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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI017620 | Chr1 | 47849830 | 47857575 | + | Zinc finger CCCH domain-containing protein 64 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI017620.m1 | 385 | 500 | PF04677.18 | CwfJ_C_1 | Family | 137.7 | 1.80E-40 |
| LITCHI017620.m1 | 523 | 603 | PF04676.17 | CwfJ_C_2 | Family | 61.9 | 9.10E-17 |
| LITCHI017620.m2 | 385 | 500 | PF04677.18 | CwfJ_C_1 | Family | 137.7 | 1.80E-40 |
| LITCHI017620.m2 | 523 | 603 | PF04676.17 | CwfJ_C_2 | Family | 61.9 | 9.10E-17 |
| LITCHI017620.m3 | 332 | 447 | PF04677.18 | CwfJ_C_1 | Family | 137.9 | 1.50E-40 |
| LITCHI017620.m3 | 470 | 550 | PF04676.17 | CwfJ_C_2 | Family | 62.1 | 7.90E-17 |
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>LITCHI017620.m1 ATGGCTCCTCCAAGAATTCTGCTATGCGGCGACGTCCTAGGCCGCCTGAACCAGCTGTTC AAACGAGTTCAATCGGTCAACAAATCAGCTGGTCCATTCGATGCCCTTCTCTGCGTGGGC CAGTTCTTCCCGGACTCACCGGACCGCCTGCAGGAGCTTATGGACTTCATCGAAAACCGC TCGCAGTTTCCTCTGCCAACCTACTTCATCGGCGACTACGGCGTAGGCGCCGCCAAGGTC CTAGTCGCCGCTTCCAAAGACCCCGTCAATCAAGGCTTCAAGCTTGACGGCTTCAAAATC TGCAACAATTTGTTCTGGTTGAAAGGCAGTGGCAAGTTCACTCTTCACGGTTTATCTGTG GCATATTTATCTGGTAGGCGATTGTCGGATGGTCAGCAGTTTGGAAAGTATACTCAAGAT GATGTTGATGCTTTGCGAGCATTAGCCGAGGAACCTGGAATTGTTGACTTGTTTTTAACT AATGAATGGCCAAGGGGGGTTACAAACAGAGCTGCTACATCTGATGTACCCGTCGGAATC TCAGATTCATTAGGCAGTGATTCTACAGTATCAGAGTTGGTGGTGGAAATCAAACCGCGC TATCACATTGCTGGTTCTAAGGGTGTATTCTATGCTCGCGAACCTTACTCTAATATTGAT GCGGTGCATGTAACTCGCTTCTTGGGTCTTGCTCCTGTTGGAAACAAAGATAAACAGAAA TTTCTTCATGCCATTTCTCCTACGCCAGCATCTACCATGTCTGCCACTGAGATAAGCATG AAATCACCAAACACAACCTTATCTCCGTACACATCAGTTGATCTAGGAGCTCATCCTAAA GAAGTCACAAAGAGGTCTAGTGATAGTGTTTCAGATTCACAATATTGGAGATATGATGTC TCTCAAAAACGACAGAAACATGGAGGTGGTGAGGGTGATAAAGTGTGTTTTAAATTTATA TATTCTGGGTCTTGTCCACGTGGAGAGAACTGCAACTTTCAACATGATACTGAAGCACGA GAACAATGTTTAAGAGGTGTTTGTCTAGATTTTATTATAAAAGGAAAATGTGAAAAGGGT CCAGAATGCAGCTATAAGCACAGCCTACAGAGTGAAGGTGACTATTCTCACAGAAGACCT