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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI017611Chr14767860847686854+Sm-like protein LSM7

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI017611.m112109PF03195.17LOBFamily96.31.30E-27
LITCHI017611.m1244316PF01423.25LSMDomain69.12.10E-19
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>LITCHI017611.m1
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AAGAGGTGTATTCCAGATTGTGAAATGGCTCGATATTTTCCCGCGAGTAGATACTCAGAG
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>LITCHI017611.m1
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>LITCHI017611.m1
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CAGATGAGATTGCCAACCCATTCCTCCAACCCGATGGGGCGGCCTAA
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ACAATTTCTTTGCTTGTAAAATAAAATAGAAGCACCGCTAAAAGAAAATTTTGGACAAAA
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AAAAAAGAAACAACATTAAATTCCAGAGAGAGAACCCAAAAGCATCTCTCTCTATCTCTC
TCGAATTTGGTGAATGAAGATTTTAAAGCCTTCACTATTCTTTCTCTCTCTGCTTTAAAG
CCTTCTTCAGTTACGCACTTCTTCGGAGCCAGAGAGAGAGAGAGAGTTGGTGTTTTGTTC
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TCCTCATTCTCTCTTTCTGTATCTTAATTACAGCCTAAATTTTTCTGAATTTCTCTCATT
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TTTCTCGTTTCTTTTGCACTAGTAATGGGAATAGTCCTTGTTCAATCACAGACACTTTGA
ATATACTGGGTACCGAGAGCAGGAAGAAGGCGATATATTTTATATATACATACACACGCA
GATACTTATTATATATATTT
>LITCHI022983.m2 +  Up_Stream_Len 2000
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ATTTTGATATGTCTATTTAGTATTTAAAATTCATCACAAAAGAAATGAAAATCTTTTATA
TTTTCAATAAAGAAATGAATATGAGAATTTGTTGGACGTTCAAATAAAATTTGTTTTCAA
ACAAATTTAGTAAAATTTATCACAAACAATTATGATAAAGCTTTTGTTAAAACTTTAAGA
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TAATATAAAATATAATTATTGTGATTAAGTTATTATTAATATATAATTATTTTTTAACTT
TGGTTAGGTATAATAGTTAATATATATATGAATATAAAAGTTGACATTTCTAGCAATATG
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TCTCTCTCTGCTTTAAAGCCTTCTTCAGTTACGCACTTCTTCGGAGCCAGAGAGAGAGAG
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TGTTGTAGCGAAGTTATATATAAATAAATAAATATATATATATATATATAGAGAGAGAGA
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GTTACCATCGCCACACTGCCCACCAGATTCAGAGGCTTGAATCGTAAGGCCATTTGCATT
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GAGGACCCAAATGAAGGTATATGTTAACTATATATGTTTTGTTGTTGGTCACTTCATGGA
GACTTTTTTTGAAGGAAAAAAATGTTCACTTTATATAGGCACAACATGAGAGGGCAGATA
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CACTCAAGAATGTCATTTGCCCTTCTTGTGGTGGTCCTCCTGTCACTGAAGATTCTTATT
TCGATGAACAGAAGTTGAGA
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>LITCHI004396.m3 GenomeSequence + 
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TTCTCCATCACAAAATGTCACTGTGTCTGTGTCTCTCCTTAAGGTTGCAGAGAGAAACGG
AAAATGAACCCAACTCCATGACTTCCGTCTAGCGTTTGACGTTCTTTTCTTTGCTTCGCA
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GTTCTCGAATCATGTAAAGTTTTGATTTTTATGTTTTTTGGTTGTTCCTTGTTTGCATTT
TGTTAGCTAATTCAATGGATTTTTTTGGTTTGGATTTTTTCTTTTTGAAGCTGAATTTCG
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TAAAAGTTAATTGTTTCTTAAGCTTTGTTTCATAGTCATATGCACTTAAATTATTGTTTT
ATGTCTCATGAATTGACAACATAAAGCATGTGTAGAAGTTCGACAAGAGTTCTGTGTATT
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CAAAACCTGATGAAGATAGGCAGTTAGACCATGGTGCTCATAATGTGTTGCAGTCAACCA
