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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI017609 | Chr1 | 47654358 | 47658088 | - | Putative transcription factor bHLH041 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI017609.m1 | 342 | 387 | PF00010.29 | HLH | Domain | 43.5 | 2.50E-11 |
LITCHI017609.m2 | 341 | 386 | PF00010.29 | HLH | Domain | 43.5 | 2.50E-11 |
LITCHI017609.m3 | 341 | 386 | PF00010.29 | HLH | Domain | 43.5 | 2.50E-11 |
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>LITCHI017609.m1 ATGGACACCACCATCCTTGTTGATGAAGTGACTCGCGCCAACTTCCTCCAATCAGTAATG CAGTCTTTTGGCTGCACTTACATATGCCTCTGGTCTTATGATCAACCACACAGCAGCTGC TTATACTTCTGGGATGGACGTTACAATGAAGAAAACAACCAAGCTCAAAGGCTTTTCCAT GACTACTGTCAACAACTGTATCCCGTGTCCAATTACGACTGTGTTCCCGGACTTGCTTTC AAGAATAGTCAACAGTACGTTGAGCTTAACGAATCTGAACTTCATAGGCTGGCTTCCAAC GAAACACAGCGCAGATTTTACCAAGAGGCGCGTATCAAGATTGCAGTATTCATGGCGTGC AAAAGTGGCGAAATTGAGTTAGGCTTGTCTCATTCAACACAGATTAACATGGAAATAGAG ATGAGAAATTTGTTCCCAGTACAAAACTTGTCACGACAATCGCCGGCTAGAGATCAGCTT AGCCTTCCACTGCCGACGGATCCGAACATGCCTTCATCATCTTCATCATCATTGAGATCT CTATCTATGGACAGCCCTGATAGCTCTTCTCTTCTCTTCAACATTCCAAGCACAACCCAC CTACCAGAAACCCTGAAAGAGGGTCCTTCAATGCCACCAATTATGCCAACCACAACTAGT TCACGCCAACAAGCACTGCAAGCCTTTGCTCAAATCCGAAACCTACAATTACCAACTCCA GAGAGTGAAGATGCTGTAATGACAAGAGCCATTCTTGCTGTTTTAACTGCGTCTTCTTCT CCTTCTTCTTCTTCTTCGTCATCACACCATCAACCCCAGCAAAACCTACCTCCTGGCTAC CAAGTAAGCCCAAAAGCTAGTGCTTTCAAAAATTATAACTTGGGTGTAGGCCCCAGTACG TCTCAAATGAGAACCAGTTTACGCGCCCAAAGCATGTTAAAACGAGCAATTTCATACTAC AAACGGTTAAACATTATAAGACGTGAACATTCGCTAGCAAGCCGCCCTACTAGCACCCAG TTACACCATATGATGTCAGAGCGGAAAAGGCGTGAGAAACTTAATGAAAGTTTCCAGGCA CTTAGATCTCTACTTCCTCCAGGAACTAAGAAGGACAAAGCGTCGCTGCTTATTAGTACA AGAGAATACTTGAGCTCTTTGAAAGATCAAGTTGCGGAGCTGACTGATAAAAACAAGAAA TTGGAGGTGCAGCTTTTGCCTCCAGCTTCTGCTGCCAACGAAGCTGCTGCAGAAGCAAGT GCTTCCACAGCAAATCAACGACTTGGCATAAGTATCACTCCTGTGTCTGAATCAACCTCA GAAGACAGAATTATTGACTTAGGATTGATTGTCACGGCGGAAGCTCCCTTGCTGGATTTA GTTATTCGCATCCTGGAGTTCTTGAAGCAACCTCAAAACAATAATGTCAGCTTGATTTCC GTGGAAGCCAATACCCGGATAACAGAATCAGCTTCTTCTAACCATTTAAATTTCAGACTC AGGATAATACAGGATAGTGAATGGGACGAGTCTGCCTTCCAGGAAGCAGTGAGAAGAGTT GTTGCTGACTTGGCACAATGA >LITCHI017609.m2 ATGGACACCACCATCCTTGTTGATGAAGTGACTCGCGCCAACTTCCTCCAATCAGTAATG CAGTCTTTTGGCTGCACTTACATATGCCTCTGGTCTTATGATCAACCACACAGCTGCTTA TACTTCTGGGATGGACGTTACAATGAAGAAAACAACCAAGCTCAAAGGCTTTTCCATGAC TACTGTCAACAACTGTATCCCGTGTCCAATTACGACTGTGTTCCCGGACTTGCTTTCAAG AATAGTCAACAGTACGTTGAGCTTAACGAATCTGAACTTCATAGGCTGGCTTCCAACGAA ACACAGCGCAGATTTTACCAAGAGGCGCGTATCAAGATTGCAGTATTCATGGCGTGCAAA AGTGGCGAAATTGAGTTAGGCTTGTCTCATTCAACACAGATTAACATGGAAATAGAGATG AGAAATTTGTTCCCAGTACAAAACTTGTCACGACAATCGCCGGCTAGAGATCAGCTTAGC CTTCCACTGCCGACGGATCCGAACATGCCTTCATCATCTTCATCATCATTGAGATCTCTA