AGATCTGAAAATGCAAGTGCTAGCAGGTCAAAAGAGTGCTGGTTCTGTTTGTCAAGCCCC AGTGTAGAGTCACATCTGATTGTTAGCATAGGAGAAAATTGCTACTGTGCACTGCCTAAA GGCCCGCTTGTTCAAGACCATGTGCTGATTGTACCCATTGAGCACTCACCTAACACCATG TCTCTTTCCCCAGAGTGCGAAATTGAGCTTGCTAGATTCCAAGACAGTCTCAAGAACTAT TATAAAAGCCAGGGGAAGGAAGCTGTTTTTTTTGAGTGGGTTTCAAAACGTGGTACTCAT GCTAATGTTCAGTCTGTTCCTATACCGTCATCAAGAGCGGCTGCTGTTCAAGCTATATTT AATATGGCTGCAGAAAAGTTGGGTTTCAAATTTTTGGCCACAAAATCCAATGGTAACTCT GATGGGAGAAAATCATTGAGGACCGAATTTGATAAGAACTTTAATTTCTTTTATGTGGAA CTCCCTGGAGGTATTATACTGTCACACAGAGTTGAAGACACTGAAACATTCCCAGCACAA TTTGGACGTGAGGTTTTGGCAGGCTTTCTGAACATTGCAGAGAAGGCTGATTGGAGGAAT TGTGCACTTGGCAAGGAAGAGGAAAGGAAGATGGCAGAAAATTTCAAAAAACAGTTTGAA GAATTTGATCCTATTAAATAA >LITCHI017620.m2 ATGGCTCCTCCAAGAATTCTGCTATGCGGCGACGTCCTAGGCCGCCTGAACCAGCTGTTC AAACGAGTTCAATCGGTCAACAAATCAGCTGGTCCATTCGATGCCCTTCTCTGCGTGGGC CAGTTCTTCCCGGACTCACCGGACCGCCTGCAGGAGCTTATGGACTTCATCGAAAACCGC TCGCAGTTTCCTCTGCCAACCTACTTCATCGGCGACTACGGCGTAGGCGCCGCCAAGGTC CTAGTCGCCGCTTCCAAAGACCCCGTCAATCAAGGCTTCAAGCTTGACGGCTTCAAAATC TGCAACAATTTGTTCTGGTTGAAAGGCAGTGGCAAGTTCACTCTTCACGGTTTATCTGTG GCATATTTATCTGGTAGGCGATTGTCGGATGGTCAGCAGTTTGGAAAGTATACTCAAGAT GATGTTGATGCTTTGCGAGCATTAGCCGAGGAACCTGGAATTGTTGACTTGTTTTTAACT AATGAATGGCCAAGGGGGGTTACAAACAGAGCTGCTACATCTGATGTACCCGTCGGAATC TCAGATTCATTAGGCAGTGATTCTACAGTATCAGAGTTGGTGGTGGAAATCAAACCGCGC TATCACATTGCTGGTTCTAAGGGTGTATTCTATGCTCGCGAACCTTACTCTAATATTGAT GCGGTGCATGTAACTCGCTTCTTGGGTCTTGCTCCTGTTGGAAACAAAGATAAACAGAAA TTTCTTCATGCCATTTCTCCTACGCCAGCATCTACCATGTCTGCCACTGAGATAAGCATG AAATCACCAAACACAACCTTATCTCCGTACACATCAGTTGATCTAGGAGCTCATCCTAAA GAAGTCACAAAGAGGTCTAGTGATAGTGTTTCAGATTCACAATATTGGAGATATGATGTC TCTCAAAAACGACAGAAACATGGAGGTGGTGAGGGTGATAAAGTGTGTTTTAAATTTATA TATTCTGGGTCTTGTCCACGTGGAGAGAACTGCAACTTTCAACATGATACTGAAGCACGA 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AAGCTTGACGGCTTCAAAATCTGCAACAATTTGTTCTGGTTGAAAGGCAGTGGCAAGTTC ACTCTTCACGGTTTATCTGTGGCATATTTATCTGGTAGGCGATTGTCGGATGGTCAGCAG