACAGCATCTATGGTATCAGAGAAGTCGATCATCATGGTGCGCTTAGTTCAGTTTTT GATCCATTGAAGCTTCCTGTGGCTGCTGTTCCTATCGGTGAGGGCTACAGTAAGACTTGT GGCGTTGTCTTGGATGACGGCAGGTTTTGTATAAAACAGCCAATTCAAGGAAATAAAAGG TGCAACGAGCACAAATGGAGGAAAACTTACGGATCTGATTCTAAGTCAGGAGGAACATCA CACCCAGTGGCTGATGCGGCCTATGATTCTTGTGATAGGAAGGCTTTAAATCATGATAAG AGGAATTCCCCAGAAATATATAGAGCAGGAAGAATATTTTTCCCAAAGAGATCTGAAGTC AACCTACACTATAATAATATATGTGGGGTAAAATTAGGTGATGGGTATTTCTGTACCAGT CAGCCTGTTACGGGAAGAGTGAGGTGTGAGGAGCATAAAGGGTTGAAGGTTAATGGGAAC TTCTCTAGGTCACATGAAAAGGATAAAACTCGTGTATATGATAAGGATTCGAAATCCAGC ACATTTGCTGATAGGGAATACGGTTCCTCTGTTTGTGGAGCAAAGATGGCGAGTGGTTCA TATTGCAAAAGGCCAGTCAAGGGAAATACGAGTTGTTGGCAGCATTCAGCACGGATTTCT TATAGGGACTCGACAATCAATTCCTCTAATGACTGGAAATATGGAGGAACCTCTCTCTGT GGAGCACCCACACGAAGCGGTTCTTCTTGCAAAAGGCCAGTTAAGGGAGGTGGAAGGTGT TGGCAGCACTAA >LITCHI017648.m2 ATGGTTCTTGTCGGGCCTTCAGATTGGGAAGATCACTCACGCGGTAAGGAAGGAGTGGCT AGATATAGGGTTCACAACCTCCCTACTGTTATCTCTCCTGGACTTTATGAGCTTGGTATA GCTGTATCTTCCTCTCGCAAGATACTCTCAGATGATGTGGTTGTTGTTTACCTCGGACAT TCTGACAATGTCCGAACACGAGTTCAGTGCTATGGTCGTAGTGGTGCTCATTTGAATAAC 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