TCTATTCCCAGCCTTGGTGGCATGGGGTTGGGACTGGTGGCTCCTTGAGTGAAACTGCTT
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AATTTAACAGGTCTATATATGTATGTTAATGTGGTATTCTACCAAATATGTATGAGCAAC
TTGTTCTTGTCAGCTTTACTTGGAGTGTGATAGTGATAGAATTCTTTTTCGTTAAAGCAG
ATGGGAGTCGTGGACCAGAACATGGAAATCTCAAGCATATTCCATCCTCAACTCCCCATG
CTATGGCTGAACACCTTGAACCAAATTCCCAAATGGAGCTAGTTGGTCACTCGATTGTGA
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TACTAATTTTATCAGAATTTATATTTAGATTATATGAGCTTAAATAGATTATTCCCTTGC
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ATTCATTTATCAATCTTTGACAGAGAATCAACTTCTTAATCTTATTGAGTTTTTTACTAC
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TTCATTTTGTTGTATTAATGAAGTGTCATTGTGGTATATCCTTGGTAAACATACATATGT
AAATTTAGTGTAGGAATGATGTGGGAGGGAGATCATTCTCTTATACTGCTTAGGTTCCAG
GTTCATTGCTGTGTGTTAGTATATCTTTTGCCATACCAGGAGGATCATTCAACTTAGGGT
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GTGCAGTCTTCCTCCAGTGGCAACAGCAACGGACATGGTCTGTTATCAATGTATAATTCA
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>LITCHI004396.m4 GenomeSequence + 
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TAAAAGTTAATTGTTTCTTAAGCTTTGTTTCATAGTCATATGCACTTAAATTATTGTTTT
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TCTATTCCCAGCCTTGGTGGCATGGGGTTGGGACTGGTGGCTCCTTGAGTGAAACTGCTT
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AATTTAACAGGTCTATATATGTATGTTAATGTGGTATTCTACCAAATATGTATGAGCAAC
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ATGGGAGTCGTGGACCAGAACATGGAAATCTCAAGCATATTCCATCCTCAACTCCCCATG
CTATGGCTGAACACCTTGAACCAAATTCCCAAATGGAGCTAGTTGGTCACTCGATTGTGA
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AGTTGTGTAAAATTTTCAGGTTTTGACATCATATCCTTATACAGATCCACAGTATGGTGG
TATATTGACTCCATATGGGCCACAAGCTATGGTATGCTTTTGTTGTCCTTTTGTATATGT
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CCACTGATAGAACCTTGTTTCTTGTGGTCAAATGCTTTTGTATGGATCGTTGAATGCAAT
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AAATTTAGTGTAGGAATGATGTGGGAGGGAGATCATTCTCTTATACTGCTTAGGTTCCAG
GTTCATTGCTGTGTGTTAGTATATCTTTTGCCATACCAGGAGGATCATTCAACTTAGGGT
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GTTGCCAGATACATCCTCAGTTATATGGCATGCATCATGCTAGGATGCCTCTGCCCCTTG
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GGCAGTCACGTGCTAAGGCTGAGCTTGAAAAGAAAGCGATAAAAGTTAGAAAGGTAGAAT
TTGTATTTATTACATTTTCGTACTTTGGAACGAATAACATTTTCCCATGAAAAAAGAATT
TAGCAAGGTCAAGACATGTTATCTTGTATTCTCATTTCTTTACAGCCTTATCTTCATGAG
TCGAGGCACCAACATGCCATGAGAAGAGCCAGAGGTTGTGGAGGCCGCTTTCTTAATACA
AAGAAGCCGGACAACAATGGTGCAAAATCCACTTCGGGAGAGAGCGCAAATGCCGGTTCA
AACCTTTCAGCGGAGTCTGCCAGCTTATCTGGTTCTGAAAGCTTGCCCAACAATTGTAGT
GGAAATACGGCATCCTCCATTGATCAGCAAGTAGGATTGGTGGTTGGACACATGCAGAGA
GTGCAGTCTTCCTCCAGTGGCAACAGCAACGGACATGGTCTGTTATCAATGTATAATTCA
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AATGGGGCACCGCGAGGGGCCCTTCCCGTTAAGTGAAATTCCTCCTCGACACGGAGGGGC
CTCTCCAGCATTGCTCTACTGGTTTGATTTTATCCACTTTTTATTCATGCACACACACAC
ACACACAGAGACACACAGACACAGAGACACACACCCACCCACACATCTACAACTATGCAT
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GGAGGTCGGGGATATGCTCACAAGTGTGGGGCAGTCCTCAGGCAAATCATTCTTGGCTTA
ACAAACCTATCTTTGCTGGGGTTTAGATGAGGAAGGAGGACATATACATGCATGGATGTC
ACCATGCCATCTTCACTCTTCCATTCATTTCAACCTCATTTGTAAAAAAGGAATAGCTAT