TTTGGAAAGTATACTCAAGATGATGTTGATGCTTTGCGAGCATTAGCCGAGGAACCTGGA ATTGTTGACTTGTTTTTAACTAATGAATGGCCAAGGGGGGTTACAAACAGAGCTGCTACA TCTGATGTACCCGTCGGAATCTCAGATTCATTAGGCAGTGATTCTACAGTATCAGAGTTG GTGGTGGAAATCAAACCGCGCTATCACATTGCTGGTTCTAAGGGTGTATTCTATGCTCGC GAACCTTACTCTAATATTGATGCGGTGCATGTAACTCGCTTCTTGGGTCTTGCTCCTGTT GGAAACAAAGATAAACAGAAATTTCTTCATGCCATTTCTCCTACGCCAGCATCTACCATG TCTGCCACTGAGATAAGCATGAAATCACCAAACACAACCTTATCTCCGTACACATCAGTT GATCTAGGAGCTCATCCTAAAGAAGTCACAAAGAGGTCTAGTGATAGTGTTTCAGATTCA CAATATTGGAGATATGATGTCTCTCAAAAACGACAGAAACATGGAGGTGGTGAGGGTGAT AAAGTGTGTTTTAAATTTATATATTCTGGGTCTTGTCCACGTGGAGAGAACTGCAACTTT CAACATGATACTGAAGCACGAGAACAATGTTTAAGAGGTGTTTGTCTAGATTTTATTATA AAAGGAAAATGTGAAAAGGGTCCAGAATGCAGCTATAAGCACAGCCTACAGAGTGAAGGT GACTATTCTCACAGAAGACCTAGATCTGAAAATGCAAGTGCTAGCAGGTCAAAAGAGTGC TGGTTCTGTTTGTCAAGCCCCAGTGTAGAGTCACATCTGATTGTTAGCATAGGAGAAAAT 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>LITCHI017620.m1 MAPPRILLCGDVLGRLNQLFKRVQSVNKSAGPFDALLCVGQFFPDSPDRLQELMDFIENR SQFPLPTYFIGDYGVGAAKVLVAASKDPVNQGFKLDGFKICNNLFWLKGSGKFTLHGLSV AYLSGRRLSDGQQFGKYTQDDVDALRALAEEPGIVDLFLTNEWPRGVTNRAATSDVPVGI SDSLGSDSTVSELVVEIKPRYHIAGSKGVFYAREPYSNIDAVHVTRFLGLAPVGNKDKQK FLHAISPTPASTMSATEISMKSPNTTLSPYTSVDLGAHPKEVTKRSSDSVSDSQYWRYDV SQKRQKHGGGEGDKVCFKFIYSGSCPRGENCNFQHDTEAREQCLRGVCLDFIIKGKCEKG PECSYKHSLQSEGDYSHRRPRSENASASRSKECWFCLSSPSVESHLIVSIGENCYCALPK GPLVQDHVLIVPIEHSPNTMSLSPECEIELARFQDSLKNYYKSQGKEAVFFEWVSKRGTH ANVQSVPIPSSRAAAVQAIFNMAAEKLGFKFLATKSNGNSDGRKSLRTEFDKNFNFFYVE LPGGIILSHRVEDTETFPAQFGREVLAGFLNIAEKADWRNCALGKEEERKMAENFKKQFE EFDPIK. >LITCHI017620.m2 MAPPRILLCGDVLGRLNQLFKRVQSVNKSAGPFDALLCVGQFFPDSPDRLQELMDFIENR SQFPLPTYFIGDYGVGAAKVLVAASKDPVNQGFKLDGFKICNNLFWLKGSGKFTLHGLSV AYLSGRRLSDGQQFGKYTQDDVDALRALAEEPGIVDLFLTNEWPRGVTNRAATSDVPVGI SDSLGSDSTVSELVVEIKPRYHIAGSKGVFYAREPYSNIDAVHVTRFLGLAPVGNKDKQK FLHAISPTPASTMSATEISMKSPNTTLSPYTSVDLGAHPKEVTKRSSDSVSDSQYWRYDV SQKRQKHGGGEGDKVCFKFIYSGSCPRGENCNFQHDTEAREQCLRGVCLDFIIKGKCEKG