TCTATGGACAGCCCTGATAGCTCTTCTCTTCTCTTCAACATTCCAAGCACAACCCACCTA CCAGAAACCCTGAAAGAGGGTCCTTCAATGCCACCAATTATGCCAACCACAACTAGTTCA CGCCAACAAGCACTGCAAGCCTTTGCTCAAATCCGAAACCTACAATTACCAACTCCAGAG AGTGAAGATGCTGTAATGACAAGAGCCATTCTTGCTGTTTTAACTGCGTCTTCTTCTCCT TCTTCTTCTTCTTCGTCATCACACCATCAACCCCAGCAAAACCTACCTCCTGGCTACCAA GTAAGCCCAAAAGCTAGTGCTTTCAAAAATTATAACTTGGGTGTAGGCCCCAGTACGTCT CAAATGAGAACCAGTTTACGCGCCCAAAGCATGTTAAAACGAGCAATTTCATACTACAAA CGGTTAAACATTATAAGACGTGAACATTCGCTAGCAAGCCGCCCTACTAGCACCCAGTTA CACCATATGATGTCAGAGCGGAAAAGGCGTGAGAAACTTAATGAAAGTTTCCAGGCACTT AGATCTCTACTTCCTCCAGGAACTAAGAAGGACAAAGCGTCGCTGCTTATTAGTACAAGA GAATACTTGAGCTCTTTGAAAGATCAAGTTGCGGAGCTGACTGATAAAAACAAGAAATTG GAGGTGCAGCTTTTGCCTCCAGCTTCTGCTGCCAACGAAGCTGCTGCAGAAGCAAGTGCT TCCACAGCAAATCAACGACTTGGCATAAGTATCACTCCTGTGTCTGAATCAACCTCAGAA GACAGAATTATTGACTTAGGATTGATTGTCACGGCGGAAGCTCCCTTGCTGGATTTAGTT ATTCGCATCCTGGAGTTCTTGAAGCAACCTCAAAACAATAATGTCAGCTTGATTTCCGTG GAAGCCAATACCCGGATAACAGAATCAGCTTCTTCTAACCATTTAAATTTCAGACTCAGG ATAATACAGGATAGTGAATGGGACGAGTCTGCCTTCCAGGAAGCAGTGAGAAGAGTTGTT GCTGACTTGGCACAATGA >LITCHI017609.m3 ATGGACACCACCATCCTTGTTGATGAAGTGACTCGCGCCAACTTCCTCCAATCAGTAATG CAGTCTTTTGGCTGCACTTACATATGCCTCTGGTCTTATGATCAACCACACAGCTGCTTA TACTTCTGGGATGGACGTTACAATGAAGAAAACAACCAAGCTCAAAGGCTTTTCCATGAC TACTGTCAACAACTGTATCCCGTGTCCAATTACGACTGTGTTCCCGGACTTGCTTTCAAG AATAGTCAACAGTACGTTGAGCTTAACGAATCTGAACTTCATAGGCTGGCTTCCAACGAA ACACAGCGCAGATTTTACCAAGAGGCGCGTATCAAGATTGCAGTATTCATGGCGTGCAAA AGTGGCGAAATTGAGTTAGGCTTGTCTCATTCAACACAGATTAACATGGAAATAGAGATG AGAAATTTGTTCCCAGTACAAAACTTGTCACGACAATCGCCGGCTAGAGATCAGCTTAGC CTTCCACTGCCGACGGATCCGAACATGCCTTCATCATCTTCATCATCATTGAGATCTCTA TCTATGGACAGCCCTGATAGCTCTTCTCTTCTCTTCAACATTCCAAGCACAACCCACCTA CCAGAAACCCTGAAAGAGGGTCCTTCAATGCCACCAATTATGCCAACCACAACTAGTTCA CGCCAACAAGCACTGCAAGCCTTTGCTCAAATCCGAAACCTACAATTACCAACTCCAGAG AGTGAAGATGCTGTAATGACAAGAGCCATTCTTGCTGTTTTAACTGCGTCTTCTTCTCCT TCTTCTTCTTCTTCGTCATCACACCATCAACCCCAGCAAAACCTACCTCCTGGCTACCAA GTAAGCCCAAAAGCTAGTGCTTTCAAAAATTATAACTTGGGTGTAGGCCCCAGTACGTCT CAAATGAGAACCAGTTTACGCGCCCAAAGCATGTTAAAACGAGCAATTTCATACTACAAA CGGTTAAACATTATAAGACGTGAACATTCGCTAGCAAGCCGCCCTACTAGCACCCAGTTA CACCATATGATGTCAGAGCGGAAAAGGCGTGAGAAACTTAATGAAAGTTTCCAGGCACTT AGATCTCTACTTCCTCCAGGAACTAAGAAGGACAAAGCGTCGCTGCTTATTAGTACAAGA GAATACTTGAGCTCTTTGAAAGATCAAGTTGCGGAGCTGACTGATAAAAACAAGAAATTG GAGGTGCAGCTTTTGCCTCCAGCTTCTGCTGCCAACGAAGCTGCTGCAGAAGCAAGTGCT TCCACAGCAAATCAACGACTTGGCATAAGTATCACTCCTGTGTCTGAATCAACCTCAGAA GACAGAATTATTGACTTAGGATTGATTGTCACGGCGGAAGCTCCCTTGCTGGATTTAGTT ATTCGCATCCTGGAGTTCTTGAAGCAACCTCAAAACAATAATGTCAGCTTGATTTCCGTG GAAGCCAATACCCGGATAACAGAATCAGCTTCTTCTAACCATTTAAATTTCAGACTCAGG ATAATACAGGTACATACACTCTCACGGGCTCAACAAACTCAACCTAACAGATCTTAG
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