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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI017648 | Chr1 | 48087029 | 48089836 | + | Protein EFFECTOR OF TRANSCRIPTION 2 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI017648.m1 | 29 | 177 | PF19239.2 | GIY_YIG_domain | Domain | 217.3 | 1.10E-64 |
| LITCHI017648.m2 | 2 | 145 | PF19239.2 | GIY_YIG_domain | Domain | 207.7 | 9.20E-62 |
| LITCHI017648.m3 | 23 | 167 | PF19239.2 | GIY_YIG_domain | Domain | 208.7 | 4.70E-62 |
| LITCHI017648.m4 | 29 | 69 | PF19239.2 | GIY_YIG_domain | Domain | 46.2 | 4.20E-12 |
| LITCHI017648.m5 | 23 | 167 | PF19239.2 | GIY_YIG_domain | Domain | 208.7 | 4.70E-62 |
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>LITCHI017648.m1 ATGGGAGCCGCAGACTTGGCCTTCTTCGTCGCAGCTGCTCGTATCAACAGAGAAGATTGC AAGCGAACCAAACACGACTCCCAGTTTTACAAATGGCAGGTTCTTGTCGGGCCTTCAGAT TGGGAAGATCACTCACGCGGTAAGGAAGGAGTGGCTAGATATAGGGTTCACAACCTCCCT ACTGTTATCTCTCCTGGACTTTATGAGCTTGGTATAGCTGTATCTTCCTCTCGCAAGATA CTCTCAGATGATGTGGTTGTTGTTTACCTCGGACATTCTGACAATGTCCGAACACGAGTT CAGTGCTATGGTCGTAGTGGTGCTCATTTGAATAACCCCAATGACTCTGCCCTCAAAAGG GGGCCTGGATTGTTTGAGGATATATTCAGTAGAGGTTATAGTATTGTGTTTAGATGGGTT CCTATGAAAAGCAAGGCAGATGCTCTTAAAATGGAAGCTCAACTTCTAGATATATTCGAT TATGCGTGGAACAAAAGCAGCAATGGTGCACGTCGCCGCGATGATGTCCTTAGGAAACTC GACAGAGCTCCTTCAAGGAATATTCAGTTTCCTAAGTTTGTCAGGAAGATTCTACATTAC AGTCAAAAGCCGGTGGGCATCAAAATCAAAGAAACCAAGTTTCTTTTCCCAGGACAGAAA TGCAACAATTGTGCTGATGAGAAGAGTAACAATTTCTTTCCTCAAGTTTTCAAGTTTAGC AAATCACAGCCCAAGTTAGTTTTTCTTGGACAAGGTGAAGAAGATAGACATATAATTATC AAAGGGTCCATCTCAAAGTCGAATAAAGGAGGGAAAATACAAGTGGAAAGTGCTGACTCA GAATACAGCATCTATGGTATCAGAGAAGTCGATCATCATGGTGCGCTTAGTTCAGTTTTT GATCCATTGAAGCTTCCTGTGGCTGCTGTTCCTATCGGTGAGGGCTACAGTAAGACTTGT 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GGGGTAAAATTAGGTGATGGGTATTTCTGTACCAGTCAGCCTGTTACGGGAAGAGTGAGG TGTGAGGAGCATAAAGGGTTGAAGGTTAATGGGAACTTCTCTAGGTCACATGAAAAGGAT AAAACTCGTGTATATGATAAGGATTCGAAATCCAGCACATTTGCTGATAGGGAATACGGT TCCTCTGTTTGTGGAGCAAAGATGGCGAGTGGTTCATATTGCAAAAGGCCAGTCAAGGGA AATACGAGTTGTTGGCAGCATTCAGCACGGATTTCTTATAGGGACTCGACAATCAATTCC TCTAATGACTGGAAATATGGAGGAACCTCTCTCTGTGGAGCACCCACACGAAGCGGTTCT TCTTGCAAAAGGCCAGTTAAGGGAGGTGGAAGGTGTTGGCAGCACTAA >LITCHI017648.m5 ATGGGTTTGAAATTTGGGTGGCTAAAATTGACGAGGGCAAGTGTTGTTGTAAAAATAATG TGCACCCAGGTTCTTGTCGGGCCTTCAGATTGGGAAGATCACTCACGCGGTAAGGAAGGA GTGGCTAGATATAGGGTTCACAACCTCCCTACTGTTATCTCTCCTGGACTTTATGAGCTT GGTATAGCTGTATCTTCCTCTCGCAAGATACTCTCAGATGATGTGGTTGTTGTTTACCTC GGACATTCTGACAATGTCCGAACACGAGTTCAGTGCTATGGTCGTAGTGGTGCTCATTTG AATAACCCCAATGACTCTGCCCTCAAAAGGGGGCCTGGATTGTTTGAGGATATATTCAGT AGAGGTTATAGTATTGTGTTTAGATGGGTTCCTATGAAAAGCAAGGCAGATGCTCTTAAA ATGGAAGCTCAACTTCTAGATATATTCGATTATGCGTGGAACAAAAGCAGCAATGGTGCA CGTCGCCGCGATGATGTCCTTAGGAAACTCGACAGAGCTCCTTCAAGGAATATTCAGTTT 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>LITCHI013083.m2 GATAAGTGTCTCTCTATTCACACAAAAGATTCACTCTTATTTCTAAGAGCTATGTGATGA TATCAATTACCAGATAACATAAGTGTATTAATGTCATCATTAACAACAACTGGAGTAAGA CATAAGCTAAAACAAACAAACAAGAATTAGTGTGGTTTGGTGTAAACGAGAGATATATTC AGTAGTTGAGAAATCACAAAGGTAAACTGACTTCTACTTAATTTAAAAGAAATCTACATG ATTAGTAATATGAAACAATAAAGCGGTCAATAAAGCTACAGATTCAAGCAGCCAACCATG TTAATAAAATTTTGTTTCTTCAGGTGATGCTATGTCAAACCGCATGCTATAAATATCAGA CCTAGCTGCCAAGTGAAAAGGAATTCTTCAGTGTCCTTATCGCCAAGGTAAAACGACAGC TTTCAGTGTTCTAATTGCCACGTAAAAAGGATAGTTCTTAAATACTCTTTTAAGGTGTGA TCATCACCCTGTCTAGCATGTTTTATATTTAAGTGGCAGCGCTGGTCAATGAGCTCAAAT ATGTAACCTGAACAAAACTTGTTCAGCAAAGAATTAGGCATGCATACACTCAAACGTAAT GATTTCCGATTCGTCAGAAACTTACTATCTATTTTTACTTTTATCAAATATGAAGAGGCC AATGCAATTTATCCTAGTATGTACATCCTGGTGATTATTGATGAACAATACAAGAATAAT TTGTGTGAACCTCATATTCGTATATATTTCATGCTCTGGACCACCTTGGGTTGCAATTAT TGGTGTGACTAACATGCTATGATGTCGTGTAAAACTTGGATTGCAACCACAGCATAAAAA AAAAACAAATTTACAGTTCTCCTTTTTAGTTTCTAATCATTTTAAATCACTCAGAAACAA TAAAATGTAGCTAGTGGTCCTACCCCATCTTTTTCACCTTTTTCCTTACACTCTCTTTAC 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