PECSYKHSLQSEGDYSHRRPRSENASASRSKECWFCLSSPSVESHLIVSIGENCYCALPK GPLVQDHVLIVPIEHSPNTMSLSPECEIELARFQDSLKNYYKSQGKEAVFFEWVSKRGTH ANVQSVPIPSSRAAAVQAIFNMAAEKLGFKFLATKSNGNSDGRKSLRTEFDKNFNFFYVE LPGGIILSHRVEDTETFPAQFGREVLAGFLNIAEKADWRNCALGKEEERKMAENFKKQFE EFDPIK. >LITCHI017620.m3 MDFIENRSQFPLPTYFIGDYGVGAAKVLVAASKDPVNQGFKLDGFKICNNLFWLKGSGKF TLHGLSVAYLSGRRLSDGQQFGKYTQDDVDALRALAEEPGIVDLFLTNEWPRGVTNRAAT SDVPVGISDSLGSDSTVSELVVEIKPRYHIAGSKGVFYAREPYSNIDAVHVTRFLGLAPV GNKDKQKFLHAISPTPASTMSATEISMKSPNTTLSPYTSVDLGAHPKEVTKRSSDSVSDS QYWRYDVSQKRQKHGGGEGDKVCFKFIYSGSCPRGENCNFQHDTEAREQCLRGVCLDFII KGKCEKGPECSYKHSLQSEGDYSHRRPRSENASASRSKECWFCLSSPSVESHLIVSIGEN CYCALPKGPLVQDHVLIVPIEHSPNTMSLSPECEIELARFQDSLKNYYKSQGKEAVFFEW VSKRGTHANVQSVPIPSSRAAAVQAIFNMAAEKLGFKFLATKSNGNSDGRKSLRTEFDKN FNFFYVELPGGIILSHRVEDTETFPAQFGREVLAGFLNIAEKADWRNCALGKEEERKMAE NFKKQFEEFDPIK.
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>LITCHI017620.m1 CTTGTGTTCTGGGTCACATCATAATTTTTATTATAGTGATCCCGGTAAATGTAATTAGCT CAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGCTCCAAAGAAAAAATTCTACTCATGTGTTGGGACGGT GATGCGGCATTGACACTGTTTTTCCATATAACGGCGTAAACCAGAACCAGAATTTCCCAA AATAATTTTCCTACCCGCCCAGACCGGCCCAAAATCCAGAGGCCGAAAATTCAATGGCCC AAATACTCAACTCGTAGCAGATTCACTCCCTCTCTCGCTCACACACTCTCACGCACCAAC GGAGAGTCATGGCTCCTCCAAGAATTCTGCTATGCGGCGACGTCCTAGGCCGCCTGAACC AGCTGTTCAAACGAGTTCAATCGGTCAACAAATCAGCTGGTCCATTCGATGCCCTTCTCT GCGTGGGCCAGTTCTTCCCGGACTCACCGGACCGCCTGCAGGAGCTTATGGACTTCATCG AAAACCGCTCGCAGTTTCCTCTGCCAACCTACTTCATCGGCGACTACGGCGTAGGCGCCG CCAAGGTCCTAGTCGCCGCTTCCAAAGACCCCGTCAATCAAGGCTTCAAGCTTGACGGCT TCAAAATCTGCAACAATTTGTTCTGGTTGAAAGGCAGTGGCAAGTTCACTCTTCACGGTT TATCTGTGGCATATTTATCTGGTAGGCGATTGTCGGATGGTCAGCAGTTTGGAAAGTATA CTCAAGATGATGTTGATGCTTTGCGAGCATTAGCCGAGGAACCTGGAATTGTTGACTTGT TTTTAACTAATGAATGGCCAAGGGGGGTTACAAACAGAGCTGCTACATCTGATGTACCCG TCGGAATCTCAGATTCATTAGGCAGTGATTCTACAGTATCAGAGTTGGTGGTGGAAATCA AACCGCGCTATCACATTGCTGGTTCTAAGGGTGTATTCTATGCTCGCGAACCTTACTCTA 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