AGTTTTATATACTGTGTACCTATCGATCAATTAGGGGATTTTAGTTGTGAAGGTGAGAAG
TTTTTCCTGAAAGAACCATGAAAACATCTGAATAGTCTGCAAAAAGTGTGAAGAAACTCT
TGTTGTTTGCAACCATGTTAAAATAATGTCAAATATATGAGGGGTTTCTCCTCTTCTCTT
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ATACTCCTTTATCTATTTATGTTCTTATTGATTGCATACAAAATATGAGTGGCTTGGATT
TGATTGTTTTTATTGCTTTTATGAGTTGTTACTCTCATTTACAGTAATTTTTTGCAACCT
AACTAAT
>LITCHI004396.m1 GenomeSequence + 
TTTATATTTATTTTCTCTTCTCAAACATAAATAAATAAGTCTCCAATATAAAATCTGTCT
TTCTCCATCACAAAATGTCACTGTGTCTGTGTCTCTCCTTAAGGTTGCAGAGAGAAACGG
AAAATGAACCCAACTCCATGACTTCCGTCTAGCGTTTGACGTTCTTTTCTTTGCTTCGCA
TCCAATTGTAAGCCCCTCTCTCTCTCTCTTGCTGTTTGCTCTGTGAAATTTTGATTGGAC
ATCAAATTCAGGTTCTTTGATGGACGTCCGATTTTTTTTTTTGTTTGTGGTTTCTGGGTT
GTTGAAAGTTGGTTTTTTCGAATTCTATGACAAGGGTTTTGTGTTTGGTTGATGAGAAAG
CTGTTAGAGAAGAAAAAGTTTGAAGCTTTGGACTTTTTTGTTGGGGAGTTTTGGAGTGAG
AAGGGTGGATGTAGTAGAATTTGGAGTGGAATTAGCAATAACCAGATGATGATATTTGTT
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GTTCTCGAATCATGTAAAGTTTTGATTTTTATGTTTTTTGGTTGTTCCTTGTTTGCATTT
TGTTAGCTAATTCAATGGATTTTTTTGGTTTGGATTTTTTCTTTTTGAAGCTGAATTTCG
CGCAGGAGGTTTTTATGTCAGTGGAGATTGAATTTGTTCTATTGGGTATTGAAGTTGACA
GTAGGAAGATGGACATTTTTGTAACTATGCATGGCATTTGATATTCTATTTTTTCAACTG
TTTGTATGCTCTTTTTTTGAAATTTGATTCTTCCTGTCTAAATTGTGGAGCCTGGATACT
GAATCGAACAATTTTGTACTTCGTTGCTCTTGCTCTTTAGAATATTTAATCTTGTTTGTG
TAAAAGTTAATTGTTTCTTAAGCTTTGTTTCATAGTCATATGCACTTAAATTATTGTTTT
ATGTCTCATGAATTGACAACATAAAGCATGTGTAGAAGTTCGACAAGAGTTCTGTGTATT
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CAATGGCTAACCAGCTGTTTTGATCTGTTTTCTCTTTAGCTCTCGATTTTCTTGTGGGTC
AATTTGTTTGGGGATTAGGCTATTGACATTCTTTGAGGATTAGGTTGTGAATAATGCCGG
CAAAACCTGATGAAGATAGGCAGTTAGACCATGGTGCTCATAATGTGTTGCAGTCAACCA
TCTATTCCCAGCCTTGGTGGCATGGGGTTGGGACTGGTGGCTCCTTGAGTGAAACTGCTT
CCAAAACATCAAGTGAAAAACCAAATGGTTCTGCCTCTAATGAAGCTACCCATTCACAAG
GTAATAGTCACTTTGGAGATGATTCTGGATTTCTTGGGGCTTGATCAGGTTGTAAGTTTT
AATTTAACAGGTCTATATATGTATGTTAATGTGGTATTCTACCAAATATGTATGAGCAAC
TTGTTCTTGTCAGCTTTACTTGGAGTGTGATAGTGATAGAATTCTTTTTCGTTAAAGCAG
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CTATGGCTGAACACCTTGAACCAAATTCCCAAATGGAGCTAGTTGGTCACTCGATTGTGA
GACATCTCTCTCTTTACACACTCACACACAAGCACACAGTTGTGAGTACTTTCTGCTGTG
CATCTAGACAAGTTTCTAGGACTTGGCCATTTTAATTGTAGTGTAACAGTGATGATTTTA
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TATATTGACTCCATATGGGCCACAAGCTATGGTATGCTTTTGTTGTCCTTTTGTATATGT
TCAGTGTTTGAACAAGAAAAGGTAGTCAAAATACTACTTGACATGACTATGTTTTCTATA
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TACTAATTTTATCAGAATTTATATTTAGATTATATGAGCTTAAATAGATTATTCCCTTGC
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ATTCATTTATCAATCTTTGACAGAGAATCAACTTCTTAATCTTATTGAGTTTTTTACTAC
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>LITCHI004396.m2 GenomeSequence + 
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AACTAAT
>LITCHI004396.m7 GenomeSequence + 
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AACTAAT
>LITCHI004396.m8 GenomeSequence + 
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AACTAAT
>LITCHI004396.m5 GenomeSequence + 
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AGTTTTATATACTGTGTACCTATCGATCAATTAGGGGATTTTAGTTGTGAAGGTGAGAAG
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